data_SMR-a1e259576d575317d900dd3af6b5f1eb_2 _entry.id SMR-a1e259576d575317d900dd3af6b5f1eb_2 _struct.entry_id SMR-a1e259576d575317d900dd3af6b5f1eb_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - A0A8C6GNB1/ A0A8C6GNB1_MUSSI, B cell CLL/lymphoma 9-like - Q67FY2/ BCL9L_MOUSE, B-cell CLL/lymphoma 9-like protein Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A0A8C6GNB1, Q67FY2' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 183718.678 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP BCL9L_MOUSE Q67FY2 1 ;MRILANKTRLPHPRRREAPGSPPLSPRGHCPPAPAKPMHPENKLTNHGKTGNGGAQSQHQNVNQGPTCNL GSKGVGAGSHGAKANQISPSNSSLKNPQAGVSPFSSLKGKVKRERSVSVDSGEQREAGTPSLDSEAKEVA PRSKRRCVLERKQPYSGDEWCSGPDSEEDDKPIAAAHNCNVADPAMVTPQLGPGQTAQLPLSESSAPGPQ HGPQPGLRPDVPGGGGGGVPGKPPSQFVYVFTTHLANTAAEAVLQGRAESILAYHQQNVPRAKLDQAPKV PPTPEPLPLNTPSAGTPQSQPPPLPPPPPAPGSAPPALPPEGPPEDTSQDLAPNSVGAASTGGGTGGTHP NTPTAATANNPLPPGGDPGSAPGSALLGEATPTGNGQRNLVGSEGLSKEQLEHRERSLQTLRDIERLLLR SGETEPFLKGPPGGAGEGGPPAQAPSAAQPPPSAPPGGLKKYEEPLQSMISQTQSLGGPPLEHEVPGHPQ GGDMGQQMNMMMQRLGQDSLTPEQVAWRKLQEEYYEEKRRKEEQIGLHGGRPLQDMVGMGGMMGRGPPPP YHSKPGDQWPPGMGAQLRGPMDVQDPMQLRPGPPFPGPRFPGNQMQRVPGFGGMQSMPMEVPMNAMQRPV RPGMAWNEDLPPIGGPSNFAQNAVPYPGGQGEAERFMTPRVREELLRHQLLEKRSMGMQRPLGMAGSGMG QSMEMERMIQAHRQMDPAMFPGQMTGGDGLAGTPMGIEFGGGRGLLSPPMGQSGLREVDPPMGPGNLNMN MNVNMNMNMNLNVQMTPQQQMLMSQKMRGPGDMMGPQGLSPEEMARVRAQNSSGMMGGPQKMLMPSQFPN QGQQGFSGGQGPYQAMPQDMGNTPDMFSPDQSSVPMGTVGTARLSHMPLPPASNPPGSVHLASNRGLGRR PSDLTISINQMGSPGMGHLKSPTLSQVHSPLVTSPSANLKSPQTPSQMVPLPSANPPGPLKSPQVLSSSL GVRSPTGSPSRLKSPSMAVPSPGWVASPKTAMPSPGVSQNKQPPLSINSSSTLGNVEQGALPPSAPRNSS SAPPANPSSGLMNPSLPFTSSPDPTPSQNPLSLMMSQMSKYAMPSSTPLYHNAIKTIATSDDELLPDRPL LPPPPPPQGSGPGISNNQPNQMHMNPAAAQSPMGMNLPGQQPLSHEPPPTMLPSPTPLGSNIPLHPNAQG TGGSSQNSMMMAPGGPDSLNAPCGPVPSSSQMMSFPPRLQQPHGAMAPTGAGGPGLQQHYPSGMALPPED LPTQPPGPIPPQQHLMGKGMTGRMGDAYPPGVLPGVASVLNDPELSEVIRPTPTGIPEFDLSRIIPSEKP SSTLQYFPKSENQPPKAQPPNLHLMNLQNMMAEQTPSRPPNLPGQQGVQRGLSMSMCHPGQMSLLGRTGV PPQQGMVPHGLHQGVMSPPQGLMTQQNFMLMKQRGVGGEVYTQPPHMLSPQGSLMGPPPQQNLMVSHPLR QRSVSLDSQMGYLPTPGSMANLPF ; 'B-cell CLL/lymphoma 9-like protein' 2 1 UNP A0A8C6GNB1_MUSSI A0A8C6GNB1 1 ;MRILANKTRLPHPRRREAPGSPPLSPRGHCPPAPAKPMHPENKLTNHGKTGNGGAQSQHQNVNQGPTCNL GSKGVGAGSHGAKANQISPSNSSLKNPQAGVSPFSSLKGKVKRERSVSVDSGEQREAGTPSLDSEAKEVA PRSKRRCVLERKQPYSGDEWCSGPDSEEDDKPIAAAHNCNVADPAMVTPQLGPGQTAQLPLSESSAPGPQ HGPQPGLRPDVPGGGGGGVPGKPPSQFVYVFTTHLANTAAEAVLQGRAESILAYHQQNVPRAKLDQAPKV PPTPEPLPLNTPSAGTPQSQPPPLPPPPPAPGSAPPALPPEGPPEDTSQDLAPNSVGAASTGGGTGGTHP NTPTAATANNPLPPGGDPGSAPGSALLGEATPTGNGQRNLVGSEGLSKEQLEHRERSLQTLRDIERLLLR SGETEPFLKGPPGGAGEGGPPAQAPSAAQPPPSAPPGGLKKYEEPLQSMISQTQSLGGPPLEHEVPGHPQ GGDMGQQMNMMMQRLGQDSLTPEQVAWRKLQEEYYEEKRRKEEQIGLHGGRPLQDMVGMGGMMGRGPPPP YHSKPGDQWPPGMGAQLRGPMDVQDPMQLRPGPPFPGPRFPGNQMQRVPGFGGMQSMPMEVPMNAMQRPV RPGMAWNEDLPPIGGPSNFAQNAVPYPGGQGEAERFMTPRVREELLRHQLLEKRSMGMQRPLGMAGSGMG QSMEMERMIQAHRQMDPAMFPGQMTGGDGLAGTPMGIEFGGGRGLLSPPMGQSGLREVDPPMGPGNLNMN MNVNMNMNMNLNVQMTPQQQMLMSQKMRGPGDMMGPQGLSPEEMARVRAQNSSGMMGGPQKMLMPSQFPN QGQQGFSGGQGPYQAMPQDMGNTPDMFSPDQSSVPMGTVGTARLSHMPLPPASNPPGSVHLASNRGLGRR PSDLTISINQMGSPGMGHLKSPTLSQVHSPLVTSPSANLKSPQTPSQMVPLPSANPPGPLKSPQVLSSSL GVRSPTGSPSRLKSPSMAVPSPGWVASPKTAMPSPGVSQNKQPPLSINSSSTLGNVEQGALPPSAPRNSS SAPPANPSSGLMNPSLPFTSSPDPTPSQNPLSLMMSQMSKYAMPSSTPLYHNAIKTIATSDDELLPDRPL LPPPPPPQGSGPGISNNQPNQMHMNPAAAQSPMGMNLPGQQPLSHEPPPTMLPSPTPLGSNIPLHPNAQG TGGSSQNSMMMAPGGPDSLNAPCGPVPSSSQMMSFPPRLQQPHGAMAPTGAGGPGLQQHYPSGMALPPED LPTQPPGPIPPQQHLMGKGMTGRMGDAYPPGVLPGVASVLNDPELSEVIRPTPTGIPEFDLSRIIPSEKP SSTLQYFPKSENQPPKAQPPNLHLMNLQNMMAEQTPSRPPNLPGQQGVQRGLSMSMCHPGQMSLLGRTGV PPQQGMVPHGLHQGVMSPPQGLMTQQNFMLMKQRGVGGEVYTQPPHMLSPQGSLMGPPPQQNLMVSHPLR QRSVSLDSQMGYLPTPGSMANLPF ; 'B cell CLL/lymphoma 9-like' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1494 1 1494 2 2 1 1494 1 1494 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . BCL9L_MOUSE Q67FY2 . 1 1494 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2004-10-11 31A9904C5923581C 1 UNP . A0A8C6GNB1_MUSSI A0A8C6GNB1 . 1 1494 10103 'Mus spicilegus (Steppe mouse)' 2022-01-19 31A9904C5923581C # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MRILANKTRLPHPRRREAPGSPPLSPRGHCPPAPAKPMHPENKLTNHGKTGNGGAQSQHQNVNQGPTCNL GSKGVGAGSHGAKANQISPSNSSLKNPQAGVSPFSSLKGKVKRERSVSVDSGEQREAGTPSLDSEAKEVA PRSKRRCVLERKQPYSGDEWCSGPDSEEDDKPIAAAHNCNVADPAMVTPQLGPGQTAQLPLSESSAPGPQ HGPQPGLRPDVPGGGGGGVPGKPPSQFVYVFTTHLANTAAEAVLQGRAESILAYHQQNVPRAKLDQAPKV PPTPEPLPLNTPSAGTPQSQPPPLPPPPPAPGSAPPALPPEGPPEDTSQDLAPNSVGAASTGGGTGGTHP NTPTAATANNPLPPGGDPGSAPGSALLGEATPTGNGQRNLVGSEGLSKEQLEHRERSLQTLRDIERLLLR SGETEPFLKGPPGGAGEGGPPAQAPSAAQPPPSAPPGGLKKYEEPLQSMISQTQSLGGPPLEHEVPGHPQ GGDMGQQMNMMMQRLGQDSLTPEQVAWRKLQEEYYEEKRRKEEQIGLHGGRPLQDMVGMGGMMGRGPPPP YHSKPGDQWPPGMGAQLRGPMDVQDPMQLRPGPPFPGPRFPGNQMQRVPGFGGMQSMPMEVPMNAMQRPV 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B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'B-cell CLL/lymphoma 9 protein {PDB ID=3sl9, label_asym_id=D, auth_asym_id=D, SMTL ID=3sl9.2.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 3sl9, label_asym_id=D' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A D 2 1 D # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 MALGENPDGLSQEQLEHRERSLQTLRDIQRMLFPDEKEFTGAQSGGPQQNPGVLD MALGENPDGLSQEQLEHRERSLQTLRDIQRMLFPDEKEFTGAQSGGPQQNPGVLD # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 8 33 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 3sl9 2023-09-13 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1494 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1494 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 9.88e-06 80.769 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MRILANKTRLPHPRRREAPGSPPLSPRGHCPPAPAKPMHPENKLTNHGKTGNGGAQSQHQNVNQGPTCNLGSKGVGAGSHGAKANQISPSNSSLKNPQAGVSPFSSLKGKVKRERSVSVDSGEQREAGTPSLDSEAKEVAPRSKRRCVLERKQPYSGDEWCSGPDSEEDDKPIAAAHNCNVADPAMVTPQLGPGQTAQLPLSESSAPGPQHGPQPGLRPDVPGGGGGGVPGKPPSQFVYVFTTHLANTAAEAVLQGRAESILAYHQQNVPRAKLDQAPKVPPTPEPLPLNTPSAGTPQSQPPPLPPPPPAPGSAPPALPPEGPPEDTSQDLAPNSVGAASTGGGTGGTHPNTPTAATANNPLPPGGDPGSAPGSALLGEATPTGNGQRNLVGSEGLSKEQLEHRERSLQTLRDIERLLLRSGETEPFLKGPPGGAGEGGPPAQAPSAAQPPPSAPPGGLKKYEEPLQSMISQTQSLGGPPLEHEVPGHPQGGDMGQQMNMMMQRLGQDSLTPEQVAWRKLQEEYYEEKRRKEEQIGLHGGRPLQDMVGMGGMMGRGPPPPYHSKPGDQWPPGMGAQLRGPMDVQDPMQLRPGPPFPGPRFPGNQMQRVPGFGGMQSMPMEVPMNAMQRPVRPGMAWNEDLPPIGGPSNFAQNAVPYPGGQGEAERFMTPRVREELLRHQLLEKRSMGMQRPLGMAGSGMGQSMEMERMIQAHRQMDPAMFPGQMTGGDGLAGTPMGIEFGGGRGLLSPPMGQSGLREVDPPMGPGNLNMNMNVNMNMNMNLNVQMTPQQQMLMSQKMRGPGDMMGPQGLSPEEMARVRAQNSSGMMGGPQKMLMPSQFPNQGQQGFSGGQGPYQAMPQDMGNTPDMFSPDQSSVPMGTVGTARLSHMPLPPASNPPGSVHLASNRGLGRRPSDLTISINQMGSPGMGHLKSPTLSQVHSPLVTSPSANLKSPQTPSQMVPLPSANPPGPLKSPQVLSSSLGVRSPTGSPSRLKSPSMAVPSPGWVASPKTAMPSPGVSQNKQPPLSINSSSTLGNVEQGALPPSAPRNSSSAPPANPSSGLMNPSLPFTSSPDPTPSQNPLSLMMSQMSKYAMPSSTPLYHNAIKTIATSDDELLPDRPLLPPPPPPQGSGPGISNNQPNQMHMNPAAAQSPMGMNLPGQQPLSHEPPPTMLPSPTPLGSNIPLHPNAQGTGGSSQNSMMMAPGGPDSLNAPCGPVPSSSQMMSFPPRLQQPHGAMAPTGAGGPGLQQHYPSGMALPPEDLPTQPPGPIPPQQHLMGKGMTGRMGDAYPPGVLPGVASVLNDPELSEVIRPTPTGIPEFDLSRIIPSEKPSSTLQYFPKSENQPPKAQPPNLHLMNLQNMMAEQTPSRPPNLPGQQGVQRGLSMSMCHPGQMSLLGRTGVPPQQGMVPHGLHQGVMSPPQGLMTQQNFMLMKQRGVGGEVYTQPPHMLSPQGSLMGPPPQQNLMVSHPLRQRSVSLDSQMGYLPTPGSMANLPF 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------DGLSQEQLEHRERSLQTLRDIQRMLF------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 3sl9.2' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . SER 397 397 ? A 30.598 26.827 16.672 1 1 B SER 0.610 1 ATOM 2 C CA . SER 397 397 ? A 31.468 26.667 17.901 1 1 B SER 0.610 1 ATOM 3 C C . SER 397 397 ? A 32.756 27.480 17.831 1 1 B SER 0.610 1 ATOM 4 O O . SER 397 397 ? A 33.045 28.223 18.739 1 1 B SER 0.610 1 ATOM 5 C CB . SER 397 397 ? A 31.653 25.184 18.347 1 1 B SER 0.610 1 ATOM 6 O OG . SER 397 397 ? A 32.252 25.140 19.641 1 1 B SER 0.610 1 ATOM 7 N N . LYS 398 398 ? A 33.512 27.478 16.697 1 1 B LYS 0.510 1 ATOM 8 C CA . LYS 398 398 ? A 34.640 28.387 16.528 1 1 B LYS 0.510 1 ATOM 9 C C . LYS 398 398 ? A 34.209 29.855 16.576 1 1 B LYS 0.510 1 ATOM 10 O O . LYS 398 398 ? A 34.652 30.603 17.423 1 1 B LYS 0.510 1 ATOM 11 C CB . LYS 398 398 ? A 35.330 28.032 15.189 1 1 B LYS 0.510 1 ATOM 12 C CG . LYS 398 398 ? A 35.955 26.626 15.230 1 1 B LYS 0.510 1 ATOM 13 C CD . LYS 398 398 ? A 36.598 26.244 13.889 1 1 B LYS 0.510 1 ATOM 14 C CE . LYS 398 398 ? A 37.261 24.862 13.919 1 1 B LYS 0.510 1 ATOM 15 N NZ . LYS 398 398 ? A 37.819 24.536 12.588 1 1 B LYS 0.510 1 ATOM 16 N N . GLU 399 399 ? A 33.173 30.220 15.778 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 17 C CA . GLU 399 399 ? A 32.558 31.534 15.821 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 18 C C . GLU 399 399 ? A 31.957 31.897 17.187 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 19 O O . GLU 399 399 ? A 32.062 33.011 17.686 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 20 C CB . GLU 399 399 ? A 31.460 31.572 14.738 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 21 C CG . GLU 399 399 ? A 32.009 31.527 13.288 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 22 C CD . GLU 399 399 ? A 30.873 31.461 12.270 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 23 O OE1 . GLU 399 399 ? A 29.713 31.237 12.704 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 24 O OE2 . GLU 399 399 ? A 31.177 31.579 11.059 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 25 N N . GLN 400 400 ? A 31.323 30.910 17.861 1 1 B GLN 0.560 1 ATOM 26 C CA . GLN 400 400 ? A 30.808 31.056 19.215 1 1 B GLN 0.560 1 ATOM 27 C C . GLN 400 400 ? A 31.866 31.312 20.275 1 1 B GLN 0.560 1 ATOM 28 O O . GLN 400 400 ? A 31.649 32.141 21.155 1 1 B GLN 0.560 1 ATOM 29 C CB . GLN 400 400 ? A 30.045 29.799 19.685 1 1 B GLN 0.560 1 ATOM 30 C CG . GLN 400 400 ? A 28.646 29.638 19.048 1 1 B GLN 0.560 1 ATOM 31 C CD . GLN 400 400 ? A 28.031 28.282 19.402 1 1 B GLN 0.560 1 ATOM 32 O OE1 . GLN 400 400 ? A 28.737 27.329 19.701 1 1 B GLN 0.560 1 ATOM 33 N NE2 . GLN 400 400 ? A 26.685 28.176 19.284 1 1 B GLN 0.560 1 ATOM 34 N N . LEU 401 401 ? A 33.021 30.608 20.245 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 35 C CA . LEU 401 401 ? A 34.107 30.793 21.189 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 36 C C . LEU 401 401 ? A 34.705 32.170 21.059 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 37 O O . LEU 401 401 ? A 34.905 32.829 22.066 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 38 C CB . LEU 401 401 ? A 35.209 29.708 21.055 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 39 C CG . LEU 401 401 ? A 34.917 28.350 21.762 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 40 C CD1 . LEU 401 401 ? A 35.824 28.183 22.997 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 41 C CD2 . LEU 401 401 ? A 33.448 28.081 22.161 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 42 N N . GLU 402 402 ? A 34.894 32.663 19.819 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 43 C CA . GLU 402 402 ? A 35.325 34.014 19.540 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 44 C C . GLU 402 402 ? A 34.322 35.061 19.965 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 45 O O . GLU 402 402 ? A 34.693 36.072 20.547 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 46 C CB . GLU 402 402 ? A 35.646 34.176 18.051 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 47 C CG . GLU 402 402 ? A 36.850 33.306 17.625 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 48 C CD . GLU 402 402 ? A 37.122 33.432 16.131 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 49 O OE1 . GLU 402 402 ? A 36.371 34.182 15.452 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 50 O OE2 . GLU 402 402 ? A 38.073 32.762 15.655 1 1 B GLU 0.540 1 ATOM 51 N N . HIS 403 403 ? A 33.000 34.838 19.760 1 1 B HIS 0.520 1 ATOM 52 C CA . HIS 403 403 ? A 31.981 35.689 20.357 1 1 B HIS 0.520 1 ATOM 53 C C . HIS 403 403 ? A 32.050 35.661 21.878 1 1 B HIS 0.520 1 ATOM 54 O O . HIS 403 403 ? A 32.036 36.703 22.513 1 1 B HIS 0.520 1 ATOM 55 C CB . HIS 403 403 ? A 30.538 35.325 19.912 1 1 B HIS 0.520 1 ATOM 56 C CG . HIS 403 403 ? A 29.476 36.129 20.602 1 1 B HIS 0.520 1 ATOM 57 N ND1 . HIS 403 403 ? 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A 29.678 29.197 27.088 1 1 B ARG 0.490 1 ATOM 72 N N . GLU 405 405 ? A 34.785 34.827 23.874 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 73 C CA . GLU 405 405 ? A 36.055 35.436 24.214 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 74 C C . GLU 405 405 ? A 36.028 36.945 24.053 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 75 O O . GLU 405 405 ? A 36.442 37.697 24.925 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 76 C CB . GLU 405 405 ? A 37.166 34.851 23.308 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 77 C CG . GLU 405 405 ? A 38.594 35.326 23.673 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 78 C CD . GLU 405 405 ? A 39.679 34.701 22.797 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 79 O OE1 . GLU 405 405 ? A 39.345 33.871 21.917 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 80 O OE2 . GLU 405 405 ? A 40.861 35.062 23.029 1 1 B GLU 0.530 1 ATOM 81 N N . ARG 406 406 ? A 35.442 37.425 22.937 1 1 B ARG 0.490 1 ATOM 82 C CA . ARG 406 406 ? A 35.192 38.826 22.693 1 1 B ARG 0.490 1 ATOM 83 C C . ARG 406 406 ? A 34.220 39.452 23.677 1 1 B ARG 0.490 1 ATOM 84 O O . ARG 406 406 ? A 34.487 40.518 24.211 1 1 B ARG 0.490 1 ATOM 85 C CB . ARG 406 406 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.535 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 397 SER 1 0.610 2 1 A 398 LYS 1 0.510 3 1 A 399 GLU 1 0.530 4 1 A 400 GLN 1 0.560 5 1 A 401 LEU 1 0.540 6 1 A 402 GLU 1 0.540 7 1 A 403 HIS 1 0.520 8 1 A 404 ARG 1 0.490 9 1 A 405 GLU 1 0.530 10 1 A 406 ARG 1 0.490 11 1 A 407 SER 1 0.540 12 1 A 408 LEU 1 0.540 13 1 A 409 GLN 1 0.540 14 1 A 410 THR 1 0.560 15 1 A 411 LEU 1 0.540 16 1 A 412 ARG 1 0.470 17 1 A 413 ASP 1 0.560 18 1 A 414 ILE 1 0.530 19 1 A 415 GLU 1 0.510 20 1 A 416 ARG 1 0.450 21 1 A 417 LEU 1 0.520 22 1 A 418 LEU 1 0.570 23 1 A 419 LEU 1 0.660 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #