data_SMR-13175deaa77ce0f95b3a972805ade38f_2 _entry.id SMR-13175deaa77ce0f95b3a972805ade38f_2 _struct.entry_id SMR-13175deaa77ce0f95b3a972805ade38f_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q6DFV3/ RHG21_MOUSE, Rho GTPase-activating protein 21 Estimated model accuracy of this model is 0.051, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q6DFV3' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 251209.345 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP RHG21_MOUSE Q6DFV3 1 ;MMATHWTGLPEEDGDKLKACGAASACEVSKNKDGKDQGEPVSPSEDEPFSWPGPKTVMLKRTSQGFGFTL RHFIVYPPESAIQFSYKDEENGNRGGKQRNRLEPMDTIFVKQVKEGGPAFEAGLCTGDRIIKVNGESVIG KTYSQVIALIQNSDTTLELSVMPKDEDILQVAYSQDAYLKGNEAYSGNARNIPEPPPVCYPWLPSTPSAT AQPVETCPPDSLPNKQQTSAPVLTQPGRAYRMEIQVPPSPTDVAKSNTAVCVCNESVRTVIVPSEKVVDL LANRNNPSGPSHRTEEVRYGVNEQASTKAASRTTSPASVPTAHLIHQTTGSRSLEPSGILLKSGNYSGHS EGISSSRSQAVDSPPVSVNHYSANSHQHIDWKNYKTYKEYIDNRRLHIGCRTIQERLDSLRAASQSAADY NQVVPTRTTLQVRRRSTSHDRVPQSVQIRQRSVSQERLEDSVLMKYCPRSASQGALTSPPVSFNNHRTRS WDYIEGQTEATATVNSESQIPDSNGERKQTYKWSGFTEQDDRRGIHERPRQQEMHKPFRGSNLTVAPVVN SDNRRLVGRGVGPVSQFKKIPPDLRPPHSNRNFPTTTGVSLQRGIAQDRSPLVKVRSNSLKVPPPPVSKP SFSQHSLASMKDQRPVNHLHQHSVLSQQTQFRSESTFEHQLETEVSSCLPGTSAKTSPQLSENLGTSDLE LPAIPRNGDINLQEAEIQQPDVLDNKESVILREKPQSGRQTPQPLRHQSYILAVNDQETGSDTTCWLPND ARREVHIKRMEERKASSTSPPGDSLASIPFIDEPTSPSIDHEIAHIPASAVISASTAHVPSIATVPPSLT TSAPLIRRQLSHDQESVGPPSLDGQHSSKTERSKSYDEGLDDYREDAKLSFKHVSSLKGIKITDSQKSSE DSGSRKGSSSEVFSDAAREGWLQFRPLVTDKGKRVGGSIRPWKQMYVVLRGHSLYLYKDRREQTTPSEEE QPISVNACLIDISYSETKRRNVFRLTTSDCECLFQAEDRDDMLSWIKTIQESSNLNEEDTGVTNRDLISR RIKEYNSLLSKTEQLPKTPRQSLSIRQTLLGAKSEPKTQSPHSPKEESERKLLSKDDTSPPKDKGTWRRG IPSIVRKTFEKKPAATGTFGVRLDDCPPAHTNRYIPLIVDICCKLVEERGLEYTGIYRVPGNNAAISSMQ EELNKGMADIDIQDDKWRDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTNDKYADFIEANRKEDPLDRLRTLKRLIHDL PEHHFETLKFLSAHLKTVAENSEKNKMEPRNLAIVFGPTLVRTSEDNMTHMVTHMPDQYKIVETLIQHHD WFFTEEGAEEPLTAVQEENTVDSQPVPNIDHLLTNIGRTGVLPGDVSDSATSDSAKSKGSWGSGKDQYSR ELLVSSIFAAASRKRKKPKEKAQPSSSEDELDSVFFKKENTEQSHSEIKEESKRESETSGSKQRVVVAKE SNTKKDSGTTKEEKKIPWEEPPPPHSSKRNRSPTLSCRLAMLKEGPRSLLTQKPHCEETGSDSGTLLSTS SQASLLRSSTKKSTSPETKHSEFLSIAGTTTSDYSTTSSTTYLTSLDSSRLSPEVQSVAESKGDEADDER SELVSEGRPVETDSESEFPVFPTTLTSDRLFRGKFQEVARVSRRNSEGSEASCTEGSLTPSLDSRRQQFS SHRLIECDTLSRKKSARFKSDSGSPGDTRTEKETPALAKMFDVMKKGKSTGSLLTPSRSESEKQEATWKT KIADRLKLRPRAPADDMFGVGNQKPTAETAKRKNIKRRHTLGGHRDATEISVLSFWKAHEQSADKESELS AVNRLKPKCSAQDLSISDWLARERVRTSASDLSRGEGLEPQAESPSVLGTPISTHSPPSQQPEARVAATS TLASTSQSPLFTPPQSPDQINRESFQNMSQNASSTANIHPHKQSESPDTKAETPP ; 'Rho GTPase-activating protein 21' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1945 1 1945 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . RHG21_MOUSE Q6DFV3 . 1 1945 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2022-12-14 1C02406759A1BB8B # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MMATHWTGLPEEDGDKLKACGAASACEVSKNKDGKDQGEPVSPSEDEPFSWPGPKTVMLKRTSQGFGFTL RHFIVYPPESAIQFSYKDEENGNRGGKQRNRLEPMDTIFVKQVKEGGPAFEAGLCTGDRIIKVNGESVIG KTYSQVIALIQNSDTTLELSVMPKDEDILQVAYSQDAYLKGNEAYSGNARNIPEPPPVCYPWLPSTPSAT AQPVETCPPDSLPNKQQTSAPVLTQPGRAYRMEIQVPPSPTDVAKSNTAVCVCNESVRTVIVPSEKVVDL LANRNNPSGPSHRTEEVRYGVNEQASTKAASRTTSPASVPTAHLIHQTTGSRSLEPSGILLKSGNYSGHS EGISSSRSQAVDSPPVSVNHYSANSHQHIDWKNYKTYKEYIDNRRLHIGCRTIQERLDSLRAASQSAADY NQVVPTRTTLQVRRRSTSHDRVPQSVQIRQRSVSQERLEDSVLMKYCPRSASQGALTSPPVSFNNHRTRS WDYIEGQTEATATVNSESQIPDSNGERKQTYKWSGFTEQDDRRGIHERPRQQEMHKPFRGSNLTVAPVVN SDNRRLVGRGVGPVSQFKKIPPDLRPPHSNRNFPTTTGVSLQRGIAQDRSPLVKVRSNSLKVPPPPVSKP 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B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'RHO-GTPASE ACTIVATING PROTEIN 10 {PDB ID=2j59, label_asym_id=G, auth_asym_id=M, SMTL ID=2j59.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 2j59, label_asym_id=G' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A G 2 1 M # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;SDAAKEGWLHFRPLVTDKGKRVGGSIRPWKQMYVVLRGHSLYLYKDKREQTTPSEEEQPISVNACLIDIS YSETKRKNVFRLTTSDCECLFQAEDRDDMLAWIKTIQESSNLNEEDTGVTNRDLISRRIKEYNNLMSKAE QLPKTPRQSLSIRQTLLGAKSEPKTQSP ; ;SDAAKEGWLHFRPLVTDKGKRVGGSIRPWKQMYVVLRGHSLYLYKDKREQTTPSEEEQPISVNACLIDIS YSETKRKNVFRLTTSDCECLFQAEDRDDMLAWIKTIQESSNLNEEDTGVTNRDLISRRIKEYNNLMSKAE QLPKTPRQSLSIRQTLLGAKSEPKTQSP ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 168 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2j59 2023-12-13 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1945 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1945 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 3.13e-106 95.238 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MMATHWTGLPEEDGDKLKACGAASACEVSKNKDGKDQGEPVSPSEDEPFSWPGPKTVMLKRTSQGFGFTLRHFIVYPPESAIQFSYKDEENGNRGGKQRNRLEPMDTIFVKQVKEGGPAFEAGLCTGDRIIKVNGESVIGKTYSQVIALIQNSDTTLELSVMPKDEDILQVAYSQDAYLKGNEAYSGNARNIPEPPPVCYPWLPSTPSATAQPVETCPPDSLPNKQQTSAPVLTQPGRAYRMEIQVPPSPTDVAKSNTAVCVCNESVRTVIVPSEKVVDLLANRNNPSGPSHRTEEVRYGVNEQASTKAASRTTSPASVPTAHLIHQTTGSRSLEPSGILLKSGNYSGHSEGISSSRSQAVDSPPVSVNHYSANSHQHIDWKNYKTYKEYIDNRRLHIGCRTIQERLDSLRAASQSAADYNQVVPTRTTLQVRRRSTSHDRVPQSVQIRQRSVSQERLEDSVLMKYCPRSASQGALTSPPVSFNNHRTRSWDYIEGQTEATATVNSESQIPDSNGERKQTYKWSGFTEQDDRRGIHERPRQQEMHKPFRGSNLTVAPVVNSDNRRLVGRGVGPVSQFKKIPPDLRPPHSNRNFPTTTGVSLQRGIAQDRSPLVKVRSNSLKVPPPPVSKPSFSQHSLASMKDQRPVNHLHQHSVLSQQTQFRSESTFEHQLETEVSSCLPGTSAKTSPQLSENLGTSDLELPAIPRNGDINLQEAEIQQPDVLDNKESVILREKPQSGRQTPQPLRHQSYILAVNDQETGSDTTCWLPNDARREVHIKRMEERKASSTSPPGDSLASIPFIDEPTSPSIDHEIAHIPASAVISASTAHVPSIATVPPSLTTSAPLIRRQLSHDQESVGPPSLDGQHSSKTERSKSYDEGLDDYREDAKLSFKHVSSLKGIKITDSQKSSEDSGSRKGSSSEVFSDAAREGWLQFRPLVTDKGKRVGGSIRPWKQMYVVLRGHSLYLYKDRREQTTPSEEEQPISVNACLIDISYSETKRRNVFRLTTSDCECLFQAEDRDDMLSWIKTIQESSNLNEEDTGVTNRDLISRRIKEYNSLLSKTEQLPKTPRQSLSIRQTLLGAKSEPKTQSPHSPKEESERKLLSKDDTSPPKDKGTWRRGIPSIVRKTFEKKPAATGTFGVRLDDCPPAHTNRYIPLIVDICCKLVEERGLEYTGIYRVPGNNAAISSMQEELNKGMADIDIQDDKWRDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTNDKYADFIEANRKEDPLDRLRTLKRLIHDLPEHHFETLKFLSAHLKTVAENSEKNKMEPRNLAIVFGPTLVRTSEDNMTHMVTHMPDQYKIVETLIQHHDWFFTEEGAEEPLTAVQEENTVDSQPVPNIDHLLTNIGRTGVLPGDVSDSATSDSAKSKGSWGSGKDQYSRELLVSSIFAAASRKRKKPKEKAQPSSSEDELDSVFFKKENTEQSHSEIKEESKRESETSGSKQRVVVAKESNTKKDSGTTKEEKKIPWEEPPPPHSSKRNRSPTLSCRLAMLKEGPRSLLTQKPHCEETGSDSGTLLSTSSQASLLRSSTKKSTSPETKHSEFLSIAGTTTSDYSTTSSTTYLTSLDSSRLSPEVQSVAESKGDEADDERSELVSEGRPVETDSESEFPVFPTTLTSDRLFRGKFQEVARVSRRNSEGSEASCTEGSLTPSLDSRRQQFSSHRLIECDTLSRKKSARFKSDSGSPGDTRTEKETPALAKMFDVMKKGKSTGSLLTPSRSESEKQEATWKTKIADRLKLRPRAPADDMFGVGNQKPTAETAKRKNIKRRHTLGGHRDATEISVLSFWKAHEQSADKESELSAVNRLKPKCSAQDLSISDWLARERVRTSASDLSRGEGLEPQAESPSVLGTPISTHSPPSQQPEARVAATSTLASTSQSPLFTPPQSPDQINRESFQNMSQNASSTANIHPHKQSESPDTKAETPP 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SDAAKEGWLHFRPLVTDKGKRVGGSIRPWKQMYVVLRGHSLYLYKDKREQTTPSEEEQPISVNACLIDISYSETKRKNVFRLTTSDCECLFQAEDRDDMLAWIKTIQESSNLNEEDTGVTNRDLISRRIKEYNNLMSKAEQLPKTPRQSLSIRQTLLGAKSEPKTQSP-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2j59.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ALA 926 926 ? A -8.784 2.710 78.244 1 1 B ALA 0.720 1 ATOM 2 C CA . ALA 926 926 ? A -7.822 2.469 77.136 1 1 B ALA 0.720 1 ATOM 3 C C . ALA 926 926 ? A -8.150 3.361 75.969 1 1 B ALA 0.720 1 ATOM 4 O O . ALA 926 926 ? A -9.284 3.802 75.848 1 1 B ALA 0.720 1 ATOM 5 C CB . ALA 926 926 ? A -7.935 0.988 76.766 1 1 B ALA 0.720 1 ATOM 6 N N . ALA 927 927 ? A -7.166 3.685 75.113 1 1 B ALA 0.700 1 ATOM 7 C CA . ALA 927 927 ? A -7.450 4.369 73.866 1 1 B ALA 0.700 1 ATOM 8 C C . ALA 927 927 ? A -8.007 3.410 72.825 1 1 B ALA 0.700 1 ATOM 9 O O . ALA 927 927 ? A -8.873 3.740 72.021 1 1 B ALA 0.700 1 ATOM 10 C CB . ALA 927 927 ? A -6.182 5.051 73.331 1 1 B ALA 0.700 1 ATOM 11 N N . ARG 928 928 ? A -7.497 2.168 72.844 1 1 B ARG 0.820 1 ATOM 12 C CA . ARG 928 928 ? A -8.011 1.088 72.043 1 1 B ARG 0.820 1 ATOM 13 C C . ARG 928 928 ? A -7.609 -0.214 72.703 1 1 B ARG 0.820 1 ATOM 14 O O . ARG 928 928 ? A -6.573 -0.285 73.366 1 1 B ARG 0.820 1 ATOM 15 C CB . ARG 928 928 ? A -7.451 1.171 70.602 1 1 B ARG 0.820 1 ATOM 16 C CG . ARG 928 928 ? A -8.058 0.159 69.618 1 1 B ARG 0.820 1 ATOM 17 C CD . ARG 928 928 ? A -7.577 0.374 68.182 1 1 B ARG 0.820 1 ATOM 18 N NE . ARG 928 928 ? A -8.365 -0.537 67.295 1 1 B ARG 0.820 1 ATOM 19 C CZ . ARG 928 928 ? A -9.568 -0.229 66.801 1 1 B ARG 0.820 1 ATOM 20 N NH1 . ARG 928 928 ? A -10.186 0.907 67.128 1 1 B ARG 0.820 1 ATOM 21 N NH2 . ARG 928 928 ? A -10.169 -1.031 65.934 1 1 B ARG 0.820 1 ATOM 22 N N . GLU 929 929 ? A -8.423 -1.269 72.526 1 1 B GLU 0.830 1 ATOM 23 C CA . GLU 929 929 ? A -8.113 -2.598 72.993 1 1 B GLU 0.830 1 ATOM 24 C C . GLU 929 929 ? A -8.764 -3.627 72.091 1 1 B GLU 0.830 1 ATOM 25 O O . GLU 929 929 ? A -9.764 -3.359 71.428 1 1 B GLU 0.830 1 ATOM 26 C CB . GLU 929 929 ? A -8.486 -2.835 74.472 1 1 B GLU 0.830 1 ATOM 27 C CG . GLU 929 929 ? A -9.922 -2.456 74.884 1 1 B GLU 0.830 1 ATOM 28 C CD . GLU 929 929 ? A -10.032 -2.494 76.405 1 1 B GLU 0.830 1 ATOM 29 O OE1 . GLU 929 929 ? A -9.985 -1.398 77.030 1 1 B GLU 0.830 1 ATOM 30 O OE2 . GLU 929 929 ? A -10.120 -3.619 76.961 1 1 B GLU 0.830 1 ATOM 31 N N . GLY 930 930 ? A -8.177 -4.837 71.999 1 1 B GLY 0.890 1 ATOM 32 C CA . GLY 930 930 ? A -8.675 -5.865 71.097 1 1 B GLY 0.890 1 ATOM 33 C C . GLY 930 930 ? A -7.694 -6.985 70.950 1 1 B GLY 0.890 1 ATOM 34 O O . GLY 930 930 ? A -6.524 -6.870 71.296 1 1 B GLY 0.890 1 ATOM 35 N N . TRP 931 931 ? A -8.158 -8.140 70.445 1 1 B TRP 0.830 1 ATOM 36 C CA . TRP 931 931 ? A -7.276 -9.237 70.102 1 1 B TRP 0.830 1 ATOM 37 C C . TRP 931 931 ? A -6.496 -8.959 68.826 1 1 B TRP 0.830 1 ATOM 38 O O . TRP 931 931 ? A -7.040 -8.466 67.844 1 1 B TRP 0.830 1 ATOM 39 C CB . TRP 931 931 ? A -8.062 -10.564 69.943 1 1 B TRP 0.830 1 ATOM 40 C CG . TRP 931 931 ? A -8.693 -11.100 71.211 1 1 B TRP 0.830 1 ATOM 41 C CD1 . TRP 931 931 ? A -9.993 -11.053 71.638 1 1 B TRP 0.830 1 ATOM 42 C CD2 . TRP 931 931 ? A -7.980 -11.866 72.204 1 1 B TRP 0.830 1 ATOM 43 N NE1 . TRP 931 931 ? A -10.139 -11.734 72.837 1 1 B TRP 0.830 1 ATOM 44 C CE2 . TRP 931 931 ? A -8.899 -12.234 73.187 1 1 B TRP 0.830 1 ATOM 45 C CE3 . TRP 931 931 ? A -6.642 -12.243 72.283 1 1 B TRP 0.830 1 ATOM 46 C CZ2 . TRP 931 931 ? A -8.515 -13.004 74.282 1 1 B TRP 0.830 1 ATOM 47 C CZ3 . TRP 931 931 ? A -6.245 -13.027 73.381 1 1 B TRP 0.830 1 ATOM 48 C CH2 . TRP 931 931 ? A -7.167 -13.398 74.367 1 1 B TRP 0.830 1 ATOM 49 N N . LEU 932 932 ? A -5.198 -9.297 68.813 1 1 B LEU 0.850 1 ATOM 50 C CA . LEU 932 932 ? A -4.370 -9.183 67.633 1 1 B LEU 0.850 1 ATOM 51 C C . LEU 932 932 ? A -3.513 -10.432 67.578 1 1 B LEU 0.850 1 ATOM 52 O O . LEU 932 932 ? A -3.140 -11.006 68.600 1 1 B LEU 0.850 1 ATOM 53 C CB . LEU 932 932 ? A -3.437 -7.935 67.669 1 1 B LEU 0.850 1 ATOM 54 C CG . LEU 932 932 ? A -4.152 -6.564 67.624 1 1 B LEU 0.850 1 ATOM 55 C CD1 . LEU 932 932 ? A -3.180 -5.406 67.890 1 1 B LEU 0.850 1 ATOM 56 C CD2 . LEU 932 932 ? A -4.840 -6.329 66.279 1 1 B LEU 0.850 1 ATOM 57 N N . GLN 933 933 ? A -3.153 -10.903 66.369 1 1 B GLN 0.810 1 ATOM 58 C CA . GLN 933 933 ? A -2.097 -11.897 66.257 1 1 B GLN 0.810 1 ATOM 59 C C . GLN 933 933 ? A -0.771 -11.173 66.218 1 1 B GLN 0.810 1 ATOM 60 O O . GLN 933 933 ? A -0.604 -10.212 65.477 1 1 B GLN 0.810 1 ATOM 61 C CB . GLN 933 933 ? A -2.201 -12.785 64.999 1 1 B GLN 0.810 1 ATOM 62 C CG . GLN 933 933 ? A -3.522 -13.572 64.892 1 1 B GLN 0.810 1 ATOM 63 C CD . GLN 933 933 ? A -3.570 -14.717 65.899 1 1 B GLN 0.810 1 ATOM 64 O OE1 . GLN 933 933 ? A -2.559 -15.332 66.228 1 1 B GLN 0.810 1 ATOM 65 N NE2 . GLN 933 933 ? A -4.793 -15.054 66.366 1 1 B GLN 0.810 1 ATOM 66 N N . PHE 934 934 ? A 0.201 -11.604 67.024 1 1 B PHE 0.790 1 ATOM 67 C CA . PHE 934 934 ? A 1.459 -10.916 67.203 1 1 B PHE 0.790 1 ATOM 68 C C . PHE 934 934 ? A 2.604 -11.839 66.819 1 1 B PHE 0.790 1 ATOM 69 O O . PHE 934 934 ? A 2.602 -13.017 67.174 1 1 B PHE 0.790 1 ATOM 70 C CB . PHE 934 934 ? A 1.546 -10.463 68.692 1 1 B PHE 0.790 1 ATOM 71 C CG . PHE 934 934 ? 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A 6.625 -13.053 60.588 1 1 B ARG 0.790 1 ATOM 86 N NH1 . ARG 935 935 ? A 7.806 -13.014 61.197 1 1 B ARG 0.790 1 ATOM 87 N NH2 . ARG 935 935 ? A 6.565 -12.869 59.274 1 1 B ARG 0.790 1 ATOM 88 N N . PRO 936 936 ? A 7.184 -11.016 66.765 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 89 C CA . PRO 936 936 ? A 8.280 -10.081 66.649 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 90 C C . PRO 936 936 ? A 9.191 -10.442 65.494 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 91 O O . PRO 936 936 ? A 9.261 -11.592 65.060 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 92 C CB . PRO 936 936 ? A 8.997 -10.159 68.011 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 93 C CG . PRO 936 936 ? A 8.350 -11.327 68.778 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 94 C CD . PRO 936 936 ? A 7.484 -12.048 67.751 1 1 B PRO 0.790 1 ATOM 95 N N . LEU 937 937 ? A 9.890 -9.431 64.961 1 1 B LEU 0.780 1 ATOM 96 C CA . LEU 937 937 ? A 10.972 -9.618 64.024 1 1 B LEU 0.780 1 ATOM 97 C C . LEU 937 937 ? A 12.309 -9.433 64.744 1 1 B LEU 0.780 1 ATOM 98 O O . LEU 937 937 ? A 13.251 -10.199 64.545 1 1 B LEU 0.780 1 ATOM 99 C CB . LEU 937 937 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.728 2 1 3 0.051 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 926 ALA 1 0.720 2 1 A 927 ALA 1 0.700 3 1 A 928 ARG 1 0.820 4 1 A 929 GLU 1 0.830 5 1 A 930 GLY 1 0.890 6 1 A 931 TRP 1 0.830 7 1 A 932 LEU 1 0.850 8 1 A 933 GLN 1 0.810 9 1 A 934 PHE 1 0.790 10 1 A 935 ARG 1 0.790 11 1 A 936 PRO 1 0.790 12 1 A 937 LEU 1 0.780 13 1 A 938 VAL 1 0.730 14 1 A 939 THR 1 0.570 15 1 A 940 ASP 1 0.510 16 1 A 941 LYS 1 0.520 17 1 A 942 GLY 1 0.470 18 1 A 943 LYS 1 0.480 19 1 A 944 ARG 1 0.450 20 1 A 945 VAL 1 0.510 21 1 A 946 GLY 1 0.470 22 1 A 947 GLY 1 0.490 23 1 A 948 SER 1 0.450 24 1 A 949 ILE 1 0.460 25 1 A 950 ARG 1 0.480 26 1 A 951 PRO 1 0.740 27 1 A 952 TRP 1 0.770 28 1 A 953 LYS 1 0.750 29 1 A 954 GLN 1 0.790 30 1 A 955 MET 1 0.780 31 1 A 956 TYR 1 0.820 32 1 A 957 VAL 1 0.830 33 1 A 958 VAL 1 0.820 34 1 A 959 LEU 1 0.830 35 1 A 960 ARG 1 0.770 36 1 A 961 GLY 1 0.790 37 1 A 962 HIS 1 0.800 38 1 A 963 SER 1 0.830 39 1 A 964 LEU 1 0.820 40 1 A 965 TYR 1 0.800 41 1 A 966 LEU 1 0.800 42 1 A 967 TYR 1 0.740 43 1 A 968 LYS 1 0.740 44 1 A 969 ASP 1 0.660 45 1 A 970 ARG 1 0.690 46 1 A 971 ARG 1 0.490 47 1 A 972 GLU 1 0.570 48 1 A 973 GLN 1 0.670 49 1 A 974 THR 1 0.500 50 1 A 975 THR 1 0.470 51 1 A 976 PRO 1 0.520 52 1 A 977 SER 1 0.390 53 1 A 978 GLU 1 0.420 54 1 A 979 GLU 1 0.400 55 1 A 980 GLU 1 0.430 56 1 A 981 GLN 1 0.540 57 1 A 982 PRO 1 0.750 58 1 A 983 ILE 1 0.780 59 1 A 984 SER 1 0.810 60 1 A 985 VAL 1 0.850 61 1 A 986 ASN 1 0.830 62 1 A 987 ALA 1 0.870 63 1 A 988 CYS 1 0.860 64 1 A 989 LEU 1 0.880 65 1 A 990 ILE 1 0.890 66 1 A 991 ASP 1 0.860 67 1 A 992 ILE 1 0.840 68 1 A 993 SER 1 0.820 69 1 A 994 TYR 1 0.570 70 1 A 995 SER 1 0.590 71 1 A 996 GLU 1 0.720 72 1 A 997 THR 1 0.720 73 1 A 998 LYS 1 0.600 74 1 A 999 ARG 1 0.650 75 1 A 1000 ARG 1 0.650 76 1 A 1001 ASN 1 0.770 77 1 A 1002 VAL 1 0.830 78 1 A 1003 PHE 1 0.870 79 1 A 1004 ARG 1 0.840 80 1 A 1005 LEU 1 0.890 81 1 A 1006 THR 1 0.860 82 1 A 1007 THR 1 0.800 83 1 A 1008 SER 1 0.770 84 1 A 1009 ASP 1 0.720 85 1 A 1010 CYS 1 0.780 86 1 A 1011 GLU 1 0.810 87 1 A 1012 CYS 1 0.840 88 1 A 1013 LEU 1 0.830 89 1 A 1014 PHE 1 0.840 90 1 A 1015 GLN 1 0.810 91 1 A 1016 ALA 1 0.830 92 1 A 1017 GLU 1 0.770 93 1 A 1018 ASP 1 0.720 94 1 A 1019 ARG 1 0.730 95 1 A 1020 ASP 1 0.760 96 1 A 1021 ASP 1 0.790 97 1 A 1022 MET 1 0.790 98 1 A 1023 LEU 1 0.800 99 1 A 1024 SER 1 0.840 100 1 A 1025 TRP 1 0.830 101 1 A 1026 ILE 1 0.850 102 1 A 1027 LYS 1 0.820 103 1 A 1028 THR 1 0.830 104 1 A 1029 ILE 1 0.830 105 1 A 1030 GLN 1 0.820 106 1 A 1031 GLU 1 0.820 107 1 A 1032 SER 1 0.820 108 1 A 1033 SER 1 0.800 109 1 A 1034 ASN 1 0.720 110 1 A 1035 LEU 1 0.600 111 1 A 1036 ASN 1 0.630 112 1 A 1037 GLU 1 0.570 113 1 A 1038 GLU 1 0.560 114 1 A 1039 ASP 1 0.610 115 1 A 1040 THR 1 0.720 116 1 A 1041 GLY 1 0.740 117 1 A 1042 VAL 1 0.760 118 1 A 1043 THR 1 0.810 119 1 A 1044 ASN 1 0.840 120 1 A 1045 ARG 1 0.780 121 1 A 1046 ASP 1 0.860 122 1 A 1047 LEU 1 0.880 123 1 A 1048 ILE 1 0.870 124 1 A 1049 SER 1 0.870 125 1 A 1050 ARG 1 0.860 126 1 A 1051 ARG 1 0.870 127 1 A 1052 ILE 1 0.760 128 1 A 1053 LYS 1 0.740 129 1 A 1054 GLU 1 0.790 130 1 A 1055 TYR 1 0.700 131 1 A 1056 ASN 1 0.700 132 1 A 1057 SER 1 0.590 133 1 A 1058 LEU 1 0.550 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. 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