data_SMR-b9b9e8dec63ba05e4b57469b1ee73e58_2 _entry.id SMR-b9b9e8dec63ba05e4b57469b1ee73e58_2 _struct.entry_id SMR-b9b9e8dec63ba05e4b57469b1ee73e58_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - A0A2J8J9W4/ A0A2J8J9W4_PANTR, IQSEC2 isoform 1 - H2PVQ5/ H2PVQ5_PONAB, IQSEC2 isoform 6 - Q5JU85/ IQEC2_HUMAN, IQ motif and SEC7 domain-containing protein 2 Estimated model accuracy of this model is 0.005, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A0A2J8J9W4, H2PVQ5, Q5JU85' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 189814.248 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP IQEC2_HUMAN Q5JU85 1 ;MEAGSGPPGGPGSESPNRAVEYLLELNNIIESQQQLLETQRRRIEELEGQLDQLTQENRDLREESQLHRG ELHRDPHGARDSPGRESQYQNLRETQFHHRELRESQFHQAARDVGYPNREGAYQNREAVYRDKERDASYP LQDTTGYTARERDVAQCHLHHENPALGRERGGREAGPAHPGREKEAGYSAAVGVGPRPPRERGQLSRGAS RSSSPGAGGGHSTSTSTSPATTLQRKSDGENSRTVSVEGDAPGSDLSTAVDSPGSQPPYRLSQLPPSSSH MGGPPAGVGLPWAQRARLQPASVALRKQEEEEIKRSKALSDSYELSTDLQDKKVEMLERKYGGSFLSRRA ARTIQTAFRQYRMNKNFERLRSSASESRMSRRIILSNMRMQFSFEEYEKAQNPAYFEGKPASLDEGAMAG ARSHRLERGLPYGGSCGGGIDGGGSSVTTSGEFSNDITELEDSFSKQVKSLAESIDEALNCHPSGPMSEE PGSAQLEKRESKEQQEDSSATSFSDLPLYLDDTVPQQSPERLPSTEPPPQGRPEFWAPAPLPPVPPPVPS GTREDGSREEGTRRGPGCLECRDFRLRAAHLPLLTIEPPSDSSVDLSDRSDRGSVHRQLVYEADGCSPHG TLKHKGPPGRAPIPHRHYPAPEGPAPAPPGPLPPAPNSGTGPSGVAGGRRLGKCEAAGENSDGGDNESLE SSSNSNETINCSSGSSSRDSLREPPATGLCKQTYQRETRHSWDSPAFNNDVVQRRHYRIGLNLFNKKPEK GIQYLIERGFLSDTPVGVAHFILERKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSSMDLDDALRKF QSHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCVCNPALVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPSVKAERKMKLDD FIKNLRGVDNGEDIPRDLLVGIYQRIQGRELRTNDDHVSQVQAVERMIVGKKPVLSLPHRRLVCCCQLYE VPDPNRPQRLGLHQREVFLFNDLLVVTKIFQKKKILVTYSFRQSFPLVEMHMQLFQNSYYQFGIKLLSAV PGGERKVLIIFNAPSLQDRLRFTSDLRESIAEVQEMEKYRVESELEKQKGMMRPNASQPGGAKDSVNGTM ARSSLEDTYGAGDGLKRGALSSSLRDLSDAGKRGRRNSVGSLDSTIEGSVISSPRPHQRMPPPPPPPPPE EYKSQRPVSNSSSFLGSLFGSKRGKGPFQMPPPPTGQASASSSSASSTHHHHHHHHHGHSHGGLGVLPDG 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;MEAGSGPPGGPGSESPNRAVEYLLELNNIIESQQQLLETQRRRIEELEGQLDQLTQENRDLREESQLHRG ELHRDPHGARDSPGRESQYQNLRETQFHHRELRESQFHQAARDVGYPNREGAYQNREAVYRDKERDASYP LQDTTGYTARERDVAQCHLHHENPALGRERGGREAGPAHPGREKEAGYSAAVGVGPRPPRERGQLSRGAS RSSSPGAGGGHSTSTSTSPATTLQRKSDGENSRTVSVEGDAPGSDLSTAVDSPGSQPPYRLSQLPPSSSH MGGPPAGVGLPWAQRARLQPASVALRKQEEEEIKRSKALSDSYELSTDLQDKKVEMLERKYGGSFLSRRA ARTIQTAFRQYRMNKNFERLRSSASESRMSRRIILSNMRMQFSFEEYEKAQNPAYFEGKPASLDEGAMAG ARSHRLERGLPYGGSCGGGIDGGGSSVTTSGEFSNDITELEDSFSKQVKSLAESIDEALNCHPSGPMSEE PGSAQLEKRESKEQQEDSSATSFSDLPLYLDDTVPQQSPERLPSTEPPPQGRPEFWAPAPLPPVPPPVPS GTREDGSREEGTRRGPGCLECRDFRLRAAHLPLLTIEPPSDSSVDLSDRSDRGSVHRQLVYEADGCSPHG TLKHKGPPGRAPIPHRHYPAPEGPAPAPPGPLPPAPNSGTGPSGVAGGRRLGKCEAAGENSDGGDNESLE SSSNSNETINCSSGSSSRDSLREPPATGLCKQTYQRETRHSWDSPAFNNDVVQRRHYRIGLNLFNKKPEK GIQYLIERGFLSDTPVGVAHFILERKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSSMDLDDALRKF QSHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCVCNPALVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPSVKAERKMKLDD FIKNLRGVDNGEDIPRDLLVGIYQRIQGRELRTNDDHVSQVQAVERMIVGKKPVLSLPHRRLVCCCQLYE 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_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . IQEC2_HUMAN Q5JU85 . 1 1488 9606 'Homo sapiens (Human)' 2018-03-28 52F8B7BE28A175F3 1 UNP . H2PVQ5_PONAB H2PVQ5 . 1 1488 9601 'Pongo abelii (Sumatran orangutan) (Pongo pygmaeus abelii)' 2022-05-25 52F8B7BE28A175F3 1 UNP . A0A2J8J9W4_PANTR A0A2J8J9W4 . 1 1488 9598 'Pan troglodytes (Chimpanzee)' 2018-03-28 52F8B7BE28A175F3 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MEAGSGPPGGPGSESPNRAVEYLLELNNIIESQQQLLETQRRRIEELEGQLDQLTQENRDLREESQLHRG ELHRDPHGARDSPGRESQYQNLRETQFHHRELRESQFHQAARDVGYPNREGAYQNREAVYRDKERDASYP LQDTTGYTARERDVAQCHLHHENPALGRERGGREAGPAHPGREKEAGYSAAVGVGPRPPRERGQLSRGAS RSSSPGAGGGHSTSTSTSPATTLQRKSDGENSRTVSVEGDAPGSDLSTAVDSPGSQPPYRLSQLPPSSSH MGGPPAGVGLPWAQRARLQPASVALRKQEEEEIKRSKALSDSYELSTDLQDKKVEMLERKYGGSFLSRRA ARTIQTAFRQYRMNKNFERLRSSASESRMSRRIILSNMRMQFSFEEYEKAQNPAYFEGKPASLDEGAMAG ARSHRLERGLPYGGSCGGGIDGGGSSVTTSGEFSNDITELEDSFSKQVKSLAESIDEALNCHPSGPMSEE PGSAQLEKRESKEQQEDSSATSFSDLPLYLDDTVPQQSPERLPSTEPPPQGRPEFWAPAPLPPVPPPVPS GTREDGSREEGTRRGPGCLECRDFRLRAAHLPLLTIEPPSDSSVDLSDRSDRGSVHRQLVYEADGCSPHG 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Isoform K of Myosin heavy chain, muscle {PDB ID=8exw, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=8exw.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8exw, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;PKPVANQEDEDPTPYLFVSLEQRRIDQSKPYDSKKSCWIPDEKEGYLLGEIKATKGDIVSVGLQGGETRD LKKDLLQQVNPPKYEKAEDMSNLTYLNDASVLHNLRQRYYNKLIYTYSGLFCVAINPYKRYPVYTNRCAK MYRGKRRNEVPPHIFAISDGAYVDMLTNHVNQSMLITGESGAGKTENTKKVIAYFATVGASKKTDEAAKS KGSLEDQVVQTNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGPTGKLAGADIETYLLEKARVISQQSLERS YHIFYQIMSGSVPGVKEMCFLSDNIYDYYNVSQGKVTVPNMDDGEEFQLADQAFDILGFTKQEKEDVYRI TAAVMHMGGMKFKQRGREEQAEQDGEEEGGRVSKLFGCDTAELYKNLLKPRIKVGNEFVTQGRNVQQVTN SIGALCKGVFDRLFKWLVKKCNETLDTQQKRQHFIGVLDIAGFEIFEYNGFEQLCINFTNEKLQQFFNHI MFVMEQEEYKKEGINWDFIDFGMDLLACIDLIEKPMGILSILEEESMFPKATDQTFSEKLTNTHLGKSAP FQKPKPPKPGQQAAHFAIAHYAGCVSYNITGWLEKNKDPLNDTVVDQFKKSQNKLLIEIFADHAGQSGGG EQAKGGRGKKGGGFATVSSAYKEQLNSLMTTLRSTQPHFVRCIIPNEMKQPGVVDAHLVMHQLTCNGVLE GIRICRKGFPNRMMYPDFKMRYMILAPAIMAAEKVAKNAAGKCLEAVGLDPDMYRIGHTKVFFRAGVLGQ MEEFRDERLGKIMSWMQAWARGYLSRKGFKKLQEQRVA ; ;PKPVANQEDEDPTPYLFVSLEQRRIDQSKPYDSKKSCWIPDEKEGYLLGEIKATKGDIVSVGLQGGETRD LKKDLLQQVNPPKYEKAEDMSNLTYLNDASVLHNLRQRYYNKLIYTYSGLFCVAINPYKRYPVYTNRCAK MYRGKRRNEVPPHIFAISDGAYVDMLTNHVNQSMLITGESGAGKTENTKKVIAYFATVGASKKTDEAAKS KGSLEDQVVQTNPVLEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGPTGKLAGADIETYLLEKARVISQQSLERS YHIFYQIMSGSVPGVKEMCFLSDNIYDYYNVSQGKVTVPNMDDGEEFQLADQAFDILGFTKQEKEDVYRI TAAVMHMGGMKFKQRGREEQAEQDGEEEGGRVSKLFGCDTAELYKNLLKPRIKVGNEFVTQGRNVQQVTN SIGALCKGVFDRLFKWLVKKCNETLDTQQKRQHFIGVLDIAGFEIFEYNGFEQLCINFTNEKLQQFFNHI MFVMEQEEYKKEGINWDFIDFGMDLLACIDLIEKPMGILSILEEESMFPKATDQTFSEKLTNTHLGKSAP FQKPKPPKPGQQAAHFAIAHYAGCVSYNITGWLEKNKDPLNDTVVDQFKKSQNKLLIEIFADHAGQSGGG EQAKGGRGKKGGGFATVSSAYKEQLNSLMTTLRSTQPHFVRCIIPNEMKQPGVVDAHLVMHQLTCNGVLE GIRICRKGFPNRMMYPDFKMRYMILAPAIMAAEKVAKNAAGKCLEAVGLDPDMYRIGHTKVFFRAGVLGQ MEEFRDERLGKIMSWMQAWARGYLSRKGFKKLQEQRVA ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 763 804 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8exw 2024-02-07 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1488 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1488 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 17.000 16.667 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MEAGSGPPGGPGSESPNRAVEYLLELNNIIESQQQLLETQRRRIEELEGQLDQLTQENRDLREESQLHRGELHRDPHGARDSPGRESQYQNLRETQFHHRELRESQFHQAARDVGYPNREGAYQNREAVYRDKERDASYPLQDTTGYTARERDVAQCHLHHENPALGRERGGREAGPAHPGREKEAGYSAAVGVGPRPPRERGQLSRGASRSSSPGAGGGHSTSTSTSPATTLQRKSDGENSRTVSVEGDAPGSDLSTAVDSPGSQPPYRLSQLPPSSSHMGGPPAGVGLPWAQRARLQPASVALRKQEEEEIKRSKALSDSYELSTDLQDKKVEMLERKYGGSFLSRRAARTIQTAFRQYRMNKNFERLRSSASESRMSRRIILSNMRMQFSFEEYEKAQNPAYFEGKPASLDEGAMAGARSHRLERGLPYGGSCGGGIDGGGSSVTTSGEFSNDITELEDSFSKQVKSLAESIDEALNCHPSGPMSEEPGSAQLEKRESKEQQEDSSATSFSDLPLYLDDTVPQQSPERLPSTEPPPQGRPEFWAPAPLPPVPPPVPSGTREDGSREEGTRRGPGCLECRDFRLRAAHLPLLTIEPPSDSSVDLSDRSDRGSVHRQLVYEADGCSPHGTLKHKGPPGRAPIPHRHYPAPEGPAPAPPGPLPPAPNSGTGPSGVAGGRRLGKCEAAGENSDGGDNESLESSSNSNETINCSSGSSSRDSLREPPATGLCKQTYQRETRHSWDSPAFNNDVVQRRHYRIGLNLFNKKPEKGIQYLIERGFLSDTPVGVAHFILERKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSSMDLDDALRKFQSHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCVCNPALVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPSVKAERKMKLDDFIKNLRGVDNGEDIPRDLLVGIYQRIQGRELRTNDDHVSQVQAVERMIVGKKPVLSLPHRRLVCCCQLYEVPDPNRPQRLGLHQREVFLFNDLLVVTKIFQKKKILVTYSFRQSFPLVEMHMQLFQNSYYQFGIKLLSAVPGGERKVLIIFNAPSLQDRLRFTSDLRESIAEVQEMEKYRVESELEKQKGMMRPNASQPGGAKDSVNGTMARSSLEDTYGAGDGLKRGALSSSLRDLSDAGKRGRRNSVGSLDSTIEGSVISSPRPHQRMPPPPPPPPPEEYKSQRPVSNSSSFLGSLFGSKRGKGPFQMPPPPTGQASASSSSASSTHHHHHHHHHGHSHGGLGVLPDGQSKLQALHAQYCQGPGPAPPPYLPPQQPSLPPPPQQPPPLPQLGSIPPPPASAPPVGPHRHFHAHGPVPGPQHYTLGRPGRAPRRGAGGHPQFAPHGRHPLHQPTSPLPLYSPAPQHPPAHKQGPKHFIFSHHPQMMPAAGAAGGPGSRPPGGSYSHPHHPQSPLSPHSPIPPHPSYPPLPPPSPHTPHSPLPPTSPHGPLHASGPPGTANPPSANPKAKPSRISTVV 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------FRAGVLGQMEEFRDER--LGKIMSWMQAWARGYLSRKGFKKLQE------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8exw.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LEU 329 329 ? A -4.189 18.392 70.443 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 2 C CA . LEU 329 329 ? A -4.184 19.891 70.579 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 3 C C . LEU 329 329 ? A -4.498 20.507 69.235 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 4 O O . LEU 329 329 ? A -4.045 19.979 68.233 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 5 C CB . LEU 329 329 ? A -2.793 20.371 71.089 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 6 C CG . LEU 329 329 ? A -2.468 19.985 72.553 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 7 C CD1 . LEU 329 329 ? A -1.014 20.367 72.885 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 8 C CD2 . LEU 329 329 ? A -3.419 20.642 73.575 1 1 A LEU 0.460 1 ATOM 9 N N . GLN 330 330 ? A -5.299 21.600 69.195 1 1 A GLN 0.540 1 ATOM 10 C CA . GLN 330 330 ? A -5.462 22.477 68.048 1 1 A GLN 0.540 1 ATOM 11 C C . GLN 330 330 ? A -4.212 23.310 67.932 1 1 A GLN 0.540 1 ATOM 12 O O . GLN 330 330 ? A -3.409 23.331 68.866 1 1 A GLN 0.540 1 ATOM 13 C CB . GLN 330 330 ? A -6.660 23.456 68.257 1 1 A GLN 0.540 1 ATOM 14 C CG . GLN 330 330 ? A -8.019 22.743 68.450 1 1 A GLN 0.540 1 ATOM 15 C CD . GLN 330 330 ? A -8.359 22.004 67.159 1 1 A GLN 0.540 1 ATOM 16 O OE1 . GLN 330 330 ? A -8.416 22.633 66.096 1 1 A GLN 0.540 1 ATOM 17 N NE2 . GLN 330 330 ? A -8.583 20.678 67.199 1 1 A GLN 0.540 1 ATOM 18 N N . ASP 331 331 ? A -4.056 24.019 66.799 1 1 A ASP 0.420 1 ATOM 19 C CA . ASP 331 331 ? A -2.933 24.874 66.505 1 1 A ASP 0.420 1 ATOM 20 C C . ASP 331 331 ? A -2.719 25.917 67.591 1 1 A ASP 0.420 1 ATOM 21 O O . ASP 331 331 ? A -3.664 26.407 68.210 1 1 A ASP 0.420 1 ATOM 22 C CB . ASP 331 331 ? A -3.137 25.589 65.141 1 1 A ASP 0.420 1 ATOM 23 C CG . ASP 331 331 ? A -3.096 24.598 63.990 1 1 A ASP 0.420 1 ATOM 24 O OD1 . ASP 331 331 ? A -2.716 23.426 64.228 1 1 A ASP 0.420 1 ATOM 25 O OD2 . ASP 331 331 ? A -3.429 25.033 62.861 1 1 A ASP 0.420 1 ATOM 26 N N . LYS 332 332 ? A -1.440 26.214 67.890 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 27 C CA . LYS 332 332 ? A -1.012 27.240 68.835 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 28 C C . LYS 332 332 ? A -1.209 26.899 70.304 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 29 O O . LYS 332 332 ? A -0.733 27.608 71.189 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 30 C CB . LYS 332 332 ? A -1.597 28.637 68.535 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 31 C CG . LYS 332 332 ? A -1.156 29.176 67.176 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 32 C CD . LYS 332 332 ? A -1.873 30.494 66.899 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 33 C CE . LYS 332 332 ? A -1.459 31.090 65.563 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 34 N NZ . LYS 332 332 ? A -2.142 32.384 65.391 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 35 N N . LYS 333 333 ? A -1.871 25.781 70.649 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 36 C CA . LYS 333 333 ? A -2.076 25.455 72.049 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 37 C C . LYS 333 333 ? A -0.813 25.061 72.780 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 38 O O . LYS 333 333 ? A -0.581 25.498 73.903 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 39 C CB . LYS 333 333 ? A -3.107 24.337 72.221 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 40 C CG . LYS 333 333 ? A -4.518 24.815 71.872 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 41 C CD . LYS 333 333 ? A -5.542 23.698 72.111 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 42 C CE . LYS 333 333 ? A -7.000 24.167 71.999 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 43 N NZ . LYS 333 333 ? A -7.945 23.024 72.032 1 1 A LYS 0.640 1 ATOM 44 N N . VAL 334 334 ? A 0.055 24.254 72.131 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 45 C CA . VAL 334 334 ? A 1.374 23.889 72.635 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 46 C C . VAL 334 334 ? A 2.254 25.111 72.838 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 47 O O . VAL 334 334 ? A 2.955 25.213 73.843 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 48 C CB . VAL 334 334 ? A 2.079 22.832 71.771 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 49 C CG1 . VAL 334 334 ? A 2.457 23.361 70.363 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 50 C CG2 . VAL 334 334 ? A 3.311 22.291 72.538 1 1 A VAL 0.580 1 ATOM 51 N N . GLU 335 335 ? A 2.182 26.118 71.938 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 52 C CA . GLU 335 335 ? A 2.889 27.379 72.046 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 53 C C . GLU 335 335 ? A 2.500 28.135 73.315 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 54 O O . GLU 335 335 ? A 3.348 28.595 74.076 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 55 C CB . GLU 335 335 ? A 2.569 28.270 70.811 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 56 C CG . GLU 335 335 ? A 3.277 29.649 70.874 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 57 C CD . GLU 335 335 ? A 2.910 30.659 69.791 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 58 O OE1 . GLU 335 335 ? A 3.364 31.827 69.994 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 59 O OE2 . GLU 335 335 ? A 2.174 30.318 68.833 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 60 N N . MET 336 336 ? A 1.190 28.231 73.620 1 1 A MET 0.600 1 ATOM 61 C CA . MET 336 336 ? A 0.688 28.786 74.867 1 1 A MET 0.600 1 ATOM 62 C C . MET 336 336 ? A 1.098 28.000 76.109 1 1 A MET 0.600 1 ATOM 63 O O . MET 336 336 ? A 1.451 28.587 77.133 1 1 A MET 0.600 1 ATOM 64 C CB . MET 336 336 ? A -0.850 28.900 74.837 1 1 A MET 0.600 1 ATOM 65 C CG . MET 336 336 ? A -1.359 29.925 73.808 1 1 A MET 0.600 1 ATOM 66 S SD . MET 336 336 ? A -3.175 29.987 73.691 1 1 A MET 0.600 1 ATOM 67 C CE . MET 336 336 ? A -3.485 30.701 75.336 1 1 A MET 0.600 1 ATOM 68 N N . LEU 337 337 ? A 1.082 26.650 76.036 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 69 C CA . LEU 337 337 ? A 1.569 25.751 77.076 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 70 C C . LEU 337 337 ? A 3.050 25.938 77.385 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 71 O O . LEU 337 337 ? 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A 19.275 31.281 119.329 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 348 C CD . ARG 369 369 ? A 20.659 31.311 118.667 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 349 N NE . ARG 369 369 ? A 20.539 32.019 117.335 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 350 C CZ . ARG 369 369 ? A 20.452 33.343 117.140 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 351 N NH1 . ARG 369 369 ? A 20.527 34.200 118.152 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 352 N NH2 . ARG 369 369 ? A 20.281 33.810 115.902 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 353 N N . LEU 370 370 ? A 16.063 33.200 118.843 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 354 C CA . LEU 370 370 ? A 15.681 34.542 119.255 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 355 C C . LEU 370 370 ? A 14.421 34.568 120.128 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 356 O O . LEU 370 370 ? A 14.246 35.461 120.955 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 357 C CB . LEU 370 370 ? A 15.443 35.403 117.984 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 358 C CG . LEU 370 370 ? A 15.062 36.884 118.233 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 359 C CD1 . LEU 370 370 ? A 16.292 37.772 118.504 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 360 C CD2 . LEU 370 370 ? A 14.209 37.419 117.070 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 361 N N . 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.600 2 1 3 0.005 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 329 LEU 1 0.460 2 1 A 330 GLN 1 0.540 3 1 A 331 ASP 1 0.420 4 1 A 332 LYS 1 0.610 5 1 A 333 LYS 1 0.640 6 1 A 334 VAL 1 0.580 7 1 A 335 GLU 1 0.580 8 1 A 336 MET 1 0.600 9 1 A 337 LEU 1 0.570 10 1 A 338 GLU 1 0.560 11 1 A 339 ARG 1 0.560 12 1 A 340 LYS 1 0.580 13 1 A 341 TYR 1 0.530 14 1 A 342 GLY 1 0.620 15 1 A 343 GLY 1 0.550 16 1 A 344 SER 1 0.530 17 1 A 345 PHE 1 0.490 18 1 A 346 LEU 1 0.540 19 1 A 347 SER 1 0.570 20 1 A 348 ARG 1 0.510 21 1 A 349 ARG 1 0.540 22 1 A 350 ALA 1 0.670 23 1 A 351 ALA 1 0.660 24 1 A 352 ARG 1 0.600 25 1 A 353 THR 1 0.690 26 1 A 354 ILE 1 0.670 27 1 A 355 GLN 1 0.680 28 1 A 356 THR 1 0.690 29 1 A 357 ALA 1 0.700 30 1 A 358 PHE 1 0.680 31 1 A 359 ARG 1 0.640 32 1 A 360 GLN 1 0.670 33 1 A 361 TYR 1 0.680 34 1 A 362 ARG 1 0.640 35 1 A 363 MET 1 0.670 36 1 A 364 ASN 1 0.710 37 1 A 365 LYS 1 0.670 38 1 A 366 ASN 1 0.680 39 1 A 367 PHE 1 0.620 40 1 A 368 GLU 1 0.650 41 1 A 369 ARG 1 0.540 42 1 A 370 LEU 1 0.570 43 1 A 371 ARG 1 0.550 44 1 A 372 SER 1 0.510 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #