data_SMR-e45a8a576ec1534366289311df8230e2_5 _entry.id SMR-e45a8a576ec1534366289311df8230e2_5 _struct.entry_id SMR-e45a8a576ec1534366289311df8230e2_5 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q62240/ KDM5D_MOUSE, Lysine-specific demethylase 5D Estimated model accuracy of this model is 0.025, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q62240' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 205120.205 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP KDM5D_MOUSE Q62240 1 ;MKPGSDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRIQ RLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKILDLYSLNKIVMEEGGYEAICKDRRWARVAQR LNYPSGKNIGSLLRSHYERIIYPYEIFQSGANLVQCNTDPFDSEERDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSCYS RRGKRLQPEPEPTEEDIEKNPELKKLQIYGAGPKMIGLGLKAKEKTLRKKDSKQPDKEEVTCPATIVVKG EASEFGKVTSAFSDKNLNHSFEPCMKMTMQLRNNHSSTQFMNSYVCRICSRGDEVDKFLLCDGCSDNYHI FCLLPPLSEVPKGVWRCPKCILAECKSPPEAFGFEQATQEYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTEVV EKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVNNSKWDLSPEEKEYAACGWNLNVMPVLDQSVLCHIN ADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEDVMKRLTPELFDSQP DLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPVGRQCIE HYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFPEKLDLNLAVAVHKEMFIMVQEERRLRKTLLEKGITEAEREAFELLP DDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDSLVCLSHINDLCKCSRNRQYLRYRYTLDELPAMLQKLKIRAESFD NWANKVQAALEVEDGRKRSFEELRALESEARDRRFPNSELLQRLKKCLTEAEACISQVLGLISNSEDRLQ TPQITLTELQLLLKQMGTLPCTMHQIDEVKDVLQQVESYQIETREALTSLPYSLEILQSLMEKGQQLRVE VPEAHQLEELLEQAQWLDQVKQALAPSGQRHSLVIMKKLLVMGTKVASSPSVNKARAELQELLTIAECWE EKAHFCLKASQKHSPATLEVIIREAENIPVYLPNIQSLKEALTKAQAWIADVNEIQNGDHYPCLDDLEGL VAVGRDLPVELEELRQLENQVLTAHSWKEKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSVSTKRSRWIEKEMG LYKYDTELLGLSAQDLRDPGSVIMAFKEGEEKEKEGILHLRHINSAKPSPMSSSMNASATSICICGQVCA GVESLQCDLCHDWFHGQCVTVPHLLSSVRASHTSSQLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILSLLVGL QRLSVRLPEGEALQCLTERAIGWQGRARQALASEDVTALLKQLEKSRQQLQDELRHKKPPTLPSGFAFDC LTENSGKDILKEEEELVLNEERIKSSEKIVPKESSCKGDKELLPSLLSQLTGPVLELPEATRAPLEELMM EGDLLEVTLDENYSIWQLLQAGQNPNLERIHTLLELEKPENPGNWSEEQTPERRRQRRQKVVLSRKGEDF TQKELESKRVKSSRIKPKEEKFQKPILGDNVLYTHHTEHTNILKEHINSVQGKDPSPSSSFPSLTPLLHL SYFHQQKL ; 'Lysine-specific demethylase 5D' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1548 1 1548 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . KDM5D_MOUSE Q62240 . 1 1548 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2001-10-24 44AAB94708EA4A02 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MKPGSDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRIQ RLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKILDLYSLNKIVMEEGGYEAICKDRRWARVAQR LNYPSGKNIGSLLRSHYERIIYPYEIFQSGANLVQCNTDPFDSEERDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSCYS RRGKRLQPEPEPTEEDIEKNPELKKLQIYGAGPKMIGLGLKAKEKTLRKKDSKQPDKEEVTCPATIVVKG EASEFGKVTSAFSDKNLNHSFEPCMKMTMQLRNNHSSTQFMNSYVCRICSRGDEVDKFLLCDGCSDNYHI FCLLPPLSEVPKGVWRCPKCILAECKSPPEAFGFEQATQEYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTEVV EKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVNNSKWDLSPEEKEYAACGWNLNVMPVLDQSVLCHIN ADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEDVMKRLTPELFDSQP DLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPVGRQCIE 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;MKPGSDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRIQ RLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKILDLYSLNKIVMEEGGYEAICKDRRWARVAQR LNYPSGKNIGSLLRSHYERIIYPYEIFQSGANLVQCNTDPFDSEERDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSCYS RRGKRLQPEPEPTEEDIEKNPELKKLQIYGAGPKMIGLGLKAKEKTLRKKDSKQPDKEEVTCPATIVVKG EASEFGKVTSAFSDKNLNHSFEPCMKMTMQLRNNHSSTQFMNSYVCRICSRGDEVDKFLLCDGCSDNYHI FCLLPPLSEVPKGVWRCPKCILAECKSPPEAFGFEQATQEYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTEVV EKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVNNSKWDLSPEEKEYAACGWNLNVMPVLDQSVLCHIN ADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEDVMKRLTPELFDSQP DLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPVGRQCIE HYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFPEKLDLNLAVAVHKEMFIMVQEERRLRKTLLEKGITEAEREAFELLP DDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDSLVCLSHINDLCKCSRNRQYLRYRYTLDELPAMLQKLKIRAESFD NWANKVQAALEVEDGRKRSFEELRALESEARDRRFPNSELLQRLKKCLTEAEACISQVLGLISNSEDRLQ TPQITLTELQLLLKQMGTLPCTMHQIDEVKDVLQQVESYQIETREALTSLPYSLEILQSLMEKGQQLRVE VPEAHQLEELLEQAQWLDQVKQALAPSGQRHSLVIMKKLLVMGTKVASSPSVNKARAELQELLTIAECWE EKAHFCLKASQKHSPATLEVIIREAENIPVYLPNIQSLKEALTKAQAWIADVNEIQNGDHYPCLDDLEGL VAVGRDLPVELEELRQLENQVLTAHSWKEKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSVSTKRSRWIEKEMG LYKYDTELLGLSAQDLRDPGSVIMAFKEGEEKEKEGILHLRHINSAKPSPMSSSMNASATSICICGQVCA GVESLQCDLCHDWFHGQCVTVPHLLSSVRASHTSSQLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILSLLVGL QRLSVRLPEGEALQCLTERAIGWQGRARQALASEDVTALLKQLEKSRQQLQDELRHKKPPTLPSGFAFDC LTENSGKDILKEEEELVLNEERIKSSEKIVPKESSCKGDKELLPSLLSQLTGPVLELPEATRAPLEELMM EGDLLEVTLDENYSIWQLLQAGQNPNLERIHTLLELEKPENPGNWSEEQTPERRRQRRQKVVLSRKGEDF TQKELESKRVKSSRIKPKEEKFQKPILGDNVLYTHHTEHTNILKEHINSVQGKDPSPSSSFPSLTPLLHL SYFHQQKL ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 LYS . 1 3 PRO . 1 4 GLY . 1 5 SER . 1 6 ASP . 1 7 ASP . 1 8 PHE . 1 9 LEU . 1 10 PRO . 1 11 PRO . 1 12 PRO . 1 13 GLU . 1 14 CYS . 1 15 PRO . 1 16 VAL . 1 17 PHE . 1 18 GLU . 1 19 PRO . 1 20 SER . 1 21 TRP . 1 22 ALA . 1 23 GLU . 1 24 PHE . 1 25 ARG . 1 26 ASP . 1 27 PRO . 1 28 LEU . 1 29 GLY . 1 30 TYR . 1 31 ILE . 1 32 ALA . 1 33 LYS . 1 34 ILE . 1 35 ARG . 1 36 PRO . 1 37 ILE . 1 38 ALA . 1 39 GLU . 1 40 LYS . 1 41 SER . 1 42 GLY . 1 43 ILE . 1 44 CYS . 1 45 LYS . 1 46 ILE . 1 47 ARG . 1 48 PRO . 1 49 PRO . 1 50 ALA . 1 51 ASP . 1 52 TRP . 1 53 GLN . 1 54 PRO . 1 55 PRO . 1 56 PHE . 1 57 ALA . 1 58 VAL . 1 59 GLU . 1 60 VAL . 1 61 ASP . 1 62 ASN . 1 63 PHE . 1 64 ARG . 1 65 PHE . 1 66 THR . 1 67 PRO . 1 68 ARG . 1 69 ILE . 1 70 GLN . 1 71 ARG . 1 72 LEU . 1 73 ASN . 1 74 GLU . 1 75 LEU . 1 76 GLU . 1 77 ALA . 1 78 GLN . 1 79 THR . 1 80 ARG . 1 81 VAL . 1 82 LYS . 1 83 LEU . 1 84 ASN . 1 85 TYR . 1 86 LEU . 1 87 ASP . 1 88 GLN . 1 89 ILE . 1 90 ALA . 1 91 LYS . 1 92 PHE . 1 93 TRP . 1 94 GLU . 1 95 ILE . 1 96 GLN . 1 97 GLY . 1 98 SER . 1 99 SER . 1 100 LEU . 1 101 LYS . 1 102 ILE . 1 103 PRO . 1 104 ASN . 1 105 VAL . 1 106 GLU . 1 107 ARG . 1 108 LYS . 1 109 ILE . 1 110 LEU . 1 111 ASP . 1 112 LEU . 1 113 TYR . 1 114 SER . 1 115 LEU . 1 116 ASN . 1 117 LYS . 1 118 ILE . 1 119 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A 1 1506 HIS 1506 ? ? ? B . A 1 1507 THR 1507 ? ? ? B . A 1 1508 GLU 1508 ? ? ? B . A 1 1509 HIS 1509 ? ? ? B . A 1 1510 THR 1510 ? ? ? B . A 1 1511 ASN 1511 ? ? ? B . A 1 1512 ILE 1512 ? ? ? B . A 1 1513 LEU 1513 ? ? ? B . A 1 1514 LYS 1514 ? ? ? B . A 1 1515 GLU 1515 ? ? ? B . A 1 1516 HIS 1516 ? ? ? B . A 1 1517 ILE 1517 ? ? ? B . A 1 1518 ASN 1518 ? ? ? B . A 1 1519 SER 1519 ? ? ? B . A 1 1520 VAL 1520 ? ? ? B . A 1 1521 GLN 1521 ? ? ? B . A 1 1522 GLY 1522 ? ? ? B . A 1 1523 LYS 1523 ? ? ? B . A 1 1524 ASP 1524 ? ? ? B . A 1 1525 PRO 1525 ? ? ? B . A 1 1526 SER 1526 ? ? ? B . A 1 1527 PRO 1527 ? ? ? B . A 1 1528 SER 1528 ? ? ? B . A 1 1529 SER 1529 ? ? ? B . A 1 1530 SER 1530 ? ? ? B . A 1 1531 PHE 1531 ? ? ? B . A 1 1532 PRO 1532 ? ? ? B . A 1 1533 SER 1533 ? ? ? B . A 1 1534 LEU 1534 ? ? ? B . A 1 1535 THR 1535 ? ? ? B . A 1 1536 PRO 1536 ? ? ? B . A 1 1537 LEU 1537 ? ? ? B . A 1 1538 LEU 1538 ? ? ? B . A 1 1539 HIS 1539 ? ? ? B . A 1 1540 LEU 1540 ? ? ? B . A 1 1541 SER 1541 ? ? ? B . A 1 1542 TYR 1542 ? ? ? B . A 1 1543 PHE 1543 ? ? ? B . A 1 1544 HIS 1544 ? ? ? B . A 1 1545 GLN 1545 ? ? ? B . A 1 1546 GLN 1546 ? ? ? B . A 1 1547 LYS 1547 ? ? ? B . A 1 1548 LEU 1548 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Design construct XXA_GVDQ {PDB ID=6nz1, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=6nz1.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6nz1, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 5' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSHMGTEDLKYSLERLREILERLEENPSEKQIVEAIRAIVENNAQIVEAIRAIVENNAQIVEILRAIIEA LEAIGVDQKILEEMKKLLKDLKRSLERG ; ;GSHMGTEDLKYSLERLREILERLEENPSEKQIVEAIRAIVENNAQIVEAIRAIVENNAQIVEILRAIIEA LEAIGVDQKILEEMKKLLKDLKRSLERG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 10 90 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6nz1 2024-04-03 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1548 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1548 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 10.000 14.815 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MKPGSDDFLPPPECPVFEPSWAEFRDPLGYIAKIRPIAEKSGICKIRPPADWQPPFAVEVDNFRFTPRIQRLNELEAQTRVKLNYLDQIAKFWEIQGSSLKIPNVERKILDLYSLNKIVMEEGGYEAICKDRRWARVAQRLNYPSGKNIGSLLRSHYERIIYPYEIFQSGANLVQCNTDPFDSEERDKEYKPHSIPLRQSVQPSKFSCYSRRGKRLQPEPEPTEEDIEKNPELKKLQIYGAGPKMIGLGLKAKEKTLRKKDSKQPDKEEVTCPATIVVKGEASEFGKVTSAFSDKNLNHSFEPCMKMTMQLRNNHSSTQFMNSYVCRICSRGDEVDKFLLCDGCSDNYHIFCLLPPLSEVPKGVWRCPKCILAECKSPPEAFGFEQATQEYTLQSFGEMADSFKADYFNMPVHMVPTEVVEKEFWRLVSSIEEDVTVEYGADIHSKEFGSGFPVNNSKWDLSPEEKEYAACGWNLNVMPVLDQSVLCHINADISGMKVPWLYVGMVFSAFCWHIEDHWSYSINYLHWGEPKTWYGVPSLAAEHLEDVMKRLTPELFDSQPDLLHQLVTLMNPNTLMSHGVPVVRTNQCAGEFVITFPRAYHSGFNQGYNFAEAVNFCTADWLPVGRQCIEHYRRLRRYCVFSHEELICKMAAFPEKLDLNLAVAVHKEMFIMVQEERRLRKTLLEKGITEAEREAFELLPDDERQCIKCKTTCFLSALACYDCPDSLVCLSHINDLCKCSRNRQYLRYRYTLDELPAMLQKLKIRAESFDNWANKVQAALEVEDGRKRSFEELRALESEARDRRFPNSELLQRLKKCLTEAEACISQVLGLISNSEDRLQTPQITLTELQLLLKQMGTLPCTMHQIDEVKDVLQQVESYQIETREALTSLPYSLEILQSLMEKGQQLRVEVPEAHQLEELLEQAQWLDQVKQALAPSGQRHSLVIMKKLLVMGTKVASSPSVNKARAELQELLTIAECWEEKAHFCLKASQKHSPATLEVIIREAENIPVYLPNIQSLKEALTKAQAWIADVNEIQNGDHYPCLDDLEGLVAVGRDLPVELEELRQLENQVLTAHSWKEKASKTFLKKNSCYTLLEVLCPCADAGSVSTKRSRWIEKEMGLYKYDTELLGLSAQDLRDPGSVIMAFKEGEEKEKEGILHLRHINSAKPSPMSSSMNASATSICICGQVCAGVESLQCDLCHDWFHGQCVTVPHLLSSVRASHTSSQLLAWWEWDTKFLCPLCMRSRRPRLETILSLLVGLQRLSVRLPEGEALQCLTERAIGWQGRARQALASEDVTALLKQLEKSRQQLQDELRHKKPPTLPSGFAFDCLTENSGKDILKEEEELVLNEERIKSSEKIVPKESSCKGDKELLPSLLSQLTGPVLELPEATRAPLEELMMEGDLLEVTLDENYSIWQLLQAGQNPNLERIHTLLELEKPENPGNWSEEQTPERRRQRRQKVVLSRKGEDFTQKELESKRVKSSRIKPKEEKFQKPILGDNVLYTHHTEHTNILKEHINSVQGKDPSPSSSFPSLTPLLHLSYFHQQKL 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KYSLERLREILERLEENPSEKQIVEAIRAIVENNAQIVEAIRAIVENNAQIVEILRAIIEALEAIGVDQKILEEMKKLLKD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6nz1.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 5' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLN 843 843 ? A 22.359 35.371 51.485 1 1 B GLN 0.350 1 ATOM 2 C CA . GLN 843 843 ? A 21.304 34.638 50.687 1 1 B GLN 0.350 1 ATOM 3 C C . GLN 843 843 ? A 20.652 35.438 49.577 1 1 B GLN 0.350 1 ATOM 4 O O . GLN 843 843 ? A 20.590 34.957 48.463 1 1 B GLN 0.350 1 ATOM 5 C CB . GLN 843 843 ? A 20.202 34.021 51.594 1 1 B GLN 0.350 1 ATOM 6 C CG . GLN 843 843 ? A 19.194 33.070 50.878 1 1 B GLN 0.350 1 ATOM 7 C CD . GLN 843 843 ? A 19.920 31.854 50.298 1 1 B GLN 0.350 1 ATOM 8 O OE1 . GLN 843 843 ? A 20.508 31.096 51.061 1 1 B GLN 0.350 1 ATOM 9 N NE2 . GLN 843 843 ? A 19.939 31.688 48.955 1 1 B GLN 0.350 1 ATOM 10 N N . ILE 844 844 ? A 20.180 36.689 49.838 1 1 B ILE 0.310 1 ATOM 11 C CA . ILE 844 844 ? A 19.533 37.543 48.842 1 1 B ILE 0.310 1 ATOM 12 C C . ILE 844 844 ? A 20.421 37.784 47.621 1 1 B ILE 0.310 1 ATOM 13 O O . ILE 844 844 ? A 20.054 37.473 46.518 1 1 B ILE 0.310 1 ATOM 14 C CB . ILE 844 844 ? A 19.093 38.848 49.510 1 1 B ILE 0.310 1 ATOM 15 C CG1 . ILE 844 844 ? A 17.995 38.533 50.558 1 1 B ILE 0.310 1 ATOM 16 C CG2 . ILE 844 844 ? A 18.599 39.884 48.475 1 1 B ILE 0.310 1 ATOM 17 C CD1 . ILE 844 844 ? A 17.661 39.701 51.493 1 1 B ILE 0.310 1 ATOM 18 N N . THR 845 845 ? A 21.694 38.205 47.875 1 1 B THR 0.610 1 ATOM 19 C CA . THR 845 845 ? A 22.683 38.472 46.840 1 1 B THR 0.610 1 ATOM 20 C C . THR 845 845 ? A 23.025 37.239 46.022 1 1 B THR 0.610 1 ATOM 21 O O . THR 845 845 ? A 23.168 37.277 44.809 1 1 B THR 0.610 1 ATOM 22 C CB . THR 845 845 ? A 23.942 39.119 47.430 1 1 B THR 0.610 1 ATOM 23 O OG1 . THR 845 845 ? A 24.539 38.357 48.473 1 1 B THR 0.610 1 ATOM 24 C CG2 . THR 845 845 ? A 23.551 40.471 48.054 1 1 B THR 0.610 1 ATOM 25 N N . LEU 846 846 ? A 23.089 36.057 46.671 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 26 C CA . LEU 846 846 ? A 23.238 34.787 45.974 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 27 C C . LEU 846 846 ? A 22.067 34.417 45.075 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 28 O O . LEU 846 846 ? A 22.238 33.939 43.959 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 29 C CB . LEU 846 846 ? A 23.481 33.620 46.961 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 30 C CG . LEU 846 846 ? A 23.698 32.237 46.306 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 31 C CD1 . LEU 846 846 ? A 24.880 32.237 45.325 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 32 C CD2 . LEU 846 846 ? A 23.910 31.163 47.379 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 33 N N . THR 847 847 ? A 20.827 34.631 45.554 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 34 C CA . THR 847 847 ? A 19.610 34.424 44.774 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 35 C C . THR 847 847 ? A 19.527 35.341 43.556 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 36 O O . THR 847 847 ? A 19.156 34.909 42.465 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 37 C CB . THR 847 847 ? A 18.347 34.587 45.611 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 38 O OG1 . THR 847 847 ? A 18.318 33.664 46.695 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 39 C CG2 . THR 847 847 ? A 17.078 34.324 44.785 1 1 B THR 0.600 1 ATOM 40 N N . GLU 848 848 ? A 19.915 36.631 43.704 1 1 B GLU 0.590 1 ATOM 41 C CA . GLU 848 848 ? A 20.076 37.590 42.619 1 1 B GLU 0.590 1 ATOM 42 C C . GLU 848 848 ? A 21.100 37.105 41.594 1 1 B GLU 0.590 1 ATOM 43 O O . GLU 848 848 ? A 20.843 37.084 40.394 1 1 B GLU 0.590 1 ATOM 44 C CB . GLU 848 848 ? A 20.471 38.985 43.176 1 1 B GLU 0.590 1 ATOM 45 C CG . GLU 848 848 ? A 19.326 39.678 43.967 1 1 B GLU 0.590 1 ATOM 46 C CD . GLU 848 848 ? A 19.679 40.986 44.690 1 1 B GLU 0.590 1 ATOM 47 O OE1 . GLU 848 848 ? A 20.876 41.314 44.868 1 1 B GLU 0.590 1 ATOM 48 O OE2 . GLU 848 848 ? A 18.699 41.635 45.151 1 1 B GLU 0.590 1 ATOM 49 N N . LEU 849 849 ? A 22.253 36.582 42.068 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 50 C CA . LEU 849 849 ? A 23.259 36.003 41.197 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 51 C C . LEU 849 849 ? A 22.778 34.809 40.376 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 52 O O . LEU 849 849 ? A 23.010 34.705 39.171 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 53 C CB . LEU 849 849 ? A 24.511 35.583 41.997 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 54 C CG . LEU 849 849 ? A 25.725 35.219 41.126 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 55 C CD1 . LEU 849 849 ? A 26.139 36.403 40.246 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 56 C CD2 . LEU 849 849 ? A 26.912 34.836 42.011 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 57 N N . GLN 850 850 ? A 22.033 33.880 41.008 1 1 B GLN 0.650 1 ATOM 58 C CA . GLN 850 850 ? A 21.402 32.740 40.360 1 1 B GLN 0.650 1 ATOM 59 C C . GLN 850 850 ? A 20.366 33.128 39.320 1 1 B GLN 0.650 1 ATOM 60 O O . GLN 850 850 ? A 20.220 32.475 38.286 1 1 B GLN 0.650 1 ATOM 61 C CB . GLN 850 850 ? A 20.725 31.815 41.389 1 1 B GLN 0.650 1 ATOM 62 C CG . GLN 850 850 ? A 21.740 31.068 42.274 1 1 B GLN 0.650 1 ATOM 63 C CD . GLN 850 850 ? A 21.016 30.202 43.300 1 1 B GLN 0.650 1 ATOM 64 O OE1 . GLN 850 850 ? A 19.878 30.450 43.692 1 1 B GLN 0.650 1 ATOM 65 N NE2 . GLN 850 850 ? A 21.693 29.118 43.748 1 1 B GLN 0.650 1 ATOM 66 N N . LEU 851 851 ? A 19.614 34.216 39.592 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 67 C CA . LEU 851 851 ? A 18.718 34.823 38.630 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 68 C C . LEU 851 851 ? A 19.451 35.335 37.395 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 69 O O . LEU 851 851 ? A 19.089 34.989 36.271 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 70 C CB . LEU 851 851 ? A 17.920 35.985 39.272 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 71 C CG . LEU 851 851 ? A 16.938 36.707 38.330 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 72 C CD1 . LEU 851 851 ? A 15.869 35.752 37.781 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 73 C CD2 . LEU 851 851 ? A 16.310 37.913 39.043 1 1 B LEU 0.650 1 ATOM 74 N N . LEU 852 852 ? A 20.551 36.099 37.581 1 1 B LEU 0.660 1 ATOM 75 C CA . LEU 852 852 ? A 21.407 36.565 36.498 1 1 B LEU 0.660 1 ATOM 76 C C . LEU 852 852 ? A 22.047 35.443 35.705 1 1 B LEU 0.660 1 ATOM 77 O O . LEU 852 852 ? A 22.141 35.502 34.484 1 1 B LEU 0.660 1 ATOM 78 C CB . LEU 852 852 ? A 22.529 37.488 37.004 1 1 B LEU 0.660 1 ATOM 79 C CG . LEU 852 852 ? A 22.043 38.849 37.520 1 1 B LEU 0.660 1 ATOM 80 C CD1 . LEU 852 852 ? A 23.224 39.568 38.153 1 1 B LEU 0.660 1 ATOM 81 C CD2 . LEU 852 852 ? A 21.430 39.732 36.427 1 1 B LEU 0.660 1 ATOM 82 N N . LEU 853 853 ? A 22.478 34.367 36.384 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 83 C CA . LEU 853 853 ? A 23.078 33.213 35.749 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 84 C C . LEU 853 853 ? A 22.188 32.488 34.737 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 85 O O . LEU 853 853 ? A 22.593 32.159 33.626 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 86 C CB . LEU 853 853 ? A 23.492 32.203 36.836 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 87 C CG . LEU 853 853 ? A 24.232 30.963 36.309 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 88 C CD1 . LEU 853 853 ? A 25.505 31.366 35.554 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 89 C CD2 . LEU 853 853 ? A 24.558 30.008 37.463 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 90 N N . LYS 854 854 ? A 20.909 32.239 35.101 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 91 C CA . LYS 854 854 ? A 19.924 31.692 34.182 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 92 C C . LYS 854 854 ? A 19.575 32.651 33.066 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 93 O O . LYS 854 854 ? A 19.398 32.248 31.923 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 94 C CB . LYS 854 854 ? A 18.640 31.223 34.899 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 95 C CG . LYS 854 854 ? A 18.879 29.988 35.777 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 96 C CD . LYS 854 854 ? A 17.590 29.524 36.470 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 97 C CE . LYS 854 854 ? A 17.800 28.292 37.352 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 98 N NZ . LYS 854 854 ? A 16.535 27.938 38.032 1 1 B LYS 0.620 1 ATOM 99 N N . GLN 855 855 ? A 19.487 33.963 33.361 1 1 B GLN 0.620 1 ATOM 100 C CA . GLN 855 855 ? A 19.297 34.978 32.345 1 1 B GLN 0.620 1 ATOM 101 C C . GLN 855 855 ? A 20.430 35.004 31.324 1 1 B GLN 0.620 1 ATOM 102 O O . GLN 855 855 ? A 20.184 35.044 30.125 1 1 B GLN 0.620 1 ATOM 103 C CB . GLN 855 855 ? A 19.098 36.363 32.993 1 1 B GLN 0.620 1 ATOM 104 C CG . GLN 855 855 ? A 17.750 36.460 33.740 1 1 B GLN 0.620 1 ATOM 105 C CD . GLN 855 855 ? A 17.607 37.799 34.457 1 1 B GLN 0.620 1 ATOM 106 O OE1 . GLN 855 855 ? A 18.572 38.482 34.783 1 1 B GLN 0.620 1 ATOM 107 N NE2 . GLN 855 855 ? A 16.342 38.204 34.724 1 1 B GLN 0.620 1 ATOM 108 N N . MET 856 856 ? A 21.694 34.895 31.809 1 1 B MET 0.550 1 ATOM 109 C CA . MET 856 856 ? A 22.883 34.796 30.982 1 1 B MET 0.550 1 ATOM 110 C C . MET 856 856 ? A 22.903 33.565 30.109 1 1 B MET 0.550 1 ATOM 111 O O . MET 856 856 ? A 23.159 33.653 28.920 1 1 B MET 0.550 1 ATOM 112 C CB . MET 856 856 ? A 24.178 34.783 31.844 1 1 B MET 0.550 1 ATOM 113 C CG . MET 856 856 ? A 25.524 34.760 31.064 1 1 B MET 0.550 1 ATOM 114 S SD . MET 856 856 ? A 26.147 33.161 30.421 1 1 B MET 0.550 1 ATOM 115 C CE . MET 856 856 ? A 26.409 32.350 32.020 1 1 B MET 0.550 1 ATOM 116 N N . GLY 857 857 ? A 22.607 32.364 30.654 1 1 B GLY 0.610 1 ATOM 117 C CA . GLY 857 857 ? A 22.702 31.159 29.834 1 1 B GLY 0.610 1 ATOM 118 C C . GLY 857 857 ? A 21.583 30.980 28.842 1 1 B GLY 0.610 1 ATOM 119 O O . GLY 857 857 ? A 21.712 30.225 27.884 1 1 B GLY 0.610 1 ATOM 120 N N . THR 858 858 ? A 20.463 31.693 29.055 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 121 C CA . THR 858 858 ? A 19.317 31.724 28.150 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 122 C C . THR 858 858 ? A 19.516 32.690 27.002 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 123 O O . THR 858 858 ? A 19.313 32.330 25.846 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 124 C CB . THR 858 858 ? A 18.020 32.091 28.862 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 125 O OG1 . THR 858 858 ? A 17.682 31.103 29.818 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 126 C CG2 . THR 858 858 ? A 16.815 32.142 27.910 1 1 B THR 0.550 1 ATOM 127 N N . LEU 859 859 ? A 19.950 33.942 27.271 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 128 C CA . LEU 859 859 ? A 20.260 34.888 26.209 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 129 C C . LEU 859 859 ? A 21.635 35.491 26.455 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 130 O O . LEU 859 859 ? A 21.717 36.616 26.946 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 131 C CB . LEU 859 859 ? A 19.218 36.038 26.101 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 132 C CG . LEU 859 859 ? A 17.807 35.597 25.667 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 133 C CD1 . LEU 859 859 ? A 16.807 36.757 25.799 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 134 C CD2 . LEU 859 859 ? A 17.791 35.023 24.240 1 1 B LEU 0.470 1 ATOM 135 N N . PRO 860 860 ? A 22.743 34.812 26.154 1 1 B PRO 0.500 1 ATOM 136 C CA . PRO 860 860 ? A 24.078 35.315 26.445 1 1 B PRO 0.500 1 ATOM 137 C C . PRO 860 860 ? A 24.404 36.640 25.788 1 1 B PRO 0.500 1 ATOM 138 O O . PRO 860 860 ? A 23.989 36.893 24.663 1 1 B PRO 0.500 1 ATOM 139 C CB . PRO 860 860 ? A 25.038 34.206 25.984 1 1 B PRO 0.500 1 ATOM 140 C CG . PRO 860 860 ? A 24.189 32.934 25.931 1 1 B PRO 0.500 1 ATOM 141 C CD . PRO 860 860 ? A 22.773 33.438 25.653 1 1 B PRO 0.500 1 ATOM 142 N N . CYS 861 861 ? A 25.168 37.501 26.482 1 1 B CYS 0.550 1 ATOM 143 C CA . CYS 861 861 ? A 25.515 38.799 25.962 1 1 B CYS 0.550 1 ATOM 144 C C . CYS 861 861 ? A 26.641 39.288 26.837 1 1 B CYS 0.550 1 ATOM 145 O O . CYS 861 861 ? A 26.718 38.924 28.005 1 1 B CYS 0.550 1 ATOM 146 C CB . CYS 861 861 ? A 24.315 39.791 26.061 1 1 B CYS 0.550 1 ATOM 147 S SG . CYS 861 861 ? A 24.591 41.472 25.394 1 1 B CYS 0.550 1 ATOM 148 N N . THR 862 862 ? A 27.525 40.154 26.302 1 1 B THR 0.580 1 ATOM 149 C CA . THR 862 862 ? A 28.640 40.751 27.040 1 1 B THR 0.580 1 ATOM 150 C C . THR 862 862 ? A 28.206 41.581 28.225 1 1 B THR 0.580 1 ATOM 151 O O . THR 862 862 ? A 28.768 41.488 29.307 1 1 B THR 0.580 1 ATOM 152 C CB . THR 862 862 ? A 29.500 41.656 26.173 1 1 B THR 0.580 1 ATOM 153 O OG1 . THR 862 862 ? A 30.006 40.922 25.072 1 1 B THR 0.580 1 ATOM 154 C CG2 . THR 862 862 ? A 30.703 42.222 26.950 1 1 B THR 0.580 1 ATOM 155 N N . MET 863 863 ? A 27.153 42.413 28.062 1 1 B MET 0.530 1 ATOM 156 C CA . MET 863 863 ? A 26.622 43.202 29.158 1 1 B MET 0.530 1 ATOM 157 C C . MET 863 863 ? A 26.088 42.328 30.282 1 1 B MET 0.530 1 ATOM 158 O O . MET 863 863 ? A 26.411 42.537 31.433 1 1 B MET 0.530 1 ATOM 159 C CB . MET 863 863 ? A 25.594 44.254 28.670 1 1 B MET 0.530 1 ATOM 160 C CG . MET 863 863 ? A 26.232 45.378 27.823 1 1 B MET 0.530 1 ATOM 161 S SD . MET 863 863 ? A 27.561 46.303 28.666 1 1 B MET 0.530 1 ATOM 162 C CE . MET 863 863 ? A 26.543 47.088 29.951 1 1 B MET 0.530 1 ATOM 163 N N . HIS 864 864 ? A 25.363 41.238 29.946 1 1 B HIS 0.550 1 ATOM 164 C CA . HIS 864 864 ? A 24.929 40.260 30.934 1 1 B HIS 0.550 1 ATOM 165 C C . HIS 864 864 ? A 26.068 39.571 31.666 1 1 B HIS 0.550 1 ATOM 166 O O . HIS 864 864 ? A 25.987 39.320 32.865 1 1 B HIS 0.550 1 ATOM 167 C CB . HIS 864 864 ? A 24.023 39.204 30.302 1 1 B HIS 0.550 1 ATOM 168 C CG . HIS 864 864 ? A 22.728 39.768 29.848 1 1 B HIS 0.550 1 ATOM 169 N ND1 . HIS 864 864 ? 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A 36.722 35.151 68.833 1 1 B LEU 0.410 1 ATOM 380 O O . LEU 890 890 ? A 36.856 34.585 69.919 1 1 B LEU 0.410 1 ATOM 381 C CB . LEU 890 890 ? A 36.199 33.660 66.787 1 1 B LEU 0.410 1 ATOM 382 C CG . LEU 890 890 ? A 35.166 32.794 66.032 1 1 B LEU 0.410 1 ATOM 383 C CD1 . LEU 890 890 ? A 35.863 32.071 64.867 1 1 B LEU 0.410 1 ATOM 384 C CD2 . LEU 890 890 ? A 34.449 31.789 66.948 1 1 B LEU 0.410 1 ATOM 385 N N . PRO 891 891 ? A 37.510 36.201 68.573 1 1 B PRO 0.410 1 ATOM 386 C CA . PRO 891 891 ? A 38.341 36.952 69.528 1 1 B PRO 0.410 1 ATOM 387 C C . PRO 891 891 ? A 37.600 37.391 70.757 1 1 B PRO 0.410 1 ATOM 388 O O . PRO 891 891 ? A 38.094 37.218 71.853 1 1 B PRO 0.410 1 ATOM 389 C CB . PRO 891 891 ? A 38.850 38.156 68.736 1 1 B PRO 0.410 1 ATOM 390 C CG . PRO 891 891 ? A 38.783 37.743 67.272 1 1 B PRO 0.410 1 ATOM 391 C CD . PRO 891 891 ? A 37.751 36.631 67.205 1 1 B PRO 0.410 1 ATOM 392 N N . TYR 892 892 ? A 36.386 37.946 70.587 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 393 C CA . TYR 892 892 ? A 35.551 38.291 71.724 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 394 C C . TYR 892 892 ? A 35.160 37.077 72.545 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 395 O O . TYR 892 892 ? A 35.178 37.115 73.775 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 396 C CB . TYR 892 892 ? A 34.290 39.086 71.316 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 397 C CG . TYR 892 892 ? A 34.629 40.452 70.789 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 398 C CD1 . TYR 892 892 ? A 35.563 41.285 71.428 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 399 C CD2 . TYR 892 892 ? A 33.958 40.944 69.662 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 400 C CE1 . TYR 892 892 ? A 35.846 42.559 70.925 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 401 C CE2 . TYR 892 892 ? A 34.231 42.225 69.164 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 402 C CZ . TYR 892 892 ? A 35.182 43.031 69.796 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 403 O OH . TYR 892 892 ? A 35.464 44.323 69.318 1 1 B TYR 0.390 1 ATOM 404 N N . SER 893 893 ? A 34.858 35.942 71.884 1 1 B SER 0.450 1 ATOM 405 C CA . SER 893 893 ? A 34.664 34.660 72.548 1 1 B SER 0.450 1 ATOM 406 C C . SER 893 893 ? A 35.891 34.193 73.311 1 1 B SER 0.450 1 ATOM 407 O O . SER 893 893 ? A 35.775 33.739 74.441 1 1 B SER 0.450 1 ATOM 408 C CB . SER 893 893 ? A 34.202 33.518 71.608 1 1 B SER 0.450 1 ATOM 409 O OG . SER 893 893 ? A 32.920 33.811 71.054 1 1 B SER 0.450 1 ATOM 410 N N . LEU 894 894 ? A 37.107 34.340 72.740 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 411 C CA . LEU 894 894 ? A 38.374 34.074 73.412 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 412 C C . LEU 894 894 ? A 38.597 34.921 74.664 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 413 O O . LEU 894 894 ? A 39.024 34.406 75.695 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 414 C CB . LEU 894 894 ? A 39.581 34.248 72.457 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 415 C CG . LEU 894 894 ? A 39.675 33.217 71.313 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 416 C CD1 . LEU 894 894 ? A 40.782 33.613 70.325 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 417 C CD2 . LEU 894 894 ? A 39.960 31.804 71.835 1 1 B LEU 0.540 1 ATOM 418 N N . GLU 895 895 ? A 38.254 36.227 74.617 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 419 C CA . GLU 895 895 ? A 38.295 37.125 75.762 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 420 C C . GLU 895 895 ? A 37.375 36.694 76.902 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 421 O O . GLU 895 895 ? A 37.751 36.687 78.076 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 422 C CB . GLU 895 895 ? A 37.943 38.578 75.338 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 423 C CG . GLU 895 895 ? A 38.952 39.217 74.354 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 424 C CD . GLU 895 895 ? A 40.359 39.176 74.934 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 425 O OE1 . GLU 895 895 ? A 40.586 39.855 75.968 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 426 O OE2 . GLU 895 895 ? A 41.203 38.444 74.358 1 1 B GLU 0.610 1 ATOM 427 N N . ILE 896 896 ? A 36.138 36.261 76.567 1 1 B ILE 0.560 1 ATOM 428 C CA . ILE 896 896 ? A 35.207 35.639 77.507 1 1 B ILE 0.560 1 ATOM 429 C C . ILE 896 896 ? A 35.761 34.334 78.066 1 1 B ILE 0.560 1 ATOM 430 O O . ILE 896 896 ? A 35.710 34.084 79.264 1 1 B ILE 0.560 1 ATOM 431 C CB . ILE 896 896 ? A 33.817 35.420 76.906 1 1 B ILE 0.560 1 ATOM 432 C CG1 . ILE 896 896 ? A 33.182 36.760 76.459 1 1 B ILE 0.560 1 ATOM 433 C CG2 . ILE 896 896 ? A 32.884 34.686 77.905 1 1 B ILE 0.560 1 ATOM 434 C CD1 . ILE 896 896 ? A 32.056 36.569 75.433 1 1 B ILE 0.560 1 ATOM 435 N N . LEU 897 897 ? A 36.368 33.464 77.232 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 436 C CA . LEU 897 897 ? A 37.001 32.246 77.718 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 437 C C . LEU 897 897 ? A 38.127 32.507 78.711 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 438 O O . LEU 897 897 ? A 38.226 31.835 79.736 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 439 C CB . LEU 897 897 ? A 37.550 31.374 76.574 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 440 C CG . LEU 897 897 ? A 36.492 30.781 75.628 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 441 C CD1 . LEU 897 897 ? A 37.224 30.147 74.442 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 442 C CD2 . LEU 897 897 ? A 35.551 29.771 76.299 1 1 B LEU 0.630 1 ATOM 443 N N . GLN 898 898 ? A 38.972 33.526 78.450 1 1 B GLN 0.590 1 ATOM 444 C CA . GLN 898 898 ? A 40.016 33.955 79.366 1 1 B GLN 0.590 1 ATOM 445 C C . GLN 898 898 ? A 39.483 34.466 80.703 1 1 B GLN 0.590 1 ATOM 446 O O . GLN 898 898 ? A 39.996 34.119 81.769 1 1 B GLN 0.590 1 ATOM 447 C CB . GLN 898 898 ? A 40.910 35.053 78.741 1 1 B GLN 0.590 1 ATOM 448 C CG . GLN 898 898 ? A 42.145 35.431 79.600 1 1 B GLN 0.590 1 ATOM 449 C CD . GLN 898 898 ? 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A 39.528 33.396 88.022 1 1 B GLU 0.580 1 ATOM 478 C CB . GLU 902 902 ? A 40.294 35.270 85.372 1 1 B GLU 0.580 1 ATOM 479 C CG . GLU 902 902 ? A 40.301 36.296 86.550 1 1 B GLU 0.580 1 ATOM 480 C CD . GLU 902 902 ? A 41.462 36.193 87.544 1 1 B GLU 0.580 1 ATOM 481 O OE1 . GLU 902 902 ? A 42.486 35.545 87.231 1 1 B GLU 0.580 1 ATOM 482 O OE2 . GLU 902 902 ? A 41.307 36.803 88.639 1 1 B GLU 0.580 1 ATOM 483 N N . LYS 903 903 ? A 37.883 33.489 86.526 1 1 B LYS 0.560 1 ATOM 484 C CA . LYS 903 903 ? A 36.848 33.242 87.518 1 1 B LYS 0.560 1 ATOM 485 C C . LYS 903 903 ? A 37.014 31.939 88.291 1 1 B LYS 0.560 1 ATOM 486 O O . LYS 903 903 ? A 36.830 31.880 89.499 1 1 B LYS 0.560 1 ATOM 487 C CB . LYS 903 903 ? A 35.446 33.225 86.870 1 1 B LYS 0.560 1 ATOM 488 C CG . LYS 903 903 ? A 34.304 33.002 87.877 1 1 B LYS 0.560 1 ATOM 489 C CD . LYS 903 903 ? A 32.928 32.979 87.206 1 1 B LYS 0.560 1 ATOM 490 C CE . LYS 903 903 ? A 31.804 32.709 88.207 1 1 B LYS 0.560 1 ATOM 491 N NZ . LYS 903 903 ? 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A 46.116 27.646 69.032 1 1 B GLN 0.400 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #