data_SMR-31c5ed885271fc7117ea6188611bf602_3 _entry.id SMR-31c5ed885271fc7117ea6188611bf602_3 _struct.entry_id SMR-31c5ed885271fc7117ea6188611bf602_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - O08788 (isoform 2)/ DCTN1_MOUSE, Dynactin subunit 1 Estimated model accuracy of this model is 0.033, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries O08788 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 160779.410 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DCTN1_MOUSE O08788 1 ;MAQSRRHMSSRTPSGSRMSTEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKND GTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKVLKREGADAAAKTSKLRGLKPKKAP TARKTTTRRPKPTRPASTGVAGPSSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPALTSPGAAPPL PSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRSEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEAR KEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKG SDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAE STIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLD MAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFA ETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKF DLSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLD FLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDSTMQLADHIKFTQSALDCMGVEVGRLRAF LQGGQEATDIALLLRDLETSCSDTRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGSQVSDTLLDCRKHLTWVVAV LQEVAAAAAQLIAPLAENEGLPVAALEELAFKASEQIYGSPSSSPYECLRQSCTILISTMNKLATAMQEG EYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKL DSAAKDADERIEKVQTRLDETQTLLRKKEKDFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQSKRTIEGLVK DSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILRGAQMKASLAALPPLHVAKLSLPPHEGPGGNLVAGALYRKTSQL LEKLNQLSTHTHVVDITRSSPAAKSPSAQLMEQVAQLKSLSDTIEKLKDEVLKETVTQRPGATVPTDFAT FPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGLGQRHRLVLTQEQLHQLHSRLIS ; 'Dynactin subunit 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1243 1 1243 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . DCTN1_MOUSE O08788 O08788-2 1 1243 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2011-07-27 17BD5B9ED7CD2474 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MAQSRRHMSSRTPSGSRMSTEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKND GTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKVLKREGADAAAKTSKLRGLKPKKAP TARKTTTRRPKPTRPASTGVAGPSSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPALTSPGAAPPL PSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRSEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEAR KEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKG SDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAE STIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLD MAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFA ETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKF DLSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLD FLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDSTMQLADHIKFTQSALDCMGVEVGRLRAF LQGGQEATDIALLLRDLETSCSDTRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGSQVSDTLLDCRKHLTWVVAV LQEVAAAAAQLIAPLAENEGLPVAALEELAFKASEQIYGSPSSSPYECLRQSCTILISTMNKLATAMQEG EYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKL DSAAKDADERIEKVQTRLDETQTLLRKKEKDFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQSKRTIEGLVK DSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILRGAQMKASLAALPPLHVAKLSLPPHEGPGGNLVAGALYRKTSQL LEKLNQLSTHTHVVDITRSSPAAKSPSAQLMEQVAQLKSLSDTIEKLKDEVLKETVTQRPGATVPTDFAT FPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGLGQRHRLVLTQEQLHQLHSRLIS ; ;MAQSRRHMSSRTPSGSRMSTEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKND GTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKVLKREGADAAAKTSKLRGLKPKKAP TARKTTTRRPKPTRPASTGVAGPSSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPALTSPGAAPPL PSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRSEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEAR KEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKG 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_entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ALA . 1 3 GLN . 1 4 SER . 1 5 ARG . 1 6 ARG . 1 7 HIS . 1 8 MET . 1 9 SER . 1 10 SER . 1 11 ARG . 1 12 THR . 1 13 PRO . 1 14 SER . 1 15 GLY . 1 16 SER . 1 17 ARG . 1 18 MET . 1 19 SER . 1 20 THR . 1 21 GLU . 1 22 ALA . 1 23 SER . 1 24 ALA . 1 25 ARG . 1 26 PRO . 1 27 LEU . 1 28 ARG . 1 29 VAL . 1 30 GLY . 1 31 SER . 1 32 ARG . 1 33 VAL . 1 34 GLU . 1 35 VAL . 1 36 ILE . 1 37 GLY . 1 38 LYS . 1 39 GLY . 1 40 HIS . 1 41 ARG . 1 42 GLY . 1 43 THR . 1 44 VAL . 1 45 ALA . 1 46 TYR . 1 47 VAL . 1 48 GLY . 1 49 ALA . 1 50 THR . 1 51 LEU . 1 52 PHE . 1 53 ALA . 1 54 THR . 1 55 GLY . 1 56 LYS . 1 57 TRP . 1 58 VAL . 1 59 GLY . 1 60 VAL . 1 61 ILE . 1 62 LEU . 1 63 ASP . 1 64 GLU . 1 65 ALA . 1 66 LYS . 1 67 GLY . 1 68 LYS . 1 69 ASN . 1 70 ASP . 1 71 GLY . 1 72 THR . 1 73 VAL . 1 74 GLN . 1 75 GLY . 1 76 ARG . 1 77 LYS . 1 78 TYR . 1 79 PHE . 1 80 THR . 1 81 CYS . 1 82 ASP . 1 83 GLU . 1 84 GLY . 1 85 HIS . 1 86 GLY . 1 87 ILE . 1 88 PHE . 1 89 VAL . 1 90 ARG . 1 91 GLN . 1 92 SER . 1 93 GLN . 1 94 ILE . 1 95 GLN . 1 96 VAL . 1 97 PHE . 1 98 GLU . 1 99 ASP . 1 100 GLY . 1 101 ALA . 1 102 ASP . 1 103 THR . 1 104 THR . 1 105 SER . 1 106 PRO . 1 107 GLU . 1 108 THR . 1 109 PRO . 1 110 ASP . 1 111 SER . 1 112 SER . 1 113 ALA . 1 114 SER . 1 115 LYS . 1 116 VAL . 1 117 LEU . 1 118 LYS . 1 119 ARG . 1 120 GLU . 1 121 GLY . 1 122 ALA . 1 123 ASP . 1 124 ALA . 1 125 ALA . 1 126 ALA . 1 127 LYS . 1 128 THR . 1 129 SER . 1 130 LYS . 1 131 LEU . 1 132 ARG . 1 133 GLY . 1 134 LEU . 1 135 LYS . 1 136 PRO . 1 137 LYS . 1 138 LYS . 1 139 ALA . 1 140 PRO . 1 141 THR . 1 142 ALA . 1 143 ARG . 1 144 LYS . 1 145 THR . 1 146 THR . 1 147 THR . 1 148 ARG . 1 149 ARG . 1 150 PRO . 1 151 LYS . 1 152 PRO . 1 153 THR . 1 154 ARG . 1 155 PRO . 1 156 ALA . 1 157 SER . 1 158 THR . 1 159 GLY . 1 160 VAL . 1 161 ALA . 1 162 GLY . 1 163 PRO . 1 164 SER . 1 165 SER . 1 166 SER . 1 167 LEU . 1 168 GLY . 1 169 PRO . 1 170 SER . 1 171 GLY . 1 172 SER . 1 173 ALA . 1 174 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A . A 1 1020 GLN 1020 ? ? ? A . A 1 1021 ALA 1021 ? ? ? A . A 1 1022 ASP 1022 ? ? ? A . A 1 1023 ILE 1023 ? ? ? A . A 1 1024 ASP 1024 ? ? ? A . A 1 1025 GLN 1025 ? ? ? A . A 1 1026 LEU 1026 ? ? ? A . A 1 1027 GLU 1027 ? ? ? A . A 1 1028 ALA 1028 ? ? ? A . A 1 1029 GLU 1029 ? ? ? A . A 1 1030 LYS 1030 ? ? ? A . A 1 1031 ALA 1031 ? ? ? A . A 1 1032 GLU 1032 ? ? ? A . A 1 1033 LEU 1033 ? ? ? A . A 1 1034 LYS 1034 ? ? ? A . A 1 1035 GLN 1035 ? ? ? A . A 1 1036 ARG 1036 ? ? ? A . A 1 1037 LEU 1037 ? ? ? A . A 1 1038 ASN 1038 ? ? ? A . A 1 1039 SER 1039 ? ? ? A . A 1 1040 GLN 1040 ? ? ? A . A 1 1041 SER 1041 ? ? ? A . A 1 1042 LYS 1042 ? ? ? A . A 1 1043 ARG 1043 ? ? ? A . A 1 1044 THR 1044 ? ? ? A . A 1 1045 ILE 1045 ? ? ? A . A 1 1046 GLU 1046 ? ? ? A . A 1 1047 GLY 1047 ? ? ? A . A 1 1048 LEU 1048 ? ? ? A . A 1 1049 VAL 1049 ? ? ? A . A 1 1050 LYS 1050 ? ? ? A . A 1 1051 ASP 1051 ? ? ? A . A 1 1052 SER 1052 ? ? ? A . A 1 1053 PRO 1053 ? ? ? A . A 1 1054 LEU 1054 ? ? ? A . A 1 1055 LEU 1055 ? ? ? A . A 1 1056 LEU 1056 ? ? ? A . A 1 1057 GLN 1057 ? ? ? A . A 1 1058 GLN 1058 ? ? ? A . A 1 1059 ILE 1059 ? ? ? A . A 1 1060 SER 1060 ? ? ? A . A 1 1061 ALA 1061 ? ? ? A . A 1 1062 MET 1062 ? ? ? A . A 1 1063 ARG 1063 ? ? ? A . A 1 1064 LEU 1064 ? ? ? A . A 1 1065 HIS 1065 ? ? ? A . A 1 1066 ILE 1066 ? ? ? A . A 1 1067 SER 1067 ? ? ? A . A 1 1068 GLN 1068 ? ? ? A . A 1 1069 LEU 1069 ? ? ? A . A 1 1070 GLN 1070 ? ? ? A . A 1 1071 HIS 1071 ? ? ? A . A 1 1072 GLU 1072 ? ? ? A . A 1 1073 ASN 1073 ? ? ? A . A 1 1074 SER 1074 ? ? ? A . A 1 1075 ILE 1075 ? ? ? A . A 1 1076 LEU 1076 ? ? ? A . A 1 1077 ARG 1077 ? ? ? A . A 1 1078 GLY 1078 ? ? ? A . A 1 1079 ALA 1079 ? ? ? A . A 1 1080 GLN 1080 ? ? ? A . A 1 1081 MET 1081 ? ? ? A . A 1 1082 LYS 1082 ? ? ? A . A 1 1083 ALA 1083 ? ? ? A . A 1 1084 SER 1084 ? ? ? A . A 1 1085 LEU 1085 ? ? ? A . A 1 1086 ALA 1086 ? ? ? A . A 1 1087 ALA 1087 ? ? ? A . A 1 1088 LEU 1088 ? ? ? A . A 1 1089 PRO 1089 ? ? ? A . A 1 1090 PRO 1090 ? ? ? A . A 1 1091 LEU 1091 ? ? ? A . A 1 1092 HIS 1092 ? ? ? A . A 1 1093 VAL 1093 ? ? ? A . A 1 1094 ALA 1094 ? ? ? A . A 1 1095 LYS 1095 ? ? ? A . A 1 1096 LEU 1096 ? ? ? A . A 1 1097 SER 1097 ? ? ? A . A 1 1098 LEU 1098 ? ? ? A . A 1 1099 PRO 1099 ? ? ? A . A 1 1100 PRO 1100 ? ? ? A . A 1 1101 HIS 1101 ? ? ? A . A 1 1102 GLU 1102 ? ? ? A . A 1 1103 GLY 1103 ? ? ? A . A 1 1104 PRO 1104 ? ? ? A . A 1 1105 GLY 1105 ? ? ? A . A 1 1106 GLY 1106 ? ? ? A . A 1 1107 ASN 1107 ? ? ? A . A 1 1108 LEU 1108 ? ? ? A . A 1 1109 VAL 1109 ? ? ? A . A 1 1110 ALA 1110 ? ? ? A . A 1 1111 GLY 1111 ? ? ? A . A 1 1112 ALA 1112 ? ? ? A . A 1 1113 LEU 1113 ? ? ? A . A 1 1114 TYR 1114 ? ? ? A . A 1 1115 ARG 1115 ? ? ? A . A 1 1116 LYS 1116 ? ? ? A . A 1 1117 THR 1117 ? ? ? A . A 1 1118 SER 1118 ? ? ? A . A 1 1119 GLN 1119 ? ? ? A . A 1 1120 LEU 1120 ? ? ? A . A 1 1121 LEU 1121 ? ? ? A . A 1 1122 GLU 1122 ? ? ? A . A 1 1123 LYS 1123 ? ? ? A . A 1 1124 LEU 1124 ? ? ? A . A 1 1125 ASN 1125 ? ? ? A . A 1 1126 GLN 1126 ? ? ? A . A 1 1127 LEU 1127 ? ? ? A . A 1 1128 SER 1128 ? ? ? A . A 1 1129 THR 1129 ? ? ? A . A 1 1130 HIS 1130 ? ? ? A . A 1 1131 THR 1131 ? ? ? A . A 1 1132 HIS 1132 ? ? ? A . A 1 1133 VAL 1133 ? ? ? A . A 1 1134 VAL 1134 ? ? ? A . A 1 1135 ASP 1135 ? ? ? A . A 1 1136 ILE 1136 ? ? ? A . A 1 1137 THR 1137 ? ? ? A . A 1 1138 ARG 1138 ? ? ? A . A 1 1139 SER 1139 ? ? ? A . A 1 1140 SER 1140 ? ? ? A . A 1 1141 PRO 1141 ? ? ? A . A 1 1142 ALA 1142 ? ? ? A . A 1 1143 ALA 1143 ? ? ? A . A 1 1144 LYS 1144 ? ? ? A . A 1 1145 SER 1145 ? ? ? A . A 1 1146 PRO 1146 ? ? ? A . A 1 1147 SER 1147 ? ? ? A . A 1 1148 ALA 1148 ? ? ? A . A 1 1149 GLN 1149 ? ? ? A . A 1 1150 LEU 1150 ? ? ? A . A 1 1151 MET 1151 ? ? ? A . A 1 1152 GLU 1152 ? ? ? A . A 1 1153 GLN 1153 ? ? ? A . A 1 1154 VAL 1154 ? ? ? A . A 1 1155 ALA 1155 ? ? ? A . A 1 1156 GLN 1156 ? ? ? A . A 1 1157 LEU 1157 ? ? ? A . A 1 1158 LYS 1158 ? ? ? A . A 1 1159 SER 1159 ? ? ? A . A 1 1160 LEU 1160 ? ? ? A . A 1 1161 SER 1161 ? ? ? A . A 1 1162 ASP 1162 ? ? ? A . A 1 1163 THR 1163 ? ? ? A . A 1 1164 ILE 1164 ? ? ? A . A 1 1165 GLU 1165 ? ? ? A . A 1 1166 LYS 1166 ? ? ? A . A 1 1167 LEU 1167 ? ? ? A . A 1 1168 LYS 1168 ? ? ? A . A 1 1169 ASP 1169 ? ? ? A . A 1 1170 GLU 1170 ? ? ? A . A 1 1171 VAL 1171 ? ? ? A . A 1 1172 LEU 1172 ? ? ? A . A 1 1173 LYS 1173 ? ? ? A . A 1 1174 GLU 1174 ? ? ? A . A 1 1175 THR 1175 ? ? ? A . A 1 1176 VAL 1176 ? ? ? A . A 1 1177 THR 1177 ? ? ? A . A 1 1178 GLN 1178 ? ? ? A . A 1 1179 ARG 1179 ? ? ? A . A 1 1180 PRO 1180 ? ? ? A . A 1 1181 GLY 1181 ? ? ? A . A 1 1182 ALA 1182 ? ? ? A . A 1 1183 THR 1183 ? ? ? A . A 1 1184 VAL 1184 ? ? ? A . A 1 1185 PRO 1185 ? ? ? A . A 1 1186 THR 1186 ? ? ? A . A 1 1187 ASP 1187 ? ? ? A . A 1 1188 PHE 1188 ? ? ? A . A 1 1189 ALA 1189 ? ? ? A . A 1 1190 THR 1190 ? ? ? A . A 1 1191 PHE 1191 ? ? ? A . A 1 1192 PRO 1192 ? ? ? A . A 1 1193 SER 1193 ? ? ? A . A 1 1194 SER 1194 ? ? ? A . A 1 1195 ALA 1195 ? ? ? A . A 1 1196 PHE 1196 ? ? ? A . A 1 1197 LEU 1197 ? ? ? A . A 1 1198 ARG 1198 ? ? ? A . A 1 1199 ALA 1199 ? ? ? A . A 1 1200 LYS 1200 ? ? ? A . A 1 1201 GLU 1201 ? ? ? A . A 1 1202 GLU 1202 ? ? ? A . A 1 1203 GLN 1203 ? ? ? A . A 1 1204 GLN 1204 ? ? ? A . A 1 1205 ASP 1205 ? ? ? A . A 1 1206 ASP 1206 ? ? ? A . A 1 1207 THR 1207 ? ? ? A . A 1 1208 VAL 1208 ? ? ? A . A 1 1209 TYR 1209 ? ? ? A . A 1 1210 MET 1210 ? ? ? A . A 1 1211 GLY 1211 ? ? ? A . A 1 1212 LYS 1212 ? ? ? A . A 1 1213 VAL 1213 ? ? ? A . A 1 1214 THR 1214 ? ? ? A . A 1 1215 PHE 1215 ? ? ? A . A 1 1216 SER 1216 ? ? ? A . A 1 1217 CYS 1217 ? ? ? A . A 1 1218 ALA 1218 ? ? ? A . A 1 1219 ALA 1219 ? ? ? A . A 1 1220 GLY 1220 ? ? ? A . A 1 1221 LEU 1221 ? ? ? A . A 1 1222 GLY 1222 ? ? ? A . A 1 1223 GLN 1223 ? ? ? A . A 1 1224 ARG 1224 ? ? ? A . A 1 1225 HIS 1225 ? ? ? A . A 1 1226 ARG 1226 ? ? ? A . A 1 1227 LEU 1227 ? ? ? A . A 1 1228 VAL 1228 ? ? ? A . A 1 1229 LEU 1229 ? ? ? A . A 1 1230 THR 1230 ? ? ? A . A 1 1231 GLN 1231 ? ? ? A . A 1 1232 GLU 1232 ? ? ? A . A 1 1233 GLN 1233 ? ? ? A . A 1 1234 LEU 1234 ? ? ? A . A 1 1235 HIS 1235 ? ? ? A . A 1 1236 GLN 1236 ? ? ? A . A 1 1237 LEU 1237 ? ? ? A . A 1 1238 HIS 1238 ? ? ? A . A 1 1239 SER 1239 ? ? ? A . A 1 1240 ARG 1240 ? ? ? A . A 1 1241 LEU 1241 ? ? ? A . A 1 1242 ILE 1242 ? ? ? A . A 1 1243 SER 1243 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Membrane-associated protein Vipp1 {PDB ID=8qi6, label_asym_id=A, auth_asym_id=D, SMTL ID=8qi6.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8qi6, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 D # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;DPEKVLEQAVIDMQEDLVQLRQAVARTIAEEKRTEQRLNQDTQEAKKWEDRAKLALTNGEENLAREALAR KKSLTDTAAAYQTQLAQQRTMSENLRRNLAALEAKISEAKTKKNMLQARAKAAKANAELQQTLGGLGTSS ATSAFERMENKVLDMEATSQAAGELAGFGIENQFAQLEASSGVEDELAALKA ; ;DPEKVLEQAVIDMQEDLVQLRQAVARTIAEEKRTEQRLNQDTQEAKKWEDRAKLALTNGEENLAREALAR KKSLTDTAAAYQTQLAQQRTMSENLRRNLAALEAKISEAKTKKNMLQARAKAAKANAELQQTLGGLGTSS ATSAFERMENKVLDMEATSQAAGELAGFGIENQFAQLEASSGVEDELAALKA ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 17 86 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8qi6 2024-10-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1243 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1245 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 4.700 13.235 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAQSRRHMSSRTPSGSRMSTEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKVLKREGADAAAKTSKLRGLKPKKAPTARKTTTRRPKPTRPASTGVAGPSSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPALTSPGAAPPLPSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRSEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEARKEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQVDAALGA--EEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDMAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKFDLSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDFLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDSTMQLADHIKFTQSALDCMGVEVGRLRAFLQGGQEATDIALLLRDLETSCSDTRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGSQVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVAAAAAQLIAPLAENEGLPVAALEELAFKASEQIYGSPSSSPYECLRQSCTILISTMNKLATAMQEGEYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKLDSAAKDADERIEKVQTRLDETQTLLRKKEKDFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQSKRTIEGLVKDSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILRGAQMKASLAALPPLHVAKLSLPPHEGPGGNLVAGALYRKTSQLLEKLNQLSTHTHVVDITRSSPAAKSPSAQLMEQVAQLKSLSDTIEKLKDEVLKETVTQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGLGQRHRLVLTQEQLHQLHSRLIS 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LVQLRQAVARTIAEEKRTEQRLNQDTQEAKKWEDRAKLALTNGEENLAREALARKKSLTDTAAAYQTQLA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8qi6.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . MET 395 395 ? A 365.373 258.883 373.148 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 2 C CA . MET 395 395 ? A 364.650 257.930 374.061 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 3 C C . MET 395 395 ? A 363.830 258.591 375.156 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 4 O O . MET 395 395 ? A 362.703 258.189 375.386 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 5 C CB . MET 395 395 ? A 365.645 256.873 374.602 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 6 C CG . MET 395 395 ? A 366.247 255.930 373.530 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 7 S SD . MET 395 395 ? A 365.028 254.944 372.597 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 8 C CE . MET 395 395 ? A 364.393 253.927 373.967 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 9 N N . GLU 396 396 ? A 364.310 259.678 375.794 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 10 C CA . GLU 396 396 ? A 363.511 260.470 376.713 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 11 C C . GLU 396 396 ? A 362.244 261.064 376.111 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 12 O O . GLU 396 396 ? A 361.174 260.981 376.699 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 13 C CB . GLU 396 396 ? A 364.411 261.572 377.263 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 14 C CG . GLU 396 396 ? A 365.535 261.003 378.154 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 15 C CD . GLU 396 396 ? A 366.462 262.117 378.626 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 16 O OE1 . GLU 396 396 ? A 366.329 263.253 378.106 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 17 O OE2 . GLU 396 396 ? A 367.323 261.806 379.483 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 18 N N . LYS 397 397 ? A 362.323 261.579 374.862 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 19 C CA . LYS 397 397 ? A 361.155 261.986 374.088 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 20 C C . LYS 397 397 ? A 360.141 260.858 373.892 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 21 O O . LYS 397 397 ? A 358.957 261.028 374.125 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 22 C CB . LYS 397 397 ? A 361.577 262.555 372.706 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 23 C CG . LYS 397 397 ? A 362.343 263.884 372.813 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 24 C CD . LYS 397 397 ? A 362.752 264.438 371.437 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 25 C CE . LYS 397 397 ? A 363.488 265.781 371.523 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 26 N NZ . LYS 397 397 ? A 363.895 266.232 370.173 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 27 N N . LYS 398 398 ? A 360.614 259.642 373.556 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 28 C CA . LYS 398 398 ? A 359.793 258.447 373.423 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 29 C C . LYS 398 398 ? A 359.105 258.033 374.721 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 30 O O . LYS 398 398 ? A 357.943 257.638 374.731 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 31 C CB . LYS 398 398 ? A 360.636 257.266 372.893 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 32 C CG . LYS 398 398 ? A 361.104 257.473 371.445 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 33 C CD . LYS 398 398 ? A 361.959 256.295 370.953 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 34 C CE . LYS 398 398 ? A 362.428 256.426 369.499 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 35 N NZ . LYS 398 398 ? A 363.282 255.274 369.120 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 36 N N . ASN 399 399 ? A 359.810 258.147 375.869 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 37 C CA . ASN 399 399 ? A 359.234 257.975 377.196 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 38 C C . ASN 399 399 ? A 358.125 258.977 377.491 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 39 O O . ASN 399 399 ? A 357.080 258.625 378.032 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 40 C CB . ASN 399 399 ? A 360.303 258.130 378.308 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 41 C CG . ASN 399 399 ? A 361.272 256.959 378.299 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 42 O OD1 . ASN 399 399 ? A 361.000 255.879 377.781 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 43 N ND2 . ASN 399 399 ? A 362.456 257.157 378.929 1 1 A ASN 0.680 1 ATOM 44 N N . GLN 400 400 ? A 358.321 260.257 377.109 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 45 C CA . GLN 400 400 ? A 357.292 261.278 377.167 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 46 C C . GLN 400 400 ? A 356.094 260.947 376.287 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 47 O O . GLN 400 400 ? A 354.960 260.990 376.749 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 48 C CB . GLN 400 400 ? A 357.863 262.667 376.783 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 49 C CG . GLN 400 400 ? A 358.882 263.210 377.810 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 50 C CD . GLN 400 400 ? A 359.546 264.499 377.324 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 51 O OE1 . GLN 400 400 ? A 359.741 264.744 376.135 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 52 N NE2 . GLN 400 400 ? A 359.948 265.359 378.291 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 53 N N . GLU 401 401 ? A 356.320 260.521 375.025 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 54 C CA . GLU 401 401 ? A 355.282 260.084 374.107 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 55 C C . GLU 401 401 ? A 354.478 258.912 374.649 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 56 O O . GLU 401 401 ? A 353.249 258.925 374.631 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 57 C CB . GLU 401 401 ? A 355.889 259.715 372.732 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 58 C CG . GLU 401 401 ? A 356.440 260.937 371.954 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 59 C CD . GLU 401 401 ? A 357.246 260.555 370.710 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 60 O OE1 . GLU 401 401 ? A 357.517 259.343 370.502 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 61 O OE2 . GLU 401 401 ? A 357.648 261.499 369.980 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 62 N N . LEU 402 402 ? A 355.154 257.901 375.233 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 63 C CA . LEU 402 402 ? A 354.513 256.780 375.893 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 64 C C . LEU 402 402 ? A 353.629 257.184 377.061 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 65 O O . LEU 402 402 ? A 352.496 256.723 377.185 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 66 C CB . LEU 402 402 ? A 355.577 255.802 376.440 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 67 C CG . LEU 402 402 ? A 355.029 254.576 377.207 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 68 C CD1 . LEU 402 402 ? A 354.144 253.688 376.317 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 69 C CD2 . LEU 402 402 ? A 356.189 253.779 377.822 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 70 N N . GLU 403 403 ? A 354.129 258.093 377.924 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 71 C CA . GLU 403 403 ? A 353.387 258.638 379.048 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 72 C C . GLU 403 403 ? A 352.146 259.415 378.610 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 73 O O . GLU 403 403 ? A 351.047 259.221 379.127 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 74 C CB . GLU 403 403 ? A 354.312 259.493 379.956 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 75 C CG . GLU 403 403 ? A 353.640 260.072 381.235 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 76 C CD . GLU 403 403 ? A 352.828 259.112 382.101 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 77 O OE1 . GLU 403 403 ? A 351.914 259.622 382.808 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 78 O OE2 . GLU 403 403 ? A 353.042 257.877 382.071 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 79 N N . VAL 404 404 ? A 352.261 260.259 377.562 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 80 C CA . VAL 404 404 ? A 351.131 260.952 376.950 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 81 C C . VAL 404 404 ? A 350.074 260.001 376.389 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 82 O O . VAL 404 404 ? A 348.873 260.185 376.604 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 83 C CB . VAL 404 404 ? A 351.610 261.858 375.817 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 84 C CG1 . VAL 404 404 ? A 350.447 262.437 374.977 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 85 C CG2 . VAL 404 404 ? A 352.440 263.017 376.400 1 1 A VAL 0.740 1 ATOM 86 N N . VAL 405 405 ? A 350.507 258.941 375.668 1 1 A VAL 0.780 1 ATOM 87 C CA . VAL 405 405 ? A 349.650 257.902 375.101 1 1 A VAL 0.780 1 ATOM 88 C C . VAL 405 405 ? A 348.910 257.126 376.165 1 1 A VAL 0.780 1 ATOM 89 O O . VAL 405 405 ? A 347.708 256.882 376.047 1 1 A VAL 0.780 1 ATOM 90 C CB . VAL 405 405 ? A 350.440 256.936 374.211 1 1 A VAL 0.780 1 ATOM 91 C CG1 . VAL 405 405 ? A 349.677 255.627 373.882 1 1 A VAL 0.780 1 ATOM 92 C CG2 . VAL 405 405 ? 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A 333.599 254.848 380.489 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 197 C CA . SER 417 417 ? A 333.092 254.347 381.750 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 198 C C . SER 417 417 ? A 332.021 255.233 382.356 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 199 O O . SER 417 417 ? A 330.989 254.767 382.826 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 200 C CB . SER 417 417 ? A 334.243 254.245 382.784 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 201 O OG . SER 417 417 ? A 335.161 253.200 382.461 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 202 N N . GLN 418 418 ? A 332.226 256.567 382.340 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 203 C CA . GLN 418 418 ? A 331.224 257.521 382.785 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 204 C C . GLN 418 418 ? A 329.991 257.594 381.921 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 205 O O . GLN 418 418 ? A 328.874 257.667 382.428 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 206 C CB . GLN 418 418 ? A 331.798 258.938 382.931 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 207 C CG . GLN 418 418 ? A 332.794 259.021 384.100 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 208 C CD . GLN 418 418 ? A 333.361 260.430 384.209 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 209 O OE1 . GLN 418 418 ? A 333.383 261.207 383.258 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 210 N NE2 . GLN 418 418 ? A 333.832 260.794 385.424 1 1 A GLN 0.720 1 ATOM 211 N N . ALA 419 419 ? A 330.154 257.549 380.589 1 1 A ALA 0.800 1 ATOM 212 C CA . ALA 419 419 ? A 329.054 257.481 379.667 1 1 A ALA 0.800 1 ATOM 213 C C . ALA 419 419 ? A 328.171 256.231 379.878 1 1 A ALA 0.800 1 ATOM 214 O O . ALA 419 419 ? A 326.955 256.365 379.950 1 1 A ALA 0.800 1 ATOM 215 C CB . ALA 419 419 ? A 329.640 257.580 378.250 1 1 A ALA 0.800 1 ATOM 216 N N . GLU 420 420 ? A 328.764 255.025 380.079 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 217 C CA . GLU 420 420 ? A 328.105 253.781 380.500 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 218 C C . GLU 420 420 ? A 327.377 253.884 381.824 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 219 O O . GLU 420 420 ? A 326.222 253.494 381.950 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 220 C CB . GLU 420 420 ? A 329.050 252.551 380.408 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 221 C CG . GLU 420 420 ? A 329.481 252.233 378.949 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 222 C CD . GLU 420 420 ? A 330.441 251.049 378.800 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 223 O OE1 . GLU 420 420 ? A 330.888 250.487 379.829 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 224 O OE2 . GLU 420 420 ? A 330.726 250.704 377.620 1 1 A GLU 0.700 1 ATOM 225 N N . SER 421 421 ? A 327.973 254.524 382.832 1 1 A SER 0.730 1 ATOM 226 C CA . SER 421 421 ? A 327.254 254.809 384.069 1 1 A SER 0.730 1 ATOM 227 C C . SER 421 421 ? A 326.041 255.725 383.902 1 1 A SER 0.730 1 ATOM 228 O O . SER 421 421 ? A 324.984 255.517 384.493 1 1 A SER 0.730 1 ATOM 229 C CB . SER 421 421 ? A 328.197 255.434 385.108 1 1 A SER 0.730 1 ATOM 230 O OG . SER 421 421 ? A 329.228 254.504 385.441 1 1 A SER 0.730 1 ATOM 231 N N . THR 422 422 ? A 326.152 256.767 383.054 1 1 A THR 0.740 1 ATOM 232 C CA . THR 422 422 ? A 325.035 257.632 382.654 1 1 A THR 0.740 1 ATOM 233 C C . THR 422 422 ? A 323.950 256.887 381.879 1 1 A THR 0.740 1 ATOM 234 O O . THR 422 422 ? A 322.762 257.161 382.029 1 1 A THR 0.740 1 ATOM 235 C CB . THR 422 422 ? A 325.469 258.859 381.858 1 1 A THR 0.740 1 ATOM 236 O OG1 . THR 422 422 ? A 326.365 259.648 382.623 1 1 A THR 0.740 1 ATOM 237 C CG2 . THR 422 422 ? A 324.302 259.799 381.513 1 1 A THR 0.740 1 ATOM 238 N N . ILE 423 423 ? A 324.327 255.896 381.035 1 1 A ILE 0.720 1 ATOM 239 C CA . ILE 423 423 ? A 323.413 254.959 380.368 1 1 A ILE 0.720 1 ATOM 240 C C . ILE 423 423 ? A 322.593 254.187 381.364 1 1 A ILE 0.720 1 ATOM 241 O O . ILE 423 423 ? A 321.373 254.108 381.268 1 1 A ILE 0.720 1 ATOM 242 C CB . ILE 423 423 ? A 324.162 253.962 379.474 1 1 A ILE 0.720 1 ATOM 243 C CG1 . ILE 423 423 ? A 324.786 254.728 378.322 1 1 A ILE 0.720 1 ATOM 244 C CG2 . ILE 423 423 ? A 323.247 252.902 378.847 1 1 A ILE 0.720 1 ATOM 245 C CD1 . ILE 423 423 ? A 325.922 254.067 377.555 1 1 A ILE 0.720 1 ATOM 246 N N . ASP 424 424 ? A 323.224 253.648 382.411 1 1 A ASP 0.670 1 ATOM 247 C CA . ASP 424 424 ? A 322.494 252.959 383.448 1 1 A ASP 0.670 1 ATOM 248 C C . ASP 424 424 ? A 321.480 253.847 384.165 1 1 A ASP 0.670 1 ATOM 249 O O . ASP 424 424 ? A 320.325 253.461 384.319 1 1 A ASP 0.670 1 ATOM 250 C CB . ASP 424 424 ? A 323.498 252.324 384.419 1 1 A ASP 0.670 1 ATOM 251 C CG . ASP 424 424 ? A 324.183 251.138 383.750 1 1 A ASP 0.670 1 ATOM 252 O OD1 . ASP 424 424 ? A 323.665 250.624 382.711 1 1 A ASP 0.670 1 ATOM 253 O OD2 . ASP 424 424 ? A 325.229 250.708 384.295 1 1 A ASP 0.670 1 ATOM 254 N N . GLU 425 425 ? A 321.857 255.102 384.495 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 255 C CA . GLU 425 425 ? A 320.968 256.089 385.099 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 256 C C . GLU 425 425 ? A 319.735 256.348 384.254 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 257 O O . GLU 425 425 ? A 318.592 256.278 384.691 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 258 C CB . GLU 425 425 ? A 321.736 257.430 385.292 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 259 C CG . GLU 425 425 ? A 320.891 258.664 385.708 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 260 C CD . GLU 425 425 ? A 320.199 258.581 387.064 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 261 O OE1 . GLU 425 425 ? A 319.119 259.231 387.151 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 262 O OE2 . GLU 425 425 ? A 320.758 257.963 387.998 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 263 N N . LEU 426 426 ? A 319.929 256.578 382.954 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 264 C CA . LEU 426 426 ? A 318.849 256.742 382.028 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 265 C C . LEU 426 426 ? A 317.968 255.513 381.841 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 266 O O . LEU 426 426 ? A 316.757 255.643 381.712 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 267 C CB . LEU 426 426 ? A 319.455 257.172 380.726 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 268 C CG . LEU 426 426 ? A 320.039 258.583 380.680 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 269 C CD1 . LEU 426 426 ? A 320.735 258.498 379.346 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 270 C CD2 . LEU 426 426 ? A 318.988 259.695 380.742 1 1 A LEU 0.700 1 ATOM 271 N N . LYS 427 427 ? A 318.530 254.285 381.867 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 272 C CA . LYS 427 427 ? A 317.769 253.041 381.990 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 273 C C . LYS 427 427 ? A 316.928 252.967 383.264 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 274 O O . LYS 427 427 ? 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A 319.376 253.912 388.886 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 288 O OE2 . GLU 428 428 ? A 320.127 251.833 388.675 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 289 N N . GLN 429 429 ? A 315.831 255.670 384.915 1 1 A GLN 0.590 1 ATOM 290 C CA . GLN 429 429 ? A 314.833 256.673 384.611 1 1 A GLN 0.590 1 ATOM 291 C C . GLN 429 429 ? A 313.704 256.077 383.775 1 1 A GLN 0.590 1 ATOM 292 O O . GLN 429 429 ? A 312.531 256.368 384.002 1 1 A GLN 0.590 1 ATOM 293 C CB . GLN 429 429 ? A 315.446 257.891 383.873 1 1 A GLN 0.590 1 ATOM 294 C CG . GLN 429 429 ? A 316.373 258.757 384.752 1 1 A GLN 0.590 1 ATOM 295 C CD . GLN 429 429 ? A 317.028 259.893 383.969 1 1 A GLN 0.590 1 ATOM 296 O OE1 . GLN 429 429 ? A 316.568 260.355 382.918 1 1 A GLN 0.590 1 ATOM 297 N NE2 . GLN 429 429 ? A 318.167 260.374 384.520 1 1 A GLN 0.590 1 ATOM 298 N N . VAL 430 430 ? A 314.056 255.194 382.802 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 299 C CA . VAL 430 430 ? A 313.116 254.414 381.998 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 300 C C . VAL 430 430 ? A 312.230 253.555 382.852 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 301 O O . VAL 430 430 ? A 311.014 253.641 382.759 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 302 C CB . VAL 430 430 ? A 313.764 253.502 380.961 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 303 C CG1 . VAL 430 430 ? A 312.715 252.672 380.219 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 304 C CG2 . VAL 430 430 ? A 314.420 254.334 379.878 1 1 A VAL 0.600 1 ATOM 305 N N . ASP 431 431 ? A 312.820 252.774 383.768 1 1 A ASP 0.530 1 ATOM 306 C CA . ASP 431 431 ? A 312.103 251.909 384.675 1 1 A ASP 0.530 1 ATOM 307 C C . ASP 431 431 ? A 311.121 252.678 385.571 1 1 A ASP 0.530 1 ATOM 308 O O . ASP 431 431 ? A 309.991 252.254 385.813 1 1 A ASP 0.530 1 ATOM 309 C CB . ASP 431 431 ? A 313.151 251.134 385.515 1 1 A ASP 0.530 1 ATOM 310 C CG . ASP 431 431 ? A 313.928 250.128 384.672 1 1 A ASP 0.530 1 ATOM 311 O OD1 . ASP 431 431 ? A 313.469 249.789 383.552 1 1 A ASP 0.530 1 ATOM 312 O OD2 . ASP 431 431 ? A 314.985 249.664 385.170 1 1 A ASP 0.530 1 ATOM 313 N N . ALA 432 432 ? 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A 304.218 254.378 385.186 1 1 A LEU 0.410 1 ATOM 327 C CB . LEU 434 434 ? A 306.354 252.352 385.495 1 1 A LEU 0.410 1 ATOM 328 C CG . LEU 434 434 ? A 305.455 251.102 385.436 1 1 A LEU 0.410 1 ATOM 329 C CD1 . LEU 434 434 ? A 305.767 250.224 384.210 1 1 A LEU 0.410 1 ATOM 330 C CD2 . LEU 434 434 ? A 305.588 250.302 386.742 1 1 A LEU 0.410 1 ATOM 331 N N . GLY 435 435 ? A 304.171 253.771 383.021 1 1 A GLY 0.360 1 ATOM 332 C CA . GLY 435 435 ? A 302.864 254.367 382.759 1 1 A GLY 0.360 1 ATOM 333 C C . GLY 435 435 ? A 302.958 255.664 382.005 1 1 A GLY 0.360 1 ATOM 334 O O . GLY 435 435 ? A 301.946 256.296 381.727 1 1 A GLY 0.360 1 ATOM 335 N N . ALA 436 436 ? A 304.184 256.067 381.618 1 1 A ALA 0.480 1 ATOM 336 C CA . ALA 436 436 ? A 304.441 257.210 380.784 1 1 A ALA 0.480 1 ATOM 337 C C . ALA 436 436 ? A 305.427 256.779 379.700 1 1 A ALA 0.480 1 ATOM 338 O O . ALA 436 436 ? A 306.519 257.315 379.601 1 1 A ALA 0.480 1 ATOM 339 C CB . ALA 436 436 ? A 305.037 258.396 381.586 1 1 A ALA 0.480 1 ATOM 340 N N . GLU 437 437 ? A 305.044 255.773 378.862 1 1 A GLU 0.460 1 ATOM 341 C CA . GLU 437 437 ? A 305.820 255.200 377.759 1 1 A GLU 0.460 1 ATOM 342 C C . GLU 437 437 ? A 306.580 256.187 376.865 1 1 A GLU 0.460 1 ATOM 343 O O . GLU 437 437 ? A 307.711 255.949 376.480 1 1 A GLU 0.460 1 ATOM 344 C CB . GLU 437 437 ? A 304.951 254.289 376.865 1 1 A GLU 0.460 1 ATOM 345 C CG . GLU 437 437 ? A 304.569 252.953 377.544 1 1 A GLU 0.460 1 ATOM 346 C CD . GLU 437 437 ? A 303.630 252.100 376.689 1 1 A GLU 0.460 1 ATOM 347 O OE1 . GLU 437 437 ? A 303.118 252.604 375.661 1 1 A GLU 0.460 1 ATOM 348 O OE2 . GLU 437 437 ? A 303.394 250.938 377.110 1 1 A GLU 0.460 1 ATOM 349 N N . GLU 438 438 ? A 306.008 257.373 376.588 1 1 A GLU 0.450 1 ATOM 350 C CA . GLU 438 438 ? A 306.676 258.476 375.919 1 1 A GLU 0.450 1 ATOM 351 C C . GLU 438 438 ? A 308.012 258.870 376.552 1 1 A GLU 0.450 1 ATOM 352 O O . GLU 438 438 ? A 309.056 258.897 375.905 1 1 A GLU 0.450 1 ATOM 353 C CB . GLU 438 438 ? A 305.724 259.691 375.968 1 1 A GLU 0.450 1 ATOM 354 C CG . GLU 438 438 ? A 306.246 260.936 375.215 1 1 A GLU 0.450 1 ATOM 355 C CD . GLU 438 438 ? A 305.274 262.115 375.260 1 1 A GLU 0.450 1 ATOM 356 O OE1 . GLU 438 438 ? A 304.197 261.989 375.898 1 1 A GLU 0.450 1 ATOM 357 O OE2 . GLU 438 438 ? A 305.623 263.158 374.652 1 1 A GLU 0.450 1 ATOM 358 N N . MET 439 439 ? A 308.023 259.080 377.886 1 1 A MET 0.500 1 ATOM 359 C CA . MET 439 439 ? A 309.219 259.344 378.661 1 1 A MET 0.500 1 ATOM 360 C C . MET 439 439 ? A 310.195 258.172 378.634 1 1 A MET 0.500 1 ATOM 361 O O . MET 439 439 ? A 311.396 258.370 378.475 1 1 A MET 0.500 1 ATOM 362 C CB . MET 439 439 ? A 308.870 259.756 380.120 1 1 A MET 0.500 1 ATOM 363 C CG . MET 439 439 ? A 308.169 261.128 380.234 1 1 A MET 0.500 1 ATOM 364 S SD . MET 439 439 ? A 309.128 262.521 379.550 1 1 A MET 0.500 1 ATOM 365 C CE . MET 439 439 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #