data_SMR-c166389874112c0481c62891407b9c59_2 _entry.id SMR-c166389874112c0481c62891407b9c59_2 _struct.entry_id SMR-c166389874112c0481c62891407b9c59_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P46100 (isoform 2)/ ATRX_HUMAN, Transcriptional regulator ATRX Estimated model accuracy of this model is 0.002, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P46100 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 176139.746 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ATRX_HUMAN P46100 1 ;MTAEPMSESKLNTLVQKLHDFLAHSSEESEETSSPPRLAMNQNTDKISGSGSNSDMMENSKEEGTSSSEK SKSSGSSRSKRKPSIVTKYVESDDEKPLDDETVNEDASNENSENDITMQSLPKDGLHGIVSCTACGQQVN HFQKDSIYRHPSLQVLICKNCFKYYMSDDISRDSDGMDEQCRWCAEGGNLICCDFCHNAFCKKCILRNLG RKELSTIMDENNQWYCYICHPEPLLDLVTACNSVFENLEQLLQQNKKKIKVDSEKSNKVYEHTSRFSPKK TSSNCNGEEKKLDDSCSGSVTYSYSALIVPKEMIKKAKKLIETTANMNSSYVKFLKQATDNSEISSATKL RQLKAFKSVLADIKKAHLALEEDLNSEFRAMDAVNKEKNTKEHKVIDAKFETKARKGEKPCALEKKDISK SEAKLSRKQVDSEHMHQNVPTEEQRTNKSTGGEHKKSDRKEEPQYEPANTSEDLDMDIVSVPSSVPEDIF ENLETAMEVQSSVDHQGDGSSGTEQEVESSSVKLNISSKDNRGGADCQEVPQDKDGYKSCGLNPKLEKCG LGQENSDNEHLVENEVSLLLEESDLRRSPRVKTTPLRRPTETNPVTSNSDEECNETVKEKQKLSVPVRKK DKRNSSDSAIDNPKPNKLPKSKQSETVDQNSDSDEMLAILKEVSRMSHSSSSDTDINEIHTNHKTLYDLK TQAGKDDKGKRKRKSSTSGSDFDTKKGKSAKSSIISKKKRQTQSESSNYDSELEKEIKSMSKIGAARTTK KRIPNTKDFDSSEDEKHSKKGMDNQGHKNLKTSQEGSSDDAERKQERETFSSAEGTVDKDTTIMELRDRL PKKQQASASTDGVDKLSGKEESFTSLEVRKVAETKEKSKHLKTKTCKKVQDGLSDIAEKFLKKDQSDETS EDDKKQSKKGTEEKKKPSDFKKKVIKMEQQYESSSDGTEKLPEREEICHFPKGIKQIKNGTTDGEKKSKK IRDKTSKKKDELSDYAEKSTGKGDSCDSSEDKKSKNGAYGREKKRCKLLGKSSRKRQDCSSSDTEKYSMK EDGCNSSDKRLKRIELRERRNLSSKRNTKEIQSGSSSSDAEESSEDNKKKKQRTSSKKKAVIVKEKKRNS LRTSTKRKQADITSSSSSDIEDDDQNSIGEGSSDEQKIKPVTENLVLSSHTGFCQSSGDEALSKSVPVTV DDDDDDNDPENRIAKKMLLEEIKANLSSDEDGSSDDEPEEGKKRTGKQNEENPGDEEAKNQVNSESDSDS EESKKPRYRHRLLRHKLTVSDGESGEEKKTKPKEHKEVKGRNRRKVSSEDSEDSDFQESGVSEEVSESED EQRPRTRSAKKAELEENQRS ; 'Transcriptional regulator ATRX' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1350 1 1350 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ATRX_HUMAN P46100 P46100-2 1 1350 9606 'Homo sapiens (Human)' 2022-02-23 3BCF19CA24A2E867 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no D ;MTAEPMSESKLNTLVQKLHDFLAHSSEESEETSSPPRLAMNQNTDKISGSGSNSDMMENSKEEGTSSSEK SKSSGSSRSKRKPSIVTKYVESDDEKPLDDETVNEDASNENSENDITMQSLPKDGLHGIVSCTACGQQVN HFQKDSIYRHPSLQVLICKNCFKYYMSDDISRDSDGMDEQCRWCAEGGNLICCDFCHNAFCKKCILRNLG RKELSTIMDENNQWYCYICHPEPLLDLVTACNSVFENLEQLLQQNKKKIKVDSEKSNKVYEHTSRFSPKK TSSNCNGEEKKLDDSCSGSVTYSYSALIVPKEMIKKAKKLIETTANMNSSYVKFLKQATDNSEISSATKL RQLKAFKSVLADIKKAHLALEEDLNSEFRAMDAVNKEKNTKEHKVIDAKFETKARKGEKPCALEKKDISK SEAKLSRKQVDSEHMHQNVPTEEQRTNKSTGGEHKKSDRKEEPQYEPANTSEDLDMDIVSVPSSVPEDIF ENLETAMEVQSSVDHQGDGSSGTEQEVESSSVKLNISSKDNRGGADCQEVPQDKDGYKSCGLNPKLEKCG LGQENSDNEHLVENEVSLLLEESDLRRSPRVKTTPLRRPTETNPVTSNSDEECNETVKEKQKLSVPVRKK 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RKELSTIMDENNQWYCYICHPEPLLDLVTACNSVFENLEQLLQQNKKKIKVDSEKSNKVYEHTSRFSPKK TSSNCNGEEKKLDDSCSGSVTYSYSALIVPKEMIKKAKKLIETTANMNSSYVKFLKQATDNSEISSATKL RQLKAFKSVLADIKKAHLALEEDLNSEFRAMDAVNKEKNTKEHKVIDAKFETKARKGEKPCALEKKDISK SEAKLSRKQVDSEHMHQNVPTEEQRTNKSTGGEHKKSDRKEEPQYEPANTSEDLDMDIVSVPSSVPEDIF ENLETAMEVQSSVDHQGDGSSGTEQEVESSSVKLNISSKDNRGGADCQEVPQDKDGYKSCGLNPKLEKCG LGQENSDNEHLVENEVSLLLEESDLRRSPRVKTTPLRRPTETNPVTSNSDEECNETVKEKQKLSVPVRKK DKRNSSDSAIDNPKPNKLPKSKQSETVDQNSDSDEMLAILKEVSRMSHSSSSDTDINEIHTNHKTLYDLK TQAGKDDKGKRKRKSSTSGSDFDTKKGKSAKSSIISKKKRQTQSESSNYDSELEKEIKSMSKIGAARTTK KRIPNTKDFDSSEDEKHSKKGMDNQGHKNLKTSQEGSSDDAERKQERETFSSAEGTVDKDTTIMELRDRL PKKQQASASTDGVDKLSGKEESFTSLEVRKVAETKEKSKHLKTKTCKKVQDGLSDIAEKFLKKDQSDETS EDDKKQSKKGTEEKKKPSDFKKKVIKMEQQYESSSDGTEKLPEREEICHFPKGIKQIKNGTTDGEKKSKK IRDKTSKKKDELSDYAEKSTGKGDSCDSSEDKKSKNGAYGREKKRCKLLGKSSRKRQDCSSSDTEKYSMK EDGCNSSDKRLKRIELRERRNLSSKRNTKEIQSGSSSSDAEESSEDNKKKKQRTSSKKKAVIVKEKKRNS LRTSTKRKQADITSSSSSDIEDDDQNSIGEGSSDEQKIKPVTENLVLSSHTGFCQSSGDEALSKSVPVTV 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68 SER . 1 69 GLU . 1 70 LYS . 1 71 SER . 1 72 LYS . 1 73 SER . 1 74 SER . 1 75 GLY . 1 76 SER . 1 77 SER . 1 78 ARG . 1 79 SER . 1 80 LYS . 1 81 ARG . 1 82 LYS . 1 83 PRO . 1 84 SER . 1 85 ILE . 1 86 VAL . 1 87 THR . 1 88 LYS . 1 89 TYR . 1 90 VAL . 1 91 GLU . 1 92 SER . 1 93 ASP . 1 94 ASP . 1 95 GLU . 1 96 LYS . 1 97 PRO . 1 98 LEU . 1 99 ASP . 1 100 ASP . 1 101 GLU . 1 102 THR . 1 103 VAL . 1 104 ASN . 1 105 GLU . 1 106 ASP . 1 107 ALA . 1 108 SER . 1 109 ASN . 1 110 GLU . 1 111 ASN . 1 112 SER . 1 113 GLU . 1 114 ASN . 1 115 ASP . 1 116 ILE . 1 117 THR . 1 118 MET . 1 119 GLN . 1 120 SER . 1 121 LEU . 1 122 PRO . 1 123 LYS . 1 124 ASP . 1 125 GLY . 1 126 LEU . 1 127 HIS . 1 128 GLY . 1 129 ILE . 1 130 VAL . 1 131 SER . 1 132 CYS . 1 133 THR . 1 134 ALA . 1 135 CYS . 1 136 GLY . 1 137 GLN . 1 138 GLN . 1 139 VAL . 1 140 ASN . 1 141 HIS . 1 142 PHE . 1 143 GLN . 1 144 LYS . 1 145 ASP . 1 146 SER . 1 147 ILE . 1 148 TYR . 1 149 ARG . 1 150 HIS . 1 151 PRO . 1 152 SER . 1 153 LEU . 1 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A 1 1274 ARG 1274 ? ? ? D . A 1 1275 HIS 1275 ? ? ? D . A 1 1276 LYS 1276 ? ? ? D . A 1 1277 LEU 1277 ? ? ? D . A 1 1278 THR 1278 ? ? ? D . A 1 1279 VAL 1279 ? ? ? D . A 1 1280 SER 1280 ? ? ? D . A 1 1281 ASP 1281 ? ? ? D . A 1 1282 GLY 1282 ? ? ? D . A 1 1283 GLU 1283 ? ? ? D . A 1 1284 SER 1284 ? ? ? D . A 1 1285 GLY 1285 ? ? ? D . A 1 1286 GLU 1286 ? ? ? D . A 1 1287 GLU 1287 ? ? ? D . A 1 1288 LYS 1288 ? ? ? D . A 1 1289 LYS 1289 ? ? ? D . A 1 1290 THR 1290 ? ? ? D . A 1 1291 LYS 1291 ? ? ? D . A 1 1292 PRO 1292 ? ? ? D . A 1 1293 LYS 1293 ? ? ? D . A 1 1294 GLU 1294 ? ? ? D . A 1 1295 HIS 1295 ? ? ? D . A 1 1296 LYS 1296 ? ? ? D . A 1 1297 GLU 1297 ? ? ? D . A 1 1298 VAL 1298 ? ? ? D . A 1 1299 LYS 1299 ? ? ? D . A 1 1300 GLY 1300 ? ? ? D . A 1 1301 ARG 1301 ? ? ? D . A 1 1302 ASN 1302 ? ? ? D . A 1 1303 ARG 1303 ? ? ? D . A 1 1304 ARG 1304 ? ? ? D . A 1 1305 LYS 1305 ? ? ? D . A 1 1306 VAL 1306 ? ? ? D . A 1 1307 SER 1307 ? ? ? D . A 1 1308 SER 1308 ? ? ? D . A 1 1309 GLU 1309 ? ? ? D . A 1 1310 ASP 1310 ? ? ? D . A 1 1311 SER 1311 ? ? ? D . A 1 1312 GLU 1312 ? ? ? D . A 1 1313 ASP 1313 ? ? ? D . A 1 1314 SER 1314 ? ? ? D . A 1 1315 ASP 1315 ? ? ? D . A 1 1316 PHE 1316 ? ? ? D . A 1 1317 GLN 1317 ? ? ? D . A 1 1318 GLU 1318 ? ? ? D . A 1 1319 SER 1319 ? ? ? D . A 1 1320 GLY 1320 ? ? ? D . A 1 1321 VAL 1321 ? ? ? D . A 1 1322 SER 1322 ? ? ? D . A 1 1323 GLU 1323 ? ? ? D . A 1 1324 GLU 1324 ? ? ? D . A 1 1325 VAL 1325 ? ? ? D . A 1 1326 SER 1326 ? ? ? D . A 1 1327 GLU 1327 ? ? ? D . A 1 1328 SER 1328 ? ? ? D . A 1 1329 GLU 1329 ? ? ? D . A 1 1330 ASP 1330 ? ? ? D . A 1 1331 GLU 1331 ? ? ? D . A 1 1332 GLN 1332 ? ? ? D . A 1 1333 ARG 1333 ? ? ? D . A 1 1334 PRO 1334 ? ? ? D . A 1 1335 ARG 1335 ? ? ? D . A 1 1336 THR 1336 ? ? ? D . A 1 1337 ARG 1337 ? ? ? D . A 1 1338 SER 1338 ? ? ? D . A 1 1339 ALA 1339 ? ? ? D . A 1 1340 LYS 1340 ? ? ? D . A 1 1341 LYS 1341 ? ? ? D . A 1 1342 ALA 1342 ? ? ? D . A 1 1343 GLU 1343 ? ? ? D . A 1 1344 LEU 1344 ? ? ? D . A 1 1345 GLU 1345 ? ? ? D . A 1 1346 GLU 1346 ? ? ? D . A 1 1347 ASN 1347 ? ? ? D . A 1 1348 GLN 1348 ? ? ? D . A 1 1349 ARG 1349 ? ? ? D . A 1 1350 SER 1350 ? ? ? D . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Transcriptional regulator ATRX {PDB ID=5grq, label_asym_id=D, auth_asym_id=D, SMTL ID=5grq.1.D}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 5grq, label_asym_id=D' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A D 2 1 D # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 VTVDDDDDDNDPENRIAKKMLLEEIKANLS VTVDDDDDDNDPENRIAKKMLLEEIKANLS # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 5 30 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5grq 2024-03-20 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1350 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1350 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 5.5e-10 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MTAEPMSESKLNTLVQKLHDFLAHSSEESEETSSPPRLAMNQNTDKISGSGSNSDMMENSKEEGTSSSEKSKSSGSSRSKRKPSIVTKYVESDDEKPLDDETVNEDASNENSENDITMQSLPKDGLHGIVSCTACGQQVNHFQKDSIYRHPSLQVLICKNCFKYYMSDDISRDSDGMDEQCRWCAEGGNLICCDFCHNAFCKKCILRNLGRKELSTIMDENNQWYCYICHPEPLLDLVTACNSVFENLEQLLQQNKKKIKVDSEKSNKVYEHTSRFSPKKTSSNCNGEEKKLDDSCSGSVTYSYSALIVPKEMIKKAKKLIETTANMNSSYVKFLKQATDNSEISSATKLRQLKAFKSVLADIKKAHLALEEDLNSEFRAMDAVNKEKNTKEHKVIDAKFETKARKGEKPCALEKKDISKSEAKLSRKQVDSEHMHQNVPTEEQRTNKSTGGEHKKSDRKEEPQYEPANTSEDLDMDIVSVPSSVPEDIFENLETAMEVQSSVDHQGDGSSGTEQEVESSSVKLNISSKDNRGGADCQEVPQDKDGYKSCGLNPKLEKCGLGQENSDNEHLVENEVSLLLEESDLRRSPRVKTTPLRRPTETNPVTSNSDEECNETVKEKQKLSVPVRKKDKRNSSDSAIDNPKPNKLPKSKQSETVDQNSDSDEMLAILKEVSRMSHSSSSDTDINEIHTNHKTLYDLKTQAGKDDKGKRKRKSSTSGSDFDTKKGKSAKSSIISKKKRQTQSESSNYDSELEKEIKSMSKIGAARTTKKRIPNTKDFDSSEDEKHSKKGMDNQGHKNLKTSQEGSSDDAERKQERETFSSAEGTVDKDTTIMELRDRLPKKQQASASTDGVDKLSGKEESFTSLEVRKVAETKEKSKHLKTKTCKKVQDGLSDIAEKFLKKDQSDETSEDDKKQSKKGTEEKKKPSDFKKKVIKMEQQYESSSDGTEKLPEREEICHFPKGIKQIKNGTTDGEKKSKKIRDKTSKKKDELSDYAEKSTGKGDSCDSSEDKKSKNGAYGREKKRCKLLGKSSRKRQDCSSSDTEKYSMKEDGCNSSDKRLKRIELRERRNLSSKRNTKEIQSGSSSSDAEESSEDNKKKKQRTSSKKKAVIVKEKKRNSLRTSTKRKQADITSSSSSDIEDDDQNSIGEGSSDEQKIKPVTENLVLSSHTGFCQSSGDEALSKSVPVTVDDDDDDNDPENRIAKKMLLEEIKANLSSDEDGSSDDEPEEGKKRTGKQNEENPGDEEAKNQVNSESDSDSEESKKPRYRHRLLRHKLTVSDGESGEEKKTKPKEHKEVKGRNRRKVSSEDSEDSDFQESGVSEEVSESEDEQRPRTRSAKKAELEENQRS 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DDDDDNDPENRIAKKMLLEEIKANLS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5grq.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ASP 1192 1192 ? A 50.366 -1.595 113.060 1 1 D ASP 0.370 1 ATOM 2 C CA . ASP 1192 1192 ? A 49.780 -2.670 112.168 1 1 D ASP 0.370 1 ATOM 3 C C . ASP 1192 1192 ? A 49.859 -2.509 110.659 1 1 D ASP 0.370 1 ATOM 4 O O . ASP 1192 1192 ? A 49.704 -3.481 109.942 1 1 D ASP 0.370 1 ATOM 5 C CB . ASP 1192 1192 ? A 48.367 -3.002 112.695 1 1 D ASP 0.370 1 ATOM 6 C CG . ASP 1192 1192 ? A 48.684 -3.455 114.114 1 1 D ASP 0.370 1 ATOM 7 O OD1 . ASP 1192 1192 ? A 49.349 -4.503 114.247 1 1 D ASP 0.370 1 ATOM 8 O OD2 . ASP 1192 1192 ? A 48.694 -2.488 114.924 1 1 D ASP 0.370 1 ATOM 9 N N . ASP 1193 1193 ? A 50.229 -1.326 110.128 1 1 D ASP 0.370 1 ATOM 10 C CA . ASP 1193 1193 ? A 50.382 -1.141 108.689 1 1 D ASP 0.370 1 ATOM 11 C C . ASP 1193 1193 ? A 51.794 -1.461 108.207 1 1 D ASP 0.370 1 ATOM 12 O O . ASP 1193 1193 ? A 52.157 -1.252 107.054 1 1 D ASP 0.370 1 ATOM 13 C CB . ASP 1193 1193 ? A 50.123 0.343 108.361 1 1 D ASP 0.370 1 ATOM 14 C CG . ASP 1193 1193 ? 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A 54.468 -6.462 106.540 1 1 D ASP 0.620 1 ATOM 28 O O . ASP 1195 1195 ? A 53.866 -7.385 105.991 1 1 D ASP 0.620 1 ATOM 29 C CB . ASP 1195 1195 ? A 55.912 -5.112 105.115 1 1 D ASP 0.620 1 ATOM 30 C CG . ASP 1195 1195 ? A 56.097 -3.934 104.177 1 1 D ASP 0.620 1 ATOM 31 O OD1 . ASP 1195 1195 ? A 55.160 -3.610 103.417 1 1 D ASP 0.620 1 ATOM 32 O OD2 . ASP 1195 1195 ? A 57.250 -3.420 104.154 1 1 D ASP 0.620 1 ATOM 33 N N . ASP 1196 1196 ? A 55.025 -6.614 107.750 1 1 D ASP 0.540 1 ATOM 34 C CA . ASP 1196 1196 ? A 55.104 -7.892 108.395 1 1 D ASP 0.540 1 ATOM 35 C C . ASP 1196 1196 ? A 53.835 -8.205 109.192 1 1 D ASP 0.540 1 ATOM 36 O O . ASP 1196 1196 ? A 53.770 -9.234 109.861 1 1 D ASP 0.540 1 ATOM 37 C CB . ASP 1196 1196 ? A 56.319 -7.919 109.361 1 1 D ASP 0.540 1 ATOM 38 C CG . ASP 1196 1196 ? A 57.679 -7.988 108.663 1 1 D ASP 0.540 1 ATOM 39 O OD1 . ASP 1196 1196 ? A 57.751 -7.969 107.406 1 1 D ASP 0.540 1 ATOM 40 O OD2 . ASP 1196 1196 ? 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A 52.774 -13.196 103.457 1 1 D GLU 0.640 1 ATOM 67 O O . GLU 1200 1200 ? A 53.877 -13.517 103.012 1 1 D GLU 0.640 1 ATOM 68 C CB . GLU 1200 1200 ? A 50.585 -14.405 103.067 1 1 D GLU 0.640 1 ATOM 69 C CG . GLU 1200 1200 ? A 50.937 -15.181 101.771 1 1 D GLU 0.640 1 ATOM 70 C CD . GLU 1200 1200 ? A 49.806 -15.333 100.747 1 1 D GLU 0.640 1 ATOM 71 O OE1 . GLU 1200 1200 ? A 48.812 -14.569 100.787 1 1 D GLU 0.640 1 ATOM 72 O OE2 . GLU 1200 1200 ? A 49.963 -16.240 99.885 1 1 D GLU 0.640 1 ATOM 73 N N . ASN 1201 1201 ? A 52.416 -11.898 103.589 1 1 D ASN 0.670 1 ATOM 74 C CA . ASN 1201 1201 ? A 53.263 -10.771 103.221 1 1 D ASN 0.670 1 ATOM 75 C C . ASN 1201 1201 ? A 54.615 -10.738 103.955 1 1 D ASN 0.670 1 ATOM 76 O O . ASN 1201 1201 ? A 55.654 -10.531 103.333 1 1 D ASN 0.670 1 ATOM 77 C CB . ASN 1201 1201 ? A 52.512 -9.431 103.419 1 1 D ASN 0.670 1 ATOM 78 C CG . ASN 1201 1201 ? A 53.157 -8.331 102.578 1 1 D ASN 0.670 1 ATOM 79 O OD1 . ASN 1201 1201 ? A 53.211 -8.431 101.353 1 1 D ASN 0.670 1 ATOM 80 N ND2 . ASN 1201 1201 ? A 53.675 -7.268 103.229 1 1 D ASN 0.670 1 ATOM 81 N N . ARG 1202 1202 ? A 54.633 -11.002 105.285 1 1 D ARG 0.570 1 ATOM 82 C CA . ARG 1202 1202 ? A 55.841 -11.124 106.106 1 1 D ARG 0.570 1 ATOM 83 C C . ARG 1202 1202 ? A 56.810 -12.192 105.613 1 1 D ARG 0.570 1 ATOM 84 O O . ARG 1202 1202 ? A 58.018 -11.986 105.501 1 1 D ARG 0.570 1 ATOM 85 C CB . ARG 1202 1202 ? A 55.437 -11.520 107.559 1 1 D ARG 0.570 1 ATOM 86 C CG . ARG 1202 1202 ? A 56.623 -11.777 108.521 1 1 D ARG 0.570 1 ATOM 87 C CD . ARG 1202 1202 ? A 56.298 -11.793 110.022 1 1 D ARG 0.570 1 ATOM 88 N NE . ARG 1202 1202 ? A 55.296 -12.890 110.272 1 1 D ARG 0.570 1 ATOM 89 C CZ . ARG 1202 1202 ? A 54.107 -12.718 110.869 1 1 D ARG 0.570 1 ATOM 90 N NH1 . ARG 1202 1202 ? A 53.330 -13.774 111.109 1 1 D ARG 0.570 1 ATOM 91 N NH2 . ARG 1202 1202 ? A 53.621 -11.529 111.189 1 1 D ARG 0.570 1 ATOM 92 N N . ILE 1203 1203 ? A 56.280 -13.389 105.292 1 1 D ILE 0.620 1 ATOM 93 C CA . ILE 1203 1203 ? A 57.056 -14.489 104.733 1 1 D ILE 0.620 1 ATOM 94 C C . ILE 1203 1203 ? A 57.579 -14.170 103.335 1 1 D ILE 0.620 1 ATOM 95 O O . ILE 1203 1203 ? A 58.764 -14.349 103.050 1 1 D ILE 0.620 1 ATOM 96 C CB . ILE 1203 1203 ? A 56.253 -15.790 104.745 1 1 D ILE 0.620 1 ATOM 97 C CG1 . ILE 1203 1203 ? A 55.935 -16.201 106.203 1 1 D ILE 0.620 1 ATOM 98 C CG2 . ILE 1203 1203 ? A 57.015 -16.920 104.015 1 1 D ILE 0.620 1 ATOM 99 C CD1 . ILE 1203 1203 ? A 54.879 -17.307 106.309 1 1 D ILE 0.620 1 ATOM 100 N N . ALA 1204 1204 ? A 56.718 -13.631 102.443 1 1 D ALA 0.560 1 ATOM 101 C CA . ALA 1204 1204 ? A 57.079 -13.245 101.090 1 1 D ALA 0.560 1 ATOM 102 C C . ALA 1204 1204 ? A 58.153 -12.162 101.031 1 1 D ALA 0.560 1 ATOM 103 O O . ALA 1204 1204 ? A 59.114 -12.256 100.270 1 1 D ALA 0.560 1 ATOM 104 C CB . ALA 1204 1204 ? A 55.823 -12.761 100.334 1 1 D ALA 0.560 1 ATOM 105 N N . LYS 1205 1205 ? A 58.028 -11.119 101.878 1 1 D LYS 0.510 1 ATOM 106 C CA . LYS 1205 1205 ? A 59.019 -10.068 102.020 1 1 D LYS 0.510 1 ATOM 107 C C . LYS 1205 1205 ? A 60.366 -10.558 102.512 1 1 D LYS 0.510 1 ATOM 108 O O . LYS 1205 1205 ? A 61.402 -10.222 101.940 1 1 D LYS 0.510 1 ATOM 109 C CB . LYS 1205 1205 ? A 58.527 -8.995 103.015 1 1 D LYS 0.510 1 ATOM 110 C CG . LYS 1205 1205 ? A 59.505 -7.822 103.197 1 1 D LYS 0.510 1 ATOM 111 C CD . LYS 1205 1205 ? A 58.957 -6.761 104.157 1 1 D LYS 0.510 1 ATOM 112 C CE . LYS 1205 1205 ? A 59.881 -5.555 104.330 1 1 D LYS 0.510 1 ATOM 113 N NZ . LYS 1205 1205 ? A 59.270 -4.585 105.257 1 1 D LYS 0.510 1 ATOM 114 N N . LYS 1206 1206 ? A 60.384 -11.401 103.568 1 1 D LYS 0.490 1 ATOM 115 C CA . LYS 1206 1206 ? A 61.613 -11.992 104.065 1 1 D LYS 0.490 1 ATOM 116 C C . LYS 1206 1206 ? A 62.306 -12.837 103.004 1 1 D LYS 0.490 1 ATOM 117 O O . LYS 1206 1206 ? A 63.479 -12.634 102.709 1 1 D LYS 0.490 1 ATOM 118 C CB . LYS 1206 1206 ? A 61.332 -12.846 105.326 1 1 D LYS 0.490 1 ATOM 119 C CG . LYS 1206 1206 ? A 62.580 -13.552 105.880 1 1 D LYS 0.490 1 ATOM 120 C CD . LYS 1206 1206 ? A 62.364 -14.224 107.242 1 1 D LYS 0.490 1 ATOM 121 C CE . LYS 1206 1206 ? A 63.657 -14.856 107.765 1 1 D LYS 0.490 1 ATOM 122 N NZ . LYS 1206 1206 ? A 63.423 -15.407 109.114 1 1 D LYS 0.490 1 ATOM 123 N N . MET 1207 1207 ? A 61.549 -13.735 102.334 1 1 D MET 0.510 1 ATOM 124 C CA . MET 1207 1207 ? A 62.070 -14.549 101.251 1 1 D MET 0.510 1 ATOM 125 C C . MET 1207 1207 ? A 62.654 -13.750 100.093 1 1 D MET 0.510 1 ATOM 126 O O . MET 1207 1207 ? A 63.762 -14.025 99.636 1 1 D MET 0.510 1 ATOM 127 C CB . MET 1207 1207 ? A 60.953 -15.434 100.646 1 1 D MET 0.510 1 ATOM 128 C CG . MET 1207 1207 ? A 60.628 -16.707 101.444 1 1 D MET 0.510 1 ATOM 129 S SD . MET 1207 1207 ? A 59.326 -17.747 100.692 1 1 D MET 0.510 1 ATOM 130 C CE . MET 1207 1207 ? A 59.806 -17.712 98.930 1 1 D MET 0.510 1 ATOM 131 N N . LEU 1208 1208 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #