data_SMR-4b95d94ebf7740b26f69e851ae7674cb_7 _entry.id SMR-4b95d94ebf7740b26f69e851ae7674cb_7 _struct.entry_id SMR-4b95d94ebf7740b26f69e851ae7674cb_7 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q7Z7A1 (isoform 2)/ CNTRL_HUMAN, Centriolin Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q7Z7A1 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 237408.900 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CNTRL_HUMAN Q7Z7A1 1 ;MKAQKSGKEQQLDIMNKQYQQLESRLDEILSRIAKETEEIKDLEEQLTEGQIAANEALKKDLEGVISGLQ EYLGTIKGQATQAQNECRKLRDEKETLLQRLTEVEQERDQLEIVAMDAENMRKELAELESALQEQHEVNA SLQQTQGDLSAYEAELEARLNLRDAEANQLKEELEKVTRLTQLEQSALQAELEKERQALKNALGKAQFSE EKEQENSELHAKLKHLQDDNNLLKQQLKDFQNHLNHVVDGLVRPEEVAARVDELRRKLKLGTGEMNIHSP SDVLGKSLADLQKQFSEILARSKWERDEAQVRERKLQEEMALQQEKLATGQEEFRQACERALEARMNFDK RQHEARIQQMENEIHYLQENLKSMEEIQGLTDLQLQEADEEKERILAQLRELEKKKKLEDAKSQEQVFGL DKELKKLKKAVATSDKLATAELTIAKDQLKSLHGTVMKINQERAEELQEAERFSRKAAQAARDLTRAEAE IELLQNLLRQKGEQFRLEMEKTGVGTGANSQVLEIEKLNETMERQRTEIARLQNVLDLTGSDNKGGFENV LEEIAELRREVSYQNDYISSMADPFKRRGYWYFMPPPPSSKVSSHSSQATKDSGVGLKYSASTPVRKPRP GQQDGKEGSQPPPASGYWVYSPIRSGLHKLFPSRDADSGGDSQEESELDDQEEPPFVPPPGYMMYTVLPD GSPVPQGMALYAPPPPLPNNSRPLTPGTVVYGPPPAGAPMVYGPPPPNFSIPFIPMGVLHCNVPEHHNLE NEVSRLEDIMQHLKSKKREERWMRASKRQSEKEMEELHHNIDDLLQEKKSLECEVEELHRTVQKRQQQKD FIDGNVESLMTELEIEKSLKHHEDIVDEIECIEKTLLKRRSELREADRLLAEAESELSCTKEKTKNAVEK FTDAKRSLLQTESDAEELERRAQETAVNLVKADQQLRSLQADAKDLEQHKIKQEEILKEINKIVAAKDSD FQCLSKKKEKLTEELQKLQKDIEMAERNEDHHLQVLKESEVLLQAKRAELEKLKSQVTSQQQEMAVLDRQ LGHKKEELHLLQGSMVQAKADLQEALRLGETEVTEKCNHIREVKSLLEELSFQKGELNVQISERKTQLTL IKQEIEKEEENLQVVLRQMSKHKTELKNILDMLQLENHELQGLKLQHDQRVSELEKTQVAVLEEKLELEN LQQISQQQKGEIEWQKQLLERDKREIERMTAESRALQSCVECLSKEKEDLQEKCDIWEKKLAQTKRVLAA AEENSKMEQSNLEKLELNVRKLQQELDQLNRDKLSLHNDISAMQQQLQEKREAVNSLQEELANVQDHLNL AKQDLLHTTKHQDVLLSEQTRLQKDISEWANRFEDCQKEEETKQQQLQVLQNEIEENKLKLVQQEMMFQR LQKERESEESKLETSKVTLKEQQHQLEKELTDQKSKLDQVLSKVLAAEERVRTLQEEERWCESLEKTLSQ TKRQLSEREQQLVEKSGELLALQKEADSMRADFSLLRNQFLTERKKAEKQVASLKEALKIQRSQLEKNLL EQKQENSCIQKEMATIELVAQDNHERARRLMKELNQMQYEYTELKKQMANQKDLERRQMEISDAMRTLKS EVKDEIRTSLKNLNQFLPELPADLEAILERNENLEGELESLKENLPFTMNEGPFEEKLNFSQVHIMDEHW RGEALREKLRHREDRLKAQLRHCMSKQAEVLIKGKRQTEGTLHSLRRQVDALGELVTSTSADSASSPSLS QLESSLTEDSQLGQNQEKNASAR ; Centriolin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1773 1 1773 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CNTRL_HUMAN Q7Z7A1 Q7Z7A1-2 1 1773 9606 'Homo sapiens (Human)' 2008-03-18 F430B910E219D5E2 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no D ;MKAQKSGKEQQLDIMNKQYQQLESRLDEILSRIAKETEEIKDLEEQLTEGQIAANEALKKDLEGVISGLQ EYLGTIKGQATQAQNECRKLRDEKETLLQRLTEVEQERDQLEIVAMDAENMRKELAELESALQEQHEVNA SLQQTQGDLSAYEAELEARLNLRDAEANQLKEELEKVTRLTQLEQSALQAELEKERQALKNALGKAQFSE EKEQENSELHAKLKHLQDDNNLLKQQLKDFQNHLNHVVDGLVRPEEVAARVDELRRKLKLGTGEMNIHSP SDVLGKSLADLQKQFSEILARSKWERDEAQVRERKLQEEMALQQEKLATGQEEFRQACERALEARMNFDK RQHEARIQQMENEIHYLQENLKSMEEIQGLTDLQLQEADEEKERILAQLRELEKKKKLEDAKSQEQVFGL DKELKKLKKAVATSDKLATAELTIAKDQLKSLHGTVMKINQERAEELQEAERFSRKAAQAARDLTRAEAE IELLQNLLRQKGEQFRLEMEKTGVGTGANSQVLEIEKLNETMERQRTEIARLQNVLDLTGSDNKGGFENV LEEIAELRREVSYQNDYISSMADPFKRRGYWYFMPPPPSSKVSSHSSQATKDSGVGLKYSASTPVRKPRP 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A 1 1643 ASN 1643 ? ? ? D . A 1 1644 LEU 1644 ? ? ? D . A 1 1645 GLU 1645 ? ? ? D . A 1 1646 GLY 1646 ? ? ? D . A 1 1647 GLU 1647 ? ? ? D . A 1 1648 LEU 1648 ? ? ? D . A 1 1649 GLU 1649 ? ? ? D . A 1 1650 SER 1650 ? ? ? D . A 1 1651 LEU 1651 ? ? ? D . A 1 1652 LYS 1652 ? ? ? D . A 1 1653 GLU 1653 ? ? ? D . A 1 1654 ASN 1654 ? ? ? D . A 1 1655 LEU 1655 ? ? ? D . A 1 1656 PRO 1656 ? ? ? D . A 1 1657 PHE 1657 ? ? ? D . A 1 1658 THR 1658 ? ? ? D . A 1 1659 MET 1659 ? ? ? D . A 1 1660 ASN 1660 ? ? ? D . A 1 1661 GLU 1661 ? ? ? D . A 1 1662 GLY 1662 ? ? ? D . A 1 1663 PRO 1663 ? ? ? D . A 1 1664 PHE 1664 ? ? ? D . A 1 1665 GLU 1665 ? ? ? D . A 1 1666 GLU 1666 ? ? ? D . A 1 1667 LYS 1667 ? ? ? D . A 1 1668 LEU 1668 ? ? ? D . A 1 1669 ASN 1669 ? ? ? D . A 1 1670 PHE 1670 ? ? ? D . A 1 1671 SER 1671 ? ? ? D . A 1 1672 GLN 1672 ? ? ? D . A 1 1673 VAL 1673 ? ? ? D . A 1 1674 HIS 1674 ? ? ? D . A 1 1675 ILE 1675 ? ? ? D . A 1 1676 MET 1676 ? ? ? D . A 1 1677 ASP 1677 ? ? ? D . A 1 1678 GLU 1678 ? ? ? D . A 1 1679 HIS 1679 ? ? ? D . A 1 1680 TRP 1680 ? ? ? D . A 1 1681 ARG 1681 ? ? ? D . A 1 1682 GLY 1682 ? ? ? D . A 1 1683 GLU 1683 ? ? ? D . A 1 1684 ALA 1684 ? ? ? D . A 1 1685 LEU 1685 ? ? ? D . A 1 1686 ARG 1686 ? ? ? D . A 1 1687 GLU 1687 ? ? ? D . A 1 1688 LYS 1688 ? ? ? D . A 1 1689 LEU 1689 ? ? ? D . A 1 1690 ARG 1690 ? ? ? D . A 1 1691 HIS 1691 ? ? ? D . A 1 1692 ARG 1692 ? ? ? D . A 1 1693 GLU 1693 ? ? ? D . A 1 1694 ASP 1694 ? ? ? D . A 1 1695 ARG 1695 ? ? ? D . A 1 1696 LEU 1696 ? ? ? D . A 1 1697 LYS 1697 ? ? ? D . A 1 1698 ALA 1698 ? ? ? D . A 1 1699 GLN 1699 ? ? ? D . A 1 1700 LEU 1700 ? ? ? D . A 1 1701 ARG 1701 ? ? ? D . A 1 1702 HIS 1702 ? ? ? D . A 1 1703 CYS 1703 ? ? ? D . A 1 1704 MET 1704 ? ? ? D . A 1 1705 SER 1705 ? ? ? D . A 1 1706 LYS 1706 ? ? ? D . A 1 1707 GLN 1707 ? ? ? D . A 1 1708 ALA 1708 ? ? ? D . A 1 1709 GLU 1709 ? ? ? D . A 1 1710 VAL 1710 ? ? ? D . A 1 1711 LEU 1711 ? ? ? D . A 1 1712 ILE 1712 ? ? ? D . A 1 1713 LYS 1713 ? ? ? D . A 1 1714 GLY 1714 ? ? ? D . A 1 1715 LYS 1715 ? ? ? D . A 1 1716 ARG 1716 ? ? ? D . A 1 1717 GLN 1717 ? ? ? D . A 1 1718 THR 1718 ? ? ? D . A 1 1719 GLU 1719 ? ? ? D . A 1 1720 GLY 1720 ? ? ? D . A 1 1721 THR 1721 ? ? ? D . A 1 1722 LEU 1722 ? ? ? D . A 1 1723 HIS 1723 ? ? ? D . A 1 1724 SER 1724 ? ? ? D . A 1 1725 LEU 1725 ? ? ? D . A 1 1726 ARG 1726 ? ? ? D . A 1 1727 ARG 1727 ? ? ? D . A 1 1728 GLN 1728 ? ? ? D . A 1 1729 VAL 1729 ? ? ? D . A 1 1730 ASP 1730 ? ? ? D . A 1 1731 ALA 1731 ? ? ? D . A 1 1732 LEU 1732 ? ? ? D . A 1 1733 GLY 1733 ? ? ? D . A 1 1734 GLU 1734 ? ? ? D . A 1 1735 LEU 1735 ? ? ? D . A 1 1736 VAL 1736 ? ? ? D . A 1 1737 THR 1737 ? ? ? D . A 1 1738 SER 1738 ? ? ? D . A 1 1739 THR 1739 ? ? ? D . A 1 1740 SER 1740 ? ? ? D . A 1 1741 ALA 1741 ? ? ? D . A 1 1742 ASP 1742 ? ? ? D . A 1 1743 SER 1743 ? ? ? D . A 1 1744 ALA 1744 ? ? ? D . A 1 1745 SER 1745 ? ? ? D . A 1 1746 SER 1746 ? ? ? D . A 1 1747 PRO 1747 ? ? ? D . A 1 1748 SER 1748 ? ? ? D . A 1 1749 LEU 1749 ? ? ? D . A 1 1750 SER 1750 ? ? ? D . A 1 1751 GLN 1751 ? ? ? D . A 1 1752 LEU 1752 ? ? ? D . A 1 1753 GLU 1753 ? ? ? D . A 1 1754 SER 1754 ? ? ? D . A 1 1755 SER 1755 ? ? ? D . A 1 1756 LEU 1756 ? ? ? D . A 1 1757 THR 1757 ? ? ? D . A 1 1758 GLU 1758 ? ? ? D . A 1 1759 ASP 1759 ? ? ? D . A 1 1760 SER 1760 ? ? ? D . A 1 1761 GLN 1761 ? ? ? D . A 1 1762 LEU 1762 ? ? ? D . A 1 1763 GLY 1763 ? ? ? D . A 1 1764 GLN 1764 ? ? ? D . A 1 1765 ASN 1765 ? ? ? D . A 1 1766 GLN 1766 ? ? ? D . A 1 1767 GLU 1767 ? ? ? D . A 1 1768 LYS 1768 ? ? ? D . A 1 1769 ASN 1769 ? ? ? D . A 1 1770 ALA 1770 ? ? ? D . A 1 1771 SER 1771 ? ? ? D . A 1 1772 ALA 1772 ? ? ? D . A 1 1773 ARG 1773 ? ? ? D . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Kinetochore protein NUF2 {PDB ID=8q84, label_asym_id=D, auth_asym_id=G, SMTL ID=8q84.1.D}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8q84, label_asym_id=D' 'target-template alignment' . 4 'model 7' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A D 2 1 G # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MSRNQDVFPILDLQELVICLQSCDFALATQENISRPTSDYMVTLYKQIIENFMGISVESLLNSSNQETGD GHLQEENENIYLDTLNVLVLNKICFKFFENIGVQDFNMTDLYKPEAQRTQRLLSAVVNYARFREERMFDC NSFILQMESLLGQLRSKFDDYNLIQQQLKQYEDVDGDNIPDEQELQKLEEQNKELEIQLKKLTKIQETLS IDYNDYKISKQSIFKDLEALSFQIVELESNRDKLIKISNTDMEELSEGIKELNDLLIQRKKTLDDLTAQQ KNLQDTVTTFETIISELYDVLRIISSEVQESNRTETELVGLKQNLINNKLKLMNVLETGIMYKLEILQEQ LDLQLKNLEKLSQDTKEESRLNDTKLMDLQIKYENEIKPKIDKTDIFIQEELISGKINKLNDEIKQLQKD FEVEVKEIEIEYSLLSGHINKYMNEMLEYMQ ; ;MSRNQDVFPILDLQELVICLQSCDFALATQENISRPTSDYMVTLYKQIIENFMGISVESLLNSSNQETGD GHLQEENENIYLDTLNVLVLNKICFKFFENIGVQDFNMTDLYKPEAQRTQRLLSAVVNYARFREERMFDC NSFILQMESLLGQLRSKFDDYNLIQQQLKQYEDVDGDNIPDEQELQKLEEQNKELEIQLKKLTKIQETLS IDYNDYKISKQSIFKDLEALSFQIVELESNRDKLIKISNTDMEELSEGIKELNDLLIQRKKTLDDLTAQQ KNLQDTVTTFETIISELYDVLRIISSEVQESNRTETELVGLKQNLINNKLKLMNVLETGIMYKLEILQEQ LDLQLKNLEKLSQDTKEESRLNDTKLMDLQIKYENEIKPKIDKTDIFIQEELISGKINKLNDEIKQLQKD FEVEVKEIEIEYSLLSGHINKYMNEMLEYMQ ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 185 285 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8q84 2023-12-20 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1773 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1773 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.061 17.822 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MKAQKSGKEQQLDIMNKQYQQLESRLDEILSRIAKETEEIKDLEEQLTEGQIAANEALKKDLEGVISGLQEYLGTIKGQATQAQNECRKLRDEKETLLQRLTEVEQERDQLEIVAMDAENMRKELAELESALQEQHEVNASLQQTQGDLSAYEAELEARLNLRDAEANQLKEELEKVTRLTQLEQSALQAELEKERQALKNALGKAQFSEEKEQENSELHAKLKHLQDDNNLLKQQLKDFQNHLNHVVDGLVRPEEVAARVDELRRKLKLGTGEMNIHSPSDVLGKSLADLQKQFSEILARSKWERDEAQVRERKLQEEMALQQEKLATGQEEFRQACERALEARMNFDKRQHEARIQQMENEIHYLQENLKSMEEIQGLTDLQLQEADEEKERILAQLRELEKKKKLEDAKSQEQVFGLDKELKKLKKAVATSDKLATAELTIAKDQLKSLHGTVMKINQERAEELQEAERFSRKAAQAARDLTRAEAEIELLQNLLRQKGEQFRLEMEKTGVGTGANSQVLEIEKLNETMERQRTEIARLQNVLDLTGSDNKGGFENVLEEIAELRREVSYQNDYISSMADPFKRRGYWYFMPPPPSSKVSSHSSQATKDSGVGLKYSASTPVRKPRPGQQDGKEGSQPPPASGYWVYSPIRSGLHKLFPSRDADSGGDSQEESELDDQEEPPFVPPPGYMMYTVLPDGSPVPQGMALYAPPPPLPNNSRPLTPGTVVYGPPPAGAPMVYGPPPPNFSIPFIPMGVLHCNVPEHHNLENEVSRLEDIMQHLKSKKREERWMRASKRQSEKEMEELHHNIDDLLQEKKSLECEVEELHRTVQKRQQQKDFIDGNVESLMTELEIEKSLKHHEDIVDEIECIEKTLLKRRSELREADRLLAEAESELSCTKEKTKNAVEKFTDAKRSLLQTESDAEELERRAQETAVNLVKADQQLRSLQADAKDLEQHKIKQEEILKEINKIVAAKDSDFQCLSKKKEKLTEELQKLQKDIEMAERNEDHHLQVLKESEVLLQAKRAELEKLKSQVTSQQQEMAVLDRQLGHKKEELHLLQGSMVQAKADLQEALRLGETEVTEKCNHIREVKSLLEELSFQKGELNVQISERKTQLTLIKQEIEKEEENLQVVLRQMSKHKTELKNILDMLQLENHELQGLKLQHDQRVSELEKTQVAVLEEKLELENLQQISQQQKGEIEWQKQLLERDKREIERMTAESRALQSCVECLSKEKEDLQEKCDIWEKKLAQTKRVLAAAEENSKMEQSNLEKLELNVRKLQQELDQLNRDKLSLHNDISAMQQQLQEKREAVNSLQEELANVQDHLNLAKQDLLHTTKHQDVLLSEQTRLQKDISEWANRFEDCQKEEETKQQQLQVLQNEIEENKLKLVQQEMMFQRLQKERESEESKLETSKVTLKEQQHQLEKELTDQKSKLDQVLSKVLAAEERVRTLQEEERWCESLEKTLSQTKRQLSEREQQLVEKSGELLALQKEADSMRADFSLLRNQFLTERKKAEKQVASLKEALKIQRSQLEKNLLEQKQENSCIQKEMATIELVAQDNHERARRLMKELNQMQYEYTELKKQMANQKDLERRQMEISDAMRTLKSEVKDEIRTSLKNLNQFLPELPADLEAILERNENLEGELESLKENLPFTMNEGPFEEKLNFSQVHIMDEHWRGEALREKLRHREDRLKAQLRHCMSKQAEVLIKGKRQTEGTLHSLRRQVDALGELVTSTSADSASSPSLSQLESSLTEDSQLGQNQEKNASAR 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LQKLEEQNKELEIQLKKLTKIQETLSIDYNDYKISKQSIFKDLEALSFQIVELESNRDKLIKIS----------NTDMEELSEGIKELNDLLIQRKKTLDDLTAQQKNLQD------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8q84.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 7' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ASP 1299 1299 ? A 71.211 223.938 118.905 1 1 D ASP 0.530 1 ATOM 2 C CA . ASP 1299 1299 ? A 71.865 222.933 117.986 1 1 D ASP 0.530 1 ATOM 3 C C . ASP 1299 1299 ? A 72.781 221.910 118.602 1 1 D ASP 0.530 1 ATOM 4 O O . ASP 1299 1299 ? A 72.759 220.749 118.198 1 1 D ASP 0.530 1 ATOM 5 C CB . ASP 1299 1299 ? A 72.497 223.714 116.816 1 1 D ASP 0.530 1 ATOM 6 C CG . ASP 1299 1299 ? A 71.377 224.510 116.134 1 1 D ASP 0.530 1 ATOM 7 O OD1 . ASP 1299 1299 ? A 70.211 224.408 116.622 1 1 D ASP 0.530 1 ATOM 8 O OD2 . ASP 1299 1299 ? A 71.686 225.287 115.223 1 1 D ASP 0.530 1 ATOM 9 N N . ILE 1300 1300 ? A 73.546 222.273 119.649 1 1 D ILE 0.570 1 ATOM 10 C CA . ILE 1300 1300 ? A 74.483 221.389 120.325 1 1 D ILE 0.570 1 ATOM 11 C C . ILE 1300 1300 ? A 73.811 220.116 120.831 1 1 D ILE 0.570 1 ATOM 12 O O . ILE 1300 1300 ? A 74.282 219.015 120.567 1 1 D ILE 0.570 1 ATOM 13 C CB . ILE 1300 1300 ? A 75.163 222.151 121.460 1 1 D ILE 0.570 1 ATOM 14 C CG1 . ILE 1300 1300 ? 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A 118.688 152.295 160.663 1 1 D LEU 0.650 1 ATOM 678 C CD2 . LEU 1380 1380 ? A 120.213 150.805 162.043 1 1 D LEU 0.650 1 ATOM 679 N N . GLN 1381 1381 ? A 115.948 151.344 165.451 1 1 D GLN 0.570 1 ATOM 680 C CA . GLN 1381 1381 ? A 115.331 151.854 166.665 1 1 D GLN 0.570 1 ATOM 681 C C . GLN 1381 1381 ? A 115.357 150.905 167.858 1 1 D GLN 0.570 1 ATOM 682 O O . GLN 1381 1381 ? A 115.410 151.367 169.001 1 1 D GLN 0.570 1 ATOM 683 C CB . GLN 1381 1381 ? A 113.859 152.245 166.403 1 1 D GLN 0.570 1 ATOM 684 C CG . GLN 1381 1381 ? A 113.714 153.493 165.510 1 1 D GLN 0.570 1 ATOM 685 C CD . GLN 1381 1381 ? A 112.249 153.798 165.209 1 1 D GLN 0.570 1 ATOM 686 O OE1 . GLN 1381 1381 ? A 111.368 152.940 165.188 1 1 D GLN 0.570 1 ATOM 687 N NE2 . GLN 1381 1381 ? A 111.961 155.096 164.946 1 1 D GLN 0.570 1 ATOM 688 N N . ASN 1382 1382 ? A 115.248 149.591 167.603 1 1 D ASN 0.550 1 ATOM 689 C CA . ASN 1382 1382 ? A 115.372 148.526 168.588 1 1 D ASN 0.550 1 ATOM 690 C C . ASN 1382 1382 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.610 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1299 ASP 1 0.530 2 1 A 1300 ILE 1 0.570 3 1 A 1301 SER 1 0.600 4 1 A 1302 ALA 1 0.720 5 1 A 1303 MET 1 0.630 6 1 A 1304 GLN 1 0.680 7 1 A 1305 GLN 1 0.720 8 1 A 1306 GLN 1 0.720 9 1 A 1307 LEU 1 0.730 10 1 A 1308 GLN 1 0.740 11 1 A 1309 GLU 1 0.730 12 1 A 1310 LYS 1 0.730 13 1 A 1311 ARG 1 0.660 14 1 A 1312 GLU 1 0.720 15 1 A 1313 ALA 1 0.780 16 1 A 1314 VAL 1 0.740 17 1 A 1315 ASN 1 0.710 18 1 A 1316 SER 1 0.710 19 1 A 1317 LEU 1 0.670 20 1 A 1318 GLN 1 0.650 21 1 A 1319 GLU 1 0.640 22 1 A 1320 GLU 1 0.620 23 1 A 1321 LEU 1 0.580 24 1 A 1322 ALA 1 0.650 25 1 A 1323 ASN 1 0.570 26 1 A 1324 VAL 1 0.550 27 1 A 1325 GLN 1 0.540 28 1 A 1326 ASP 1 0.530 29 1 A 1327 HIS 1 0.480 30 1 A 1328 LEU 1 0.530 31 1 A 1329 ASN 1 0.550 32 1 A 1330 LEU 1 0.480 33 1 A 1331 ALA 1 0.490 34 1 A 1332 LYS 1 0.550 35 1 A 1333 GLN 1 0.510 36 1 A 1334 ASP 1 0.510 37 1 A 1335 LEU 1 0.530 38 1 A 1336 LEU 1 0.510 39 1 A 1337 HIS 1 0.580 40 1 A 1338 THR 1 0.560 41 1 A 1339 THR 1 0.500 42 1 A 1340 LYS 1 0.420 43 1 A 1341 HIS 1 0.410 44 1 A 1342 GLN 1 0.490 45 1 A 1343 ASP 1 0.540 46 1 A 1344 VAL 1 0.670 47 1 A 1345 LEU 1 0.560 48 1 A 1346 LEU 1 0.550 49 1 A 1347 SER 1 0.560 50 1 A 1348 GLU 1 0.560 51 1 A 1349 GLN 1 0.550 52 1 A 1350 THR 1 0.480 53 1 A 1351 ARG 1 0.510 54 1 A 1352 LEU 1 0.490 55 1 A 1353 GLN 1 0.490 56 1 A 1354 LYS 1 0.570 57 1 A 1355 ASP 1 0.580 58 1 A 1356 ILE 1 0.580 59 1 A 1357 SER 1 0.640 60 1 A 1358 GLU 1 0.630 61 1 A 1359 TRP 1 0.550 62 1 A 1360 ALA 1 0.700 63 1 A 1361 ASN 1 0.650 64 1 A 1362 ARG 1 0.580 65 1 A 1363 PHE 1 0.610 66 1 A 1364 GLU 1 0.640 67 1 A 1365 ASP 1 0.650 68 1 A 1366 CYS 1 0.640 69 1 A 1367 GLN 1 0.640 70 1 A 1368 LYS 1 0.660 71 1 A 1369 GLU 1 0.660 72 1 A 1370 GLU 1 0.680 73 1 A 1371 GLU 1 0.680 74 1 A 1372 THR 1 0.700 75 1 A 1373 LYS 1 0.710 76 1 A 1374 GLN 1 0.710 77 1 A 1375 GLN 1 0.710 78 1 A 1376 GLN 1 0.720 79 1 A 1377 LEU 1 0.710 80 1 A 1378 GLN 1 0.680 81 1 A 1379 VAL 1 0.680 82 1 A 1380 LEU 1 0.650 83 1 A 1381 GLN 1 0.570 84 1 A 1382 ASN 1 0.550 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #