data_SMR-e0eb6b2e358318af87c32e922df584e4_8 _entry.id SMR-e0eb6b2e358318af87c32e922df584e4_8 _struct.entry_id SMR-e0eb6b2e358318af87c32e922df584e4_8 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q922J3/ CLIP1_MOUSE, CAP-Gly domain-containing linker protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.03, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q922J3' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 181084.937 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CLIP1_MOUSE Q922J3 1 ;MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPAAAAAPVEKTIPSEKASGPPSSETQEEFVDDFRVGERVWVNGNK PGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQAA PGRTASPLSTAAATMVSSSPATPSNIPHKPSQSTAKEPSATPQISNLTKTASESISNLSEAGSVKKGERE LKVGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTKI GFPSTTPAKAKAAAVRRVMAATPASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSKPSRTGLLTETSSRYARKISGTT ALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAAD REKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEVATVSEKSRIMELEKDLALRAQEVAELRRRLESSK PPGDVDMSLSLLQEISALQEKLEAIHTDHQGEMTSLKEHFGAREEAFQKEIKALHTATEKLSKENESLRS KLDHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGIGTDSAEFAELKTQIERLRLDYQHEIESL QSKQDSERSAHAKEMETMQAKLMKIIKEKEDSLEAVKARLDSAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIKVKELEV LQAKYTEQSEVIGNFTSQLSAVKEKLLDLDALRKANSEGKLELETLRQQLEGAEKQIKNLETERNAESSK ANSITKELQEKELVLTGLQDSLNQVNQVKETLEKELQTLKEKFASTSEEAVSAQTRMQDTVNKLHQKEEQ FNVLSSELEKLRENLTDMEAKFKEKDDREDQLVKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKERS VEELQLKLTKANENASFLQKSIGEVTLKAEQSQQQAARKHEEEKKELEEKLLELEKKMETSYNQCQDLKA KYEKASSETKTKHEEILQNLQKMLADTEDKLKAAQEANRDLMQDMEELKTQADKAKAAQTAEDAMQIMEQ MTKEKTETLASLEDTKQTNARLQNELDTLKENNLKTVEELNKSKELLSVENQKMEEFKKEIETLKQAAAQ KSQQLSALQEENVKLAEELGRTRDEVTSHQKLEEERSVLNNQLLEMKKRESEFRKDADEEKASLQKSISL TSALLTEKDAELEKLRNEVTVLRGENATAKSLHSVVQTLESDKVKLELKVKNLELQLKENKRQLSSSSGN TDAQAEEDERAQESQIDFLNSVIVDLQRKNQDLKMKVEMMSEAALNGNGEDLNSYDSDDQEKQSKKKPRL FCDICDCFDLHDTEDCPTQAQMSEDPPHSTHHGSRSEERPYCEICEMFGHWATNCNDDETF ; 'CAP-Gly domain-containing linker protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1391 1 1391 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CLIP1_MOUSE Q922J3 . 1 1391 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2001-12-01 061BED1FB3D4068D # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPAAAAAPVEKTIPSEKASGPPSSETQEEFVDDFRVGERVWVNGNK PGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQAA PGRTASPLSTAAATMVSSSPATPSNIPHKPSQSTAKEPSATPQISNLTKTASESISNLSEAGSVKKGERE LKVGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTKI GFPSTTPAKAKAAAVRRVMAATPASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSKPSRTGLLTETSSRYARKISGTT ALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAAD REKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEVATVSEKSRIMELEKDLALRAQEVAELRRRLESSK PPGDVDMSLSLLQEISALQEKLEAIHTDHQGEMTSLKEHFGAREEAFQKEIKALHTATEKLSKENESLRS KLDHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGIGTDSAEFAELKTQIERLRLDYQHEIESL 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LKVGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTKI GFPSTTPAKAKAAAVRRVMAATPASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSKPSRTGLLTETSSRYARKISGTT ALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAAD REKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEVATVSEKSRIMELEKDLALRAQEVAELRRRLESSK PPGDVDMSLSLLQEISALQEKLEAIHTDHQGEMTSLKEHFGAREEAFQKEIKALHTATEKLSKENESLRS KLDHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGIGTDSAEFAELKTQIERLRLDYQHEIESL QSKQDSERSAHAKEMETMQAKLMKIIKEKEDSLEAVKARLDSAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIKVKELEV LQAKYTEQSEVIGNFTSQLSAVKEKLLDLDALRKANSEGKLELETLRQQLEGAEKQIKNLETERNAESSK ANSITKELQEKELVLTGLQDSLNQVNQVKETLEKELQTLKEKFASTSEEAVSAQTRMQDTVNKLHQKEEQ FNVLSSELEKLRENLTDMEAKFKEKDDREDQLVKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKERS VEELQLKLTKANENASFLQKSIGEVTLKAEQSQQQAARKHEEEKKELEEKLLELEKKMETSYNQCQDLKA KYEKASSETKTKHEEILQNLQKMLADTEDKLKAAQEANRDLMQDMEELKTQADKAKAAQTAEDAMQIMEQ MTKEKTETLASLEDTKQTNARLQNELDTLKENNLKTVEELNKSKELLSVENQKMEEFKKEIETLKQAAAQ KSQQLSALQEENVKLAEELGRTRDEVTSHQKLEEERSVLNNQLLEMKKRESEFRKDADEEKASLQKSISL 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VAL . 1 65 TRP . 1 66 VAL . 1 67 ASN . 1 68 GLY . 1 69 ASN . 1 70 LYS . 1 71 PRO . 1 72 GLY . 1 73 PHE . 1 74 ILE . 1 75 GLN . 1 76 PHE . 1 77 LEU . 1 78 GLY . 1 79 GLU . 1 80 THR . 1 81 GLN . 1 82 PHE . 1 83 ALA . 1 84 PRO . 1 85 GLY . 1 86 GLN . 1 87 TRP . 1 88 ALA . 1 89 GLY . 1 90 ILE . 1 91 VAL . 1 92 LEU . 1 93 ASP . 1 94 GLU . 1 95 PRO . 1 96 ILE . 1 97 GLY . 1 98 LYS . 1 99 ASN . 1 100 ASP . 1 101 GLY . 1 102 SER . 1 103 VAL . 1 104 ALA . 1 105 GLY . 1 106 VAL . 1 107 ARG . 1 108 TYR . 1 109 PHE . 1 110 GLN . 1 111 CYS . 1 112 GLU . 1 113 PRO . 1 114 LEU . 1 115 LYS . 1 116 GLY . 1 117 ILE . 1 118 PHE . 1 119 THR . 1 120 ARG . 1 121 PRO . 1 122 SER . 1 123 LYS . 1 124 LEU . 1 125 THR . 1 126 ARG . 1 127 LYS . 1 128 VAL . 1 129 GLN . 1 130 ALA . 1 131 GLU . 1 132 ASP . 1 133 GLU . 1 134 ALA . 1 135 ASN . 1 136 GLY . 1 137 LEU . 1 138 GLN . 1 139 ALA . 1 140 ALA . 1 141 PRO . 1 142 GLY . 1 143 ARG . 1 144 THR . 1 145 ALA . 1 146 SER . 1 147 PRO . 1 148 LEU . 1 149 SER . 1 150 THR 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A 1 1266 GLU 1266 ? ? ? B . A 1 1267 GLU 1267 ? ? ? B . A 1 1268 ASP 1268 ? ? ? B . A 1 1269 GLU 1269 ? ? ? B . A 1 1270 ARG 1270 ? ? ? B . A 1 1271 ALA 1271 ? ? ? B . A 1 1272 GLN 1272 ? ? ? B . A 1 1273 GLU 1273 ? ? ? B . A 1 1274 SER 1274 ? ? ? B . A 1 1275 GLN 1275 ? ? ? B . A 1 1276 ILE 1276 ? ? ? B . A 1 1277 ASP 1277 ? ? ? B . A 1 1278 PHE 1278 ? ? ? B . A 1 1279 LEU 1279 ? ? ? B . A 1 1280 ASN 1280 ? ? ? B . A 1 1281 SER 1281 ? ? ? B . A 1 1282 VAL 1282 ? ? ? B . A 1 1283 ILE 1283 ? ? ? B . A 1 1284 VAL 1284 ? ? ? B . A 1 1285 ASP 1285 ? ? ? B . A 1 1286 LEU 1286 ? ? ? B . A 1 1287 GLN 1287 ? ? ? B . A 1 1288 ARG 1288 ? ? ? B . A 1 1289 LYS 1289 ? ? ? B . A 1 1290 ASN 1290 ? ? ? B . A 1 1291 GLN 1291 ? ? ? B . A 1 1292 ASP 1292 ? ? ? B . A 1 1293 LEU 1293 ? ? ? B . A 1 1294 LYS 1294 ? ? ? B . A 1 1295 MET 1295 ? ? ? B . A 1 1296 LYS 1296 ? ? ? B . A 1 1297 VAL 1297 ? ? ? B . A 1 1298 GLU 1298 ? ? ? B . A 1 1299 MET 1299 ? ? ? B . A 1 1300 MET 1300 ? ? ? B . A 1 1301 SER 1301 ? ? ? B . A 1 1302 GLU 1302 ? ? ? B . A 1 1303 ALA 1303 ? ? ? B . A 1 1304 ALA 1304 ? ? ? B . A 1 1305 LEU 1305 ? ? ? B . A 1 1306 ASN 1306 ? ? ? B . A 1 1307 GLY 1307 ? ? ? B . A 1 1308 ASN 1308 ? ? ? B . A 1 1309 GLY 1309 ? ? ? B . A 1 1310 GLU 1310 ? ? ? B . A 1 1311 ASP 1311 ? ? ? B . A 1 1312 LEU 1312 ? ? ? B . A 1 1313 ASN 1313 ? ? ? B . A 1 1314 SER 1314 ? ? ? B . A 1 1315 TYR 1315 ? ? ? B . A 1 1316 ASP 1316 ? ? ? B . A 1 1317 SER 1317 ? ? ? B . A 1 1318 ASP 1318 ? ? ? B . A 1 1319 ASP 1319 ? ? ? B . A 1 1320 GLN 1320 ? ? ? B . A 1 1321 GLU 1321 ? ? ? B . A 1 1322 LYS 1322 ? ? ? B . A 1 1323 GLN 1323 ? ? ? B . A 1 1324 SER 1324 ? ? ? B . A 1 1325 LYS 1325 ? ? ? B . A 1 1326 LYS 1326 ? ? ? B . A 1 1327 LYS 1327 ? ? ? B . A 1 1328 PRO 1328 ? ? ? B . A 1 1329 ARG 1329 ? ? ? B . A 1 1330 LEU 1330 ? ? ? B . A 1 1331 PHE 1331 ? ? ? B . A 1 1332 CYS 1332 ? ? ? B . A 1 1333 ASP 1333 ? ? ? B . A 1 1334 ILE 1334 ? ? ? B . A 1 1335 CYS 1335 ? ? ? B . A 1 1336 ASP 1336 ? ? ? B . A 1 1337 CYS 1337 ? ? ? B . A 1 1338 PHE 1338 ? ? ? B . A 1 1339 ASP 1339 ? ? ? B . A 1 1340 LEU 1340 ? ? ? B . A 1 1341 HIS 1341 ? ? ? B . A 1 1342 ASP 1342 ? ? ? B . A 1 1343 THR 1343 ? ? ? B . A 1 1344 GLU 1344 ? ? ? B . A 1 1345 ASP 1345 ? ? ? B . A 1 1346 CYS 1346 ? ? ? B . A 1 1347 PRO 1347 ? ? ? B . A 1 1348 THR 1348 ? ? ? B . A 1 1349 GLN 1349 ? ? ? B . A 1 1350 ALA 1350 ? ? ? B . A 1 1351 GLN 1351 ? ? ? B . A 1 1352 MET 1352 ? ? ? B . A 1 1353 SER 1353 ? ? ? B . A 1 1354 GLU 1354 ? ? ? B . A 1 1355 ASP 1355 ? ? ? B . A 1 1356 PRO 1356 ? ? ? B . A 1 1357 PRO 1357 ? ? ? B . A 1 1358 HIS 1358 ? ? ? B . A 1 1359 SER 1359 ? ? ? B . A 1 1360 THR 1360 ? ? ? B . A 1 1361 HIS 1361 ? ? ? B . A 1 1362 HIS 1362 ? ? ? B . A 1 1363 GLY 1363 ? ? ? B . A 1 1364 SER 1364 ? ? ? B . A 1 1365 ARG 1365 ? ? ? B . A 1 1366 SER 1366 ? ? ? B . A 1 1367 GLU 1367 ? ? ? B . A 1 1368 GLU 1368 ? ? ? B . A 1 1369 ARG 1369 ? ? ? B . A 1 1370 PRO 1370 ? ? ? B . A 1 1371 TYR 1371 ? ? ? B . A 1 1372 CYS 1372 ? ? ? B . A 1 1373 GLU 1373 ? ? ? B . A 1 1374 ILE 1374 ? ? ? B . A 1 1375 CYS 1375 ? ? ? B . A 1 1376 GLU 1376 ? ? ? B . A 1 1377 MET 1377 ? ? ? B . A 1 1378 PHE 1378 ? ? ? B . A 1 1379 GLY 1379 ? ? ? B . A 1 1380 HIS 1380 ? ? ? B . A 1 1381 TRP 1381 ? ? ? B . A 1 1382 ALA 1382 ? ? ? B . A 1 1383 THR 1383 ? ? ? B . A 1 1384 ASN 1384 ? ? ? B . A 1 1385 CYS 1385 ? ? ? B . A 1 1386 ASN 1386 ? ? ? B . A 1 1387 ASP 1387 ? ? ? B . A 1 1388 ASP 1388 ? ? ? B . A 1 1389 GLU 1389 ? ? ? B . A 1 1390 THR 1390 ? ? ? B . A 1 1391 PHE 1391 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Dynactin-1 {PDB ID=2hkn, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=2hkn.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2hkn, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 8' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSHMSAEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEG HGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDS ; ;GSHMSAEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEG HGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDS ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 10 84 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2hkn 2024-02-14 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1391 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1392 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.6e-17 44.595 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSMLKPSGLKAPTKILKPGSTALKTPAAAAAPVEKTIPSEKASGPPSSETQEEFVDDFRVGERVWVNGN-KPGFIQFLGETQFAPGQWAGIVLDEPIGKNDGSVAGVRYFQCEPLKGIFTRPSKLTRKVQAEDEANGLQAAPGRTASPLSTAAATMVSSSPATPSNIPHKPSQSTAKEPSATPQISNLTKTASESISNLSEAGSVKKGERELKVGDRVLVGGTKAGVVRFLGETDFAKGEWCGVELDEPLGKNDGAVAGTRYFQCQPKYGLFAPVHKVTKIGFPSTTPAKAKAAAVRRVMAATPASLKRSPSASSLSSMSSVASSVSSKPSRTGLLTETSSRYARKISGTTALQEALKEKQQHIEQLLAERDLERAEVAKATSHVGEIEQELALARDGHDQHVLELEAKMDQLRTMVEAADREKVELLNQLEEEKRKVEDLQFRVEEESITKGDLEVATVSEKSRIMELEKDLALRAQEVAELRRRLESSKPPGDVDMSLSLLQEISALQEKLEAIHTDHQGEMTSLKEHFGAREEAFQKEIKALHTATEKLSKENESLRSKLDHANKENSDVIALWKSKLETAIASHQQAMEELKVSFSKGIGTDSAEFAELKTQIERLRLDYQHEIESLQSKQDSERSAHAKEMETMQAKLMKIIKEKEDSLEAVKARLDSAEDQHLVEMEDTLNKLQEAEIKVKELEVLQAKYTEQSEVIGNFTSQLSAVKEKLLDLDALRKANSEGKLELETLRQQLEGAEKQIKNLETERNAESSKANSITKELQEKELVLTGLQDSLNQVNQVKETLEKELQTLKEKFASTSEEAVSAQTRMQDTVNKLHQKEEQFNVLSSELEKLRENLTDMEAKFKEKDDREDQLVKAKEKLENDIAEIMKMSGDNSSQLTKMNDELRLKERSVEELQLKLTKANENASFLQKSIGEVTLKAEQSQQQAARKHEEEKKELEEKLLELEKKMETSYNQCQDLKAKYEKASSETKTKHEEILQNLQKMLADTEDKLKAAQEANRDLMQDMEELKTQADKAKAAQTAEDAMQIMEQMTKEKTETLASLEDTKQTNARLQNELDTLKENNLKTVEELNKSKELLSVENQKMEEFKKEIETLKQAAAQKSQQLSALQEENVKLAEELGRTRDEVTSHQKLEEERSVLNNQLLEMKKRESEFRKDADEEKASLQKSISLTSALLTEKDAELEKLRNEVTVLRGENATAKSLHSVVQTLESDKVKLELKVKNLELQLKENKRQLSSSSGNTDAQAEEDERAQESQIDFLNSVIVDLQRKNQDLKMKVEMMSEAALNGNGEDLNSYDSDDQEKQSKKKPRLFCDICDCFDLHDTEDCPTQAQMSEDPPHSTHHGSRSEERPYCEICEMFGHWATNCNDDETF 2 1 2 ------------------------------------------------------ARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFE--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.040}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2hkn.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 8' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ASP 57 57 ? A 29.983 16.759 13.041 1 1 B ASP 0.250 1 ATOM 2 C CA . ASP 57 57 ? A 29.071 16.316 11.927 1 1 B ASP 0.250 1 ATOM 3 C C . ASP 57 57 ? A 27.623 16.397 12.311 1 1 B ASP 0.250 1 ATOM 4 O O . ASP 57 57 ? A 27.330 16.488 13.502 1 1 B ASP 0.250 1 ATOM 5 C CB . ASP 57 57 ? A 29.492 14.896 11.476 1 1 B ASP 0.250 1 ATOM 6 C CG . ASP 57 57 ? A 30.930 15.000 10.974 1 1 B ASP 0.250 1 ATOM 7 O OD1 . ASP 57 57 ? A 31.465 16.143 11.031 1 1 B ASP 0.250 1 ATOM 8 O OD2 . ASP 57 57 ? A 31.508 13.956 10.623 1 1 B ASP 0.250 1 ATOM 9 N N . PHE 58 58 ? A 26.702 16.405 11.321 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 10 C CA . PHE 58 58 ? A 25.268 16.456 11.552 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 11 C C . PHE 58 58 ? A 24.804 15.244 12.353 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 12 O O . PHE 58 58 ? A 25.141 14.100 12.027 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 13 C CB . PHE 58 58 ? A 24.526 16.592 10.184 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 14 C CG . PHE 58 58 ? A 23.024 16.464 10.296 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 15 C CD1 . PHE 58 58 ? A 22.378 15.315 9.807 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 16 C CD2 . PHE 58 58 ? A 22.262 17.430 10.971 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 17 C CE1 . PHE 58 58 ? A 20.997 15.147 9.966 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 18 C CE2 . PHE 58 58 ? A 20.883 17.255 11.146 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 19 C CZ . PHE 58 58 ? A 20.246 16.124 10.628 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 20 N N . ARG 59 59 ? A 24.041 15.473 13.433 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 21 C CA . ARG 59 59 ? A 23.594 14.408 14.296 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 22 C C . ARG 59 59 ? A 22.085 14.416 14.421 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 23 O O . ARG 59 59 ? A 21.422 15.450 14.412 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 24 C CB . ARG 59 59 ? A 24.259 14.567 15.674 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 25 C CG . ARG 59 59 ? A 24.241 13.318 16.576 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 26 C CD . ARG 59 59 ? A 25.125 13.566 17.800 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 27 N NE . ARG 59 59 ? A 24.537 12.861 18.991 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 28 C CZ . ARG 59 59 ? A 24.635 13.332 20.243 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 29 N NH1 . ARG 59 59 ? A 25.273 14.471 20.501 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 30 N NH2 . ARG 59 59 ? A 24.077 12.675 21.257 1 1 B ARG 0.430 1 ATOM 31 N N . VAL 60 60 ? A 21.461 13.232 14.526 1 1 B VAL 0.300 1 ATOM 32 C CA . VAL 60 60 ? A 20.034 13.129 14.767 1 1 B VAL 0.300 1 ATOM 33 C C . VAL 60 60 ? A 19.635 13.689 16.136 1 1 B VAL 0.300 1 ATOM 34 O O . VAL 60 60 ? A 20.347 13.519 17.128 1 1 B VAL 0.300 1 ATOM 35 C CB . VAL 60 60 ? A 19.528 11.702 14.604 1 1 B VAL 0.300 1 ATOM 36 C CG1 . VAL 60 60 ? A 17.998 11.707 14.399 1 1 B VAL 0.300 1 ATOM 37 C CG2 . VAL 60 60 ? A 20.222 11.024 13.401 1 1 B VAL 0.300 1 ATOM 38 N N . GLY 61 61 ? A 18.484 14.394 16.211 1 1 B GLY 0.360 1 ATOM 39 C CA . GLY 61 61 ? A 18.009 15.089 17.406 1 1 B GLY 0.360 1 ATOM 40 C C . GLY 61 61 ? A 18.553 16.489 17.545 1 1 B GLY 0.360 1 ATOM 41 O O . GLY 61 61 ? A 18.170 17.219 18.455 1 1 B GLY 0.360 1 ATOM 42 N N . GLU 62 62 ? A 19.445 16.917 16.633 1 1 B GLU 0.410 1 ATOM 43 C CA . GLU 62 62 ? A 19.967 18.269 16.585 1 1 B GLU 0.410 1 ATOM 44 C C . GLU 62 62 ? A 18.947 19.312 16.123 1 1 B GLU 0.410 1 ATOM 45 O O . GLU 62 62 ? A 18.071 19.069 15.296 1 1 B GLU 0.410 1 ATOM 46 C CB . GLU 62 62 ? A 21.254 18.303 15.728 1 1 B GLU 0.410 1 ATOM 47 C CG . GLU 62 62 ? A 22.075 19.616 15.757 1 1 B GLU 0.410 1 ATOM 48 C CD . GLU 62 62 ? A 23.398 19.506 14.989 1 1 B GLU 0.410 1 ATOM 49 O OE1 . GLU 62 62 ? A 24.127 20.531 14.973 1 1 B GLU 0.410 1 ATOM 50 O OE2 . GLU 62 62 ? A 23.706 18.414 14.432 1 1 B GLU 0.410 1 ATOM 51 N N . ARG 63 63 ? A 19.032 20.538 16.681 1 1 B ARG 0.370 1 ATOM 52 C CA . ARG 63 63 ? A 18.247 21.673 16.235 1 1 B ARG 0.370 1 ATOM 53 C C . ARG 63 63 ? A 18.905 22.334 15.045 1 1 B ARG 0.370 1 ATOM 54 O O . ARG 63 63 ? A 20.066 22.725 15.101 1 1 B ARG 0.370 1 ATOM 55 C CB . ARG 63 63 ? A 18.092 22.726 17.359 1 1 B ARG 0.370 1 ATOM 56 C CG . ARG 63 63 ? A 17.208 22.236 18.523 1 1 B ARG 0.370 1 ATOM 57 C CD . ARG 63 63 ? A 15.736 21.988 18.169 1 1 B ARG 0.370 1 ATOM 58 N NE . ARG 63 63 ? A 15.153 23.334 17.842 1 1 B ARG 0.370 1 ATOM 59 C CZ . ARG 63 63 ? A 13.964 23.536 17.259 1 1 B ARG 0.370 1 ATOM 60 N NH1 . ARG 63 63 ? A 13.215 22.512 16.861 1 1 B ARG 0.370 1 ATOM 61 N NH2 . ARG 63 63 ? A 13.512 24.775 17.069 1 1 B ARG 0.370 1 ATOM 62 N N . VAL 64 64 ? A 18.158 22.485 13.939 1 1 B VAL 0.320 1 ATOM 63 C CA . VAL 64 64 ? A 18.700 22.953 12.688 1 1 B VAL 0.320 1 ATOM 64 C C . VAL 64 64 ? A 17.790 24.001 12.098 1 1 B VAL 0.320 1 ATOM 65 O O . VAL 64 64 ? A 16.604 24.085 12.433 1 1 B VAL 0.320 1 ATOM 66 C CB . VAL 64 64 ? A 18.815 21.837 11.651 1 1 B VAL 0.320 1 ATOM 67 C CG1 . VAL 64 64 ? A 19.896 20.840 12.097 1 1 B VAL 0.320 1 ATOM 68 C CG2 . VAL 64 64 ? A 17.463 21.119 11.426 1 1 B VAL 0.320 1 ATOM 69 N N . TRP 65 65 ? A 18.330 24.798 11.161 1 1 B TRP 0.170 1 ATOM 70 C CA . TRP 65 65 ? A 17.568 25.673 10.298 1 1 B TRP 0.170 1 ATOM 71 C C . TRP 65 65 ? A 17.554 25.036 8.915 1 1 B TRP 0.170 1 ATOM 72 O O . TRP 65 65 ? A 18.602 24.715 8.357 1 1 B TRP 0.170 1 ATOM 73 C CB . TRP 65 65 ? A 18.194 27.090 10.186 1 1 B TRP 0.170 1 ATOM 74 C CG . TRP 65 65 ? A 18.136 27.895 11.477 1 1 B TRP 0.170 1 ATOM 75 C CD1 . TRP 65 65 ? A 19.055 27.982 12.486 1 1 B TRP 0.170 1 ATOM 76 C CD2 . TRP 65 65 ? A 17.026 28.722 11.867 1 1 B TRP 0.170 1 ATOM 77 N NE1 . TRP 65 65 ? A 18.591 28.810 13.483 1 1 B TRP 0.170 1 ATOM 78 C CE2 . TRP 65 65 ? A 17.351 29.279 13.128 1 1 B TRP 0.170 1 ATOM 79 C CE3 . TRP 65 65 ? A 15.820 29.011 11.244 1 1 B TRP 0.170 1 ATOM 80 C CZ2 . TRP 65 65 ? A 16.470 30.139 13.768 1 1 B TRP 0.170 1 ATOM 81 C CZ3 . TRP 65 65 ? A 14.933 29.879 11.895 1 1 B TRP 0.170 1 ATOM 82 C CH2 . TRP 65 65 ? A 15.255 30.440 13.139 1 1 B TRP 0.170 1 ATOM 83 N N . VAL 66 66 ? A 16.354 24.818 8.342 1 1 B VAL 0.140 1 ATOM 84 C CA . VAL 66 66 ? A 16.163 24.347 6.976 1 1 B VAL 0.140 1 ATOM 85 C C . VAL 66 66 ? A 15.942 25.580 6.089 1 1 B VAL 0.140 1 ATOM 86 O O . VAL 66 66 ? A 15.194 26.483 6.451 1 1 B VAL 0.140 1 ATOM 87 C CB . VAL 66 66 ? A 14.978 23.373 6.864 1 1 B VAL 0.140 1 ATOM 88 C CG1 . VAL 66 66 ? A 14.784 22.892 5.410 1 1 B VAL 0.140 1 ATOM 89 C CG2 . VAL 66 66 ? A 15.188 22.146 7.783 1 1 B VAL 0.140 1 ATOM 90 N N . ASN 67 67 ? A 16.626 25.658 4.919 1 1 B ASN 0.160 1 ATOM 91 C CA . ASN 67 67 ? A 16.558 26.780 3.980 1 1 B ASN 0.160 1 ATOM 92 C C . ASN 67 67 ? A 15.585 26.539 2.803 1 1 B ASN 0.160 1 ATOM 93 O O . ASN 67 67 ? A 15.041 25.447 2.647 1 1 B ASN 0.160 1 ATOM 94 C CB . ASN 67 67 ? A 17.975 27.166 3.465 1 1 B ASN 0.160 1 ATOM 95 C CG . ASN 67 67 ? A 18.844 27.641 4.629 1 1 B ASN 0.160 1 ATOM 96 O OD1 . ASN 67 67 ? A 18.392 28.373 5.508 1 1 B ASN 0.160 1 ATOM 97 N ND2 . ASN 67 67 ? A 20.146 27.273 4.626 1 1 B ASN 0.160 1 ATOM 98 N N . GLY 68 68 ? A 15.309 27.596 1.981 1 1 B GLY 0.260 1 ATOM 99 C CA . GLY 68 68 ? A 14.259 27.645 0.935 1 1 B GLY 0.260 1 ATOM 100 C C . GLY 68 68 ? A 14.681 27.768 -0.538 1 1 B GLY 0.260 1 ATOM 101 O O . GLY 68 68 ? A 15.791 27.397 -0.914 1 1 B GLY 0.260 1 ATOM 102 N N . ASN 69 69 ? A 13.777 28.259 -1.440 1 1 B ASN 0.530 1 ATOM 103 C CA . ASN 69 69 ? A 13.916 28.085 -2.894 1 1 B ASN 0.530 1 ATOM 104 C C . ASN 69 69 ? A 13.227 29.111 -3.845 1 1 B ASN 0.530 1 ATOM 105 O O . ASN 69 69 ? A 12.477 29.973 -3.392 1 1 B ASN 0.530 1 ATOM 106 C CB . ASN 69 69 ? A 13.464 26.623 -3.230 1 1 B ASN 0.530 1 ATOM 107 C CG . ASN 69 69 ? A 12.065 26.247 -2.723 1 1 B ASN 0.530 1 ATOM 108 O OD1 . ASN 69 69 ? A 11.295 27.059 -2.186 1 1 B ASN 0.530 1 ATOM 109 N ND2 . ASN 69 69 ? A 11.667 24.971 -2.915 1 1 B ASN 0.530 1 ATOM 110 N N . LYS 70 70 ? A 13.506 29.054 -5.191 1 1 B LYS 0.600 1 ATOM 111 C CA . LYS 70 70 ? A 12.603 29.359 -6.329 1 1 B LYS 0.600 1 ATOM 112 C C . LYS 70 70 ? A 13.026 30.301 -7.469 1 1 B LYS 0.600 1 ATOM 113 O O . LYS 70 70 ? A 13.811 31.213 -7.232 1 1 B LYS 0.600 1 ATOM 114 C CB . LYS 70 70 ? A 11.116 29.547 -5.983 1 1 B LYS 0.600 1 ATOM 115 C CG . LYS 70 70 ? A 10.518 28.235 -5.462 1 1 B LYS 0.600 1 ATOM 116 C CD . LYS 70 70 ? A 10.405 27.090 -6.472 1 1 B LYS 0.600 1 ATOM 117 C CE . LYS 70 70 ? A 9.658 25.933 -5.830 1 1 B LYS 0.600 1 ATOM 118 N NZ . LYS 70 70 ? A 9.488 24.880 -6.832 1 1 B LYS 0.600 1 ATOM 119 N N . PRO 71 71 ? A 12.575 30.106 -8.736 1 1 B PRO 0.620 1 ATOM 120 C CA . PRO 71 71 ? A 12.911 30.979 -9.857 1 1 B PRO 0.620 1 ATOM 121 C C . PRO 71 71 ? A 11.898 32.096 -10.083 1 1 B PRO 0.620 1 ATOM 122 O O . PRO 71 71 ? A 10.744 32.007 -9.647 1 1 B PRO 0.620 1 ATOM 123 C CB . PRO 71 71 ? A 12.911 30.015 -11.058 1 1 B PRO 0.620 1 ATOM 124 C CG . PRO 71 71 ? A 11.869 28.941 -10.716 1 1 B PRO 0.620 1 ATOM 125 C CD . PRO 71 71 ? A 11.763 28.971 -9.191 1 1 B PRO 0.620 1 ATOM 126 N N . GLY 72 72 ? A 12.333 33.184 -10.752 1 1 B GLY 0.600 1 ATOM 127 C CA . GLY 72 72 ? A 11.453 34.233 -11.215 1 1 B GLY 0.600 1 ATOM 128 C C . GLY 72 72 ? A 12.228 35.259 -11.981 1 1 B GLY 0.600 1 ATOM 129 O O . GLY 72 72 ? A 13.430 35.116 -12.223 1 1 B GLY 0.600 1 ATOM 130 N N . PHE 73 73 ? A 11.548 36.351 -12.352 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 131 C CA . PHE 73 73 ? A 12.060 37.427 -13.165 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 132 C C . PHE 73 73 ? A 11.958 38.721 -12.365 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 133 O O . PHE 73 73 ? A 10.899 39.062 -11.835 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 134 C CB . PHE 73 73 ? A 11.223 37.565 -14.464 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 135 C CG . PHE 73 73 ? A 11.363 36.328 -15.311 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 136 C CD1 . PHE 73 73 ? A 12.378 36.243 -16.277 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 137 C CD2 . PHE 73 73 ? A 10.512 35.224 -15.127 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 138 C CE1 . PHE 73 73 ? A 12.533 35.085 -17.052 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 139 C CE2 . PHE 73 73 ? A 10.676 34.061 -15.887 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 140 C CZ . PHE 73 73 ? A 11.679 33.994 -16.857 1 1 B PHE 0.590 1 ATOM 141 N N . ILE 74 74 ? A 13.064 39.490 -12.242 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 142 C CA . ILE 74 74 ? A 13.088 40.802 -11.593 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 143 C C . ILE 74 74 ? A 12.205 41.794 -12.329 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 144 O O . ILE 74 74 ? A 12.290 41.928 -13.548 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 145 C CB . ILE 74 74 ? A 14.509 41.369 -11.501 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 146 C CG1 . ILE 74 74 ? A 15.413 40.423 -10.678 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 147 C CG2 . ILE 74 74 ? A 14.529 42.803 -10.905 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 148 C CD1 . ILE 74 74 ? A 16.900 40.769 -10.815 1 1 B ILE 0.660 1 ATOM 149 N N . GLN 75 75 ? A 11.335 42.509 -11.598 1 1 B GLN 0.690 1 ATOM 150 C CA . GLN 75 75 ? A 10.471 43.512 -12.179 1 1 B GLN 0.690 1 ATOM 151 C C . GLN 75 75 ? A 10.614 44.871 -11.515 1 1 B GLN 0.690 1 ATOM 152 O O . GLN 75 75 ? A 10.137 45.878 -12.037 1 1 B GLN 0.690 1 ATOM 153 C CB . GLN 75 75 ? A 9.013 43.068 -11.976 1 1 B GLN 0.690 1 ATOM 154 C CG . GLN 75 75 ? A 8.596 41.735 -12.648 1 1 B GLN 0.690 1 ATOM 155 C CD . GLN 75 75 ? A 8.793 41.681 -14.166 1 1 B GLN 0.690 1 ATOM 156 O OE1 . GLN 75 75 ? A 8.279 42.522 -14.909 1 1 B GLN 0.690 1 ATOM 157 N NE2 . GLN 75 75 ? A 9.483 40.632 -14.670 1 1 B GLN 0.690 1 ATOM 158 N N . PHE 76 76 ? A 11.278 44.965 -10.353 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 159 C CA . PHE 76 76 ? A 11.496 46.244 -9.725 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 160 C C . PHE 76 76 ? A 12.776 46.149 -8.914 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 161 O O . PHE 76 76 ? A 13.039 45.125 -8.283 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 162 C CB . PHE 76 76 ? A 10.261 46.595 -8.851 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 163 C CG . PHE 76 76 ? A 10.373 47.943 -8.211 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 164 C CD1 . PHE 76 76 ? A 10.803 48.069 -6.881 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 165 C CD2 . PHE 76 76 ? A 10.067 49.097 -8.945 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 166 C CE1 . PHE 76 76 ? A 10.923 49.333 -6.293 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 167 C CE2 . PHE 76 76 ? A 10.191 50.363 -8.360 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 168 C CZ . PHE 76 76 ? A 10.620 50.481 -7.033 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 169 N N . LEU 77 77 ? A 13.599 47.211 -8.894 1 1 B LEU 0.730 1 ATOM 170 C CA . LEU 77 77 ? 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A 11.177 51.824 -3.783 1 1 B GLU 0.720 1 ATOM 185 C CB . GLU 79 79 ? A 13.450 53.459 -2.093 1 1 B GLU 0.720 1 ATOM 186 C CG . GLU 79 79 ? A 14.921 53.718 -1.717 1 1 B GLU 0.720 1 ATOM 187 C CD . GLU 79 79 ? A 15.244 55.125 -1.223 1 1 B GLU 0.720 1 ATOM 188 O OE1 . GLU 79 79 ? A 16.445 55.315 -0.890 1 1 B GLU 0.720 1 ATOM 189 O OE2 . GLU 79 79 ? A 14.338 55.991 -1.174 1 1 B GLU 0.720 1 ATOM 190 N N . THR 80 80 ? A 11.061 51.502 -1.566 1 1 B THR 0.740 1 ATOM 191 C CA . THR 80 80 ? A 9.626 51.303 -1.525 1 1 B THR 0.740 1 ATOM 192 C C . THR 80 80 ? A 9.083 52.221 -0.460 1 1 B THR 0.740 1 ATOM 193 O O . THR 80 80 ? A 9.832 52.856 0.279 1 1 B THR 0.740 1 ATOM 194 C CB . THR 80 80 ? A 9.160 49.857 -1.294 1 1 B THR 0.740 1 ATOM 195 O OG1 . THR 80 80 ? A 9.463 49.352 -0.001 1 1 B THR 0.740 1 ATOM 196 C CG2 . THR 80 80 ? A 9.841 48.938 -2.320 1 1 B THR 0.740 1 ATOM 197 N N . GLN 81 81 ? A 7.750 52.360 -0.380 1 1 B GLN 0.700 1 ATOM 198 C CA . GLN 81 81 ? 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PHE 82 82 ? A 7.366 47.126 1.825 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 214 C CE1 . PHE 82 82 ? A 7.036 47.265 -0.943 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 215 C CE2 . PHE 82 82 ? A 8.204 46.384 0.987 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 216 C CZ . PHE 82 82 ? A 8.040 46.457 -0.397 1 1 B PHE 0.640 1 ATOM 217 N N . ALA 83 83 ? A 8.635 49.895 3.544 1 1 B ALA 0.740 1 ATOM 218 C CA . ALA 83 83 ? A 9.685 49.524 4.459 1 1 B ALA 0.740 1 ATOM 219 C C . ALA 83 83 ? A 10.945 50.255 3.995 1 1 B ALA 0.740 1 ATOM 220 O O . ALA 83 83 ? A 11.014 50.608 2.818 1 1 B ALA 0.740 1 ATOM 221 C CB . ALA 83 83 ? A 9.910 47.998 4.385 1 1 B ALA 0.740 1 ATOM 222 N N . PRO 84 84 ? A 11.967 50.507 4.809 1 1 B PRO 0.740 1 ATOM 223 C CA . PRO 84 84 ? A 13.173 51.183 4.369 1 1 B PRO 0.740 1 ATOM 224 C C . PRO 84 84 ? A 14.182 50.251 3.731 1 1 B PRO 0.740 1 ATOM 225 O O . PRO 84 84 ? A 14.056 49.018 3.781 1 1 B PRO 0.740 1 ATOM 226 C CB . PRO 84 84 ? A 13.743 51.746 5.678 1 1 B PRO 0.740 1 ATOM 227 C CG . PRO 84 84 ? 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A 11.193 38.566 -7.755 1 1 B ILE 0.700 1 ATOM 270 C CG1 . ILE 90 90 ? A 12.592 39.141 -7.415 1 1 B ILE 0.700 1 ATOM 271 C CG2 . ILE 90 90 ? A 11.323 37.330 -8.676 1 1 B ILE 0.700 1 ATOM 272 C CD1 . ILE 90 90 ? A 13.470 38.196 -6.584 1 1 B ILE 0.700 1 ATOM 273 N N . VAL 91 91 ? A 8.708 38.719 -10.005 1 1 B VAL 0.700 1 ATOM 274 C CA . VAL 91 91 ? A 7.606 37.873 -10.422 1 1 B VAL 0.700 1 ATOM 275 C C . VAL 91 91 ? A 8.149 36.495 -10.439 1 1 B VAL 0.700 1 ATOM 276 O O . VAL 91 91 ? A 9.035 36.166 -11.226 1 1 B VAL 0.700 1 ATOM 277 C CB . VAL 91 91 ? A 7.085 38.201 -11.808 1 1 B VAL 0.700 1 ATOM 278 C CG1 . VAL 91 91 ? A 6.087 37.153 -12.370 1 1 B VAL 0.700 1 ATOM 279 C CG2 . VAL 91 91 ? A 6.338 39.507 -11.599 1 1 B VAL 0.700 1 ATOM 280 N N . LEU 92 92 ? A 7.661 35.674 -9.520 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 281 C CA . LEU 92 92 ? A 7.982 34.283 -9.437 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 282 C C . LEU 92 92 ? A 7.190 33.483 -10.447 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 283 O O . LEU 92 92 ? 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A 2.353 29.248 -8.338 1 1 B PRO 0.600 1 ATOM 312 N N . ILE 96 96 ? A 3.936 31.467 -5.288 1 1 B ILE 0.590 1 ATOM 313 C CA . ILE 96 96 ? A 4.432 31.302 -3.931 1 1 B ILE 0.590 1 ATOM 314 C C . ILE 96 96 ? A 4.750 32.669 -3.307 1 1 B ILE 0.590 1 ATOM 315 O O . ILE 96 96 ? A 5.339 32.787 -2.228 1 1 B ILE 0.590 1 ATOM 316 C CB . ILE 96 96 ? A 5.709 30.473 -3.989 1 1 B ILE 0.590 1 ATOM 317 C CG1 . ILE 96 96 ? A 6.739 31.212 -4.869 1 1 B ILE 0.590 1 ATOM 318 C CG2 . ILE 96 96 ? A 5.432 29.041 -4.524 1 1 B ILE 0.590 1 ATOM 319 C CD1 . ILE 96 96 ? A 8.118 30.605 -4.735 1 1 B ILE 0.590 1 ATOM 320 N N . GLY 97 97 ? A 4.398 33.751 -4.029 1 1 B GLY 0.590 1 ATOM 321 C CA . GLY 97 97 ? A 4.583 35.144 -3.659 1 1 B GLY 0.590 1 ATOM 322 C C . GLY 97 97 ? A 3.444 35.641 -2.813 1 1 B GLY 0.590 1 ATOM 323 O O . GLY 97 97 ? A 2.603 34.887 -2.332 1 1 B GLY 0.590 1 ATOM 324 N N . LYS 98 98 ? A 3.396 36.965 -2.594 1 1 B LYS 0.610 1 ATOM 325 C CA . LYS 98 98 ? 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A 23.733 32.116 -14.658 1 1 B LYS 0.340 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.597 2 1 3 0.030 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 57 ASP 1 0.250 2 1 A 58 PHE 1 0.460 3 1 A 59 ARG 1 0.430 4 1 A 60 VAL 1 0.300 5 1 A 61 GLY 1 0.360 6 1 A 62 GLU 1 0.410 7 1 A 63 ARG 1 0.370 8 1 A 64 VAL 1 0.320 9 1 A 65 TRP 1 0.170 10 1 A 66 VAL 1 0.140 11 1 A 67 ASN 1 0.160 12 1 A 68 GLY 1 0.260 13 1 A 69 ASN 1 0.530 14 1 A 70 LYS 1 0.600 15 1 A 71 PRO 1 0.620 16 1 A 72 GLY 1 0.600 17 1 A 73 PHE 1 0.590 18 1 A 74 ILE 1 0.660 19 1 A 75 GLN 1 0.690 20 1 A 76 PHE 1 0.640 21 1 A 77 LEU 1 0.730 22 1 A 78 GLY 1 0.700 23 1 A 79 GLU 1 0.720 24 1 A 80 THR 1 0.740 25 1 A 81 GLN 1 0.700 26 1 A 82 PHE 1 0.640 27 1 A 83 ALA 1 0.740 28 1 A 84 PRO 1 0.740 29 1 A 85 GLY 1 0.730 30 1 A 86 GLN 1 0.760 31 1 A 87 TRP 1 0.630 32 1 A 88 ALA 1 0.760 33 1 A 89 GLY 1 0.750 34 1 A 90 ILE 1 0.700 35 1 A 91 VAL 1 0.700 36 1 A 92 LEU 1 0.650 37 1 A 93 ASP 1 0.610 38 1 A 94 GLU 1 0.610 39 1 A 95 PRO 1 0.600 40 1 A 96 ILE 1 0.590 41 1 A 97 GLY 1 0.590 42 1 A 98 LYS 1 0.610 43 1 A 99 ASN 1 0.660 44 1 A 100 ASP 1 0.600 45 1 A 101 GLY 1 0.680 46 1 A 102 SER 1 0.710 47 1 A 103 VAL 1 0.700 48 1 A 104 ALA 1 0.660 49 1 A 105 GLY 1 0.640 50 1 A 106 VAL 1 0.710 51 1 A 107 ARG 1 0.700 52 1 A 108 TYR 1 0.670 53 1 A 109 PHE 1 0.630 54 1 A 110 GLN 1 0.690 55 1 A 111 CYS 1 0.680 56 1 A 112 GLU 1 0.620 57 1 A 113 PRO 1 0.610 58 1 A 114 LEU 1 0.610 59 1 A 115 LYS 1 0.600 60 1 A 116 GLY 1 0.670 61 1 A 117 ILE 1 0.720 62 1 A 118 PHE 1 0.710 63 1 A 119 THR 1 0.760 64 1 A 120 ARG 1 0.740 65 1 A 121 PRO 1 0.710 66 1 A 122 SER 1 0.720 67 1 A 123 LYS 1 0.670 68 1 A 124 LEU 1 0.670 69 1 A 125 THR 1 0.580 70 1 A 126 ARG 1 0.390 71 1 A 127 LYS 1 0.340 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #