data_SMR-307985378eba8d054e5fcbb5193ae2fd_3 _entry.id SMR-307985378eba8d054e5fcbb5193ae2fd_3 _struct.entry_id SMR-307985378eba8d054e5fcbb5193ae2fd_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9HAW4/ CLSPN_HUMAN, Claspin Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9HAW4' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 175415.964 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CLSPN_HUMAN Q9HAW4 1 ;MTGEVGSEVHLEINDPNVISQEEADSPSDSGQGSYETIGPLSEGDSDEEIFVSKKLKNRKVLQDSDSETE DTNASPEKTTYDSAEEENKENLYAGKNTKIKRIYKTVADSDESYMEKSLYQENLEAQVKPCLELSLQSGN STDFTTDRKSSKKHIHDKEGTAGKAKVKSKRRLEKEERKMEKIRQLKKKETKNQEDDVEQPFNDSGCLLV DKDLFETGLEDENNSPLEDEESLESIRAAVKNKVKKHKKKEPSLESGVHSFEEGSELSKGTTRKERKAAR LSKEALKQLHSETQRLIRESALNLPYHMPENKTIHDFFKRKPRPTCHGNAMALLKSSKYQSSHHKEIIDT ANTTEMNSDHHSKGSEQTTGAENEVETNALPVVSKETQIITGSDESCRKDLVKNEELEIQEKQKQSDIRP SPGDSSVLQQESNFLGNNHSEECQVGGLVAFEPHALEGEGPQNPEETDEKVEEPEQQNKSSAVGPPEKVR RFTLDRLKQLGVDVSIKPRLGADEDSFVILEPETNRELEALKQRFWKHANPAAKPRAGQTVNVNVIVKDM GTDGKEELKADVVPVTLAPKKLDGASHTKPGEKLQVLKAKLQEAMKLRRFEERQKRQALFKLDNEDGFEE EEEEEEEMTDESEEDGEEKVEKEEKEEELEEEEEKEEEEEEEGNQETAEFLLSSEEIETKDEKEMDKENN DGSSEIGKAVGFLSVPKSLSSDSTLLLFKDSSSKMGYFPTEEKSETDENSGKQPSKLDEDDSCSLLTKES SHNSSFELIGSTIPSYQPCNRQTGRGTSFFPTAGGFRSPSPGLFRASLVSSASKSSGKLSEPSLPIEDSQ DLYNASPEPKTLFLGAGDFQFCLEDDTQSQLLDADGFLNVRNHRNQYQALKPRLPLASMDENAMDANMDE LLDLCTGKFTSQAEKHLPRKSDKKENMEELLNLCSGKFTSQDASTPASSELNKQEKESSMGDPMEEALAL CSGSFPTDKEEEDEEEEFGDFRLVSNDNEFDSDEDEHSDSGNDLALEDHEDDDEEELLKRSEKLKRQMRL RKYLEDEAEVSGSDVGSEDEYDGEEIDEYEEDVIDEVLPSDEELQSQIKKIHMKTMLDDDKRQLRLYQER YLADGDLHSDGPGRMRKFRWKNIDDASQMDLFHRDSDDDQTEEQLDESEARWRKERIEREQWLRDMAQQG KITAEEEEEIGEDSQFMILAKKVTAKALQKNASRPMVIQESKSLLRNPFEAIRPGSAQQVKTGSLLNQPK AVLQKLAALSDHNPSAPRNSRNFVFHTLSPVKAEAAKESSKSQVKKRGPSFMTSPSPKHLKTDDSTSGLT RSIFKYLES ; Claspin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1339 1 1339 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CLSPN_HUMAN Q9HAW4 . 1 1339 9606 'Homo sapiens (Human)' 2008-12-16 3F3E392D5915955F # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no Y ;MTGEVGSEVHLEINDPNVISQEEADSPSDSGQGSYETIGPLSEGDSDEEIFVSKKLKNRKVLQDSDSETE DTNASPEKTTYDSAEEENKENLYAGKNTKIKRIYKTVADSDESYMEKSLYQENLEAQVKPCLELSLQSGN STDFTTDRKSSKKHIHDKEGTAGKAKVKSKRRLEKEERKMEKIRQLKKKETKNQEDDVEQPFNDSGCLLV DKDLFETGLEDENNSPLEDEESLESIRAAVKNKVKKHKKKEPSLESGVHSFEEGSELSKGTTRKERKAAR LSKEALKQLHSETQRLIRESALNLPYHMPENKTIHDFFKRKPRPTCHGNAMALLKSSKYQSSHHKEIIDT ANTTEMNSDHHSKGSEQTTGAENEVETNALPVVSKETQIITGSDESCRKDLVKNEELEIQEKQKQSDIRP SPGDSSVLQQESNFLGNNHSEECQVGGLVAFEPHALEGEGPQNPEETDEKVEEPEQQNKSSAVGPPEKVR RFTLDRLKQLGVDVSIKPRLGADEDSFVILEPETNRELEALKQRFWKHANPAAKPRAGQTVNVNVIVKDM GTDGKEELKADVVPVTLAPKKLDGASHTKPGEKLQVLKAKLQEAMKLRRFEERQKRQALFKLDNEDGFEE 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Y . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Putative NOC2 family protein {PDB ID=8i9v, label_asym_id=Y, auth_asym_id=CY, SMTL ID=8i9v.1.Y}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8i9v, label_asym_id=Y' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A Y 25 1 CY # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MGTAKKNLKATKKFEKKHLKGVLERRNKVKKIKQRQQLKEKEKAKRALDDEFYKGPNGDADKKKPGPNKA AEMSVDDFFKGGFEILSESKKKEKPAKLGKRKRDPEAEAEEQEEKSEFSENESDVSESDITDNDPISESE SESEGEESEDEDLGMSKSAMDALAEKDPDFYKFLKEHDPEALDFDENADLAEIDELSGSEDEEQPKKKQK TEEGGEGEEKKKKKKKKGKEGKDDRELTREMVAKWKKSMEETHSLRAARQVVIAFRCAATLHEIDEDNPP RYSITSPEVFHDIVVTALKHIPEVLQHHVPVKESSSGKTYVQTEGKKFKTLSMLIKNFTAAIIRLLSTLS DDGTLKLTLSALHPLLPYLLSFRKLLKMLIKTVVAFWSQSASTDSTRITAFLVIRRLVVIGDKAVRETVL KASYQGLVQGCRVTNANTLSGINLMKNSAAELWGLDQNLGYTTAFTSIRQLAIHLRNSIINNKNQAYRNV YNWQYVHSLDFWSCVLSEHCSPLKEAEAGKESPLRPLIYPLVQVTLGAMRLIPTAIYFPLRFHLIRSLLR LSRATDTYIPLASALLEVLQSAEMKKPPKSSTLKPLDFATAYKTPKSYLRTRVYQDGVGEQVVELLSEFF VLWSRNIAFPEFALPTIVALKRWMKEMRKPGKGNKNAKLGSSLVVLVQKLEMNAKFIEERRAKVDFAPKD RAQVDAFLKDLEWEKTPLGAYVVAQRKLREERKRLMEEARREEERKRREEKAAEREEGSEEEEEDEEMED AEGGEGSDEDEDEKGGGE ; ;MGTAKKNLKATKKFEKKHLKGVLERRNKVKKIKQRQQLKEKEKAKRALDDEFYKGPNGDADKKKPGPNKA AEMSVDDFFKGGFEILSESKKKEKPAKLGKRKRDPEAEAEEQEEKSEFSENESDVSESDITDNDPISESE SESEGEESEDEDLGMSKSAMDALAEKDPDFYKFLKEHDPEALDFDENADLAEIDELSGSEDEEQPKKKQK TEEGGEGEEKKKKKKKKGKEGKDDRELTREMVAKWKKSMEETHSLRAARQVVIAFRCAATLHEIDEDNPP RYSITSPEVFHDIVVTALKHIPEVLQHHVPVKESSSGKTYVQTEGKKFKTLSMLIKNFTAAIIRLLSTLS DDGTLKLTLSALHPLLPYLLSFRKLLKMLIKTVVAFWSQSASTDSTRITAFLVIRRLVVIGDKAVRETVL KASYQGLVQGCRVTNANTLSGINLMKNSAAELWGLDQNLGYTTAFTSIRQLAIHLRNSIINNKNQAYRNV YNWQYVHSLDFWSCVLSEHCSPLKEAEAGKESPLRPLIYPLVQVTLGAMRLIPTAIYFPLRFHLIRSLLR LSRATDTYIPLASALLEVLQSAEMKKPPKSSTLKPLDFATAYKTPKSYLRTRVYQDGVGEQVVELLSEFF VLWSRNIAFPEFALPTIVALKRWMKEMRKPGKGNKNAKLGSSLVVLVQKLEMNAKFIEERRAKVDFAPKD RAQVDAFLKDLEWEKTPLGAYVVAQRKLREERKRLMEEARREEERKRREEKAAEREEGSEEEEEDEEMED AEGGEGSDEDEDEKGGGE ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 357 387 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8i9v 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1339 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1339 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 44.000 16.129 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MTGEVGSEVHLEINDPNVISQEEADSPSDSGQGSYETIGPLSEGDSDEEIFVSKKLKNRKVLQDSDSETEDTNASPEKTTYDSAEEENKENLYAGKNTKIKRIYKTVADSDESYMEKSLYQENLEAQVKPCLELSLQSGNSTDFTTDRKSSKKHIHDKEGTAGKAKVKSKRRLEKEERKMEKIRQLKKKETKNQEDDVEQPFNDSGCLLVDKDLFETGLEDENNSPLEDEESLESIRAAVKNKVKKHKKKEPSLESGVHSFEEGSELSKGTTRKERKAARLSKEALKQLHSETQRLIRESALNLPYHMPENKTIHDFFKRKPRPTCHGNAMALLKSSKYQSSHHKEIIDTANTTEMNSDHHSKGSEQTTGAENEVETNALPVVSKETQIITGSDESCRKDLVKNEELEIQEKQKQSDIRPSPGDSSVLQQESNFLGNNHSEECQVGGLVAFEPHALEGEGPQNPEETDEKVEEPEQQNKSSAVGPPEKVRRFTLDRLKQLGVDVSIKPRLGADEDSFVILEPETNRELEALKQRFWKHANPAAKPRAGQTVNVNVIVKDMGTDGKEELKADVVPVTLAPKKLDGASHTKPGEKLQVLKAKLQEAMKLRRFEERQKRQALFKLDNEDGFEEEEEEEEEMTDESEEDGEEKVEKEEKEEELEEEEEKEEEEEEEGNQETAEFLLSSEEIETKDEKEMDKENNDGSSEIGKAVGFLSVPKSLSSDSTLLLFKDSSSKMGYFPTEEKSETDENSGKQPSKLDEDDSCSLLTKESSHNSSFELIGSTIPSYQPCNRQTGRGTSFFPTAGGFRSPSPGLFRASLVSSASKSSGKLSEPSLPIEDSQDLYNASPEPKTLFLGAGDFQFCLEDDTQSQLLDADGFLNVRNHRNQYQALKPRLPLASMDENAMDANMDELLDLCTGKFTSQAEKHLPRKSDKKENMEELLNLCSGKFTSQDASTPASSELNKQEKESSMGDPMEEALALCSGSFPTDKEEEDEEEEFGDFRLVSNDNEFDSDEDEHSDSGNDLALEDHEDDDEEELLKRSEKLKRQMRLRKYLEDEAEVSGSDVGSEDEYDGEEIDEYEEDVIDEVLPSDEELQSQIKKIHMKTMLDDDKRQLRLYQERYLADGDLHSDGPGRMRKFRWKNIDDASQMDLFHRDSDDDQTEEQLDESEARWRKERIEREQWLRDMAQQGKITAEEEEEIGEDSQFMILAKKVTAKALQKNASRPMVIQESKSLLRNPFEAIRPGSAQQVKTGSLLNQPKAVLQKLAALSDHNPSAPRNSRNFVFHTLSPVKAEAAKESSKSQVKKRGPSFMTSPSPKHLKTDDSTSGLTRSIFKYLES 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LTLSALHPLLPYLLSFRKLLKMLIKTVVAFW------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8i9v.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PRO 309 309 ? A 122.733 168.329 151.856 1 1 Y PRO 0.670 1 ATOM 2 C CA . PRO 309 309 ? A 122.001 169.501 151.261 1 1 Y PRO 0.670 1 ATOM 3 C C . PRO 309 309 ? A 121.857 170.665 152.186 1 1 Y PRO 0.670 1 ATOM 4 O O . PRO 309 309 ? A 122.210 171.719 151.705 1 1 Y PRO 0.670 1 ATOM 5 C CB . PRO 309 309 ? A 120.721 168.965 150.695 1 1 Y PRO 0.670 1 ATOM 6 C CG . PRO 309 309 ? A 120.845 167.429 150.690 1 1 Y PRO 0.670 1 ATOM 7 C CD . PRO 309 309 ? A 121.898 167.059 151.699 1 1 Y PRO 0.670 1 ATOM 8 N N . GLU 310 310 ? A 121.359 170.582 153.438 1 1 Y GLU 0.670 1 ATOM 9 C CA . GLU 310 310 ? A 121.135 171.761 154.268 1 1 Y GLU 0.670 1 ATOM 10 C C . GLU 310 310 ? A 122.388 172.585 154.540 1 1 Y GLU 0.670 1 ATOM 11 O O . GLU 310 310 ? A 122.411 173.805 154.464 1 1 Y GLU 0.670 1 ATOM 12 C CB . GLU 310 310 ? A 120.478 171.332 155.578 1 1 Y GLU 0.670 1 ATOM 13 C CG . GLU 310 310 ? A 119.030 170.833 155.367 1 1 Y GLU 0.670 1 ATOM 14 C CD . GLU 310 310 ? A 118.426 170.320 156.667 1 1 Y GLU 0.670 1 ATOM 15 O OE1 . GLU 310 310 ? A 119.182 170.202 157.662 1 1 Y GLU 0.670 1 ATOM 16 O OE2 . GLU 310 310 ? A 117.210 170.012 156.639 1 1 Y GLU 0.670 1 ATOM 17 N N . ASN 311 311 ? A 123.525 171.910 154.769 1 1 Y ASN 0.550 1 ATOM 18 C CA . ASN 311 311 ? A 124.814 172.581 154.838 1 1 Y ASN 0.550 1 ATOM 19 C C . ASN 311 311 ? A 125.219 173.278 153.533 1 1 Y ASN 0.550 1 ATOM 20 O O . ASN 311 311 ? A 125.741 174.387 153.529 1 1 Y ASN 0.550 1 ATOM 21 C CB . ASN 311 311 ? A 125.914 171.568 155.234 1 1 Y ASN 0.550 1 ATOM 22 C CG . ASN 311 311 ? A 125.725 171.154 156.686 1 1 Y ASN 0.550 1 ATOM 23 O OD1 . ASN 311 311 ? A 125.110 171.849 157.488 1 1 Y ASN 0.550 1 ATOM 24 N ND2 . ASN 311 311 ? A 126.281 169.979 157.054 1 1 Y ASN 0.550 1 ATOM 25 N N . LYS 312 312 ? A 124.954 172.638 152.374 1 1 Y LYS 0.560 1 ATOM 26 C CA . LYS 312 312 ? A 125.168 173.223 151.058 1 1 Y LYS 0.560 1 ATOM 27 C C . LYS 312 312 ? A 124.275 174.429 150.778 1 1 Y LYS 0.560 1 ATOM 28 O O . LYS 312 312 ? A 124.748 175.448 150.287 1 1 Y LYS 0.560 1 ATOM 29 C CB . LYS 312 312 ? A 124.952 172.171 149.937 1 1 Y LYS 0.560 1 ATOM 30 C CG . LYS 312 312 ? A 126.019 171.069 149.930 1 1 Y LYS 0.560 1 ATOM 31 C CD . LYS 312 312 ? A 125.795 170.039 148.811 1 1 Y LYS 0.560 1 ATOM 32 C CE . LYS 312 312 ? A 126.892 168.967 148.766 1 1 Y LYS 0.560 1 ATOM 33 N NZ . LYS 312 312 ? A 126.623 167.972 147.701 1 1 Y LYS 0.560 1 ATOM 34 N N . THR 313 313 ? A 122.969 174.354 151.124 1 1 Y THR 0.590 1 ATOM 35 C CA . THR 313 313 ? A 121.986 175.424 150.949 1 1 Y THR 0.590 1 ATOM 36 C C . THR 313 313 ? A 122.325 176.646 151.772 1 1 Y THR 0.590 1 ATOM 37 O O . THR 313 313 ? A 122.164 177.777 151.316 1 1 Y THR 0.590 1 ATOM 38 C CB . THR 313 313 ? A 120.539 175.023 151.251 1 1 Y THR 0.590 1 ATOM 39 O OG1 . THR 313 313 ? A 120.407 174.428 152.526 1 1 Y THR 0.590 1 ATOM 40 C CG2 . THR 313 313 ? A 120.065 173.971 150.242 1 1 Y THR 0.590 1 ATOM 41 N N . ILE 314 314 ? A 122.842 176.445 153.006 1 1 Y ILE 0.550 1 ATOM 42 C CA . ILE 314 314 ? A 123.398 177.499 153.834 1 1 Y ILE 0.550 1 ATOM 43 C C . ILE 314 314 ? A 124.637 178.102 153.226 1 1 Y ILE 0.550 1 ATOM 44 O O . ILE 314 314 ? A 124.815 179.301 153.308 1 1 Y ILE 0.550 1 ATOM 45 C CB . ILE 314 314 ? A 123.702 177.057 155.261 1 1 Y ILE 0.550 1 ATOM 46 C CG1 . ILE 314 314 ? A 122.383 176.659 155.957 1 1 Y ILE 0.550 1 ATOM 47 C CG2 . ILE 314 314 ? A 124.418 178.176 156.071 1 1 Y ILE 0.550 1 ATOM 48 C CD1 . ILE 314 314 ? A 122.605 175.925 157.282 1 1 Y ILE 0.550 1 ATOM 49 N N . HIS 315 315 ? A 125.539 177.331 152.600 1 1 Y HIS 0.600 1 ATOM 50 C CA . HIS 315 315 ? A 126.779 177.856 152.055 1 1 Y HIS 0.600 1 ATOM 51 C C . HIS 315 315 ? A 126.593 178.829 150.907 1 1 Y HIS 0.600 1 ATOM 52 O O . HIS 315 315 ? A 127.206 179.883 150.889 1 1 Y HIS 0.600 1 ATOM 53 C CB . HIS 315 315 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.535 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 309 PRO 1 0.670 2 1 A 310 GLU 1 0.670 3 1 A 311 ASN 1 0.550 4 1 A 312 LYS 1 0.560 5 1 A 313 THR 1 0.590 6 1 A 314 ILE 1 0.550 7 1 A 315 HIS 1 0.600 8 1 A 316 ASP 1 0.710 9 1 A 317 PHE 1 0.610 10 1 A 318 PHE 1 0.600 11 1 A 319 LYS 1 0.710 12 1 A 320 ARG 1 0.330 13 1 A 321 LYS 1 0.380 14 1 A 322 PRO 1 0.380 15 1 A 323 ARG 1 0.350 16 1 A 324 PRO 1 0.430 17 1 A 325 THR 1 0.400 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #