data_SMR-3c54187707070924e7451aa92ea8a50e_5
_entry.id SMR-3c54187707070924e7451aa92ea8a50e_5
_struct.entry_id SMR-3c54187707070924e7451aa92ea8a50e_5
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q6A009/ LTN1_MOUSE, E3 ubiquitin-protein ligase listerin

Estimated model accuracy of this model is 0.349, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q6A009'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
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_citation.title
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_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
loop_
_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3
package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 5 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
loop_
_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 230966.741 1 .
#
#
loop_
_struct_ref.id
_struct_ref.entity_id
_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP LTN1_MOUSE Q6A009 1
;MGGKNKQRTKGNLRPSNSGRAAELLAKEQGTVPGFIGFGTSHSDLGYVPAVQGAEDIDSLVDSDFRMVLR
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ALCQHVPQVMKEEAAKVSPSVLLSIDDSDPVVCPALWEAVLYTLTTIEDCWFHVNAKKSVFPKLMAMIRE
GGRGLAAVMYPYLLPFISKLPQSITEPKLDFFKNFLTSLVTGLSTERTKSSSSECSAVISAFFECLRFIM
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SLLRLALSQHVKNDYLIGEVYVGRIIVKLHETLSKTKDLSEAANSDSSVSFVCDVVHSFFSSAGGGLLMP
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GSLHTIQSLCPFLSKEEKKEFSAQCIPAFLGWTKEDLCSINGAFGHLAIFNSCLQTRSIDDKQLLHGILK
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MLQLSTYLTHQNGSIMEGLALWKNNVDKRFEGVEDCMICFSVIHGFNYSLPKKACRTCKKKFHSACLYKW
FTSSNKSTCPLCRETFF
;
'E3 ubiquitin-protein ligase listerin'
#
#
loop_
_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1767 1 1767
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . LTN1_MOUSE Q6A009 . 1 1767 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2011-07-27
EFEC1BAAD32776C6
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no n
;MGGKNKQRTKGNLRPSNSGRAAELLAKEQGTVPGFIGFGTSHSDLGYVPAVQGAEDIDSLVDSDFRMVLR
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;

;MGGKNKQRTKGNLRPSNSGRAAELLAKEQGTVPGFIGFGTSHSDLGYVPAVQGAEDIDSLVDSDFRMVLR
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;

#
#
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_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 GLY .
1 3 GLY .
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1 5 ASN .
1 6 LYS .
1 7 GLN .
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1 9 THR .
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1 12 ASN .
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1 14 ARG .
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1 16 SER .
1 17 ASN .
1 18 SER .
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1 20 ARG .
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1 22 ALA .
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1 24 LEU .
1 25 LEU .
1 26 ALA .
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1 43 SER .
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1 51 VAL .
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1 58 ASP .
1 59 SER .
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1 62 ASP .
1 63 SER .
1 64 ASP .
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1 66 ARG .
1 67 MET .
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1 75 LYS .
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1 79 THR .
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1 92 THR .
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1 95 ASP .
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1 107 PRO .
1 108 ARG .
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1 1650 ILE .
1 1651 ILE .
1 1652 GLN .
1 1653 LEU .
1 1654 PRO .
1 1655 SER .
1 1656 ASN .
1 1657 TYR .
1 1658 PRO .
1 1659 LEU .
1 1660 GLY .
1 1661 SER .
1 1662 ILE .
1 1663 THR .
1 1664 VAL .
1 1665 GLU .
1 1666 SER .
1 1667 GLY .
1 1668 LYS .
1 1669 ARG .
1 1670 ILE .
1 1671 GLY .
1 1672 VAL .
1 1673 ALA .
1 1674 VAL .
1 1675 GLN .
1 1676 GLN .
1 1677 TRP .
1 1678 ARG .
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1 1680 TRP .
1 1681 MET .
1 1682 LEU .
1 1683 GLN .
1 1684 LEU .
1 1685 SER .
1 1686 THR .
1 1687 TYR .
1 1688 LEU .
1 1689 THR .
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1 1691 GLN .
1 1692 ASN .
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1 1695 ILE .
1 1696 MET .
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1 1698 GLY .
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1 1700 ALA .
1 1701 LEU .
1 1702 TRP .
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1 1705 ASN .
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1 1709 ARG .
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1 1712 GLY .
1 1713 VAL .
1 1714 GLU .
1 1715 ASP .
1 1716 CYS .
1 1717 MET .
1 1718 ILE .
1 1719 CYS .
1 1720 PHE .
1 1721 SER .
1 1722 VAL .
1 1723 ILE .
1 1724 HIS .
1 1725 GLY .
1 1726 PHE .
1 1727 ASN .
1 1728 TYR .
1 1729 SER .
1 1730 LEU .
1 1731 PRO .
1 1732 LYS .
1 1733 LYS .
1 1734 ALA .
1 1735 CYS .
1 1736 ARG .
1 1737 THR .
1 1738 CYS .
1 1739 LYS .
1 1740 LYS .
1 1741 LYS .
1 1742 PHE .
1 1743 HIS .
1 1744 SER .
1 1745 ALA .
1 1746 CYS .
1 1747 LEU .
1 1748 TYR .
1 1749 LYS .
1 1750 TRP .
1 1751 PHE .
1 1752 THR .
1 1753 SER .
1 1754 SER .
1 1755 ASN .
1 1756 LYS .
1 1757 SER .
1 1758 THR .
1 1759 CYS .
1 1760 PRO .
1 1761 LEU .
1 1762 CYS .
1 1763 ARG .
1 1764 GLU .
1 1765 THR .
1 1766 PHE .
1 1767 PHE .
#
#
loop_
_struct_asym.id
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.details
A 1 .
#
#
loop_
_pdbx_poly_seq_scheme.asym_id
_pdbx_poly_seq_scheme.entity_id
_pdbx_poly_seq_scheme.seq_id
_pdbx_poly_seq_scheme.mon_id
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_pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num
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_pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id
_pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code
A 1 1 MET 1 ? ? ? n .
A 1 2 GLY 2 ? ? ? n .
A 1 3 GLY 3 ? ? ? n .
A 1 4 LYS 4 ? ? ? n .
A 1 5 ASN 5 ? ? ? n .
A 1 6 LYS 6 ? ? ? n .
A 1 7 GLN 7 ? ? ? n .
A 1 8 ARG 8 ? ? ? n .
A 1 9 THR 9 ? ? ? n .
A 1 10 LYS 10 ? ? ? n .
A 1 11 GLY 11 ? ? ? n .
A 1 12 ASN 12 ? ? ? n .
A 1 13 LEU 13 ? ? ? n .
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A 1 18 SER 18 ? ? ? n .
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A 1 20 ARG 20 ? ? ? n .
A 1 21 ALA 21 ? ? ? n .
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A 1 40 THR 40 ? ? ? n .
A 1 41 SER 41 ? ? ? n .
A 1 42 HIS 42 ? ? ? n .
A 1 43 SER 43 ? ? ? n .
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A 1 47 TYR 47 ? ? ? n .
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A 1 60 LEU 60 ? ? ? n .
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A 1 64 ASP 64 ? ? ? n .
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A 1 71 LYS 71 ? ? ? n .
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A 1 79 THR 79 ? ? ? n .
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A 1 90 MET 90 ? ? ? n .
A 1 91 CYS 91 ? ? ? n .
A 1 92 THR 92 ? ? ? n .
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A 1 104 PRO 104 ? ? ? n .
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A 1 107 PRO 107 ? ? ? n .
A 1 108 ARG 108 ? ? ? n .
A 1 109 ILE 109 ? ? ? n .
A 1 110 PHE 110 ? ? ? n .
A 1 111 CYS 111 ? ? ? n .
A 1 112 LYS 112 ? ? ? n .
A 1 113 ILE 113 ? ? ? n .
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A 1 116 ASP 116 ? ? ? n .
A 1 117 HIS 117 ? ? ? n .
A 1 118 ASP 118 ? ? ? n .
A 1 119 ARG 119 ? ? ? n .
A 1 120 ARG 120 ? ? ? n .
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A 1 122 ARG 122 ? ? ? n .
A 1 123 GLU 123 ? ? ? n .
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A 1 125 THR 125 ? ? ? n .
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A 1 138 LYS 138 ? ? ? n .
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A 1 160 PRO 160 ? ? ? n .
A 1 161 PRO 161 ? ? ? n .
A 1 162 ALA 162 ? ? ? n .
A 1 163 ALA 163 ? ? ? n .
A 1 164 LEU 164 ? ? ? n .
A 1 165 ALA 165 ? ? ? n .
A 1 166 ALA 166 ? ? ? n .
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A 1 169 ALA 169 ? ? ? n .
A 1 170 PHE 170 ? ? ? n .
A 1 171 GLU 171 ? ? ? n .
A 1 172 ALA 172 ? ? ? n .
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A 1 174 PHE 174 ? ? ? n .
A 1 175 PRO 175 ? ? ? n .
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A 1 177 SER 177 ? ? ? n .
A 1 178 LYS 178 ? ? ? n .
A 1 179 GLN 179 ? ? ? n .
A 1 180 PRO 180 ? ? ? n .
A 1 181 GLU 181 ? ? ? n .
A 1 182 ALA 182 ? ? ? n .
A 1 183 ILE 183 ? ? ? n .
A 1 184 ALA 184 ? ? ? n .
A 1 185 PHE 185 ? ? ? n .
A 1 186 CYS 186 ? ? ? n .
A 1 187 LYS 187 ? ? ? n .
A 1 188 GLU 188 ? ? ? n .
A 1 189 GLU 189 ? ? ? n .
A 1 190 ILE 190 ? ? ? n .
A 1 191 THR 191 ? ? ? n .
A 1 192 THR 192 ? ? ? n .
A 1 193 VAL 193 ? ? ? n .
A 1 194 LEU 194 ? ? ? n .
A 1 195 GLN 195 ? ? ? n .
A 1 196 ASP 196 ? ? ? n .
A 1 197 HIS 197 ? ? ? n .
A 1 198 LEU 198 ? ? ? n .
A 1 199 LEU 199 ? ? ? n .
A 1 200 LYS 200 ? ? ? n .
A 1 201 GLU 201 ? ? ? n .
A 1 202 THR 202 ? ? ? n .
A 1 203 PRO 203 ? ? ? n .
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A 1 205 THR 205 ? ? ? n .
A 1 206 LEU 206 ? ? ? n .
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A 1 209 PRO 209 ? ? ? n .
A 1 210 GLN 210 ? ? ? n .
A 1 211 THR 211 ? ? ? n .
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A 1 214 GLU 214 ? ? ? n .
A 1 215 GLU 215 ? ? ? n .
A 1 216 GLU 216 ? ? ? n .
A 1 217 ARG 217 ? ? ? n .
A 1 218 GLU 218 ? ? ? n .
A 1 219 ALA 219 ? ? ? n .
A 1 220 LYS 220 ? ? ? n .
A 1 221 PHE 221 ? ? ? n .
A 1 222 HIS 222 ? ? ? n .
A 1 223 ARG 223 ? ? ? n .
A 1 224 VAL 224 ? ? ? n .
A 1 225 VAL 225 ? ? ? n .
A 1 226 THR 226 ? ? ? n .
A 1 227 CYS 227 ? ? ? n .
A 1 228 SER 228 ? ? ? n .
A 1 229 LEU 229 ? ? ? n .
A 1 230 LEU 230 ? ? ? n .
A 1 231 ALA 231 ? ? ? n .
A 1 232 LEU 232 ? ? ? n .
A 1 233 LYS 233 ? ? ? n .
A 1 234 ARG 234 ? ? ? n .
A 1 235 LEU 235 ? ? ? n .
A 1 236 LEU 236 ? ? ? n .
A 1 237 CYS 237 ? ? ? n .
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A 1 239 LEU 239 ? ? ? n .
A 1 240 PRO 240 ? ? ? n .
A 1 241 ASN 241 ? ? ? n .
A 1 242 ASN 242 ? ? ? n .
A 1 243 GLU 243 ? ? ? n .
A 1 244 LEU 244 ? ? ? n .
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A 1 246 SER 246 ? ? ? n .
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A 1 255 LEU 255 ? ? ? n .
A 1 256 SER 256 ? ? ? n .
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A 1 258 ASN 258 ? ? ? n .
A 1 259 LYS 259 ? ? ? n .
A 1 260 PHE 260 ? ? ? n .
A 1 261 TRP 261 ? ? ? n .
A 1 262 LYS 262 ? ? ? n .
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A 1 264 GLY 264 ? ? ? n .
A 1 265 LYS 265 ? ? ? n .
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A 1 267 SER 267 ? ? ? n .
A 1 268 VAL 268 ? ? ? n .
A 1 269 PRO 269 ? ? ? n .
A 1 270 GLN 270 ? ? ? n .
A 1 271 VAL 271 ? ? ? n .
A 1 272 ARG 272 ? ? ? n .
A 1 273 SER 273 ? ? ? n .
A 1 274 ALA 274 ? ? ? n .
A 1 275 TYR 275 ? ? ? n .
A 1 276 PHE 276 ? ? ? n .
A 1 277 GLU 277 ? ? ? n .
A 1 278 LEU 278 ? ? ? n .
A 1 279 VAL 279 ? ? ? n .
A 1 280 SER 280 ? ? ? n .
A 1 281 ALA 281 ? ? ? n .
A 1 282 LEU 282 ? ? ? n .
A 1 283 CYS 283 ? ? ? n .
A 1 284 GLN 284 ? ? ? n .
A 1 285 HIS 285 ? ? ? n .
A 1 286 VAL 286 ? ? ? n .
A 1 287 PRO 287 ? ? ? n .
A 1 288 GLN 288 ? ? ? n .
A 1 289 VAL 289 ? ? ? n .
A 1 290 MET 290 ? ? ? n .
A 1 291 LYS 291 ? ? ? n .
A 1 292 GLU 292 ? ? ? n .
A 1 293 GLU 293 ? ? ? n .
A 1 294 ALA 294 ? ? ? n .
A 1 295 ALA 295 ? ? ? n .
A 1 296 LYS 296 ? ? ? n .
A 1 297 VAL 297 ? ? ? n .
A 1 298 SER 298 ? ? ? n .
A 1 299 PRO 299 ? ? ? n .
A 1 300 SER 300 ? ? ? n .
A 1 301 VAL 301 ? ? ? n .
A 1 302 LEU 302 ? ? ? n .
A 1 303 LEU 303 ? ? ? n .
A 1 304 SER 304 ? ? ? n .
A 1 305 ILE 305 ? ? ? n .
A 1 306 ASP 306 ? ? ? n .
A 1 307 ASP 307 ? ? ? n .
A 1 308 SER 308 ? ? ? n .
A 1 309 ASP 309 ? ? ? n .
A 1 310 PRO 310 ? ? ? n .
A 1 311 VAL 311 ? ? ? n .
A 1 312 VAL 312 ? ? ? n .
A 1 313 CYS 313 ? ? ? n .
A 1 314 PRO 314 ? ? ? n .
A 1 315 ALA 315 ? ? ? n .
A 1 316 LEU 316 ? ? ? n .
A 1 317 TRP 317 ? ? ? n .
A 1 318 GLU 318 ? ? ? n .
A 1 319 ALA 319 ? ? ? n .
A 1 320 VAL 320 ? ? ? n .
A 1 321 LEU 321 ? ? ? n .
A 1 322 TYR 322 ? ? ? n .
A 1 323 THR 323 ? ? ? n .
A 1 324 LEU 324 ? ? ? n .
A 1 325 THR 325 ? ? ? n .
A 1 326 THR 326 ? ? ? n .
A 1 327 ILE 327 ? ? ? n .
A 1 328 GLU 328 ? ? ? n .
A 1 329 ASP 329 ? ? ? n .
A 1 330 CYS 330 ? ? ? n .
A 1 331 TRP 331 ? ? ? n .
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A 1 333 HIS 333 ? ? ? n .
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A 1 335 ASN 335 ? ? ? n .
A 1 336 ALA 336 ? ? ? n .
A 1 337 LYS 337 ? ? ? n .
A 1 338 LYS 338 ? ? ? n .
A 1 339 SER 339 ? ? ? n .
A 1 340 VAL 340 ? ? ? n .
A 1 341 PHE 341 ? ? ? n .
A 1 342 PRO 342 ? ? ? n .
A 1 343 LYS 343 ? ? ? n .
A 1 344 LEU 344 ? ? ? n .
A 1 345 MET 345 ? ? ? n .
A 1 346 ALA 346 ? ? ? n .
A 1 347 MET 347 ? ? ? n .
A 1 348 ILE 348 ? ? ? n .
A 1 349 ARG 349 ? ? ? n .
A 1 350 GLU 350 ? ? ? n .
A 1 351 GLY 351 ? ? ? n .
A 1 352 GLY 352 ? ? ? n .
A 1 353 ARG 353 ? ? ? n .
A 1 354 GLY 354 ? ? ? n .
A 1 355 LEU 355 ? ? ? n .
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#
#
loop_
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_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1 'Listerin {PDB ID=3j92, label_asym_id=XA, auth_asym_id=0, SMTL ID=3j92.1.n}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by BLAST to 3j92, label_asym_id=XA'
'target-template alignment' .
4 'model 5' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
3 1 6
4 2 7
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9 4 3
10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
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_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
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_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
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1.000000 0 0 0
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_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
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_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A XA 45 1 0
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#
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_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
;MGGKNKQRTKGNLRPSNSGRAAELLAKEQGTVPGFIGFGTSQSDLGYVPAIQGAEEIDSLVDSDFRMVLR
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TVPEEEREAKFYRVVTCSLLALKRLLCLLPDNELDSLEEKFKSLLSQNKFWKYGKHSVPQIRSAYFELVS
ALCQRIPQLMKEEASKVSPSVLLSIDDSDPIVCPALWEAVLYTLTTIEDCWLHVNAKKSVFPKLSTVIRE
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PSSEDLLLTLFQLCAQSKEKTHLPDFLICKLKNTWLSGVNLLVHQTDSSYKESTFLHLSALWLKNQVQAS
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CFKTDFKEQDIKTLPSHLCTSALLSKMVLIALRKETVLENNELEKIIAELLYSLQWCEELDNPPIFLIGF
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TSSNKSTCPLCRETFF
;

;MGGKNKQRTKGNLRPSNSGRAAELLAKEQGTVPGFIGFGTSQSDLGYVPAIQGAEEIDSLVDSDFRMVLR
KLSKKDVTTKLKAMQEFGTMCTERDTETVKGVLPYWPRIFCKISLDHDRRVREATQQAFEKLILKVKKQL
APYLKSLMGYWLMAQCDTYTPAAFAAKDAFEAAFPPSKQPEAIAFCKDEITSVLQDHLIKETPDTLSDPQ
TVPEEEREAKFYRVVTCSLLALKRLLCLLPDNELDSLEEKFKSLLSQNKFWKYGKHSVPQIRSAYFELVS
ALCQRIPQLMKEEASKVSPSVLLSIDDSDPIVCPALWEAVLYTLTTIEDCWLHVNAKKSVFPKLSTVIRE
GGRGLATVIYPYLLPFISKLPQSITNPKLDFFKNFLTSLVAGLSTERTKTSSLESSAVISAFFECLRFIM
QQNLGEEEIEQMLVNDQLIPFIDAVLKDPGLQHGQLFNHLAETLSSWEAKADTEKDEKTAHNLENVLIHF
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WTLLSLVLSQHVKNDYLIGDVYVERIIVRLHETLFKTKKLSEAESSDSSVSFICDVAYNYFSSAKGCLLM
PSSEDLLLTLFQLCAQSKEKTHLPDFLICKLKNTWLSGVNLLVHQTDSSYKESTFLHLSALWLKNQVQAS
SLDINSLQVLLSAVDDLLNTLLESEDSYLMGVYIGSVMPNDSEWEKMRQSLPMQWLHRPLLEGRLSLNYE
CFKTDFKEQDIKTLPSHLCTSALLSKMVLIALRKETVLENNELEKIIAELLYSLQWCEELDNPPIFLIGF
CEILQKMNITYDNLRVLGNTSGLLQLLFNRSREHGTLWSLIIAKLILSRSISSDEVKPHYKRKESFFPLT
EGNLHTIQSLCPFLSKEEKKEFSAQCIPALLGWTKKDLCSTNGGFGHLAIFNSCLQTKSIDDGELLHGIL
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NQALYSIPLVQLFACVSCDLACDLSAFFDSTTLDTIGNLPVNLISEWKEFFSQGIHSLLLPILVTVTGEN
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ISSVQTSTQLFNGMTVKARATTREVMATYTIEDIVIELIIQLPSNYPLGSIIVESGKRVGVAVQQWRNWM
LQLSTYLTHQNGSIMEGLALWKNNVDKRFEGVEDCMICFSVIHGFNYSLPKKACRTCKKKFHSACLYKWF
TSSNKSTCPLCRETFF
;

#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 1 1766
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
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1 PDB . 3j92 2024-10-30
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_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 1767
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#
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1 3 1 1768 'target-template pairwise alignment' local
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#
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1 1 1 A 'BLAST e-value' . 0 85.496
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
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#
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1 1 1
MGGKNKQRTKGNLRPSNSGRAAELLAKEQGTVPGFIGFGTSHSDLGYVPAVQGAEDIDSLVDSDFRMVLRKLSKKDVTTKLKAMQEFGIMCTERDTEAVKGVLPYWPRIFCKISLDHDRRVREATQQAFEKLILKVKKHLAPYLKSVMGYWLMAQCDTYPPAALAAKDAFEAAFPPSKQPEAIAFCKEEITTVLQDHLLKETPDTLSDPQTVPEEEREAKFHRVVTCSLLALKRLLCFLPNNELDSLEEKFKSLLSQNKFWKYGKHSVPQVRSAYFELVSALCQHVPQVMKEEAAKVSPSVLLSIDDSDPVVCPALWEAVLYTLTTIEDCWFHVNAKKSVFPKLMAMIREGGRGLAAVMYPYLLPFISKLPQSITEPKLDFFKNFLTSLVTGLSTERTKSSSSECSAVISAFFECLRFIMQQNLGEEEMVQMLINEQLIPFIDTVLKDSGLHHGPMFDHLADTLSSWEAKADAERDPGAVYNLENVLLSFWGRLSEICTEKIRQPEADVKSVLCVSSLVGVLQRPRSSLKLHRKKTAQVRFAINIPEAHKGDEKSMSSEGENSEGSDGGAQSPLSNTSSDLVSPLRKKPLEDLVCKLAEVSISFVNERKSEQHLQFLSTLLDSFSSVQVFNILLSDKQKNVVKAKPLEITKLAEKNPAVKFLYHKLIGWLNDSQKEDGGFLVDILYSALRCCDSGVERKEVLDDLTKEDLKWSSLLQVIEKACSSSDKHALVTPWLKGSILGEKLVALADCLCDKDLEA-TTSESHSSEQWSLLRLALSQHVKNDYLIGEVYVGRIIVKLHETLSKTKDLSEAANSDSSVSFVCDVVHSFFSSAGGGLLMPPSEDLLLTLFQLCAQSKERTHLPDFLICKLKNTLLSGVNLLVHQTASTYEQSTFLRLSVLWLKDQVQSSALDNTSLQVLLSAAGDLLGTLVESEDTSLLGVYIGSVMPSDSEWEKMRQALPVQWLHRPLLEGRLSLNYECFKTDFKEQDTKTLPNHLCTSSLLSKMILVAQKKKLVLEDNVLEKIIAELLYSLQWCEELDNAPSFLSGFCGILQKMNITYSNLSVLSETSSLLQLLFDRSRKNGTLWSLIIAKLILSRSISSDEVKPYYKRKESFFPLTEGSLHTIQSLCPFLSKEEKKEFSAQCIPAFLGWTKEDLCSINGAFGHLAIFNSCLQTRSIDDKQLLHGILKIITSWRKQHEDIFLFSCNLSEASPEVLGLNIEIMRFLSLFLKHCAYPLPLADSEWDFIMCSMLAWLETTSENQALYSVPLVQLFACVSFDLACDLCAFFDSITPDIVDNLPVNLISEWKEFFSKGIHSLLLPLLVNAIGENKDLSETSFQNAMLKPMCETLTYISKDQLLSHKLPARLVASQKTNLPEHLQTLLNTLTPLLLFRARPVQIAAYHMLCKLMPELPQHDQDNLRSYGDEEEEPALSPPAALMSLLSSQEELLENVLGCVPVGQIVTVKPLSEDFCYVLGYLLTWKLILTFFKAASSQLRALYSMYLRKTKSLNKLLYHLFRLMPENPTYGETAIEVSSKDPKTFFTEEVQLSIRETATLPYHIPHLACSVYHMTLKDLPAMVRLWWNSSEKRVFNIVDRFTSKYVSNVLSFQEISSVQTSTQLFNGMTVKARATTREVMATYTIEDIVIELIIQLPSNYPLGSITVESGKRIGVAVQQWRNWMLQLSTYLTHQNGSIMEGLALWKNNVDKRFEGVEDCMICFSVIHGFNYSLPKKACRTCKKKFHSACLYKWFTSSNKSTCPLCRETFF
2 1 2
MGGKNKQRTKGNLRPSNSGRAAELLAKEQGTVPGFIGFGTSQSDLGYVPAIQGAEEIDSLVDSDFRMVLRKLSKKDVTTKLKAMQEFGTMCTERDTETVKGVLPYWPRIFCKISLDHDRRVREATQQAFEKLILKVKKQLAPYLKSLMGYWLMAQCDTYTPAAFAAKDAFEAAFPPSKQPEAIAFCKDEITSVLQDHLIKETPDTLSDPQTVPEEEREAKFYRVVTCSLLALKRLLCLLPDNELDSLEEKFKSLLSQNKFWKYGKHSVPQIRSAYFELVSALCQRIPQLMKEEASKVSPSVLLSIDDSDPIVCPALWEAVLYTLTTIEDCWLHVNAKKSVFPKLSTVIREGGRGLATVIYPYLLPFISKLPQSITNPKLDFFKNFLTSLVAGLSTERTKTSSLESSAVISAFFECLRFIMQQNLGEEEIEQMLVNDQLIPFIDAVLKDPGLQHGQLFNHLAETLSSWEAKADTEKDEKTAHNLENVLIHFWERLSEICVAKISEPEADVESVLGVSNLLQVLQKPKSSLKSSKKKNGKVRFADEILESNKENEKCVSSEGEKIEGWELTTEPSLTHNSSGLLSPLRKKPLEDLVCKLADISINYVNERKSEQHLRFLSTLLDSFSSSRVFKMLLGDEKQSIVQAKPLEIAKLVQKNPAVQFLYQKLIGWLNEDQRKDFGFLVDILYSALRCCDNDMERKKVLDDLTKVDLKWNSLLKIIEKACPSSDKHALVTPWLKGDILGEKLVNLADCLCNEDLESRVSSESHFSERWTLLSLVLSQHVKNDYLIGDVYVERIIVRLHETLFKTKKLSEAESSDSSVSFICDVAYNYFSSAKGCLLMPSSEDLLLTLFQLCAQSKEKTHLPDFLICKLKNTWLSGVNLLVHQTDSSYKESTFLHLSALWLKNQVQASSLDINSLQVLLSAVDDLLNTLLESEDSYLMGVYIGSVMPNDSEWEKMRQSLPMQWLHRPLLEGRLSLNYECFKTDFKEQDIKTLPSHLCTSALLSKMVLIALRKETVLENNELEKIIAELLYSLQWCEELDNPPIFLIGFCEILQKMNITYDNLRVLGNTSGLLQLLFNRSREHGTLWSLIIAKLILSRSISSDEVKPHYKRKESFFPLTEGNLHTIQSLCPFLSKEEKKEFSAQCIPALLGWTKKDLCSTNGGFGHLAIFNSCLQTKSIDDGELLHGILKIIISWKKEHEDIFLFSCNLSEASPEVLGVNIEIIRFLSLFLKYCSS--PLAESEWDFIMCSMLAWLETTSENQALYSIPLVQLFACVSCDLACDLSAFFDSTTLDTIGNLPVNLISEWKEFFSQGIHSLLLPILVTVTGENKDVSETSFQNAMLKPMCETLTYISKEQLLSHKLPARLVADQKTNLPEYLQTLLNTLAPLLLFRARPVQIAVYHMLYKLMPELPQYDQDNLKSYGDEEEEPALSPPAALMSLLSIQEDLLENVLGCIPVGQIVTIKPLSEDFCYVLGYLLTWKLILTFFKAASSQLRALYSMYLRKTKSLNKLLYHLFRLMPENPTYAETAVEVPNKDPKTFFTEELQLSIRETTMLPYHIPHLACSVYHMTLKDLPAMVRLWWNSSEKRVFNIVDRFTSKYVSSVLSFQEISSVQTSTQLFNGMTVKARATTREVMATYTIEDIVIELIIQLPSNYPLGSIIVESGKRVGVAVQQWRNWMLQLSTYLTHQNGSIMEGLALWKNNVDKRFEGVEDCMICFSVIHGFNYSLPKKACRTCKKKFHSACLYKWFTSSNKSTCPLCRETFF
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 3j92.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_id
_ma_model_list.model_group_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.model_group_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 1 1 'model 5' . 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . PRO 1731 1731 ? A 279.384 283.148 239.215 1 1 n PRO 0.580 1
ATOM 2 C CA . PRO 1731 1731 ? A 280.453 282.904 240.242 1 1 n PRO 0.580 1
ATOM 3 C C . PRO 1731 1731 ? A 281.421 281.785 239.966 1 1 n PRO 0.580 1
ATOM 4 O O . PRO 1731 1731 ? A 281.225 281.018 239.017 1 1 n PRO 0.580 1
ATOM 5 C CB . PRO 1731 1731 ? A 279.751 282.729 241.591 1 1 n PRO 0.580 1
ATOM 6 C CG . PRO 1731 1731 ? A 278.264 283.027 241.424 1 1 n PRO 0.580 1
ATOM 7 C CD . PRO 1731 1731 ? A 278.011 283.200 239.911 1 1 n PRO 0.580 1
ATOM 8 N N . LYS 1732 1732 ? A 282.479 281.700 240.819 1 1 n LYS 0.530 1
ATOM 9 C CA . LYS 1732 1732 ? A 283.599 280.785 240.796 1 1 n LYS 0.530 1
ATOM 10 C C . LYS 1732 1732 ? A 283.436 279.723 241.872 1 1 n LYS 0.530 1
ATOM 11 O O . LYS 1732 1732 ? A 282.555 279.835 242.720 1 1 n LYS 0.530 1
ATOM 12 C CB . LYS 1732 1732 ? A 284.935 281.541 241.088 1 1 n LYS 0.530 1
ATOM 13 C CG . LYS 1732 1732 ? A 285.119 282.016 242.552 1 1 n LYS 0.530 1
ATOM 14 C CD . LYS 1732 1732 ? A 286.061 283.229 242.688 1 1 n LYS 0.530 1
ATOM 15 C CE . LYS 1732 1732 ? A 286.013 283.868 244.084 1 1 n LYS 0.530 1
ATOM 16 N NZ . LYS 1732 1732 ? A 286.831 285.105 244.162 1 1 n LYS 0.530 1
ATOM 17 N N . LYS 1733 1733 ? A 284.319 278.695 241.871 1 1 n LYS 0.470 1
ATOM 18 C CA . LYS 1733 1733 ? A 284.396 277.677 242.911 1 1 n LYS 0.470 1
ATOM 19 C C . LYS 1733 1733 ? A 283.243 276.690 242.973 1 1 n LYS 0.470 1
ATOM 20 O O . LYS 1733 1733 ? A 282.453 276.658 243.914 1 1 n LYS 0.470 1
ATOM 21 C CB . LYS 1733 1733 ? A 284.791 278.220 244.312 1 1 n LYS 0.470 1
ATOM 22 C CG . LYS 1733 1733 ? A 286.281 278.588 244.411 1 1 n LYS 0.470 1
ATOM 23 C CD . LYS 1733 1733 ? A 286.634 279.244 245.761 1 1 n LYS 0.470 1
ATOM 24 C CE . LYS 1733 1733 ? A 288.086 279.721 245.895 1 1 n LYS 0.470 1
ATOM 25 N NZ . LYS 1733 1733 ? A 289.010 278.575 245.745 1 1 n LYS 0.470 1
ATOM 26 N N . ALA 1734 1734 ? A 283.174 275.798 241.969 1 1 n ALA 0.560 1
ATOM 27 C CA . ALA 1734 1734 ? A 282.446 274.560 242.091 1 1 n ALA 0.560 1
ATOM 28 C C . ALA 1734 1734 ? A 283.330 273.535 242.806 1 1 n ALA 0.560 1
ATOM 29 O O . ALA 1734 1734 ? A 284.554 273.681 242.859 1 1 n ALA 0.560 1
ATOM 30 C CB . ALA 1734 1734 ? A 282.004 274.067 240.694 1 1 n ALA 0.560 1
ATOM 31 N N . CYS 1735 1735 ? A 282.725 272.493 243.417 1 1 n CYS 0.530 1
ATOM 32 C CA . CYS 1735 1735 ? A 283.448 271.409 244.083 1 1 n CYS 0.530 1
ATOM 33 C C . CYS 1735 1735 ? A 284.166 270.475 243.102 1 1 n CYS 0.530 1
ATOM 34 O O . CYS 1735 1735 ? A 283.915 270.494 241.903 1 1 n CYS 0.530 1
ATOM 35 C CB . CYS 1735 1735 ? A 282.513 270.584 245.020 1 1 n CYS 0.530 1
ATOM 36 S SG . CYS 1735 1735 ? A 283.191 270.288 246.688 1 1 n CYS 0.530 1
ATOM 37 N N . ARG 1736 1736 ? A 285.107 269.624 243.573 1 1 n ARG 0.420 1
ATOM 38 C CA . ARG 1736 1736 ? A 285.920 268.815 242.670 1 1 n ARG 0.420 1
ATOM 39 C C . ARG 1736 1736 ? A 285.199 267.737 241.855 1 1 n ARG 0.420 1
ATOM 40 O O . ARG 1736 1736 ? A 285.391 267.627 240.650 1 1 n ARG 0.420 1
ATOM 41 C CB . ARG 1736 1736 ? A 287.078 268.175 243.473 1 1 n ARG 0.420 1
ATOM 42 C CG . ARG 1736 1736 ? A 288.041 267.305 242.633 1 1 n ARG 0.420 1
ATOM 43 C CD . ARG 1736 1736 ? A 289.404 267.060 243.290 1 1 n ARG 0.420 1
ATOM 44 N NE . ARG 1736 1736 ? A 290.207 268.314 243.079 1 1 n ARG 0.420 1
ATOM 45 C CZ . ARG 1736 1736 ? A 291.368 268.587 243.689 1 1 n ARG 0.420 1
ATOM 46 N NH1 . ARG 1736 1736 ? A 291.875 267.764 244.600 1 1 n ARG 0.420 1
ATOM 47 N NH2 . ARG 1736 1736 ? A 292.037 269.701 243.394 1 1 n ARG 0.420 1
ATOM 48 N N . THR 1737 1737 ? A 284.333 266.923 242.490 1 1 n THR 0.480 1
ATOM 49 C CA . THR 1737 1737 ? A 283.545 265.903 241.799 1 1 n THR 0.480 1
ATOM 50 C C . THR 1737 1737 ? A 282.081 266.296 241.933 1 1 n THR 0.480 1
ATOM 51 O O . THR 1737 1737 ? A 281.205 265.537 242.334 1 1 n THR 0.480 1
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ATOM 53 O OG1 . THR 1737 1737 ? A 283.250 263.466 241.516 1 1 n THR 0.480 1
ATOM 54 C CG2 . THR 1737 1737 ? A 283.559 264.252 243.760 1 1 n THR 0.480 1
ATOM 55 N N . CYS 1738 1738 ? A 281.747 267.569 241.621 1 1 n CYS 0.470 1
ATOM 56 C CA . CYS 1738 1738 ? A 280.374 268.006 241.776 1 1 n CYS 0.470 1
ATOM 57 C C . CYS 1738 1738 ? A 280.097 269.192 240.876 1 1 n CYS 0.470 1
ATOM 58 O O . CYS 1738 1738 ? A 280.994 269.924 240.477 1 1 n CYS 0.470 1
ATOM 59 C CB . CYS 1738 1738 ? A 280.074 268.407 243.254 1 1 n CYS 0.470 1
ATOM 60 S SG . CYS 1738 1738 ? A 278.318 268.470 243.731 1 1 n CYS 0.470 1
ATOM 61 N N . LYS 1739 1739 ? A 278.814 269.431 240.551 1 1 n LYS 0.470 1
ATOM 62 C CA . LYS 1739 1739 ? A 278.383 270.584 239.782 1 1 n LYS 0.470 1
ATOM 63 C C . LYS 1739 1739 ? A 277.859 271.684 240.687 1 1 n LYS 0.470 1
ATOM 64 O O . LYS 1739 1739 ? A 277.325 272.692 240.222 1 1 n LYS 0.470 1
ATOM 65 C CB . LYS 1739 1739 ? A 277.221 270.169 238.850 1 1 n LYS 0.470 1
ATOM 66 C CG . LYS 1739 1739 ? A 277.663 269.352 237.627 1 1 n LYS 0.470 1
ATOM 67 C CD . LYS 1739 1739 ? A 278.217 270.238 236.494 1 1 n LYS 0.470 1
ATOM 68 C CE . LYS 1739 1739 ? A 278.483 269.447 235.208 1 1 n LYS 0.470 1
ATOM 69 N NZ . LYS 1739 1739 ? A 278.931 270.345 234.118 1 1 n LYS 0.470 1
ATOM 70 N N . LYS 1740 1740 ? A 277.971 271.512 242.019 1 1 n LYS 0.510 1
ATOM 71 C CA . LYS 1740 1740 ? A 277.465 272.479 242.965 1 1 n LYS 0.510 1
ATOM 72 C C . LYS 1740 1740 ? A 278.294 273.756 243.017 1 1 n LYS 0.510 1
ATOM 73 O O . LYS 1740 1740 ? A 279.436 273.752 243.472 1 1 n LYS 0.510 1
ATOM 74 C CB . LYS 1740 1740 ? A 277.322 271.869 244.379 1 1 n LYS 0.510 1
ATOM 75 C CG . LYS 1740 1740 ? A 276.332 272.641 245.267 1 1 n LYS 0.510 1
ATOM 76 C CD . LYS 1740 1740 ? A 276.054 271.916 246.595 1 1 n LYS 0.510 1
ATOM 77 C CE . LYS 1740 1740 ? A 274.835 272.438 247.372 1 1 n LYS 0.510 1
ATOM 78 N NZ . LYS 1740 1740 ? A 273.579 272.049 246.689 1 1 n LYS 0.510 1
ATOM 79 N N . LYS 1741 1741 ? A 277.697 274.867 242.540 1 1 n LYS 0.510 1
ATOM 80 C CA . LYS 1741 1741 ? A 278.236 276.211 242.584 1 1 n LYS 0.510 1
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ATOM 86 C CE . LYS 1741 1741 ? A 275.933 275.999 238.140 1 1 n LYS 0.510 1
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ATOM 215 N NZ . LYS 1756 1756 ? A 284.162 266.563 257.876 1 1 n LYS 0.580 1
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ATOM 270 O O . GLU 1764 1764 ? A 284.194 268.619 250.230 1 1 n GLU 0.510 1
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ATOM 283 N N . PHE 1766 1766 ? A 286.668 271.051 250.657 1 1 n PHE 0.610 1
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ATOM 290 C CD2 . PHE 1766 1766 ? A 284.092 273.329 248.332 1 1 n PHE 0.610 1
ATOM 291 C CE1 . PHE 1766 1766 ? A 285.223 275.645 247.261 1 1 n PHE 0.610 1
ATOM 292 C CE2 . PHE 1766 1766 ? A 283.550 273.897 247.173 1 1 n PHE 0.610 1
ATOM 293 C CZ . PHE 1766 1766 ? A 284.121 275.054 246.635 1 1 n PHE 0.610 1
ATOM 294 O OXT . PHE 1766 1766 ? A 288.540 274.043 249.701 1 1 n PHE 0.610 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
S
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
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_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
_ma_qa_metric_global.metric_id
_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.529
2 1 3 0.349
#
#
loop_
_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
_ma_qa_metric_local.label_seq_id
_ma_qa_metric_local.label_comp_id
_ma_qa_metric_local.metric_id
_ma_qa_metric_local.metric_value
1 1 A 1731 PRO 1 0.580
2 1 A 1732 LYS 1 0.530
3 1 A 1733 LYS 1 0.470
4 1 A 1734 ALA 1 0.560
5 1 A 1735 CYS 1 0.530
6 1 A 1736 ARG 1 0.420
7 1 A 1737 THR 1 0.480
8 1 A 1738 CYS 1 0.470
9 1 A 1739 LYS 1 0.470
10 1 A 1740 LYS 1 0.510
11 1 A 1741 LYS 1 0.510
12 1 A 1742 PHE 1 0.450
13 1 A 1743 HIS 1 0.430
14 1 A 1744 SER 1 0.520
15 1 A 1745 ALA 1 0.570
16 1 A 1746 CYS 1 0.560
17 1 A 1747 LEU 1 0.610
18 1 A 1748 TYR 1 0.510
19 1 A 1749 LYS 1 0.570
20 1 A 1750 TRP 1 0.460
21 1 A 1751 PHE 1 0.510
22 1 A 1752 THR 1 0.520
23 1 A 1753 SER 1 0.530
24 1 A 1754 SER 1 0.570
25 1 A 1755 ASN 1 0.570
26 1 A 1756 LYS 1 0.580
27 1 A 1757 SER 1 0.630
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29 1 A 1759 CYS 1 0.630
30 1 A 1760 PRO 1 0.600
31 1 A 1761 LEU 1 0.450
32 1 A 1762 CYS 1 0.380
33 1 A 1763 ARG 1 0.420
34 1 A 1764 GLU 1 0.510
35 1 A 1765 THR 1 0.690
36 1 A 1766 PHE 1 0.610
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor
endorses you or your use. When you publish, patent or distribute
results that were fully or partially based on the model, please cite
the corresponding papers mentioned under JRNL.
ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material,
you must distribute your contributions under the same license as the
original.
No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the
CC BY-SA 4.0 license at this link:
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
;
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode
2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer
#