data_SMR-70df824bd3ccdc350892c208fcfd3a3b_5 _entry.id SMR-70df824bd3ccdc350892c208fcfd3a3b_5 _struct.entry_id SMR-70df824bd3ccdc350892c208fcfd3a3b_5 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q10411/ SPO15_SCHPO, Sporulation-specific protein 15 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q10411' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 258345.115 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SPO15_SCHPO Q10411 1 ;MSNQSSSGSNTSDLDEESASSLVSSAASPFIDSDLETPRPNISRASTGQLAEDGDTSSQHEDSSEELKRQ EVRGMRRHSDLSIDAKLGSSEGSTASSALPLTPRSPSNASWLLVRGGLLDSPILDINSVTQKSNLLNELK QVRSKLAALEHENGILSLQLSSSNKKDKNTSSVTTLTSEEDVSYFQKKLTNMESNFSAKQSEAYDLSRQL LTVTEKLDKKEKDYEKIKEDVSSIKASLAEEQASNKSLRGEQERLEKLLVSSNKTVSTLRQTENSLRAEC KTLQEKLEKCAINEEDSKLLEELKHNVANYSDAIVHKDKLIEDLSTRISEFDNLKSERDTLSIKNEKLEK LLRNTIGSLKDSRTSNSQLEEEMVELKESNRTIHSQLTDAESKLSSFEQENKSLKGSIDEYQNNLSSKDK MVKQVSSQLEEARSSLAHATGKLAEINSERDFQNKKIKDFEKIEQDLRACLNSSSNELKEKSALIDKKDQ ELNNLREQIKEQKKVSESTQSSLQSLQRDILNEKKKHEVYESQLNELKGELQTEISNSEHLSSQLSTLAA EKEAAVATNNELSESKNSLQTLCNAFQEKLAKSVMQLKENEQNFSSLDTSFKKLNESHQELENNHQTITK QLKDTSSKLQQLQLERANFEQKESTLSDENNDLRTKLLKLEESNKSLIKKQEDVDSLEKNIQTLKEDLRK SEEALRFSKLEAKNLREVIDNLKGKHETLEAQRNDLHSSLSDAKNTNAILSSELTKSSEDVKRLTANVET LTQDSKAMKQSFTSLVNSYQSISNLYHELRDDHVNMQSQNNTLLESESKLKTDCENLTQQNMTLIDNVQK LMHKHVNQESKVSELKEVNGKLSLDLKNLRSSLNVAISDNDQILTQLAELSKNYDSLEQESAQLNSGLKS LEAEKQLLHTENEELHIRLDKLTGKLKIEESKSSDLGKKLTARQEEISNLKEENMSQSQAITSVKSKLDE TLSKSSKLEADIEHLKNKVSEVEVERNALLASNERLMDDLKNNGENIASLQTEIEKKRAENDDLQSKLSV VSSEYENLLLISSQTNKSLEDKTNQLKYIEKNVQKLLDEKDQRNVELEELTSKYGKLGEENAQIKDELLA LRKKSKKQHDLCANFVDDLKEKSDALEQLTNEKNELIVSLEQSNSNNEALVEERSDLANRLSDMKKSLSD SDNVISVIRSDLVRVNDELDTLKKDKDSLSTQYSEVCQDRDDLLDSLKGCEESFNKYAVSLRELCTKSEI DVPVSEILDDNFVFNAGNFSELSRLTVLSLENYLDAFNQVNFKKMELDNRLTTTDAEFTKVVADLEKLQH EHDDWLIQRGDLEKALKDSEKNFLRKEAEMTENIHSLEEGKEETKKEIAELSSRLEDNQLATNKLKNQLD HLNQEIRLKEDVLKEKESLIISLEESLSNQRQKESSLLDAKNELEHMLDDTSRKNSSLMEKIESINSSLD DKSFELASAVEKLGALQKLHSESLSLMENIKSQLQEAKEKIQVDESTIQELDHEITASKNNYEGKLNDKD SIIRDLSENIEQLNNLLAEEKSAVKRLSTEKESEILQFNSRLADLEYHKSQVESELGRSKLKLASTTEEL QLAENERLSLTTRMLDLQNQVKDLSNIKDSLSEDLRTLRSLEDSVASLQKECKIKSNTVESLQDVLTSVQ ARNAELEDEVSRSVDKIRRRDDRCEHLSGKLKKLHSQLEEQHETFFRAEQQRMTQLGFLKETVKKQEKLL KKLNLRQEQLIPRSSILVYESYIRDIEKEIIVLQERLNGIELSQQLPKGYFGYFFKTNRVEMEVLDSFKQ QVAKLQFLAGAEFIVKFKEDLEKCAAEEKEKQATFDNYSEKVENLGKSIEALYFALNREISFRKSLALSK SAYHNLLVRDSPKFNPDSQITYSIPVTNTKQSLLRSAILCVISLQRLRLLGQRHSFCEEVIENLSCV ; 'Sporulation-specific protein 15' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1957 1 1957 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . SPO15_SCHPO Q10411 . 1 1957 284812 'Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) (Fission yeast)' 1996-10-01 3F480CA06171D9DA # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MSNQSSSGSNTSDLDEESASSLVSSAASPFIDSDLETPRPNISRASTGQLAEDGDTSSQHEDSSEELKRQ EVRGMRRHSDLSIDAKLGSSEGSTASSALPLTPRSPSNASWLLVRGGLLDSPILDINSVTQKSNLLNELK QVRSKLAALEHENGILSLQLSSSNKKDKNTSSVTTLTSEEDVSYFQKKLTNMESNFSAKQSEAYDLSRQL LTVTEKLDKKEKDYEKIKEDVSSIKASLAEEQASNKSLRGEQERLEKLLVSSNKTVSTLRQTENSLRAEC KTLQEKLEKCAINEEDSKLLEELKHNVANYSDAIVHKDKLIEDLSTRISEFDNLKSERDTLSIKNEKLEK LLRNTIGSLKDSRTSNSQLEEEMVELKESNRTIHSQLTDAESKLSSFEQENKSLKGSIDEYQNNLSSKDK MVKQVSSQLEEARSSLAHATGKLAEINSERDFQNKKIKDFEKIEQDLRACLNSSSNELKEKSALIDKKDQ ELNNLREQIKEQKKVSESTQSSLQSLQRDILNEKKKHEVYESQLNELKGELQTEISNSEHLSSQLSTLAA 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Rho-associated protein kinase 1 {PDB ID=3o0z, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=3o0z.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 3o0z, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 5' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQLESLNRELQERNRILENSKSQTDKD YYQLQAILEAERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEEVKHLKHNLEKVEGERKEAQDMLNHSEKEKNNLEID LNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKARLTD ; ;GSLANEKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMSKSISQLESLNRELQERNRILENSKSQTDKD YYQLQAILEAERRDRGHDSEMIGDLQARITSLQEEVKHLKHNLEKVEGERKEAQDMLNHSEKEKNNLEID LNYKLKSLQQRLEQEVNEHKVTKARLTD ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 6 40 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 3o0z 2024-10-16 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1957 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1957 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.089 11.429 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSNQSSSGSNTSDLDEESASSLVSSAASPFIDSDLETPRPNISRASTGQLAEDGDTSSQHEDSSEELKRQEVRGMRRHSDLSIDAKLGSSEGSTASSALPLTPRSPSNASWLLVRGGLLDSPILDINSVTQKSNLLNELKQVRSKLAALEHENGILSLQLSSSNKKDKNTSSVTTLTSEEDVSYFQKKLTNMESNFSAKQSEAYDLSRQLLTVTEKLDKKEKDYEKIKEDVSSIKASLAEEQASNKSLRGEQERLEKLLVSSNKTVSTLRQTENSLRAECKTLQEKLEKCAINEEDSKLLEELKHNVANYSDAIVHKDKLIEDLSTRISEFDNLKSERDTLSIKNEKLEKLLRNTIGSLKDSRTSNSQLEEEMVELKESNRTIHSQLTDAESKLSSFEQENKSLKGSIDEYQNNLSSKDKMVKQVSSQLEEARSSLAHATGKLAEINSERDFQNKKIKDFEKIEQDLRACLNSSSNELKEKSALIDKKDQELNNLREQIKEQKKVSESTQSSLQSLQRDILNEKKKHEVYESQLNELKGELQTEISNSEHLSSQLSTLAAEKEAAVATNNELSESKNSLQTLCNAFQEKLAKSVMQLKENEQNFSSLDTSFKKLNESHQELENNHQTITKQLKDTSSKLQQLQLERANFEQKESTLSDENNDLRTKLLKLEESNKSLIKKQEDVDSLEKNIQTLKEDLRKSEEALRFSKLEAKNLREVIDNLKGKHETLEAQRNDLHSSLSDAKNTNAILSSELTKSSEDVKRLTANVETLTQDSKAMKQSFTSLVNSYQSISNLYHELRDDHVNMQSQNNTLLESESKLKTDCENLTQQNMTLIDNVQKLMHKHVNQESKVSELKEVNGKLSLDLKNLRSSLNVAISDNDQILTQLAELSKNYDSLEQESAQLNSGLKSLEAEKQLLHTENEELHIRLDKLTGKLKIEESKSSDLGKKLTARQEEISNLKEENMSQSQAITSVKSKLDETLSKSSKLEADIEHLKNKVSEVEVERNALLASNERLMDDLKNNGENIASLQTEIEKKRAENDDLQSKLSVVSSEYENLLLISSQTNKSLEDKTNQLKYIEKNVQKLLDEKDQRNVELEELTSKYGKLGEENAQIKDELLALRKKSKKQHDLCANFVDDLKEKSDALEQLTNEKNELIVSLEQSNSNNEALVEERSDLANRLSDMKKSLSDSDNVISVIRSDLVRVNDELDTLKKDKDSLSTQYSEVCQDRDDLLDSLKGCEESFNKYAVSLRELCTKSEIDVPVSEILDDNFVFNAGNFSELSRLTVLSLENYLDAFNQVNFKKMELDNRLTTTDAEFTKVVADLEKLQHEHDDWLIQRGDLEKALKDSEKNFLRKEAEMTENIHSLEEGKEETKKEIAELSSRLEDNQLATNKLKNQLDHLNQEIRLKEDVLKEKESLIISLEESLSNQRQKESSLLDAKNELEHMLDDTSRKNSSLMEKIESINSSLDDKSFELASAVEKLGALQKLHSESLSLMENIKSQLQEAKEKIQVDESTIQELDHEITASKNNYEGKLNDKDSIIRDLSENIEQLNNLLAEEKSAVKRLSTEKESEILQFNSRLADLEYHKSQVESELGRSKLKLASTTEELQLAENERLSLTTRMLDLQNQVKDLSNIKDSLSEDLRTLRSLEDSVASLQKECKIKSNTVESLQDVLTSVQARNAELEDEVSRSVDKIRRRDDRCEHLSGKLKKLHSQLEEQHETFFRAEQQRMTQLGFLKETVKKQEKLLKKLNLRQEQLIPRSSILVYESYIRDIEKEIIVLQERLNGIELSQQLPKGYFGYFFKTNRVEMEVLDSFKQQVAKLQFLAGAEFIVKFKEDLEKCAAEEKEKQATFDNYSEKVENLGKSIEALYFALNREISFRKSLALSKSAYHNLLVRDSPKFNPDSQITYSIPVTNTKQSLLRSAILCVISLQRLRLLGQRHSFCEEVIENLSCV 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EKLSQLQKQLEEANDLLRTESDTAVRLRKSHTEMS------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 3o0z.1, oligomeric state (monomer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 5' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ASP 205 205 ? A 72.915 81.739 309.430 1 1 A ASP 0.240 1 ATOM 2 C CA . ASP 205 205 ? A 72.621 83.193 309.272 1 1 A ASP 0.240 1 ATOM 3 C C . ASP 205 205 ? A 73.191 83.606 307.970 1 1 A ASP 0.240 1 ATOM 4 O O . ASP 205 205 ? A 72.998 82.910 306.983 1 1 A ASP 0.240 1 ATOM 5 C CB . ASP 205 205 ? A 73.182 83.897 310.517 1 1 A ASP 0.240 1 ATOM 6 C CG . ASP 205 205 ? A 72.415 83.293 311.708 1 1 A ASP 0.240 1 ATOM 7 O OD1 . ASP 205 205 ? A 71.572 82.389 311.483 1 1 A ASP 0.240 1 ATOM 8 O OD2 . ASP 205 205 ? A 72.757 83.644 312.838 1 1 A ASP 0.240 1 ATOM 9 N N . LEU 206 206 ? A 73.941 84.713 307.969 1 1 A LEU 0.300 1 ATOM 10 C CA . LEU 206 206 ? A 74.433 85.348 306.776 1 1 A LEU 0.300 1 ATOM 11 C C . LEU 206 206 ? A 75.653 84.631 306.257 1 1 A LEU 0.300 1 ATOM 12 O O . LEU 206 206 ? A 75.954 84.675 305.067 1 1 A LEU 0.300 1 ATOM 13 C CB . LEU 206 206 ? A 74.758 86.822 307.062 1 1 A LEU 0.300 1 ATOM 14 C CG . LEU 206 206 ? A 73.535 87.764 307.272 1 1 A LEU 0.300 1 ATOM 15 C CD1 . LEU 206 206 ? A 73.578 88.870 306.207 1 1 A LEU 0.300 1 ATOM 16 C CD2 . LEU 206 206 ? A 72.114 87.150 307.262 1 1 A LEU 0.300 1 ATOM 17 N N . SER 207 207 ? A 76.327 83.835 307.103 1 1 A SER 0.460 1 ATOM 18 C CA . SER 207 207 ? A 77.385 82.937 306.676 1 1 A SER 0.460 1 ATOM 19 C C . SER 207 207 ? A 76.870 81.883 305.717 1 1 A SER 0.460 1 ATOM 20 O O . SER 207 207 ? A 77.583 81.480 304.794 1 1 A SER 0.460 1 ATOM 21 C CB . SER 207 207 ? A 78.114 82.299 307.884 1 1 A SER 0.460 1 ATOM 22 O OG . SER 207 207 ? A 77.220 81.540 308.703 1 1 A SER 0.460 1 ATOM 23 N N . ARG 208 208 ? A 75.606 81.446 305.811 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 24 C CA . ARG 208 208 ? A 75.039 80.490 304.879 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 25 C C . ARG 208 208 ? A 74.393 81.182 303.694 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 26 O O . ARG 208 208 ? A 74.050 80.544 302.703 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 27 C CB . ARG 208 208 ? A 73.936 79.656 305.577 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 28 C CG . ARG 208 208 ? A 74.478 78.796 306.740 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 29 C CD . ARG 208 208 ? A 73.439 77.886 307.416 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 30 N NE . ARG 208 208 ? A 72.471 78.834 308.089 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 31 C CZ . ARG 208 208 ? A 71.327 78.477 308.696 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 32 N NH1 . ARG 208 208 ? A 70.958 77.199 308.723 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 33 N NH2 . ARG 208 208 ? A 70.484 79.342 309.271 1 1 A ARG 0.410 1 ATOM 34 N N . GLN 209 209 ? A 74.216 82.511 303.749 1 1 A GLN 0.520 1 ATOM 35 C CA . GLN 209 209 ? A 73.687 83.282 302.644 1 1 A GLN 0.520 1 ATOM 36 C C . GLN 209 209 ? A 74.833 83.712 301.765 1 1 A GLN 0.520 1 ATOM 37 O O . GLN 209 209 ? A 74.707 83.731 300.537 1 1 A GLN 0.520 1 ATOM 38 C CB . GLN 209 209 ? A 72.859 84.471 303.178 1 1 A GLN 0.520 1 ATOM 39 C CG . GLN 209 209 ? A 71.348 84.292 302.909 1 1 A GLN 0.520 1 ATOM 40 C CD . GLN 209 209 ? A 70.532 85.097 303.904 1 1 A GLN 0.520 1 ATOM 41 O OE1 . GLN 209 209 ? A 70.053 86.220 303.626 1 1 A GLN 0.520 1 ATOM 42 N NE2 . GLN 209 209 ? A 70.353 84.565 305.120 1 1 A GLN 0.520 1 ATOM 43 N N . LEU 210 210 ? A 76.012 84.013 302.337 1 1 A LEU 0.540 1 ATOM 44 C CA . LEU 210 210 ? A 77.170 84.342 301.539 1 1 A LEU 0.540 1 ATOM 45 C C . LEU 210 210 ? A 77.852 83.135 300.945 1 1 A LEU 0.540 1 ATOM 46 O O . LEU 210 210 ? A 78.407 83.231 299.848 1 1 A LEU 0.540 1 ATOM 47 C CB . LEU 210 210 ? A 78.193 85.247 302.255 1 1 A LEU 0.540 1 ATOM 48 C CG . LEU 210 210 ? A 77.742 86.721 302.396 1 1 A LEU 0.540 1 ATOM 49 C CD1 . LEU 210 210 ? A 78.853 87.507 303.103 1 1 A LEU 0.540 1 ATOM 50 C CD2 . LEU 210 210 ? A 77.424 87.418 301.055 1 1 A LEU 0.540 1 ATOM 51 N N . LEU 211 211 ? A 77.800 81.938 301.544 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 52 C CA . LEU 211 211 ? A 78.374 80.767 300.906 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 53 C C . LEU 211 211 ? A 77.597 80.334 299.660 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 54 O O . LEU 211 211 ? A 78.157 79.758 298.734 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 55 C CB . LEU 211 211 ? A 78.510 79.635 301.943 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 56 C CG . LEU 211 211 ? A 79.576 79.927 303.030 1 1 A LEU 0.570 1 ATOM 57 C CD1 . LEU 211 211 ? 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A 82.454 78.683 278.401 1 1 A LYS 0.670 1 ATOM 181 C C . LYS 226 226 ? A 81.725 79.315 277.236 1 1 A LYS 0.670 1 ATOM 182 O O . LYS 226 226 ? A 82.026 78.999 276.088 1 1 A LYS 0.670 1 ATOM 183 C CB . LYS 226 226 ? A 81.527 77.679 279.113 1 1 A LYS 0.670 1 ATOM 184 C CG . LYS 226 226 ? A 82.315 76.804 280.090 1 1 A LYS 0.670 1 ATOM 185 C CD . LYS 226 226 ? A 81.383 75.817 280.778 1 1 A LYS 0.670 1 ATOM 186 C CE . LYS 226 226 ? A 82.095 74.928 281.775 1 1 A LYS 0.670 1 ATOM 187 N NZ . LYS 226 226 ? A 81.042 74.133 282.421 1 1 A LYS 0.670 1 ATOM 188 N N . ILE 227 227 ? A 80.833 80.298 277.457 1 1 A ILE 0.650 1 ATOM 189 C CA . ILE 227 227 ? A 80.176 81.032 276.381 1 1 A ILE 0.650 1 ATOM 190 C C . ILE 227 227 ? A 81.171 81.740 275.471 1 1 A ILE 0.650 1 ATOM 191 O O . ILE 227 227 ? A 81.037 81.724 274.255 1 1 A ILE 0.650 1 ATOM 192 C CB . ILE 227 227 ? A 79.154 82.049 276.896 1 1 A ILE 0.650 1 ATOM 193 C CG1 . ILE 227 227 ? A 77.992 81.310 277.599 1 1 A ILE 0.650 1 ATOM 194 C CG2 . 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A 86.716 80.665 271.068 1 1 A SER 0.550 1 ATOM 235 N N . SER 233 233 ? A 84.513 79.268 268.782 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 236 C CA . SER 233 233 ? A 84.397 78.086 267.923 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 237 C C . SER 233 233 ? A 83.336 78.210 266.835 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 238 O O . SER 233 233 ? A 83.430 77.516 265.816 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 239 C CB . SER 233 233 ? A 84.088 76.774 268.723 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 240 O OG . SER 233 233 ? A 82.753 76.718 269.239 1 1 A SER 0.520 1 ATOM 241 N N . ILE 234 234 ? A 82.302 79.066 267.015 1 1 A ILE 0.300 1 ATOM 242 C CA . ILE 234 234 ? A 81.269 79.341 266.010 1 1 A ILE 0.300 1 ATOM 243 C C . ILE 234 234 ? A 81.653 80.469 265.055 1 1 A ILE 0.300 1 ATOM 244 O O . ILE 234 234 ? A 80.985 80.681 264.046 1 1 A ILE 0.300 1 ATOM 245 C CB . ILE 234 234 ? A 79.898 79.709 266.619 1 1 A ILE 0.300 1 ATOM 246 C CG1 . ILE 234 234 ? A 79.962 81.057 267.389 1 1 A ILE 0.300 1 ATOM 247 C CG2 . ILE 234 234 ? A 79.432 78.540 267.519 1 1 A ILE 0.300 1 ATOM 248 C CD1 . ILE 234 234 ? A 78.649 81.605 267.966 1 1 A ILE 0.300 1 ATOM 249 N N . LYS 235 235 ? A 82.717 81.225 265.396 1 1 A LYS 0.260 1 ATOM 250 C CA . LYS 235 235 ? A 83.389 82.188 264.549 1 1 A LYS 0.260 1 ATOM 251 C C . LYS 235 235 ? A 84.302 81.519 263.474 1 1 A LYS 0.260 1 ATOM 252 O O . LYS 235 235 ? A 84.631 80.313 263.599 1 1 A LYS 0.260 1 ATOM 253 C CB . LYS 235 235 ? A 84.212 83.159 265.456 1 1 A LYS 0.260 1 ATOM 254 C CG . LYS 235 235 ? A 84.847 84.331 264.689 1 1 A LYS 0.260 1 ATOM 255 C CD . LYS 235 235 ? A 85.651 85.318 265.541 1 1 A LYS 0.260 1 ATOM 256 C CE . LYS 235 235 ? A 86.321 86.367 264.651 1 1 A LYS 0.260 1 ATOM 257 N NZ . LYS 235 235 ? A 87.104 87.295 265.490 1 1 A LYS 0.260 1 ATOM 258 O OXT . LYS 235 235 ? A 84.676 82.231 262.501 1 1 A LYS 0.260 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.570 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 205 ASP 1 0.240 2 1 A 206 LEU 1 0.300 3 1 A 207 SER 1 0.460 4 1 A 208 ARG 1 0.410 5 1 A 209 GLN 1 0.520 6 1 A 210 LEU 1 0.540 7 1 A 211 LEU 1 0.570 8 1 A 212 THR 1 0.620 9 1 A 213 VAL 1 0.660 10 1 A 214 THR 1 0.650 11 1 A 215 GLU 1 0.640 12 1 A 216 LYS 1 0.650 13 1 A 217 LEU 1 0.650 14 1 A 218 ASP 1 0.660 15 1 A 219 LYS 1 0.670 16 1 A 220 LYS 1 0.660 17 1 A 221 GLU 1 0.670 18 1 A 222 LYS 1 0.670 19 1 A 223 ASP 1 0.670 20 1 A 224 TYR 1 0.640 21 1 A 225 GLU 1 0.670 22 1 A 226 LYS 1 0.670 23 1 A 227 ILE 1 0.650 24 1 A 228 LYS 1 0.650 25 1 A 229 GLU 1 0.640 26 1 A 230 ASP 1 0.610 27 1 A 231 VAL 1 0.600 28 1 A 232 SER 1 0.550 29 1 A 233 SER 1 0.520 30 1 A 234 ILE 1 0.300 31 1 A 235 LYS 1 0.260 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #