data_SMR-cf5576e073797b3449a8863c889da524_4 _entry.id SMR-cf5576e073797b3449a8863c889da524_4 _struct.entry_id SMR-cf5576e073797b3449a8863c889da524_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P28481 (isoform 1)/ CO2A1_MOUSE, Collagen alpha-1(II) chain Estimated model accuracy of this model is 0.017, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P28481 (isoform 1)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 163954.957 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CO2A1_MOUSE P28481 1 ;MIRLGAPQSLVLLTLLIAAVLRCQGQDAQEAGSCLQNGQRYKDKDVWKPSSCRICVCDTGNVLCDDIICE DPDCLNPEIPFGECCPICPADLATASGKLGPKGQKGEPGDIRDGPAGEQGPRGDRGDKGEKNFAAQMAGG YDEKAGGAQMGVMQGPMGPMGPRGPPGPAGAPGPQGFQGNPGEPGEPGVSGPMGPRGPPGPAGKPGDDGE AGKPGKSGERGLPGPQGARGFPGTPGLPGVKGHRGYPGLDGAKGEAGAPGVKGESGSPGENGSPGPMGPR GLPGERGRTGPAGAAGARGNDGQPGPAGPPGPVGPAGGPGFPGAPGAKGEAGPTGARGPEGAQGSRGEPG NPGSPGPAGASGNPGTDGIPGAKGSAGAPGIAGAPGFPGPRGPPGPQGATGPLGPKGQAGEPGIAGFKGD QGPKGETGPAGPQGAPGPAGEEGKRGARGEPGGAGPIGPPGERGAPGNRGFPGQDGLAGPKGAPGERGPS GLTGPKGANGDPGRPGEPGLPGARGLTGRPGDAGPQGKVGPSGAPGEDGRPGPPGPQGARGQPGVMGFPG PKGANGEPGKAGEKGLAGAPGLRGLPGKDGETGAAGPPGPSGPAGERGEQGAPGPSGFQGLPGPPGPPGE GGKQGDQGIPGEAGAPGLVGPRGERGFPGERGSPGAQGLQGPRGLPGTPGTDGPKGAAGPDGPPGAQGPP GLQGMPGERGAAGIAGPKGDRGDVGEKGPEGAPGKDGGRGLTGPIGPPGPAGANGEKGEVGPPGPSGSTG ARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGA RGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPGLQGPAGAPGEK GEPGDDGPSGLDGPPGPQGLAGQRGIVGLPGQRGERGFPGLPGPSGEPGKQGAPGASGDRGPPGPVGPPG LTGPAGEPGREGSPGADGPPGRDGAAGVKGDRGETGALGAPGAPGPPGSPGPAGPTGKQGDRGEAGAQGP MGPSGPAGARGIAGPQGPRGDKGESGEQGERGLKGHRGFTGLQGLPGPPGPSGDQGASGPAGPSGPRGPP GPVGPSGKDGSNGIPGPIGPPGPRGRSGETGPVGPPGSPGPPGPPGPPGPGIDMSAFAGLGQREKGPDPM QYMRADEADSTLRQHDVEVDATLKSLNNQIESIRSPDGSRKNPARTCQDLKLCHPEWKSGDYWIDPNQGC TLDAMKVFCNMETGETCVYPNPATVPRKNWWSSKSKEKKHIWFGETMNGGFHFSYGDGNLAPNTANVQMT FLRLLSTEGSQNITYHCKNSIAYLDEAAGNLKKALLIQGSNDVEMRAEGNSRFTYTALKDGCTKHTGKWG KTVIEYRSQKTSRLPIIDIAPMDIGGAEQEFGVDIGPVCFL ; 'Collagen alpha-1(II) chain' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1441 1 1441 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CO2A1_MOUSE P28481 P28481-1 1 1441 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2007-02-06 88086B838B2876F9 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MIRLGAPQSLVLLTLLIAAVLRCQGQDAQEAGSCLQNGQRYKDKDVWKPSSCRICVCDTGNVLCDDIICE DPDCLNPEIPFGECCPICPADLATASGKLGPKGQKGEPGDIRDGPAGEQGPRGDRGDKGEKNFAAQMAGG YDEKAGGAQMGVMQGPMGPMGPRGPPGPAGAPGPQGFQGNPGEPGEPGVSGPMGPRGPPGPAGKPGDDGE AGKPGKSGERGLPGPQGARGFPGTPGLPGVKGHRGYPGLDGAKGEAGAPGVKGESGSPGENGSPGPMGPR GLPGERGRTGPAGAAGARGNDGQPGPAGPPGPVGPAGGPGFPGAPGAKGEAGPTGARGPEGAQGSRGEPG NPGSPGPAGASGNPGTDGIPGAKGSAGAPGIAGAPGFPGPRGPPGPQGATGPLGPKGQAGEPGIAGFKGD QGPKGETGPAGPQGAPGPAGEEGKRGARGEPGGAGPIGPPGERGAPGNRGFPGQDGLAGPKGAPGERGPS GLTGPKGANGDPGRPGEPGLPGARGLTGRPGDAGPQGKVGPSGAPGEDGRPGPPGPQGARGQPGVMGFPG PKGANGEPGKAGEKGLAGAPGLRGLPGKDGETGAAGPPGPSGPAGERGEQGAPGPSGFQGLPGPPGPPGE 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53 ARG . 1 54 ILE . 1 55 CYS . 1 56 VAL . 1 57 CYS . 1 58 ASP . 1 59 THR . 1 60 GLY . 1 61 ASN . 1 62 VAL . 1 63 LEU . 1 64 CYS . 1 65 ASP . 1 66 ASP . 1 67 ILE . 1 68 ILE . 1 69 CYS . 1 70 GLU . 1 71 ASP . 1 72 PRO . 1 73 ASP . 1 74 CYS . 1 75 LEU . 1 76 ASN . 1 77 PRO . 1 78 GLU . 1 79 ILE . 1 80 PRO . 1 81 PHE . 1 82 GLY . 1 83 GLU . 1 84 CYS . 1 85 CYS . 1 86 PRO . 1 87 ILE . 1 88 CYS . 1 89 PRO . 1 90 ALA . 1 91 ASP . 1 92 LEU . 1 93 ALA . 1 94 THR . 1 95 ALA . 1 96 SER . 1 97 GLY . 1 98 LYS . 1 99 LEU . 1 100 GLY . 1 101 PRO . 1 102 LYS . 1 103 GLY . 1 104 GLN . 1 105 LYS . 1 106 GLY . 1 107 GLU . 1 108 PRO . 1 109 GLY . 1 110 ASP . 1 111 ILE . 1 112 ARG . 1 113 ASP . 1 114 GLY . 1 115 PRO . 1 116 ALA . 1 117 GLY . 1 118 GLU . 1 119 GLN . 1 120 GLY . 1 121 PRO . 1 122 ARG . 1 123 GLY . 1 124 ASP . 1 125 ARG . 1 126 GLY . 1 127 ASP . 1 128 LYS . 1 129 GLY . 1 130 GLU . 1 131 LYS . 1 132 ASN . 1 133 PHE . 1 134 ALA . 1 135 ALA . 1 136 GLN . 1 137 MET . 1 138 ALA . 1 139 GLY . 1 140 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A 1 1266 LYS 1266 ? ? ? A . A 1 1267 VAL 1267 ? ? ? A . A 1 1268 PHE 1268 ? ? ? A . A 1 1269 CYS 1269 ? ? ? A . A 1 1270 ASN 1270 ? ? ? A . A 1 1271 MET 1271 ? ? ? A . A 1 1272 GLU 1272 ? ? ? A . A 1 1273 THR 1273 ? ? ? A . A 1 1274 GLY 1274 ? ? ? A . A 1 1275 GLU 1275 ? ? ? A . A 1 1276 THR 1276 ? ? ? A . A 1 1277 CYS 1277 ? ? ? A . A 1 1278 VAL 1278 ? ? ? A . A 1 1279 TYR 1279 ? ? ? A . A 1 1280 PRO 1280 ? ? ? A . A 1 1281 ASN 1281 ? ? ? A . A 1 1282 PRO 1282 ? ? ? A . A 1 1283 ALA 1283 ? ? ? A . A 1 1284 THR 1284 ? ? ? A . A 1 1285 VAL 1285 ? ? ? A . A 1 1286 PRO 1286 ? ? ? A . A 1 1287 ARG 1287 ? ? ? A . A 1 1288 LYS 1288 ? ? ? A . A 1 1289 ASN 1289 ? ? ? A . A 1 1290 TRP 1290 ? ? ? A . A 1 1291 TRP 1291 ? ? ? A . A 1 1292 SER 1292 ? ? ? A . A 1 1293 SER 1293 ? ? ? A . A 1 1294 LYS 1294 ? ? ? A . A 1 1295 SER 1295 ? ? ? A . A 1 1296 LYS 1296 ? ? ? A . A 1 1297 GLU 1297 ? ? ? A . A 1 1298 LYS 1298 ? ? ? A . A 1 1299 LYS 1299 ? ? ? A . A 1 1300 HIS 1300 ? ? ? A . A 1 1301 ILE 1301 ? ? ? A . A 1 1302 TRP 1302 ? ? ? A . A 1 1303 PHE 1303 ? ? ? A . A 1 1304 GLY 1304 ? ? ? A . A 1 1305 GLU 1305 ? ? ? A . A 1 1306 THR 1306 ? ? ? A . A 1 1307 MET 1307 ? ? ? A . A 1 1308 ASN 1308 ? ? ? A . A 1 1309 GLY 1309 ? ? ? A . A 1 1310 GLY 1310 ? ? ? A . A 1 1311 PHE 1311 ? ? ? A . A 1 1312 HIS 1312 ? ? ? A . A 1 1313 PHE 1313 ? ? ? A . A 1 1314 SER 1314 ? ? ? A . A 1 1315 TYR 1315 ? ? ? A . A 1 1316 GLY 1316 ? ? ? A . A 1 1317 ASP 1317 ? ? ? A . A 1 1318 GLY 1318 ? ? ? A . A 1 1319 ASN 1319 ? ? ? A . A 1 1320 LEU 1320 ? ? ? A . A 1 1321 ALA 1321 ? ? ? A . A 1 1322 PRO 1322 ? ? ? A . A 1 1323 ASN 1323 ? ? ? A . A 1 1324 THR 1324 ? ? ? A . A 1 1325 ALA 1325 ? ? ? A . A 1 1326 ASN 1326 ? ? ? A . A 1 1327 VAL 1327 ? ? ? A . A 1 1328 GLN 1328 ? ? ? A . A 1 1329 MET 1329 ? ? ? A . A 1 1330 THR 1330 ? ? ? A . A 1 1331 PHE 1331 ? ? ? A . A 1 1332 LEU 1332 ? ? ? A . A 1 1333 ARG 1333 ? ? ? A . A 1 1334 LEU 1334 ? ? ? A . A 1 1335 LEU 1335 ? ? ? A . A 1 1336 SER 1336 ? ? ? A . A 1 1337 THR 1337 ? ? ? A . A 1 1338 GLU 1338 ? ? ? A . A 1 1339 GLY 1339 ? ? ? A . A 1 1340 SER 1340 ? ? ? A . A 1 1341 GLN 1341 ? ? ? A . A 1 1342 ASN 1342 ? ? ? A . A 1 1343 ILE 1343 ? ? ? A . A 1 1344 THR 1344 ? ? ? A . A 1 1345 TYR 1345 ? ? ? A . A 1 1346 HIS 1346 ? ? ? A . A 1 1347 CYS 1347 ? ? ? A . A 1 1348 LYS 1348 ? ? ? A . A 1 1349 ASN 1349 ? ? ? A . A 1 1350 SER 1350 ? ? ? A . A 1 1351 ILE 1351 ? ? ? A . A 1 1352 ALA 1352 ? ? ? A . A 1 1353 TYR 1353 ? ? ? A . A 1 1354 LEU 1354 ? ? ? A . A 1 1355 ASP 1355 ? ? ? A . A 1 1356 GLU 1356 ? ? ? A . A 1 1357 ALA 1357 ? ? ? A . A 1 1358 ALA 1358 ? ? ? A . A 1 1359 GLY 1359 ? ? ? A . A 1 1360 ASN 1360 ? ? ? A . A 1 1361 LEU 1361 ? ? ? A . A 1 1362 LYS 1362 ? ? ? A . A 1 1363 LYS 1363 ? ? ? A . A 1 1364 ALA 1364 ? ? ? A . A 1 1365 LEU 1365 ? ? ? A . A 1 1366 LEU 1366 ? ? ? A . A 1 1367 ILE 1367 ? ? ? A . A 1 1368 GLN 1368 ? ? ? A . A 1 1369 GLY 1369 ? ? ? A . A 1 1370 SER 1370 ? ? ? A . A 1 1371 ASN 1371 ? ? ? A . A 1 1372 ASP 1372 ? ? ? A . A 1 1373 VAL 1373 ? ? ? A . A 1 1374 GLU 1374 ? ? ? A . A 1 1375 MET 1375 ? ? ? A . A 1 1376 ARG 1376 ? ? ? A . A 1 1377 ALA 1377 ? ? ? A . A 1 1378 GLU 1378 ? ? ? A . A 1 1379 GLY 1379 ? ? ? A . A 1 1380 ASN 1380 ? ? ? A . A 1 1381 SER 1381 ? ? ? A . A 1 1382 ARG 1382 ? ? ? A . A 1 1383 PHE 1383 ? ? ? A . A 1 1384 THR 1384 ? ? ? A . A 1 1385 TYR 1385 ? ? ? A . A 1 1386 THR 1386 ? ? ? A . A 1 1387 ALA 1387 ? ? ? A . A 1 1388 LEU 1388 ? ? ? A . A 1 1389 LYS 1389 ? ? ? A . A 1 1390 ASP 1390 ? ? ? A . A 1 1391 GLY 1391 ? ? ? A . A 1 1392 CYS 1392 ? ? ? A . A 1 1393 THR 1393 ? ? ? A . A 1 1394 LYS 1394 ? ? ? A . A 1 1395 HIS 1395 ? ? ? A . A 1 1396 THR 1396 ? ? ? A . A 1 1397 GLY 1397 ? ? ? A . A 1 1398 LYS 1398 ? ? ? A . A 1 1399 TRP 1399 ? ? ? A . A 1 1400 GLY 1400 ? ? ? A . A 1 1401 LYS 1401 ? ? ? A . A 1 1402 THR 1402 ? ? ? A . A 1 1403 VAL 1403 ? ? ? A . A 1 1404 ILE 1404 ? ? ? A . A 1 1405 GLU 1405 ? ? ? A . A 1 1406 TYR 1406 ? ? ? A . A 1 1407 ARG 1407 ? ? ? A . A 1 1408 SER 1408 ? ? ? A . A 1 1409 GLN 1409 ? ? ? A . A 1 1410 LYS 1410 ? ? ? A . A 1 1411 THR 1411 ? ? ? A . A 1 1412 SER 1412 ? ? ? A . A 1 1413 ARG 1413 ? ? ? A . A 1 1414 LEU 1414 ? ? ? A . A 1 1415 PRO 1415 ? ? ? A . A 1 1416 ILE 1416 ? ? ? A . A 1 1417 ILE 1417 ? ? ? A . A 1 1418 ASP 1418 ? ? ? A . A 1 1419 ILE 1419 ? ? ? A . A 1 1420 ALA 1420 ? ? ? A . A 1 1421 PRO 1421 ? ? ? A . A 1 1422 MET 1422 ? ? ? A . A 1 1423 ASP 1423 ? ? ? A . A 1 1424 ILE 1424 ? ? ? A . A 1 1425 GLY 1425 ? ? ? A . A 1 1426 GLY 1426 ? ? ? A . A 1 1427 ALA 1427 ? ? ? A . A 1 1428 GLU 1428 ? ? ? A . A 1 1429 GLN 1429 ? ? ? A . A 1 1430 GLU 1430 ? ? ? A . A 1 1431 PHE 1431 ? ? ? A . A 1 1432 GLY 1432 ? ? ? A . A 1 1433 VAL 1433 ? ? ? A . A 1 1434 ASP 1434 ? ? ? A . A 1 1435 ILE 1435 ? ? ? A . A 1 1436 GLY 1436 ? ? ? A . A 1 1437 PRO 1437 ? ? ? A . A 1 1438 VAL 1438 ? ? ? A . A 1 1439 CYS 1439 ? ? ? A . A 1 1440 PHE 1440 ? ? ? A . A 1 1441 LEU 1441 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Collagen alpha-1(II) chain {PDB ID=5nir, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=5nir.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 5nir, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSMAQEAGSCVQDGQRYNDKDVWKPEPCRICVCDTGTVLCDDIICEDVKDCLSPEIPFGECCPICPTDLA TASG ; ;GSMAQEAGSCVQDGQRYNDKDVWKPEPCRICVCDTGTVLCDDIICEDVKDCLSPEIPFGECCPICPTDLA TASG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 5 74 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5nir 2024-11-06 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1441 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1442 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 8.87e-34 86.957 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MIRLGAPQSLVLLTLLIAAVLRCQGQDAQEAGSCLQNGQRYKDKDVWKPSSCRICVCDTGNVLCDDIICEDP-DCLNPEIPFGECCPICPADLATASGKLGPKGQKGEPGDIRDGPAGEQGPRGDRGDKGEKNFAAQMAGGYDEKAGGAQMGVMQGPMGPMGPRGPPGPAGAPGPQGFQGNPGEPGEPGVSGPMGPRGPPGPAGKPGDDGEAGKPGKSGERGLPGPQGARGFPGTPGLPGVKGHRGYPGLDGAKGEAGAPGVKGESGSPGENGSPGPMGPRGLPGERGRTGPAGAAGARGNDGQPGPAGPPGPVGPAGGPGFPGAPGAKGEAGPTGARGPEGAQGSRGEPGNPGSPGPAGASGNPGTDGIPGAKGSAGAPGIAGAPGFPGPRGPPGPQGATGPLGPKGQAGEPGIAGFKGDQGPKGETGPAGPQGAPGPAGEEGKRGARGEPGGAGPIGPPGERGAPGNRGFPGQDGLAGPKGAPGERGPSGLTGPKGANGDPGRPGEPGLPGARGLTGRPGDAGPQGKVGPSGAPGEDGRPGPPGPQGARGQPGVMGFPGPKGANGEPGKAGEKGLAGAPGLRGLPGKDGETGAAGPPGPSGPAGERGEQGAPGPSGFQGLPGPPGPPGEGGKQGDQGIPGEAGAPGLVGPRGERGFPGERGSPGAQGLQGPRGLPGTPGTDGPKGAAGPDGPPGAQGPPGLQGMPGERGAAGIAGPKGDRGDVGEKGPEGAPGKDGGRGLTGPIGPPGPAGANGEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPGLQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQGLAGQRGIVGLPGQRGERGFPGLPGPSGEPGKQGAPGASGDRGPPGPVGPPGLTGPAGEPGREGSPGADGPPGRDGAAGVKGDRGETGALGAPGAPGPPGSPGPAGPTGKQGDRGEAGAQGPMGPSGPAGARGIAGPQGPRGDKGESGEQGERGLKGHRGFTGLQGLPGPPGPSGDQGASGPAGPSGPRGPPGPVGPSGKDGSNGIPGPIGPPGPRGRSGETGPVGPPGSPGPPGPPGPPGPGIDMSAFAGLGQREKGPDPMQYMRADEADSTLRQHDVEVDATLKSLNNQIESIRSPDGSRKNPARTCQDLKLCHPEWKSGDYWIDPNQGCTLDAMKVFCNMETGETCVYPNPATVPRKNWWSSKSKEKKHIWFGETMNGGFHFSYGDGNLAPNTANVQMTFLRLLSTEGSQNITYHCKNSIAYLDEAAGNLKKALLIQGSNDVEMRAEGNSRFTYTALKDGCTKHTGKWGKTVIEYRSQKTSRLPIIDIAPMDIGGAEQEFGVDIGPVCFL 2 1 2 ----------------------------QEAGSCVQDGQRYNDKDVWKPEPCRICVCDTGTVLCDDIICEDVKDCLSPEIPFGECCPICPTDLATASG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5nir.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 30 30 ? A -5.286 2.917 7.062 1 1 A GLU 0.400 1 ATOM 2 C CA . GLU 30 30 ? A -6.615 3.558 6.985 1 1 A GLU 0.400 1 ATOM 3 C C . GLU 30 30 ? A -6.462 5.055 6.812 1 1 A GLU 0.400 1 ATOM 4 O O . GLU 30 30 ? A -5.374 5.567 7.068 1 1 A GLU 0.400 1 ATOM 5 C CB . GLU 30 30 ? A -7.377 3.210 8.304 1 1 A GLU 0.400 1 ATOM 6 C CG . GLU 30 30 ? A -8.870 3.600 8.313 1 1 A GLU 0.400 1 ATOM 7 C CD . GLU 30 30 ? A -9.435 3.036 7.016 1 1 A GLU 0.400 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 30 30 ? A -9.271 3.721 5.973 1 1 A GLU 0.400 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 30 30 ? A -9.837 1.852 7.055 1 1 A GLU 0.400 1 ATOM 10 N N . ALA 31 31 ? A -7.504 5.779 6.371 1 1 A ALA 0.470 1 ATOM 11 C CA . ALA 31 31 ? A -7.554 7.223 6.308 1 1 A ALA 0.470 1 ATOM 12 C C . ALA 31 31 ? A -7.249 7.916 7.649 1 1 A ALA 0.470 1 ATOM 13 O O . ALA 31 31 ? A -7.782 7.549 8.692 1 1 A ALA 0.470 1 ATOM 14 C CB . ALA 31 31 ? A -8.950 7.609 5.784 1 1 A ALA 0.470 1 ATOM 15 N N . GLY 32 32 ? A -6.317 8.904 7.651 1 1 A GLY 0.600 1 ATOM 16 C CA . GLY 32 32 ? A -5.941 9.684 8.837 1 1 A GLY 0.600 1 ATOM 17 C C . GLY 32 32 ? A -4.995 8.989 9.788 1 1 A GLY 0.600 1 ATOM 18 O O . GLY 32 32 ? A -4.609 9.540 10.812 1 1 A GLY 0.600 1 ATOM 19 N N . SER 33 33 ? A -4.576 7.749 9.481 1 1 A SER 0.640 1 ATOM 20 C CA . SER 33 33 ? A -3.663 6.996 10.330 1 1 A SER 0.640 1 ATOM 21 C C . SER 33 33 ? A -2.246 7.532 10.388 1 1 A SER 0.640 1 ATOM 22 O O . SER 33 33 ? A -1.721 8.084 9.423 1 1 A SER 0.640 1 ATOM 23 C CB . SER 33 33 ? A -3.633 5.476 10.024 1 1 A SER 0.640 1 ATOM 24 O OG . SER 33 33 ? A -2.914 5.135 8.834 1 1 A SER 0.640 1 ATOM 25 N N . CYS 34 34 ? A -1.576 7.348 11.537 1 1 A CYS 0.660 1 ATOM 26 C CA . CYS 34 34 ? A -0.266 7.911 11.789 1 1 A CYS 0.660 1 ATOM 27 C C . CYS 34 34 ? A 0.768 6.805 11.773 1 1 A CYS 0.660 1 ATOM 28 O O . CYS 34 34 ? A 0.437 5.642 11.987 1 1 A CYS 0.660 1 ATOM 29 C CB . CYS 34 34 ? A -0.199 8.618 13.161 1 1 A CYS 0.660 1 ATOM 30 S SG . CYS 34 34 ? A -1.404 9.966 13.329 1 1 A CYS 0.660 1 ATOM 31 N N . LEU 35 35 ? A 2.051 7.127 11.523 1 1 A LEU 0.580 1 ATOM 32 C CA . LEU 35 35 ? A 3.136 6.164 11.610 1 1 A LEU 0.580 1 ATOM 33 C C . LEU 35 35 ? A 4.187 6.732 12.546 1 1 A LEU 0.580 1 ATOM 34 O O . LEU 35 35 ? A 4.640 7.855 12.347 1 1 A LEU 0.580 1 ATOM 35 C CB . LEU 35 35 ? A 3.772 5.926 10.211 1 1 A LEU 0.580 1 ATOM 36 C CG . LEU 35 35 ? A 4.994 4.975 10.148 1 1 A LEU 0.580 1 ATOM 37 C CD1 . LEU 35 35 ? A 4.616 3.506 10.368 1 1 A LEU 0.580 1 ATOM 38 C CD2 . LEU 35 35 ? A 5.746 5.096 8.812 1 1 A LEU 0.580 1 ATOM 39 N N . GLN 36 36 ? A 4.605 5.987 13.591 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 40 C CA . GLN 36 36 ? A 5.670 6.447 14.465 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 41 C C . GLN 36 36 ? A 6.487 5.254 14.923 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 42 O O . GLN 36 36 ? A 5.932 4.247 15.354 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 43 C CB . GLN 36 36 ? A 5.089 7.196 15.691 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 44 C CG . GLN 36 36 ? A 6.084 8.027 16.537 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 45 C CD . GLN 36 36 ? A 6.736 9.126 15.701 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 46 O OE1 . GLN 36 36 ? A 6.052 9.918 15.058 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 47 N NE2 . GLN 36 36 ? A 8.088 9.204 15.704 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 48 N N . ASN 37 37 ? A 7.836 5.307 14.809 1 1 A ASN 0.630 1 ATOM 49 C CA . ASN 37 37 ? A 8.743 4.225 15.205 1 1 A ASN 0.630 1 ATOM 50 C C . ASN 37 37 ? A 8.402 2.843 14.643 1 1 A ASN 0.630 1 ATOM 51 O O . ASN 37 37 ? A 8.490 1.828 15.327 1 1 A ASN 0.630 1 ATOM 52 C CB . ASN 37 37 ? A 8.933 4.148 16.739 1 1 A ASN 0.630 1 ATOM 53 C CG . ASN 37 37 ? A 9.501 5.472 17.215 1 1 A ASN 0.630 1 ATOM 54 O OD1 . ASN 37 37 ? A 10.332 6.089 16.548 1 1 A ASN 0.630 1 ATOM 55 N ND2 . ASN 37 37 ? A 9.064 5.952 18.402 1 1 A ASN 0.630 1 ATOM 56 N N . GLY 38 38 ? A 8.006 2.787 13.354 1 1 A GLY 0.590 1 ATOM 57 C CA . GLY 38 38 ? A 7.626 1.551 12.675 1 1 A GLY 0.590 1 ATOM 58 C C . GLY 38 38 ? A 6.225 1.042 12.943 1 1 A GLY 0.590 1 ATOM 59 O O . GLY 38 38 ? A 5.829 0.026 12.380 1 1 A GLY 0.590 1 ATOM 60 N N . GLN 39 39 ? A 5.415 1.743 13.763 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 61 C CA . GLN 39 39 ? A 4.070 1.315 14.115 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 62 C C . GLN 39 39 ? A 3.024 2.257 13.583 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 63 O O . GLN 39 39 ? A 3.173 3.478 13.615 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 64 C CB . GLN 39 39 ? A 3.821 1.292 15.636 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 65 C CG . GLN 39 39 ? A 4.734 0.320 16.393 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 66 C CD . GLN 39 39 ? A 4.263 0.191 17.839 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 67 O OE1 . GLN 39 39 ? A 3.085 0.315 18.172 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 68 N NE2 . GLN 39 39 ? A 5.212 -0.087 18.761 1 1 A GLN 0.610 1 ATOM 69 N N . ARG 40 40 ? A 1.920 1.685 13.075 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 70 C CA . ARG 40 40 ? A 0.815 2.442 12.545 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 71 C C . ARG 40 40 ? A -0.297 2.508 13.566 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 72 O O . ARG 40 40 ? A -0.718 1.492 14.110 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 73 C CB . ARG 40 40 ? A 0.272 1.827 11.233 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 74 C CG . ARG 40 40 ? A -0.831 2.681 10.572 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 75 C CD . ARG 40 40 ? A -1.288 2.197 9.196 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 76 N NE . ARG 40 40 ? A -0.165 2.359 8.215 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 77 C CZ . ARG 40 40 ? A 0.238 3.484 7.599 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 78 N NH1 . ARG 40 40 ? A -0.303 4.684 7.774 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 79 N NH2 . ARG 40 40 ? A 1.253 3.401 6.735 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 80 N N . TYR 41 41 ? A -0.798 3.725 13.811 1 1 A TYR 0.600 1 ATOM 81 C CA . TYR 41 41 ? A -1.826 4.002 14.790 1 1 A TYR 0.600 1 ATOM 82 C C . TYR 41 41 ? A -3.031 4.472 14.010 1 1 A TYR 0.600 1 ATOM 83 O O . TYR 41 41 ? A -2.885 5.201 13.030 1 1 A TYR 0.600 1 ATOM 84 C CB . TYR 41 41 ? A -1.405 5.116 15.780 1 1 A TYR 0.600 1 ATOM 85 C CG . TYR 41 41 ? A -0.147 4.730 16.497 1 1 A TYR 0.600 1 ATOM 86 C CD1 . TYR 41 41 ? A 1.115 5.026 15.954 1 1 A TYR 0.600 1 ATOM 87 C CD2 . TYR 41 41 ? A -0.217 4.030 17.709 1 1 A TYR 0.600 1 ATOM 88 C CE1 . TYR 41 41 ? A 2.283 4.631 16.618 1 1 A TYR 0.600 1 ATOM 89 C CE2 . TYR 41 41 ? A 0.953 3.656 18.384 1 1 A TYR 0.600 1 ATOM 90 C CZ . TYR 41 41 ? A 2.203 3.979 17.848 1 1 A TYR 0.600 1 ATOM 91 O OH . TYR 41 41 ? 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A -6.491 16.985 48.977 1 1 A GLY 0.470 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.548 2 1 3 0.017 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 30 GLU 1 0.400 2 1 A 31 ALA 1 0.470 3 1 A 32 GLY 1 0.600 4 1 A 33 SER 1 0.640 5 1 A 34 CYS 1 0.660 6 1 A 35 LEU 1 0.580 7 1 A 36 GLN 1 0.610 8 1 A 37 ASN 1 0.630 9 1 A 38 GLY 1 0.590 10 1 A 39 GLN 1 0.610 11 1 A 40 ARG 1 0.570 12 1 A 41 TYR 1 0.600 13 1 A 42 LYS 1 0.630 14 1 A 43 ASP 1 0.580 15 1 A 44 LYS 1 0.630 16 1 A 45 ASP 1 0.630 17 1 A 46 VAL 1 0.690 18 1 A 47 TRP 1 0.480 19 1 A 48 LYS 1 0.600 20 1 A 49 PRO 1 0.620 21 1 A 50 SER 1 0.630 22 1 A 51 SER 1 0.610 23 1 A 52 CYS 1 0.600 24 1 A 53 ARG 1 0.540 25 1 A 54 ILE 1 0.620 26 1 A 55 CYS 1 0.730 27 1 A 56 VAL 1 0.780 28 1 A 57 CYS 1 0.740 29 1 A 58 ASP 1 0.650 30 1 A 59 THR 1 0.610 31 1 A 60 GLY 1 0.670 32 1 A 61 ASN 1 0.680 33 1 A 62 VAL 1 0.740 34 1 A 63 LEU 1 0.720 35 1 A 64 CYS 1 0.730 36 1 A 65 ASP 1 0.630 37 1 A 66 ASP 1 0.550 38 1 A 67 ILE 1 0.560 39 1 A 68 ILE 1 0.450 40 1 A 69 CYS 1 0.520 41 1 A 70 GLU 1 0.530 42 1 A 71 ASP 1 0.440 43 1 A 72 PRO 1 0.380 44 1 A 73 ASP 1 0.270 45 1 A 74 CYS 1 0.480 46 1 A 75 LEU 1 0.390 47 1 A 76 ASN 1 0.490 48 1 A 77 PRO 1 0.520 49 1 A 78 GLU 1 0.560 50 1 A 79 ILE 1 0.520 51 1 A 80 PRO 1 0.450 52 1 A 81 PHE 1 0.310 53 1 A 82 GLY 1 0.470 54 1 A 83 GLU 1 0.540 55 1 A 84 CYS 1 0.590 56 1 A 85 CYS 1 0.550 57 1 A 86 PRO 1 0.550 58 1 A 87 ILE 1 0.540 59 1 A 88 CYS 1 0.520 60 1 A 89 PRO 1 0.450 61 1 A 90 ALA 1 0.490 62 1 A 91 ASP 1 0.390 63 1 A 92 LEU 1 0.310 64 1 A 93 ALA 1 0.320 65 1 A 94 THR 1 0.280 66 1 A 95 ALA 1 0.560 67 1 A 96 SER 1 0.290 68 1 A 97 GLY 1 0.470 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #