data_SMR-452aac53942bbd890354a03526d5de3b_6 _entry.id SMR-452aac53942bbd890354a03526d5de3b_6 _struct.entry_id SMR-452aac53942bbd890354a03526d5de3b_6 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q5SNZ0 (isoform 2)/ GRDN_MOUSE, Girdin Estimated model accuracy of this model is 0.003, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q5SNZ0 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 246040.983 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP GRDN_MOUSE Q5SNZ0 1 ;MENEIFTPLLEQFMTSPLVTWVKTFGPLAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMLQINPKSESQRVNKKVNN DASLRIHNLSILVKQIKFYYQETLQQLIMMPLPDILIIGKNPFSEQGTEEVKKLLLLLLGCAVQCQKKEE FIEKIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTDMSQEDIEPLLKNMVSHLRRLIDERDEHSET IVELSEERDGVHFLPHASSSAQSPCGSPGMKRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQE LEQIEVELKRLQQENMNLLSDARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESELSRYKERLHDIEFYKARVEELK EDNQVLLETKTMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLEMAQK QSMDESLHLGWELEQISRTSELAEAPQKSLGHEVNELTSSKLLKLEMENQSLTKTVEELRSTADSAAGST SKILKVEKENQRLNKKVEILENEIIQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKAQLEKTIETLRENSERQIKILEQEN EHLNQTVSSLRQRSQISAEARVKDIEKENKILHESIKETCGKLSKIEFEKRQMKKELELYKEKGERAEEL ENELNHLGKENELLQKKITNLKITCEKLETLEQENSELERENRKFKKTLDSFKNLTFQLESLEKENSQLD EENLELRRSVESLKCASMRMAQLQLENKELESEKEQLRKGLELMRASFKKTERLEVSYQGLDTENQRLQK ALENSNKKIQQLESELQDLEMENQTLQKSLEELKISSKRLEQLEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKR LRQQAEIKDTTLEENNVKIGNLEKENKTLFKEINVYKESCVRLKELEKENKELVKRATIDIKTLVTLRED LVSEKLKTQQMNNDLEKLTHELEKIGLNKERLLHDEQSTDDSRYKLLESKLESTLKKSLEIKEEKIAALE ARLEESTNYNQQLRHELKTVKKNYEALKQRQDEERMVQSSIPVSGEDDKWGRESQEATRELLKVKDRLIE VERNNATLQAEKQALKTQLKQLETQNNNLQAQILALQRQTVSLQEQNTTLQTQNAKLQVENSTLNSQSTS LMNQNAQLLIQQSSLENENESIMKEREDLKSLYDALIKDHEKLELLHERQASEYESLISKHGTLKSAHKN LEVEHKDLEDRYNQLLKQKGQLEDLEKMIKTEQEKMLLESKNHEVVASEYKKLCGENDRLNYTYSQLLKE TEILQMDHKNLKSVLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNLEEENRHLLDQ IQTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQYKFYDPSPPRRRGNWITLKM RKLIKSKKDINRERQKSLTLTPTRSDSSEGFLQLPHQDSQDSSSVGSNSLEDGQTLGTKKSSTMNDLVQS MVLAGGQWTGSTENLEVPDDISTGKRRKELGAMAFSTTAINFSTVNSSAAFRSKQLVNNKDTTSFEDISP QGISDDSSTGSRVHASRPASLDSGRTSTSNSNNNASLHEVKAGAVNIQSRPQSHSSGDFSLLHDHETWSS SGSSPIQYLKRQTRSSPMLQHKISETIESRAHHKMKAGSPGSEVVTLQQFLEESNKLTSIQLKSSSQENL LDEVMKSLSVSSDFLGKDKPVSCTLARSVSGKTPGDFYDRRTTKPEFLRTGPQKTEDAYTISSAGKPTPS TQGKIKLVKETSVSRQSKDSNPYATLPRASSVISTAEGTTRRTSIHDFLSKDSRLPVSVDSSPPTAGSSS TTASNVNKVQESRNSKSRSREQQSS ; Girdin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1845 1 1845 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . GRDN_MOUSE Q5SNZ0 Q5SNZ0-2 1 1845 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2007-05-15 87AEDC047EA4A72A # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MENEIFTPLLEQFMTSPLVTWVKTFGPLAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMLQINPKSESQRVNKKVNN DASLRIHNLSILVKQIKFYYQETLQQLIMMPLPDILIIGKNPFSEQGTEEVKKLLLLLLGCAVQCQKKEE FIEKIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTDMSQEDIEPLLKNMVSHLRRLIDERDEHSET IVELSEERDGVHFLPHASSSAQSPCGSPGMKRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQE LEQIEVELKRLQQENMNLLSDARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESELSRYKERLHDIEFYKARVEELK EDNQVLLETKTMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLEMAQK QSMDESLHLGWELEQISRTSELAEAPQKSLGHEVNELTSSKLLKLEMENQSLTKTVEELRSTADSAAGST SKILKVEKENQRLNKKVEILENEIIQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKAQLEKTIETLRENSERQIKILEQEN EHLNQTVSSLRQRSQISAEARVKDIEKENKILHESIKETCGKLSKIEFEKRQMKKELELYKEKGERAEEL 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A 1 1643 HIS 1643 ? ? ? B . A 1 1644 LYS 1644 ? ? ? B . A 1 1645 MET 1645 ? ? ? B . A 1 1646 LYS 1646 ? ? ? B . A 1 1647 ALA 1647 ? ? ? B . A 1 1648 GLY 1648 ? ? ? B . A 1 1649 SER 1649 ? ? ? B . A 1 1650 PRO 1650 ? ? ? B . A 1 1651 GLY 1651 ? ? ? B . A 1 1652 SER 1652 ? ? ? B . A 1 1653 GLU 1653 ? ? ? B . A 1 1654 VAL 1654 ? ? ? B . A 1 1655 VAL 1655 ? ? ? B . A 1 1656 THR 1656 ? ? ? B . A 1 1657 LEU 1657 ? ? ? B . A 1 1658 GLN 1658 ? ? ? B . A 1 1659 GLN 1659 ? ? ? B . A 1 1660 PHE 1660 ? ? ? B . A 1 1661 LEU 1661 ? ? ? B . A 1 1662 GLU 1662 ? ? ? B . A 1 1663 GLU 1663 ? ? ? B . A 1 1664 SER 1664 ? ? ? B . A 1 1665 ASN 1665 ? ? ? B . A 1 1666 LYS 1666 ? ? ? B . A 1 1667 LEU 1667 ? ? ? B . A 1 1668 THR 1668 ? ? ? B . A 1 1669 SER 1669 ? ? ? B . A 1 1670 ILE 1670 ? ? ? B . A 1 1671 GLN 1671 ? ? ? B . A 1 1672 LEU 1672 ? ? ? B . A 1 1673 LYS 1673 ? ? ? B . A 1 1674 SER 1674 ? ? ? B . A 1 1675 SER 1675 ? ? ? B . A 1 1676 SER 1676 ? ? ? B . A 1 1677 GLN 1677 ? ? ? B . A 1 1678 GLU 1678 ? ? ? B . A 1 1679 ASN 1679 ? ? ? B . A 1 1680 LEU 1680 ? ? ? B . A 1 1681 LEU 1681 ? ? ? B . A 1 1682 ASP 1682 ? ? ? B . A 1 1683 GLU 1683 ? ? ? B . A 1 1684 VAL 1684 ? ? ? B . A 1 1685 MET 1685 ? ? ? B . A 1 1686 LYS 1686 ? ? ? B . A 1 1687 SER 1687 ? ? ? B . A 1 1688 LEU 1688 ? ? ? B . A 1 1689 SER 1689 ? ? ? B . A 1 1690 VAL 1690 ? ? ? B . A 1 1691 SER 1691 ? ? ? B . A 1 1692 SER 1692 ? ? ? B . A 1 1693 ASP 1693 ? ? ? B . A 1 1694 PHE 1694 ? ? ? B . A 1 1695 LEU 1695 ? ? ? B . A 1 1696 GLY 1696 ? ? ? B . A 1 1697 LYS 1697 ? ? ? B . A 1 1698 ASP 1698 ? ? ? B . A 1 1699 LYS 1699 ? ? ? B . A 1 1700 PRO 1700 ? ? ? B . A 1 1701 VAL 1701 ? ? ? B . A 1 1702 SER 1702 ? ? ? B . A 1 1703 CYS 1703 ? ? ? B . A 1 1704 THR 1704 ? ? ? B . A 1 1705 LEU 1705 ? ? ? B . A 1 1706 ALA 1706 ? ? ? B . A 1 1707 ARG 1707 ? ? ? B . A 1 1708 SER 1708 ? ? ? B . A 1 1709 VAL 1709 ? ? ? B . A 1 1710 SER 1710 ? ? ? B . A 1 1711 GLY 1711 ? ? ? B . A 1 1712 LYS 1712 ? ? ? B . A 1 1713 THR 1713 ? ? ? B . A 1 1714 PRO 1714 ? ? ? B . A 1 1715 GLY 1715 ? ? ? B . A 1 1716 ASP 1716 ? ? ? B . A 1 1717 PHE 1717 ? ? ? B . A 1 1718 TYR 1718 ? ? ? B . A 1 1719 ASP 1719 ? ? ? B . A 1 1720 ARG 1720 ? ? ? B . A 1 1721 ARG 1721 ? ? ? B . A 1 1722 THR 1722 ? ? ? B . A 1 1723 THR 1723 ? ? ? B . A 1 1724 LYS 1724 ? ? ? B . A 1 1725 PRO 1725 ? ? ? B . A 1 1726 GLU 1726 ? ? ? B . A 1 1727 PHE 1727 ? ? ? B . A 1 1728 LEU 1728 ? ? ? B . A 1 1729 ARG 1729 ? ? ? B . A 1 1730 THR 1730 ? ? ? B . A 1 1731 GLY 1731 ? ? ? B . A 1 1732 PRO 1732 ? ? ? B . A 1 1733 GLN 1733 ? ? ? B . A 1 1734 LYS 1734 ? ? ? B . A 1 1735 THR 1735 ? ? ? B . A 1 1736 GLU 1736 ? ? ? B . A 1 1737 ASP 1737 ? ? ? B . A 1 1738 ALA 1738 ? ? ? B . A 1 1739 TYR 1739 ? ? ? B . A 1 1740 THR 1740 ? ? ? B . A 1 1741 ILE 1741 ? ? ? B . A 1 1742 SER 1742 ? ? ? B . A 1 1743 SER 1743 ? ? ? B . A 1 1744 ALA 1744 ? ? ? B . A 1 1745 GLY 1745 ? ? ? B . A 1 1746 LYS 1746 ? ? ? B . A 1 1747 PRO 1747 ? ? ? B . A 1 1748 THR 1748 ? ? ? B . A 1 1749 PRO 1749 ? ? ? B . A 1 1750 SER 1750 ? ? ? B . A 1 1751 THR 1751 ? ? ? B . A 1 1752 GLN 1752 ? ? ? B . A 1 1753 GLY 1753 ? ? ? B . A 1 1754 LYS 1754 ? ? ? B . A 1 1755 ILE 1755 ? ? ? B . A 1 1756 LYS 1756 ? ? ? B . A 1 1757 LEU 1757 ? ? ? B . A 1 1758 VAL 1758 ? ? ? B . A 1 1759 LYS 1759 ? ? ? B . A 1 1760 GLU 1760 ? ? ? B . A 1 1761 THR 1761 ? ? ? B . A 1 1762 SER 1762 ? ? ? B . A 1 1763 VAL 1763 ? ? ? B . A 1 1764 SER 1764 ? ? ? B . A 1 1765 ARG 1765 ? ? ? B . A 1 1766 GLN 1766 ? ? ? B . A 1 1767 SER 1767 ? ? ? B . A 1 1768 LYS 1768 ? ? ? B . A 1 1769 ASP 1769 ? ? ? B . A 1 1770 SER 1770 ? ? ? B . A 1 1771 ASN 1771 ? ? ? B . A 1 1772 PRO 1772 ? ? ? B . A 1 1773 TYR 1773 ? ? ? B . A 1 1774 ALA 1774 ? ? ? B . A 1 1775 THR 1775 ? ? ? B . A 1 1776 LEU 1776 ? ? ? B . A 1 1777 PRO 1777 ? ? ? B . A 1 1778 ARG 1778 ? ? ? B . A 1 1779 ALA 1779 ? ? ? B . A 1 1780 SER 1780 ? ? ? B . A 1 1781 SER 1781 ? ? ? B . A 1 1782 VAL 1782 ? ? ? B . A 1 1783 ILE 1783 ? ? ? B . A 1 1784 SER 1784 ? ? ? B . A 1 1785 THR 1785 ? ? ? B . A 1 1786 ALA 1786 ? ? ? B . A 1 1787 GLU 1787 ? ? ? B . A 1 1788 GLY 1788 ? ? ? B . A 1 1789 THR 1789 ? ? ? B . A 1 1790 THR 1790 ? ? ? B . A 1 1791 ARG 1791 ? ? ? B . A 1 1792 ARG 1792 ? ? ? B . A 1 1793 THR 1793 ? ? ? B . A 1 1794 SER 1794 ? ? ? B . A 1 1795 ILE 1795 ? ? ? B . A 1 1796 HIS 1796 ? ? ? B . A 1 1797 ASP 1797 ? ? ? B . A 1 1798 PHE 1798 ? ? ? B . A 1 1799 LEU 1799 ? ? ? B . A 1 1800 SER 1800 ? ? ? B . A 1 1801 LYS 1801 ? ? ? B . A 1 1802 ASP 1802 ? ? ? B . A 1 1803 SER 1803 ? ? ? B . A 1 1804 ARG 1804 ? ? ? B . A 1 1805 LEU 1805 ? ? ? B . A 1 1806 PRO 1806 ? ? ? B . A 1 1807 VAL 1807 ? ? ? B . A 1 1808 SER 1808 ? ? ? B . A 1 1809 VAL 1809 ? ? ? B . A 1 1810 ASP 1810 ? ? ? B . A 1 1811 SER 1811 ? ? ? B . A 1 1812 SER 1812 ? ? ? B . A 1 1813 PRO 1813 ? ? ? B . A 1 1814 PRO 1814 ? ? ? B . A 1 1815 THR 1815 ? ? ? B . A 1 1816 ALA 1816 ? ? ? B . A 1 1817 GLY 1817 ? ? ? B . A 1 1818 SER 1818 ? ? ? B . A 1 1819 SER 1819 ? ? ? B . A 1 1820 SER 1820 ? ? ? B . A 1 1821 THR 1821 ? ? ? B . A 1 1822 THR 1822 ? ? ? B . A 1 1823 ALA 1823 ? ? ? B . A 1 1824 SER 1824 ? ? ? B . A 1 1825 ASN 1825 ? ? ? B . A 1 1826 VAL 1826 ? ? ? B . A 1 1827 ASN 1827 ? ? ? B . A 1 1828 LYS 1828 ? ? ? B . A 1 1829 VAL 1829 ? ? ? B . A 1 1830 GLN 1830 ? ? ? B . A 1 1831 GLU 1831 ? ? ? B . A 1 1832 SER 1832 ? ? ? B . A 1 1833 ARG 1833 ? ? ? B . A 1 1834 ASN 1834 ? ? ? B . A 1 1835 SER 1835 ? ? ? B . A 1 1836 LYS 1836 ? ? ? B . A 1 1837 SER 1837 ? ? ? B . A 1 1838 ARG 1838 ? ? ? B . A 1 1839 SER 1839 ? ? ? B . A 1 1840 ARG 1840 ? ? ? B . A 1 1841 GLU 1841 ? ? ? B . A 1 1842 GLN 1842 ? ? ? B . A 1 1843 GLN 1843 ? ? ? B . A 1 1844 SER 1844 ? ? ? B . A 1 1845 SER 1845 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Intraflagellar transport protein 81 {PDB ID=6ian, label_asym_id=B, auth_asym_id=C, SMTL ID=6ian.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6ian, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 6' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 C # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GAASMRQNPPKEPSEEEVLQYIVDNVNKLLSRHYSLVEFDAIQGTDLLQILADIFGTLSPAQQIDMGVAP TDEAAASMLEFLTKTLGYRVPPMLADSFPTSFSRAEPTVIYPTLYWVLSNMQQNEKRVYLARFLQRLEIP EAMLAQDEDVRALYQQYVNLRGMFVNTHRRVDALRTAHADPADARRAVTVLEEECDRLRGYIQVAEKKLA GVPDKEALLNACKSLRAALEEESRLAEKGVELQQQLISSRQRSTEMHNRLQNLRRDAADGRVDVIVRRLR DEIQTNKMIIEEQLPKELQQKQRENAEFDRLISEPLDMQALTTENQQLDEALKKLHQQVKERQKPGEDGS TIATIKQQVERVAKRKVEVMEQLTGLQADNSRTLNDIRERENRIEQLREAHHMLKDDDFREFSKQVLAKK AATESMRTHLSEQRVEYGVLNFTENVLRSQFTSL ; ;GAASMRQNPPKEPSEEEVLQYIVDNVNKLLSRHYSLVEFDAIQGTDLLQILADIFGTLSPAQQIDMGVAP TDEAAASMLEFLTKTLGYRVPPMLADSFPTSFSRAEPTVIYPTLYWVLSNMQQNEKRVYLARFLQRLEIP EAMLAQDEDVRALYQQYVNLRGMFVNTHRRVDALRTAHADPADARRAVTVLEEECDRLRGYIQVAEKKLA GVPDKEALLNACKSLRAALEEESRLAEKGVELQQQLISSRQRSTEMHNRLQNLRRDAADGRVDVIVRRLR DEIQTNKMIIEEQLPKELQQKQRENAEFDRLISEPLDMQALTTENQQLDEALKKLHQQVKERQKPGEDGS TIATIKQQVERVAKRKVEVMEQLTGLQADNSRTLNDIRERENRIEQLREAHHMLKDDDFREFSKQVLAKK AATESMRTHLSEQRVEYGVLNFTENVLRSQFTSL ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 224 336 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6ian 2019-05-08 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1845 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1861 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.036 19.588 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MENEIFTPLLEQFMTSPLVTWVKTFGPLAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMLQINPKSESQRVNKKVNNDASLRIHNLSILVKQIKFYYQETLQQLIMMPLPDILIIGKNPFSEQGTEEVKKLLLLLLGCAVQCQKKEEFIEKIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTDMSQEDIEPLLKNMVSHLRRLIDERDEHSETIVELSEERDGVHFLPHASSSAQSPCGSPGMKRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQELEQIEVELKRLQQENMNLLSDARS------ARMYRDELDALREKAVRVDKLESELSRYKERLHDIE----------FYKARVEELKEDNQVLLETKTMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLEMAQKQSMDESLHLGWELEQISRTSELAEAPQKSLGHEVNELTSSKLLKLEMENQSLTKTVEELRSTADSAAGSTSKILKVEKENQRLNKKVEILENEIIQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKAQLEKTIETLRENSERQIKILEQENEHLNQTVSSLRQRSQISAEARVKDIEKENKILHESIKETCGKLSKIEFEKRQMKKELELYKEKGERAEELENELNHLGKENELLQKKITNLKITCEKLETLEQENSELERENRKFKKTLDSFKNLTFQLESLEKENSQLDEENLELRRSVESLKCASMRMAQLQLENKELESEKEQLRKGLELMRASFKKTERLEVSYQGLDTENQRLQKALENSNKKIQQLESELQDLEMENQTLQKSLEELKISSKRLEQLEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKRLRQQAEIKDTTLEENNVKIGNLEKENKTLFKEINVYKESCVRLKELEKENKELVKRATIDIKTLVTLREDLVSEKLKTQQMNNDLEKLTHELEKIGLNKERLLHDEQSTDDSRYKLLESKLESTLKKSLEIKEEKIAALEARLEESTNYNQQLRHELKTVKKNYEALKQRQDEERMVQSSIPVSGEDDKWGRESQEATRELLKVKDRLIEVERNNATLQAEKQALKTQLKQLETQNNNLQAQILALQRQTVSLQEQNTTLQTQNAKLQVENSTLNSQSTSLMNQNAQLLIQQSSLENENESIMKEREDLKSLYDALIKDHEKLELLHERQASEYESLISKHGTLKSAHKNLEVEHKDLEDRYNQLLKQKGQLEDLEKMIKTEQEKMLLESKNHEVVASEYKKLCGENDRLNYTYSQLLKETEILQMDHKNLKSVLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNLEEENRHLLDQIQTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQYKFYDPSPPRRRGNWITLKMRKLIKSKKDINRERQKSLTLTPTRSDSSEGFLQLPHQDSQDSSSVGSNSLEDGQTLGTKKSSTMNDLVQSMVLAGGQWTGSTENLEVPDDISTGKRRKELGAMAFSTTAINFSTVNSSAAFRSKQLVNNKDTTSFEDISPQGISDDSSTGSRVHASRPASLDSGRTSTSNSNNNASLHEVKAGAVNIQSRPQSHSSGDFSLLHDHETWSSSGSSPIQYLKRQTRSSPMLQHKISETIESRAHHKMKAGSPGSEVVTLQQFLEESNKLTSIQLKSSSQENLLDEVMKSLSVSSDFLGKDKPVSCTLARSVSGKTPGDFYDRRTTKPEFLRTGPQKTEDAYTISSAGKPTPSTQGKIKLVKETSVSRQSKDSNPYATLPRASSVISTAEGTTRRTSIHDFLSKDSRLPVSVDSSPPTAGSSSTTASNVNKVQESRNSKSRSREQQSS 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SLRAALEEESRLAEKGVELQQQLISSRQRSTEMHNRLQNLRRDAADGRVDVIVRRLRDEIQTNKMIIE--EQLPKELQQKQRENAEFDRLISEPLDMQALTTENQQLDEALKKLH------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6ian.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 6' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LYS 259 259 ? A -0.965 22.394 -28.082 1 1 B LYS 0.330 1 ATOM 2 C CA . LYS 259 259 ? A -1.946 22.601 -26.952 1 1 B LYS 0.330 1 ATOM 3 C C . LYS 259 259 ? A -1.561 21.833 -25.712 1 1 B LYS 0.330 1 ATOM 4 O O . LYS 259 259 ? A -1.355 22.468 -24.683 1 1 B LYS 0.330 1 ATOM 5 C CB . LYS 259 259 ? A -3.398 22.310 -27.417 1 1 B LYS 0.330 1 ATOM 6 C CG . LYS 259 259 ? A -3.921 23.353 -28.423 1 1 B LYS 0.330 1 ATOM 7 C CD . LYS 259 259 ? A -5.345 23.057 -28.920 1 1 B LYS 0.330 1 ATOM 8 C CE . LYS 259 259 ? A -5.858 24.098 -29.933 1 1 B LYS 0.330 1 ATOM 9 N NZ . LYS 259 259 ? A -7.206 23.733 -30.421 1 1 B LYS 0.330 1 ATOM 10 N N . ILE 260 260 ? A -1.340 20.497 -25.788 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 11 C CA . ILE 260 260 ? A -0.925 19.652 -24.670 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 12 C C . ILE 260 260 ? A 0.317 20.163 -23.965 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 13 O O . ILE 260 260 ? A 0.380 20.226 -22.740 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 14 C CB . ILE 260 260 ? A -0.653 18.233 -25.172 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 15 C CG1 . ILE 260 260 ? A -1.965 17.591 -25.684 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 16 C CG2 . ILE 260 260 ? A -0.013 17.361 -24.057 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 17 C CD1 . ILE 260 260 ? A -1.723 16.284 -26.452 1 1 B ILE 0.400 1 ATOM 18 N N . ARG 261 261 ? A 1.344 20.591 -24.714 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 19 C CA . ARG 261 261 ? A 2.541 21.159 -24.127 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 20 C C . ARG 261 261 ? A 2.330 22.430 -23.295 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 21 O O . ARG 261 261 ? A 2.912 22.572 -22.222 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 22 C CB . ARG 261 261 ? A 3.551 21.454 -25.253 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 23 C CG . ARG 261 261 ? A 4.826 22.165 -24.761 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 24 C CD . ARG 261 261 ? A 5.845 22.378 -25.881 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 25 N NE . ARG 261 261 ? A 6.797 23.456 -25.436 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 26 C CZ . ARG 261 261 ? A 6.561 24.774 -25.524 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 27 N NH1 . ARG 261 261 ? A 5.431 25.253 -26.030 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 28 N NH2 . ARG 261 261 ? A 7.480 25.643 -25.109 1 1 B ARG 0.510 1 ATOM 29 N N . ARG 262 262 ? A 1.479 23.371 -23.763 1 1 B ARG 0.530 1 ATOM 30 C CA . ARG 262 262 ? A 1.060 24.552 -23.018 1 1 B ARG 0.530 1 ATOM 31 C C . ARG 262 262 ? A 0.278 24.193 -21.762 1 1 B ARG 0.530 1 ATOM 32 O O . ARG 262 262 ? A 0.488 24.801 -20.712 1 1 B ARG 0.530 1 ATOM 33 C CB . ARG 262 262 ? A 0.211 25.526 -23.882 1 1 B ARG 0.530 1 ATOM 34 C CG . ARG 262 262 ? A 1.024 26.230 -24.991 1 1 B ARG 0.530 1 ATOM 35 C CD . ARG 262 262 ? A 0.325 27.465 -25.578 1 1 B ARG 0.530 1 ATOM 36 N NE . ARG 262 262 ? A -0.918 26.971 -26.267 1 1 B ARG 0.530 1 ATOM 37 C CZ . ARG 262 262 ? A -0.987 26.538 -27.531 1 1 B ARG 0.530 1 ATOM 38 N NH1 . ARG 262 262 ? A 0.080 26.499 -28.316 1 1 B ARG 0.530 1 ATOM 39 N NH2 . ARG 262 262 ? A -2.173 26.241 -28.049 1 1 B ARG 0.530 1 ATOM 40 N N . LEU 263 263 ? A -0.608 23.174 -21.823 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 41 C CA . LEU 263 263 ? A -1.302 22.628 -20.665 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 42 C C . LEU 263 263 ? A -0.361 22.052 -19.616 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 43 O O . LEU 263 263 ? A -0.517 22.303 -18.423 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 44 C CB . LEU 263 263 ? A -2.274 21.489 -21.086 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 45 C CG . LEU 263 263 ? A -3.475 21.939 -21.941 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 46 C CD1 . LEU 263 263 ? A -4.248 20.710 -22.456 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 47 C CD2 . LEU 263 263 ? A -4.403 22.872 -21.141 1 1 B LEU 0.600 1 ATOM 48 N N . ARG 264 264 ? A 0.660 21.280 -20.041 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 49 C CA . ARG 264 264 ? A 1.692 20.745 -19.167 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 50 C C . ARG 264 264 ? A 2.571 21.806 -18.515 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 51 O O . ARG 264 264 ? A 2.870 21.718 -17.327 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 52 C CB . ARG 264 264 ? A 2.603 19.754 -19.925 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 53 C CG . ARG 264 264 ? A 1.898 18.450 -20.348 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 54 C CD . ARG 264 264 ? A 2.846 17.562 -21.152 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 55 N NE . ARG 264 264 ? A 2.095 16.321 -21.543 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 56 C CZ . ARG 264 264 ? A 2.576 15.402 -22.392 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 57 N NH1 . ARG 264 264 ? A 3.769 15.555 -22.955 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 58 N NH2 . ARG 264 264 ? A 1.869 14.311 -22.677 1 1 B ARG 0.580 1 ATOM 59 N N . GLN 265 265 ? A 2.995 22.853 -19.250 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 60 C CA . GLN 265 265 ? A 3.753 23.951 -18.666 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 61 C C . GLN 265 265 ? A 2.969 24.750 -17.641 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 62 O O . GLN 265 265 ? A 3.467 25.035 -16.551 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 63 C CB . GLN 265 265 ? A 4.290 24.888 -19.771 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 64 C CG . GLN 265 265 ? A 5.391 24.179 -20.585 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 65 C CD . GLN 265 265 ? A 5.916 25.023 -21.735 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 66 O OE1 . GLN 265 265 ? A 5.233 25.813 -22.401 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 67 N NE2 . GLN 265 265 ? A 7.215 24.837 -22.043 1 1 B GLN 0.660 1 ATOM 68 N N . GLU 266 266 ? A 1.692 25.068 -17.940 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 69 C CA . GLU 266 266 ? A 0.785 25.700 -17.002 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 70 C C . GLU 266 266 ? A 0.524 24.822 -15.774 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 71 O O . GLU 266 266 ? A 0.472 25.299 -14.639 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 72 C CB . GLU 266 266 ? A -0.549 26.085 -17.698 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 73 C CG . GLU 266 266 ? A -1.498 26.891 -16.774 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 74 C CD . GLU 266 266 ? A -1.032 28.307 -16.417 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 75 O OE1 . GLU 266 266 ? A 0.043 28.750 -16.878 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 76 O OE2 . GLU 266 266 ? A -1.810 28.952 -15.662 1 1 B GLU 0.670 1 ATOM 77 N N . LEU 267 267 ? A 0.392 23.486 -15.949 1 1 B LEU 0.680 1 ATOM 78 C CA . LEU 267 267 ? A 0.277 22.535 -14.851 1 1 B LEU 0.680 1 ATOM 79 C C . LEU 267 267 ? A 1.445 22.590 -13.874 1 1 B LEU 0.680 1 ATOM 80 O O . LEU 267 267 ? A 1.243 22.715 -12.664 1 1 B LEU 0.680 1 ATOM 81 C CB . LEU 267 267 ? A 0.230 21.078 -15.398 1 1 B LEU 0.680 1 ATOM 82 C CG . LEU 267 267 ? A 0.164 19.969 -14.322 1 1 B LEU 0.680 1 ATOM 83 C CD1 . LEU 267 267 ? A -1.136 20.056 -13.507 1 1 B LEU 0.680 1 ATOM 84 C CD2 . LEU 267 267 ? A 0.359 18.584 -14.963 1 1 B LEU 0.680 1 ATOM 85 N N . GLU 268 268 ? A 2.695 22.531 -14.379 1 1 B GLU 0.680 1 ATOM 86 C CA . GLU 268 268 ? A 3.903 22.593 -13.577 1 1 B GLU 0.680 1 ATOM 87 C C . GLU 268 268 ? A 4.073 23.914 -12.853 1 1 B GLU 0.680 1 ATOM 88 O O . GLU 268 268 ? A 4.355 23.922 -11.653 1 1 B GLU 0.680 1 ATOM 89 C CB . GLU 268 268 ? A 5.152 22.273 -14.428 1 1 B GLU 0.680 1 ATOM 90 C CG . GLU 268 268 ? A 5.180 20.793 -14.885 1 1 B GLU 0.680 1 ATOM 91 C CD . GLU 268 268 ? A 6.382 20.452 -15.763 1 1 B GLU 0.680 1 ATOM 92 O OE1 . GLU 268 268 ? A 7.146 21.375 -16.142 1 1 B GLU 0.680 1 ATOM 93 O OE2 . GLU 268 268 ? A 6.522 19.241 -16.076 1 1 B GLU 0.680 1 ATOM 94 N N . GLU 269 269 ? A 3.820 25.054 -13.535 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 95 C CA . GLU 269 269 ? A 3.866 26.377 -12.930 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 96 C C . GLU 269 269 ? A 2.846 26.537 -11.802 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 97 O O . GLU 269 269 ? A 3.165 26.991 -10.699 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 98 C CB . GLU 269 269 ? A 3.648 27.488 -13.997 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 99 C CG . GLU 269 269 ? A 3.799 28.921 -13.418 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 100 C CD . GLU 269 269 ? A 5.193 29.253 -12.888 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 101 O OE1 . GLU 269 269 ? A 5.259 30.215 -12.078 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 102 O OE2 . GLU 269 269 ? A 6.181 28.604 -13.300 1 1 B GLU 0.690 1 ATOM 103 N N . LYS 270 270 ? A 1.586 26.084 -12.000 1 1 B LYS 0.690 1 ATOM 104 C CA . LYS 270 270 ? A 0.573 26.080 -10.952 1 1 B LYS 0.690 1 ATOM 105 C C . LYS 270 270 ? A 0.938 25.218 -9.761 1 1 B LYS 0.690 1 ATOM 106 O O . LYS 270 270 ? A 0.710 25.614 -8.620 1 1 B LYS 0.690 1 ATOM 107 C CB . LYS 270 270 ? A -0.801 25.593 -11.454 1 1 B LYS 0.690 1 ATOM 108 C CG . LYS 270 270 ? A -1.474 26.617 -12.362 1 1 B LYS 0.690 1 ATOM 109 C CD . LYS 270 270 ? A -2.854 26.124 -12.805 1 1 B LYS 0.690 1 ATOM 110 C CE . LYS 270 270 ? A -3.536 27.159 -13.692 1 1 B LYS 0.690 1 ATOM 111 N NZ . LYS 270 270 ? A -4.780 26.635 -14.277 1 1 B LYS 0.690 1 ATOM 112 N N . THR 271 271 ? A 1.529 24.026 -9.999 1 1 B THR 0.690 1 ATOM 113 C CA . THR 271 271 ? 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A 29.748 4.248 -10.920 1 1 B LYS 0.500 1 ATOM 729 C CB . LYS 343 343 ? A 27.124 3.850 -12.698 1 1 B LYS 0.500 1 ATOM 730 C CG . LYS 343 343 ? A 25.590 3.839 -12.577 1 1 B LYS 0.500 1 ATOM 731 C CD . LYS 343 343 ? A 24.978 2.647 -13.330 1 1 B LYS 0.500 1 ATOM 732 C CE . LYS 343 343 ? A 23.449 2.594 -13.240 1 1 B LYS 0.500 1 ATOM 733 N NZ . LYS 343 343 ? A 22.931 1.454 -14.030 1 1 B LYS 0.500 1 ATOM 734 N N . ALA 344 344 ? A 30.095 5.435 -12.791 1 1 B ALA 0.570 1 ATOM 735 C CA . ALA 344 344 ? A 31.530 5.562 -12.620 1 1 B ALA 0.570 1 ATOM 736 C C . ALA 344 344 ? A 31.904 6.425 -11.409 1 1 B ALA 0.570 1 ATOM 737 O O . ALA 344 344 ? A 32.664 5.975 -10.565 1 1 B ALA 0.570 1 ATOM 738 C CB . ALA 344 344 ? A 32.143 6.112 -13.927 1 1 B ALA 0.570 1 ATOM 739 N N . ARG 345 345 ? A 31.267 7.617 -11.220 1 1 B ARG 0.480 1 ATOM 740 C CA . ARG 345 345 ? A 31.460 8.479 -10.054 1 1 B ARG 0.480 1 ATOM 741 C C . ARG 345 345 ? A 31.089 7.744 -8.785 1 1 B ARG 0.480 1 ATOM 742 O O . ARG 345 345 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.562 2 1 3 0.003 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 259 LYS 1 0.330 2 1 A 260 ILE 1 0.400 3 1 A 261 ARG 1 0.510 4 1 A 262 ARG 1 0.530 5 1 A 263 LEU 1 0.600 6 1 A 264 ARG 1 0.580 7 1 A 265 GLN 1 0.660 8 1 A 266 GLU 1 0.670 9 1 A 267 LEU 1 0.680 10 1 A 268 GLU 1 0.680 11 1 A 269 GLU 1 0.690 12 1 A 270 LYS 1 0.690 13 1 A 271 THR 1 0.690 14 1 A 272 GLU 1 0.660 15 1 A 273 GLN 1 0.660 16 1 A 274 LEU 1 0.660 17 1 A 275 LEU 1 0.660 18 1 A 276 ASP 1 0.660 19 1 A 277 CYS 1 0.630 20 1 A 278 LYS 1 0.640 21 1 A 279 GLN 1 0.650 22 1 A 280 GLU 1 0.630 23 1 A 281 LEU 1 0.630 24 1 A 282 GLU 1 0.650 25 1 A 283 GLN 1 0.650 26 1 A 284 ILE 1 0.640 27 1 A 285 GLU 1 0.660 28 1 A 286 VAL 1 0.690 29 1 A 287 GLU 1 0.650 30 1 A 288 LEU 1 0.650 31 1 A 289 LYS 1 0.650 32 1 A 290 ARG 1 0.580 33 1 A 291 LEU 1 0.630 34 1 A 292 GLN 1 0.610 35 1 A 293 GLN 1 0.590 36 1 A 294 GLU 1 0.560 37 1 A 295 ASN 1 0.560 38 1 A 296 MET 1 0.490 39 1 A 297 ASN 1 0.470 40 1 A 298 LEU 1 0.420 41 1 A 299 LEU 1 0.360 42 1 A 300 SER 1 0.370 43 1 A 301 ASP 1 0.270 44 1 A 302 ALA 1 0.320 45 1 A 303 ARG 1 0.390 46 1 A 304 SER 1 0.440 47 1 A 305 ALA 1 0.550 48 1 A 306 ARG 1 0.510 49 1 A 307 MET 1 0.480 50 1 A 308 TYR 1 0.570 51 1 A 309 ARG 1 0.590 52 1 A 310 ASP 1 0.650 53 1 A 311 GLU 1 0.640 54 1 A 312 LEU 1 0.690 55 1 A 313 ASP 1 0.680 56 1 A 314 ALA 1 0.700 57 1 A 315 LEU 1 0.670 58 1 A 316 ARG 1 0.520 59 1 A 317 GLU 1 0.590 60 1 A 318 LYS 1 0.620 61 1 A 319 ALA 1 0.650 62 1 A 320 VAL 1 0.560 63 1 A 321 ARG 1 0.340 64 1 A 322 VAL 1 0.440 65 1 A 323 ASP 1 0.540 66 1 A 324 LYS 1 0.600 67 1 A 325 LEU 1 0.630 68 1 A 326 GLU 1 0.630 69 1 A 327 SER 1 0.660 70 1 A 328 GLU 1 0.650 71 1 A 329 LEU 1 0.680 72 1 A 330 SER 1 0.620 73 1 A 331 ARG 1 0.580 74 1 A 332 TYR 1 0.610 75 1 A 333 LYS 1 0.580 76 1 A 334 GLU 1 0.530 77 1 A 335 ARG 1 0.490 78 1 A 336 LEU 1 0.440 79 1 A 337 HIS 1 0.460 80 1 A 338 ASP 1 0.410 81 1 A 339 ILE 1 0.260 82 1 A 340 GLU 1 0.250 83 1 A 341 PHE 1 0.240 84 1 A 342 TYR 1 0.460 85 1 A 343 LYS 1 0.500 86 1 A 344 ALA 1 0.570 87 1 A 345 ARG 1 0.480 88 1 A 346 VAL 1 0.570 89 1 A 347 GLU 1 0.610 90 1 A 348 GLU 1 0.610 91 1 A 349 LEU 1 0.620 92 1 A 350 LYS 1 0.640 93 1 A 351 GLU 1 0.630 94 1 A 352 ASP 1 0.620 95 1 A 353 ASN 1 0.620 96 1 A 354 GLN 1 0.590 97 1 A 355 VAL 1 0.620 98 1 A 356 LEU 1 0.380 99 1 A 357 LEU 1 0.340 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #