data_SMR-07676af3e5ed8b1437c8c7264e928934_3 _entry.id SMR-07676af3e5ed8b1437c8c7264e928934_3 _struct.entry_id SMR-07676af3e5ed8b1437c8c7264e928934_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P70424/ ERBB2_MOUSE, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P70424' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 161340.588 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ERBB2_MOUSE P70424 1 ;MELAAWCRWGFLLALLSPGAAGTQVCTGTDMKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQGNLELTYLPANAS LSFLQDIQEVQGYMLIAHNRVKHVPLQRLRIVRGTQLFEDKYALAVLDNRDPLDNVTTAAPGRTPEGLRE LQLRSLTEILKGGVLIRGNPQLCYQDMVLWKDVLRKNNQLAPVDMDTNRSRACPPCAPTCKDNHCWGESP EDCQILTGTICTSGCARCKGRLPTDCCHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALITYNTDTF ESMLNPEGRYTFGASCVTTCPYNYLSTEVGSCTLVCPPNNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCAGVCYGLGMEH LRGARAITSDNIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGNPSSGVAPLKPEHLQVFETLEEITGYLYISAWPESF QDLSVFQNLRVIRGRILHDGAYSLTLQGLGIHSLGLRSLRELGSGLALIHRNTHLCFVNTVPWDQLFRNP HQALLHSGNRPEEACGLEGLVCNSLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLRGQECVEECRVWKGLPREYVRGKH CLPCHPECQPQNSSETCYGSEADQCEACAHYKDSSSCVARCPSGVKPDLSYMPIWKYPDEEGICQPCPIN CTHSCVDLDERGCPAEQRASPVTFIIATVVGVLLFLIIVVVIGILIKRRRQKIRKYTMRRLLQETELVEP LTPSGAVPNQAQMRILKETELRKLKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANKEILD EAYVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVREHRGRLGSQDLLNWCVQIAKGMSYLEEV RLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGGKVPIKWMALESILRRRFTHQSDVWSYG VTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRM ARDPQRFVVIQNEDLGPSSPMDSTFYRSLLEDDDMGELVDAEEYLVPQQGFFSPDPALGTGSTAHRRHRS SSARSGGGELTLGLEPSEEEPPRSPLAPSEGAGSDVFDGDLAVGVTKGLQSLSPHDLSPLQRYSEDPTLP LPPETDGYVAPLACSPQPEYVNQPEVRPQSPLTPEGPPPPIRPAGATLERPKTLSPGKNGVVKDVFAFGG AVENPEYLAPRAGTASQPHPSPAFSPAFDNLYYWDQNSSEQGPPPSTFEGTPTAENPEYLGLDVPV ; 'Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1256 1 1256 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ERBB2_MOUSE P70424 . 1 1256 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2005-09-27 6040978428B93A28 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MELAAWCRWGFLLALLSPGAAGTQVCTGTDMKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQGNLELTYLPANAS LSFLQDIQEVQGYMLIAHNRVKHVPLQRLRIVRGTQLFEDKYALAVLDNRDPLDNVTTAAPGRTPEGLRE LQLRSLTEILKGGVLIRGNPQLCYQDMVLWKDVLRKNNQLAPVDMDTNRSRACPPCAPTCKDNHCWGESP EDCQILTGTICTSGCARCKGRLPTDCCHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALITYNTDTF ESMLNPEGRYTFGASCVTTCPYNYLSTEVGSCTLVCPPNNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCAGVCYGLGMEH LRGARAITSDNIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGNPSSGVAPLKPEHLQVFETLEEITGYLYISAWPESF QDLSVFQNLRVIRGRILHDGAYSLTLQGLGIHSLGLRSLRELGSGLALIHRNTHLCFVNTVPWDQLFRNP HQALLHSGNRPEEACGLEGLVCNSLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLRGQECVEECRVWKGLPREYVRGKH CLPCHPECQPQNSSETCYGSEADQCEACAHYKDSSSCVARCPSGVKPDLSYMPIWKYPDEEGICQPCPIN CTHSCVDLDERGCPAEQRASPVTFIIATVVGVLLFLIIVVVIGILIKRRRQKIRKYTMRRLLQETELVEP LTPSGAVPNQAQMRILKETELRKLKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANKEILD EAYVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVREHRGRLGSQDLLNWCVQIAKGMSYLEEV RLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGGKVPIKWMALESILRRRFTHQSDVWSYG VTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRM ARDPQRFVVIQNEDLGPSSPMDSTFYRSLLEDDDMGELVDAEEYLVPQQGFFSPDPALGTGSTAHRRHRS SSARSGGGELTLGLEPSEEEPPRSPLAPSEGAGSDVFDGDLAVGVTKGLQSLSPHDLSPLQRYSEDPTLP LPPETDGYVAPLACSPQPEYVNQPEVRPQSPLTPEGPPPPIRPAGATLERPKTLSPGKNGVVKDVFAFGG AVENPEYLAPRAGTASQPHPSPAFSPAFDNLYYWDQNSSEQGPPPSTFEGTPTAENPEYLGLDVPV ; ;MELAAWCRWGFLLALLSPGAAGTQVCTGTDMKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQGNLELTYLPANAS LSFLQDIQEVQGYMLIAHNRVKHVPLQRLRIVRGTQLFEDKYALAVLDNRDPLDNVTTAAPGRTPEGLRE LQLRSLTEILKGGVLIRGNPQLCYQDMVLWKDVLRKNNQLAPVDMDTNRSRACPPCAPTCKDNHCWGESP EDCQILTGTICTSGCARCKGRLPTDCCHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALITYNTDTF ESMLNPEGRYTFGASCVTTCPYNYLSTEVGSCTLVCPPNNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCAGVCYGLGMEH LRGARAITSDNIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGNPSSGVAPLKPEHLQVFETLEEITGYLYISAWPESF QDLSVFQNLRVIRGRILHDGAYSLTLQGLGIHSLGLRSLRELGSGLALIHRNTHLCFVNTVPWDQLFRNP HQALLHSGNRPEEACGLEGLVCNSLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLRGQECVEECRVWKGLPREYVRGKH CLPCHPECQPQNSSETCYGSEADQCEACAHYKDSSSCVARCPSGVKPDLSYMPIWKYPDEEGICQPCPIN CTHSCVDLDERGCPAEQRASPVTFIIATVVGVLLFLIIVVVIGILIKRRRQKIRKYTMRRLLQETELVEP LTPSGAVPNQAQMRILKETELRKLKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANKEILD EAYVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVREHRGRLGSQDLLNWCVQIAKGMSYLEEV RLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGGKVPIKWMALESILRRRFTHQSDVWSYG VTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRM ARDPQRFVVIQNEDLGPSSPMDSTFYRSLLEDDDMGELVDAEEYLVPQQGFFSPDPALGTGSTAHRRHRS SSARSGGGELTLGLEPSEEEPPRSPLAPSEGAGSDVFDGDLAVGVTKGLQSLSPHDLSPLQRYSEDPTLP LPPETDGYVAPLACSPQPEYVNQPEVRPQSPLTPEGPPPPIRPAGATLERPKTLSPGKNGVVKDVFAFGG AVENPEYLAPRAGTASQPHPSPAFSPAFDNLYYWDQNSSEQGPPPSTFEGTPTAENPEYLGLDVPV ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 GLU . 1 3 LEU . 1 4 ALA . 1 5 ALA . 1 6 TRP . 1 7 CYS . 1 8 ARG . 1 9 TRP . 1 10 GLY . 1 11 PHE . 1 12 LEU . 1 13 LEU . 1 14 ALA . 1 15 LEU . 1 16 LEU . 1 17 SER . 1 18 PRO . 1 19 GLY . 1 20 ALA . 1 21 ALA . 1 22 GLY . 1 23 THR . 1 24 GLN . 1 25 VAL . 1 26 CYS . 1 27 THR . 1 28 GLY . 1 29 THR . 1 30 ASP . 1 31 MET . 1 32 LYS . 1 33 LEU . 1 34 ARG . 1 35 LEU . 1 36 PRO . 1 37 ALA . 1 38 SER . 1 39 PRO . 1 40 GLU . 1 41 THR . 1 42 HIS . 1 43 LEU . 1 44 ASP . 1 45 MET . 1 46 LEU . 1 47 ARG . 1 48 HIS . 1 49 LEU . 1 50 TYR . 1 51 GLN . 1 52 GLY . 1 53 CYS . 1 54 GLN . 1 55 VAL . 1 56 VAL . 1 57 GLN . 1 58 GLY . 1 59 ASN . 1 60 LEU . 1 61 GLU . 1 62 LEU . 1 63 THR . 1 64 TYR . 1 65 LEU . 1 66 PRO . 1 67 ALA . 1 68 ASN . 1 69 ALA . 1 70 SER . 1 71 LEU . 1 72 SER . 1 73 PHE . 1 74 LEU . 1 75 GLN . 1 76 ASP . 1 77 ILE . 1 78 GLN . 1 79 GLU . 1 80 VAL . 1 81 GLN . 1 82 GLY . 1 83 TYR . 1 84 MET . 1 85 LEU . 1 86 ILE . 1 87 ALA . 1 88 HIS . 1 89 ASN . 1 90 ARG . 1 91 VAL . 1 92 LYS . 1 93 HIS . 1 94 VAL . 1 95 PRO . 1 96 LEU . 1 97 GLN . 1 98 ARG . 1 99 LEU . 1 100 ARG . 1 101 ILE . 1 102 VAL . 1 103 ARG . 1 104 GLY . 1 105 THR . 1 106 GLN . 1 107 LEU . 1 108 PHE . 1 109 GLU . 1 110 ASP . 1 111 LYS . 1 112 TYR . 1 113 ALA . 1 114 LEU . 1 115 ALA . 1 116 VAL . 1 117 LEU . 1 118 ASP . 1 119 ASN . 1 120 ARG . 1 121 ASP . 1 122 PRO . 1 123 LEU . 1 124 ASP . 1 125 ASN . 1 126 VAL . 1 127 THR . 1 128 THR . 1 129 ALA . 1 130 ALA . 1 131 PRO . 1 132 GLY . 1 133 ARG . 1 134 THR . 1 135 PRO . 1 136 GLU . 1 137 GLY . 1 138 LEU . 1 139 ARG . 1 140 GLU . 1 141 LEU . 1 142 GLN . 1 143 LEU . 1 144 ARG . 1 145 SER . 1 146 LEU . 1 147 THR . 1 148 GLU . 1 149 ILE . 1 150 LEU . 1 151 LYS . 1 152 GLY . 1 153 GLY . 1 154 VAL . 1 155 LEU . 1 156 ILE . 1 157 ARG . 1 158 GLY . 1 159 ASN . 1 160 PRO . 1 161 GLN . 1 162 LEU . 1 163 CYS . 1 164 TYR . 1 165 GLN . 1 166 ASP . 1 167 MET . 1 168 VAL . 1 169 LEU . 1 170 TRP . 1 171 LYS . 1 172 ASP 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A 1 1028 GLN 1028 ? ? ? A . A 1 1029 GLN 1029 ? ? ? A . A 1 1030 GLY 1030 ? ? ? A . A 1 1031 PHE 1031 ? ? ? A . A 1 1032 PHE 1032 ? ? ? A . A 1 1033 SER 1033 ? ? ? A . A 1 1034 PRO 1034 ? ? ? A . A 1 1035 ASP 1035 ? ? ? A . A 1 1036 PRO 1036 ? ? ? A . A 1 1037 ALA 1037 ? ? ? A . A 1 1038 LEU 1038 ? ? ? A . A 1 1039 GLY 1039 ? ? ? A . A 1 1040 THR 1040 ? ? ? A . A 1 1041 GLY 1041 ? ? ? A . A 1 1042 SER 1042 ? ? ? A . A 1 1043 THR 1043 ? ? ? A . A 1 1044 ALA 1044 ? ? ? A . A 1 1045 HIS 1045 ? ? ? A . A 1 1046 ARG 1046 ? ? ? A . A 1 1047 ARG 1047 ? ? ? A . A 1 1048 HIS 1048 ? ? ? A . A 1 1049 ARG 1049 ? ? ? A . A 1 1050 SER 1050 ? ? ? A . A 1 1051 SER 1051 ? ? ? A . A 1 1052 SER 1052 ? ? ? A . A 1 1053 ALA 1053 ? ? ? A . A 1 1054 ARG 1054 ? ? ? A . A 1 1055 SER 1055 ? ? ? A . A 1 1056 GLY 1056 ? ? ? A . A 1 1057 GLY 1057 ? ? ? A . A 1 1058 GLY 1058 ? ? ? A . A 1 1059 GLU 1059 ? ? ? A . A 1 1060 LEU 1060 ? ? ? A . A 1 1061 THR 1061 ? ? ? A . A 1 1062 LEU 1062 ? ? ? A . A 1 1063 GLY 1063 ? ? ? A . A 1 1064 LEU 1064 ? ? ? A . A 1 1065 GLU 1065 ? ? ? A . A 1 1066 PRO 1066 ? ? ? A . A 1 1067 SER 1067 ? ? ? A . A 1 1068 GLU 1068 ? ? ? A . A 1 1069 GLU 1069 ? ? ? A . A 1 1070 GLU 1070 ? ? ? A . A 1 1071 PRO 1071 ? ? ? A . A 1 1072 PRO 1072 ? ? ? A . A 1 1073 ARG 1073 ? ? ? A . A 1 1074 SER 1074 ? ? ? A . A 1 1075 PRO 1075 ? ? ? A . A 1 1076 LEU 1076 ? ? ? A . A 1 1077 ALA 1077 ? ? ? A . A 1 1078 PRO 1078 ? ? ? A . A 1 1079 SER 1079 ? ? ? A . A 1 1080 GLU 1080 ? ? ? A . A 1 1081 GLY 1081 ? ? ? A . A 1 1082 ALA 1082 ? ? ? A . A 1 1083 GLY 1083 ? ? ? A . A 1 1084 SER 1084 ? ? ? A . A 1 1085 ASP 1085 ? ? ? A . A 1 1086 VAL 1086 ? ? ? A . A 1 1087 PHE 1087 ? ? ? A . A 1 1088 ASP 1088 ? ? ? A . A 1 1089 GLY 1089 ? ? ? A . A 1 1090 ASP 1090 ? ? ? A . A 1 1091 LEU 1091 ? ? ? A . A 1 1092 ALA 1092 ? ? ? A . A 1 1093 VAL 1093 ? ? ? A . A 1 1094 GLY 1094 ? ? ? A . A 1 1095 VAL 1095 ? ? ? A . A 1 1096 THR 1096 ? ? ? A . A 1 1097 LYS 1097 ? ? ? A . A 1 1098 GLY 1098 ? ? ? A . A 1 1099 LEU 1099 ? ? ? A . A 1 1100 GLN 1100 ? ? ? A . A 1 1101 SER 1101 ? ? ? A . A 1 1102 LEU 1102 ? ? ? A . A 1 1103 SER 1103 ? ? ? A . A 1 1104 PRO 1104 ? ? ? A . A 1 1105 HIS 1105 ? ? ? A . A 1 1106 ASP 1106 ? ? ? A . A 1 1107 LEU 1107 ? ? ? A . A 1 1108 SER 1108 ? ? ? A . A 1 1109 PRO 1109 ? ? ? A . A 1 1110 LEU 1110 ? ? ? A . A 1 1111 GLN 1111 ? ? ? A . A 1 1112 ARG 1112 ? ? ? A . A 1 1113 TYR 1113 ? ? ? A . A 1 1114 SER 1114 ? ? ? A . A 1 1115 GLU 1115 ? ? ? A . A 1 1116 ASP 1116 ? ? ? A . A 1 1117 PRO 1117 ? ? ? A . A 1 1118 THR 1118 ? ? ? A . A 1 1119 LEU 1119 ? ? ? A . A 1 1120 PRO 1120 ? ? ? A . A 1 1121 LEU 1121 ? ? ? A . A 1 1122 PRO 1122 ? ? ? A . A 1 1123 PRO 1123 ? ? ? A . A 1 1124 GLU 1124 ? ? ? A . A 1 1125 THR 1125 ? ? ? A . A 1 1126 ASP 1126 ? ? ? A . A 1 1127 GLY 1127 ? ? ? A . A 1 1128 TYR 1128 ? ? ? A . A 1 1129 VAL 1129 ? ? ? A . A 1 1130 ALA 1130 ? ? ? A . A 1 1131 PRO 1131 ? ? ? A . A 1 1132 LEU 1132 ? ? ? A . A 1 1133 ALA 1133 ? ? ? A . A 1 1134 CYS 1134 ? ? ? A . A 1 1135 SER 1135 ? ? ? A . A 1 1136 PRO 1136 ? ? ? A . A 1 1137 GLN 1137 ? ? ? A . A 1 1138 PRO 1138 ? ? ? A . A 1 1139 GLU 1139 ? ? ? A . A 1 1140 TYR 1140 ? ? ? A . A 1 1141 VAL 1141 ? ? ? A . A 1 1142 ASN 1142 ? ? ? A . A 1 1143 GLN 1143 ? ? ? A . A 1 1144 PRO 1144 ? ? ? A . A 1 1145 GLU 1145 ? ? ? A . A 1 1146 VAL 1146 ? ? ? A . A 1 1147 ARG 1147 ? ? ? A . A 1 1148 PRO 1148 ? ? ? A . A 1 1149 GLN 1149 ? ? ? A . A 1 1150 SER 1150 ? ? ? A . A 1 1151 PRO 1151 ? ? ? A . A 1 1152 LEU 1152 ? ? ? A . A 1 1153 THR 1153 ? ? ? A . A 1 1154 PRO 1154 ? ? ? A . A 1 1155 GLU 1155 ? ? ? A . A 1 1156 GLY 1156 ? ? ? A . A 1 1157 PRO 1157 ? ? ? A . A 1 1158 PRO 1158 ? ? ? A . A 1 1159 PRO 1159 ? ? ? A . A 1 1160 PRO 1160 ? ? ? A . A 1 1161 ILE 1161 ? ? ? A . A 1 1162 ARG 1162 ? ? ? A . A 1 1163 PRO 1163 ? ? ? A . A 1 1164 ALA 1164 ? ? ? A . A 1 1165 GLY 1165 ? ? ? A . A 1 1166 ALA 1166 ? ? ? A . A 1 1167 THR 1167 ? ? ? A . A 1 1168 LEU 1168 ? ? ? A . A 1 1169 GLU 1169 ? ? ? A . A 1 1170 ARG 1170 ? ? ? A . A 1 1171 PRO 1171 ? ? ? A . A 1 1172 LYS 1172 ? ? ? A . A 1 1173 THR 1173 ? ? ? A . A 1 1174 LEU 1174 ? ? ? A . A 1 1175 SER 1175 ? ? ? A . A 1 1176 PRO 1176 ? ? ? A . A 1 1177 GLY 1177 ? ? ? A . A 1 1178 LYS 1178 ? ? ? A . A 1 1179 ASN 1179 ? ? ? A . A 1 1180 GLY 1180 ? ? ? A . A 1 1181 VAL 1181 ? ? ? A . A 1 1182 VAL 1182 ? ? ? A . A 1 1183 LYS 1183 ? ? ? A . A 1 1184 ASP 1184 ? ? ? A . A 1 1185 VAL 1185 ? ? ? A . A 1 1186 PHE 1186 ? ? ? A . A 1 1187 ALA 1187 ? ? ? A . A 1 1188 PHE 1188 ? ? ? A . A 1 1189 GLY 1189 ? ? ? A . A 1 1190 GLY 1190 ? ? ? A . A 1 1191 ALA 1191 ? ? ? A . A 1 1192 VAL 1192 ? ? ? A . A 1 1193 GLU 1193 ? ? ? A . A 1 1194 ASN 1194 ? ? ? A . A 1 1195 PRO 1195 ? ? ? A . A 1 1196 GLU 1196 ? ? ? A . A 1 1197 TYR 1197 ? ? ? A . A 1 1198 LEU 1198 ? ? ? A . A 1 1199 ALA 1199 ? ? ? A . A 1 1200 PRO 1200 ? ? ? A . A 1 1201 ARG 1201 ? ? ? A . A 1 1202 ALA 1202 ? ? ? A . A 1 1203 GLY 1203 ? ? ? A . A 1 1204 THR 1204 ? ? ? A . A 1 1205 ALA 1205 ? ? ? A . A 1 1206 SER 1206 ? ? ? A . A 1 1207 GLN 1207 ? ? ? A . A 1 1208 PRO 1208 ? ? ? A . A 1 1209 HIS 1209 ? ? ? A . A 1 1210 PRO 1210 ? ? ? A . A 1 1211 SER 1211 ? ? ? A . A 1 1212 PRO 1212 ? ? ? A . A 1 1213 ALA 1213 ? ? ? A . A 1 1214 PHE 1214 ? ? ? A . A 1 1215 SER 1215 ? ? ? A . A 1 1216 PRO 1216 ? ? ? A . A 1 1217 ALA 1217 ? ? ? A . A 1 1218 PHE 1218 ? ? ? A . A 1 1219 ASP 1219 ? ? ? A . A 1 1220 ASN 1220 ? ? ? A . A 1 1221 LEU 1221 ? ? ? A . A 1 1222 TYR 1222 ? ? ? A . A 1 1223 TYR 1223 ? ? ? A . A 1 1224 TRP 1224 ? ? ? A . A 1 1225 ASP 1225 ? ? ? A . A 1 1226 GLN 1226 ? ? ? A . A 1 1227 ASN 1227 ? ? ? A . A 1 1228 SER 1228 ? ? ? A . A 1 1229 SER 1229 ? ? ? A . A 1 1230 GLU 1230 ? ? ? A . A 1 1231 GLN 1231 ? ? ? A . A 1 1232 GLY 1232 ? ? ? A . A 1 1233 PRO 1233 ? ? ? A . A 1 1234 PRO 1234 ? ? ? A . A 1 1235 PRO 1235 ? ? ? A . A 1 1236 SER 1236 ? ? ? A . A 1 1237 THR 1237 ? ? ? A . A 1 1238 PHE 1238 ? ? ? A . A 1 1239 GLU 1239 ? ? ? A . A 1 1240 GLY 1240 ? ? ? A . A 1 1241 THR 1241 ? ? ? A . A 1 1242 PRO 1242 ? ? ? A . A 1 1243 THR 1243 ? ? ? A . A 1 1244 ALA 1244 ? ? ? A . A 1 1245 GLU 1245 ? ? ? A . A 1 1246 ASN 1246 ? ? ? A . A 1 1247 PRO 1247 ? ? ? A . A 1 1248 GLU 1248 ? ? ? A . A 1 1249 TYR 1249 ? ? ? A . A 1 1250 LEU 1250 ? ? ? A . A 1 1251 GLY 1251 ? ? ? A . A 1 1252 LEU 1252 ? ? ? A . A 1 1253 ASP 1253 ? ? ? A . A 1 1254 VAL 1254 ? ? ? A . A 1 1255 PRO 1255 ? ? ? A . A 1 1256 VAL 1256 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'ERBB-2 RECEPTOR PROTEIN-TYROSINE KINASE {PDB ID=1iij, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=1iij.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 1iij, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 EQRASPVTFIIATVVGVLLFLILVVVVGILIKRRR EQRASPVTFIIATVVGVLLFLILVVVVGILIKRRR # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 4 33 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1iij 2024-05-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1256 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1256 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.340 93.333 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MELAAWCRWGFLLALLSPGAAGTQVCTGTDMKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQGNLELTYLPANASLSFLQDIQEVQGYMLIAHNRVKHVPLQRLRIVRGTQLFEDKYALAVLDNRDPLDNVTTAAPGRTPEGLRELQLRSLTEILKGGVLIRGNPQLCYQDMVLWKDVLRKNNQLAPVDMDTNRSRACPPCAPTCKDNHCWGESPEDCQILTGTICTSGCARCKGRLPTDCCHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALITYNTDTFESMLNPEGRYTFGASCVTTCPYNYLSTEVGSCTLVCPPNNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCAGVCYGLGMEHLRGARAITSDNIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGNPSSGVAPLKPEHLQVFETLEEITGYLYISAWPESFQDLSVFQNLRVIRGRILHDGAYSLTLQGLGIHSLGLRSLRELGSGLALIHRNTHLCFVNTVPWDQLFRNPHQALLHSGNRPEEACGLEGLVCNSLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLRGQECVEECRVWKGLPREYVRGKHCLPCHPECQPQNSSETCYGSEADQCEACAHYKDSSSCVARCPSGVKPDLSYMPIWKYPDEEGICQPCPINCTHSCVDLDERGCPAEQRASPVTFIIATVVGVLLFLIIVVVIGILIKRRRQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTPSGAVPNQAQMRILKETELRKLKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANKEILDEAYVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVREHRGRLGSQDLLNWCVQIAKGMSYLEEVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGGKVPIKWMALESILRRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQNEDLGPSSPMDSTFYRSLLEDDDMGELVDAEEYLVPQQGFFSPDPALGTGSTAHRRHRSSSARSGGGELTLGLEPSEEEPPRSPLAPSEGAGSDVFDGDLAVGVTKGLQSLSPHDLSPLQRYSEDPTLPLPPETDGYVAPLACSPQPEYVNQPEVRPQSPLTPEGPPPPIRPAGATLERPKTLSPGKNGVVKDVFAFGGAVENPEYLAPRAGTASQPHPSPAFSPAFDNLYYWDQNSSEQGPPPSTFEGTPTAENPEYLGLDVPV 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ASPVTFIIATVVGVLLFLILVVVVGILIKR-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1iij.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ALA 649 649 ? A 5.576 -0.302 -2.078 1 1 A ALA 0.930 1 ATOM 2 C CA . ALA 649 649 ? A 6.085 -0.031 -3.457 1 1 A ALA 0.930 1 ATOM 3 C C . ALA 649 649 ? A 7.506 0.531 -3.499 1 1 A ALA 0.930 1 ATOM 4 O O . ALA 649 649 ? A 8.361 -0.102 -4.064 1 1 A ALA 0.930 1 ATOM 5 C CB . ALA 649 649 ? A 5.030 0.783 -4.237 1 1 A ALA 0.930 1 ATOM 6 N N . SER 650 650 ? A 7.835 1.654 -2.802 1 1 A SER 0.930 1 ATOM 7 C CA . SER 650 650 ? A 9.186 2.236 -2.846 1 1 A SER 0.930 1 ATOM 8 C C . SER 650 650 ? A 10.328 1.281 -2.441 1 1 A SER 0.930 1 ATOM 9 O O . SER 650 650 ? A 11.292 1.192 -3.202 1 1 A SER 0.930 1 ATOM 10 C CB . SER 650 650 ? A 9.225 3.573 -2.042 1 1 A SER 0.930 1 ATOM 11 O OG . SER 650 650 ? A 10.489 4.222 -2.138 1 1 A SER 0.930 1 ATOM 12 N N . PRO 651 651 ? A 10.289 0.471 -1.367 1 1 A PRO 0.660 1 ATOM 13 C CA . PRO 651 651 ? A 11.419 -0.398 -1.052 1 1 A PRO 0.660 1 ATOM 14 C C . PRO 651 651 ? A 11.508 -1.585 -1.995 1 1 A PRO 0.660 1 ATOM 15 O O . PRO 651 651 ? A 12.612 -2.009 -2.319 1 1 A PRO 0.660 1 ATOM 16 C CB . PRO 651 651 ? A 11.220 -0.805 0.421 1 1 A PRO 0.660 1 ATOM 17 C CG . PRO 651 651 ? A 9.756 -0.481 0.731 1 1 A PRO 0.660 1 ATOM 18 C CD . PRO 651 651 ? A 9.486 0.715 -0.175 1 1 A PRO 0.660 1 ATOM 19 N N . VAL 652 652 ? A 10.366 -2.126 -2.470 1 1 A VAL 0.770 1 ATOM 20 C CA . VAL 652 652 ? A 10.308 -3.176 -3.481 1 1 A VAL 0.770 1 ATOM 21 C C . VAL 652 652 ? A 10.932 -2.720 -4.805 1 1 A VAL 0.770 1 ATOM 22 O O . VAL 652 652 ? A 11.736 -3.432 -5.397 1 1 A VAL 0.770 1 ATOM 23 C CB . VAL 652 652 ? A 8.881 -3.716 -3.642 1 1 A VAL 0.770 1 ATOM 24 C CG1 . VAL 652 652 ? A 8.757 -4.708 -4.817 1 1 A VAL 0.770 1 ATOM 25 C CG2 . VAL 652 652 ? A 8.500 -4.447 -2.336 1 1 A VAL 0.770 1 ATOM 26 N N . THR 653 653 ? A 10.646 -1.477 -5.259 1 1 A THR 0.730 1 ATOM 27 C CA . THR 653 653 ? A 11.262 -0.851 -6.434 1 1 A THR 0.730 1 ATOM 28 C C . THR 653 653 ? A 12.760 -0.679 -6.286 1 1 A THR 0.730 1 ATOM 29 O O . THR 653 653 ? A 13.522 -0.949 -7.214 1 1 A THR 0.730 1 ATOM 30 C CB . THR 653 653 ? A 10.624 0.487 -6.786 1 1 A THR 0.730 1 ATOM 31 O OG1 . THR 653 653 ? A 9.239 0.280 -7.008 1 1 A THR 0.730 1 ATOM 32 C CG2 . THR 653 653 ? A 11.168 1.101 -8.087 1 1 A THR 0.730 1 ATOM 33 N N . PHE 654 654 ? A 13.240 -0.282 -5.085 1 1 A PHE 0.700 1 ATOM 34 C CA . PHE 654 654 ? A 14.655 -0.238 -4.753 1 1 A PHE 0.700 1 ATOM 35 C C . PHE 654 654 ? A 15.308 -1.629 -4.840 1 1 A PHE 0.700 1 ATOM 36 O O . PHE 654 654 ? A 16.345 -1.792 -5.461 1 1 A PHE 0.700 1 ATOM 37 C CB . PHE 654 654 ? A 14.855 0.439 -3.360 1 1 A PHE 0.700 1 ATOM 38 C CG . PHE 654 654 ? A 16.299 0.703 -2.986 1 1 A PHE 0.700 1 ATOM 39 C CD1 . PHE 654 654 ? A 16.960 1.866 -3.422 1 1 A PHE 0.700 1 ATOM 40 C CD2 . PHE 654 654 ? A 16.986 -0.179 -2.134 1 1 A PHE 0.700 1 ATOM 41 C CE1 . PHE 654 654 ? A 18.280 2.132 -3.031 1 1 A PHE 0.700 1 ATOM 42 C CE2 . PHE 654 654 ? A 18.306 0.083 -1.740 1 1 A PHE 0.700 1 ATOM 43 C CZ . PHE 654 654 ? A 18.957 1.235 -2.196 1 1 A PHE 0.700 1 ATOM 44 N N . ILE 655 655 ? A 14.670 -2.699 -4.300 1 1 A ILE 0.780 1 ATOM 45 C CA . ILE 655 655 ? A 15.174 -4.071 -4.406 1 1 A ILE 0.780 1 ATOM 46 C C . ILE 655 655 ? A 15.281 -4.554 -5.857 1 1 A ILE 0.780 1 ATOM 47 O O . ILE 655 655 ? A 16.285 -5.152 -6.244 1 1 A ILE 0.780 1 ATOM 48 C CB . ILE 655 655 ? A 14.364 -5.034 -3.529 1 1 A ILE 0.780 1 ATOM 49 C CG1 . ILE 655 655 ? A 14.604 -4.703 -2.034 1 1 A ILE 0.780 1 ATOM 50 C CG2 . ILE 655 655 ? A 14.720 -6.518 -3.799 1 1 A ILE 0.780 1 ATOM 51 C CD1 . ILE 655 655 ? A 13.500 -5.240 -1.115 1 1 A ILE 0.780 1 ATOM 52 N N . ILE 656 656 ? A 14.275 -4.254 -6.714 1 1 A ILE 0.790 1 ATOM 53 C CA . ILE 656 656 ? A 14.283 -4.563 -8.145 1 1 A ILE 0.790 1 ATOM 54 C C . ILE 656 656 ? A 15.415 -3.855 -8.891 1 1 A ILE 0.790 1 ATOM 55 O O . ILE 656 656 ? A 16.127 -4.463 -9.689 1 1 A ILE 0.790 1 ATOM 56 C CB . ILE 656 656 ? A 12.924 -4.255 -8.787 1 1 A ILE 0.790 1 ATOM 57 C CG1 . ILE 656 656 ? A 11.859 -5.230 -8.230 1 1 A ILE 0.790 1 ATOM 58 C CG2 . ILE 656 656 ? A 12.963 -4.349 -10.335 1 1 A ILE 0.790 1 ATOM 59 C CD1 . ILE 656 656 ? A 10.419 -4.742 -8.434 1 1 A ILE 0.790 1 ATOM 60 N N . ALA 657 657 ? A 15.645 -2.554 -8.613 1 1 A ALA 0.820 1 ATOM 61 C CA . ALA 657 657 ? A 16.750 -1.784 -9.155 1 1 A ALA 0.820 1 ATOM 62 C C . ALA 657 657 ? A 18.125 -2.298 -8.711 1 1 A ALA 0.820 1 ATOM 63 O O . ALA 657 657 ? A 19.047 -2.438 -9.522 1 1 A ALA 0.820 1 ATOM 64 C CB . ALA 657 657 ? A 16.563 -0.292 -8.801 1 1 A ALA 0.820 1 ATOM 65 N N . THR 658 658 ? A 18.298 -2.638 -7.417 1 1 A THR 0.800 1 ATOM 66 C CA . THR 658 658 ? A 19.543 -3.166 -6.854 1 1 A THR 0.800 1 ATOM 67 C C . THR 658 658 ? A 19.970 -4.485 -7.466 1 1 A THR 0.800 1 ATOM 68 O O . THR 658 658 ? A 21.135 -4.663 -7.817 1 1 A THR 0.800 1 ATOM 69 C CB . THR 658 658 ? A 19.488 -3.286 -5.336 1 1 A THR 0.800 1 ATOM 70 O OG1 . THR 658 658 ? A 19.303 -1.984 -4.810 1 1 A THR 0.800 1 ATOM 71 C CG2 . THR 658 658 ? A 20.789 -3.784 -4.688 1 1 A THR 0.800 1 ATOM 72 N N . VAL 659 659 ? A 19.042 -5.451 -7.664 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 73 C CA . VAL 659 659 ? A 19.377 -6.734 -8.275 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 74 C C . VAL 659 659 ? A 19.797 -6.631 -9.749 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 75 O O . VAL 659 659 ? A 20.786 -7.242 -10.148 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 76 C CB . VAL 659 659 ? A 18.342 -7.832 -7.990 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 77 C CG1 . VAL 659 659 ? A 17.005 -7.587 -8.711 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 78 C CG2 . VAL 659 659 ? A 18.896 -9.243 -8.296 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 79 N N . VAL 660 660 ? A 19.128 -5.807 -10.605 1 1 A VAL 0.840 1 ATOM 80 C CA . VAL 660 660 ? A 19.595 -5.589 -11.977 1 1 A VAL 0.840 1 ATOM 81 C C . VAL 660 660 ? A 20.947 -4.879 -12.044 1 1 A VAL 0.840 1 ATOM 82 O O . VAL 660 660 ? A 21.811 -5.257 -12.824 1 1 A VAL 0.840 1 ATOM 83 C CB . VAL 660 660 ? A 18.581 -4.966 -12.947 1 1 A VAL 0.840 1 ATOM 84 C CG1 . VAL 660 660 ? A 17.383 -5.927 -13.090 1 1 A VAL 0.840 1 ATOM 85 C CG2 . VAL 660 660 ? A 18.110 -3.567 -12.510 1 1 A VAL 0.840 1 ATOM 86 N N . GLY 661 661 ? A 21.192 -3.861 -11.178 1 1 A GLY 0.840 1 ATOM 87 C CA . GLY 661 661 ? A 22.494 -3.200 -11.066 1 1 A GLY 0.840 1 ATOM 88 C C . GLY 661 661 ? A 23.649 -4.108 -10.730 1 1 A GLY 0.840 1 ATOM 89 O O . GLY 661 661 ? A 24.690 -4.078 -11.385 1 1 A GLY 0.840 1 ATOM 90 N N . VAL 662 662 ? A 23.488 -4.964 -9.702 1 1 A VAL 0.840 1 ATOM 91 C CA . VAL 662 662 ? A 24.488 -5.939 -9.288 1 1 A VAL 0.840 1 ATOM 92 C C . VAL 662 662 ? A 24.779 -6.954 -10.394 1 1 A VAL 0.840 1 ATOM 93 O O . VAL 662 662 ? A 25.933 -7.270 -10.676 1 1 A VAL 0.840 1 ATOM 94 C CB . VAL 662 662 ? A 24.089 -6.605 -7.970 1 1 A VAL 0.840 1 ATOM 95 C CG1 . VAL 662 662 ? A 25.002 -7.793 -7.599 1 1 A VAL 0.840 1 ATOM 96 C CG2 . VAL 662 662 ? A 24.178 -5.542 -6.854 1 1 A VAL 0.840 1 ATOM 97 N N . LEU 663 663 ? A 23.729 -7.443 -11.095 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 98 C CA . LEU 663 663 ? A 23.842 -8.350 -12.229 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 99 C C . LEU 663 663 ? A 24.594 -7.739 -13.416 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 100 O O . LEU 663 663 ? A 25.491 -8.361 -13.989 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 101 C CB . LEU 663 663 ? A 22.424 -8.828 -12.642 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 102 C CG . LEU 663 663 ? A 22.315 -9.909 -13.747 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 103 C CD1 . LEU 663 663 ? A 22.977 -11.244 -13.359 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 104 C CD2 . LEU 663 663 ? A 20.831 -10.155 -14.075 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 105 N N . LEU 664 664 ? A 24.310 -6.467 -13.782 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 106 C CA . LEU 664 664 ? A 25.062 -5.738 -14.793 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 107 C C . LEU 664 664 ? A 26.528 -5.541 -14.404 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 108 O O . LEU 664 664 ? A 27.423 -5.742 -15.217 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 109 C CB . LEU 664 664 ? A 24.398 -4.373 -15.127 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 110 C CG . LEU 664 664 ? A 23.096 -4.492 -15.958 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 111 C CD1 . LEU 664 664 ? A 22.287 -3.186 -15.904 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 112 C CD2 . LEU 664 664 ? A 23.352 -4.874 -17.429 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 113 N N . 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.809 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 649 ALA 1 0.930 2 1 A 650 SER 1 0.930 3 1 A 651 PRO 1 0.660 4 1 A 652 VAL 1 0.770 5 1 A 653 THR 1 0.730 6 1 A 654 PHE 1 0.700 7 1 A 655 ILE 1 0.780 8 1 A 656 ILE 1 0.790 9 1 A 657 ALA 1 0.820 10 1 A 658 THR 1 0.800 11 1 A 659 VAL 1 0.830 12 1 A 660 VAL 1 0.840 13 1 A 661 GLY 1 0.840 14 1 A 662 VAL 1 0.840 15 1 A 663 LEU 1 0.820 16 1 A 664 LEU 1 0.810 17 1 A 665 PHE 1 0.800 18 1 A 666 LEU 1 0.820 19 1 A 667 ILE 1 0.820 20 1 A 668 ILE 1 0.830 21 1 A 669 VAL 1 0.850 22 1 A 670 VAL 1 0.850 23 1 A 671 VAL 1 0.850 24 1 A 672 ILE 1 0.790 25 1 A 673 GLY 1 0.830 26 1 A 674 ILE 1 0.770 27 1 A 675 LEU 1 0.750 28 1 A 676 ILE 1 0.650 29 1 A 677 LYS 1 0.890 30 1 A 678 ARG 1 0.870 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #