data_SMR-8fbd9470f303429389b049f069fd7c99_1 _entry.id SMR-8fbd9470f303429389b049f069fd7c99_1 _struct.entry_id SMR-8fbd9470f303429389b049f069fd7c99_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9UBW7/ ZMYM2_HUMAN, Zinc finger MYM-type protein 2 Estimated model accuracy of this model is 0.021, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9UBW7' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' ZN non-polymer 'ZINC ION' Zn 65.380 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 179880.160 1 . 2 non-polymer man 'ZINC ION' 65.380 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ZMYM2_HUMAN Q9UBW7 1 ;MDTSSVGGLELTDQTPVLLGSTAMATSLTNVGNSFSGPANPLVSRSNKFQNSSVEDDDDVVFIEPVQPPP PSVPVVADQRTITFTSSKNEELQGNDSKITPSSKELASQKGSVSETIVIDDEEDMETNQGQEKNSSNFIE RRPPETKNRTNDVDFSTSSFSRSKVNAGMGNSGITTEPDSEIQIANVTTLETGVSSVNDGQLENTDGRDM NLMITHVTSLQNTNLGDVSNGLQSSNFGVNIQTYTPSLTSQTKTGVGPFNPGRMNVAGDVFQNGESATHH NPDSWISQSASFPRNQKQPGVDSLSPVASLPKQIFQPSVQQQPTKPVKVTCANCKKPLQKGQTAYQRKGS AHLFCSTTCLSSFSHKPAPKKLCVMCKKDITTMKGTIVAQVDSSESFQEFCSTSCLSLYEDKQNPTKGAL NKSRCTICGKLTEIRHEVSFKNMTHKLCSDHCFNRYRMANGLIMNCCEQCGEYLPSKGAGNNVLVIDGQQ KRFCCQSCVSEYKQVGSHPSFLKEVRDHMQDSFLMQPEKYGKLTTCTGCRTQCRFFDMTQCIGPNGYMEP YCSTACMNSHKTKYAKSQSLGIICHFCKRNSLPQYQATMPDGKLYNFCNSSCVAKFQALSMQSSPNGQFV APSDIQLKCNYCKNSFCSKPEILEWENKVHQFCSKTCSDDYKKLHCIVTYCEYCQEEKTLHETVNFSGVK RPFCSEGCKLLYKQDFARRLGLRCVTCNYCSQLCKKGATKELDGVVRDFCSEDCCKKFQDWYYKAARCDC CKSQGTLKERVQWRGEMKHFCDQHCLLRFYCQQNEPNMTTQKGPENLHYDQGCQTSRTKMTGSAPPPSPT PNKEMKNKAVLCKPLTMTKATYCKPHMQTKSCQTDDTWRTEYVPVPIPVPVYIPVPMHMYSQNIPVPTTV PVPVPVPVFLPAPLDSSEKIPAAIEELKSKVSSDALDTELLTMTDMMSEDEGKTETTNINSVIIETDIIG SDLLKNSDPETQSSMPDVPYEPDLDIEIDFPRAAEELDMENEFLLPPVFGEEYEEQPRPRSKKKGAKRKA VSGYQSHDDSSDNSECSFPFKYTYGVNAWKHWVKTRQLDEDLLVLDELKSSKSVKLKEDLLSHTTAELNY GLAHFVNEIRRPNGENYAPDSIYYLCLGIQEYLCGSNRKDNIFIDPGYQTFEQELNKILRSWQPSILPDG SIFSRVEEDYLWRIKQLGSHSPVALLNTLFYFNTKYFGLKTVEQHLRLSFGTVFRHWKKNPLTMENKACL RYQVSSLCGTDNEDKITTGKRKHEDDEPVFEQIENTANPSRCPVKMFECYLSKSPQNLNQRMDVFYLQPE CSSSTDSPVWYTSTSLDRNTLENMLVRVLLVKDIYDKDNYELDEDTD ; 'Zinc finger MYM-type protein 2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1377 1 1377 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ZMYM2_HUMAN Q9UBW7 . 1 1377 9606 'Homo sapiens (Human)' 2000-05-01 2652D4C766492FF9 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MDTSSVGGLELTDQTPVLLGSTAMATSLTNVGNSFSGPANPLVSRSNKFQNSSVEDDDDVVFIEPVQPPP PSVPVVADQRTITFTSSKNEELQGNDSKITPSSKELASQKGSVSETIVIDDEEDMETNQGQEKNSSNFIE RRPPETKNRTNDVDFSTSSFSRSKVNAGMGNSGITTEPDSEIQIANVTTLETGVSSVNDGQLENTDGRDM NLMITHVTSLQNTNLGDVSNGLQSSNFGVNIQTYTPSLTSQTKTGVGPFNPGRMNVAGDVFQNGESATHH NPDSWISQSASFPRNQKQPGVDSLSPVASLPKQIFQPSVQQQPTKPVKVTCANCKKPLQKGQTAYQRKGS AHLFCSTTCLSSFSHKPAPKKLCVMCKKDITTMKGTIVAQVDSSESFQEFCSTSCLSLYEDKQNPTKGAL NKSRCTICGKLTEIRHEVSFKNMTHKLCSDHCFNRYRMANGLIMNCCEQCGEYLPSKGAGNNVLVIDGQQ KRFCCQSCVSEYKQVGSHPSFLKEVRDHMQDSFLMQPEKYGKLTTCTGCRTQCRFFDMTQCIGPNGYMEP YCSTACMNSHKTKYAKSQSLGIICHFCKRNSLPQYQATMPDGKLYNFCNSSCVAKFQALSMQSSPNGQFV 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NLMITHVTSLQNTNLGDVSNGLQSSNFGVNIQTYTPSLTSQTKTGVGPFNPGRMNVAGDVFQNGESATHH NPDSWISQSASFPRNQKQPGVDSLSPVASLPKQIFQPSVQQQPTKPVKVTCANCKKPLQKGQTAYQRKGS AHLFCSTTCLSSFSHKPAPKKLCVMCKKDITTMKGTIVAQVDSSESFQEFCSTSCLSLYEDKQNPTKGAL NKSRCTICGKLTEIRHEVSFKNMTHKLCSDHCFNRYRMANGLIMNCCEQCGEYLPSKGAGNNVLVIDGQQ KRFCCQSCVSEYKQVGSHPSFLKEVRDHMQDSFLMQPEKYGKLTTCTGCRTQCRFFDMTQCIGPNGYMEP YCSTACMNSHKTKYAKSQSLGIICHFCKRNSLPQYQATMPDGKLYNFCNSSCVAKFQALSMQSSPNGQFV APSDIQLKCNYCKNSFCSKPEILEWENKVHQFCSKTCSDDYKKLHCIVTYCEYCQEEKTLHETVNFSGVK RPFCSEGCKLLYKQDFARRLGLRCVTCNYCSQLCKKGATKELDGVVRDFCSEDCCKKFQDWYYKAARCDC CKSQGTLKERVQWRGEMKHFCDQHCLLRFYCQQNEPNMTTQKGPENLHYDQGCQTSRTKMTGSAPPPSPT PNKEMKNKAVLCKPLTMTKATYCKPHMQTKSCQTDDTWRTEYVPVPIPVPVYIPVPMHMYSQNIPVPTTV PVPVPVPVFLPAPLDSSEKIPAAIEELKSKVSSDALDTELLTMTDMMSEDEGKTETTNINSVIIETDIIG SDLLKNSDPETQSSMPDVPYEPDLDIEIDFPRAAEELDMENEFLLPPVFGEEYEEQPRPRSKKKGAKRKA VSGYQSHDDSSDNSECSFPFKYTYGVNAWKHWVKTRQLDEDLLVLDELKSSKSVKLKEDLLSHTTAELNY GLAHFVNEIRRPNGENYAPDSIYYLCLGIQEYLCGSNRKDNIFIDPGYQTFEQELNKILRSWQPSILPDG 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A 1 1290 PHE 1290 ? ? ? A . A 1 1291 GLU 1291 ? ? ? A . A 1 1292 GLN 1292 ? ? ? A . A 1 1293 ILE 1293 ? ? ? A . A 1 1294 GLU 1294 ? ? ? A . A 1 1295 ASN 1295 ? ? ? A . A 1 1296 THR 1296 ? ? ? A . A 1 1297 ALA 1297 ? ? ? A . A 1 1298 ASN 1298 ? ? ? A . A 1 1299 PRO 1299 ? ? ? A . A 1 1300 SER 1300 ? ? ? A . A 1 1301 ARG 1301 ? ? ? A . A 1 1302 CYS 1302 ? ? ? A . A 1 1303 PRO 1303 ? ? ? A . A 1 1304 VAL 1304 ? ? ? A . A 1 1305 LYS 1305 ? ? ? A . A 1 1306 MET 1306 ? ? ? A . A 1 1307 PHE 1307 ? ? ? A . A 1 1308 GLU 1308 ? ? ? A . A 1 1309 CYS 1309 ? ? ? A . A 1 1310 TYR 1310 ? ? ? A . A 1 1311 LEU 1311 ? ? ? A . A 1 1312 SER 1312 ? ? ? A . A 1 1313 LYS 1313 ? ? ? A . A 1 1314 SER 1314 ? ? ? A . A 1 1315 PRO 1315 ? ? ? A . A 1 1316 GLN 1316 ? ? ? A . A 1 1317 ASN 1317 ? ? ? A . A 1 1318 LEU 1318 ? ? ? A . A 1 1319 ASN 1319 ? ? ? A . A 1 1320 GLN 1320 ? ? ? A . A 1 1321 ARG 1321 ? ? ? A . A 1 1322 MET 1322 ? ? ? A . A 1 1323 ASP 1323 ? ? ? A . A 1 1324 VAL 1324 ? ? ? A . A 1 1325 PHE 1325 ? ? ? A . A 1 1326 TYR 1326 ? ? ? A . A 1 1327 LEU 1327 ? ? ? A . A 1 1328 GLN 1328 ? ? ? A . A 1 1329 PRO 1329 ? ? ? A . A 1 1330 GLU 1330 ? ? ? A . A 1 1331 CYS 1331 ? ? ? A . A 1 1332 SER 1332 ? ? ? A . A 1 1333 SER 1333 ? ? ? A . A 1 1334 SER 1334 ? ? ? A . A 1 1335 THR 1335 ? ? ? A . A 1 1336 ASP 1336 ? ? ? A . A 1 1337 SER 1337 ? ? ? A . A 1 1338 PRO 1338 ? ? ? A . A 1 1339 VAL 1339 ? ? ? A . A 1 1340 TRP 1340 ? ? ? A . A 1 1341 TYR 1341 ? ? ? A . A 1 1342 THR 1342 ? ? ? A . A 1 1343 SER 1343 ? ? ? A . A 1 1344 THR 1344 ? ? ? A . A 1 1345 SER 1345 ? ? ? A . A 1 1346 LEU 1346 ? ? ? A . A 1 1347 ASP 1347 ? ? ? A . A 1 1348 ARG 1348 ? ? ? A . A 1 1349 ASN 1349 ? ? ? A . A 1 1350 THR 1350 ? ? ? A . A 1 1351 LEU 1351 ? ? ? A . A 1 1352 GLU 1352 ? ? ? A . A 1 1353 ASN 1353 ? ? ? A . A 1 1354 MET 1354 ? ? ? A . A 1 1355 LEU 1355 ? ? ? A . A 1 1356 VAL 1356 ? ? ? A . A 1 1357 ARG 1357 ? ? ? A . A 1 1358 VAL 1358 ? ? ? A . A 1 1359 LEU 1359 ? ? ? A . A 1 1360 LEU 1360 ? ? ? A . A 1 1361 VAL 1361 ? ? ? A . A 1 1362 LYS 1362 ? ? ? A . A 1 1363 ASP 1363 ? ? ? A . A 1 1364 ILE 1364 ? ? ? A . A 1 1365 TYR 1365 ? ? ? A . A 1 1366 ASP 1366 ? ? ? A . A 1 1367 LYS 1367 ? ? ? A . A 1 1368 ASP 1368 ? ? ? A . A 1 1369 ASN 1369 ? ? ? A . A 1 1370 TYR 1370 ? ? ? A . A 1 1371 GLU 1371 ? ? ? A . A 1 1372 LEU 1372 ? ? ? A . A 1 1373 ASP 1373 ? ? ? A . A 1 1374 GLU 1374 ? ? ? A . A 1 1375 ASP 1375 ? ? ? A . A 1 1376 THR 1376 ? ? ? A . A 1 1377 ASP 1377 ? ? ? A . # # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 ZN 1 1 1 ZN '_' . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Zinc finger MYM-type protein 5 {PDB ID=2das, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2das.1.A}' 'template structure' . 2 'ZINC ION {PDB ID=2das, label_asym_id=B, auth_asym_id=A, SMTL ID=2das.1._.1}' 'template structure' . 3 . target . 4 'ZINC ION' target . 5 'Target-template alignment by HHblits to 2das, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 4 7 3 1 8 3 2 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 5 13 4 4 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2024-12-25 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-20 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' 2 4 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' non-polymer 1 2 B B 2 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 GSSGSSGQPTAQQQLTKPAKITCANCKKPLQKGQTAYQRKGSAHLFCSTTCLSSFSSGPSSG GSSGSSGQPTAQQQLTKPAKITCANCKKPLQKGQTAYQRKGSAHLFCSTTCLSSFSSGPSSG # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 8 56 # # loop_ _ma_template_non_poly.template_id _ma_template_non_poly.comp_id _ma_template_non_poly.details 2 ZN 'ZINC ION' # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2das 2024-05-29 2 PDB . 2das 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1377 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 5 1 1377 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.1e-13 89.796 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MDTSSVGGLELTDQTPVLLGSTAMATSLTNVGNSFSGPANPLVSRSNKFQNSSVEDDDDVVFIEPVQPPPPSVPVVADQRTITFTSSKNEELQGNDSKITPSSKELASQKGSVSETIVIDDEEDMETNQGQEKNSSNFIERRPPETKNRTNDVDFSTSSFSRSKVNAGMGNSGITTEPDSEIQIANVTTLETGVSSVNDGQLENTDGRDMNLMITHVTSLQNTNLGDVSNGLQSSNFGVNIQTYTPSLTSQTKTGVGPFNPGRMNVAGDVFQNGESATHHNPDSWISQSASFPRNQKQPGVDSLSPVASLPKQIFQPSVQQQPTKPVKVTCANCKKPLQKGQTAYQRKGSAHLFCSTTCLSSFSHKPAPKKLCVMCKKDITTMKGTIVAQVDSSESFQEFCSTSCLSLYEDKQNPTKGALNKSRCTICGKLTEIRHEVSFKNMTHKLCSDHCFNRYRMANGLIMNCCEQCGEYLPSKGAGNNVLVIDGQQKRFCCQSCVSEYKQVGSHPSFLKEVRDHMQDSFLMQPEKYGKLTTCTGCRTQCRFFDMTQCIGPNGYMEPYCSTACMNSHKTKYAKSQSLGIICHFCKRNSLPQYQATMPDGKLYNFCNSSCVAKFQALSMQSSPNGQFVAPSDIQLKCNYCKNSFCSKPEILEWENKVHQFCSKTCSDDYKKLHCIVTYCEYCQEEKTLHETVNFSGVKRPFCSEGCKLLYKQDFARRLGLRCVTCNYCSQLCKKGATKELDGVVRDFCSEDCCKKFQDWYYKAARCDCCKSQGTLKERVQWRGEMKHFCDQHCLLRFYCQQNEPNMTTQKGPENLHYDQGCQTSRTKMTGSAPPPSPTPNKEMKNKAVLCKPLTMTKATYCKPHMQTKSCQTDDTWRTEYVPVPIPVPVYIPVPMHMYSQNIPVPTTVPVPVPVPVFLPAPLDSSEKIPAAIEELKSKVSSDALDTELLTMTDMMSEDEGKTETTNINSVIIETDIIGSDLLKNSDPETQSSMPDVPYEPDLDIEIDFPRAAEELDMENEFLLPPVFGEEYEEQPRPRSKKKGAKRKAVSGYQSHDDSSDNSECSFPFKYTYGVNAWKHWVKTRQLDEDLLVLDELKSSKSVKLKEDLLSHTTAELNYGLAHFVNEIRRPNGENYAPDSIYYLCLGIQEYLCGSNRKDNIFIDPGYQTFEQELNKILRSWQPSILPDGSIFSRVEEDYLWRIKQLGSHSPVALLNTLFYFNTKYFGLKTVEQHLRLSFGTVFRHWKKNPLTMENKACLRYQVSSLCGTDNEDKITTGKRKHEDDEPVFEQIENTANPSRCPVKMFECYLSKSPQNLNQRMDVFYLQPECSSSTDSPVWYTSTSLDRNTLENMLVRVLLVKDIYDKDNYELDEDTD 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------QPTAQQQLTKPAKITCANCKKPLQKGQTAYQRKGSAHLFCSTTCLSSFS----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2das.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A -23.242 10.344 9.319 1 1 A PRO 0.400 1 ATOM 16 C CD . PRO 317 317 ? A -23.985 10.583 8.007 1 1 A PRO 0.400 1 ATOM 17 N N . SER 318 318 ? A -19.555 11.721 6.994 1 1 A SER 0.320 1 ATOM 18 C CA . SER 318 318 ? A -18.316 11.090 6.574 1 1 A SER 0.320 1 ATOM 19 C C . SER 318 318 ? A -17.201 12.039 6.967 1 1 A SER 0.320 1 ATOM 20 O O . SER 318 318 ? A -17.295 13.240 6.725 1 1 A SER 0.320 1 ATOM 21 C CB . SER 318 318 ? A -18.246 10.848 5.040 1 1 A SER 0.320 1 ATOM 22 O OG . SER 318 318 ? A -17.044 10.183 4.636 1 1 A SER 0.320 1 ATOM 23 N N . VAL 319 319 ? A -16.131 11.519 7.595 1 1 A VAL 0.360 1 ATOM 24 C CA . VAL 319 319 ? A -15.013 12.297 8.102 1 1 A VAL 0.360 1 ATOM 25 C C . VAL 319 319 ? A -13.953 11.300 8.553 1 1 A VAL 0.360 1 ATOM 26 O O . VAL 319 319 ? A -14.168 10.538 9.486 1 1 A VAL 0.360 1 ATOM 27 C CB . VAL 319 319 ? A -15.374 13.285 9.235 1 1 A VAL 0.360 1 ATOM 28 C CG1 . VAL 319 319 ? A -16.078 12.648 10.461 1 1 A VAL 0.360 1 ATOM 29 C CG2 . VAL 319 319 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.672 2 1 3 0.021 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 316 GLN 1 0.390 2 1 A 317 PRO 1 0.400 3 1 A 318 SER 1 0.320 4 1 A 319 VAL 1 0.360 5 1 A 320 GLN 1 0.340 6 1 A 321 GLN 1 0.400 7 1 A 322 GLN 1 0.450 8 1 A 323 PRO 1 0.550 9 1 A 324 THR 1 0.510 10 1 A 325 LYS 1 0.510 11 1 A 326 PRO 1 0.610 12 1 A 327 VAL 1 0.590 13 1 A 328 LYS 1 0.660 14 1 A 329 VAL 1 0.770 15 1 A 330 THR 1 0.810 16 1 A 331 CYS 1 0.840 17 1 A 332 ALA 1 0.850 18 1 A 333 ASN 1 0.820 19 1 A 334 CYS 1 0.820 20 1 A 335 LYS 1 0.780 21 1 A 336 LYS 1 0.780 22 1 A 337 PRO 1 0.770 23 1 A 338 LEU 1 0.770 24 1 A 339 GLN 1 0.720 25 1 A 340 LYS 1 0.690 26 1 A 341 GLY 1 0.570 27 1 A 342 GLN 1 0.680 28 1 A 343 THR 1 0.760 29 1 A 344 ALA 1 0.830 30 1 A 345 TYR 1 0.780 31 1 A 346 GLN 1 0.750 32 1 A 347 ARG 1 0.670 33 1 A 348 LYS 1 0.630 34 1 A 349 GLY 1 0.530 35 1 A 350 SER 1 0.670 36 1 A 351 ALA 1 0.730 37 1 A 352 HIS 1 0.780 38 1 A 353 LEU 1 0.820 39 1 A 354 PHE 1 0.820 40 1 A 355 CYS 1 0.850 41 1 A 356 SER 1 0.850 42 1 A 357 THR 1 0.820 43 1 A 358 THR 1 0.810 44 1 A 359 CYS 1 0.830 45 1 A 360 LEU 1 0.810 46 1 A 361 SER 1 0.790 47 1 A 362 SER 1 0.790 48 1 A 363 PHE 1 0.400 49 1 A 364 SER 1 0.430 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #