data_SMR-23f8e47f0218e68f7ca90bb5ef9f24a1_3 _entry.id SMR-23f8e47f0218e68f7ca90bb5ef9f24a1_3 _struct.entry_id SMR-23f8e47f0218e68f7ca90bb5ef9f24a1_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P28481 (isoform 1)/ CO2A1_MOUSE, Collagen alpha-1(II) chain Estimated model accuracy of this model is 0.018, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P28481 (isoform 1)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 165417.636 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CO2A1_MOUSE P28481 1 ;MIRLGAPQSLVLLTLLIAAVLRCQGQDAQEAGSCLQNGQRYKDKDVWKPSSCRICVCDTGNVLCDDIICE DPDCLNPEIPFGECCPICPADLATASGKLGPKIIGPRGPPGPQGAPGPRGRDGEPGTPGNPGPAGPPGPP GPPGLSAGNFAAQMAGGYDEKAGGAQMGVMQGPMGPMGPRGPPGPAGAPGPQGFQGNPGEPGEPGVSGPM GPRGPPGPAGKPGDDGEAGKPGKSGERGLPGPQGARGFPGTPGLPGVKGHRGYPGLDGAKGEAGAPGVKG ESGSPGENGSPGPMGPRGLPGERGRTGPAGAAGARGNDGQPGPAGPPGPVGPAGGPGFPGAPGAKGEAGP TGARGPEGAQGSRGEPGNPGSPGPAGASGNPGTDGIPGAKGSAGAPGIAGAPGFPGPRGPPGPQGATGPL GPKGQAGEPGIAGFKGDQGPKGETGPAGPQGAPGPAGEEGKRGARGEPGGAGPIGPPGERGAPGNRGFPG QDGLAGPKGAPGERGPSGLTGPKGANGDPGRPGEPGLPGARGLTGRPGDAGPQGKVGPSGAPGEDGRPGP PGPQGARGQPGVMGFPGPKGANGEPGKAGEKGLAGAPGLRGLPGKDGETGAAGPPGPSGPAGERGEQGAP GPSGFQGLPGPPGPPGEGGKQGDQGIPGEAGAPGLVGPRGERGFPGERGSPGAQGLQGPRGLPGTPGTDG PKGAAGPDGPPGAQGPPGLQGMPGERGAAGIAGPKGDRGDVGEKGPEGAPGKDGGRGLTGPIGPPGPAGA NGEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPS GAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPKGVRGDSGPPG RAGDPGLQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQGLAGQRGIVGLPGQRGERGFPGLPGPSGEPGKQGA PGASGDRGPPGPVGPPGLTGPAGEPGREGSPGADGPPGRDGAAGVKGDRGETGALGAPGAPGPPGSPGPA GPTGKQGDRGEAGAQGPMGPSGPAGARGIAGPQGPRGDKGESGEQGERGLKGHRGFTGLQGLPGPPGPSG DQGASGPAGPSGPRGPPGPVGPSGKDGSNGIPGPIGPPGPRGRSGETGPVGPPGSPGPPGPPGPPGPGID MSAFAGLGQREKGPDPMQYMRADEADSTLRQHDVEVDATLKSLNNQIESIRSPDGSRKNPARTCQDLKLC HPEWKSGDYWIDPNQGCTLDAMKVFCNMETGETCVYPNPATVPRKNWWSSKSKEKKHIWFGETMNGGFHF SYGDGNLAPNTANVQMTFLRLLSTEGSQNITYHCKNSIAYLDEAAGNLKKALLIQGSNDVEMRAEGNSRF TYTALKDGCTKHTGKWGKTVIEYRSQKTSRLPIIDIAPMDIGGAEQEFGVDIGPVCFL ; 'Collagen alpha-1(II) chain' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1458 1 1458 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CO2A1_MOUSE P28481 P28481-1 1 1458 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2007-02-06 0D7D97A4DD9E1540 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MIRLGAPQSLVLLTLLIAAVLRCQGQDAQEAGSCLQNGQRYKDKDVWKPSSCRICVCDTGNVLCDDIICE DPDCLNPEIPFGECCPICPADLATASGKLGPKIIGPRGPPGPQGAPGPRGRDGEPGTPGNPGPAGPPGPP GPPGLSAGNFAAQMAGGYDEKAGGAQMGVMQGPMGPMGPRGPPGPAGAPGPQGFQGNPGEPGEPGVSGPM GPRGPPGPAGKPGDDGEAGKPGKSGERGLPGPQGARGFPGTPGLPGVKGHRGYPGLDGAKGEAGAPGVKG ESGSPGENGSPGPMGPRGLPGERGRTGPAGAAGARGNDGQPGPAGPPGPVGPAGGPGFPGAPGAKGEAGP TGARGPEGAQGSRGEPGNPGSPGPAGASGNPGTDGIPGAKGSAGAPGIAGAPGFPGPRGPPGPQGATGPL GPKGQAGEPGIAGFKGDQGPKGETGPAGPQGAPGPAGEEGKRGARGEPGGAGPIGPPGERGAPGNRGFPG QDGLAGPKGAPGERGPSGLTGPKGANGDPGRPGEPGLPGARGLTGRPGDAGPQGKVGPSGAPGEDGRPGP PGPQGARGQPGVMGFPGPKGANGEPGKAGEKGLAGAPGLRGLPGKDGETGAAGPPGPSGPAGERGEQGAP 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GPPGLSAGNFAAQMAGGYDEKAGGAQMGVMQGPMGPMGPRGPPGPAGAPGPQGFQGNPGEPGEPGVSGPM GPRGPPGPAGKPGDDGEAGKPGKSGERGLPGPQGARGFPGTPGLPGVKGHRGYPGLDGAKGEAGAPGVKG ESGSPGENGSPGPMGPRGLPGERGRTGPAGAAGARGNDGQPGPAGPPGPVGPAGGPGFPGAPGAKGEAGP TGARGPEGAQGSRGEPGNPGSPGPAGASGNPGTDGIPGAKGSAGAPGIAGAPGFPGPRGPPGPQGATGPL GPKGQAGEPGIAGFKGDQGPKGETGPAGPQGAPGPAGEEGKRGARGEPGGAGPIGPPGERGAPGNRGFPG QDGLAGPKGAPGERGPSGLTGPKGANGDPGRPGEPGLPGARGLTGRPGDAGPQGKVGPSGAPGEDGRPGP PGPQGARGQPGVMGFPGPKGANGEPGKAGEKGLAGAPGLRGLPGKDGETGAAGPPGPSGPAGERGEQGAP GPSGFQGLPGPPGPPGEGGKQGDQGIPGEAGAPGLVGPRGERGFPGERGSPGAQGLQGPRGLPGTPGTDG PKGAAGPDGPPGAQGPPGLQGMPGERGAAGIAGPKGDRGDVGEKGPEGAPGKDGGRGLTGPIGPPGPAGA NGEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPS GAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPKGVRGDSGPPG RAGDPGLQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQGLAGQRGIVGLPGQRGERGFPGLPGPSGEPGKQGA PGASGDRGPPGPVGPPGLTGPAGEPGREGSPGADGPPGRDGAAGVKGDRGETGALGAPGAPGPPGSPGPA GPTGKQGDRGEAGAQGPMGPSGPAGARGIAGPQGPRGDKGESGEQGERGLKGHRGFTGLQGLPGPPGPSG 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. 1 52 CYS . 1 53 ARG . 1 54 ILE . 1 55 CYS . 1 56 VAL . 1 57 CYS . 1 58 ASP . 1 59 THR . 1 60 GLY . 1 61 ASN . 1 62 VAL . 1 63 LEU . 1 64 CYS . 1 65 ASP . 1 66 ASP . 1 67 ILE . 1 68 ILE . 1 69 CYS . 1 70 GLU . 1 71 ASP . 1 72 PRO . 1 73 ASP . 1 74 CYS . 1 75 LEU . 1 76 ASN . 1 77 PRO . 1 78 GLU . 1 79 ILE . 1 80 PRO . 1 81 PHE . 1 82 GLY . 1 83 GLU . 1 84 CYS . 1 85 CYS . 1 86 PRO . 1 87 ILE . 1 88 CYS . 1 89 PRO . 1 90 ALA . 1 91 ASP . 1 92 LEU . 1 93 ALA . 1 94 THR . 1 95 ALA . 1 96 SER . 1 97 GLY . 1 98 LYS . 1 99 LEU . 1 100 GLY . 1 101 PRO . 1 102 LYS . 1 103 ILE . 1 104 ILE . 1 105 GLY . 1 106 PRO . 1 107 ARG . 1 108 GLY . 1 109 PRO . 1 110 PRO . 1 111 GLY . 1 112 PRO . 1 113 GLN . 1 114 GLY . 1 115 ALA . 1 116 PRO . 1 117 GLY . 1 118 PRO . 1 119 ARG . 1 120 GLY . 1 121 ARG . 1 122 ASP . 1 123 GLY . 1 124 GLU . 1 125 PRO . 1 126 GLY . 1 127 THR . 1 128 PRO . 1 129 GLY . 1 130 ASN . 1 131 PRO . 1 132 GLY . 1 133 PRO . 1 134 ALA . 1 135 GLY . 1 136 PRO . 1 137 PRO . 1 138 GLY . 1 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A 1 1266 SER 1266 ? ? ? A . A 1 1267 GLY 1267 ? ? ? A . A 1 1268 ASP 1268 ? ? ? A . A 1 1269 TYR 1269 ? ? ? A . A 1 1270 TRP 1270 ? ? ? A . A 1 1271 ILE 1271 ? ? ? A . A 1 1272 ASP 1272 ? ? ? A . A 1 1273 PRO 1273 ? ? ? A . A 1 1274 ASN 1274 ? ? ? A . A 1 1275 GLN 1275 ? ? ? A . A 1 1276 GLY 1276 ? ? ? A . A 1 1277 CYS 1277 ? ? ? A . A 1 1278 THR 1278 ? ? ? A . A 1 1279 LEU 1279 ? ? ? A . A 1 1280 ASP 1280 ? ? ? A . A 1 1281 ALA 1281 ? ? ? A . A 1 1282 MET 1282 ? ? ? A . A 1 1283 LYS 1283 ? ? ? A . A 1 1284 VAL 1284 ? ? ? A . A 1 1285 PHE 1285 ? ? ? A . A 1 1286 CYS 1286 ? ? ? A . A 1 1287 ASN 1287 ? ? ? A . A 1 1288 MET 1288 ? ? ? A . A 1 1289 GLU 1289 ? ? ? A . A 1 1290 THR 1290 ? ? ? A . A 1 1291 GLY 1291 ? ? ? A . A 1 1292 GLU 1292 ? ? ? A . A 1 1293 THR 1293 ? ? ? A . A 1 1294 CYS 1294 ? ? ? A . A 1 1295 VAL 1295 ? ? ? A . A 1 1296 TYR 1296 ? ? ? A . A 1 1297 PRO 1297 ? ? ? A . A 1 1298 ASN 1298 ? ? ? A . A 1 1299 PRO 1299 ? ? ? A . A 1 1300 ALA 1300 ? ? ? A . A 1 1301 THR 1301 ? ? ? A . A 1 1302 VAL 1302 ? ? ? A . A 1 1303 PRO 1303 ? ? ? A . A 1 1304 ARG 1304 ? ? ? A . A 1 1305 LYS 1305 ? ? ? A . A 1 1306 ASN 1306 ? ? ? A . A 1 1307 TRP 1307 ? ? ? A . A 1 1308 TRP 1308 ? ? ? A . A 1 1309 SER 1309 ? ? ? A . A 1 1310 SER 1310 ? ? ? A . A 1 1311 LYS 1311 ? ? ? A . A 1 1312 SER 1312 ? ? ? A . A 1 1313 LYS 1313 ? ? ? A . A 1 1314 GLU 1314 ? ? ? A . A 1 1315 LYS 1315 ? ? ? A . A 1 1316 LYS 1316 ? ? ? A . A 1 1317 HIS 1317 ? ? ? A . A 1 1318 ILE 1318 ? ? ? A . A 1 1319 TRP 1319 ? ? ? A . A 1 1320 PHE 1320 ? ? ? A . A 1 1321 GLY 1321 ? ? ? A . A 1 1322 GLU 1322 ? ? ? A . A 1 1323 THR 1323 ? ? ? A . A 1 1324 MET 1324 ? ? ? A . A 1 1325 ASN 1325 ? ? ? A . A 1 1326 GLY 1326 ? ? ? A . A 1 1327 GLY 1327 ? ? ? A . A 1 1328 PHE 1328 ? ? ? A . A 1 1329 HIS 1329 ? ? ? A . A 1 1330 PHE 1330 ? ? ? A . A 1 1331 SER 1331 ? ? ? A . A 1 1332 TYR 1332 ? ? ? A . A 1 1333 GLY 1333 ? ? ? A . A 1 1334 ASP 1334 ? ? ? A . A 1 1335 GLY 1335 ? ? ? A . A 1 1336 ASN 1336 ? ? ? A . A 1 1337 LEU 1337 ? ? ? A . A 1 1338 ALA 1338 ? ? ? A . A 1 1339 PRO 1339 ? ? ? A . A 1 1340 ASN 1340 ? ? ? A . A 1 1341 THR 1341 ? ? ? A . A 1 1342 ALA 1342 ? ? ? A . A 1 1343 ASN 1343 ? ? ? A . A 1 1344 VAL 1344 ? ? ? A . A 1 1345 GLN 1345 ? ? ? A . A 1 1346 MET 1346 ? ? ? A . A 1 1347 THR 1347 ? ? ? A . A 1 1348 PHE 1348 ? ? ? A . A 1 1349 LEU 1349 ? ? ? A . A 1 1350 ARG 1350 ? ? ? A . A 1 1351 LEU 1351 ? ? ? A . A 1 1352 LEU 1352 ? ? ? A . A 1 1353 SER 1353 ? ? ? A . A 1 1354 THR 1354 ? ? ? A . A 1 1355 GLU 1355 ? ? ? A . A 1 1356 GLY 1356 ? ? ? A . A 1 1357 SER 1357 ? ? ? A . A 1 1358 GLN 1358 ? ? ? A . A 1 1359 ASN 1359 ? ? ? A . A 1 1360 ILE 1360 ? ? ? A . A 1 1361 THR 1361 ? ? ? A . A 1 1362 TYR 1362 ? ? ? A . A 1 1363 HIS 1363 ? ? ? A . A 1 1364 CYS 1364 ? ? ? A . A 1 1365 LYS 1365 ? ? ? A . A 1 1366 ASN 1366 ? ? ? A . A 1 1367 SER 1367 ? ? ? A . A 1 1368 ILE 1368 ? ? ? A . A 1 1369 ALA 1369 ? ? ? A . A 1 1370 TYR 1370 ? ? ? A . A 1 1371 LEU 1371 ? ? ? A . A 1 1372 ASP 1372 ? ? ? A . A 1 1373 GLU 1373 ? ? ? A . A 1 1374 ALA 1374 ? ? ? A . A 1 1375 ALA 1375 ? ? ? A . A 1 1376 GLY 1376 ? ? ? A . A 1 1377 ASN 1377 ? ? ? A . A 1 1378 LEU 1378 ? ? ? A . A 1 1379 LYS 1379 ? ? ? A . A 1 1380 LYS 1380 ? ? ? A . A 1 1381 ALA 1381 ? ? ? A . A 1 1382 LEU 1382 ? ? ? A . A 1 1383 LEU 1383 ? ? ? A . A 1 1384 ILE 1384 ? ? ? A . A 1 1385 GLN 1385 ? ? ? A . A 1 1386 GLY 1386 ? ? ? A . A 1 1387 SER 1387 ? ? ? A . A 1 1388 ASN 1388 ? ? ? A . A 1 1389 ASP 1389 ? ? ? A . A 1 1390 VAL 1390 ? ? ? A . A 1 1391 GLU 1391 ? ? ? A . A 1 1392 MET 1392 ? ? ? A . A 1 1393 ARG 1393 ? ? ? A . A 1 1394 ALA 1394 ? ? ? A . A 1 1395 GLU 1395 ? ? ? A . A 1 1396 GLY 1396 ? ? ? A . A 1 1397 ASN 1397 ? ? ? A . A 1 1398 SER 1398 ? ? ? A . A 1 1399 ARG 1399 ? ? ? A . A 1 1400 PHE 1400 ? ? ? A . A 1 1401 THR 1401 ? ? ? A . A 1 1402 TYR 1402 ? ? ? A . A 1 1403 THR 1403 ? ? ? A . A 1 1404 ALA 1404 ? ? ? A . A 1 1405 LEU 1405 ? ? ? A . A 1 1406 LYS 1406 ? ? ? A . A 1 1407 ASP 1407 ? ? ? A . A 1 1408 GLY 1408 ? ? ? A . A 1 1409 CYS 1409 ? ? ? A . A 1 1410 THR 1410 ? ? ? A . A 1 1411 LYS 1411 ? ? ? A . A 1 1412 HIS 1412 ? ? ? A . A 1 1413 THR 1413 ? ? ? A . A 1 1414 GLY 1414 ? ? ? A . A 1 1415 LYS 1415 ? ? ? A . A 1 1416 TRP 1416 ? ? ? A . A 1 1417 GLY 1417 ? ? ? A . A 1 1418 LYS 1418 ? ? ? A . A 1 1419 THR 1419 ? ? ? A . A 1 1420 VAL 1420 ? ? ? A . A 1 1421 ILE 1421 ? ? ? A . A 1 1422 GLU 1422 ? ? ? A . A 1 1423 TYR 1423 ? ? ? A . A 1 1424 ARG 1424 ? ? ? A . A 1 1425 SER 1425 ? ? ? A . A 1 1426 GLN 1426 ? ? ? A . A 1 1427 LYS 1427 ? ? ? A . A 1 1428 THR 1428 ? ? ? A . A 1 1429 SER 1429 ? ? ? A . A 1 1430 ARG 1430 ? ? ? A . A 1 1431 LEU 1431 ? ? ? A . A 1 1432 PRO 1432 ? ? ? A . A 1 1433 ILE 1433 ? ? ? A . A 1 1434 ILE 1434 ? ? ? A . A 1 1435 ASP 1435 ? ? ? A . A 1 1436 ILE 1436 ? ? ? A . A 1 1437 ALA 1437 ? ? ? A . A 1 1438 PRO 1438 ? ? ? A . A 1 1439 MET 1439 ? ? ? A . A 1 1440 ASP 1440 ? ? ? A . A 1 1441 ILE 1441 ? ? ? A . A 1 1442 GLY 1442 ? ? ? A . A 1 1443 GLY 1443 ? ? ? A . A 1 1444 ALA 1444 ? ? ? A . A 1 1445 GLU 1445 ? ? ? A . A 1 1446 GLN 1446 ? ? ? A . A 1 1447 GLU 1447 ? ? ? A . A 1 1448 PHE 1448 ? ? ? A . A 1 1449 GLY 1449 ? ? ? A . A 1 1450 VAL 1450 ? ? ? A . A 1 1451 ASP 1451 ? ? ? A . A 1 1452 ILE 1452 ? ? ? A . A 1 1453 GLY 1453 ? ? ? A . A 1 1454 PRO 1454 ? ? ? A . A 1 1455 VAL 1455 ? ? ? A . A 1 1456 CYS 1456 ? ? ? A . A 1 1457 PHE 1457 ? ? ? A . A 1 1458 LEU 1458 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Collagen alpha-1(II) chain {PDB ID=5nir, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=5nir.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 5nir, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSMAQEAGSCVQDGQRYNDKDVWKPEPCRICVCDTGTVLCDDIICEDVKDCLSPEIPFGECCPICPTDLA TASG ; ;GSMAQEAGSCVQDGQRYNDKDVWKPEPCRICVCDTGTVLCDDIICEDVKDCLSPEIPFGECCPICPTDLA TASG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 5 73 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5nir 2024-11-06 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1458 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1459 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 4.29e-33 86.765 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MIRLGAPQSLVLLTLLIAAVLRCQGQDAQEAGSCLQNGQRYKDKDVWKPSSCRICVCDTGNVLCDDIICED-PDCLNPEIPFGECCPICPADLATASGKLGPKIIGPRGPPGPQGAPGPRGRDGEPGTPGNPGPAGPPGPPGPPGLSAGNFAAQMAGGYDEKAGGAQMGVMQGPMGPMGPRGPPGPAGAPGPQGFQGNPGEPGEPGVSGPMGPRGPPGPAGKPGDDGEAGKPGKSGERGLPGPQGARGFPGTPGLPGVKGHRGYPGLDGAKGEAGAPGVKGESGSPGENGSPGPMGPRGLPGERGRTGPAGAAGARGNDGQPGPAGPPGPVGPAGGPGFPGAPGAKGEAGPTGARGPEGAQGSRGEPGNPGSPGPAGASGNPGTDGIPGAKGSAGAPGIAGAPGFPGPRGPPGPQGATGPLGPKGQAGEPGIAGFKGDQGPKGETGPAGPQGAPGPAGEEGKRGARGEPGGAGPIGPPGERGAPGNRGFPGQDGLAGPKGAPGERGPSGLTGPKGANGDPGRPGEPGLPGARGLTGRPGDAGPQGKVGPSGAPGEDGRPGPPGPQGARGQPGVMGFPGPKGANGEPGKAGEKGLAGAPGLRGLPGKDGETGAAGPPGPSGPAGERGEQGAPGPSGFQGLPGPPGPPGEGGKQGDQGIPGEAGAPGLVGPRGERGFPGERGSPGAQGLQGPRGLPGTPGTDGPKGAAGPDGPPGAQGPPGLQGMPGERGAAGIAGPKGDRGDVGEKGPEGAPGKDGGRGLTGPIGPPGPAGANGEKGEVGPPGPSGSTGARGAPGERGETGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGDQGEAGQKGDAGAPGPQGPSGAPGPQGPTGVTGPKGARGAQGPPGATGFPGAAGRVGPPGANGNPGPAGPPGPAGKDGPKGVRGDSGPPGRAGDPGLQGPAGAPGEKGEPGDDGPSGLDGPPGPQGLAGQRGIVGLPGQRGERGFPGLPGPSGEPGKQGAPGASGDRGPPGPVGPPGLTGPAGEPGREGSPGADGPPGRDGAAGVKGDRGETGALGAPGAPGPPGSPGPAGPTGKQGDRGEAGAQGPMGPSGPAGARGIAGPQGPRGDKGESGEQGERGLKGHRGFTGLQGLPGPPGPSGDQGASGPAGPSGPRGPPGPVGPSGKDGSNGIPGPIGPPGPRGRSGETGPVGPPGSPGPPGPPGPPGPGIDMSAFAGLGQREKGPDPMQYMRADEADSTLRQHDVEVDATLKSLNNQIESIRSPDGSRKNPARTCQDLKLCHPEWKSGDYWIDPNQGCTLDAMKVFCNMETGETCVYPNPATVPRKNWWSSKSKEKKHIWFGETMNGGFHFSYGDGNLAPNTANVQMTFLRLLSTEGSQNITYHCKNSIAYLDEAAGNLKKALLIQGSNDVEMRAEGNSRFTYTALKDGCTKHTGKWGKTVIEYRSQKTSRLPIIDIAPMDIGGAEQEFGVDIGPVCFL 2 1 2 ----------------------------QEAGSCVQDGQRYNDKDVWKPEPCRICVCDTGTVLCDDIICEDVKDCLSPEIPFGECCPICPTDLATAS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5nir.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 30 30 ? A -5.297 2.911 7.056 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 2 C CA . GLU 30 30 ? A -6.621 3.555 6.986 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 3 C C . GLU 30 30 ? A -6.466 5.054 6.806 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 4 O O . GLU 30 30 ? A -5.377 5.563 7.061 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 5 C CB . GLU 30 30 ? A -7.378 3.210 8.308 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 6 C CG . GLU 30 30 ? A -8.870 3.595 8.317 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 7 C CD . GLU 30 30 ? A -9.434 3.042 7.018 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 30 30 ? A -9.283 3.734 5.975 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 30 30 ? A -9.823 1.856 7.049 1 1 A GLU 0.390 1 ATOM 10 N N . ALA 31 31 ? A -7.502 5.780 6.362 1 1 A ALA 0.450 1 ATOM 11 C CA . ALA 31 31 ? A -7.554 7.226 6.304 1 1 A ALA 0.450 1 ATOM 12 C C . ALA 31 31 ? A -7.244 7.915 7.645 1 1 A ALA 0.450 1 ATOM 13 O O . ALA 31 31 ? A -7.766 7.540 8.691 1 1 A ALA 0.450 1 ATOM 14 C CB . ALA 31 31 ? A -8.951 7.613 5.782 1 1 A ALA 0.450 1 ATOM 15 N N . GLY 32 32 ? A -6.317 8.908 7.649 1 1 A GLY 0.620 1 ATOM 16 C CA . GLY 32 32 ? A -5.939 9.685 8.836 1 1 A GLY 0.620 1 ATOM 17 C C . GLY 32 32 ? A -4.991 8.990 9.785 1 1 A GLY 0.620 1 ATOM 18 O O . GLY 32 32 ? A -4.600 9.541 10.806 1 1 A GLY 0.620 1 ATOM 19 N N . SER 33 33 ? A -4.574 7.749 9.478 1 1 A SER 0.650 1 ATOM 20 C CA . SER 33 33 ? A -3.661 6.996 10.327 1 1 A SER 0.650 1 ATOM 21 C C . SER 33 33 ? A -2.243 7.528 10.383 1 1 A SER 0.650 1 ATOM 22 O O . SER 33 33 ? A -1.716 8.070 9.415 1 1 A SER 0.650 1 ATOM 23 C CB . SER 33 33 ? A -3.635 5.474 10.024 1 1 A SER 0.650 1 ATOM 24 O OG . SER 33 33 ? A -2.917 5.126 8.841 1 1 A SER 0.650 1 ATOM 25 N N . CYS 34 34 ? A -1.576 7.350 11.535 1 1 A CYS 0.690 1 ATOM 26 C CA . CYS 34 34 ? A -0.266 7.913 11.787 1 1 A CYS 0.690 1 ATOM 27 C C . CYS 34 34 ? A 0.767 6.805 11.769 1 1 A CYS 0.690 1 ATOM 28 O O . CYS 34 34 ? A 0.437 5.642 11.977 1 1 A CYS 0.690 1 ATOM 29 C CB . CYS 34 34 ? A -0.198 8.617 13.161 1 1 A CYS 0.690 1 ATOM 30 S SG . CYS 34 34 ? A -1.402 9.967 13.332 1 1 A CYS 0.690 1 ATOM 31 N N . LEU 35 35 ? A 2.051 7.126 11.522 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 32 C CA . LEU 35 35 ? A 3.134 6.162 11.608 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 33 C C . LEU 35 35 ? A 4.186 6.729 12.545 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 34 O O . LEU 35 35 ? A 4.642 7.851 12.343 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 35 C CB . LEU 35 35 ? A 3.772 5.927 10.210 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 36 C CG . LEU 35 35 ? A 4.992 4.976 10.143 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 37 C CD1 . LEU 35 35 ? A 4.618 3.508 10.357 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 38 C CD2 . LEU 35 35 ? A 5.744 5.098 8.809 1 1 A LEU 0.640 1 ATOM 39 N N . GLN 36 36 ? A 4.603 5.989 13.592 1 1 A GLN 0.630 1 ATOM 40 C CA . GLN 36 36 ? A 5.670 6.449 14.465 1 1 A GLN 0.630 1 ATOM 41 C C . GLN 36 36 ? A 6.487 5.255 14.920 1 1 A GLN 0.630 1 ATOM 42 O O . GLN 36 36 ? A 5.932 4.247 15.349 1 1 A GLN 0.630 1 ATOM 43 C CB . GLN 36 36 ? A 5.091 7.199 15.690 1 1 A GLN 0.630 1 ATOM 44 C CG . GLN 36 36 ? A 6.086 8.024 16.540 1 1 A GLN 0.630 1 ATOM 45 C CD . GLN 36 36 ? A 6.734 9.124 15.700 1 1 A GLN 0.630 1 ATOM 46 O OE1 . GLN 36 36 ? A 6.052 9.915 15.066 1 1 A GLN 0.630 1 ATOM 47 N NE2 . GLN 36 36 ? A 8.089 9.201 15.708 1 1 A GLN 0.630 1 ATOM 48 N N . ASN 37 37 ? A 7.836 5.307 14.807 1 1 A ASN 0.610 1 ATOM 49 C CA . ASN 37 37 ? A 8.742 4.226 15.204 1 1 A ASN 0.610 1 ATOM 50 C C . ASN 37 37 ? A 8.402 2.842 14.641 1 1 A ASN 0.610 1 ATOM 51 O O . ASN 37 37 ? A 8.496 1.827 15.324 1 1 A ASN 0.610 1 ATOM 52 C CB . ASN 37 37 ? A 8.930 4.149 16.739 1 1 A ASN 0.610 1 ATOM 53 C CG . ASN 37 37 ? A 9.500 5.473 17.216 1 1 A ASN 0.610 1 ATOM 54 O OD1 . ASN 37 37 ? A 10.317 6.093 16.545 1 1 A ASN 0.610 1 ATOM 55 N ND2 . ASN 37 37 ? A 9.059 5.951 18.404 1 1 A ASN 0.610 1 ATOM 56 N N . GLY 38 38 ? A 8.002 2.786 13.354 1 1 A GLY 0.570 1 ATOM 57 C CA . GLY 38 38 ? A 7.623 1.549 12.676 1 1 A GLY 0.570 1 ATOM 58 C C . GLY 38 38 ? A 6.221 1.041 12.944 1 1 A GLY 0.570 1 ATOM 59 O O . GLY 38 38 ? A 5.823 0.027 12.382 1 1 A GLY 0.570 1 ATOM 60 N N . GLN 39 39 ? A 5.414 1.743 13.767 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 61 C CA . GLN 39 39 ? A 4.069 1.316 14.119 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 62 C C . GLN 39 39 ? A 3.024 2.255 13.585 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 63 O O . GLN 39 39 ? A 3.167 3.473 13.623 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 64 C CB . GLN 39 39 ? A 3.823 1.290 15.641 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 65 C CG . GLN 39 39 ? A 4.738 0.317 16.397 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 66 C CD . GLN 39 39 ? A 4.264 0.189 17.844 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 67 O OE1 . GLN 39 39 ? A 3.094 0.320 18.176 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 68 N NE2 . GLN 39 39 ? A 5.220 -0.086 18.765 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 69 N N . ARG 40 40 ? A 1.922 1.685 13.075 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 70 C CA . ARG 40 40 ? A 0.815 2.442 12.546 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 71 C C . ARG 40 40 ? A -0.300 2.504 13.562 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 72 O O . ARG 40 40 ? A -0.730 1.487 14.096 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 73 C CB . ARG 40 40 ? A 0.276 1.827 11.234 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 74 C CG . ARG 40 40 ? A -0.825 2.680 10.571 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 75 C CD . ARG 40 40 ? A -1.282 2.196 9.197 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 76 N NE . ARG 40 40 ? A -0.162 2.363 8.215 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 77 C CZ . ARG 40 40 ? A 0.242 3.486 7.600 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 78 N NH1 . ARG 40 40 ? A -0.293 4.689 7.775 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 79 N NH2 . ARG 40 40 ? A 1.256 3.402 6.737 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 80 N N . TYR 41 41 ? A -0.795 3.721 13.815 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 81 C CA . TYR 41 41 ? A -1.824 3.998 14.792 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 82 C C . TYR 41 41 ? A -3.028 4.466 14.011 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 83 O O . TYR 41 41 ? A -2.882 5.182 13.026 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 84 C CB . TYR 41 41 ? A -1.404 5.116 15.779 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 85 C CG . TYR 41 41 ? A -0.145 4.733 16.496 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 86 C CD1 . TYR 41 41 ? A 1.117 5.028 15.955 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 87 C CD2 . TYR 41 41 ? A -0.217 4.031 17.707 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 88 C CE1 . TYR 41 41 ? A 2.284 4.632 16.620 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 89 C CE2 . TYR 41 41 ? A 0.951 3.658 18.383 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 90 C CZ . TYR 41 41 ? A 2.202 3.979 17.851 1 1 A TYR 0.620 1 ATOM 91 O OH . TYR 41 41 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.599 2 1 3 0.018 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 30 GLU 1 0.390 2 1 A 31 ALA 1 0.450 3 1 A 32 GLY 1 0.620 4 1 A 33 SER 1 0.650 5 1 A 34 CYS 1 0.690 6 1 A 35 LEU 1 0.640 7 1 A 36 GLN 1 0.630 8 1 A 37 ASN 1 0.610 9 1 A 38 GLY 1 0.570 10 1 A 39 GLN 1 0.640 11 1 A 40 ARG 1 0.590 12 1 A 41 TYR 1 0.620 13 1 A 42 LYS 1 0.650 14 1 A 43 ASP 1 0.600 15 1 A 44 LYS 1 0.650 16 1 A 45 ASP 1 0.640 17 1 A 46 VAL 1 0.700 18 1 A 47 TRP 1 0.490 19 1 A 48 LYS 1 0.600 20 1 A 49 PRO 1 0.670 21 1 A 50 SER 1 0.670 22 1 A 51 SER 1 0.660 23 1 A 52 CYS 1 0.650 24 1 A 53 ARG 1 0.640 25 1 A 54 ILE 1 0.700 26 1 A 55 CYS 1 0.760 27 1 A 56 VAL 1 0.760 28 1 A 57 CYS 1 0.760 29 1 A 58 ASP 1 0.660 30 1 A 59 THR 1 0.650 31 1 A 60 GLY 1 0.650 32 1 A 61 ASN 1 0.680 33 1 A 62 VAL 1 0.740 34 1 A 63 LEU 1 0.760 35 1 A 64 CYS 1 0.780 36 1 A 65 ASP 1 0.700 37 1 A 66 ASP 1 0.630 38 1 A 67 ILE 1 0.640 39 1 A 68 ILE 1 0.530 40 1 A 69 CYS 1 0.590 41 1 A 70 GLU 1 0.560 42 1 A 71 ASP 1 0.480 43 1 A 72 PRO 1 0.350 44 1 A 73 ASP 1 0.580 45 1 A 74 CYS 1 0.560 46 1 A 75 LEU 1 0.520 47 1 A 76 ASN 1 0.640 48 1 A 77 PRO 1 0.660 49 1 A 78 GLU 1 0.650 50 1 A 79 ILE 1 0.620 51 1 A 80 PRO 1 0.550 52 1 A 81 PHE 1 0.480 53 1 A 82 GLY 1 0.530 54 1 A 83 GLU 1 0.600 55 1 A 84 CYS 1 0.650 56 1 A 85 CYS 1 0.640 57 1 A 86 PRO 1 0.630 58 1 A 87 ILE 1 0.640 59 1 A 88 CYS 1 0.600 60 1 A 89 PRO 1 0.540 61 1 A 90 ALA 1 0.550 62 1 A 91 ASP 1 0.440 63 1 A 92 LEU 1 0.330 64 1 A 93 ALA 1 0.380 65 1 A 94 THR 1 0.380 66 1 A 95 ALA 1 0.500 67 1 A 96 SER 1 0.340 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #