data_SMR-44933a61d37d31f493b7d97814302f9c_3 _entry.id SMR-44933a61d37d31f493b7d97814302f9c_3 _struct.entry_id SMR-44933a61d37d31f493b7d97814302f9c_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9QX74/ SHAN2_RAT, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2 Estimated model accuracy of this model is 0.029, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9QX74' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 185418.779 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SHAN2_RAT Q9QX74 1 ;MKSLLNAFTKKEVPFREAPAYSNRRRRPPNTLAAPRVLLRSNSDNNLNAGAPEWAVCSAATSHRSLSPQL LQQTPSKPDGATKSLGSYAPGPRSRSPSLNRLGGAGEDGKRPQPPHWHVGSPFTPGANKDSLSTFEYPGP RRKLYSAVPGRLFVAIKPYQPQVDGEIPLHRGDRVKVLSIGEGGFWEGSARGHIGWFPAECVEEVQCKPR DSQAETRADRSKKLFRHYTVGSYDSFDAASDCIIEDKTVVLQKKDNEGFGFVLRGAKADTPIEEFTPTPA FPALQYLESVDEGGVAWQAGLRTGDFLIEVNNENVVKVGHRQVVNMIRQGGNHLVLKVVTVTRNLDPDDT ARKKAPPPPKRAPTTALTLRSKSMTAELEELGLSLVDKASVRKKKDKPEEIVPASKPSRTAENVAIESRV ATIKQRPTSRCFPAASDVNSVYERQGIAVMTPTVPGSPKGPFLGLPRGTMRRQKSIDSRIFLSGITEEER QFLAPPMLKFTRSLSMPDTSEDIPPPPQSVPPSPPPPSPTTYNCPRSPTPRVYGTIKPAFNQNPVAKVPP ATRSDTVATMMREKGMFYRRELDRFSLDSEDVYSRSPAPQAAFRTKRGQMPENPYSEVGKIASKAVYVPA KPARRKGMLVKQSNVEDSPEKTCSIPIPTIIVKEPSTSSSGKSSQGSSMEIDPQATEPGQLRPDDSLTVS SPFAAAIAGAVRDREKRLEARRNSPAFLSTDLGDEDVGLGPPAPRMQPSKFPEEGGFGDEDETEQPLLPT PGAAPRELENHFLGGGEAGAQGEAGGPLSSTSKAKGPESGPAAALKSSSPASPENYVHPLTGRLLDPSSP LALALSARDRAMQESQQGHKGEAPKADLNKPLYIDTKMRPSVESGFPPVTRQNTRGPLRRQETENKYETD LSKDRRADDKKNMLINIVDTAQQKSAGLLMVHTVDIPVAGPPLEEEEDREDGDTKPDHSPSTVPEGVPKT EGALQISAAPEPAAAPGRTIVAAGSVEEAVILPFRIPPPPLASVDLDEDFLFTEPLPPPLEFANSFDIPD DRAASVPALADLVKQKKSDTPQPPSLNSSQPANSTDSKKPAGISNCLPSSFLPPPESFDAVTDSGIEEVD SRSSSDHHLETTSTISTVSSISTLSSEGGESMDTCTVYADGQAFVVDKPPVPPKPKMKPIVHKSNALYQD TLPEEDTDGFVIPPPAPPPPPGSAQAGVAKVIQPRTSKLWGDVTEVKSPILSGPKANVISELNSILQQMN RGKSVKPGEGLELPVGAKSANLAPRSPEVMSTVSGTRSTTVTFTVRPGTSQPITLQSRPPDYESRTSGPR RAPSPVVSPTELSKEILPTPPSAAAASPSPTLSDVFSLPSQSPAGDLFGLNPAGRSRSPSPSILQQPISN KPFTTKPVHLWTKPDVADWLESLNLGEHKETFMDNEIDGSHLPNLQKEDLIDLGVTRVGHRMNIERALKQ LLDR ; 'SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1474 1 1474 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . SHAN2_RAT Q9QX74 . 1 1474 10116 'Rattus norvegicus (Rat)' 2002-07-26 F503D44D0D9AB7C1 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MKSLLNAFTKKEVPFREAPAYSNRRRRPPNTLAAPRVLLRSNSDNNLNAGAPEWAVCSAATSHRSLSPQL LQQTPSKPDGATKSLGSYAPGPRSRSPSLNRLGGAGEDGKRPQPPHWHVGSPFTPGANKDSLSTFEYPGP RRKLYSAVPGRLFVAIKPYQPQVDGEIPLHRGDRVKVLSIGEGGFWEGSARGHIGWFPAECVEEVQCKPR DSQAETRADRSKKLFRHYTVGSYDSFDAASDCIIEDKTVVLQKKDNEGFGFVLRGAKADTPIEEFTPTPA FPALQYLESVDEGGVAWQAGLRTGDFLIEVNNENVVKVGHRQVVNMIRQGGNHLVLKVVTVTRNLDPDDT ARKKAPPPPKRAPTTALTLRSKSMTAELEELGLSLVDKASVRKKKDKPEEIVPASKPSRTAENVAIESRV ATIKQRPTSRCFPAASDVNSVYERQGIAVMTPTVPGSPKGPFLGLPRGTMRRQKSIDSRIFLSGITEEER QFLAPPMLKFTRSLSMPDTSEDIPPPPQSVPPSPPPPSPTTYNCPRSPTPRVYGTIKPAFNQNPVAKVPP ATRSDTVATMMREKGMFYRRELDRFSLDSEDVYSRSPAPQAAFRTKRGQMPENPYSEVGKIASKAVYVPA KPARRKGMLVKQSNVEDSPEKTCSIPIPTIIVKEPSTSSSGKSSQGSSMEIDPQATEPGQLRPDDSLTVS SPFAAAIAGAVRDREKRLEARRNSPAFLSTDLGDEDVGLGPPAPRMQPSKFPEEGGFGDEDETEQPLLPT PGAAPRELENHFLGGGEAGAQGEAGGPLSSTSKAKGPESGPAAALKSSSPASPENYVHPLTGRLLDPSSP LALALSARDRAMQESQQGHKGEAPKADLNKPLYIDTKMRPSVESGFPPVTRQNTRGPLRRQETENKYETD LSKDRRADDKKNMLINIVDTAQQKSAGLLMVHTVDIPVAGPPLEEEEDREDGDTKPDHSPSTVPEGVPKT EGALQISAAPEPAAAPGRTIVAAGSVEEAVILPFRIPPPPLASVDLDEDFLFTEPLPPPLEFANSFDIPD DRAASVPALADLVKQKKSDTPQPPSLNSSQPANSTDSKKPAGISNCLPSSFLPPPESFDAVTDSGIEEVD SRSSSDHHLETTSTISTVSSISTLSSEGGESMDTCTVYADGQAFVVDKPPVPPKPKMKPIVHKSNALYQD TLPEEDTDGFVIPPPAPPPPPGSAQAGVAKVIQPRTSKLWGDVTEVKSPILSGPKANVISELNSILQQMN RGKSVKPGEGLELPVGAKSANLAPRSPEVMSTVSGTRSTTVTFTVRPGTSQPITLQSRPPDYESRTSGPR RAPSPVVSPTELSKEILPTPPSAAAASPSPTLSDVFSLPSQSPAGDLFGLNPAGRSRSPSPSILQQPISN KPFTTKPVHLWTKPDVADWLESLNLGEHKETFMDNEIDGSHLPNLQKEDLIDLGVTRVGHRMNIERALKQ LLDR ; ;MKSLLNAFTKKEVPFREAPAYSNRRRRPPNTLAAPRVLLRSNSDNNLNAGAPEWAVCSAATSHRSLSPQL LQQTPSKPDGATKSLGSYAPGPRSRSPSLNRLGGAGEDGKRPQPPHWHVGSPFTPGANKDSLSTFEYPGP RRKLYSAVPGRLFVAIKPYQPQVDGEIPLHRGDRVKVLSIGEGGFWEGSARGHIGWFPAECVEEVQCKPR DSQAETRADRSKKLFRHYTVGSYDSFDAASDCIIEDKTVVLQKKDNEGFGFVLRGAKADTPIEEFTPTPA FPALQYLESVDEGGVAWQAGLRTGDFLIEVNNENVVKVGHRQVVNMIRQGGNHLVLKVVTVTRNLDPDDT ARKKAPPPPKRAPTTALTLRSKSMTAELEELGLSLVDKASVRKKKDKPEEIVPASKPSRTAENVAIESRV ATIKQRPTSRCFPAASDVNSVYERQGIAVMTPTVPGSPKGPFLGLPRGTMRRQKSIDSRIFLSGITEEER QFLAPPMLKFTRSLSMPDTSEDIPPPPQSVPPSPPPPSPTTYNCPRSPTPRVYGTIKPAFNQNPVAKVPP ATRSDTVATMMREKGMFYRRELDRFSLDSEDVYSRSPAPQAAFRTKRGQMPENPYSEVGKIASKAVYVPA KPARRKGMLVKQSNVEDSPEKTCSIPIPTIIVKEPSTSSSGKSSQGSSMEIDPQATEPGQLRPDDSLTVS SPFAAAIAGAVRDREKRLEARRNSPAFLSTDLGDEDVGLGPPAPRMQPSKFPEEGGFGDEDETEQPLLPT PGAAPRELENHFLGGGEAGAQGEAGGPLSSTSKAKGPESGPAAALKSSSPASPENYVHPLTGRLLDPSSP LALALSARDRAMQESQQGHKGEAPKADLNKPLYIDTKMRPSVESGFPPVTRQNTRGPLRRQETENKYETD LSKDRRADDKKNMLINIVDTAQQKSAGLLMVHTVDIPVAGPPLEEEEDREDGDTKPDHSPSTVPEGVPKT EGALQISAAPEPAAAPGRTIVAAGSVEEAVILPFRIPPPPLASVDLDEDFLFTEPLPPPLEFANSFDIPD 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2 {PDB ID=6cpj, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=6cpj.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6cpj, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 MVPGRLFVAIKPYQPQVDGEIPLHRGDRVKVLSIGEGGFWEGSARGHIGWFPAECVEEVQS MVPGRLFVAIKPYQPQVDGEIPLHRGDRVKVLSIGEGGFWEGSARGHIGWFPAECVEEVQS # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 3 59 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6cpj 2024-05-01 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1474 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1474 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.00031 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MKSLLNAFTKKEVPFREAPAYSNRRRRPPNTLAAPRVLLRSNSDNNLNAGAPEWAVCSAATSHRSLSPQLLQQTPSKPDGATKSLGSYAPGPRSRSPSLNRLGGAGEDGKRPQPPHWHVGSPFTPGANKDSLSTFEYPGPRRKLYSAVPGRLFVAIKPYQPQVDGEIPLHRGDRVKVLSIGEGGFWEGSARGHIGWFPAECVEEVQCKPRDSQAETRADRSKKLFRHYTVGSYDSFDAASDCIIEDKTVVLQKKDNEGFGFVLRGAKADTPIEEFTPTPAFPALQYLESVDEGGVAWQAGLRTGDFLIEVNNENVVKVGHRQVVNMIRQGGNHLVLKVVTVTRNLDPDDTARKKAPPPPKRAPTTALTLRSKSMTAELEELGLSLVDKASVRKKKDKPEEIVPASKPSRTAENVAIESRVATIKQRPTSRCFPAASDVNSVYERQGIAVMTPTVPGSPKGPFLGLPRGTMRRQKSIDSRIFLSGITEEERQFLAPPMLKFTRSLSMPDTSEDIPPPPQSVPPSPPPPSPTTYNCPRSPTPRVYGTIKPAFNQNPVAKVPPATRSDTVATMMREKGMFYRRELDRFSLDSEDVYSRSPAPQAAFRTKRGQMPENPYSEVGKIASKAVYVPAKPARRKGMLVKQSNVEDSPEKTCSIPIPTIIVKEPSTSSSGKSSQGSSMEIDPQATEPGQLRPDDSLTVSSPFAAAIAGAVRDREKRLEARRNSPAFLSTDLGDEDVGLGPPAPRMQPSKFPEEGGFGDEDETEQPLLPTPGAAPRELENHFLGGGEAGAQGEAGGPLSSTSKAKGPESGPAAALKSSSPASPENYVHPLTGRLLDPSSPLALALSARDRAMQESQQGHKGEAPKADLNKPLYIDTKMRPSVESGFPPVTRQNTRGPLRRQETENKYETDLSKDRRADDKKNMLINIVDTAQQKSAGLLMVHTVDIPVAGPPLEEEEDREDGDTKPDHSPSTVPEGVPKTEGALQISAAPEPAAAPGRTIVAAGSVEEAVILPFRIPPPPLASVDLDEDFLFTEPLPPPLEFANSFDIPDDRAASVPALADLVKQKKSDTPQPPSLNSSQPANSTDSKKPAGISNCLPSSFLPPPESFDAVTDSGIEEVDSRSSSDHHLETTSTISTVSSISTLSSEGGESMDTCTVYADGQAFVVDKPPVPPKPKMKPIVHKSNALYQDTLPEEDTDGFVIPPPAPPPPPGSAQAGVAKVIQPRTSKLWGDVTEVKSPILSGPKANVISELNSILQQMNRGKSVKPGEGLELPVGAKSANLAPRSPEVMSTVSGTRSTTVTFTVRPGTSQPITLQSRPPDYESRTSGPRRAPSPVVSPTELSKEILPTPPSAAAASPSPTLSDVFSLPSQSPAGDLFGLNPAGRSRSPSPSILQQPISNKPFTTKPVHLWTKPDVADWLESLNLGEHKETFMDNEIDGSHLPNLQKEDLIDLGVTRVGHRMNIERALKQLLDR 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PGRLFVAIKPYQPQVDGEIPLHRGDRVKVLSIGEGGFWEGSARGHIGWFPAECVEEV--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6cpj.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PRO 149 149 ? A 3.604 -4.528 -12.105 1 1 A PRO 0.550 1 ATOM 2 C CA . PRO 149 149 ? A 3.094 -3.658 -10.981 1 1 A PRO 0.550 1 ATOM 3 C C . PRO 149 149 ? A 2.702 -2.320 -11.576 1 1 A PRO 0.550 1 ATOM 4 O O . PRO 149 149 ? A 2.684 -2.219 -12.801 1 1 A PRO 0.550 1 ATOM 5 C CB . PRO 149 149 ? A 4.315 -3.594 -10.074 1 1 A PRO 0.550 1 ATOM 6 C CG . PRO 149 149 ? A 5.529 -3.652 -11.003 1 1 A PRO 0.550 1 ATOM 7 C CD . PRO 149 149 ? A 5.119 -4.602 -12.106 1 1 A PRO 0.550 1 ATOM 8 N N . GLY 150 150 ? A 2.385 -1.328 -10.707 1 1 A GLY 0.620 1 ATOM 9 C CA . GLY 150 150 ? A 1.929 0.029 -11.026 1 1 A GLY 0.620 1 ATOM 10 C C . GLY 150 150 ? A 0.433 0.164 -11.178 1 1 A GLY 0.620 1 ATOM 11 O O . GLY 150 150 ? A -0.089 1.202 -11.565 1 1 A GLY 0.620 1 ATOM 12 N N . ARG 151 151 ? A -0.295 -0.918 -10.858 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 13 C CA . ARG 151 151 ? A -1.740 -1.002 -10.865 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 14 C C . ARG 151 151 ? A -2.362 -0.596 -9.541 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 15 O O . ARG 151 151 ? A -1.688 -0.325 -8.547 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 16 C CB . ARG 151 151 ? A -2.202 -2.432 -11.243 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 17 C CG . ARG 151 151 ? A -1.958 -2.809 -12.717 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 18 C CD . ARG 151 151 ? A -2.881 -2.042 -13.676 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 19 N NE . ARG 151 151 ? A -3.043 -2.832 -14.940 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 20 C CZ . ARG 151 151 ? A -3.801 -3.935 -15.048 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 21 N NH1 . ARG 151 151 ? A -4.428 -4.478 -14.009 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 22 N NH2 . ARG 151 151 ? A -3.898 -4.544 -16.228 1 1 A ARG 0.320 1 ATOM 23 N N . LEU 152 152 ? A -3.706 -0.521 -9.535 1 1 A LEU 0.490 1 ATOM 24 C CA . LEU 152 152 ? A -4.476 -0.019 -8.428 1 1 A LEU 0.490 1 ATOM 25 C C . LEU 152 152 ? A -4.869 -1.207 -7.576 1 1 A LEU 0.490 1 ATOM 26 O O . LEU 152 152 ? A -5.703 -2.025 -7.962 1 1 A LEU 0.490 1 ATOM 27 C CB . LEU 152 152 ? A -5.737 0.751 -8.909 1 1 A LEU 0.490 1 ATOM 28 C CG . LEU 152 152 ? A -5.552 1.659 -10.151 1 1 A LEU 0.490 1 ATOM 29 C CD1 . LEU 152 152 ? A -6.843 2.455 -10.394 1 1 A LEU 0.490 1 ATOM 30 C CD2 . LEU 152 152 ? A -4.360 2.630 -10.085 1 1 A LEU 0.490 1 ATOM 31 N N . PHE 153 153 ? A -4.239 -1.348 -6.404 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 32 C CA . PHE 153 153 ? A -4.471 -2.460 -5.523 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 33 C C . PHE 153 153 ? A -5.376 -1.978 -4.409 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 34 O O . PHE 153 153 ? A -5.494 -0.786 -4.122 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 35 C CB . PHE 153 153 ? A -3.137 -3.008 -4.960 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 36 C CG . PHE 153 153 ? A -2.456 -3.910 -5.958 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 37 C CD1 . PHE 153 153 ? A -2.553 -5.301 -5.813 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 38 C CD2 . PHE 153 153 ? A -1.730 -3.404 -7.048 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 39 C CE1 . PHE 153 153 ? A -1.961 -6.165 -6.737 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 40 C CE2 . PHE 153 153 ? A -1.122 -4.264 -7.972 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 41 C CZ . PHE 153 153 ? A -1.260 -5.647 -7.831 1 1 A PHE 0.600 1 ATOM 42 N N . VAL 154 154 ? A -6.074 -2.897 -3.739 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 43 C CA . VAL 154 154 ? A -6.896 -2.554 -2.603 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 44 C C . VAL 154 154 ? A -6.404 -3.341 -1.423 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 45 O O . VAL 154 154 ? A -6.135 -4.532 -1.519 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 46 C CB . VAL 154 154 ? A -8.383 -2.745 -2.896 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 47 C CG1 . VAL 154 154 ? A -8.699 -4.149 -3.457 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 48 C CG2 . VAL 154 154 ? A -9.254 -2.381 -1.675 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 49 N N . ALA 155 155 ? A -6.217 -2.691 -0.263 1 1 A ALA 0.810 1 ATOM 50 C CA . ALA 155 155 ? A -5.929 -3.365 0.972 1 1 A ALA 0.810 1 ATOM 51 C C . ALA 155 155 ? A -7.140 -4.162 1.459 1 1 A ALA 0.810 1 ATOM 52 O O . ALA 155 155 ? A -8.246 -3.640 1.611 1 1 A ALA 0.810 1 ATOM 53 C CB . ALA 155 155 ? A -5.422 -2.347 2.005 1 1 A ALA 0.810 1 ATOM 54 N N . ILE 156 156 ? A -6.946 -5.478 1.676 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 55 C CA . ILE 156 156 ? A -7.951 -6.403 2.154 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 56 C C . ILE 156 156 ? A -7.656 -6.867 3.561 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 57 O O . ILE 156 156 ? A -8.527 -7.446 4.213 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 58 C CB . ILE 156 156 ? A -8.040 -7.658 1.293 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 59 C CG1 . ILE 156 156 ? A -6.662 -8.333 1.081 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 60 C CG2 . ILE 156 156 ? A -8.709 -7.276 -0.041 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 61 C CD1 . ILE 156 156 ? A -6.767 -9.844 0.845 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 62 N N . LYS 157 157 ? A -6.447 -6.602 4.093 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 63 C CA . LYS 157 157 ? A -6.080 -7.004 5.433 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 64 C C . LYS 157 157 ? A -5.488 -5.804 6.178 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 65 O O . LYS 157 157 ? A -4.712 -5.057 5.582 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 66 C CB . LYS 157 157 ? A -5.135 -8.231 5.454 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 67 C CG . LYS 157 157 ? A -5.679 -9.447 4.676 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 68 C CD . LYS 157 157 ? A -5.166 -10.782 5.230 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 69 C CE . LYS 157 157 ? A -5.997 -11.276 6.414 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 70 N NZ . LYS 157 157 ? A -5.184 -12.185 7.244 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 71 N N . PRO 158 158 ? A -5.851 -5.526 7.436 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 72 C CA . PRO 158 158 ? A -5.296 -4.414 8.199 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 73 C C . PRO 158 158 ? A -3.903 -4.743 8.701 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 74 O O . PRO 158 158 ? A -3.644 -5.899 9.029 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 75 C CB . PRO 158 158 ? A -6.270 -4.241 9.380 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 76 C CG . PRO 158 158 ? A -6.860 -5.638 9.593 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 77 C CD . PRO 158 158 ? A -6.893 -6.226 8.184 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 78 N N . TYR 159 159 ? A -2.991 -3.755 8.770 1 1 A TYR 0.610 1 ATOM 79 C CA . TYR 159 159 ? A -1.641 -3.990 9.231 1 1 A TYR 0.610 1 ATOM 80 C C . TYR 159 159 ? A -1.099 -2.664 9.737 1 1 A TYR 0.610 1 ATOM 81 O O . TYR 159 159 ? A -1.632 -1.615 9.381 1 1 A TYR 0.610 1 ATOM 82 C CB . TYR 159 159 ? A -0.749 -4.533 8.082 1 1 A TYR 0.610 1 ATOM 83 C CG . TYR 159 159 ? A 0.147 -5.629 8.569 1 1 A TYR 0.610 1 ATOM 84 C CD1 . TYR 159 159 ? A -0.411 -6.878 8.876 1 1 A TYR 0.610 1 ATOM 85 C CD2 . TYR 159 159 ? A 1.531 -5.448 8.713 1 1 A TYR 0.610 1 ATOM 86 C CE1 . TYR 159 159 ? A 0.393 -7.924 9.337 1 1 A TYR 0.610 1 ATOM 87 C CE2 . TYR 159 159 ? A 2.342 -6.504 9.159 1 1 A TYR 0.610 1 ATOM 88 C CZ . TYR 159 159 ? A 1.768 -7.739 9.482 1 1 A TYR 0.610 1 ATOM 89 O OH . TYR 159 159 ? A 2.558 -8.807 9.946 1 1 A TYR 0.610 1 ATOM 90 N N . GLN 160 160 ? A -0.038 -2.667 10.576 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 91 C CA . GLN 160 160 ? A 0.550 -1.457 11.140 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 92 C C . GLN 160 160 ? A 2.046 -1.390 10.816 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 93 O O . GLN 160 160 ? A 2.661 -2.448 10.692 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 94 C CB . GLN 160 160 ? A 0.330 -1.383 12.684 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 95 C CG . GLN 160 160 ? A -1.067 -0.851 13.097 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 96 C CD . GLN 160 160 ? A -1.384 0.522 12.502 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 97 O OE1 . GLN 160 160 ? A -2.162 0.641 11.559 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 98 N NE2 . GLN 160 160 ? A -0.778 1.607 13.036 1 1 A GLN 0.640 1 ATOM 99 N N . PRO 161 161 ? 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A -11.597 -6.923 -8.659 1 1 A VAL 0.410 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.641 2 1 3 0.029 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 149 PRO 1 0.550 2 1 A 150 GLY 1 0.620 3 1 A 151 ARG 1 0.320 4 1 A 152 LEU 1 0.490 5 1 A 153 PHE 1 0.600 6 1 A 154 VAL 1 0.710 7 1 A 155 ALA 1 0.810 8 1 A 156 ILE 1 0.680 9 1 A 157 LYS 1 0.720 10 1 A 158 PRO 1 0.690 11 1 A 159 TYR 1 0.610 12 1 A 160 GLN 1 0.640 13 1 A 161 PRO 1 0.590 14 1 A 162 GLN 1 0.440 15 1 A 163 VAL 1 0.430 16 1 A 164 ASP 1 0.470 17 1 A 165 GLY 1 0.630 18 1 A 166 GLU 1 0.650 19 1 A 167 ILE 1 0.720 20 1 A 168 PRO 1 0.710 21 1 A 169 LEU 1 0.740 22 1 A 170 HIS 1 0.690 23 1 A 171 ARG 1 0.580 24 1 A 172 GLY 1 0.670 25 1 A 173 ASP 1 0.700 26 1 A 174 ARG 1 0.640 27 1 A 175 VAL 1 0.790 28 1 A 176 LYS 1 0.720 29 1 A 177 VAL 1 0.710 30 1 A 178 LEU 1 0.590 31 1 A 179 SER 1 0.590 32 1 A 180 ILE 1 0.530 33 1 A 181 GLY 1 0.570 34 1 A 182 GLU 1 0.480 35 1 A 183 GLY 1 0.480 36 1 A 184 GLY 1 0.590 37 1 A 185 PHE 1 0.650 38 1 A 186 TRP 1 0.590 39 1 A 187 GLU 1 0.740 40 1 A 188 GLY 1 0.760 41 1 A 189 SER 1 0.790 42 1 A 190 ALA 1 0.790 43 1 A 191 ARG 1 0.580 44 1 A 192 GLY 1 0.640 45 1 A 193 HIS 1 0.650 46 1 A 194 ILE 1 0.690 47 1 A 195 GLY 1 0.750 48 1 A 196 TRP 1 0.590 49 1 A 197 PHE 1 0.730 50 1 A 198 PRO 1 0.770 51 1 A 199 ALA 1 0.790 52 1 A 200 GLU 1 0.770 53 1 A 201 CYS 1 0.810 54 1 A 202 VAL 1 0.810 55 1 A 203 GLU 1 0.620 56 1 A 204 GLU 1 0.460 57 1 A 205 VAL 1 0.410 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #