data_SMR-9658bb45b711aba5ccd78c8afdb85c79_6 _entry.id SMR-9658bb45b711aba5ccd78c8afdb85c79_6 _struct.entry_id SMR-9658bb45b711aba5ccd78c8afdb85c79_6 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q5SNZ0/ GRDN_MOUSE, Girdin Estimated model accuracy of this model is 0.001, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q5SNZ0' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 249976.710 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP GRDN_MOUSE Q5SNZ0 1 ;MENEIFTPLLEQFMTSPLVTWVKTFGPLAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMLQINPKSESQRVNKKVNN DASLRIHNLSILVKQIKFYYQETLQQLIMMPLPDILIIGKNPFSEQGTEEVKKLLLLLLGCAVQCQKKEE FIEKIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTDMSQEDIEPLLKNMVSHLRRLIDERDEHSET IVELSEERDGVHFLPHASSSAQSPCGSPGMKRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQE LEQIEVELKRLQQENMNLLSDARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESELSRYKERLHDIEFYKARVEELK EDNQVLLETKTMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLEMAQK QSMDESLHLGWELEQISRTSELAEAPQKSLGHEVNELTSSKLLKLEMENQSLTKTVEELRSTADSAAGST SKILKVEKENQRLNKKVEILENEIIQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKAQLEKTIETLRENSERQIKILEQEN EHLNQTVSSLRQRSQISAEARVKDIEKENKILHESIKETCGKLSKIEFEKRQMKKELELYKEKGERAEEL ENELNHLGKENELLQKKITNLKITCEKLETLEQENSELERENRKFKKTLDSFKNLTFQLESLEKENSQLD EENLELRRSVESLKCASMRMAQLQLENKELESEKEQLRKGLELMRASFKKTERLEVSYQGLDTENQRLQK ALENSNKKIQQLESELQDLEMENQTLQKSLEELKISSKRLEQLEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKR LRQQAEIKDTTLEENNVKIGNLEKENKTLFKEINVYKESCVRLKELEKENKELVKRATIDIKTLVTLRED LVSEKLKTQQMNNDLEKLTHELEKIGLNKERLLHDEQSTDDSRYKLLESKLESTLKKSLEIKEEKIAALE ARLEESTNYNQQLRHELKTVKKNYEALKQRQDEERMVQSSIPVSGEDDKWGRESQEATRELLKVKDRLIE VERNNATLQAEKQALKTQLKQLETQNNNLQAQILALQRQTVSLQEQNTTLQTQNAKLQVENSTLNSQSTS LMNQNAQLLIQQSSLENENESIMKEREDLKSLYDALIKDHEKLELLHERQASEYESLISKHGTLKSAHKN LEVEHKDLEDRYNQLLKQKGQLEDLEKMIKTEQEKMLLESKNHEVVASEYKKLCGENDRLNYTYSQLLKE TEILQMDHKNLKSVLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNLEEENRHLLDQ IQTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQYKFYDPSPPRRRGNWITLKM RKLIKSKKDINRERQKSLTLTPTRSDSSEGFLQLPHQDSQDSSSVGSNSLEDGQTLGTKKSSMVALKRLP FLRNRPKDKDKMKACYRRSMSMNDLVQSMVLAGGQWTGSTENLEVPDDISTGKRRKELGAMAFSTTAINF STVNSSAAFRSKQLVNNKDTTSFEDISPQGISDDSSTGSRVHASRPASLDSGRTSTSNSNNNASLHEVKA GAVNIQSRPQSHSSGDFSLLHDHETWSSSGSSPIQYLKRQTRSSPMLQHKISETIESRAHHKMKAGSPGS EVVTLQQFLEESNKLTSIQLKSSSQENLLDEVMKSLSVSSDFLGKDKPVSCTLARSVSGKTPGDFYDRRT TKPEFLRTGPQKTEDAYTISSAGKPTPSTQGKIKLVKETSVSRQSKDSNPYATLPRASSVISTAEGTTRR TSIHDFLSKDSRLPVSVDSSPPTAGSSSTTASNVNKVQESRNSKSRSREQQSS ; Girdin # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1873 1 1873 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . GRDN_MOUSE Q5SNZ0 . 1 1873 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2007-05-15 0E827E3D9336161F # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no V ;MENEIFTPLLEQFMTSPLVTWVKTFGPLAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMLQINPKSESQRVNKKVNN DASLRIHNLSILVKQIKFYYQETLQQLIMMPLPDILIIGKNPFSEQGTEEVKKLLLLLLGCAVQCQKKEE FIEKIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTDMSQEDIEPLLKNMVSHLRRLIDERDEHSET IVELSEERDGVHFLPHASSSAQSPCGSPGMKRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQE LEQIEVELKRLQQENMNLLSDARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESELSRYKERLHDIEFYKARVEELK EDNQVLLETKTMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLEMAQK QSMDESLHLGWELEQISRTSELAEAPQKSLGHEVNELTSSKLLKLEMENQSLTKTVEELRSTADSAAGST SKILKVEKENQRLNKKVEILENEIIQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKAQLEKTIETLRENSERQIKILEQEN EHLNQTVSSLRQRSQISAEARVKDIEKENKILHESIKETCGKLSKIEFEKRQMKKELELYKEKGERAEEL ENELNHLGKENELLQKKITNLKITCEKLETLEQENSELERENRKFKKTLDSFKNLTFQLESLEKENSQLD EENLELRRSVESLKCASMRMAQLQLENKELESEKEQLRKGLELMRASFKKTERLEVSYQGLDTENQRLQK ALENSNKKIQQLESELQDLEMENQTLQKSLEELKISSKRLEQLEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKR LRQQAEIKDTTLEENNVKIGNLEKENKTLFKEINVYKESCVRLKELEKENKELVKRATIDIKTLVTLRED LVSEKLKTQQMNNDLEKLTHELEKIGLNKERLLHDEQSTDDSRYKLLESKLESTLKKSLEIKEEKIAALE ARLEESTNYNQQLRHELKTVKKNYEALKQRQDEERMVQSSIPVSGEDDKWGRESQEATRELLKVKDRLIE VERNNATLQAEKQALKTQLKQLETQNNNLQAQILALQRQTVSLQEQNTTLQTQNAKLQVENSTLNSQSTS LMNQNAQLLIQQSSLENENESIMKEREDLKSLYDALIKDHEKLELLHERQASEYESLISKHGTLKSAHKN LEVEHKDLEDRYNQLLKQKGQLEDLEKMIKTEQEKMLLESKNHEVVASEYKKLCGENDRLNYTYSQLLKE TEILQMDHKNLKSVLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNLEEENRHLLDQ IQTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQYKFYDPSPPRRRGNWITLKM RKLIKSKKDINRERQKSLTLTPTRSDSSEGFLQLPHQDSQDSSSVGSNSLEDGQTLGTKKSSMVALKRLP FLRNRPKDKDKMKACYRRSMSMNDLVQSMVLAGGQWTGSTENLEVPDDISTGKRRKELGAMAFSTTAINF STVNSSAAFRSKQLVNNKDTTSFEDISPQGISDDSSTGSRVHASRPASLDSGRTSTSNSNNNASLHEVKA 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A 1 1678 PRO 1678 ? ? ? V . A 1 1679 GLY 1679 ? ? ? V . A 1 1680 SER 1680 ? ? ? V . A 1 1681 GLU 1681 ? ? ? V . A 1 1682 VAL 1682 ? ? ? V . A 1 1683 VAL 1683 ? ? ? V . A 1 1684 THR 1684 ? ? ? V . A 1 1685 LEU 1685 ? ? ? V . A 1 1686 GLN 1686 ? ? ? V . A 1 1687 GLN 1687 ? ? ? V . A 1 1688 PHE 1688 ? ? ? V . A 1 1689 LEU 1689 ? ? ? V . A 1 1690 GLU 1690 ? ? ? V . A 1 1691 GLU 1691 ? ? ? V . A 1 1692 SER 1692 ? ? ? V . A 1 1693 ASN 1693 ? ? ? V . A 1 1694 LYS 1694 ? ? ? V . A 1 1695 LEU 1695 ? ? ? V . A 1 1696 THR 1696 ? ? ? V . A 1 1697 SER 1697 ? ? ? V . A 1 1698 ILE 1698 ? ? ? V . A 1 1699 GLN 1699 ? ? ? V . A 1 1700 LEU 1700 ? ? ? V . A 1 1701 LYS 1701 ? ? ? V . A 1 1702 SER 1702 ? ? ? V . A 1 1703 SER 1703 ? ? ? V . A 1 1704 SER 1704 ? ? ? V . A 1 1705 GLN 1705 ? ? ? V . A 1 1706 GLU 1706 ? ? ? V . A 1 1707 ASN 1707 ? ? ? V . A 1 1708 LEU 1708 ? ? ? V . A 1 1709 LEU 1709 ? ? ? V . A 1 1710 ASP 1710 ? ? ? V . A 1 1711 GLU 1711 ? ? ? V . A 1 1712 VAL 1712 ? ? ? V . A 1 1713 MET 1713 ? ? ? V . A 1 1714 LYS 1714 ? ? ? V . A 1 1715 SER 1715 ? ? ? V . A 1 1716 LEU 1716 ? ? ? V . A 1 1717 SER 1717 ? ? ? V . A 1 1718 VAL 1718 ? ? ? V . A 1 1719 SER 1719 ? ? ? V . A 1 1720 SER 1720 ? ? ? V . A 1 1721 ASP 1721 ? ? ? V . A 1 1722 PHE 1722 ? ? ? V . A 1 1723 LEU 1723 ? ? ? V . A 1 1724 GLY 1724 ? ? ? V . A 1 1725 LYS 1725 ? ? ? V . A 1 1726 ASP 1726 ? ? ? V . A 1 1727 LYS 1727 ? ? ? V . A 1 1728 PRO 1728 ? ? ? V . A 1 1729 VAL 1729 ? ? ? V . A 1 1730 SER 1730 ? ? ? V . A 1 1731 CYS 1731 ? ? ? V . A 1 1732 THR 1732 ? ? ? V . A 1 1733 LEU 1733 ? ? ? V . A 1 1734 ALA 1734 ? ? ? V . A 1 1735 ARG 1735 ? ? ? V . A 1 1736 SER 1736 ? ? ? V . A 1 1737 VAL 1737 ? ? ? V . A 1 1738 SER 1738 ? ? ? V . A 1 1739 GLY 1739 ? ? ? V . A 1 1740 LYS 1740 ? ? ? V . A 1 1741 THR 1741 ? ? ? V . A 1 1742 PRO 1742 ? ? ? V . A 1 1743 GLY 1743 ? ? ? V . A 1 1744 ASP 1744 ? ? ? V . A 1 1745 PHE 1745 ? ? ? V . A 1 1746 TYR 1746 ? ? ? V . A 1 1747 ASP 1747 ? ? ? V . A 1 1748 ARG 1748 ? ? ? V . A 1 1749 ARG 1749 ? ? ? V . A 1 1750 THR 1750 ? ? ? V . A 1 1751 THR 1751 ? ? ? V . A 1 1752 LYS 1752 ? ? ? V . A 1 1753 PRO 1753 ? ? ? V . A 1 1754 GLU 1754 ? ? ? V . A 1 1755 PHE 1755 ? ? ? V . A 1 1756 LEU 1756 ? ? ? V . A 1 1757 ARG 1757 ? ? ? V . A 1 1758 THR 1758 ? ? ? V . A 1 1759 GLY 1759 ? ? ? V . A 1 1760 PRO 1760 ? ? ? V . A 1 1761 GLN 1761 ? ? ? V . A 1 1762 LYS 1762 ? ? ? V . A 1 1763 THR 1763 ? ? ? V . A 1 1764 GLU 1764 ? ? ? V . A 1 1765 ASP 1765 ? ? ? V . A 1 1766 ALA 1766 ? ? ? V . A 1 1767 TYR 1767 ? ? ? V . A 1 1768 THR 1768 ? ? ? V . A 1 1769 ILE 1769 ? ? ? V . A 1 1770 SER 1770 ? ? ? V . A 1 1771 SER 1771 ? ? ? V . A 1 1772 ALA 1772 ? ? ? V . A 1 1773 GLY 1773 ? ? ? V . A 1 1774 LYS 1774 ? ? ? V . A 1 1775 PRO 1775 ? ? ? V . A 1 1776 THR 1776 ? ? ? V . A 1 1777 PRO 1777 ? ? ? V . A 1 1778 SER 1778 ? ? ? V . A 1 1779 THR 1779 ? ? ? V . A 1 1780 GLN 1780 ? ? ? V . A 1 1781 GLY 1781 ? ? ? V . A 1 1782 LYS 1782 ? ? ? V . A 1 1783 ILE 1783 ? ? ? V . A 1 1784 LYS 1784 ? ? ? V . A 1 1785 LEU 1785 ? ? ? V . A 1 1786 VAL 1786 ? ? ? V . A 1 1787 LYS 1787 ? ? ? V . A 1 1788 GLU 1788 ? ? ? V . A 1 1789 THR 1789 ? ? ? V . A 1 1790 SER 1790 ? ? ? V . A 1 1791 VAL 1791 ? ? ? V . A 1 1792 SER 1792 ? ? ? V . A 1 1793 ARG 1793 ? ? ? V . A 1 1794 GLN 1794 ? ? ? V . A 1 1795 SER 1795 ? ? ? V . A 1 1796 LYS 1796 ? ? ? V . A 1 1797 ASP 1797 ? ? ? V . A 1 1798 SER 1798 ? ? ? V . A 1 1799 ASN 1799 ? ? ? V . A 1 1800 PRO 1800 ? ? ? V . A 1 1801 TYR 1801 ? ? ? V . A 1 1802 ALA 1802 ? ? ? V . A 1 1803 THR 1803 ? ? ? V . A 1 1804 LEU 1804 ? ? ? V . A 1 1805 PRO 1805 ? ? ? V . A 1 1806 ARG 1806 ? ? ? V . A 1 1807 ALA 1807 ? ? ? V . A 1 1808 SER 1808 ? ? ? V . A 1 1809 SER 1809 ? ? ? V . A 1 1810 VAL 1810 ? ? ? V . A 1 1811 ILE 1811 ? ? ? V . A 1 1812 SER 1812 ? ? ? V . A 1 1813 THR 1813 ? ? ? V . A 1 1814 ALA 1814 ? ? ? V . A 1 1815 GLU 1815 ? ? ? V . A 1 1816 GLY 1816 ? ? ? V . A 1 1817 THR 1817 ? ? ? V . A 1 1818 THR 1818 ? ? ? V . A 1 1819 ARG 1819 ? ? ? V . A 1 1820 ARG 1820 ? ? ? V . A 1 1821 THR 1821 ? ? ? V . A 1 1822 SER 1822 ? ? ? V . A 1 1823 ILE 1823 ? ? ? V . A 1 1824 HIS 1824 ? ? ? V . A 1 1825 ASP 1825 ? ? ? V . A 1 1826 PHE 1826 ? ? ? V . A 1 1827 LEU 1827 ? ? ? V . A 1 1828 SER 1828 ? ? ? V . A 1 1829 LYS 1829 ? ? ? V . A 1 1830 ASP 1830 ? ? ? V . A 1 1831 SER 1831 ? ? ? V . A 1 1832 ARG 1832 ? ? ? V . A 1 1833 LEU 1833 ? ? ? V . A 1 1834 PRO 1834 ? ? ? V . A 1 1835 VAL 1835 ? ? ? V . A 1 1836 SER 1836 ? ? ? V . A 1 1837 VAL 1837 ? ? ? V . A 1 1838 ASP 1838 ? ? ? V . A 1 1839 SER 1839 ? ? ? V . A 1 1840 SER 1840 ? ? ? V . A 1 1841 PRO 1841 ? ? ? V . A 1 1842 PRO 1842 ? ? ? V . A 1 1843 THR 1843 ? ? ? V . A 1 1844 ALA 1844 ? ? ? V . A 1 1845 GLY 1845 ? ? ? V . A 1 1846 SER 1846 ? ? ? V . A 1 1847 SER 1847 ? ? ? V . A 1 1848 SER 1848 ? ? ? V . A 1 1849 THR 1849 ? ? ? V . A 1 1850 THR 1850 ? ? ? V . A 1 1851 ALA 1851 ? ? ? V . A 1 1852 SER 1852 ? ? ? V . A 1 1853 ASN 1853 ? ? ? V . A 1 1854 VAL 1854 ? ? ? V . A 1 1855 ASN 1855 ? ? ? V . A 1 1856 LYS 1856 ? ? ? V . A 1 1857 VAL 1857 ? ? ? V . A 1 1858 GLN 1858 ? ? ? V . A 1 1859 GLU 1859 ? ? ? V . A 1 1860 SER 1860 ? ? ? V . A 1 1861 ARG 1861 ? ? ? V . A 1 1862 ASN 1862 ? ? ? V . A 1 1863 SER 1863 ? ? ? V . A 1 1864 LYS 1864 ? ? ? V . A 1 1865 SER 1865 ? ? ? V . A 1 1866 ARG 1866 ? ? ? V . A 1 1867 SER 1867 ? ? ? V . A 1 1868 ARG 1868 ? ? ? V . A 1 1869 GLU 1869 ? ? ? V . A 1 1870 GLN 1870 ? ? ? V . A 1 1871 GLN 1871 ? ? ? V . A 1 1872 SER 1872 ? ? ? V . A 1 1873 SER 1873 ? ? ? V . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Clusterin-associated protein 1 {PDB ID=8bd7, label_asym_id=V, auth_asym_id=T, SMTL ID=8bd7.1.V}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8bd7, label_asym_id=V' 'target-template alignment' . 4 'model 6' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A V 9 1 T # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MSFRELRSFTEVMKALGYPRLISMENFRVPNFELVADCLYWLVHRYYPGVEIADDISTESDRVKFLQSVA QVMLTKARMKLNIKRLYAADGNAVKELLKLASLLYKATSKAGDMDDDAAEAIDVANSLKGFNPKEIKGLA AEIIKAGAGLYDALGQEPELREHRARAVAGHVDTDFVERSIREAIAQVEDNIRSLENQMEDLERNEKTLD NKIEKKKQELERQEKRLSTLQSVRPAYMDEYERLQGELNGLYQSYLDRFRNLEFLENELEAYYQAEQEKM EAQERRLKKMQKRLKEEELRILRGEQEVDEANMNFDDDDMDLSEDGEHEEAEEGEDEDYGAGGQKATMRR DQFGGQGGGGGGGRQQGGGRNVMGNLDGDFDDEASIDEDDNTDGGEVSRQGSQAGGMGGGGGYGGGGGYM NGGGMDDDENNLIQDDDEDDNDF ; ;MSFRELRSFTEVMKALGYPRLISMENFRVPNFELVADCLYWLVHRYYPGVEIADDISTESDRVKFLQSVA QVMLTKARMKLNIKRLYAADGNAVKELLKLASLLYKATSKAGDMDDDAAEAIDVANSLKGFNPKEIKGLA AEIIKAGAGLYDALGQEPELREHRARAVAGHVDTDFVERSIREAIAQVEDNIRSLENQMEDLERNEKTLD NKIEKKKQELERQEKRLSTLQSVRPAYMDEYERLQGELNGLYQSYLDRFRNLEFLENELEAYYQAEQEKM EAQERRLKKMQKRLKEEELRILRGEQEVDEANMNFDDDDMDLSEDGEHEEAEEGEDEDYGAGGQKATMRR DQFGGQGGGGGGGRQQGGGRNVMGNLDGDFDDEASIDEDDNTDGGEVSRQGSQAGGMGGGGGYGGGGGYM NGGGMDDDENNLIQDDDEDDNDF ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 185 274 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8bd7 2024-11-13 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1873 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1873 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 6.500 24.444 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MENEIFTPLLEQFMTSPLVTWVKTFGPLAAGNGTNLDEYVALVDGVFLNQVMLQINPKSESQRVNKKVNNDASLRIHNLSILVKQIKFYYQETLQQLIMMPLPDILIIGKNPFSEQGTEEVKKLLLLLLGCAVQCQKKEEFIEKIQGLDFDTKAAVAAHIQEVTHNQENVFDLQWMEVTDMSQEDIEPLLKNMVSHLRRLIDERDEHSETIVELSEERDGVHFLPHASSSAQSPCGSPGMKRTESRQHLSVELADAKAKIRRLRQELEEKTEQLLDCKQELEQIEVELKRLQQENMNLLSDARSARMYRDELDALREKAVRVDKLESELSRYKERLHDIEFYKARVEELKEDNQVLLETKTMLEDQLEGTRARSDKLHELEKENLQLKAKLHDMEMERDMDRKKIEELMEENMTLEMAQKQSMDESLHLGWELEQISRTSELAEAPQKSLGHEVNELTSSKLLKLEMENQSLTKTVEELRSTADSAAGSTSKILKVEKENQRLNKKVEILENEIIQEKQSLQNCQNLSKDLMKEKAQLEKTIETLRENSERQIKILEQENEHLNQTVSSLRQRSQISAEARVKDIEKENKILHESIKETCGKLSKIEFEKRQMKKELELYKEKGERAEELENELNHLGKENELLQKKITNLKITCEKLETLEQENSELERENRKFKKTLDSFKNLTFQLESLEKENSQLDEENLELRRSVESLKCASMRMAQLQLENKELESEKEQLRKGLELMRASFKKTERLEVSYQGLDTENQRLQKALENSNKKIQQLESELQDLEMENQTLQKSLEELKISSKRLEQLEKENKSLEQETSQLEKDKKQLEKENKRLRQQAEIKDTTLEENNVKIGNLEKENKTLFKEINVYKESCVRLKELEKENKELVKRATIDIKTLVTLREDLVSEKLKTQQMNNDLEKLTHELEKIGLNKERLLHDEQSTDDSRYKLLESKLESTLKKSLEIKEEKIAALEARLEESTNYNQQLRHELKTVKKNYEALKQRQDEERMVQSSIPVSGEDDKWGRESQEATRELLKVKDRLIEVERNNATLQAEKQALKTQLKQLETQNNNLQAQILALQRQTVSLQEQNTTLQTQNAKLQVENSTLNSQSTSLMNQNAQLLIQQSSLENENESIMKEREDLKSLYDALIKDHEKLELLHERQASEYESLISKHGTLKSAHKNLEVEHKDLEDRYNQLLKQKGQLEDLEKMIKTEQEKMLLESKNHEVVASEYKKLCGENDRLNYTYSQLLKETEILQMDHKNLKSVLNNSKLEQTRLEAEFSKLKEQYQQLDITSTKLNNQCELLSQLKGNLEEENRHLLDQIQTLMLQNRTLLEQNMESKDLFHVEQRQYIDKLNELRRQKEKLEEKIMDQYKFYDPSPPRRRGNWITLKMRKLIKSKKDINRERQKSLTLTPTRSDSSEGFLQLPHQDSQDSSSVGSNSLEDGQTLGTKKSSMVALKRLPFLRNRPKDKDKMKACYRRSMSMNDLVQSMVLAGGQWTGSTENLEVPDDISTGKRRKELGAMAFSTTAINFSTVNSSAAFRSKQLVNNKDTTSFEDISPQGISDDSSTGSRVHASRPASLDSGRTSTSNSNNNASLHEVKAGAVNIQSRPQSHSSGDFSLLHDHETWSSSGSSPIQYLKRQTRSSPMLQHKISETIESRAHHKMKAGSPGSEVVTLQQFLEESNKLTSIQLKSSSQENLLDEVMKSLSVSSDFLGKDKPVSCTLARSVSGKTPGDFYDRRTTKPEFLRTGPQKTEDAYTISSAGKPTPSTQGKIKLVKETSVSRQSKDSNPYATLPRASSVISTAEGTTRRTSIHDFLSKDSRLPVSVDSSPPTAGSSSTTASNVNKVQESRNSKSRSREQQSS 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IAQVEDNIRSLENQMEDLERNEKTLDNKIEKKKQELERQEKRLSTLQS-VR--PAYMDEYERLQG------ELNGLYQSYLDRFRNLEFLENELEAYYQ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8bd7.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 6' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LEU 253 253 ? A 452.491 421.172 391.264 1 1 V LEU 0.220 1 ATOM 2 C CA . LEU 253 253 ? A 453.414 421.473 392.422 1 1 V LEU 0.220 1 ATOM 3 C C . LEU 253 253 ? A 454.128 420.292 393.060 1 1 V LEU 0.220 1 ATOM 4 O O . LEU 253 253 ? A 455.323 420.368 393.309 1 1 V LEU 0.220 1 ATOM 5 C CB . LEU 253 253 ? A 452.666 422.263 393.514 1 1 V LEU 0.220 1 ATOM 6 C CG . LEU 253 253 ? A 452.175 423.662 393.095 1 1 V LEU 0.220 1 ATOM 7 C CD1 . LEU 253 253 ? A 451.281 424.247 394.198 1 1 V LEU 0.220 1 ATOM 8 C CD2 . LEU 253 253 ? A 453.335 424.628 392.802 1 1 V LEU 0.220 1 ATOM 9 N N . ALA 254 254 ? A 453.441 419.156 393.314 1 1 V ALA 0.350 1 ATOM 10 C CA . ALA 254 254 ? A 454.066 417.923 393.760 1 1 V ALA 0.350 1 ATOM 11 C C . ALA 254 254 ? A 455.124 417.379 392.789 1 1 V ALA 0.350 1 ATOM 12 O O . ALA 254 254 ? A 456.232 417.055 393.200 1 1 V ALA 0.350 1 ATOM 13 C CB . ALA 254 254 ? A 452.949 416.898 394.016 1 1 V ALA 0.350 1 ATOM 14 N N . ASP 255 255 ? A 454.862 417.376 391.465 1 1 V ASP 0.510 1 ATOM 15 C CA . ASP 255 255 ? A 455.874 417.005 390.492 1 1 V ASP 0.510 1 ATOM 16 C C . ASP 255 255 ? A 457.003 418.010 390.341 1 1 V ASP 0.510 1 ATOM 17 O O . ASP 255 255 ? A 458.113 417.658 389.963 1 1 V ASP 0.510 1 ATOM 18 C CB . ASP 255 255 ? A 455.238 416.742 389.114 1 1 V ASP 0.510 1 ATOM 19 C CG . ASP 255 255 ? A 454.348 415.511 389.177 1 1 V ASP 0.510 1 ATOM 20 O OD1 . ASP 255 255 ? A 454.446 414.749 390.169 1 1 V ASP 0.510 1 ATOM 21 O OD2 . ASP 255 255 ? A 453.550 415.357 388.225 1 1 V ASP 0.510 1 ATOM 22 N N . ALA 256 256 ? A 456.783 419.298 390.674 1 1 V ALA 0.600 1 ATOM 23 C CA . ALA 256 256 ? A 457.859 420.266 390.788 1 1 V ALA 0.600 1 ATOM 24 C C . ALA 256 256 ? A 458.804 419.887 391.934 1 1 V ALA 0.600 1 ATOM 25 O O . ALA 256 256 ? A 460.020 419.881 391.770 1 1 V ALA 0.600 1 ATOM 26 C CB . ALA 256 256 ? A 457.320 421.710 390.926 1 1 V ALA 0.600 1 ATOM 27 N N . LYS 257 257 ? A 458.244 419.463 393.092 1 1 V LYS 0.590 1 ATOM 28 C CA . LYS 257 257 ? A 458.976 418.875 394.207 1 1 V LYS 0.590 1 ATOM 29 C C . LYS 257 257 ? A 459.715 417.591 393.852 1 1 V LYS 0.590 1 ATOM 30 O O . LYS 257 257 ? A 460.849 417.372 394.279 1 1 V LYS 0.590 1 ATOM 31 C CB . LYS 257 257 ? A 458.073 418.587 395.425 1 1 V LYS 0.590 1 ATOM 32 C CG . LYS 257 257 ? A 457.505 419.843 396.091 1 1 V LYS 0.590 1 ATOM 33 C CD . LYS 257 257 ? A 456.550 419.476 397.236 1 1 V LYS 0.590 1 ATOM 34 C CE . LYS 257 257 ? A 455.984 420.703 397.951 1 1 V LYS 0.590 1 ATOM 35 N NZ . LYS 257 257 ? A 455.055 420.290 399.026 1 1 V LYS 0.590 1 ATOM 36 N N . ALA 258 258 ? A 459.094 416.710 393.044 1 1 V ALA 0.700 1 ATOM 37 C CA . ALA 258 258 ? A 459.753 415.562 392.460 1 1 V ALA 0.700 1 ATOM 38 C C . ALA 258 258 ? A 460.901 415.923 391.508 1 1 V ALA 0.700 1 ATOM 39 O O . ALA 258 258 ? A 461.973 415.328 391.559 1 1 V ALA 0.700 1 ATOM 40 C CB . ALA 258 258 ? A 458.723 414.666 391.744 1 1 V ALA 0.700 1 ATOM 41 N N . LYS 259 259 ? A 460.735 416.925 390.620 1 1 V LYS 0.660 1 ATOM 42 C CA . LYS 259 259 ? A 461.792 417.418 389.745 1 1 V LYS 0.660 1 ATOM 43 C C . LYS 259 259 ? A 462.966 418.053 390.466 1 1 V LYS 0.660 1 ATOM 44 O O . LYS 259 259 ? A 464.119 417.763 390.147 1 1 V LYS 0.660 1 ATOM 45 C CB . LYS 259 259 ? A 461.253 418.409 388.695 1 1 V LYS 0.660 1 ATOM 46 C CG . LYS 259 259 ? A 460.344 417.730 387.665 1 1 V LYS 0.660 1 ATOM 47 C CD . LYS 259 259 ? A 459.743 418.738 386.680 1 1 V LYS 0.660 1 ATOM 48 C CE . LYS 259 259 ? A 458.764 418.090 385.702 1 1 V LYS 0.660 1 ATOM 49 N NZ . LYS 259 259 ? A 458.222 419.108 384.777 1 1 V LYS 0.660 1 ATOM 50 N N . ILE 260 260 ? A 462.715 418.900 391.486 1 1 V ILE 0.670 1 ATOM 51 C CA . ILE 260 260 ? A 463.775 419.438 392.331 1 1 V ILE 0.670 1 ATOM 52 C C . ILE 260 260 ? A 464.468 418.341 393.121 1 1 V ILE 0.670 1 ATOM 53 O O . ILE 260 260 ? A 465.675 418.386 393.336 1 1 V ILE 0.670 1 ATOM 54 C CB . ILE 260 260 ? A 463.401 420.633 393.213 1 1 V ILE 0.670 1 ATOM 55 C CG1 . ILE 260 260 ? A 462.486 420.217 394.384 1 1 V ILE 0.670 1 ATOM 56 C CG2 . ILE 260 260 ? A 462.811 421.727 392.295 1 1 V ILE 0.670 1 ATOM 57 C CD1 . ILE 260 260 ? A 461.906 421.346 395.242 1 1 V ILE 0.670 1 ATOM 58 N N . ARG 261 261 ? A 463.747 417.279 393.548 1 1 V ARG 0.620 1 ATOM 59 C CA . ARG 261 261 ? A 464.381 416.081 394.065 1 1 V ARG 0.620 1 ATOM 60 C C . ARG 261 261 ? A 465.259 415.364 393.055 1 1 V ARG 0.620 1 ATOM 61 O O . ARG 261 261 ? A 466.379 414.984 393.382 1 1 V ARG 0.620 1 ATOM 62 C CB . ARG 261 261 ? A 463.349 415.080 394.629 1 1 V ARG 0.620 1 ATOM 63 C CG . ARG 261 261 ? A 463.927 413.773 395.223 1 1 V ARG 0.620 1 ATOM 64 C CD . ARG 261 261 ? A 464.837 413.974 396.444 1 1 V ARG 0.620 1 ATOM 65 N NE . ARG 261 261 ? A 466.283 413.923 396.010 1 1 V ARG 0.620 1 ATOM 66 C CZ . ARG 261 261 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.594 2 1 3 0.001 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 253 LEU 1 0.220 2 1 A 254 ALA 1 0.350 3 1 A 255 ASP 1 0.510 4 1 A 256 ALA 1 0.600 5 1 A 257 LYS 1 0.590 6 1 A 258 ALA 1 0.700 7 1 A 259 LYS 1 0.660 8 1 A 260 ILE 1 0.670 9 1 A 261 ARG 1 0.620 10 1 A 262 ARG 1 0.630 11 1 A 263 LEU 1 0.690 12 1 A 264 ARG 1 0.620 13 1 A 265 GLN 1 0.690 14 1 A 266 GLU 1 0.700 15 1 A 267 LEU 1 0.700 16 1 A 268 GLU 1 0.700 17 1 A 269 GLU 1 0.710 18 1 A 270 LYS 1 0.710 19 1 A 271 THR 1 0.700 20 1 A 272 GLU 1 0.680 21 1 A 273 GLN 1 0.690 22 1 A 274 LEU 1 0.700 23 1 A 275 LEU 1 0.690 24 1 A 276 ASP 1 0.690 25 1 A 277 CYS 1 0.670 26 1 A 278 LYS 1 0.680 27 1 A 279 GLN 1 0.670 28 1 A 280 GLU 1 0.660 29 1 A 281 LEU 1 0.650 30 1 A 282 GLU 1 0.650 31 1 A 283 GLN 1 0.650 32 1 A 284 ILE 1 0.640 33 1 A 285 GLU 1 0.650 34 1 A 286 VAL 1 0.670 35 1 A 287 GLU 1 0.640 36 1 A 288 LEU 1 0.650 37 1 A 289 LYS 1 0.640 38 1 A 290 ARG 1 0.600 39 1 A 291 LEU 1 0.720 40 1 A 292 GLN 1 0.670 41 1 A 293 GLN 1 0.660 42 1 A 294 GLU 1 0.670 43 1 A 295 ASN 1 0.680 44 1 A 296 MET 1 0.630 45 1 A 297 ASN 1 0.650 46 1 A 298 LEU 1 0.610 47 1 A 299 LEU 1 0.570 48 1 A 300 SER 1 0.550 49 1 A 301 ASP 1 0.520 50 1 A 302 ALA 1 0.660 51 1 A 303 ARG 1 0.400 52 1 A 304 SER 1 0.460 53 1 A 305 ALA 1 0.490 54 1 A 306 ARG 1 0.410 55 1 A 307 MET 1 0.420 56 1 A 308 TYR 1 0.540 57 1 A 309 ARG 1 0.540 58 1 A 310 ASP 1 0.600 59 1 A 311 GLU 1 0.620 60 1 A 312 LEU 1 0.630 61 1 A 313 ASP 1 0.630 62 1 A 314 ALA 1 0.640 63 1 A 315 LEU 1 0.620 64 1 A 316 ARG 1 0.400 65 1 A 317 GLU 1 0.340 66 1 A 318 LYS 1 0.450 67 1 A 319 ALA 1 0.380 68 1 A 320 VAL 1 0.270 69 1 A 321 ARG 1 0.200 70 1 A 322 VAL 1 0.310 71 1 A 323 ASP 1 0.480 72 1 A 324 LYS 1 0.650 73 1 A 325 LEU 1 0.650 74 1 A 326 GLU 1 0.640 75 1 A 327 SER 1 0.710 76 1 A 328 GLU 1 0.590 77 1 A 329 LEU 1 0.630 78 1 A 330 SER 1 0.630 79 1 A 331 ARG 1 0.580 80 1 A 332 TYR 1 0.630 81 1 A 333 LYS 1 0.630 82 1 A 334 GLU 1 0.620 83 1 A 335 ARG 1 0.560 84 1 A 336 LEU 1 0.660 85 1 A 337 HIS 1 0.650 86 1 A 338 ASP 1 0.620 87 1 A 339 ILE 1 0.600 88 1 A 340 GLU 1 0.620 89 1 A 341 PHE 1 0.600 90 1 A 342 TYR 1 0.600 91 1 A 343 LYS 1 0.650 92 1 A 344 ALA 1 0.690 93 1 A 345 ARG 1 0.550 94 1 A 346 VAL 1 0.650 95 1 A 347 GLU 1 0.630 96 1 A 348 GLU 1 0.600 97 1 A 349 LEU 1 0.580 98 1 A 350 LYS 1 0.440 99 1 A 351 GLU 1 0.410 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #