data_SMR-c307a4fb214ba9e6ee40860006a15c68_3 _entry.id SMR-c307a4fb214ba9e6ee40860006a15c68_3 _struct.entry_id SMR-c307a4fb214ba9e6ee40860006a15c68_3 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q9LUD7/ CALS8_ARATH, Putative callose synthase 8 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9LUD7' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 264344.943 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CALS8_ARATH Q9LUD7 1 ;MSHEIVPVDPIDVPSTSYSRPILGPREDSPERATEFTRSLTFREHVSSEPFDSERLPATLASEIQRFLRI ANLVESEEPRIAYLCRFHAFEIAHHMDRNSTGRGVRQFKTSLLQRLELDEEFTVRRRKEKSDVRELKRVY HAYKEYIIRHGAAFNLDNSQREKLINARRIASVLYEVLKTVTSGAGPQAIADRESIRAKSEFYVPYNILP LDKGGVHQAIMHLPEIKAAVAIVRNTRGLPPPEEFQRHQPFLDLFEFLQYAFGFQNGNVANQREHLILLL SNTIIRQPQKQSSAPKSGDEAVDALMKKFFKNYTNWCKFLGRKNNIRLPYVKQEALQYKTLYIGLYLLIW GEASNLRFMPECLCYIFHHMAYELHGVLTGAVSMITGEKVAPAYGGGHESFLADVVTPIYMVVQKEAEKN KNGTADHSMWRNYDDLNEFFWSLECFEIGWPMRPEHDFFCVESSETSKPGRWRGMLRFRKQTKKTDEEIE DDEELGVLSEEQPKPTSRWLGKTNFVETRSFWQIFRSFDRMWSFFVLSLQALIIMACHDVGSPLQVFNAN IFEDVMSIFITSAILKLIKGILDIIFKWKARNTMPINEKKKRLVKLGFAAMWTIILPVLYSHSRRKYICY FTNYKTWLGEWCFSPYMVAVTIYLTGSAIELVLFFVPAISKYIETSNHGIFKTLSWWGQPRLYVGRGMQE TQVSQFKYTFFWILVLLTKFAFSYAFEIKPLIEPTRLIMKVGVRNYEWHEIFPEVKSNAAAIVAVWAPIM VVYFMDTQIWYSVYCTIFGGLYGVLHHLGEIRTLGMLRGRFHTLPSAFNASLIPHSTKDEKRRKQRGFFP FNLGRGSDGQKNSMAKFVLVWNQVINSFRTEDLISNKELDLMTMPLSSEVLSGIIRWPIFLLANKFSTAL SIAKDFVGKDEVLYRRIRKDEYMYYAVKECYESLKYILQILVVGDLEKKIISGIINEIEESIRQSSLLEE FKMAELPALHDKCIELVQLLVEGSAEQLQVEKSEELHGKLVKALQDIFELVTNDMMVHGDRILDLLQSRE GSGEDTGIFMRVIEPQLFESYGEWRCIHFPLPDSASLSEQIQRFLLLLTVKDSAMDIPENLDARRRLSFF ATSLFMDMPDAPKVRNMMSFSVLTPHYQEDINYSTNELHSTKSSVSIIFYMQKIFPDEWKNFLERMGCDN LDALKKEGKEEELRNWASFRGQTLSRTVRGMMYCREALKLQAFLDMADDEDILEGYKDVERSNRPLAAQL DALADMKFTYVVSCQMFGAQKSSGDPHAQDILDLMIKYPSLRVAYVEEREEIVLDVPKKVYYSILVKAVN GFDQEIYRVKLPGPPNIGEGKPENQNHAIVFTRGEALQTIDMNQDHYLEEAFKMRNLLQEFLRNRGRRPP TILGLREHIFTGSVSSLAWFMSYQETSFVTIGQRLLANPLRVRFHYGHPDVFDRIFHITRGGISKSSRTI NLSEDVFAGYNTTLRRGCITYNEYLQVGKGRDVGLNQISKFEAKVANGNSEQTISRDIYRLGQRFDFFRM LSCYFTTIGFYFSSLISVIGIYIYLYGQLYLVLSGLQKTLILEAKVKNIKSLETALASQSFIQLGLLTGL PMVMEIGLEKGFLIAFQDFILMQLQLAAFFFTFSLGTKTHYFGRTILHGGAKYRPTGRKVVVFHANFSEN YRLYSRSHFIKGFELMILLVVYELFKHTSQSNMAYSFITFSVWFMSFTWLCAPFLFNPSGFTWEIIVGDW RDWNRWIKEQGGIGIQQDKSWQSWWNDEQAHLRGSGVGARCLEIILSLRFFVYQYGLVYHLDITQSNTNI IVYALSWVVILATFFTVKAVDLGRQLFSTRKHLVFRFFKVFVFVSILTIIITLANICHLSVKDLLVSCLA FLPTGWGLILIAQAVRPKIEGTSLWEFTQVLARAYDYGMGVVLFAPMAILAWLPIISAFQTRFLFNEAFN RRLQIQPILAGKKKNR ; 'Putative callose synthase 8' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1976 1 1976 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CALS8_ARATH Q9LUD7 . 1 1976 3702 'Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress)' 2008-05-20 2DEDE6CE91425957 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MSHEIVPVDPIDVPSTSYSRPILGPREDSPERATEFTRSLTFREHVSSEPFDSERLPATLASEIQRFLRI ANLVESEEPRIAYLCRFHAFEIAHHMDRNSTGRGVRQFKTSLLQRLELDEEFTVRRRKEKSDVRELKRVY HAYKEYIIRHGAAFNLDNSQREKLINARRIASVLYEVLKTVTSGAGPQAIADRESIRAKSEFYVPYNILP LDKGGVHQAIMHLPEIKAAVAIVRNTRGLPPPEEFQRHQPFLDLFEFLQYAFGFQNGNVANQREHLILLL SNTIIRQPQKQSSAPKSGDEAVDALMKKFFKNYTNWCKFLGRKNNIRLPYVKQEALQYKTLYIGLYLLIW GEASNLRFMPECLCYIFHHMAYELHGVLTGAVSMITGEKVAPAYGGGHESFLADVVTPIYMVVQKEAEKN KNGTADHSMWRNYDDLNEFFWSLECFEIGWPMRPEHDFFCVESSETSKPGRWRGMLRFRKQTKKTDEEIE DDEELGVLSEEQPKPTSRWLGKTNFVETRSFWQIFRSFDRMWSFFVLSLQALIIMACHDVGSPLQVFNAN IFEDVMSIFITSAILKLIKGILDIIFKWKARNTMPINEKKKRLVKLGFAAMWTIILPVLYSHSRRKYICY 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A 1 1929 MET 1929 ? ? ? A . A 1 1930 GLY 1930 ? ? ? A . A 1 1931 VAL 1931 ? ? ? A . A 1 1932 VAL 1932 ? ? ? A . A 1 1933 LEU 1933 ? ? ? A . A 1 1934 PHE 1934 ? ? ? A . A 1 1935 ALA 1935 ? ? ? A . A 1 1936 PRO 1936 ? ? ? A . A 1 1937 MET 1937 ? ? ? A . A 1 1938 ALA 1938 ? ? ? A . A 1 1939 ILE 1939 ? ? ? A . A 1 1940 LEU 1940 ? ? ? A . A 1 1941 ALA 1941 ? ? ? A . A 1 1942 TRP 1942 ? ? ? A . A 1 1943 LEU 1943 ? ? ? A . A 1 1944 PRO 1944 ? ? ? A . A 1 1945 ILE 1945 ? ? ? A . A 1 1946 ILE 1946 ? ? ? A . A 1 1947 SER 1947 ? ? ? A . A 1 1948 ALA 1948 ? ? ? A . A 1 1949 PHE 1949 ? ? ? A . A 1 1950 GLN 1950 ? ? ? A . A 1 1951 THR 1951 ? ? ? A . A 1 1952 ARG 1952 ? ? ? A . A 1 1953 PHE 1953 ? ? ? A . A 1 1954 LEU 1954 ? ? ? A . A 1 1955 PHE 1955 ? ? ? A . A 1 1956 ASN 1956 ? ? ? A . A 1 1957 GLU 1957 ? ? ? A . A 1 1958 ALA 1958 ? ? ? A . A 1 1959 PHE 1959 ? ? ? A . A 1 1960 ASN 1960 ? ? ? A . A 1 1961 ARG 1961 ? ? ? A . A 1 1962 ARG 1962 ? ? ? A . A 1 1963 LEU 1963 ? ? ? A . A 1 1964 GLN 1964 ? ? ? A . A 1 1965 ILE 1965 ? ? ? A . A 1 1966 GLN 1966 ? ? ? A . A 1 1967 PRO 1967 ? ? ? A . A 1 1968 ILE 1968 ? ? ? A . A 1 1969 LEU 1969 ? ? ? A . A 1 1970 ALA 1970 ? ? ? A . A 1 1971 GLY 1971 ? ? ? A . A 1 1972 LYS 1972 ? ? ? A . A 1 1973 LYS 1973 ? ? ? A . A 1 1974 LYS 1974 ? ? ? A . A 1 1975 ASN 1975 ? ? ? A . A 1 1976 ARG 1976 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Nucleoporin p58/p45 {PDB ID=7r5j, label_asym_id=VA, auth_asym_id=I2, SMTL ID=7r5j.48.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7r5j, label_asym_id=VA' 'target-template alignment' . 4 'model 3' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A VA 11 1 I2 # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MSTGFSFGSGTLGSTTVAAGGTSTGGVFSFGTGASSNPSVGLNFGNLGSTSTPATTSAPSSGFGTGLFGS KPATGFTLGGTNTGIATTITTGLTLGTPATTSAATTGFSLGFNKPAASATPFALPITSTSASGLTLSSAL TSTPAASTGFTLNNLGGTTATTTTASTGLSLGGALAGLGGSLFQSTNTGTSGLGQNALGLTLGTTAATST AGNEGLGGIDFSSSSDKKSDKTGTRPEDSKALKDENLPPVICQDVENLQKFVKEQKQVQEEISRMSSKAM LKVQEDIKALKQLLSLAANGIQRNTLNIDKLKIETAQELKNAEIALRTQKTPPGLQHEYAAPADYFRILV QQFEVQLQQYRQQIEELENHLATQANNSHITPQDLSMAMQKIYQTFVALAAQLQSIHENVKVLKEQYLGY RKMFLGDAVDVFETRRAEAKKWQNTPRVTTGPTPFSTMPNAAAVAMAATLTQQQQPATGPQPSLGVSFGT PFGSGIGTGLQSSGLGSSNLGGFGTSSGFGCSTTGASTFGFGTTNKPSGSLSAGFGSSSTSGFNFSNPGI TASAGLTFGVSNPASAGFGTGGQLLQLKKPPAGNKRGKR ; ;MSTGFSFGSGTLGSTTVAAGGTSTGGVFSFGTGASSNPSVGLNFGNLGSTSTPATTSAPSSGFGTGLFGS KPATGFTLGGTNTGIATTITTGLTLGTPATTSAATTGFSLGFNKPAASATPFALPITSTSASGLTLSSAL TSTPAASTGFTLNNLGGTTATTTTASTGLSLGGALAGLGGSLFQSTNTGTSGLGQNALGLTLGTTAATST AGNEGLGGIDFSSSSDKKSDKTGTRPEDSKALKDENLPPVICQDVENLQKFVKEQKQVQEEISRMSSKAM LKVQEDIKALKQLLSLAANGIQRNTLNIDKLKIETAQELKNAEIALRTQKTPPGLQHEYAAPADYFRILV QQFEVQLQQYRQQIEELENHLATQANNSHITPQDLSMAMQKIYQTFVALAAQLQSIHENVKVLKEQYLGY RKMFLGDAVDVFETRRAEAKKWQNTPRVTTGPTPFSTMPNAAAVAMAATLTQQQQPATGPQPSLGVSFGT PFGSGIGTGLQSSGLGSSNLGGFGTSSGFGCSTTGASTFGFGTTNKPSGSLSAGFGSSSTSGFNFSNPGI TASAGLTFGVSNPASAGFGTGGQLLQLKKPPAGNKRGKR ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 343 403 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7r5j 2024-07-17 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1976 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1976 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 320.000 19.672 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSHEIVPVDPIDVPSTSYSRPILGPREDSPERATEFTRSLTFREHVSSEPFDSERLPATLASEIQRFLRIANLVESEEPRIAYLCRFHAFEIAHHMDRNSTGRGVRQFKTSLLQRLELDEEFTVRRRKEKSDVRELKRVYHAYKEYIIRHGAAFNLDNSQREKLINARRIASVLYEVLKTVTSGAGPQAIADRESIRAKSEFYVPYNILPLDKGGVHQAIMHLPEIKAAVAIVRNTRGLPPPEEFQRHQPFLDLFEFLQYAFGFQNGNVANQREHLILLLSNTIIRQPQKQSSAPKSGDEAVDALMKKFFKNYTNWCKFLGRKNNIRLPYVKQEALQYKTLYIGLYLLIWGEASNLRFMPECLCYIFHHMAYELHGVLTGAVSMITGEKVAPAYGGGHESFLADVVTPIYMVVQKEAEKNKNGTADHSMWRNYDDLNEFFWSLECFEIGWPMRPEHDFFCVESSETSKPGRWRGMLRFRKQTKKTDEEIEDDEELGVLSEEQPKPTSRWLGKTNFVETRSFWQIFRSFDRMWSFFVLSLQALIIMACHDVGSPLQVFNANIFEDVMSIFITSAILKLIKGILDIIFKWKARNTMPINEKKKRLVKLGFAAMWTIILPVLYSHSRRKYICYFTNYKTWLGEWCFSPYMVAVTIYLTGSAIELVLFFVPAISKYIETSNHGIFKTLSWWGQPRLYVGRGMQETQVSQFKYTFFWILVLLTKFAFSYAFEIKPLIEPTRLIMKVGVRNYEWHEIFPEVKSNAAAIVAVWAPIMVVYFMDTQIWYSVYCTIFGGLYGVLHHLGEIRTLGMLRGRFHTLPSAFNASLIPHSTKDEKRRKQRGFFPFNLGRGSDGQKNSMAKFVLVWNQVINSFRTEDLISNKELDLMTMPLSSEVLSGIIRWPIFLLANKFSTALSIAKDFVGKDEVLYRRIRKDEYMYYAVKECYESLKYILQILVVGDLEKKIISGIINEIEESIRQSSLLEEFKMAELPALHDKCIELVQLLVEGSAEQLQVEKSEELHGKLVKALQDIFELVTNDMMVHGDRILDLLQSREGSGEDTGIFMRVIEPQLFESYGEWRCIHFPLPDSASLSEQIQRFLLLLTVKDSAMDIPENLDARRRLSFFATSLFMDMPDAPKVRNMMSFSVLTPHYQEDINYSTNELHSTKSSVSIIFYMQKIFPDEWKNFLERMGCDNLDALKKEGKEEELRNWASFRGQTLSRTVRGMMYCREALKLQAFLDMADDEDILEGYKDVERSNRPLAAQLDALADMKFTYVVSCQMFGAQKSSGDPHAQDILDLMIKYPSLRVAYVEEREEIVLDVPKKVYYSILVKAVNGFDQEIYRVKLPGPPNIGEGKPENQNHAIVFTRGEALQTIDMNQDHYLEEAFKMRNLLQEFLRNRGRRPPTILGLREHIFTGSVSSLAWFMSYQETSFVTIGQRLLANPLRVRFHYGHPDVFDRIFHITRGGISKSSRTINLSEDVFAGYNTTLRRGCITYNEYLQVGKGRDVGLNQISKFEAKVANGNSEQTISRDIYRLGQRFDFFRMLSCYFTTIGFYFSSLISVIGIYIYLYGQLYLVLSGLQKTLILEAKVKNIKSLETALASQSFIQLGLLTGLPMVMEIGLEKGFLIAFQDFILMQLQLAAFFFTFSLGTKTHYFGRTILHGGAKYRPTGRKVVVFHANFSENYRLYSRSHFIKGFELMILLVVYELFKHTSQSNMAYSFITFSVWFMSFTWLCAPFLFNPSGFTWEIIVGDWRDWNRWIKEQGGIGIQQDKSWQSWWNDEQAHLRGSGVGARCLEIILSLRFFVYQYGLVYHLDITQSNTNIIVYALSWVVILATFFTVKAVDLGRQLFSTRKHLVFRFFKVFVFVSILTIIITLANICHLSVKDLLVSCLAFLPTGWGLILIAQAVRPKIEGTSLWEFTQVLARAYDYGMGVVLFAPMAILAWLPIISAFQTRFLFNEAFNRRLQIQPILAGKKKNR 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ADYFRILVQQFEVQLQQYRQQIEELENHLATQANNSH--------ITPQDLSMAMQKIYQTFVALAAQL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7r5j.48' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 3' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 634.573 1002.723 994.375 1 1 A ASP 0.620 1 ATOM 15 O OD1 . ASP 253 253 ? A 634.206 1003.264 995.452 1 1 A ASP 0.620 1 ATOM 16 O OD2 . ASP 253 253 ? A 634.494 1001.484 994.106 1 1 A ASP 0.620 1 ATOM 17 N N . LEU 254 254 ? A 634.540 1004.112 990.190 1 1 A LEU 0.430 1 ATOM 18 C CA . LEU 254 254 ? A 634.813 1004.659 988.867 1 1 A LEU 0.430 1 ATOM 19 C C . LEU 254 254 ? A 633.654 1005.411 988.194 1 1 A LEU 0.430 1 ATOM 20 O O . LEU 254 254 ? A 633.842 1006.512 987.686 1 1 A LEU 0.430 1 ATOM 21 C CB . LEU 254 254 ? A 635.279 1003.545 987.896 1 1 A LEU 0.430 1 ATOM 22 C CG . LEU 254 254 ? A 635.635 1004.022 986.467 1 1 A LEU 0.430 1 ATOM 23 C CD1 . LEU 254 254 ? A 636.763 1005.062 986.447 1 1 A LEU 0.430 1 ATOM 24 C CD2 . LEU 254 254 ? A 635.993 1002.834 985.568 1 1 A LEU 0.430 1 ATOM 25 N N . PHE 255 255 ? A 632.421 1004.855 988.189 1 1 A PHE 0.430 1 ATOM 26 C CA . PHE 255 255 ? A 631.225 1005.519 987.672 1 1 A PHE 0.430 1 ATOM 27 C C . PHE 255 255 ? 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A 628.297 1019.336 981.501 1 1 A ASN 0.520 1 ATOM 132 N ND2 . ASN 266 266 ? A 627.131 1018.318 983.136 1 1 A ASN 0.520 1 ATOM 133 N N . GLY 267 267 ? A 630.154 1022.742 984.957 1 1 A GLY 0.550 1 ATOM 134 C CA . GLY 267 267 ? A 630.344 1024.048 985.589 1 1 A GLY 0.550 1 ATOM 135 C C . GLY 267 267 ? A 631.372 1024.907 984.893 1 1 A GLY 0.550 1 ATOM 136 O O . GLY 267 267 ? A 631.179 1026.108 984.700 1 1 A GLY 0.550 1 ATOM 137 N N . ASN 268 268 ? A 632.489 1024.307 984.445 1 1 A ASN 0.540 1 ATOM 138 C CA . ASN 268 268 ? A 633.488 1024.998 983.641 1 1 A ASN 0.540 1 ATOM 139 C C . ASN 268 268 ? A 632.969 1025.451 982.282 1 1 A ASN 0.540 1 ATOM 140 O O . ASN 268 268 ? A 633.218 1026.578 981.850 1 1 A ASN 0.540 1 ATOM 141 C CB . ASN 268 268 ? A 634.725 1024.110 983.394 1 1 A ASN 0.540 1 ATOM 142 C CG . ASN 268 268 ? A 635.512 1023.992 984.693 1 1 A ASN 0.540 1 ATOM 143 O OD1 . ASN 268 268 ? A 635.437 1024.830 985.584 1 1 A ASN 0.540 1 ATOM 144 N ND2 . ASN 268 268 ? 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A 635.258 1028.539 979.475 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 171 C CD . GLN 272 272 ? A 636.273 1028.014 978.457 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 172 O OE1 . GLN 272 272 ? A 636.003 1027.138 977.642 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 173 N NE2 . GLN 272 272 ? A 637.498 1028.593 978.484 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 174 N N . ARG 273 273 ? A 630.729 1029.692 978.620 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 175 C CA . ARG 273 273 ? A 629.613 1030.283 977.899 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 176 C C . ARG 273 273 ? A 629.200 1031.634 978.457 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 177 O O . ARG 273 273 ? A 629.021 1032.595 977.712 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 178 C CB . ARG 273 273 ? A 628.367 1029.369 977.933 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 179 C CG . ARG 273 273 ? A 628.478 1028.099 977.070 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 180 C CD . ARG 273 273 ? A 627.258 1027.189 977.233 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 181 N NE . ARG 273 273 ? A 627.461 1026.001 976.335 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 182 C CZ . ARG 273 273 ? A 626.659 1024.926 976.330 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 183 N NH1 . ARG 273 273 ? 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A 634.641 1062.000 972.645 1 1 A SER 0.580 1 ATOM 340 O OG . SER 292 292 ? A 635.764 1062.874 972.789 1 1 A SER 0.580 1 ATOM 341 N N . SER 293 293 ? A 633.575 1059.384 971.510 1 1 A SER 0.580 1 ATOM 342 C CA . SER 293 293 ? A 632.461 1058.667 970.923 1 1 A SER 0.580 1 ATOM 343 C C . SER 293 293 ? A 632.379 1057.201 971.280 1 1 A SER 0.580 1 ATOM 344 O O . SER 293 293 ? A 631.299 1056.663 971.501 1 1 A SER 0.580 1 ATOM 345 C CB . SER 293 293 ? A 632.562 1058.725 969.388 1 1 A SER 0.580 1 ATOM 346 O OG . SER 293 293 ? A 632.598 1060.070 968.904 1 1 A SER 0.580 1 ATOM 347 N N . ALA 294 294 ? A 633.531 1056.509 971.300 1 1 A ALA 0.620 1 ATOM 348 C CA . ALA 294 294 ? A 633.636 1055.184 971.857 1 1 A ALA 0.620 1 ATOM 349 C C . ALA 294 294 ? A 634.910 1055.168 972.714 1 1 A ALA 0.620 1 ATOM 350 O O . ALA 294 294 ? A 635.995 1055.002 972.152 1 1 A ALA 0.620 1 ATOM 351 C CB . ALA 294 294 ? A 633.774 1054.107 970.754 1 1 A ALA 0.620 1 ATOM 352 N N . PRO 295 295 ? 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A 633.842 1048.956 975.121 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 366 C CE . LYS 296 296 ? A 633.015 1048.518 976.334 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 367 N NZ . LYS 296 296 ? A 631.945 1047.595 975.896 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 368 N N . SER 297 297 ? A 637.826 1051.853 972.287 1 1 A SER 0.430 1 ATOM 369 C CA . SER 297 297 ? A 638.771 1051.689 971.193 1 1 A SER 0.430 1 ATOM 370 C C . SER 297 297 ? A 639.543 1052.976 971.000 1 1 A SER 0.430 1 ATOM 371 O O . SER 297 297 ? A 640.427 1053.036 970.138 1 1 A SER 0.430 1 ATOM 372 C CB . SER 297 297 ? A 637.985 1051.353 969.893 1 1 A SER 0.430 1 ATOM 373 O OG . SER 297 297 ? A 636.807 1052.163 969.829 1 1 A SER 0.430 1 ATOM 374 N N . GLY 298 298 ? A 639.257 1054.006 971.821 1 1 A GLY 0.500 1 ATOM 375 C CA . GLY 298 298 ? A 639.997 1055.257 971.903 1 1 A GLY 0.500 1 ATOM 376 C C . GLY 298 298 ? A 641.124 1055.191 972.898 1 1 A GLY 0.500 1 ATOM 377 O O . GLY 298 298 ? A 641.222 1054.300 973.725 1 1 A GLY 0.500 1 ATOM 378 N N . ASP 299 299 ? A 641.947 1056.258 972.888 1 1 A ASP 0.490 1 ATOM 379 C CA . ASP 299 299 ? A 643.067 1056.441 973.786 1 1 A ASP 0.490 1 ATOM 380 C C . ASP 299 299 ? A 642.640 1056.407 975.263 1 1 A ASP 0.490 1 ATOM 381 O O . ASP 299 299 ? A 643.284 1055.780 976.089 1 1 A ASP 0.490 1 ATOM 382 C CB . ASP 299 299 ? A 643.816 1057.737 973.353 1 1 A ASP 0.490 1 ATOM 383 C CG . ASP 299 299 ? A 644.429 1057.567 971.958 1 1 A ASP 0.490 1 ATOM 384 O OD1 . ASP 299 299 ? A 644.544 1056.406 971.488 1 1 A ASP 0.490 1 ATOM 385 O OD2 . ASP 299 299 ? A 644.763 1058.606 971.336 1 1 A ASP 0.490 1 ATOM 386 N N . GLU 300 300 ? A 641.479 1057.004 975.617 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 387 C CA . GLU 300 300 ? A 640.942 1057.023 976.981 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 388 C C . GLU 300 300 ? A 640.720 1055.689 977.649 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 389 O O . GLU 300 300 ? A 641.060 1055.506 978.827 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 390 C CB . GLU 300 300 ? A 639.592 1057.759 977.014 1 1 A GLU 0.470 1 ATOM 391 C CG . GLU 300 300 ? 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A 644.392 1052.714 975.301 1 1 A VAL 0.540 1 ATOM 405 C CG1 . VAL 302 302 ? A 645.854 1052.256 975.410 1 1 A VAL 0.540 1 ATOM 406 C CG2 . VAL 302 302 ? A 643.710 1052.052 974.087 1 1 A VAL 0.540 1 ATOM 407 N N . ASP 303 303 ? A 644.285 1054.145 978.109 1 1 A ASP 0.540 1 ATOM 408 C CA . ASP 303 303 ? A 644.747 1054.733 979.351 1 1 A ASP 0.540 1 ATOM 409 C C . ASP 303 303 ? A 644.035 1054.219 980.590 1 1 A ASP 0.540 1 ATOM 410 O O . ASP 303 303 ? A 644.666 1053.855 981.582 1 1 A ASP 0.540 1 ATOM 411 C CB . ASP 303 303 ? A 644.576 1056.268 979.337 1 1 A ASP 0.540 1 ATOM 412 C CG . ASP 303 303 ? A 645.621 1056.955 978.467 1 1 A ASP 0.540 1 ATOM 413 O OD1 . ASP 303 303 ? A 646.584 1056.283 978.019 1 1 A ASP 0.540 1 ATOM 414 O OD2 . ASP 303 303 ? A 645.495 1058.199 978.343 1 1 A ASP 0.540 1 ATOM 415 N N . ALA 304 304 ? A 642.696 1054.139 980.580 1 1 A ALA 0.590 1 ATOM 416 C CA . ALA 304 304 ? A 641.921 1053.584 981.667 1 1 A ALA 0.590 1 ATOM 417 C C . ALA 304 304 ? 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A 646.534 1050.890 983.156 1 1 A MET 0.580 1 ATOM 431 O O . MET 306 306 ? A 647.162 1050.252 984.002 1 1 A MET 0.580 1 ATOM 432 C CB . MET 306 306 ? A 647.481 1051.398 980.915 1 1 A MET 0.580 1 ATOM 433 C CG . MET 306 306 ? A 647.795 1050.928 979.484 1 1 A MET 0.580 1 ATOM 434 S SD . MET 306 306 ? A 649.128 1051.875 978.680 1 1 A MET 0.580 1 ATOM 435 C CE . MET 306 306 ? A 648.286 1053.480 978.544 1 1 A MET 0.580 1 ATOM 436 N N . LYS 307 307 ? A 645.789 1051.957 983.498 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 437 C CA . LYS 307 307 ? A 645.614 1052.410 984.865 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 438 C C . LYS 307 307 ? A 644.930 1051.404 985.785 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 439 O O . LYS 307 307 ? A 645.342 1051.230 986.928 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 440 C CB . LYS 307 307 ? A 644.821 1053.740 984.902 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 441 C CG . LYS 307 307 ? A 645.620 1054.945 984.372 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 442 C CD . LYS 307 307 ? A 644.782 1056.234 984.235 1 1 A LYS 0.620 1 ATOM 443 C CE . LYS 307 307 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #