data_SMR-6103cdf93f14b929d6123cab89ba5b05_2 _entry.id SMR-6103cdf93f14b929d6123cab89ba5b05_2 _struct.entry_id SMR-6103cdf93f14b929d6123cab89ba5b05_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P46889/ FTSK_ECOLI, DNA translocase FtsK - Q1JQN2/ Q1JQN2_ECOLX, DNA translocase FtsK Estimated model accuracy of this model is 0.065, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P46889, Q1JQN2' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 170720.054 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP FTSK_ECOLI P46889 1 ;MSQEYIEDKEVTLTKLSSGRRLLEALLILIVLFAVWLMAALLSFNPSDPSWSQTAWHEPIHNLGGMPGAW LADTLFFIFGVMAYTIPVIIVGGCWFAWRHQSSDEYIDYFAVSLRIIGVLALILTSCGLAAINADDIWYF ASGGVIGSLLSTTLQPLLHSSGGTIALLCVWAAGLTLFTGWSWVTIAEKLGGWILNILTFASNRTRRDDT WVDEDEYEDDEEYEDENHGKQHESRRARILRGALARRKRLAEKFINPMGRQTDAALFSGKRMDDDEEITY TARGVAADPDDVLFSGNRATQPEYDEYDPLLNGAPITEPVAVAAAATTATQSWAAPVEPVTQTPPVASVD VPPAQPTVAWQPVPGPQTGEPVIAPAPEGYPQQSQYAQPAVQYNEPLQQPVQPQQPYYAPAAEQPAQQPY YAPAPEQPVAGNAWQAEEQQSTFAPQSTYQTEQTYQQPAAQEPLYQQPQPVEQQPVVEPEPVVEETKPAR PPLYYFEEVEEKRAREREQLAAWYQPIPEPVKEPEPIKSSLKAPSVAAVPPVEAAAAVSPLASGVKKATL ATGAAATVAAPVFSLANSGGPRPQVKEGIGPQLPRPKRIRVPTRRELASYGIKLPSQRAAEEKAREAQRN QYDSGDQYNDDEIDAMQQDELARQFAQTQQQRYGEQYQHDVPVNAEDADAAAEAELARQFAQTQQQRYSG EQPAGANPFSLDDFEFSPMKALLDDGPHEPLFTPIVEPVQQPQQPVAPQQQYQQPQQPVPPQPQYQQPQQ PVAPQPQYQQPQQPVAPQQQYQQPQQPVAPQQQYQQPQQPVAPQPQDTLLHPLLMRNGDSRPLHKPTTPL PSLDLLTPPPSEVEPVDTFALEQMARLVEARLADFRIKADVVNYSPGPVITRFELNLAPGVKAARISNLS RDLARSLSTVAVRVVEVIPGKPYVGLELPNKKRQTVYLREVLDNAKFRDNPSPLTVVLGKDIAGEPVVAD LAKMPHLLVAGTTGSGKSVGVNAMILSMLYKAQPEDVRFIMIDPKMLELSVYEGIPHLLTEVVTDMKDAA NALRWCVNEMERRYKLMSALGVRNLAGYNEKIAEADRMMRPIPDPYWKPGDSMDAQHPVLKKEPYIVVLV DEFADLMMTVGKKVEELIARLAQKARAAGIHLVLATQRPSVDVITGLIKANIPTRIAFTVSSKIDSRTIL DQAGAESLLGMGDMLYSGPNSTLPVRVHGAFVRDQEVHAVVQDWKARGRPQYVDGITSDSESEGGAGGFD GAEELDPLFDQAVQFVTEKRKASISGVQRQFRIGYNRAARIIEQMEAQGIVSEQGHNGNREVLAPPPFD ; 'DNA translocase FtsK' 2 1 UNP Q1JQN2_ECOLX Q1JQN2 1 ;MSQEYIEDKEVTLTKLSSGRRLLEALLILIVLFAVWLMAALLSFNPSDPSWSQTAWHEPIHNLGGMPGAW LADTLFFIFGVMAYTIPVIIVGGCWFAWRHQSSDEYIDYFAVSLRIIGVLALILTSCGLAAINADDIWYF ASGGVIGSLLSTTLQPLLHSSGGTIALLCVWAAGLTLFTGWSWVTIAEKLGGWILNILTFASNRTRRDDT WVDEDEYEDDEEYEDENHGKQHESRRARILRGALARRKRLAEKFINPMGRQTDAALFSGKRMDDDEEITY TARGVAADPDDVLFSGNRATQPEYDEYDPLLNGAPITEPVAVAAAATTATQSWAAPVEPVTQTPPVASVD VPPAQPTVAWQPVPGPQTGEPVIAPAPEGYPQQSQYAQPAVQYNEPLQQPVQPQQPYYAPAAEQPAQQPY YAPAPEQPVAGNAWQAEEQQSTFAPQSTYQTEQTYQQPAAQEPLYQQPQPVEQQPVVEPEPVVEETKPAR PPLYYFEEVEEKRAREREQLAAWYQPIPEPVKEPEPIKSSLKAPSVAAVPPVEAAAAVSPLASGVKKATL ATGAAATVAAPVFSLANSGGPRPQVKEGIGPQLPRPKRIRVPTRRELASYGIKLPSQRAAEEKAREAQRN QYDSGDQYNDDEIDAMQQDELARQFAQTQQQRYGEQYQHDVPVNAEDADAAAEAELARQFAQTQQQRYSG EQPAGANPFSLDDFEFSPMKALLDDGPHEPLFTPIVEPVQQPQQPVAPQQQYQQPQQPVPPQPQYQQPQQ PVAPQPQYQQPQQPVAPQQQYQQPQQPVAPQQQYQQPQQPVAPQPQDTLLHPLLMRNGDSRPLHKPTTPL PSLDLLTPPPSEVEPVDTFALEQMARLVEARLADFRIKADVVNYSPGPVITRFELNLAPGVKAARISNLS RDLARSLSTVAVRVVEVIPGKPYVGLELPNKKRQTVYLREVLDNAKFRDNPSPLTVVLGKDIAGEPVVAD LAKMPHLLVAGTTGSGKSVGVNAMILSMLYKAQPEDVRFIMIDPKMLELSVYEGIPHLLTEVVTDMKDAA NALRWCVNEMERRYKLMSALGVRNLAGYNEKIAEADRMMRPIPDPYWKPGDSMDAQHPVLKKEPYIVVLV DEFADLMMTVGKKVEELIARLAQKARAAGIHLVLATQRPSVDVITGLIKANIPTRIAFTVSSKIDSRTIL DQAGAESLLGMGDMLYSGPNSTLPVRVHGAFVRDQEVHAVVQDWKARGRPQYVDGITSDSESEGGAGGFD GAEELDPLFDQAVQFVTEKRKASISGVQRQFRIGYNRAARIIEQMEAQGIVSEQGHNGNREVLAPPPFD ; 'DNA translocase FtsK' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1329 1 1329 2 2 1 1329 1 1329 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . FTSK_ECOLI P46889 . 1 1329 83333 'Escherichia coli (strain K12)' 1997-11-01 ED24BFB464481CFC 1 UNP . Q1JQN2_ECOLX Q1JQN2 . 1 1329 562 'Escherichia coli' 2006-06-13 ED24BFB464481CFC # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MSQEYIEDKEVTLTKLSSGRRLLEALLILIVLFAVWLMAALLSFNPSDPSWSQTAWHEPIHNLGGMPGAW LADTLFFIFGVMAYTIPVIIVGGCWFAWRHQSSDEYIDYFAVSLRIIGVLALILTSCGLAAINADDIWYF ASGGVIGSLLSTTLQPLLHSSGGTIALLCVWAAGLTLFTGWSWVTIAEKLGGWILNILTFASNRTRRDDT WVDEDEYEDDEEYEDENHGKQHESRRARILRGALARRKRLAEKFINPMGRQTDAALFSGKRMDDDEEITY TARGVAADPDDVLFSGNRATQPEYDEYDPLLNGAPITEPVAVAAAATTATQSWAAPVEPVTQTPPVASVD VPPAQPTVAWQPVPGPQTGEPVIAPAPEGYPQQSQYAQPAVQYNEPLQQPVQPQQPYYAPAAEQPAQQPY YAPAPEQPVAGNAWQAEEQQSTFAPQSTYQTEQTYQQPAAQEPLYQQPQPVEQQPVVEPEPVVEETKPAR PPLYYFEEVEEKRAREREQLAAWYQPIPEPVKEPEPIKSSLKAPSVAAVPPVEAAAAVSPLASGVKKATL ATGAAATVAAPVFSLANSGGPRPQVKEGIGPQLPRPKRIRVPTRRELASYGIKLPSQRAAEEKAREAQRN 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GAEELDPLFDQAVQFVTEKRKASISGVQRQFRIGYNRAARIIEQMEAQGIVSEQGHNGNREVLAPPPFD ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 SER . 1 3 GLN . 1 4 GLU . 1 5 TYR . 1 6 ILE . 1 7 GLU . 1 8 ASP . 1 9 LYS . 1 10 GLU . 1 11 VAL . 1 12 THR . 1 13 LEU . 1 14 THR . 1 15 LYS . 1 16 LEU . 1 17 SER . 1 18 SER . 1 19 GLY . 1 20 ARG . 1 21 ARG . 1 22 LEU . 1 23 LEU . 1 24 GLU . 1 25 ALA . 1 26 LEU . 1 27 LEU . 1 28 ILE . 1 29 LEU . 1 30 ILE . 1 31 VAL . 1 32 LEU . 1 33 PHE . 1 34 ALA . 1 35 VAL . 1 36 TRP . 1 37 LEU . 1 38 MET . 1 39 ALA . 1 40 ALA . 1 41 LEU . 1 42 LEU . 1 43 SER . 1 44 PHE . 1 45 ASN . 1 46 PRO . 1 47 SER . 1 48 ASP . 1 49 PRO . 1 50 SER . 1 51 TRP . 1 52 SER . 1 53 GLN . 1 54 THR . 1 55 ALA . 1 56 TRP . 1 57 HIS . 1 58 GLU . 1 59 PRO . 1 60 ILE . 1 61 HIS . 1 62 ASN . 1 63 LEU . 1 64 GLY . 1 65 GLY . 1 66 MET . 1 67 PRO . 1 68 GLY . 1 69 ALA . 1 70 TRP . 1 71 LEU . 1 72 ALA . 1 73 ASP . 1 74 THR . 1 75 LEU . 1 76 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A 1 1304 GLN 1304 1304 GLN GLN A . A 1 1305 MET 1305 1305 MET MET A . A 1 1306 GLU 1306 1306 GLU GLU A . A 1 1307 ALA 1307 1307 ALA ALA A . A 1 1308 GLN 1308 1308 GLN GLN A . A 1 1309 GLY 1309 1309 GLY GLY A . A 1 1310 ILE 1310 1310 ILE ILE A . A 1 1311 VAL 1311 1311 VAL VAL A . A 1 1312 SER 1312 1312 SER SER A . A 1 1313 GLU 1313 1313 GLU GLU A . A 1 1314 GLN 1314 1314 GLN GLN A . A 1 1315 GLY 1315 1315 GLY GLY A . A 1 1316 HIS 1316 1316 HIS HIS A . A 1 1317 ASN 1317 1317 ASN ASN A . A 1 1318 GLY 1318 1318 GLY GLY A . A 1 1319 ASN 1319 1319 ASN ASN A . A 1 1320 ARG 1320 1320 ARG ARG A . A 1 1321 GLU 1321 1321 GLU GLU A . A 1 1322 VAL 1322 1322 VAL VAL A . A 1 1323 LEU 1323 1323 LEU LEU A . A 1 1324 ALA 1324 1324 ALA ALA A . A 1 1325 PRO 1325 1325 PRO PRO A . A 1 1326 PRO 1326 1326 PRO PRO A . A 1 1327 PRO 1327 1327 PRO PRO A . A 1 1328 PHE 1328 1328 PHE PHE A . A 1 1329 ASP 1329 1329 ASP ASP A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'DNA TRANSLOCASE FTSK {PDB ID=2j5p, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2j5p.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2j5p, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MHHHHHHGAEELDPLFDQAVQFVTEKRKASISGVQRQFRIGYNRAARIIEQMEAQGIVSEQGHNGNREVL APPPFD ; ;MHHHHHHGAEELDPLFDQAVQFVTEKRKASISGVQRQFRIGYNRAARIIEQMEAQGIVSEQGHNGNREVL APPPFD ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 9 76 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2j5p 2024-05-15 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1329 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1329 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 4e-15 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSQEYIEDKEVTLTKLSSGRRLLEALLILIVLFAVWLMAALLSFNPSDPSWSQTAWHEPIHNLGGMPGAWLADTLFFIFGVMAYTIPVIIVGGCWFAWRHQSSDEYIDYFAVSLRIIGVLALILTSCGLAAINADDIWYFASGGVIGSLLSTTLQPLLHSSGGTIALLCVWAAGLTLFTGWSWVTIAEKLGGWILNILTFASNRTRRDDTWVDEDEYEDDEEYEDENHGKQHESRRARILRGALARRKRLAEKFINPMGRQTDAALFSGKRMDDDEEITYTARGVAADPDDVLFSGNRATQPEYDEYDPLLNGAPITEPVAVAAAATTATQSWAAPVEPVTQTPPVASVDVPPAQPTVAWQPVPGPQTGEPVIAPAPEGYPQQSQYAQPAVQYNEPLQQPVQPQQPYYAPAAEQPAQQPYYAPAPEQPVAGNAWQAEEQQSTFAPQSTYQTEQTYQQPAAQEPLYQQPQPVEQQPVVEPEPVVEETKPARPPLYYFEEVEEKRAREREQLAAWYQPIPEPVKEPEPIKSSLKAPSVAAVPPVEAAAAVSPLASGVKKATLATGAAATVAAPVFSLANSGGPRPQVKEGIGPQLPRPKRIRVPTRRELASYGIKLPSQRAAEEKAREAQRNQYDSGDQYNDDEIDAMQQDELARQFAQTQQQRYGEQYQHDVPVNAEDADAAAEAELARQFAQTQQQRYSGEQPAGANPFSLDDFEFSPMKALLDDGPHEPLFTPIVEPVQQPQQPVAPQQQYQQPQQPVPPQPQYQQPQQPVAPQPQYQQPQQPVAPQQQYQQPQQPVAPQQQYQQPQQPVAPQPQDTLLHPLLMRNGDSRPLHKPTTPLPSLDLLTPPPSEVEPVDTFALEQMARLVEARLADFRIKADVVNYSPGPVITRFELNLAPGVKAARISNLSRDLARSLSTVAVRVVEVIPGKPYVGLELPNKKRQTVYLREVLDNAKFRDNPSPLTVVLGKDIAGEPVVADLAKMPHLLVAGTTGSGKSVGVNAMILSMLYKAQPEDVRFIMIDPKMLELSVYEGIPHLLTEVVTDMKDAANALRWCVNEMERRYKLMSALGVRNLAGYNEKIAEADRMMRPIPDPYWKPGDSMDAQHPVLKKEPYIVVLVDEFADLMMTVGKKVEELIARLAQKARAAGIHLVLATQRPSVDVITGLIKANIPTRIAFTVSSKIDSRTILDQAGAESLLGMGDMLYSGPNSTLPVRVHGAFVRDQEVHAVVQDWKARGRPQYVDGITSDSESEGGAGGFDGAEELDPLFDQAVQFVTEKRKASISGVQRQFRIGYNRAARIIEQMEAQGIVSEQGHNGNREVLAPPPFD 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AEELDPLFDQAVQFVTEKRKASISGVQRQFRIGYNRAARIIEQMEAQGIVSEQGHNGNREVLAPPPFD # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2j5p.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ALA 1262 1262 ? A 13.248 5.834 2.743 1 1 A ALA 0.520 1 ATOM 2 C CA . ALA 1262 1262 ? A 13.678 4.402 2.819 1 1 A ALA 0.520 1 ATOM 3 C C . ALA 1262 1262 ? A 14.181 3.874 4.154 1 1 A ALA 0.520 1 ATOM 4 O O . ALA 1262 1262 ? A 14.195 2.672 4.360 1 1 A ALA 0.520 1 ATOM 5 C CB . ALA 1262 1262 ? A 14.718 4.193 1.703 1 1 A ALA 0.520 1 ATOM 6 N N . GLU 1263 1263 ? A 14.573 4.739 5.118 1 1 A GLU 0.370 1 ATOM 7 C CA . GLU 1263 1263 ? A 14.990 4.293 6.440 1 1 A GLU 0.370 1 ATOM 8 C C . GLU 1263 1263 ? A 13.903 3.533 7.194 1 1 A GLU 0.370 1 ATOM 9 O O . GLU 1263 1263 ? A 14.099 2.442 7.713 1 1 A GLU 0.370 1 ATOM 10 C CB . GLU 1263 1263 ? A 15.346 5.551 7.263 1 1 A GLU 0.370 1 ATOM 11 C CG . GLU 1263 1263 ? A 16.565 6.319 6.705 1 1 A GLU 0.370 1 ATOM 12 C CD . GLU 1263 1263 ? A 17.886 5.716 7.173 1 1 A GLU 0.370 1 ATOM 13 O OE1 . GLU 1263 1263 ? A 18.138 5.741 8.400 1 1 A GLU 0.370 1 ATOM 14 O OE2 . GLU 1263 1263 ? A 18.645 5.249 6.290 1 1 A GLU 0.370 1 ATOM 15 N N . GLU 1264 1264 ? A 12.684 4.096 7.204 1 1 A GLU 0.600 1 ATOM 16 C CA . GLU 1264 1264 ? A 11.535 3.489 7.841 1 1 A GLU 0.600 1 ATOM 17 C C . GLU 1264 1264 ? A 10.579 2.922 6.813 1 1 A GLU 0.600 1 ATOM 18 O O . GLU 1264 1264 ? A 10.039 1.830 6.990 1 1 A GLU 0.600 1 ATOM 19 C CB . GLU 1264 1264 ? A 10.797 4.543 8.702 1 1 A GLU 0.600 1 ATOM 20 C CG . GLU 1264 1264 ? A 11.147 5.995 8.302 1 1 A GLU 0.600 1 ATOM 21 C CD . GLU 1264 1264 ? A 10.380 7.025 9.117 1 1 A GLU 0.600 1 ATOM 22 O OE1 . GLU 1264 1264 ? A 10.279 6.853 10.353 1 1 A GLU 0.600 1 ATOM 23 O OE2 . GLU 1264 1264 ? A 9.908 7.997 8.477 1 1 A GLU 0.600 1 ATOM 24 N N . LEU 1265 1265 ? A 10.347 3.645 5.697 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 25 C CA . LEU 1265 1265 ? A 9.594 3.154 4.558 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 26 C C . LEU 1265 1265 ? A 10.249 2.031 3.781 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 27 O O . LEU 1265 1265 ? A 11.461 2.001 3.597 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 28 C CB . LEU 1265 1265 ? A 9.291 4.271 3.533 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 29 C CG . LEU 1265 1265 ? A 8.174 5.237 3.954 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 30 C CD1 . LEU 1265 1265 ? A 7.902 6.258 2.844 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 31 C CD2 . LEU 1265 1265 ? A 6.897 4.492 4.345 1 1 A LEU 0.800 1 ATOM 32 N N . ASP 1266 1266 ? A 9.427 1.115 3.244 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 33 C CA . ASP 1266 1266 ? A 9.834 0.089 2.311 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 34 C C . ASP 1266 1266 ? A 10.466 0.588 0.996 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 35 O O . ASP 1266 1266 ? A 10.009 1.599 0.468 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 36 C CB . ASP 1266 1266 ? A 8.590 -0.757 1.980 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 37 C CG . ASP 1266 1266 ? A 8.978 -2.088 1.387 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 38 O OD1 . ASP 1266 1266 ? A 9.215 -2.162 0.155 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 39 O OD2 . ASP 1266 1266 ? A 9.127 -3.067 2.163 1 1 A ASP 0.850 1 ATOM 40 N N . PRO 1267 1267 ? A 11.462 -0.085 0.396 1 1 A PRO 0.860 1 ATOM 41 C CA . PRO 1267 1267 ? A 12.027 0.269 -0.904 1 1 A PRO 0.860 1 ATOM 42 C C . PRO 1267 1267 ? A 11.025 0.422 -2.025 1 1 A PRO 0.860 1 ATOM 43 O O . PRO 1267 1267 ? A 11.291 1.141 -2.983 1 1 A PRO 0.860 1 ATOM 44 C CB . PRO 1267 1267 ? A 12.994 -0.886 -1.219 1 1 A PRO 0.860 1 ATOM 45 C CG . PRO 1267 1267 ? A 13.424 -1.395 0.155 1 1 A PRO 0.860 1 ATOM 46 C CD . PRO 1267 1267 ? A 12.169 -1.215 0.999 1 1 A PRO 0.860 1 ATOM 47 N N . LEU 1268 1268 ? A 9.885 -0.275 -1.945 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 48 C CA . LEU 1268 1268 ? A 8.881 -0.237 -2.973 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 49 C C . LEU 1268 1268 ? A 7.719 0.657 -2.596 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 50 O O . LEU 1268 1268 ? A 6.718 0.700 -3.311 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 51 C CB . LEU 1268 1268 ? A 8.340 -1.659 -3.197 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 52 C CG . LEU 1268 1268 ? A 9.313 -2.613 -3.912 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 53 C CD1 . LEU 1268 1268 ? A 8.891 -4.066 -3.681 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 54 C CD2 . LEU 1268 1268 ? A 9.407 -2.307 -5.414 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 55 N N . PHE 1269 1269 ? A 7.808 1.404 -1.477 1 1 A PHE 0.890 1 ATOM 56 C CA . PHE 1269 1269 ? A 6.718 2.173 -0.920 1 1 A PHE 0.890 1 ATOM 57 C C . PHE 1269 1269 ? 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ASN 1319 1319 ? A -8.722 -3.322 2.179 1 1 A ASN 0.840 1 ATOM 455 O O . ASN 1319 1319 ? A -9.381 -3.088 3.192 1 1 A ASN 0.840 1 ATOM 456 C CB . ASN 1319 1319 ? A -10.305 -4.564 0.778 1 1 A ASN 0.840 1 ATOM 457 C CG . ASN 1319 1319 ? A -10.485 -5.555 -0.363 1 1 A ASN 0.840 1 ATOM 458 O OD1 . ASN 1319 1319 ? A -10.422 -5.162 -1.528 1 1 A ASN 0.840 1 ATOM 459 N ND2 . ASN 1319 1319 ? A -10.732 -6.842 -0.055 1 1 A ASN 0.840 1 ATOM 460 N N . ARG 1320 1320 ? A -7.845 -2.442 1.682 1 1 A ARG 0.780 1 ATOM 461 C CA . ARG 1320 1320 ? A -7.582 -1.159 2.264 1 1 A ARG 0.780 1 ATOM 462 C C . ARG 1320 1320 ? A -8.053 -0.066 1.323 1 1 A ARG 0.780 1 ATOM 463 O O . ARG 1320 1320 ? A -7.902 -0.111 0.102 1 1 A ARG 0.780 1 ATOM 464 C CB . ARG 1320 1320 ? A -6.076 -1.006 2.575 1 1 A ARG 0.780 1 ATOM 465 C CG . ARG 1320 1320 ? A -5.677 -1.497 3.975 1 1 A ARG 0.780 1 ATOM 466 C CD . ARG 1320 1320 ? A -4.843 -0.464 4.715 1 1 A ARG 0.780 1 ATOM 467 N NE . ARG 1320 1320 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.739 2 1 3 0.065 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1262 ALA 1 0.520 2 1 A 1263 GLU 1 0.370 3 1 A 1264 GLU 1 0.600 4 1 A 1265 LEU 1 0.800 5 1 A 1266 ASP 1 0.850 6 1 A 1267 PRO 1 0.860 7 1 A 1268 LEU 1 0.900 8 1 A 1269 PHE 1 0.890 9 1 A 1270 ASP 1 0.870 10 1 A 1271 GLN 1 0.840 11 1 A 1272 ALA 1 0.900 12 1 A 1273 VAL 1 0.880 13 1 A 1274 GLN 1 0.820 14 1 A 1275 PHE 1 0.860 15 1 A 1276 VAL 1 0.880 16 1 A 1277 THR 1 0.830 17 1 A 1278 GLU 1 0.740 18 1 A 1279 LYS 1 0.780 19 1 A 1280 ARG 1 0.650 20 1 A 1281 LYS 1 0.780 21 1 A 1282 ALA 1 0.860 22 1 A 1283 SER 1 0.760 23 1 A 1284 ILE 1 0.750 24 1 A 1285 SER 1 0.720 25 1 A 1286 GLY 1 0.850 26 1 A 1287 VAL 1 0.840 27 1 A 1288 GLN 1 0.710 28 1 A 1289 ARG 1 0.610 29 1 A 1290 GLN 1 0.720 30 1 A 1291 PHE 1 0.690 31 1 A 1292 ARG 1 0.560 32 1 A 1293 ILE 1 0.640 33 1 A 1294 GLY 1 0.630 34 1 A 1295 TYR 1 0.580 35 1 A 1296 ASN 1 0.720 36 1 A 1297 ARG 1 0.710 37 1 A 1298 ALA 1 0.840 38 1 A 1299 ALA 1 0.840 39 1 A 1300 ARG 1 0.760 40 1 A 1301 ILE 1 0.860 41 1 A 1302 ILE 1 0.850 42 1 A 1303 GLU 1 0.830 43 1 A 1304 GLN 1 0.820 44 1 A 1305 MET 1 0.840 45 1 A 1306 GLU 1 0.790 46 1 A 1307 ALA 1 0.770 47 1 A 1308 GLN 1 0.790 48 1 A 1309 GLY 1 0.840 49 1 A 1310 ILE 1 0.800 50 1 A 1311 VAL 1 0.790 51 1 A 1312 SER 1 0.620 52 1 A 1313 GLU 1 0.520 53 1 A 1314 GLN 1 0.520 54 1 A 1315 GLY 1 0.390 55 1 A 1316 HIS 1 0.460 56 1 A 1317 ASN 1 0.660 57 1 A 1318 GLY 1 0.850 58 1 A 1319 ASN 1 0.840 59 1 A 1320 ARG 1 0.780 60 1 A 1321 GLU 1 0.840 61 1 A 1322 VAL 1 0.900 62 1 A 1323 LEU 1 0.840 63 1 A 1324 ALA 1 0.850 64 1 A 1325 PRO 1 0.740 65 1 A 1326 PRO 1 0.710 66 1 A 1327 PRO 1 0.680 67 1 A 1328 PHE 1 0.300 68 1 A 1329 ASP 1 0.380 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #