data_SMR-5fbeee2104be0998c53c6674af6a6eac_2 _entry.id SMR-5fbeee2104be0998c53c6674af6a6eac_2 _struct.entry_id SMR-5fbeee2104be0998c53c6674af6a6eac_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q15468/ STIL_HUMAN, SCL-interrupting locus protein Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q15468' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 166287.468 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP STIL_HUMAN Q15468 1 ;MEPIYPFARPQMNTRFPSSRMVPFHFPPSKCALWNPTPTGDFIYLHLSYYRNPKLVVTEKTIRLAYRHAK QNKKNSSCFLLGSLTADEDEEGVTLTVDRFDPGREVPECLEITPTASLPGDFLIPCKVHTQELCSREMIV HSVDDFSSALKALQCHICSKDSLDCGKLLSLRVHITSRESLDSVEFDLHWAAVTLANNFKCTPVKPIPII PTALARNLSSNLNISQVQGTYKYGYLTMDETRKLLLLLESDPKVYSLPLVGIWLSGITHIYSPQVWACCL RYIFNSSVQERVFSESGNFIIVLYSMTHKEPEFYECFPCDGKIPDFRFQLLTSKETLHLFKNVEPPDKNP IRCELSAESQNAETEFFSKASKNFSIKRSSQKLSSGKMPIHDHDSGVEDEDFSPRPIPSPHPVSQKISKI QPSVPELSLVLDGNFIESNPLPTPLEMVNNENPPLINHLEHLKPLQPQLYDEKHSPEVEAGEPSLRGIPN QLNQDKPALLRHCKVRQPPAYKKGNPHTRNSIKPSSHNGPSHDIFEKLQTVSAGNVQNEEYPIRPSTLNS RQSSLAPQSQPHDFVFSPHNSGRPMELQIPTPPLPSYCSTNVCRCCQHHSHIQYSPLNSWQGANTVGSIQ DVQSEALQKHSLFHPSGCPALYCNAFCSSSSPIALRPQGDMGSCSPHSNIEPSPVARPPSHMDLCNPQPC TVCMHTPKTESDNGMMGLSPDAYRFLTEQDRQLRLLQAQIQRLLEAQSLMPCSPKTTAVEDTVQAGRQME LVSVEAQSSPGLHMRKGVSIAVSTGASLFWNAAGEDQEPDSQMKQDDTKISSEDMNFSVDINNEVTSLPG SASSLKAVDIPSFEESNIAVEEEFNQPLSVSNSSLVVRKEPDVPVFFPSGQLAESVSMCLQTGPTGGASN NSETSEEPKIEHVMQPLLHQPSDNQKIYQDLLGQVNHLLNSSSKETEQPSTKAVIISHECTRTQNVYHTK KKTHHSRLVDKDCVLNATLKQLRSLGVKIDSPTKVKKNAHNVDHASVLACISPEAVISGLNCMSFANVGM SGLSPNGVDLSMEANAIALKYLNENQLSQLSVTRSNQNNCDPFSLLHINTDRSTVGLSLISPNNMSFATK KYMKRYGLLQSSDNSEDEEEPPDNADSKSEYLLNQNLRSIPEQLGGQKEPSKNDHEIINCSNCESVGTNA DTPVLRNITNEVLQTKAKQQLTEKPAFLVKNLKPSPAVNLRTGKAEFTQHPEKENEGDITIFPESLQPSE TLKQMNSMNSVGTFLDVKRLRQLPKLF ; 'SCL-interrupting locus protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1287 1 1287 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . STIL_HUMAN Q15468 . 1 1287 9606 'Homo sapiens (Human)' 2007-01-09 7F15BEDA8717659C # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MEPIYPFARPQMNTRFPSSRMVPFHFPPSKCALWNPTPTGDFIYLHLSYYRNPKLVVTEKTIRLAYRHAK QNKKNSSCFLLGSLTADEDEEGVTLTVDRFDPGREVPECLEITPTASLPGDFLIPCKVHTQELCSREMIV HSVDDFSSALKALQCHICSKDSLDCGKLLSLRVHITSRESLDSVEFDLHWAAVTLANNFKCTPVKPIPII PTALARNLSSNLNISQVQGTYKYGYLTMDETRKLLLLLESDPKVYSLPLVGIWLSGITHIYSPQVWACCL RYIFNSSVQERVFSESGNFIIVLYSMTHKEPEFYECFPCDGKIPDFRFQLLTSKETLHLFKNVEPPDKNP IRCELSAESQNAETEFFSKASKNFSIKRSSQKLSSGKMPIHDHDSGVEDEDFSPRPIPSPHPVSQKISKI QPSVPELSLVLDGNFIESNPLPTPLEMVNNENPPLINHLEHLKPLQPQLYDEKHSPEVEAGEPSLRGIPN QLNQDKPALLRHCKVRQPPAYKKGNPHTRNSIKPSSHNGPSHDIFEKLQTVSAGNVQNEEYPIRPSTLNS RQSSLAPQSQPHDFVFSPHNSGRPMELQIPTPPLPSYCSTNVCRCCQHHSHIQYSPLNSWQGANTVGSIQ DVQSEALQKHSLFHPSGCPALYCNAFCSSSSPIALRPQGDMGSCSPHSNIEPSPVARPPSHMDLCNPQPC TVCMHTPKTESDNGMMGLSPDAYRFLTEQDRQLRLLQAQIQRLLEAQSLMPCSPKTTAVEDTVQAGRQME LVSVEAQSSPGLHMRKGVSIAVSTGASLFWNAAGEDQEPDSQMKQDDTKISSEDMNFSVDINNEVTSLPG SASSLKAVDIPSFEESNIAVEEEFNQPLSVSNSSLVVRKEPDVPVFFPSGQLAESVSMCLQTGPTGGASN NSETSEEPKIEHVMQPLLHQPSDNQKIYQDLLGQVNHLLNSSSKETEQPSTKAVIISHECTRTQNVYHTK KKTHHSRLVDKDCVLNATLKQLRSLGVKIDSPTKVKKNAHNVDHASVLACISPEAVISGLNCMSFANVGM SGLSPNGVDLSMEANAIALKYLNENQLSQLSVTRSNQNNCDPFSLLHINTDRSTVGLSLISPNNMSFATK KYMKRYGLLQSSDNSEDEEEPPDNADSKSEYLLNQNLRSIPEQLGGQKEPSKNDHEIINCSNCESVGTNA DTPVLRNITNEVLQTKAKQQLTEKPAFLVKNLKPSPAVNLRTGKAEFTQHPEKENEGDITIFPESLQPSE TLKQMNSMNSVGTFLDVKRLRQLPKLF ; ;MEPIYPFARPQMNTRFPSSRMVPFHFPPSKCALWNPTPTGDFIYLHLSYYRNPKLVVTEKTIRLAYRHAK QNKKNSSCFLLGSLTADEDEEGVTLTVDRFDPGREVPECLEITPTASLPGDFLIPCKVHTQELCSREMIV HSVDDFSSALKALQCHICSKDSLDCGKLLSLRVHITSRESLDSVEFDLHWAAVTLANNFKCTPVKPIPII PTALARNLSSNLNISQVQGTYKYGYLTMDETRKLLLLLESDPKVYSLPLVGIWLSGITHIYSPQVWACCL 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TLKQMNSMNSVGTFLDVKRLRQLPKLF ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 GLU . 1 3 PRO . 1 4 ILE . 1 5 TYR . 1 6 PRO . 1 7 PHE . 1 8 ALA . 1 9 ARG . 1 10 PRO . 1 11 GLN . 1 12 MET . 1 13 ASN . 1 14 THR . 1 15 ARG . 1 16 PHE . 1 17 PRO . 1 18 SER . 1 19 SER . 1 20 ARG . 1 21 MET . 1 22 VAL . 1 23 PRO . 1 24 PHE . 1 25 HIS . 1 26 PHE . 1 27 PRO . 1 28 PRO . 1 29 SER . 1 30 LYS . 1 31 CYS . 1 32 ALA . 1 33 LEU . 1 34 TRP . 1 35 ASN . 1 36 PRO . 1 37 THR . 1 38 PRO . 1 39 THR . 1 40 GLY . 1 41 ASP . 1 42 PHE . 1 43 ILE . 1 44 TYR . 1 45 LEU . 1 46 HIS . 1 47 LEU . 1 48 SER . 1 49 TYR . 1 50 TYR . 1 51 ARG . 1 52 ASN . 1 53 PRO . 1 54 LYS . 1 55 LEU . 1 56 VAL . 1 57 VAL . 1 58 THR . 1 59 GLU . 1 60 LYS . 1 61 THR . 1 62 ILE . 1 63 ARG . 1 64 LEU . 1 65 ALA . 1 66 TYR . 1 67 ARG . 1 68 HIS . 1 69 ALA . 1 70 LYS . 1 71 GLN . 1 72 ASN . 1 73 LYS . 1 74 LYS . 1 75 ASN . 1 76 SER . 1 77 SER . 1 78 CYS . 1 79 PHE . 1 80 LEU . 1 81 LEU . 1 82 GLY . 1 83 SER . 1 84 LEU . 1 85 THR . 1 86 ALA . 1 87 ASP . 1 88 GLU . 1 89 ASP . 1 90 GLU . 1 91 GLU . 1 92 GLY . 1 93 VAL . 1 94 THR . 1 95 LEU . 1 96 THR . 1 97 VAL . 1 98 ASP . 1 99 ARG . 1 100 PHE . 1 101 ASP . 1 102 PRO . 1 103 GLY . 1 104 ARG . 1 105 GLU . 1 106 VAL . 1 107 PRO . 1 108 GLU . 1 109 CYS . 1 110 LEU . 1 111 GLU . 1 112 ILE . 1 113 THR . 1 114 PRO . 1 115 THR . 1 116 ALA . 1 117 SER . 1 118 LEU . 1 119 PRO . 1 120 GLY . 1 121 ASP . 1 122 PHE . 1 123 LEU . 1 124 ILE . 1 125 PRO . 1 126 CYS . 1 127 LYS . 1 128 VAL . 1 129 HIS . 1 130 THR . 1 131 GLN . 1 132 GLU . 1 133 LEU . 1 134 CYS . 1 135 SER . 1 136 ARG . 1 137 GLU . 1 138 MET . 1 139 ILE . 1 140 VAL . 1 141 HIS . 1 142 SER . 1 143 VAL . 1 144 ASP . 1 145 ASP . 1 146 PHE . 1 147 SER . 1 148 SER . 1 149 ALA . 1 150 LEU . 1 151 LYS . 1 152 ALA . 1 153 LEU . 1 154 GLN . 1 155 CYS . 1 156 HIS . 1 157 ILE . 1 158 CYS . 1 159 SER . 1 160 LYS . 1 161 ASP . 1 162 SER . 1 163 LEU . 1 164 ASP . 1 165 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B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Isoform 2 of SCL-interrupting locus protein {PDB ID=8oyk, label_asym_id=F, auth_asym_id=F, SMTL ID=8oyk.3.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8oyk, label_asym_id=F' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A F 1 1 F # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 LSPDAYRFLTEQDRQLRLEQAQIQRLLEAQSL LSPDAYRFLTEQDRQLRLEQAQIQRLLEAQSL # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 31 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8oyk 2023-10-18 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1287 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1287 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 3.9e-14 96.774 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEPIYPFARPQMNTRFPSSRMVPFHFPPSKCALWNPTPTGDFIYLHLSYYRNPKLVVTEKTIRLAYRHAKQNKKNSSCFLLGSLTADEDEEGVTLTVDRFDPGREVPECLEITPTASLPGDFLIPCKVHTQELCSREMIVHSVDDFSSALKALQCHICSKDSLDCGKLLSLRVHITSRESLDSVEFDLHWAAVTLANNFKCTPVKPIPIIPTALARNLSSNLNISQVQGTYKYGYLTMDETRKLLLLLESDPKVYSLPLVGIWLSGITHIYSPQVWACCLRYIFNSSVQERVFSESGNFIIVLYSMTHKEPEFYECFPCDGKIPDFRFQLLTSKETLHLFKNVEPPDKNPIRCELSAESQNAETEFFSKASKNFSIKRSSQKLSSGKMPIHDHDSGVEDEDFSPRPIPSPHPVSQKISKIQPSVPELSLVLDGNFIESNPLPTPLEMVNNENPPLINHLEHLKPLQPQLYDEKHSPEVEAGEPSLRGIPNQLNQDKPALLRHCKVRQPPAYKKGNPHTRNSIKPSSHNGPSHDIFEKLQTVSAGNVQNEEYPIRPSTLNSRQSSLAPQSQPHDFVFSPHNSGRPMELQIPTPPLPSYCSTNVCRCCQHHSHIQYSPLNSWQGANTVGSIQDVQSEALQKHSLFHPSGCPALYCNAFCSSSSPIALRPQGDMGSCSPHSNIEPSPVARPPSHMDLCNPQPCTVCMHTPKTESDNGMMGLSPDAYRFLTEQDRQLRLLQAQIQRLLEAQSLMPCSPKTTAVEDTVQAGRQMELVSVEAQSSPGLHMRKGVSIAVSTGASLFWNAAGEDQEPDSQMKQDDTKISSEDMNFSVDINNEVTSLPGSASSLKAVDIPSFEESNIAVEEEFNQPLSVSNSSLVVRKEPDVPVFFPSGQLAESVSMCLQTGPTGGASNNSETSEEPKIEHVMQPLLHQPSDNQKIYQDLLGQVNHLLNSSSKETEQPSTKAVIISHECTRTQNVYHTKKKTHHSRLVDKDCVLNATLKQLRSLGVKIDSPTKVKKNAHNVDHASVLACISPEAVISGLNCMSFANVGMSGLSPNGVDLSMEANAIALKYLNENQLSQLSVTRSNQNNCDPFSLLHINTDRSTVGLSLISPNNMSFATKKYMKRYGLLQSSDNSEDEEEPPDNADSKSEYLLNQNLRSIPEQLGGQKEPSKNDHEIINCSNCESVGTNADTPVLRNITNEVLQTKAKQQLTEKPAFLVKNLKPSPAVNLRTGKAEFTQHPEKENEGDITIFPESLQPSETLKQMNSMNSVGTFLDVKRLRQLPKLF 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LSPDAYRFLTEQDRQLRLEQAQIQRLLEAQS----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.329}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8oyk.3, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LEU 718 718 ? A -18.635 -1.251 -10.953 1 1 B LEU 0.530 1 ATOM 2 C CA . LEU 718 718 ? A -18.915 -2.351 -9.967 1 1 B LEU 0.530 1 ATOM 3 C C . LEU 718 718 ? A -20.357 -2.804 -10.048 1 1 B LEU 0.530 1 ATOM 4 O O . LEU 718 718 ? A -21.228 -1.992 -10.338 1 1 B LEU 0.530 1 ATOM 5 C CB . LEU 718 718 ? A -18.627 -1.854 -8.524 1 1 B LEU 0.530 1 ATOM 6 C CG . LEU 718 718 ? A -17.142 -1.640 -8.169 1 1 B LEU 0.530 1 ATOM 7 C CD1 . LEU 718 718 ? A -17.038 -1.042 -6.759 1 1 B LEU 0.530 1 ATOM 8 C CD2 . LEU 718 718 ? A -16.340 -2.948 -8.231 1 1 B LEU 0.530 1 ATOM 9 N N . SER 719 719 ? A -20.641 -4.105 -9.813 1 1 B SER 0.500 1 ATOM 10 C CA . SER 719 719 ? A -21.991 -4.607 -9.586 1 1 B SER 0.500 1 ATOM 11 C C . SER 719 719 ? A -22.558 -4.078 -8.260 1 1 B SER 0.500 1 ATOM 12 O O . SER 719 719 ? A -21.765 -3.687 -7.397 1 1 B SER 0.500 1 ATOM 13 C CB . SER 719 719 ? A -22.053 -6.168 -9.633 1 1 B SER 0.500 1 ATOM 14 O OG . SER 719 719 ? A -21.323 -6.773 -8.565 1 1 B SER 0.500 1 ATOM 15 N N . PRO 720 720 ? A -23.870 -4.011 -8.027 1 1 B PRO 0.640 1 ATOM 16 C CA . PRO 720 720 ? A -24.449 -3.721 -6.711 1 1 B PRO 0.640 1 ATOM 17 C C . PRO 720 720 ? A -23.936 -4.600 -5.572 1 1 B PRO 0.640 1 ATOM 18 O O . PRO 720 720 ? A -23.732 -4.089 -4.470 1 1 B PRO 0.640 1 ATOM 19 C CB . PRO 720 720 ? A -25.966 -3.870 -6.918 1 1 B PRO 0.640 1 ATOM 20 C CG . PRO 720 720 ? A -26.187 -3.638 -8.417 1 1 B PRO 0.640 1 ATOM 21 C CD . PRO 720 720 ? A -24.900 -4.158 -9.058 1 1 B PRO 0.640 1 ATOM 22 N N . ASP 721 721 ? A -23.742 -5.916 -5.811 1 1 B ASP 0.650 1 ATOM 23 C CA . ASP 721 721 ? A -23.166 -6.862 -4.866 1 1 B ASP 0.650 1 ATOM 24 C C . ASP 721 721 ? A -21.736 -6.533 -4.484 1 1 B ASP 0.650 1 ATOM 25 O O . ASP 721 721 ? A -21.382 -6.487 -3.305 1 1 B ASP 0.650 1 ATOM 26 C CB . ASP 721 721 ? A -23.221 -8.292 -5.458 1 1 B ASP 0.650 1 ATOM 27 C CG . ASP 721 721 ? A -24.647 -8.823 -5.400 1 1 B ASP 0.650 1 ATOM 28 O OD1 . ASP 721 721 ? A -25.543 -8.090 -4.898 1 1 B ASP 0.650 1 ATOM 29 O OD2 . ASP 721 721 ? A -24.838 -9.970 -5.864 1 1 B ASP 0.650 1 ATOM 30 N N . ALA 722 722 ? A -20.889 -6.228 -5.488 1 1 B ALA 0.690 1 ATOM 31 C CA . ALA 722 722 ? A -19.512 -5.838 -5.282 1 1 B ALA 0.690 1 ATOM 32 C C . ALA 722 722 ? A -19.380 -4.535 -4.510 1 1 B ALA 0.690 1 ATOM 33 O O . ALA 722 722 ? A -18.569 -4.425 -3.594 1 1 B ALA 0.690 1 ATOM 34 C CB . ALA 722 722 ? A -18.782 -5.725 -6.635 1 1 B ALA 0.690 1 ATOM 35 N N . TYR 723 723 ? A -20.227 -3.530 -4.835 1 1 B TYR 0.630 1 ATOM 36 C CA . TYR 723 723 ? A -20.290 -2.265 -4.122 1 1 B TYR 0.630 1 ATOM 37 C C . TYR 723 723 ? A -20.634 -2.469 -2.650 1 1 B TYR 0.630 1 ATOM 38 O O . TYR 723 723 ? A -19.959 -1.969 -1.755 1 1 B TYR 0.630 1 ATOM 39 C CB . TYR 723 723 ? A -21.351 -1.352 -4.802 1 1 B TYR 0.630 1 ATOM 40 C CG . TYR 723 723 ? A -21.243 0.081 -4.343 1 1 B TYR 0.630 1 ATOM 41 C CD1 . TYR 723 723 ? A -21.867 0.514 -3.160 1 1 B TYR 0.630 1 ATOM 42 C CD2 . TYR 723 723 ? A -20.498 1.007 -5.091 1 1 B TYR 0.630 1 ATOM 43 C CE1 . TYR 723 723 ? A -21.736 1.841 -2.729 1 1 B TYR 0.630 1 ATOM 44 C CE2 . TYR 723 723 ? A -20.385 2.342 -4.673 1 1 B TYR 0.630 1 ATOM 45 C CZ . TYR 723 723 ? A -21.007 2.757 -3.490 1 1 B TYR 0.630 1 ATOM 46 O OH . TYR 723 723 ? A -20.911 4.092 -3.050 1 1 B TYR 0.630 1 ATOM 47 N N . ARG 724 724 ? A -21.671 -3.281 -2.364 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 48 C CA . ARG 724 724 ? A -22.073 -3.603 -1.009 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 49 C C . ARG 724 724 ? A -21.021 -4.343 -0.195 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 50 O O . ARG 724 724 ? A -20.770 -4.014 0.965 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 51 C CB . ARG 724 724 ? A -23.375 -4.435 -1.036 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 52 C CG . ARG 724 724 ? A -23.905 -4.783 0.374 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 53 C CD . ARG 724 724 ? A -25.340 -5.322 0.481 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 54 N NE . ARG 724 724 ? A -26.242 -4.401 -0.291 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 55 C CZ . ARG 724 724 ? A -26.740 -4.666 -1.511 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 56 N NH1 . ARG 724 724 ? A -26.525 -5.823 -2.128 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 57 N NH2 . ARG 724 724 ? A -27.431 -3.722 -2.148 1 1 B ARG 0.600 1 ATOM 58 N N . PHE 725 725 ? A -20.362 -5.349 -0.801 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 59 C CA . PHE 725 725 ? A -19.278 -6.081 -0.177 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 60 C C . PHE 725 725 ? A -18.085 -5.181 0.153 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 61 O O . PHE 725 725 ? A -17.561 -5.200 1.266 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 62 C CB . PHE 725 725 ? A -18.850 -7.241 -1.118 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 63 C CG . PHE 725 725 ? A -17.861 -8.143 -0.434 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 64 C CD1 . PHE 725 725 ? A -18.304 -9.098 0.494 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 65 C CD2 . PHE 725 725 ? A -16.481 -7.971 -0.633 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 66 C CE1 . PHE 725 725 ? A -17.384 -9.867 1.217 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 67 C CE2 . PHE 725 725 ? A -15.560 -8.735 0.095 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 68 C CZ . PHE 725 725 ? A -16.011 -9.686 1.016 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 69 N N . LEU 726 726 ? A -17.658 -4.331 -0.802 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 70 C CA . LEU 726 726 ? A -16.567 -3.393 -0.605 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 71 C C . LEU 726 726 ? A -16.841 -2.324 0.444 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 72 O O . LEU 726 726 ? A -15.963 -2.001 1.238 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 73 C CB . LEU 726 726 ? A -16.106 -2.776 -1.943 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 74 C CG . LEU 726 726 ? A -15.381 -3.783 -2.864 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 75 C CD1 . LEU 726 726 ? A -15.123 -3.149 -4.237 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 76 C CD2 . LEU 726 726 ? A -14.062 -4.294 -2.257 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 77 N N . THR 727 727 ? A -18.075 -1.789 0.519 1 1 B THR 0.670 1 ATOM 78 C CA . THR 727 727 ? A -18.514 -0.880 1.587 1 1 B THR 0.670 1 ATOM 79 C C . THR 727 727 ? A -18.410 -1.496 2.975 1 1 B THR 0.670 1 ATOM 80 O O . THR 727 727 ? A -17.927 -0.870 3.919 1 1 B THR 0.670 1 ATOM 81 C CB . THR 727 727 ? A -19.956 -0.428 1.380 1 1 B THR 0.670 1 ATOM 82 O OG1 . THR 727 727 ? A -20.034 0.370 0.212 1 1 B THR 0.670 1 ATOM 83 C CG2 . THR 727 727 ? A -20.486 0.458 2.517 1 1 B THR 0.670 1 ATOM 84 N N . GLU 728 728 ? A -18.830 -2.770 3.136 1 1 B GLU 0.620 1 ATOM 85 C CA . GLU 728 728 ? A -18.639 -3.512 4.375 1 1 B GLU 0.620 1 ATOM 86 C C . GLU 728 728 ? A -17.163 -3.739 4.715 1 1 B GLU 0.620 1 ATOM 87 O O . GLU 728 728 ? A -16.719 -3.535 5.846 1 1 B GLU 0.620 1 ATOM 88 C CB . GLU 728 728 ? A -19.424 -4.852 4.335 1 1 B GLU 0.620 1 ATOM 89 C CG . GLU 728 728 ? A -19.144 -5.828 5.509 1 1 B GLU 0.620 1 ATOM 90 C CD . GLU 728 728 ? A -19.349 -5.268 6.908 1 1 B GLU 0.620 1 ATOM 91 O OE1 . GLU 728 728 ? A -19.878 -4.150 7.102 1 1 B GLU 0.620 1 ATOM 92 O OE2 . GLU 728 728 ? A -18.940 -5.982 7.861 1 1 B GLU 0.620 1 ATOM 93 N N . GLN 729 729 ? A -16.332 -4.106 3.718 1 1 B GLN 0.640 1 ATOM 94 C CA . GLN 729 729 ? A -14.889 -4.217 3.879 1 1 B GLN 0.640 1 ATOM 95 C C . GLN 729 729 ? A -14.212 -2.917 4.298 1 1 B GLN 0.640 1 ATOM 96 O O . GLN 729 729 ? A -13.404 -2.919 5.224 1 1 B GLN 0.640 1 ATOM 97 C CB . GLN 729 729 ? A -14.231 -4.744 2.582 1 1 B GLN 0.640 1 ATOM 98 C CG . GLN 729 729 ? A -14.497 -6.244 2.309 1 1 B GLN 0.640 1 ATOM 99 C CD . GLN 729 729 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #