data_SMR-8d1e9846d32e4a9c786b737d998a3ed4_2
_entry.id SMR-8d1e9846d32e4a9c786b737d998a3ed4_2
_struct.entry_id SMR-8d1e9846d32e4a9c786b737d998a3ed4_2
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q9VAW5 (isoform 1)/ LARP_DROME, La-related protein 1

Estimated model accuracy of this model is 0.163, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9VAW5 (isoform 1)'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
_audit_conform.dict_version 1.4.6
#
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_citation.id
_citation.title
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_citation.journal_volume
_citation.page_first
_citation.page_last
_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
loop_
_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3
package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
loop_
_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 176387.137 1 .
#
#
loop_
_struct_ref.id
_struct_ref.entity_id
_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP LARP_DROME Q9VAW5 1
;MSAKQSGSPKAGTSPLDKRVLQPKAQQQQQQTKQTASQNNNAQNTASNKKTQQQQQPQQGATTTTQTTTA
AAAAATAAAAATAATTSAAAATSSAAAVPAATTETATTTTVDASQADALAKVVVKDKKKVNQKASDFSNV
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SQHELRRGGSNSGLAPHKRQQQQKPKPGAGSQTGSTRATTSAAATATTAASAATSTAATPAVTVSSGSSS
SKK
;
'La-related protein 1'
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1403 1 1403
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . LARP_DROME Q9VAW5 Q9VAW5-1 1 1403 7227
'Drosophila melanogaster (Fruit fly)' 2011-09-21 B90DC1BB792454EF
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no 9
;MSAKQSGSPKAGTSPLDKRVLQPKAQQQQQQTKQTASQNNNAQNTASNKKTQQQQQPQQGATTTTQTTTA
AAAAATAAAAATAATTSAAAATSSAAAVPAATTETATTTTVDASQADALAKVVVKDKKKVNQKASDFSNV
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QEQLEQNDGQEKLEEQTEADSPPPILTSAMATKPLNSIPPPPMPRNPQNLVPKMLQDKQQSRSSTIAALN
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SQHELRRGGSNSGLAPHKRQQQQKPKPGAGSQTGSTRATTSAAATATTAASAATSTAATPAVTVSSGSSS
SKK
;

;MSAKQSGSPKAGTSPLDKRVLQPKAQQQQQQTKQTASQNNNAQNTASNKKTQQQQQPQQGATTTTQTTTA
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SKK
;

#
#
loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 SER .
1 3 ALA .
1 4 LYS .
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1 6 SER .
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1 8 SER .
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1 13 THR .
1 14 SER .
1 15 PRO .
1 16 LEU .
1 17 ASP .
1 18 LYS .
1 19 ARG .
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1 27 GLN .
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1 37 SER .
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1 62 THR .
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1 97 ALA .
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1 101 ALA .
1 102 THR .
1 103 THR .
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1 108 THR .
1 109 THR .
1 110 THR .
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1 123 VAL .
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1 125 LYS .
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A 1 1334 GLU 1334 ? ? ? 9 .
A 1 1335 LEU 1335 ? ? ? 9 .
A 1 1336 ARG 1336 ? ? ? 9 .
A 1 1337 ARG 1337 ? ? ? 9 .
A 1 1338 GLY 1338 ? ? ? 9 .
A 1 1339 GLY 1339 ? ? ? 9 .
A 1 1340 SER 1340 ? ? ? 9 .
A 1 1341 ASN 1341 ? ? ? 9 .
A 1 1342 SER 1342 ? ? ? 9 .
A 1 1343 GLY 1343 ? ? ? 9 .
A 1 1344 LEU 1344 ? ? ? 9 .
A 1 1345 ALA 1345 ? ? ? 9 .
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A 1 1347 HIS 1347 ? ? ? 9 .
A 1 1348 LYS 1348 ? ? ? 9 .
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A 1 1367 ARG 1367 ? ? ? 9 .
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A 1 1373 ALA 1373 ? ? ? 9 .
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A 1 1375 THR 1375 ? ? ? 9 .
A 1 1376 ALA 1376 ? ? ? 9 .
A 1 1377 THR 1377 ? ? ? 9 .
A 1 1378 THR 1378 ? ? ? 9 .
A 1 1379 ALA 1379 ? ? ? 9 .
A 1 1380 ALA 1380 ? ? ? 9 .
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A 1 1383 ALA 1383 ? ? ? 9 .
A 1 1384 THR 1384 ? ? ? 9 .
A 1 1385 SER 1385 ? ? ? 9 .
A 1 1386 THR 1386 ? ? ? 9 .
A 1 1387 ALA 1387 ? ? ? 9 .
A 1 1388 ALA 1388 ? ? ? 9 .
A 1 1389 THR 1389 ? ? ? 9 .
A 1 1390 PRO 1390 ? ? ? 9 .
A 1 1391 ALA 1391 ? ? ? 9 .
A 1 1392 VAL 1392 ? ? ? 9 .
A 1 1393 THR 1393 ? ? ? 9 .
A 1 1394 VAL 1394 ? ? ? 9 .
A 1 1395 SER 1395 ? ? ? 9 .
A 1 1396 SER 1396 ? ? ? 9 .
A 1 1397 GLY 1397 ? ? ? 9 .
A 1 1398 SER 1398 ? ? ? 9 .
A 1 1399 SER 1399 ? ? ? 9 .
A 1 1400 SER 1400 ? ? ? 9 .
A 1 1401 SER 1401 ? ? ? 9 .
A 1 1402 LYS 1402 ? ? ? 9 .
A 1 1403 LYS 1403 ? ? ? 9 .
#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'La-related protein 1 {PDB ID=8xp3, label_asym_id=JA, auth_asym_id=JD, SMTL ID=8xp3.1.9}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 8xp3, label_asym_id=JA'
'target-template alignment' .
4 'model 2' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
3 1 6
4 2 7
5 3 2
6 3 1
7 3 3
8 4 1
9 4 3
10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[1]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[2]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0 0 0
#
#
loop_
_ma_template_details.ordinal_id
_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A JA 36 1 JD
#
#
loop_
_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
;MATQVEPLLPGGATLLQAEEHGGLVRKKPPPAPEGKGEPGPNDVRGGEPDGSARRPRPPCAKPHKEGTGQ
QERESPRPLQLPGAEGPAISDGEEGGGEPGAGGGAAGAAGAGRRDFVEAPPPKVNPWTKNALPPVLTTVN
GQSPPEHSAPAKVVRAAVPKQRKGSKVGDFGDAINWPTPGEIAHKSVQPQSHKPQPTRKLPPKKDMKEQE
KGEGSDSKESPKTKSDESGEEKNGDEDCQRGGQKKKGNKHKWVPLQIDMKPEVPREKLASRPTRPPEPRH
IPANRGEIKGSESATYVPVAPPTPAWQPEIKPEPAWHDQDETSSVKSDGAGGARASFRGRGRGRGRGRGR
GRGGTRTHFDYQFGYRKFDGVEGPRTPKYMNNITYYFDNVSSTELYSVDQELLKDYIKRQIEYYFSVDNL
ERDFFLRRKMDADGFLPITLIASFHRVQALTTDISLIFAALKDSKVVEIVDEKVRRREEPEKWPLPPIVD
YSQTDFSQLLNCPEFVPRQHYQKETESAPGSPRAVTPVPTKTEEVSNLKTLPKGLSASLPDLDSENWIEV
KKRPRPSPARPKKSEESRFSHLTSLPQQLPSQQLMSKDQDEQEELDFLFDEEMEQMDGRKNTFTAWSDEE
SDYEIDDRDVNKILIVTQTPHYMRRHPGGDRTGNHTSRAKMSAELAKVINDGLFYYEQDLWAEKFEPEYS
QIKQEVENFKKVNMISREQFDTLTPEPPVDPNQEVPPGPPRFQQVPTDALANKLFGAPEPSTIARSLPTT
VPESPNYRNTRTPRTPRTPQLKDSSQTSRFYPVVKEGRTLDAKMPRKRKTRHSSNPPLESHVGWVMDSRE
HRPRTASISSSPSEGTPTVGSYGCTPQSLPKFQHPSHELLKENGFTQHVYHKYRRRCLNERKRLGIGQSQ
EMNTLFRFWSFFLRDHFNKKMYEEFKQLALEDAKEGYRYGLECLFRYYSYGLEKKFRLDIFKDFQEETVK
DYEAGQLYGLEKFWAFLKYSKAKNLDIDPKLQEYLGKFRRLEDFRVDPPMGEEGNHKRHSVVAGGGGGEG
RKRCPSQSSSRPAAMISQPPTPPTGQPVREDAKWTSQHSNTQTLGK
;

;MATQVEPLLPGGATLLQAEEHGGLVRKKPPPAPEGKGEPGPNDVRGGEPDGSARRPRPPCAKPHKEGTGQ
QERESPRPLQLPGAEGPAISDGEEGGGEPGAGGGAAGAAGAGRRDFVEAPPPKVNPWTKNALPPVLTTVN
GQSPPEHSAPAKVVRAAVPKQRKGSKVGDFGDAINWPTPGEIAHKSVQPQSHKPQPTRKLPPKKDMKEQE
KGEGSDSKESPKTKSDESGEEKNGDEDCQRGGQKKKGNKHKWVPLQIDMKPEVPREKLASRPTRPPEPRH
IPANRGEIKGSESATYVPVAPPTPAWQPEIKPEPAWHDQDETSSVKSDGAGGARASFRGRGRGRGRGRGR
GRGGTRTHFDYQFGYRKFDGVEGPRTPKYMNNITYYFDNVSSTELYSVDQELLKDYIKRQIEYYFSVDNL
ERDFFLRRKMDADGFLPITLIASFHRVQALTTDISLIFAALKDSKVVEIVDEKVRRREEPEKWPLPPIVD
YSQTDFSQLLNCPEFVPRQHYQKETESAPGSPRAVTPVPTKTEEVSNLKTLPKGLSASLPDLDSENWIEV
KKRPRPSPARPKKSEESRFSHLTSLPQQLPSQQLMSKDQDEQEELDFLFDEEMEQMDGRKNTFTAWSDEE
SDYEIDDRDVNKILIVTQTPHYMRRHPGGDRTGNHTSRAKMSAELAKVINDGLFYYEQDLWAEKFEPEYS
QIKQEVENFKKVNMISREQFDTLTPEPPVDPNQEVPPGPPRFQQVPTDALANKLFGAPEPSTIARSLPTT
VPESPNYRNTRTPRTPRTPQLKDSSQTSRFYPVVKEGRTLDAKMPRKRKTRHSSNPPLESHVGWVMDSRE
HRPRTASISSSPSEGTPTVGSYGCTPQSLPKFQHPSHELLKENGFTQHVYHKYRRRCLNERKRLGIGQSQ
EMNTLFRFWSFFLRDHFNKKMYEEFKQLALEDAKEGYRYGLECLFRYYSYGLEKKFRLDIFKDFQEETVK
DYEAGQLYGLEKFWAFLKYSKAKNLDIDPKLQEYLGKFRRLEDFRVDPPMGEEGNHKRHSVVAGGGGGEG
RKRCPSQSSSRPAAMISQPPTPPTGQPVREDAKWTSQHSNTQTLGK
;

#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 383 1036
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 8xp3 2025-01-01
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 1403
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 1445 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 9e-162 49.183
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
MSAKQSGSPKAGTSPLDKRVLQPKAQQQQQQTKQTASQNNNAQNTASNKKTQQQQQPQQGATTTTQTTTAAAAAATAAAAATAATTSAAAATSSAAAVPAATTETATTTTVDASQADALAKVVVKDKKKVNQKASDFSNVGDWPTLIGGTSGSGKATSNEPKRNPTKKQQSAKTAAAVAASSNTTSSEVATESNVAGTTSSSNSNPSSSTTTTNTTTNSQATTAPVASTSHDAKAQRDAEPAANSAAGTTGTAAGPALTKKIPKHKWRPLPIDLAKSSRPKPIGGRPNRRFSDDIADQRRPPRVYHDRQPGAGGAGVESRHPHAGRHPYGSRPATATSERVDSWRSSSSTTTAAFDEQRSGAAGGAGAAGTGVGSATRGPRRYRTPYRGGRQGRGGFSRQGPGRPTYRIPRHLLASGEYANYLPADAAGADSQSSYVLMGTHYFGNVP-AAYIELDANSIKEAIKKQVEYYFSVDNLTGDFFLRRKMDPEGYIPVTLIASFHRVLALTTDVAVIVNAIKESDKLELFEGYKVRTKTTPTTWPITEVPEVNEGEPKAIGTLEQEQLEQNDGQEKLEEQTEADSPPPILTSAMATKPLNSIPPPPMPRNPQNLVPKMLQDKQQSRSSTIAALNSVNAISALTQQVEGGAAELAGHLSGLAESVKPKSTSTPDKRNAASAGNGAGSAAALVAEPEGIWKEVKRRSKTNAIKENATTPPQQQQPPLSQTLNNNNDNVKTNNTSSKSKSSSNNAPSNASSSATVCVTTNNASSATKATTKTTTTSTATTTTNNNIKSGNAAYSKTHSKSSSKTAAPPSAQCHAEKEELDFQFDEELMDPLPPGTGRINNFTENFSDDDESDYEFADRDINKLLIVAQVGR-APKHEGYDRTADFTSRTKITQDLENIINDGLVNYEEDLWTTTNV---------VADYKTVNVISQADFEKLAGGRNKSVLPPQVVPPPPP-FEEDLD-E---TLVG---------D--TTLN-ST---------LNN----TLKSRRARFYAAPN-SHSIDPRTPRKRKLRHTANPPVEAHVGWLLDTVEHRPRTTSMGSSAGTSPTASSYGSFGSSVPQSLPVFQHPSHALLKENNFTQQAYHKYHSRCLKERRRLGYGQSQEMNTLYRFWSFFLRENFNKSMYNEFRSLALEDAGNGFRYGLECLFRFFSYGLEKKFRPNIYQDFQDETIADYETGQLYGLEKFWAFLKYYKNGEKLEVQPKLAEYLKSFKNIEDFRVVEPEINEMLQGVGSLNPGRQLNRHRSVSESDGTAVIAAGGRRLNTTITNRSDYVGRLLQQQHQQQQQQQHHQYQQGYGGYNQQQNRRRTGSFGSTTVRIRSGSLGNKPQVANRNQGSQHELRRGGSNSGLAPHKRQQQQKPKPGAGSQTGSTRATTSAAATATTAASAATSTAATPAVTVSSGSSSSKK
2 1 2
-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ITYYFDNVSSTELYSVDQELLKDYIKRQIEYYFSVDNLERDFFLRRKMDADGFLPITLIASFHRVQALTTDISLIFAALKDSKVVEIVD-EKVRRREEPEKWPLPPIVDYSQ-----------TDFSQLL-----------NC------------------PEFVPRQH--------YQKET-----ESAPGSPRAVTPVPTK-----T---EEVSNLKTLPKG-------------------LSASLPDLDSENWIEVKKRPRPSPARPKKSEE---------------------------S-RF-----S-H---LT-S--LPQ------Q-----L-P-------------------------SQ---QLMSKDQDEQEELDFLFDEEMEQM----DGRKNTFTA-WSD-EESDYEIDDRDVNKILIVTQTPHYMRRHPGGDRTGNHTSRAKMSAELAKVINDGLFYYEQDLWAEKFEPEYSQIKQEVENFKKVNMISREQFDTLTPEPPVD--PNQEVPPGPPRFQQVPTDALANKLFGAPEPSTIARSLPTTVPESPNYRNTRTPRTPRTPQLKDSSQTSRFYPVVKEGRTLDAKMPRKRKTRHSSNPPLESHVGWVMDSREHRPRTASISSSPS--EGTPTVGS-YGCTPQSLPKFQHPSHELLKENGFTQHVYHKYRRRCLNERKRLGIGQSQEMNTLFRFWSFFLRDHFNKKMYEEFKQLALEDAKEGYRYGLECLFRYYSYGLEKKFRLDIFKDFQEETVKDYEAGQLYGLEKFWAFLKYSKA-KNLDIDPKLQEYLGKFRRLEDFRVDPPMGEEGNH-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8xp3.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_id
_ma_model_list.model_group_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.model_group_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . ASP 882 882 ? A 249.843 272.139 213.370 1 1 9 ASP 0.260 1
ATOM 2 C CA . ASP 882 882 ? A 249.617 271.085 214.417 1 1 9 ASP 0.260 1
ATOM 3 C C . ASP 882 882 ? A 250.912 270.332 214.716 1 1 9 ASP 0.260 1
ATOM 4 O O . ASP 882 882 ? A 251.988 270.898 214.514 1 1 9 ASP 0.260 1
ATOM 5 C CB . ASP 882 882 ? A 248.456 270.176 213.917 1 1 9 ASP 0.260 1
ATOM 6 C CG . ASP 882 882 ? A 248.872 269.510 212.606 1 1 9 ASP 0.260 1
ATOM 7 O OD1 . ASP 882 882 ? A 249.369 270.264 211.726 1 1 9 ASP 0.260 1
ATOM 8 O OD2 . ASP 882 882 ? A 248.781 268.275 212.527 1 1 9 ASP 0.260 1
ATOM 9 N N . ARG 883 883 ? A 250.856 269.086 215.230 1 1 9 ARG 0.240 1
ATOM 10 C CA . ARG 883 883 ? A 252.038 268.301 215.482 1 1 9 ARG 0.240 1
ATOM 11 C C . ARG 883 883 ? A 251.623 266.863 215.580 1 1 9 ARG 0.240 1
ATOM 12 O O . ARG 883 883 ? A 250.499 266.555 215.976 1 1 9 ARG 0.240 1
ATOM 13 C CB . ARG 883 883 ? A 252.755 268.665 216.820 1 1 9 ARG 0.240 1
ATOM 14 C CG . ARG 883 883 ? A 251.931 268.373 218.101 1 1 9 ARG 0.240 1
ATOM 15 C CD . ARG 883 883 ? A 252.588 268.808 219.415 1 1 9 ARG 0.240 1
ATOM 16 N NE . ARG 883 883 ? A 253.848 268.005 219.596 1 1 9 ARG 0.240 1
ATOM 17 C CZ . ARG 883 883 ? A 253.928 266.790 220.165 1 1 9 ARG 0.240 1
ATOM 18 N NH1 . ARG 883 883 ? A 252.847 266.178 220.638 1 1 9 ARG 0.240 1
ATOM 19 N NH2 . ARG 883 883 ? A 255.111 266.182 220.257 1 1 9 ARG 0.240 1
ATOM 20 N N . THR 884 884 ? A 252.562 265.950 215.294 1 1 9 THR 0.460 1
ATOM 21 C CA . THR 884 884 ? A 252.347 264.522 215.426 1 1 9 THR 0.460 1
ATOM 22 C C . THR 884 884 ? A 252.803 264.167 216.810 1 1 9 THR 0.460 1
ATOM 23 O O . THR 884 884 ? A 253.905 264.521 217.235 1 1 9 THR 0.460 1
ATOM 24 C CB . THR 884 884 ? A 253.090 263.711 214.376 1 1 9 THR 0.460 1
ATOM 25 O OG1 . THR 884 884 ? A 252.522 264.000 213.109 1 1 9 THR 0.460 1
ATOM 26 C CG2 . THR 884 884 ? A 252.970 262.192 214.564 1 1 9 THR 0.460 1
ATOM 27 N N . ALA 885 885 ? A 251.927 263.520 217.601 1 1 9 ALA 0.470 1
ATOM 28 C CA . ALA 885 885 ? A 252.265 263.042 218.919 1 1 9 ALA 0.470 1
ATOM 29 C C . ALA 885 885 ? A 253.389 262.002 218.894 1 1 9 ALA 0.470 1
ATOM 30 O O . ALA 885 885 ? A 253.388 261.105 218.056 1 1 9 ALA 0.470 1
ATOM 31 C CB . ALA 885 885 ? A 250.987 262.561 219.650 1 1 9 ALA 0.470 1
ATOM 32 N N . ASP 886 886 ? A 254.378 262.110 219.806 1 1 9 ASP 0.540 1
ATOM 33 C CA . ASP 886 886 ? A 255.368 261.095 220.070 1 1 9 ASP 0.540 1
ATOM 34 C C . ASP 886 886 ? A 254.701 260.175 221.088 1 1 9 ASP 0.540 1
ATOM 35 O O . ASP 886 886 ? A 254.403 260.573 222.221 1 1 9 ASP 0.540 1
ATOM 36 C CB . ASP 886 886 ? A 256.680 261.792 220.545 1 1 9 ASP 0.540 1
ATOM 37 C CG . ASP 886 886 ? A 257.872 260.850 220.647 1 1 9 ASP 0.540 1
ATOM 38 O OD1 . ASP 886 886 ? A 257.692 259.636 220.396 1 1 9 ASP 0.540 1
ATOM 39 O OD2 . ASP 886 886 ? A 258.973 261.367 220.967 1 1 9 ASP 0.540 1
ATOM 40 N N . PHE 887 887 ? A 254.339 258.959 220.646 1 1 9 PHE 0.510 1
ATOM 41 C CA . PHE 887 887 ? A 253.687 257.970 221.464 1 1 9 PHE 0.510 1
ATOM 42 C C . PHE 887 887 ? A 254.341 256.638 221.242 1 1 9 PHE 0.510 1
ATOM 43 O O . PHE 887 887 ? A 254.741 256.282 220.135 1 1 9 PHE 0.510 1
ATOM 44 C CB . PHE 887 887 ? A 252.142 257.860 221.239 1 1 9 PHE 0.510 1
ATOM 45 C CG . PHE 887 887 ? A 251.752 257.369 219.859 1 1 9 PHE 0.510 1
ATOM 46 C CD1 . PHE 887 887 ? A 251.570 258.277 218.808 1 1 9 PHE 0.510 1
ATOM 47 C CD2 . PHE 887 887 ? A 251.619 255.996 219.577 1 1 9 PHE 0.510 1
ATOM 48 C CE1 . PHE 887 887 ? A 251.313 257.834 217.507 1 1 9 PHE 0.510 1
ATOM 49 C CE2 . PHE 887 887 ? A 251.347 255.550 218.278 1 1 9 PHE 0.510 1
ATOM 50 C CZ . PHE 887 887 ? A 251.200 256.470 217.242 1 1 9 PHE 0.510 1
ATOM 51 N N . THR 888 888 ? A 254.410 255.838 222.316 1 1 9 THR 0.620 1
ATOM 52 C CA . THR 888 888 ? A 255.043 254.539 222.241 1 1 9 THR 0.620 1
ATOM 53 C C . THR 888 888 ? A 254.122 253.573 222.953 1 1 9 THR 0.620 1
ATOM 54 O O . THR 888 888 ? A 253.494 253.907 223.957 1 1 9 THR 0.620 1
ATOM 55 C CB . THR 888 888 ? A 256.466 254.511 222.792 1 1 9 THR 0.620 1
ATOM 56 O OG1 . THR 888 888 ? A 257.255 255.532 222.209 1 1 9 THR 0.620 1
ATOM 57 C CG2 . THR 888 888 ? A 257.174 253.216 222.414 1 1 9 THR 0.620 1
ATOM 58 N N . SER 889 889 ? A 253.949 252.351 222.384 1 1 9 SER 0.630 1
ATOM 59 C CA . SER 889 889 ? A 253.031 251.327 222.886 1 1 9 SER 0.630 1
ATOM 60 C C . SER 889 889 ? A 253.591 250.587 224.067 1 1 9 SER 0.630 1
ATOM 61 O O . SER 889 889 ? A 254.764 250.741 224.391 1 1 9 SER 0.630 1
ATOM 62 C CB . SER 889 889 ? A 252.468 250.294 221.840 1 1 9 SER 0.630 1
ATOM 63 O OG . SER 889 889 ? A 253.261 249.120 221.528 1 1 9 SER 0.630 1
ATOM 64 N N . ARG 890 890 ? A 252.784 249.741 224.754 1 1 9 ARG 0.480 1
ATOM 65 C CA . ARG 890 890 ? A 253.291 248.976 225.882 1 1 9 ARG 0.480 1
ATOM 66 C C . ARG 890 890 ? A 254.458 248.081 225.540 1 1 9 ARG 0.480 1
ATOM 67 O O . ARG 890 890 ? A 255.511 248.200 226.157 1 1 9 ARG 0.480 1
ATOM 68 C CB . ARG 890 890 ? A 252.156 248.140 226.514 1 1 9 ARG 0.480 1
ATOM 69 C CG . ARG 890 890 ? A 251.159 249.015 227.296 1 1 9 ARG 0.480 1
ATOM 70 C CD . ARG 890 890 ? A 251.771 249.595 228.575 1 1 9 ARG 0.480 1
ATOM 71 N NE . ARG 890 890 ? A 250.762 250.505 229.203 1 1 9 ARG 0.480 1
ATOM 72 C CZ . ARG 890 890 ? A 250.656 251.821 228.970 1 1 9 ARG 0.480 1
ATOM 73 N NH1 . ARG 890 890 ? A 251.417 252.449 228.077 1 1 9 ARG 0.480 1
ATOM 74 N NH2 . ARG 890 890 ? A 249.758 252.530 229.653 1 1 9 ARG 0.480 1
ATOM 75 N N . THR 891 891 ? A 254.335 247.243 224.498 1 1 9 THR 0.670 1
ATOM 76 C CA . THR 891 891 ? A 255.370 246.281 224.137 1 1 9 THR 0.670 1
ATOM 77 C C . THR 891 891 ? A 256.696 246.905 223.782 1 1 9 THR 0.670 1
ATOM 78 O O . THR 891 891 ? A 257.742 246.438 224.207 1 1 9 THR 0.670 1
ATOM 79 C CB . THR 891 891 ? A 254.932 245.328 223.033 1 1 9 THR 0.670 1
ATOM 80 O OG1 . THR 891 891 ? A 253.698 244.729 223.404 1 1 9 THR 0.670 1
ATOM 81 C CG2 . THR 891 891 ? A 255.954 244.205 222.796 1 1 9 THR 0.670 1
ATOM 82 N N . LYS 892 892 ? A 256.695 248.009 223.015 1 1 9 LYS 0.660 1
ATOM 83 C CA . LYS 892 892 ? A 257.917 248.667 222.600 1 1 9 LYS 0.660 1
ATOM 84 C C . LYS 892 892 ? A 258.630 249.294 223.806 1 1 9 LYS 0.660 1
ATOM 85 O O . LYS 892 892 ? A 259.814 249.055 224.023 1 1 9 LYS 0.660 1
ATOM 86 C CB . LYS 892 892 ? A 257.596 249.698 221.481 1 1 9 LYS 0.660 1
ATOM 87 C CG . LYS 892 892 ? A 256.753 249.157 220.296 1 1 9 LYS 0.660 1
ATOM 88 C CD . LYS 892 892 ? A 256.045 250.288 219.506 1 1 9 LYS 0.660 1
ATOM 89 C CE . LYS 892 892 ? A 255.093 249.869 218.375 1 1 9 LYS 0.660 1
ATOM 90 N NZ . LYS 892 892 ? A 254.193 248.824 218.899 1 1 9 LYS 0.660 1
ATOM 91 N N . ILE 893 893 ? A 257.880 250.007 224.692 1 1 9 ILE 0.610 1
ATOM 92 C CA . ILE 893 893 ? A 258.421 250.613 225.913 1 1 9 ILE 0.610 1
ATOM 93 C C . ILE 893 893 ? A 259.010 249.562 226.842 1 1 9 ILE 0.610 1
ATOM 94 O O . ILE 893 893 ? A 260.123 249.708 227.349 1 1 9 ILE 0.610 1
ATOM 95 C CB . ILE 893 893 ? A 257.367 251.432 226.691 1 1 9 ILE 0.610 1
ATOM 96 C CG1 . ILE 893 893 ? A 256.905 252.648 225.862 1 1 9 ILE 0.610 1
ATOM 97 C CG2 . ILE 893 893 ? A 257.902 251.932 228.059 1 1 9 ILE 0.610 1
ATOM 98 C CD1 . ILE 893 893 ? A 255.690 253.396 226.422 1 1 9 ILE 0.610 1
ATOM 99 N N . THR 894 894 ? A 258.278 248.444 227.057 1 1 9 THR 0.690 1
ATOM 100 C CA . THR 894 894 ? A 258.710 247.337 227.908 1 1 9 THR 0.690 1
ATOM 101 C C . THR 894 894 ? A 259.962 246.649 227.404 1 1 9 THR 0.690 1
ATOM 102 O O . THR 894 894 ? A 260.859 246.333 228.183 1 1 9 THR 0.690 1
ATOM 103 C CB . THR 894 894 ? A 257.647 246.286 228.235 1 1 9 THR 0.690 1
ATOM 104 O OG1 . THR 894 894 ? A 257.043 245.707 227.088 1 1 9 THR 0.690 1
ATOM 105 C CG2 . THR 894 894 ? A 256.518 246.932 229.044 1 1 9 THR 0.690 1
ATOM 106 N N . GLN 895 895 ? A 260.083 246.431 226.082 1 1 9 GLN 0.670 1
ATOM 107 C CA . GLN 895 895 ? A 261.299 245.928 225.468 1 1 9 GLN 0.670 1
ATOM 108 C C . GLN 895 895 ? A 262.500 246.858 225.630 1 1 9 GLN 0.670 1
ATOM 109 O O . GLN 895 895 ? A 263.582 246.406 226.015 1 1 9 GLN 0.670 1
ATOM 110 C CB . GLN 895 895 ? A 261.054 245.589 223.978 1 1 9 GLN 0.670 1
ATOM 111 C CG . GLN 895 895 ? A 260.104 244.381 223.803 1 1 9 GLN 0.670 1
ATOM 112 C CD . GLN 895 895 ? A 259.732 244.126 222.344 1 1 9 GLN 0.670 1
ATOM 113 O OE1 . GLN 895 895 ? A 259.755 244.991 221.470 1 1 9 GLN 0.670 1
ATOM 114 N NE2 . GLN 895 895 ? A 259.333 242.862 222.052 1 1 9 GLN 0.670 1
ATOM 115 N N . ASP 896 896 ? A 262.337 248.181 225.409 1 1 9 ASP 0.670 1
ATOM 116 C CA . ASP 896 896 ? A 263.404 249.158 225.568 1 1 9 ASP 0.670 1
ATOM 117 C C . ASP 896 896 ? A 263.969 249.231 226.988 1 1 9 ASP 0.670 1
ATOM 118 O O . ASP 896 896 ? A 265.182 249.170 227.200 1 1 9 ASP 0.670 1
ATOM 119 C CB . ASP 896 896 ? A 262.910 250.564 225.134 1 1 9 ASP 0.670 1
ATOM 120 C CG . ASP 896 896 ? A 262.695 250.658 223.627 1 1 9 ASP 0.670 1
ATOM 121 O OD1 . ASP 896 896 ? A 263.220 249.788 222.887 1 1 9 ASP 0.670 1
ATOM 122 O OD2 . ASP 896 896 ? A 262.040 251.648 223.208 1 1 9 ASP 0.670 1
ATOM 123 N N . LEU 897 897 ? A 263.096 249.298 228.017 1 1 9 LEU 0.640 1
ATOM 124 C CA . LEU 897 897 ? A 263.510 249.250 229.414 1 1 9 LEU 0.640 1
ATOM 125 C C . LEU 897 897 ? A 264.151 247.930 229.820 1 1 9 LEU 0.640 1
ATOM 126 O O . LEU 897 897 ? A 265.123 247.927 230.572 1 1 9 LEU 0.640 1
ATOM 127 C CB . LEU 897 897 ? A 262.407 249.704 230.413 1 1 9 LEU 0.640 1
ATOM 128 C CG . LEU 897 897 ? A 261.108 248.878 230.427 1 1 9 LEU 0.640 1
ATOM 129 C CD1 . LEU 897 897 ? A 261.105 247.665 231.375 1 1 9 LEU 0.640 1
ATOM 130 C CD2 . LEU 897 897 ? A 259.913 249.789 230.745 1 1 9 LEU 0.640 1
ATOM 131 N N . GLU 898 898 ? A 263.663 246.778 229.308 1 1 9 GLU 0.680 1
ATOM 132 C CA . GLU 898 898 ? A 264.244 245.469 229.566 1 1 9 GLU 0.680 1
ATOM 133 C C . GLU 898 898 ? A 265.672 245.353 229.057 1 1 9 GLU 0.680 1
ATOM 134 O O . GLU 898 898 ? A 266.564 244.868 229.752 1 1 9 GLU 0.680 1
ATOM 135 C CB . GLU 898 898 ? A 263.338 244.343 229.013 1 1 9 GLU 0.680 1
ATOM 136 C CG . GLU 898 898 ? A 263.779 242.912 229.413 1 1 9 GLU 0.680 1
ATOM 137 C CD . GLU 898 898 ? A 263.783 242.662 230.923 1 1 9 GLU 0.680 1
ATOM 138 O OE1 . GLU 898 898 ? A 264.486 241.700 231.326 1 1 9 GLU 0.680 1
ATOM 139 O OE2 . GLU 898 898 ? A 263.102 243.407 231.672 1 1 9 GLU 0.680 1
ATOM 140 N N . ASN 899 899 ? A 265.955 245.890 227.850 1 1 9 ASN 0.680 1
ATOM 141 C CA . ASN 899 899 ? A 267.311 246.024 227.331 1 1 9 ASN 0.680 1
ATOM 142 C C . ASN 899 899 ? A 268.187 246.865 228.255 1 1 9 ASN 0.680 1
ATOM 143 O O . ASN 899 899 ? A 269.283 246.456 228.619 1 1 9 ASN 0.680 1
ATOM 144 C CB . ASN 899 899 ? A 267.296 246.586 225.887 1 1 9 ASN 0.680 1
ATOM 145 C CG . ASN 899 899 ? A 266.696 245.557 224.934 1 1 9 ASN 0.680 1
ATOM 146 O OD1 . ASN 899 899 ? A 266.618 244.357 225.208 1 1 9 ASN 0.680 1
ATOM 147 N ND2 . ASN 899 899 ? A 266.258 246.029 223.741 1 1 9 ASN 0.680 1
ATOM 148 N N . ILE 900 900 ? A 267.685 248.009 228.768 1 1 9 ILE 0.620 1
ATOM 149 C CA . ILE 900 900 ? A 268.417 248.807 229.751 1 1 9 ILE 0.620 1
ATOM 150 C C . ILE 900 900 ? A 268.728 248.038 231.039 1 1 9 ILE 0.620 1
ATOM 151 O O . ILE 900 900 ? A 269.841 248.107 231.567 1 1 9 ILE 0.620 1
ATOM 152 C CB . ILE 900 900 ? A 267.679 250.108 230.078 1 1 9 ILE 0.620 1
ATOM 153 C CG1 . ILE 900 900 ? A 267.606 251.003 228.818 1 1 9 ILE 0.620 1
ATOM 154 C CG2 . ILE 900 900 ? A 268.332 250.857 231.268 1 1 9 ILE 0.620 1
ATOM 155 C CD1 . ILE 900 900 ? A 266.638 252.185 228.953 1 1 9 ILE 0.620 1
ATOM 156 N N . ILE 901 901 ? A 267.750 247.260 231.566 1 1 9 ILE 0.630 1
ATOM 157 C CA . ILE 901 901 ? A 267.919 246.401 232.737 1 1 9 ILE 0.630 1
ATOM 158 C C . ILE 901 901 ? A 268.971 245.348 232.514 1 1 9 ILE 0.630 1
ATOM 159 O O . ILE 901 901 ? A 269.892 245.209 233.321 1 1 9 ILE 0.630 1
ATOM 160 C CB . ILE 901 901 ? A 266.612 245.697 233.120 1 1 9 ILE 0.630 1
ATOM 161 C CG1 . ILE 901 901 ? A 265.610 246.730 233.672 1 1 9 ILE 0.630 1
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ATOM 163 C CD1 . ILE 901 901 ? A 264.148 246.298 233.514 1 1 9 ILE 0.630 1
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ATOM 260 C CD2 . TRP 913 913 ? A 282.075 236.501 240.491 1 1 9 TRP 0.370 1
ATOM 261 N NE1 . TRP 913 913 ? A 279.925 236.749 239.879 1 1 9 TRP 0.370 1
ATOM 262 C CE2 . TRP 913 913 ? A 280.770 235.994 240.657 1 1 9 TRP 0.370 1
ATOM 263 C CE3 . TRP 913 913 ? A 283.149 235.952 241.174 1 1 9 TRP 0.370 1
ATOM 264 C CZ2 . TRP 913 913 ? A 280.529 234.917 241.499 1 1 9 TRP 0.370 1
ATOM 265 C CZ3 . TRP 913 913 ? A 282.906 234.874 242.029 1 1 9 TRP 0.370 1
ATOM 266 C CH2 . TRP 913 913 ? A 281.616 234.356 242.185 1 1 9 TRP 0.370 1
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ATOM 272 O OG1 . THR 914 914 ? A 285.234 241.354 236.167 1 1 9 THR 0.550 1
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ATOM 275 C CA . THR 915 915 ? A 286.362 245.395 238.949 1 1 9 THR 0.430 1
ATOM 276 C C . THR 915 915 ? A 286.555 245.946 240.327 1 1 9 THR 0.430 1
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ATOM 278 C CB . THR 915 915 ? A 285.261 246.275 238.296 1 1 9 THR 0.430 1
ATOM 279 O OG1 . THR 915 915 ? A 285.767 247.501 237.761 1 1 9 THR 0.430 1
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ATOM 342 C CE . LYS 923 923 ? A 279.755 272.243 253.536 1 1 9 LYS 0.520 1
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ATOM 348 C CB . THR 924 924 ? A 281.809 274.857 247.551 1 1 9 THR 0.480 1
ATOM 349 O OG1 . THR 924 924 ? A 280.931 274.512 246.492 1 1 9 THR 0.480 1
ATOM 350 C CG2 . THR 924 924 ? A 282.658 276.050 247.074 1 1 9 THR 0.480 1
ATOM 351 N N . VAL 925 925 ? A 283.061 274.442 250.245 1 1 9 VAL 0.540 1
ATOM 352 C CA . VAL 925 925 ? A 283.875 274.838 251.385 1 1 9 VAL 0.540 1
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ATOM 356 C CG1 . VAL 925 925 ? A 281.796 275.247 252.809 1 1 9 VAL 0.540 1
ATOM 357 C CG2 . VAL 925 925 ? A 284.013 276.164 253.569 1 1 9 VAL 0.540 1
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ATOM 363 C CG . ASN 926 926 ? A 287.672 271.504 250.963 1 1 9 ASN 0.430 1
ATOM 364 O OD1 . ASN 926 926 ? A 287.651 272.460 250.192 1 1 9 ASN 0.430 1
ATOM 365 N ND2 . ASN 926 926 ? A 288.776 270.731 251.085 1 1 9 ASN 0.430 1
ATOM 366 N N . VAL 927 927 ? A 287.928 271.633 254.539 1 1 9 VAL 0.710 1
ATOM 367 C CA . VAL 927 927 ? A 289.098 271.826 255.371 1 1 9 VAL 0.710 1
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ATOM 369 O O . VAL 927 927 ? A 290.034 269.984 254.162 1 1 9 VAL 0.710 1
ATOM 370 C CB . VAL 927 927 ? A 288.861 271.337 256.798 1 1 9 VAL 0.710 1
ATOM 371 C CG1 . VAL 927 927 ? A 290.121 271.476 257.677 1 1 9 VAL 0.710 1
ATOM 372 C CG2 . VAL 927 927 ? A 287.711 272.165 257.401 1 1 9 VAL 0.710 1
ATOM 373 N N . ILE 928 928 ? A 291.451 271.636 254.759 1 1 9 ILE 0.500 1
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ATOM 376 O O . ILE 928 928 ? A 293.412 271.799 256.450 1 1 9 ILE 0.500 1
ATOM 377 C CB . ILE 928 928 ? A 293.313 271.716 253.108 1 1 9 ILE 0.500 1
ATOM 378 C CG1 . ILE 928 928 ? A 293.622 273.222 253.336 1 1 9 ILE 0.500 1
ATOM 379 C CG2 . ILE 928 928 ? A 292.364 271.476 251.912 1 1 9 ILE 0.500 1
ATOM 380 C CD1 . ILE 928 928 ? A 294.484 273.842 252.224 1 1 9 ILE 0.500 1
ATOM 381 N N . SER 929 929 ? A 294.645 270.158 255.532 1 1 9 SER 0.570 1
ATOM 382 C CA . SER 929 929 ? A 295.590 270.076 256.640 1 1 9 SER 0.570 1
ATOM 383 C C . SER 929 929 ? A 296.700 271.104 256.556 1 1 9 SER 0.570 1
ATOM 384 O O . SER 929 929 ? A 296.909 271.738 255.524 1 1 9 SER 0.570 1
ATOM 385 C CB . SER 929 929 ? A 296.222 268.655 256.821 1 1 9 SER 0.570 1
ATOM 386 O OG . SER 929 929 ? A 297.279 268.331 255.905 1 1 9 SER 0.570 1
ATOM 387 N N . GLN 930 930 ? A 297.476 271.268 257.655 1 1 9 GLN 0.540 1
ATOM 388 C CA . GLN 930 930 ? A 298.682 272.085 257.668 1 1 9 GLN 0.540 1
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ATOM 390 O O . GLN 930 930 ? A 300.310 272.373 255.929 1 1 9 GLN 0.540 1
ATOM 391 C CB . GLN 930 930 ? A 299.309 272.117 259.088 1 1 9 GLN 0.540 1
ATOM 392 C CG . GLN 930 930 ? A 300.541 273.047 259.243 1 1 9 GLN 0.540 1
ATOM 393 C CD . GLN 930 930 ? A 300.176 274.507 258.973 1 1 9 GLN 0.540 1
ATOM 394 O OE1 . GLN 930 930 ? A 299.027 274.921 259.146 1 1 9 GLN 0.540 1
ATOM 395 N NE2 . GLN 930 930 ? A 301.164 275.316 258.537 1 1 9 GLN 0.540 1
ATOM 396 N N . ALA 931 931 ? A 299.920 270.255 256.590 1 1 9 ALA 0.610 1
ATOM 397 C CA . ALA 931 931 ? A 300.862 269.640 255.678 1 1 9 ALA 0.610 1
ATOM 398 C C . ALA 931 931 ? A 300.521 269.915 254.214 1 1 9 ALA 0.610 1
ATOM 399 O O . ALA 931 931 ? A 301.393 270.254 253.421 1 1 9 ALA 0.610 1
ATOM 400 C CB . ALA 931 931 ? A 300.960 268.117 255.940 1 1 9 ALA 0.610 1
ATOM 401 N N . ASP 932 932 ? A 299.239 269.811 253.818 1 1 9 ASP 0.540 1
ATOM 402 C CA . ASP 932 932 ? A 298.787 270.127 252.478 1 1 9 ASP 0.540 1
ATOM 403 C C . ASP 932 932 ? A 298.882 271.605 252.145 1 1 9 ASP 0.540 1
ATOM 404 O O . ASP 932 932 ? A 299.253 271.969 251.029 1 1 9 ASP 0.540 1
ATOM 405 C CB . ASP 932 932 ? A 297.371 269.570 252.245 1 1 9 ASP 0.540 1
ATOM 406 C CG . ASP 932 932 ? A 297.412 268.046 252.273 1 1 9 ASP 0.540 1
ATOM 407 O OD1 . ASP 932 932 ? A 298.517 267.447 252.125 1 1 9 ASP 0.540 1
ATOM 408 O OD2 . ASP 932 932 ? A 296.320 267.462 252.483 1 1 9 ASP 0.540 1
ATOM 409 N N . PHE 933 933 ? A 298.597 272.485 253.134 1 1 9 PHE 0.430 1
ATOM 410 C CA . PHE 933 933 ? A 298.750 273.928 253.019 1 1 9 PHE 0.430 1
ATOM 411 C C . PHE 933 933 ? A 300.201 274.307 252.656 1 1 9 PHE 0.430 1
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ATOM 413 C CB . PHE 933 933 ? A 298.224 274.617 254.324 1 1 9 PHE 0.430 1
ATOM 414 C CG . PHE 933 933 ? A 298.548 276.091 254.419 1 1 9 PHE 0.430 1
ATOM 415 C CD1 . PHE 933 933 ? A 297.964 277.032 253.559 1 1 9 PHE 0.430 1
ATOM 416 C CD2 . PHE 933 933 ? A 299.525 276.534 255.326 1 1 9 PHE 0.430 1
ATOM 417 C CE1 . PHE 933 933 ? A 298.345 278.380 253.605 1 1 9 PHE 0.430 1
ATOM 418 C CE2 . PHE 933 933 ? A 299.907 277.879 255.372 1 1 9 PHE 0.430 1
ATOM 419 C CZ . PHE 933 933 ? A 299.312 278.807 254.517 1 1 9 PHE 0.430 1
ATOM 420 N N . GLU 934 934 ? A 301.220 273.769 253.368 1 1 9 GLU 0.430 1
ATOM 421 C CA . GLU 934 934 ? A 302.644 274.043 253.129 1 1 9 GLU 0.430 1
ATOM 422 C C . GLU 934 934 ? A 303.242 273.364 251.907 1 1 9 GLU 0.430 1
ATOM 423 O O . GLU 934 934 ? A 304.386 273.613 251.522 1 1 9 GLU 0.430 1
ATOM 424 C CB . GLU 934 934 ? A 303.521 273.601 254.328 1 1 9 GLU 0.430 1
ATOM 425 C CG . GLU 934 934 ? A 303.211 274.368 255.628 1 1 9 GLU 0.430 1
ATOM 426 C CD . GLU 934 934 ? A 304.011 273.888 256.838 1 1 9 GLU 0.430 1
ATOM 427 O OE1 . GLU 934 934 ? A 305.069 273.231 256.679 1 1 9 GLU 0.430 1
ATOM 428 O OE2 . GLU 934 934 ? A 303.536 274.192 257.967 1 1 9 GLU 0.430 1
ATOM 429 N N . LYS 935 935 ? A 302.530 272.414 251.287 1 1 9 LYS 0.460 1
ATOM 430 C CA . LYS 935 935 ? A 302.891 271.862 250.000 1 1 9 LYS 0.460 1
ATOM 431 C C . LYS 935 935 ? A 302.447 272.699 248.823 1 1 9 LYS 0.460 1
ATOM 432 O O . LYS 935 935 ? A 303.182 272.827 247.845 1 1 9 LYS 0.460 1
ATOM 433 C CB . LYS 935 935 ? A 302.305 270.454 249.821 1 1 9 LYS 0.460 1
ATOM 434 C CG . LYS 935 935 ? A 303.000 269.437 250.724 1 1 9 LYS 0.460 1
ATOM 435 C CD . LYS 935 935 ? A 302.285 268.088 250.683 1 1 9 LYS 0.460 1
ATOM 436 C CE . LYS 935 935 ? A 302.838 267.086 251.686 1 1 9 LYS 0.460 1
ATOM 437 N NZ . LYS 935 935 ? A 302.066 265.834 251.565 1 1 9 LYS 0.460 1
ATOM 438 N N . LEU 936 936 ? A 301.208 273.235 248.854 1 1 9 LEU 0.510 1
ATOM 439 C CA . LEU 936 936 ? A 300.722 274.120 247.811 1 1 9 LEU 0.510 1
ATOM 440 C C . LEU 936 936 ? A 301.190 275.578 247.936 1 1 9 LEU 0.510 1
ATOM 441 O O . LEU 936 936 ? A 301.349 276.237 246.906 1 1 9 LEU 0.510 1
ATOM 442 C CB . LEU 936 936 ? A 299.185 273.962 247.577 1 1 9 LEU 0.510 1
ATOM 443 C CG . LEU 936 936 ? A 298.252 274.313 248.752 1 1 9 LEU 0.510 1
ATOM 444 C CD1 . LEU 936 936 ? A 297.841 275.794 248.784 1 1 9 LEU 0.510 1
ATOM 445 C CD2 . LEU 936 936 ? A 296.996 273.426 248.724 1 1 9 LEU 0.510 1
ATOM 446 N N . ALA 937 937 ? A 301.429 276.126 249.154 1 1 9 ALA 0.480 1
ATOM 447 C CA . ALA 937 937 ? A 301.859 277.503 249.341 1 1 9 ALA 0.480 1
ATOM 448 C C . ALA 937 937 ? A 302.865 277.674 250.518 1 1 9 ALA 0.480 1
ATOM 449 O O . ALA 937 937 ? A 303.141 276.682 251.236 1 1 9 ALA 0.480 1
ATOM 450 C CB . ALA 937 937 ? A 300.648 278.410 249.661 1 1 9 ALA 0.480 1
ATOM 451 O OXT . ALA 937 937 ? A 303.346 278.827 250.719 1 1 9 ALA 0.480 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
loop_
_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
_ma_qa_metric_global.metric_id
_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.540
2 1 3 0.163
#
#
loop_
_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
_ma_qa_metric_local.label_seq_id
_ma_qa_metric_local.label_comp_id
_ma_qa_metric_local.metric_id
_ma_qa_metric_local.metric_value
1 1 A 882 ASP 1 0.260
2 1 A 883 ARG 1 0.240
3 1 A 884 THR 1 0.460
4 1 A 885 ALA 1 0.470
5 1 A 886 ASP 1 0.540
6 1 A 887 PHE 1 0.510
7 1 A 888 THR 1 0.620
8 1 A 889 SER 1 0.630
9 1 A 890 ARG 1 0.480
10 1 A 891 THR 1 0.670
11 1 A 892 LYS 1 0.660
12 1 A 893 ILE 1 0.610
13 1 A 894 THR 1 0.690
14 1 A 895 GLN 1 0.670
15 1 A 896 ASP 1 0.670
16 1 A 897 LEU 1 0.640
17 1 A 898 GLU 1 0.680
18 1 A 899 ASN 1 0.680
19 1 A 900 ILE 1 0.620
20 1 A 901 ILE 1 0.630
21 1 A 902 ASN 1 0.670
22 1 A 903 ASP 1 0.640
23 1 A 904 GLY 1 0.670
24 1 A 905 LEU 1 0.600
25 1 A 906 VAL 1 0.640
26 1 A 907 ASN 1 0.620
27 1 A 908 TYR 1 0.560
28 1 A 909 GLU 1 0.580
29 1 A 910 GLU 1 0.580
30 1 A 911 ASP 1 0.560
31 1 A 912 LEU 1 0.510
32 1 A 913 TRP 1 0.370
33 1 A 914 THR 1 0.550
34 1 A 915 THR 1 0.430
35 1 A 916 THR 1 0.410
36 1 A 917 ASN 1 0.560
37 1 A 918 VAL 1 0.510
38 1 A 919 VAL 1 0.460
39 1 A 920 ALA 1 0.480
40 1 A 921 ASP 1 0.320
41 1 A 922 TYR 1 0.360
42 1 A 923 LYS 1 0.520
43 1 A 924 THR 1 0.480
44 1 A 925 VAL 1 0.540
45 1 A 926 ASN 1 0.430
46 1 A 927 VAL 1 0.710
47 1 A 928 ILE 1 0.500
48 1 A 929 SER 1 0.570
49 1 A 930 GLN 1 0.540
50 1 A 931 ALA 1 0.610
51 1 A 932 ASP 1 0.540
52 1 A 933 PHE 1 0.430
53 1 A 934 GLU 1 0.430
54 1 A 935 LYS 1 0.460
55 1 A 936 LEU 1 0.510
56 1 A 937 ALA 1 0.480
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor
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you must distribute your contributions under the same license as the
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No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
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CC BY-SA 4.0 license at this link:
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;
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2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
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