data_SMR-a21c6731d85f08034317998f69508abc_6 _entry.id SMR-a21c6731d85f08034317998f69508abc_6 _struct.entry_id SMR-a21c6731d85f08034317998f69508abc_6 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P0DJD0/ RGPD1_HUMAN, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.009, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P0DJD0' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 228394.582 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP RGPD1_HUMAN P0DJD0 1 ;MNVMGFNTDRLAWTRNKLRGFYFAKLYYEAKEYDLAKKYVCTYLSVQERDPRAHRFLGLLYELEENTEKA VECYRRSLELNPPQKDLVLKIAELLCKNDVTDGRAKYWVERAAKLFPGSPAIYKLKEHLLDCEGEDGWNK LFDWIQSELYVRPDDVHMNIRLVELYRSNKRLKDAVARCHEAERNIALRSSLEWNSCVVQTLKEYLESLQ CLESDKSDWRATNTDLLLAYANLMLLTLSTRDVQESRELLESFDSALQSAKSSLGGNDELSATFLEMKGH FYMHAGSLLLKMGQHGNNVQWQALSELAALCYVIAFQVPRPKIKLIKGEAGQNLLEMMACDRLSQSGHML LNLSRGKQDFLKEVVETFANKSGQSVLYNALFSSQSSKDTSFLGSDDIGNIDVQEPELEDLARYDVGAIQ AHNGSLQHLTWLGLQWNSLPALPGIRKWLKQLFHHLPQETSRLETNAPESICILDLEVFLLGVVYTSHLQ LKEKCNSHHSSYQPLCLPLPVCKRLCTERQKSWWDAVCTLIHRKAVPGNSAELRLVVQHEINTLRAQEKH GLQPALLVHWAKCLQKMGRGLNSSYDQQEYIGRSVHYWKKVLPLLKIIKKNSIPEPIDPLFKHFHSVDIQ ASEIVEYEEDAHITFAILDAVHGNIEDAVTAFESIKSVVSYWNLALIFHRKAEDIENDAVFPEEQEECKN YLRKTRDYLIKIIDDSDSNLSVVKKLPVPLESVKEMLKSVMQELEDYSEGGPLYKNGSLRNADSEIKHST PSPTKYSLSPSKSYKYSPKTPPRWAEDQNSLRKMICQEVKAITKLNSSKSASRHRWPTENYGPDSVPDGY QGSQTFHGAPLTVATTGPSVYYSQSPAYNSQYLLRPAANVTPTKGSSNTEFKSTKEGFSIAVSADGFKFG ISEPGNQEKKSEKPLENDTGFQAQDISGQKNGRGVIFGQTSSTFTFADVAKSTSGEGFQFGKKDPNFKGF SGAGEKLFSSQCGKMANKANTSGDFEKDDDACKTEDSDDIHFEPVVQMPEKVELVTGEEGEKVLYSQGVK LFRFDAEISQWKERGLGNLKILKNEVNGKPRMLMRRDQVLKVCANHWITTTMNLKPLSGSDRAWMWLASD FSDGDAKLERLAAQFKTPELAEEFKQKFEECQRLLLDIPLQTPHKLVDTGRAAKLIQRAEEMKSGLKDFK TFLTNDQTKVTEEENKGSGTGAAGASDTTIKPNPENTGPTLEWDNYDLREDALDDNVSSSSVHDSPLASS PVRKNIFRFDESTTGFNFSFKSALSLSKSPAKLNQSGTSVGTDEESDVTQEEERDGQYFEPVVPLPDLVE VSSGEENEQVVFSHRAELYRYDKDVGQWKERGIGDIKILQNYDNKQVRIVMRRDQVLKLCANHRITPDMS LQNMKGTERVWVWTACDFADGERKVEHLAVRFKLQDVADSFKKIFDEAKTAQEKDSLITPHVSRSSTPRE SPCGKIAVAVLEETTRERTDVIQGDDVADAASEVEVSSTSETTTKAVVSPPKFVFGSESVKRIFSSEKSN PFAFGNSSATGSLFGFSFNAPLKSNDSETSSVAQSGSESKVEPKKCELSKNSDIEQSSDSKVKNLSASFP MEESSINYTFKTPEKEPPLWHAEFTKEELVQKLSSTTKSADQLNGLLRETEATSAVLMEQIKLLKSEIRR LERNQEESAANVEHLKNVLLQFIFLKPGSERESLLPVINTMLQLSPEEKGKLAAVAQGLQETSIPKKK ; 'RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1748 1 1748 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . RGPD1_HUMAN P0DJD0 . 1 1748 9606 'Homo sapiens (Human)' 2012-01-25 F714EAF3129B388A # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MNVMGFNTDRLAWTRNKLRGFYFAKLYYEAKEYDLAKKYVCTYLSVQERDPRAHRFLGLLYELEENTEKA VECYRRSLELNPPQKDLVLKIAELLCKNDVTDGRAKYWVERAAKLFPGSPAIYKLKEHLLDCEGEDGWNK LFDWIQSELYVRPDDVHMNIRLVELYRSNKRLKDAVARCHEAERNIALRSSLEWNSCVVQTLKEYLESLQ CLESDKSDWRATNTDLLLAYANLMLLTLSTRDVQESRELLESFDSALQSAKSSLGGNDELSATFLEMKGH FYMHAGSLLLKMGQHGNNVQWQALSELAALCYVIAFQVPRPKIKLIKGEAGQNLLEMMACDRLSQSGHML LNLSRGKQDFLKEVVETFANKSGQSVLYNALFSSQSSKDTSFLGSDDIGNIDVQEPELEDLARYDVGAIQ AHNGSLQHLTWLGLQWNSLPALPGIRKWLKQLFHHLPQETSRLETNAPESICILDLEVFLLGVVYTSHLQ LKEKCNSHHSSYQPLCLPLPVCKRLCTERQKSWWDAVCTLIHRKAVPGNSAELRLVVQHEINTLRAQEKH GLQPALLVHWAKCLQKMGRGLNSSYDQQEYIGRSVHYWKKVLPLLKIIKKNSIPEPIDPLFKHFHSVDIQ 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_entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ASN . 1 3 VAL . 1 4 MET . 1 5 GLY . 1 6 PHE . 1 7 ASN . 1 8 THR . 1 9 ASP . 1 10 ARG . 1 11 LEU . 1 12 ALA . 1 13 TRP . 1 14 THR . 1 15 ARG . 1 16 ASN . 1 17 LYS . 1 18 LEU . 1 19 ARG . 1 20 GLY . 1 21 PHE . 1 22 TYR . 1 23 PHE . 1 24 ALA . 1 25 LYS . 1 26 LEU . 1 27 TYR . 1 28 TYR . 1 29 GLU . 1 30 ALA . 1 31 LYS . 1 32 GLU . 1 33 TYR . 1 34 ASP . 1 35 LEU . 1 36 ALA . 1 37 LYS . 1 38 LYS . 1 39 TYR . 1 40 VAL . 1 41 CYS . 1 42 THR . 1 43 TYR . 1 44 LEU . 1 45 SER . 1 46 VAL . 1 47 GLN . 1 48 GLU . 1 49 ARG . 1 50 ASP . 1 51 PRO . 1 52 ARG . 1 53 ALA . 1 54 HIS . 1 55 ARG . 1 56 PHE . 1 57 LEU . 1 58 GLY . 1 59 LEU . 1 60 LEU . 1 61 TYR . 1 62 GLU . 1 63 LEU . 1 64 GLU . 1 65 GLU . 1 66 ASN . 1 67 THR . 1 68 GLU . 1 69 LYS . 1 70 ALA . 1 71 VAL . 1 72 GLU . 1 73 CYS . 1 74 TYR . 1 75 ARG . 1 76 ARG . 1 77 SER . 1 78 LEU . 1 79 GLU . 1 80 LEU . 1 81 ASN . 1 82 PRO . 1 83 PRO . 1 84 GLN . 1 85 LYS . 1 86 ASP . 1 87 LEU . 1 88 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Trypanosoma cruzi KKT4 117-218 {PDB ID=6zpm, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=6zpm.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6zpm, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 6' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSSLQRYEKLVKECRRLEEELEQKTHEASDASQRVRQLERETTRLMRRVEQLVSAVEGQKQKLDETEAKH KLELAEIENRHELEIQSKMSSHEEALRRLMDARR ; ;GSSLQRYEKLVKECRRLEEELEQKTHEASDASQRVRQLERETTRLMRRVEQLVSAVEGQKQKLDETEAKH KLELAEIENRHELEIQSKMSSHEEALRRLMDARR ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 16 81 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6zpm 2024-06-19 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1748 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1752 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 67.000 17.742 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MNVMGFNTDRLAWTRNKLRGFYFAKLYYEAKEYDLAKKYVCTYLSVQERDPRAHRFLGLLYELEENTEKAVECYRRSLELNPPQKDLVLKIAELLCKNDVTDGRAKYWVERAAKLFPGSPAIYKLKEHLLDCEGEDGWNKLFDWIQSELYVRPDDVHMNIRLVELYRSNKRLKDAVARCHEAERNIALRSSLEWNSCVVQTLKEYLESLQCLESDKSDWRATNTDLLLAYANLMLLTLSTRDVQESRELLESFDSALQSAKSSLGGNDELSATFLEMKGHFYMHAGSLLLKMGQHGNNVQWQALSELAALCYVIAFQVPRPKIKLIKGEAGQNLLEMMACDRLSQSGHMLLNLSRGKQDFLKEVVETFANKSGQSVLYNALFSSQSSKDTSFLGSDDIGNIDVQEPELEDLARYDVGAIQAHNGSLQHLTWLGLQWNSLPALPGIRKWLKQLFHHLPQETSRLETNAPESICILDLEVFLLGVVYTSHLQLKEKCNSHHSSYQPLCLPLPVCKRLCTERQKSWWDAVCTLIHRKAVPGNSAELRLVVQHEINTLRAQEKHGLQPALLVHWAKCLQKMGRGLNSSYDQQEYIGRSVHYWKKVLPLLKIIKKNSIPEPIDPLFKHFHSVDIQASEIVEYEEDAHITFAILDAVHGNIEDAVTAFESIKSVVSYWNLALIFHRKAEDIENDAVFPEEQEECKNYLRKTRDYLIKIIDDSDSNLSVVKKLPVPLESVKEMLKSVMQELEDYSEGGPLYKNGSLRNADSEIKHSTPSPTKYSLSPSKSYKYSPKTPPRWAEDQNSLRKMICQEVKAITKLNSSKSASRHRWPTENYGPDSVPDGYQGSQTFHGAPLTVATTGPSVYYSQSPAYNSQYLLRPAANVTPTKGSSNTEFKSTKEGFSIAVSADGFKFGISEPGNQEKKSEKPLENDTGFQAQDISGQKNGRGVIFGQTSSTFTFADVAKSTSGEGFQFGKKDPNFKGFSGAGEKLFSSQCGKMANKANTSGDFEKDDDACKTEDSDDIHFEPVVQMPEKVELVTGEEGEKVLYSQGVKLFRFDAEISQWKERGLGNLKILKNEVNGKPRMLMRRDQVLKVCANHWITTTMNLKPLSGSDRAWMWLASDFSDGDAKLERLAAQFKTPELAEEFKQKFEECQRLLLDIPLQTPHKLVDTGRAAKLIQRAEEMKSGLKDFKTFLTNDQTKVTEEENKGSGTGAAGASDTTIKPNPENTGPTLEWDNYDLREDALDDNVSSSSVHDSPLASSPVRKNIFRFDESTTGFNFSFKSALSLSKSPAKLNQSGTSVGTDEESDVTQEEERDGQYFEPVVPLPDLVEVSSGEENEQVVFSHRAELYRYDKDVGQWKERGIGDIKILQNYDNKQVRIVMRRDQVLKLCANHRITPDMSLQNMKGTERVWVWTACDFADGERKVEHLAVRFKLQDVADSFKKIFDEAKTAQEKDSLITPHVSRSSTPRESPCGKIAVAVLEETTRERTDVIQGDDVADAASEVEVSSTSETTTKAVVSPPKFVFGSESVKRIFSSEKSNPFAFGNSSATGSLFGFSFNAPLKSNDSETSSVAQSGSESKVEPKKCELSKNSDIEQSSDSKVKNLSASFPMEESSINYTFKTPEKEPPLWHAEFTKEELVQKLSSTTKSADQLNGLLRETEATSAVLMEQIKLLKSEIRRLERNQE----ESAANVEHLKNVLLQFIFLKPGSERESLLPVINTMLQLSPEEKGKLAAVAQGLQETSIPKKK 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------RLEEELEQKTHEASDASQRVRQLERETTRLMRRVEQLVSAVEGQKQKLDETEAKHKLELAEIENRH------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6zpm.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 6' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 1638 1638 ? A 41.643 6.888 174.413 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 2 C CA . GLU 1638 1638 ? A 40.847 5.964 173.544 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 3 C C . GLU 1638 1638 ? A 39.681 6.637 172.820 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 4 O O . GLU 1638 1638 ? A 39.712 6.729 171.598 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 5 C CB . GLU 1638 1638 ? A 40.420 4.728 174.362 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 6 C CG . GLU 1638 1638 ? A 39.746 3.648 173.482 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 7 C CD . GLU 1638 1638 ? A 39.294 2.415 174.273 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 1638 1638 ? A 39.569 2.353 175.488 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 1638 1638 ? A 38.618 1.563 173.640 1 1 A GLU 0.610 1 ATOM 10 N N . LEU 1639 1639 ? A 38.662 7.196 173.525 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 11 C CA . LEU 1639 1639 ? A 37.524 7.891 172.914 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 12 C C . LEU 1639 1639 ? A 37.889 9.032 171.967 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 13 O O . LEU 1639 1639 ? A 37.348 9.128 170.874 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 14 C CB . LEU 1639 1639 ? A 36.608 8.463 174.020 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 15 C CG . LEU 1639 1639 ? A 35.937 7.398 174.906 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 16 C CD1 . LEU 1639 1639 ? A 35.327 8.061 176.149 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 17 C CD2 . LEU 1639 1639 ? A 34.864 6.618 174.129 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 18 N N . VAL 1640 1640 ? A 38.869 9.882 172.347 1 1 A VAL 0.540 1 ATOM 19 C CA . VAL 1640 1640 ? A 39.405 10.945 171.498 1 1 A VAL 0.540 1 ATOM 20 C C . VAL 1640 1640 ? A 39.990 10.438 170.177 1 1 A VAL 0.540 1 ATOM 21 O O . VAL 1640 1640 ? A 39.679 10.942 169.105 1 1 A VAL 0.540 1 ATOM 22 C CB . VAL 1640 1640 ? A 40.467 11.737 172.264 1 1 A VAL 0.540 1 ATOM 23 C CG1 . VAL 1640 1640 ? A 41.137 12.805 171.373 1 1 A VAL 0.540 1 ATOM 24 C CG2 . VAL 1640 1640 ? A 39.803 12.420 173.477 1 1 A VAL 0.540 1 ATOM 25 N N . GLN 1641 1641 ? A 40.821 9.374 170.218 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 26 C CA . GLN 1641 1641 ? A 41.376 8.735 169.034 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 27 C C . GLN 1641 1641 ? A 40.320 8.100 168.143 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 28 O O . GLN 1641 1641 ? A 40.357 8.242 166.923 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 29 C CB . GLN 1641 1641 ? A 42.433 7.679 169.434 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 30 C CG . GLN 1641 1641 ? A 43.708 8.309 170.043 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 31 C CD . GLN 1641 1641 ? A 44.677 7.230 170.533 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 32 O OE1 . GLN 1641 1641 ? A 44.249 6.194 171.042 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 33 N NE2 . GLN 1641 1641 ? A 45.999 7.499 170.437 1 1 A GLN 0.560 1 ATOM 34 N N . LYS 1642 1642 ? A 39.324 7.416 168.749 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 35 C CA . LYS 1642 1642 ? A 38.181 6.873 168.033 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 36 C C . LYS 1642 1642 ? A 37.360 7.949 167.342 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 37 O O . LYS 1642 1642 ? A 37.029 7.810 166.167 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 38 C CB . LYS 1642 1642 ? A 37.270 6.042 168.971 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 39 C CG . LYS 1642 1642 ? A 37.920 4.718 169.397 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 40 C CD . LYS 1642 1642 ? A 37.033 3.892 170.341 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 41 C CE . LYS 1642 1642 ? A 37.681 2.560 170.733 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 42 N NZ . LYS 1642 1642 ? A 36.903 1.874 171.784 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 43 N N . LEU 1643 1643 ? A 37.083 9.071 168.042 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 44 C CA . LEU 1643 1643 ? A 36.422 10.236 167.480 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 45 C C . LEU 1643 1643 ? A 37.199 10.839 166.319 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 46 O O . LEU 1643 1643 ? A 36.644 11.169 165.282 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 47 C CB . LEU 1643 1643 ? A 36.156 11.318 168.556 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 48 C CG . LEU 1643 1643 ? A 35.382 12.563 168.065 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 49 C CD1 . LEU 1643 1643 ? A 34.000 12.232 167.475 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 50 C CD2 . LEU 1643 1643 ? A 35.257 13.590 169.200 1 1 A LEU 0.600 1 ATOM 51 N N . SER 1644 1644 ? A 38.536 10.959 166.417 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 52 C CA . SER 1644 1644 ? A 39.342 11.409 165.288 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 53 C C . SER 1644 1644 ? A 39.294 10.507 164.065 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 54 O O . SER 1644 1644 ? A 39.257 10.985 162.934 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 55 C CB . SER 1644 1644 ? 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A 12.011 12.097 95.520 1 1 A ALA 0.650 1 ATOM 409 O O . ALA 1689 1689 ? A 11.718 11.769 94.372 1 1 A ALA 0.650 1 ATOM 410 C CB . ALA 1689 1689 ? A 11.158 10.880 97.610 1 1 A ALA 0.650 1 ATOM 411 N N . ALA 1690 1690 ? A 12.189 13.401 95.853 1 1 A ALA 0.620 1 ATOM 412 C CA . ALA 1690 1690 ? A 12.011 14.512 94.930 1 1 A ALA 0.620 1 ATOM 413 C C . ALA 1690 1690 ? A 13.007 14.454 93.775 1 1 A ALA 0.620 1 ATOM 414 O O . ALA 1690 1690 ? A 12.653 14.591 92.605 1 1 A ALA 0.620 1 ATOM 415 C CB . ALA 1690 1690 ? A 12.154 15.861 95.675 1 1 A ALA 0.620 1 ATOM 416 N N . ASN 1691 1691 ? A 14.298 14.176 94.081 1 1 A ASN 0.600 1 ATOM 417 C CA . ASN 1691 1691 ? A 15.343 14.028 93.072 1 1 A ASN 0.600 1 ATOM 418 C C . ASN 1691 1691 ? A 15.044 12.915 92.072 1 1 A ASN 0.600 1 ATOM 419 O O . ASN 1691 1691 ? A 15.194 13.103 90.868 1 1 A ASN 0.600 1 ATOM 420 C CB . ASN 1691 1691 ? A 16.753 13.797 93.686 1 1 A ASN 0.600 1 ATOM 421 C CG . ASN 1691 1691 ? A 17.251 15.079 94.344 1 1 A ASN 0.600 1 ATOM 422 O OD1 . 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #