data_SMR-5b92849b7a6892f5265adfb1cbd5c656_3 _entry.id SMR-5b92849b7a6892f5265adfb1cbd5c656_3 _struct.entry_id SMR-5b92849b7a6892f5265adfb1cbd5c656_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P28023/ DCTN1_RAT, Dynactin subunit 1 Estimated model accuracy of this model is 0.015, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P28023' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 165169.118 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DCTN1_RAT P28023 1 ;MAQSKRHMYNRTPSGSRMSTEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKND GTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKILKREGADAAAKTSKLRGLKPKKAP TARKTTTRRPKPTRPASTGVAGPSSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPALTSPGAAPPL PSPSKEEEGLRDQVRDLEEKLETLRLKRSEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEAK EAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGS DGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAES TIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDM AGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFAE TKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKFD LSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDF LIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEESTMQLADHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAFL QGGQEATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGSQVSDTLLDCRKHLTWVVAVL QEVAAAAAQLIAPLAENEGLPVAALEELAFKASEQIYGSPSSSPYECLRQSCSILISTMNKLATAMQEGE YDAERPPSKPPPVEPWPAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKLD SAAKDADERIEKVQTRLEETQTLLRKKEKEFEETMDALQADIDQLEAEKTELKQRLNSQSKRTIEGLRGP PPSGIATLVSGIAGEEQQRGGTPGQAPGALPGPGPVKDSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILRGAQMKA SLAALPPLHVAKFSLPPHEGPGGNLLSGALYRKTSQLLEKLNQLSTYTHVVDITRSSPACKSPSAQLMEQ VAQLKSLSDTIEKLKDEVLKETVTQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGLGQ RHRLVLTQEQLHQLHGRLIS ; 'Dynactin subunit 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1280 1 1280 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . DCTN1_RAT P28023 . 1 1280 10116 'Rattus norvegicus (Rat)' 1997-11-01 C9348CF129F4FF5C # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MAQSKRHMYNRTPSGSRMSTEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKND GTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKILKREGADAAAKTSKLRGLKPKKAP TARKTTTRRPKPTRPASTGVAGPSSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPALTSPGAAPPL PSPSKEEEGLRDQVRDLEEKLETLRLKRSEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEAK EAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGS DGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAES TIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDM AGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFAE TKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKFD 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# loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A LO 26 1 GY # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MEFLGTTQTASFCGPKKGCGLQALPPAGQEPVVQECYQPFHLPGYRYLNAWRPSVFHKIATSQTIPEECS GIRRPPTILPSLRSALFCRYTPRDWDRSNDLQIRNAEASRLWASRLTGDSLRIMQDKDQLIHQMQEGTSR NLGQRLSDLGFWKSELCYELDRLLTENSSMDTLKRRLECAAEEVNCPLQVALECLYNREKRIGIDLVHDN VEKNLIREVDLLKCCQDQMRKLAKRIDFQIRDNRDAQHSLERDIEDKSSAQYIDENCFNLRSTSDSISFF HGVEKFDGTVSIPETWAKFSNDNIRHAQNMRANSIRLREEAEHLFETLSDQMWKQFTNTNLAFNARISEE TDVKNKLQTQLAKILQEIFQAENTIMLLERAIVAKEYPLKMAQTMLACRTRRPNVELCRDVPQFRLVNEV FTIDDTLQTLKLRLRETQDTLQLLVMTKSRLEHELAIKANTLCIDKDKCMSMRKSFPSTPRLTGYTCSAI GSGPYANHAPRISSGPCSGSALCKGPASCGGGASCGGGASCGGHAPCGSALCSHSVSRSGPGFAPVC ; ;MEFLGTTQTASFCGPKKGCGLQALPPAGQEPVVQECYQPFHLPGYRYLNAWRPSVFHKIATSQTIPEECS GIRRPPTILPSLRSALFCRYTPRDWDRSNDLQIRNAEASRLWASRLTGDSLRIMQDKDQLIHQMQEGTSR NLGQRLSDLGFWKSELCYELDRLLTENSSMDTLKRRLECAAEEVNCPLQVALECLYNREKRIGIDLVHDN VEKNLIREVDLLKCCQDQMRKLAKRIDFQIRDNRDAQHSLERDIEDKSSAQYIDENCFNLRSTSDSISFF HGVEKFDGTVSIPETWAKFSNDNIRHAQNMRANSIRLREEAEHLFETLSDQMWKQFTNTNLAFNARISEE TDVKNKLQTQLAKILQEIFQAENTIMLLERAIVAKEYPLKMAQTMLACRTRRPNVELCRDVPQFRLVNEV FTIDDTLQTLKLRLRETQDTLQLLVMTKSRLEHELAIKANTLCIDKDKCMSMRKSFPSTPRLTGYTCSAI GSGPYANHAPRISSGPCSGSALCKGPASCGGGASCGGGASCGGHAPCGSALCSHSVSRSGPGFAPVC ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 212 252 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8to0 2023-11-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1280 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1280 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 56.000 17.073 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAQSKRHMYNRTPSGSRMSTEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKILKREGADAAAKTSKLRGLKPKKAPTARKTTTRRPKPTRPASTGVAGPSSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPALTSPGAAPPLPSPSKEEEGLRDQVRDLEEKLETLRLKRSEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEAKEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDMAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKFDLSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDFLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEESTMQLADHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAFLQGGQEATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGSQVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVAAAAAQLIAPLAENEGLPVAALEELAFKASEQIYGSPSSSPYECLRQSCSILISTMNKLATAMQEGEYDAERPPSKPPPVEPWPAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKLDSAAKDADERIEKVQTRLEETQTLLRKKEKEFEETMDALQADIDQLEAEKTELKQRLNSQSKRTIEGLRGPPPSGIATLVSGIAGEEQQRGGTPGQAPGALPGPGPVKDSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILRGAQMKASLAALPPLHVAKFSLPPHEGPGGNLLSGALYRKTSQLLEKLNQLSTYTHVVDITRSSPACKSPSAQLMEQVAQLKSLSDTIEKLKDEVLKETVTQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGLGQRHRLVLTQEQLHQLHGRLIS 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EKNLIREVDLLKCCQDQMRKLAKRIDFQIRDNRDAQHSLER--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8to0.402' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 217 217 ? A 245.355 408.329 105.624 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 2 C CA . GLU 217 217 ? A 245.551 409.573 106.441 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 3 C C . GLU 217 217 ? A 244.586 409.748 107.602 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 4 O O . GLU 217 217 ? A 245.038 409.898 108.725 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 5 C CB . GLU 217 217 ? A 245.563 410.844 105.573 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 6 C CG . GLU 217 217 ? A 245.952 412.090 106.421 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 7 C CD . GLU 217 217 ? A 245.949 413.426 105.666 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 217 217 ? A 245.709 413.439 104.446 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 217 217 ? A 246.176 414.453 106.357 1 1 A GLU 0.670 1 ATOM 10 N N . GLU 218 218 ? A 243.249 409.688 107.373 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 11 C CA . GLU 218 218 ? A 242.235 409.732 108.436 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 12 C C . GLU 218 218 ? A 242.509 408.788 109.597 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 13 O O . GLU 218 218 ? A 242.781 409.228 110.706 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 14 C CB . GLU 218 218 ? A 240.887 409.377 107.795 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 15 C CG . GLU 218 218 ? A 239.640 409.452 108.708 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 16 C CD . GLU 218 218 ? A 238.374 409.084 107.921 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 17 O OE1 . GLU 218 218 ? A 237.258 409.217 108.480 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 18 O OE2 . GLU 218 218 ? A 238.528 408.679 106.735 1 1 A GLU 0.650 1 ATOM 19 N N . GLY 219 219 ? A 242.634 407.471 109.299 1 1 A GLY 0.710 1 ATOM 20 C CA . GLY 219 219 ? A 243.052 406.447 110.258 1 1 A GLY 0.710 1 ATOM 21 C C . GLY 219 219 ? A 244.268 406.773 111.092 1 1 A GLY 0.710 1 ATOM 22 O O . GLY 219 219 ? A 244.258 406.599 112.295 1 1 A GLY 0.710 1 ATOM 23 N N . LEU 220 220 ? A 245.363 407.264 110.472 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 24 C CA . LEU 220 220 ? A 246.541 407.723 111.194 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 25 C C . LEU 220 220 ? A 246.269 408.909 112.114 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 26 O O . LEU 220 220 ? A 246.675 408.917 113.264 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 27 C CB . LEU 220 220 ? A 247.661 408.135 110.206 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 28 C CG . LEU 220 220 ? A 248.254 406.997 109.353 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 29 C CD1 . LEU 220 220 ? A 249.181 407.570 108.272 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 30 C CD2 . LEU 220 220 ? A 249.028 406.010 110.230 1 1 A LEU 0.710 1 ATOM 31 N N . ARG 221 221 ? A 245.546 409.945 111.638 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 32 C CA . ARG 221 221 ? A 245.197 411.099 112.453 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 33 C C . ARG 221 221 ? A 244.321 410.781 113.663 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 34 O O . ARG 221 221 ? A 244.540 411.314 114.746 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 35 C CB . ARG 221 221 ? A 244.517 412.199 111.617 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 36 C CG . ARG 221 221 ? A 245.447 412.915 110.622 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 37 C CD . ARG 221 221 ? A 244.688 413.976 109.824 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 38 N NE . ARG 221 221 ? A 245.640 414.635 108.899 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 39 C CZ . ARG 221 221 ? A 246.456 415.663 109.163 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 40 N NH1 . ARG 221 221 ? A 246.551 416.190 110.375 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 41 N NH2 . ARG 221 221 ? A 247.167 416.139 108.144 1 1 A ARG 0.670 1 ATOM 42 N N . ASP 222 222 ? A 243.340 409.872 113.495 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 43 C CA . ASP 222 222 ? A 242.542 409.339 114.582 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 44 C C . ASP 222 222 ? A 243.418 408.662 115.648 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 45 O O . ASP 222 222 ? A 243.399 409.026 116.816 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 46 C CB . ASP 222 222 ? A 241.521 408.339 113.993 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 47 C CG . ASP 222 222 ? A 240.500 409.010 113.077 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 48 O OD1 . ASP 222 222 ? A 240.382 410.263 113.093 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 49 O OD2 . ASP 222 222 ? A 239.836 408.241 112.337 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 50 N N . GLN 223 223 ? A 244.334 407.763 115.212 1 1 A GLN 0.700 1 ATOM 51 C CA . GLN 223 223 ? A 245.308 407.091 116.065 1 1 A GLN 0.700 1 ATOM 52 C C . GLN 223 223 ? A 246.250 408.032 116.811 1 1 A GLN 0.700 1 ATOM 53 O O . GLN 223 223 ? A 246.596 407.792 117.968 1 1 A GLN 0.700 1 ATOM 54 C CB . GLN 223 223 ? A 246.193 406.118 115.248 1 1 A GLN 0.700 1 ATOM 55 C CG . GLN 223 223 ? A 245.458 404.897 114.655 1 1 A GLN 0.700 1 ATOM 56 C CD . GLN 223 223 ? A 246.380 404.103 113.732 1 1 A GLN 0.700 1 ATOM 57 O OE1 . GLN 223 223 ? A 247.356 404.604 113.155 1 1 A GLN 0.700 1 ATOM 58 N NE2 . GLN 223 223 ? A 246.077 402.797 113.565 1 1 A GLN 0.700 1 ATOM 59 N N . VAL 224 224 ? A 246.701 409.131 116.167 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 60 C CA . VAL 224 224 ? A 247.471 410.200 116.803 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 61 C C . VAL 224 224 ? A 246.682 410.900 117.905 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 62 O O . VAL 224 224 ? A 247.184 411.112 119.001 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 63 C CB . VAL 224 224 ? A 247.949 411.253 115.800 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 64 C CG1 . VAL 224 224 ? A 248.636 412.454 116.484 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 65 C CG2 . VAL 224 224 ? A 248.965 410.631 114.830 1 1 A VAL 0.750 1 ATOM 66 N N . ARG 225 225 ? 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A 244.964 408.456 121.449 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 80 O O . ASP 226 226 ? A 244.839 408.324 122.681 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 81 C CB . ASP 226 226 ? A 243.536 407.279 119.865 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 82 C CG . ASP 226 226 ? A 242.216 407.147 119.122 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 83 O OD1 . ASP 226 226 ? A 241.294 407.969 119.342 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 84 O OD2 . ASP 226 226 ? A 242.125 406.154 118.353 1 1 A ASP 0.720 1 ATOM 85 N N . LEU 227 227 ? A 246.182 408.462 120.887 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 86 C CA . LEU 227 227 ? A 247.435 408.416 121.624 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 87 C C . LEU 227 227 ? A 247.629 409.632 122.528 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 88 O O . LEU 227 227 ? A 247.984 409.490 123.696 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 89 C CB . LEU 227 227 ? A 248.648 408.289 120.672 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 90 C CG . LEU 227 227 ? A 250.029 408.213 121.361 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 91 C CD1 . LEU 227 227 ? A 250.184 406.961 122.238 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 92 C CD2 . LEU 227 227 ? 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A 253.690 410.096 168.353 1 1 A GLN 0.640 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.692 2 1 3 0.015 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 217 GLU 1 0.670 2 1 A 218 GLU 1 0.650 3 1 A 219 GLY 1 0.710 4 1 A 220 LEU 1 0.710 5 1 A 221 ARG 1 0.670 6 1 A 222 ASP 1 0.720 7 1 A 223 GLN 1 0.700 8 1 A 224 VAL 1 0.750 9 1 A 225 ARG 1 0.690 10 1 A 226 ASP 1 0.720 11 1 A 227 LEU 1 0.740 12 1 A 228 GLU 1 0.710 13 1 A 229 GLU 1 0.710 14 1 A 230 LYS 1 0.710 15 1 A 231 LEU 1 0.740 16 1 A 232 GLU 1 0.720 17 1 A 233 THR 1 0.740 18 1 A 234 LEU 1 0.740 19 1 A 235 ARG 1 0.680 20 1 A 236 LEU 1 0.730 21 1 A 237 LYS 1 0.700 22 1 A 238 ARG 1 0.660 23 1 A 239 SER 1 0.700 24 1 A 240 GLU 1 0.680 25 1 A 241 ASP 1 0.680 26 1 A 242 LYS 1 0.660 27 1 A 243 ALA 1 0.720 28 1 A 244 LYS 1 0.670 29 1 A 245 LEU 1 0.700 30 1 A 246 LYS 1 0.670 31 1 A 247 GLU 1 0.670 32 1 A 248 LEU 1 0.700 33 1 A 249 GLU 1 0.670 34 1 A 250 LYS 1 0.660 35 1 A 251 HIS 1 0.640 36 1 A 252 LYS 1 0.660 37 1 A 253 ILE 1 0.670 38 1 A 254 GLN 1 0.660 39 1 A 255 LEU 1 0.680 40 1 A 256 GLU 1 0.680 41 1 A 257 GLN 1 0.640 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #