data_SMR-a1e259576d575317d900dd3af6b5f1eb_3 _entry.id SMR-a1e259576d575317d900dd3af6b5f1eb_3 _struct.entry_id SMR-a1e259576d575317d900dd3af6b5f1eb_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - A0A8C6GNB1/ A0A8C6GNB1_MUSSI, B cell CLL/lymphoma 9-like - Q67FY2/ BCL9L_MOUSE, B-cell CLL/lymphoma 9-like protein Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A0A8C6GNB1, Q67FY2' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 183718.678 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP BCL9L_MOUSE Q67FY2 1 ;MRILANKTRLPHPRRREAPGSPPLSPRGHCPPAPAKPMHPENKLTNHGKTGNGGAQSQHQNVNQGPTCNL GSKGVGAGSHGAKANQISPSNSSLKNPQAGVSPFSSLKGKVKRERSVSVDSGEQREAGTPSLDSEAKEVA PRSKRRCVLERKQPYSGDEWCSGPDSEEDDKPIAAAHNCNVADPAMVTPQLGPGQTAQLPLSESSAPGPQ HGPQPGLRPDVPGGGGGGVPGKPPSQFVYVFTTHLANTAAEAVLQGRAESILAYHQQNVPRAKLDQAPKV PPTPEPLPLNTPSAGTPQSQPPPLPPPPPAPGSAPPALPPEGPPEDTSQDLAPNSVGAASTGGGTGGTHP NTPTAATANNPLPPGGDPGSAPGSALLGEATPTGNGQRNLVGSEGLSKEQLEHRERSLQTLRDIERLLLR SGETEPFLKGPPGGAGEGGPPAQAPSAAQPPPSAPPGGLKKYEEPLQSMISQTQSLGGPPLEHEVPGHPQ GGDMGQQMNMMMQRLGQDSLTPEQVAWRKLQEEYYEEKRRKEEQIGLHGGRPLQDMVGMGGMMGRGPPPP YHSKPGDQWPPGMGAQLRGPMDVQDPMQLRPGPPFPGPRFPGNQMQRVPGFGGMQSMPMEVPMNAMQRPV RPGMAWNEDLPPIGGPSNFAQNAVPYPGGQGEAERFMTPRVREELLRHQLLEKRSMGMQRPLGMAGSGMG QSMEMERMIQAHRQMDPAMFPGQMTGGDGLAGTPMGIEFGGGRGLLSPPMGQSGLREVDPPMGPGNLNMN MNVNMNMNMNLNVQMTPQQQMLMSQKMRGPGDMMGPQGLSPEEMARVRAQNSSGMMGGPQKMLMPSQFPN QGQQGFSGGQGPYQAMPQDMGNTPDMFSPDQSSVPMGTVGTARLSHMPLPPASNPPGSVHLASNRGLGRR PSDLTISINQMGSPGMGHLKSPTLSQVHSPLVTSPSANLKSPQTPSQMVPLPSANPPGPLKSPQVLSSSL GVRSPTGSPSRLKSPSMAVPSPGWVASPKTAMPSPGVSQNKQPPLSINSSSTLGNVEQGALPPSAPRNSS SAPPANPSSGLMNPSLPFTSSPDPTPSQNPLSLMMSQMSKYAMPSSTPLYHNAIKTIATSDDELLPDRPL LPPPPPPQGSGPGISNNQPNQMHMNPAAAQSPMGMNLPGQQPLSHEPPPTMLPSPTPLGSNIPLHPNAQG TGGSSQNSMMMAPGGPDSLNAPCGPVPSSSQMMSFPPRLQQPHGAMAPTGAGGPGLQQHYPSGMALPPED LPTQPPGPIPPQQHLMGKGMTGRMGDAYPPGVLPGVASVLNDPELSEVIRPTPTGIPEFDLSRIIPSEKP SSTLQYFPKSENQPPKAQPPNLHLMNLQNMMAEQTPSRPPNLPGQQGVQRGLSMSMCHPGQMSLLGRTGV PPQQGMVPHGLHQGVMSPPQGLMTQQNFMLMKQRGVGGEVYTQPPHMLSPQGSLMGPPPQQNLMVSHPLR QRSVSLDSQMGYLPTPGSMANLPF ; 'B-cell CLL/lymphoma 9-like protein' 2 1 UNP A0A8C6GNB1_MUSSI A0A8C6GNB1 1 ;MRILANKTRLPHPRRREAPGSPPLSPRGHCPPAPAKPMHPENKLTNHGKTGNGGAQSQHQNVNQGPTCNL GSKGVGAGSHGAKANQISPSNSSLKNPQAGVSPFSSLKGKVKRERSVSVDSGEQREAGTPSLDSEAKEVA PRSKRRCVLERKQPYSGDEWCSGPDSEEDDKPIAAAHNCNVADPAMVTPQLGPGQTAQLPLSESSAPGPQ HGPQPGLRPDVPGGGGGGVPGKPPSQFVYVFTTHLANTAAEAVLQGRAESILAYHQQNVPRAKLDQAPKV PPTPEPLPLNTPSAGTPQSQPPPLPPPPPAPGSAPPALPPEGPPEDTSQDLAPNSVGAASTGGGTGGTHP NTPTAATANNPLPPGGDPGSAPGSALLGEATPTGNGQRNLVGSEGLSKEQLEHRERSLQTLRDIERLLLR SGETEPFLKGPPGGAGEGGPPAQAPSAAQPPPSAPPGGLKKYEEPLQSMISQTQSLGGPPLEHEVPGHPQ GGDMGQQMNMMMQRLGQDSLTPEQVAWRKLQEEYYEEKRRKEEQIGLHGGRPLQDMVGMGGMMGRGPPPP YHSKPGDQWPPGMGAQLRGPMDVQDPMQLRPGPPFPGPRFPGNQMQRVPGFGGMQSMPMEVPMNAMQRPV RPGMAWNEDLPPIGGPSNFAQNAVPYPGGQGEAERFMTPRVREELLRHQLLEKRSMGMQRPLGMAGSGMG QSMEMERMIQAHRQMDPAMFPGQMTGGDGLAGTPMGIEFGGGRGLLSPPMGQSGLREVDPPMGPGNLNMN MNVNMNMNMNLNVQMTPQQQMLMSQKMRGPGDMMGPQGLSPEEMARVRAQNSSGMMGGPQKMLMPSQFPN QGQQGFSGGQGPYQAMPQDMGNTPDMFSPDQSSVPMGTVGTARLSHMPLPPASNPPGSVHLASNRGLGRR PSDLTISINQMGSPGMGHLKSPTLSQVHSPLVTSPSANLKSPQTPSQMVPLPSANPPGPLKSPQVLSSSL GVRSPTGSPSRLKSPSMAVPSPGWVASPKTAMPSPGVSQNKQPPLSINSSSTLGNVEQGALPPSAPRNSS SAPPANPSSGLMNPSLPFTSSPDPTPSQNPLSLMMSQMSKYAMPSSTPLYHNAIKTIATSDDELLPDRPL LPPPPPPQGSGPGISNNQPNQMHMNPAAAQSPMGMNLPGQQPLSHEPPPTMLPSPTPLGSNIPLHPNAQG TGGSSQNSMMMAPGGPDSLNAPCGPVPSSSQMMSFPPRLQQPHGAMAPTGAGGPGLQQHYPSGMALPPED LPTQPPGPIPPQQHLMGKGMTGRMGDAYPPGVLPGVASVLNDPELSEVIRPTPTGIPEFDLSRIIPSEKP SSTLQYFPKSENQPPKAQPPNLHLMNLQNMMAEQTPSRPPNLPGQQGVQRGLSMSMCHPGQMSLLGRTGV PPQQGMVPHGLHQGVMSPPQGLMTQQNFMLMKQRGVGGEVYTQPPHMLSPQGSLMGPPPQQNLMVSHPLR QRSVSLDSQMGYLPTPGSMANLPF ; 'B cell CLL/lymphoma 9-like' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1494 1 1494 2 2 1 1494 1 1494 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . BCL9L_MOUSE Q67FY2 . 1 1494 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2004-10-11 31A9904C5923581C 1 UNP . A0A8C6GNB1_MUSSI A0A8C6GNB1 . 1 1494 10103 'Mus spicilegus (Steppe mouse)' 2022-01-19 31A9904C5923581C # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MRILANKTRLPHPRRREAPGSPPLSPRGHCPPAPAKPMHPENKLTNHGKTGNGGAQSQHQNVNQGPTCNL GSKGVGAGSHGAKANQISPSNSSLKNPQAGVSPFSSLKGKVKRERSVSVDSGEQREAGTPSLDSEAKEVA PRSKRRCVLERKQPYSGDEWCSGPDSEEDDKPIAAAHNCNVADPAMVTPQLGPGQTAQLPLSESSAPGPQ HGPQPGLRPDVPGGGGGGVPGKPPSQFVYVFTTHLANTAAEAVLQGRAESILAYHQQNVPRAKLDQAPKV PPTPEPLPLNTPSAGTPQSQPPPLPPPPPAPGSAPPALPPEGPPEDTSQDLAPNSVGAASTGGGTGGTHP NTPTAATANNPLPPGGDPGSAPGSALLGEATPTGNGQRNLVGSEGLSKEQLEHRERSLQTLRDIERLLLR SGETEPFLKGPPGGAGEGGPPAQAPSAAQPPPSAPPGGLKKYEEPLQSMISQTQSLGGPPLEHEVPGHPQ GGDMGQQMNMMMQRLGQDSLTPEQVAWRKLQEEYYEEKRRKEEQIGLHGGRPLQDMVGMGGMMGRGPPPP YHSKPGDQWPPGMGAQLRGPMDVQDPMQLRPGPPFPGPRFPGNQMQRVPGFGGMQSMPMEVPMNAMQRPV 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B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'B-CELL CLL/LYMPHOMA 9 PROTEIN {PDB ID=2vp7, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=2vp7.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2vp7, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 AAKVVYVFSTEMANKAAEAVLKGQVETIVSFHI AAKVVYVFSTEMANKAAEAVLKGQVETIVSFHI # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 2 33 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2vp7 2024-05-08 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1494 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1494 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.4e-13 53.125 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MRILANKTRLPHPRRREAPGSPPLSPRGHCPPAPAKPMHPENKLTNHGKTGNGGAQSQHQNVNQGPTCNLGSKGVGAGSHGAKANQISPSNSSLKNPQAGVSPFSSLKGKVKRERSVSVDSGEQREAGTPSLDSEAKEVAPRSKRRCVLERKQPYSGDEWCSGPDSEEDDKPIAAAHNCNVADPAMVTPQLGPGQTAQLPLSESSAPGPQHGPQPGLRPDVPGGGGGGVPGKPPSQFVYVFTTHLANTAAEAVLQGRAESILAYHQQNVPRAKLDQAPKVPPTPEPLPLNTPSAGTPQSQPPPLPPPPPAPGSAPPALPPEGPPEDTSQDLAPNSVGAASTGGGTGGTHPNTPTAATANNPLPPGGDPGSAPGSALLGEATPTGNGQRNLVGSEGLSKEQLEHRERSLQTLRDIERLLLRSGETEPFLKGPPGGAGEGGPPAQAPSAAQPPPSAPPGGLKKYEEPLQSMISQTQSLGGPPLEHEVPGHPQGGDMGQQMNMMMQRLGQDSLTPEQVAWRKLQEEYYEEKRRKEEQIGLHGGRPLQDMVGMGGMMGRGPPPPYHSKPGDQWPPGMGAQLRGPMDVQDPMQLRPGPPFPGPRFPGNQMQRVPGFGGMQSMPMEVPMNAMQRPVRPGMAWNEDLPPIGGPSNFAQNAVPYPGGQGEAERFMTPRVREELLRHQLLEKRSMGMQRPLGMAGSGMGQSMEMERMIQAHRQMDPAMFPGQMTGGDGLAGTPMGIEFGGGRGLLSPPMGQSGLREVDPPMGPGNLNMNMNVNMNMNMNLNVQMTPQQQMLMSQKMRGPGDMMGPQGLSPEEMARVRAQNSSGMMGGPQKMLMPSQFPNQGQQGFSGGQGPYQAMPQDMGNTPDMFSPDQSSVPMGTVGTARLSHMPLPPASNPPGSVHLASNRGLGRRPSDLTISINQMGSPGMGHLKSPTLSQVHSPLVTSPSANLKSPQTPSQMVPLPSANPPGPLKSPQVLSSSLGVRSPTGSPSRLKSPSMAVPSPGWVASPKTAMPSPGVSQNKQPPLSINSSSTLGNVEQGALPPSAPRNSSSAPPANPSSGLMNPSLPFTSSPDPTPSQNPLSLMMSQMSKYAMPSSTPLYHNAIKTIATSDDELLPDRPLLPPPPPPQGSGPGISNNQPNQMHMNPAAAQSPMGMNLPGQQPLSHEPPPTMLPSPTPLGSNIPLHPNAQGTGGSSQNSMMMAPGGPDSLNAPCGPVPSSSQMMSFPPRLQQPHGAMAPTGAGGPGLQQHYPSGMALPPEDLPTQPPGPIPPQQHLMGKGMTGRMGDAYPPGVLPGVASVLNDPELSEVIRPTPTGIPEFDLSRIIPSEKPSSTLQYFPKSENQPPKAQPPNLHLMNLQNMMAEQTPSRPPNLPGQQGVQRGLSMSMCHPGQMSLLGRTGVPPQQGMVPHGLHQGVMSPPQGLMTQQNFMLMKQRGVGGEVYTQPPHMLSPQGSLMGPPPQQNLMVSHPLRQRSVSLDSQMGYLPTPGSMANLPF 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AKVVYVFSTEMANKAAEAVLKGQVETIVSFHI---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2vp7.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . SER 235 235 ? A 21.370 -5.931 43.219 1 1 B SER 0.210 1 ATOM 2 C CA . SER 235 235 ? A 20.138 -5.073 43.050 1 1 B SER 0.210 1 ATOM 3 C C . SER 235 235 ? A 20.607 -3.654 42.790 1 1 B SER 0.210 1 ATOM 4 O O . SER 235 235 ? A 21.740 -3.344 43.102 1 1 B SER 0.210 1 ATOM 5 C CB . SER 235 235 ? A 19.224 -5.150 44.316 1 1 B SER 0.210 1 ATOM 6 O OG . SER 235 235 ? A 19.941 -4.826 45.508 1 1 B SER 0.210 1 ATOM 7 N N . GLN 236 236 ? A 19.778 -2.784 42.170 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 8 C CA . GLN 236 236 ? A 20.200 -1.445 41.819 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 9 C C . GLN 236 236 ? A 18.975 -0.586 42.013 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 10 O O . GLN 236 236 ? A 17.868 -1.018 41.710 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 11 C CB . GLN 236 236 ? A 20.634 -1.377 40.330 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 12 C CG . GLN 236 236 ? A 21.078 0.008 39.801 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 13 C CD . GLN 236 236 ? A 22.374 0.446 40.473 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 14 O OE1 . GLN 236 236 ? A 23.361 -0.285 40.472 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 15 N NE2 . GLN 236 236 ? A 22.388 1.662 41.067 1 1 B GLN 0.550 1 ATOM 16 N N . PHE 237 237 ? A 19.149 0.637 42.546 1 1 B PHE 0.130 1 ATOM 17 C CA . PHE 237 237 ? A 18.084 1.611 42.642 1 1 B PHE 0.130 1 ATOM 18 C C . PHE 237 237 ? A 18.154 2.466 41.399 1 1 B PHE 0.130 1 ATOM 19 O O . PHE 237 237 ? A 19.217 2.958 41.029 1 1 B PHE 0.130 1 ATOM 20 C CB . PHE 237 237 ? A 18.228 2.561 43.856 1 1 B PHE 0.130 1 ATOM 21 C CG . PHE 237 237 ? A 18.107 1.809 45.143 1 1 B PHE 0.130 1 ATOM 22 C CD1 . PHE 237 237 ? A 16.852 1.642 45.744 1 1 B PHE 0.130 1 ATOM 23 C CD2 . PHE 237 237 ? A 19.243 1.293 45.786 1 1 B PHE 0.130 1 ATOM 24 C CE1 . PHE 237 237 ? A 16.732 0.980 46.971 1 1 B PHE 0.130 1 ATOM 25 C CE2 . PHE 237 237 ? A 19.125 0.624 47.009 1 1 B PHE 0.130 1 ATOM 26 C CZ . PHE 237 237 ? A 17.869 0.472 47.606 1 1 B PHE 0.130 1 ATOM 27 N N . VAL 238 238 ? A 17.002 2.638 40.729 1 1 B VAL 0.400 1 ATOM 28 C CA . VAL 238 238 ? A 16.860 3.512 39.588 1 1 B VAL 0.400 1 ATOM 29 C C . VAL 238 238 ? A 15.767 4.496 39.929 1 1 B VAL 0.400 1 ATOM 30 O O . VAL 238 238 ? A 14.866 4.208 40.709 1 1 B VAL 0.400 1 ATOM 31 C CB . VAL 238 238 ? A 16.547 2.796 38.272 1 1 B VAL 0.400 1 ATOM 32 C CG1 . VAL 238 238 ? A 17.673 1.788 37.971 1 1 B VAL 0.400 1 ATOM 33 C CG2 . VAL 238 238 ? A 15.166 2.106 38.283 1 1 B VAL 0.400 1 ATOM 34 N N . TYR 239 239 ? A 15.839 5.708 39.353 1 1 B TYR 0.450 1 ATOM 35 C CA . TYR 239 239 ? A 14.898 6.764 39.658 1 1 B TYR 0.450 1 ATOM 36 C C . TYR 239 239 ? A 13.987 6.943 38.467 1 1 B TYR 0.450 1 ATOM 37 O O . TYR 239 239 ? A 14.431 7.040 37.326 1 1 B TYR 0.450 1 ATOM 38 C CB . TYR 239 239 ? A 15.615 8.090 39.994 1 1 B TYR 0.450 1 ATOM 39 C CG . TYR 239 239 ? A 16.450 7.876 41.223 1 1 B TYR 0.450 1 ATOM 40 C CD1 . TYR 239 239 ? A 15.862 7.903 42.496 1 1 B TYR 0.450 1 ATOM 41 C CD2 . TYR 239 239 ? A 17.818 7.585 41.118 1 1 B TYR 0.450 1 ATOM 42 C CE1 . TYR 239 239 ? A 16.629 7.644 43.640 1 1 B TYR 0.450 1 ATOM 43 C CE2 . TYR 239 239 ? A 18.590 7.342 42.261 1 1 B TYR 0.450 1 ATOM 44 C CZ . TYR 239 239 ? A 17.993 7.370 43.523 1 1 B TYR 0.450 1 ATOM 45 O OH . TYR 239 239 ? A 18.759 7.111 44.674 1 1 B TYR 0.450 1 ATOM 46 N N . VAL 240 240 ? A 12.667 6.950 38.718 1 1 B VAL 0.530 1 ATOM 47 C CA . VAL 240 240 ? A 11.663 6.962 37.677 1 1 B VAL 0.530 1 ATOM 48 C C . VAL 240 240 ? A 11.142 8.373 37.518 1 1 B VAL 0.530 1 ATOM 49 O O . VAL 240 240 ? A 10.639 8.989 38.455 1 1 B VAL 0.530 1 ATOM 50 C CB . VAL 240 240 ? A 10.509 6.014 37.980 1 1 B VAL 0.530 1 ATOM 51 C CG1 . VAL 240 240 ? A 9.558 5.942 36.769 1 1 B VAL 0.530 1 ATOM 52 C CG2 . VAL 240 240 ? A 11.059 4.611 38.303 1 1 B VAL 0.530 1 ATOM 53 N N . PHE 241 241 ? A 11.257 8.923 36.299 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 54 C CA . PHE 241 241 ? A 10.872 10.281 36.008 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 55 C C . PHE 241 241 ? A 9.597 10.255 35.191 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 56 O O . PHE 241 241 ? A 9.494 9.595 34.165 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 57 C CB . PHE 241 241 ? A 11.938 11.030 35.164 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 58 C CG . PHE 241 241 ? A 13.160 11.372 35.969 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 59 C CD1 . PHE 241 241 ? A 13.422 12.708 36.314 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 60 C CD2 . PHE 241 241 ? A 14.082 10.387 36.357 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 61 C CE1 . PHE 241 241 ? A 14.567 13.050 37.039 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 62 C CE2 . PHE 241 241 ? A 15.220 10.723 37.095 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 63 C CZ . PHE 241 241 ? A 15.462 12.056 37.439 1 1 B PHE 0.600 1 ATOM 64 N N . THR 242 242 ? A 8.582 11.025 35.635 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 65 C CA . THR 242 242 ? A 7.471 11.438 34.788 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 66 C C . THR 242 242 ? A 7.976 12.432 33.759 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 67 O O . THR 242 242 ? A 9.055 12.999 33.903 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 68 C CB . THR 242 242 ? A 6.264 12.067 35.511 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 69 O OG1 . THR 242 242 ? A 6.520 13.353 36.062 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 70 C CG2 . THR 242 242 ? A 5.817 11.191 36.683 1 1 B THR 0.650 1 ATOM 71 N N . THR 243 243 ? 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A 6.090 18.194 37.248 1 1 B HIS 0.590 1 ATOM 86 C CE1 . HIS 244 244 ? A 5.604 20.146 36.374 1 1 B HIS 0.590 1 ATOM 87 N NE2 . HIS 244 244 ? A 5.993 19.540 37.523 1 1 B HIS 0.590 1 ATOM 88 N N . LEU 245 245 ? A 8.555 15.711 35.581 1 1 B LEU 0.660 1 ATOM 89 C CA . LEU 245 245 ? A 9.793 15.629 36.339 1 1 B LEU 0.660 1 ATOM 90 C C . LEU 245 245 ? A 11.046 15.717 35.481 1 1 B LEU 0.660 1 ATOM 91 O O . LEU 245 245 ? A 11.988 16.426 35.816 1 1 B LEU 0.660 1 ATOM 92 C CB . LEU 245 245 ? A 9.861 14.326 37.164 1 1 B LEU 0.660 1 ATOM 93 C CG . LEU 245 245 ? A 8.827 14.222 38.301 1 1 B LEU 0.660 1 ATOM 94 C CD1 . LEU 245 245 ? A 8.834 12.803 38.887 1 1 B LEU 0.660 1 ATOM 95 C CD2 . LEU 245 245 ? A 9.042 15.271 39.404 1 1 B LEU 0.660 1 ATOM 96 N N . ALA 246 246 ? A 11.071 15.015 34.329 1 1 B ALA 0.730 1 ATOM 97 C CA . ALA 246 246 ? A 12.177 15.059 33.393 1 1 B ALA 0.730 1 ATOM 98 C C . ALA 246 246 ? A 12.434 16.451 32.811 1 1 B ALA 0.730 1 ATOM 99 O O . ALA 246 246 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #