data_SMR-173508725a5b1589c118118f1e847116_1 _entry.id SMR-173508725a5b1589c118118f1e847116_1 _struct.entry_id SMR-173508725a5b1589c118118f1e847116_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q8NEV8 (isoform 2)/ EXPH5_HUMAN, Exophilin-5 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8NEV8 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 257713.923 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP EXPH5_HUMAN Q8NEV8 1 ;MSLSFLNDEEARKILQVLERNEELQRAEKDRISKLQKTKRDIRWLQGVTGEWFEEIQRKKFCNETDVSQM LKQPLTYRLSKEMAKNDPIELPTSRSKNVTNQKKPTPFSSRMSFRSSFASLFSFRKSGKETSKLPSLGQK GCDGHAGPPMPVRGAAVQAKIYNSPLENHLVDSTFVPKPAVMREESGMPPPWDASLLENEFFQVLDDLDS KLAQEQSASSVNTRTPLNYGSRTQFGHFYSSGNRHGNITERHKKHYNETSNMSIYDILRPGTPREGFKTF SPRTSTIYDMYRTREPRVFKEDYVQKNTFGSTSLCFDSRQRSALPATGHFTARSLHFPATTQSKSGFIPP RHQQSPKRTPLSSIIWNRSDSSRDRENQEEFLRAPSPMEIDPADKYVYPRGFQENKRYESYHSQNVYQRV SLNAPMENAMSPDTFENSENMPFYHQSNTFTRSFFSNTFGRSGEQRRFGQGPFWGQEKGHSFWSDFHRSR KSFSSSDRDFEMISMEANSVSAIHGHNVSSEHWESFSSGYGTDVSRGQEEPHPWQFDFQRSTLDSMVVSH GNETQLTPHFGTPNVCSMTGSSYHVKSSELVSQQDSSPVEVHINKEASSFGIAQTLASSFKTSFSQISDD RRNPQSPNLQNPTVTLQKIFPNKPASHPMRSHTEVTVTSSNSVDSLPLAKSQPNILVTEVNNEKDLNESI SEEDKQLSKMDQTNKAGEIPQPVSQTGISNSLPDFQNPLSQDSAKSNGFGFNASTIISSKKSPRVFSRKD TSKMYIPHTDKSNDIKQDKRFTENRKLGSTASLPFIQEHRTPPSFPRTDQGCHQELTVNNEDISRIITNN HWSSALTDTQNAQYSKCKLTPGHKTSCDSLDLSSAALPDSSPSKNSSLDAPVVPSTTVFSRRSPSDKDPS LGEREEKDNAGKNQKNQFIVSHSENQERNDSPVPTHDEVVDVKCHSHSPFRNERGKGKIRHHISCIEKLS KTESISVPTSDHRSLIEANQSNSKVSELDTIYCTLPRKSSSFLIHGRQSGSKIMAASLRNGPPPFQIKNN VEDAMGNYMLNKFSPSSPESANECSKVLSDSALEAPEATERMTNVKSSGSTSVRKGPLPFLINRAMSCPS GEPHASTGREGRKKPLTSGMDASELTPRAWERIISPVESDSSVRDCSLTKRQHQKENFQEYTEKEGKMAA SRRSVFALSNEDPLPFCSDLSGKERGKTLHKVKTTSTFSVSGDEDNVKCLEVVSIYYTLPRKPSKKFCNL LQQYTQNTNLLIESPQVETETFPNALEKDKQNYSTREQSGTPSCENLKMSVNSDQTLTTENMTAFRLSNR GPLAPTLQEMASVEAAVSLPEEESKAREIFSDNLAKTPLGDSENKKERGKKLQSETLHTSLMLQRKNVSE EKSENCQQSINSSNSGPSSLPALSEVNIGNSQTRRSSWECTGSGRAIPFTGSGKCPQKDHTSTAVGDGSS GSQPREGRGDIGTNCQKMTNKTLSHSESQVFALTPALHKLQLGEETQSDEPNLESLQSEPRELPQRSQEA NMTESRKAEDEMQKSAWDQPSLPEGNKNKTNLDDLVKGENRSSVKHRLAAMSKASRKFPAKDVSPRRHVA TIFPQSGSRSGFDHLSLGTVECNPLFPEPTPKSAESIGESRLSENGKHVKKSENLLPITVLPNREPSTHV SNQKSNSISQRHQNEFKNVSESPSKHENSKDVTAAQNLVRESGAPSPITFTSLREAEFSDNQRRLSPPFP LEPAQKSRVSSPLASFLQQQRSASSLEWEPEPHLYRSKSLKSINVHGDLLRKSHPPKVRERHFSESTSID NALSRLTLGNEFSVNNGYSRRFRSFSELPSCDGNESWAYRSGTKTGPRSAISIYRPIDYGIFGKEQQLAF LENVKRSLTQGRLWKPSFLKNPGFLKDDLRNPPNPSESLSSNSPSSQVPEDGLSPSEPLNIYEDDPVDSD CDTDTTTDDEYYLDENDKESEL ; Exophilin-5 # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1982 1 1982 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . EXPH5_HUMAN Q8NEV8 Q8NEV8-2 1 1982 9606 'Homo sapiens (Human)' 2022-02-23 683F7E751CFF9163 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MSLSFLNDEEARKILQVLERNEELQRAEKDRISKLQKTKRDIRWLQGVTGEWFEEIQRKKFCNETDVSQM LKQPLTYRLSKEMAKNDPIELPTSRSKNVTNQKKPTPFSSRMSFRSSFASLFSFRKSGKETSKLPSLGQK GCDGHAGPPMPVRGAAVQAKIYNSPLENHLVDSTFVPKPAVMREESGMPPPWDASLLENEFFQVLDDLDS KLAQEQSASSVNTRTPLNYGSRTQFGHFYSSGNRHGNITERHKKHYNETSNMSIYDILRPGTPREGFKTF SPRTSTIYDMYRTREPRVFKEDYVQKNTFGSTSLCFDSRQRSALPATGHFTARSLHFPATTQSKSGFIPP RHQQSPKRTPLSSIIWNRSDSSRDRENQEEFLRAPSPMEIDPADKYVYPRGFQENKRYESYHSQNVYQRV SLNAPMENAMSPDTFENSENMPFYHQSNTFTRSFFSNTFGRSGEQRRFGQGPFWGQEKGHSFWSDFHRSR KSFSSSDRDFEMISMEANSVSAIHGHNVSSEHWESFSSGYGTDVSRGQEEPHPWQFDFQRSTLDSMVVSH GNETQLTPHFGTPNVCSMTGSSYHVKSSELVSQQDSSPVEVHINKEASSFGIAQTLASSFKTSFSQISDD 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B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Melanophilin {PDB ID=2zet, label_asym_id=B, auth_asym_id=C, SMTL ID=2zet.1.B}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2zet, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 C # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSSGSSGMGKRLDLSTLTDEEAEHVWAVVQRDFDLRRREEERLQGLKGKIQKESSKRELLSDTAHLNETH CARCLQPYRLLLNSRRQCLECSLFVCKSCSHAHPEEQGWLCDPCHLARVVKIGSLEWYYQHVRARFKRFG SAKVIRSLCGRLQ ; ;GSSGSSGMGKRLDLSTLTDEEAEHVWAVVQRDFDLRRREEERLQGLKGKIQKESSKRELLSDTAHLNETH CARCLQPYRLLLNSRRQCLECSLFVCKSCSHAHPEEQGWLCDPCHLARVVKIGSLEWYYQHVRARFKRFG SAKVIRSLCGRLQ ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 12 150 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2zet 2024-10-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1982 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2046 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 5.2e-10 25.333 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSLSFLNDEEARKILQVLERNEELQRAEKDRISKLQKTKRD----------------------------------------------------------------IRWLQGVTGEWFEEIQRKKFCNETDVSQMLKQPLTYRLSKEMAKNDPIELPTSRSKNVTNQKKPTPFSSRMSFRSSFASLFSFRKSGKETSKLPSLGQKGCDGHAGPPMPVRGAAVQAKIYNSPLENHLVDSTFVPKPAVMREESGMPPPWDASLLENEFFQVLDDLDSKLAQEQSASSVNTRTPLNYGSRTQFGHFYSSGNRHGNITERHKKHYNETSNMSIYDILRPGTPREGFKTFSPRTSTIYDMYRTREPRVFKEDYVQKNTFGSTSLCFDSRQRSALPATGHFTARSLHFPATTQSKSGFIPPRHQQSPKRTPLSSIIWNRSDSSRDRENQEEFLRAPSPMEIDPADKYVYPRGFQENKRYESYHSQNVYQRVSLNAPMENAMSPDTFENSENMPFYHQSNTFTRSFFSNTFGRSGEQRRFGQGPFWGQEKGHSFWSDFHRSRKSFSSSDRDFEMISMEANSVSAIHGHNVSSEHWESFSSGYGTDVSRGQEEPHPWQFDFQRSTLDSMVVSHGNETQLTPHFGTPNVCSMTGSSYHVKSSELVSQQDSSPVEVHINKEASSFGIAQTLASSFKTSFSQISDDRRNPQSPNLQNPTVTLQKIFPNKPASHPMRSHTEVTVTSSNSVDSLPLAKSQPNILVTEVNNEKDLNESISEEDKQLSKMDQTNKAGEIPQPVSQTGISNSLPDFQNPLSQDSAKSNGFGFNASTIISSKKSPRVFSRKDTSKMYIPHTDKSNDIKQDKRFTENRKLGSTASLPFIQEHRTPPSFPRTDQGCHQELTVNNEDISRIITNNHWSSALTDTQNAQYSKCKLTPGHKTSCDSLDLSSAALPDSSPSKNSSLDAPVVPSTTVFSRRSPSDKDPSLGEREEKDNAGKNQKNQFIVSHSENQERNDSPVPTHDEVVDVKCHSHSPFRNERGKGKIRHHISCIEKLSKTESISVPTSDHRSLIEANQSNSKVSELDTIYCTLPRKSSSFLIHGRQSGSKIMAASLRNGPPPFQIKNNVEDAMGNYMLNKFSPSSPESANECSKVLSDSALEAPEATERMTNVKSSGSTSVRKGPLPFLINRAMSCPSGEPHASTGREGRKKPLTSGMDASELTPRAWERIISPVESDSSVRDCSLTKRQHQKENFQEYTEKEGKMAASRRSVFALSNEDPLPFCSDLSGKERGKTLHKVKTTSTFSVSGDEDNVKCLEVVSIYYTLPRKPSKKFCNLLQQYTQNTNLLIESPQVETETFPNALEKDKQNYSTREQSGTPSCENLKMSVNSDQTLTTENMTAFRLSNRGPLAPTLQEMASVEAAVSLPEEESKAREIFSDNLAKTPLGDSENKKERGKKLQSETLHTSLMLQRKNVSEEKSENCQQSINSSNSGPSSLPALSEVNIGNSQTRRSSWECTGSGRAIPFTGSGKCPQKDHTSTAVGDGSSGSQPREGRGDIGTNCQKMTNKTLSHSESQVFALTPALHKLQLGEETQSDEPNLESLQSEPRELPQRSQEANMTESRKAEDEMQKSAWDQPSLPEGNKNKTNLDDLVKGENRSSVKHRLAAMSKASRKFPAKDVSPRRHVATIFPQSGSRSGFDHLSLGTVECNPLFPEPTPKSAESIGESRLSENGKHVKKSENLLPITVLPNREPSTHVSNQKSNSISQRHQNEFKNVSESPSKHENSKDVTAAQNLVRESGAPSPITFTSLREAEFSDNQRRLSPPFPLEPAQKSRVSSPLASFLQQQRSASSLEWEPEPHLYRSKSLKSINVHGDLLRKSHPPKVRERHFSESTSIDNALSRLTLGNEFSVNNGYSRRFRSFSELPSCDGNESWAYRSGTKTGPRSAISIYRPIDYGIFGKEQQLAFLENVKRSLTQGRLWKPSFLKNPGFLKDDLRNPPNPSESLSSNSPSSQVPEDGLSPSEPLNIYEDDPVDSDCDTDTTTDDEYYLDENDKESEL 2 1 2 LDLSTLTDEEAEHVWAVVQRDFDLRRREEERLQGLKGKIQKESSKRELLSDTAHLNETHCARCLQPYRLLLNSRRQCLECSLFVCKSCSHAHPEEQGWLCDPCHLARVVKIGSLEWYYQHVRARFK-RFGSAKVIRSLCG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2zet.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . MET 1 1 ? A 29.769 91.031 120.605 1 1 B MET 0.330 1 ATOM 2 C CA . MET 1 1 ? A 29.785 92.513 120.802 1 1 B MET 0.330 1 ATOM 3 C C . MET 1 1 ? A 30.730 93.085 119.774 1 1 B MET 0.330 1 ATOM 4 O O . MET 1 1 ? A 31.863 92.640 119.710 1 1 B MET 0.330 1 ATOM 5 C CB . MET 1 1 ? A 30.293 92.778 122.242 1 1 B MET 0.330 1 ATOM 6 C CG . MET 1 1 ? A 30.405 94.260 122.639 1 1 B MET 0.330 1 ATOM 7 S SD . MET 1 1 ? A 28.810 95.114 122.777 1 1 B MET 0.330 1 ATOM 8 C CE . MET 1 1 ? A 28.349 94.361 124.366 1 1 B MET 0.330 1 ATOM 9 N N . SER 2 2 ? A 30.308 94.023 118.906 1 1 B SER 0.320 1 ATOM 10 C CA . SER 2 2 ? A 31.178 94.465 117.816 1 1 B SER 0.320 1 ATOM 11 C C . SER 2 2 ? A 31.664 95.868 118.074 1 1 B SER 0.320 1 ATOM 12 O O . SER 2 2 ? A 30.884 96.812 118.097 1 1 B SER 0.320 1 ATOM 13 C CB . SER 2 2 ? A 30.496 94.444 116.424 1 1 B SER 0.320 1 ATOM 14 O OG . SER 2 2 ? A 31.452 94.726 115.397 1 1 B SER 0.320 1 ATOM 15 N N . LEU 3 3 ? A 32.985 96.031 118.288 1 1 B LEU 0.400 1 ATOM 16 C CA . LEU 3 3 ? A 33.527 97.307 118.719 1 1 B LEU 0.400 1 ATOM 17 C C . LEU 3 3 ? A 34.194 98.096 117.598 1 1 B LEU 0.400 1 ATOM 18 O O . LEU 3 3 ? A 34.818 99.123 117.839 1 1 B LEU 0.400 1 ATOM 19 C CB . LEU 3 3 ? A 34.526 97.131 119.890 1 1 B LEU 0.400 1 ATOM 20 C CG . LEU 3 3 ? A 33.945 96.563 121.205 1 1 B LEU 0.400 1 ATOM 21 C CD1 . LEU 3 3 ? A 34.984 96.725 122.321 1 1 B LEU 0.400 1 ATOM 22 C CD2 . LEU 3 3 ? A 32.637 97.226 121.662 1 1 B LEU 0.400 1 ATOM 23 N N . SER 4 4 ? A 34.039 97.686 116.320 1 1 B SER 0.500 1 ATOM 24 C CA . SER 4 4 ? A 34.738 98.322 115.207 1 1 B SER 0.500 1 ATOM 25 C C . SER 4 4 ? A 34.265 99.732 114.913 1 1 B SER 0.500 1 ATOM 26 O O . SER 4 4 ? A 34.951 100.506 114.261 1 1 B SER 0.500 1 ATOM 27 C CB . SER 4 4 ? A 34.632 97.514 113.886 1 1 B SER 0.500 1 ATOM 28 O OG . SER 4 4 ? A 33.279 97.428 113.418 1 1 B SER 0.500 1 ATOM 29 N N . PHE 5 5 ? A 33.069 100.097 115.419 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 30 C CA . PHE 5 5 ? A 32.588 101.461 115.417 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 31 C C . PHE 5 5 ? A 33.462 102.438 116.223 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 32 O O . PHE 5 5 ? A 33.585 103.595 115.839 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 33 C CB . PHE 5 5 ? A 31.106 101.460 115.903 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 34 C CG . PHE 5 5 ? A 30.503 102.838 115.942 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 35 C CD1 . PHE 5 5 ? A 30.528 103.572 117.140 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 36 C CD2 . PHE 5 5 ? A 29.966 103.431 114.790 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 37 C CE1 . PHE 5 5 ? A 30.071 104.893 117.175 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 38 C CE2 . PHE 5 5 ? A 29.497 104.752 114.825 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 39 C CZ . PHE 5 5 ? A 29.567 105.489 116.014 1 1 B PHE 0.460 1 ATOM 40 N N . LEU 6 6 ? A 34.057 102.021 117.367 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 41 C CA . LEU 6 6 ? A 34.798 102.939 118.225 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 42 C C . LEU 6 6 ? A 35.996 103.590 117.528 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 43 O O . LEU 6 6 ? A 36.845 102.911 116.954 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 44 C CB . LEU 6 6 ? A 35.346 102.228 119.503 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 45 C CG . LEU 6 6 ? A 34.419 102.065 120.735 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 46 C CD1 . LEU 6 6 ? A 33.137 102.906 120.696 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 47 C CD2 . LEU 6 6 ? A 34.120 100.588 121.033 1 1 B LEU 0.590 1 ATOM 48 N N . ASN 7 7 ? A 36.118 104.934 117.603 1 1 B ASN 0.600 1 ATOM 49 C CA . ASN 7 7 ? A 37.300 105.649 117.154 1 1 B ASN 0.600 1 ATOM 50 C C . ASN 7 7 ? A 38.455 105.349 118.100 1 1 B ASN 0.600 1 ATOM 51 O O . ASN 7 7 ? A 38.249 105.080 119.283 1 1 B ASN 0.600 1 ATOM 52 C CB . ASN 7 7 ? A 37.101 107.188 117.103 1 1 B ASN 0.600 1 ATOM 53 C CG . ASN 7 7 ? A 35.995 107.562 116.121 1 1 B ASN 0.600 1 ATOM 54 O OD1 . ASN 7 7 ? A 35.987 107.133 114.965 1 1 B ASN 0.600 1 ATOM 55 N ND2 . ASN 7 7 ? A 35.056 108.437 116.558 1 1 B ASN 0.600 1 ATOM 56 N N . ASP 8 8 ? A 39.721 105.397 117.639 1 1 B ASP 0.590 1 ATOM 57 C CA . ASP 8 8 ? A 40.853 105.079 118.488 1 1 B ASP 0.590 1 ATOM 58 C C . ASP 8 8 ? A 40.982 105.895 119.779 1 1 B ASP 0.590 1 ATOM 59 O O . ASP 8 8 ? A 41.427 105.358 120.793 1 1 B ASP 0.590 1 ATOM 60 C CB . ASP 8 8 ? A 42.180 105.142 117.698 1 1 B ASP 0.590 1 ATOM 61 C CG . ASP 8 8 ? A 42.248 104.042 116.648 1 1 B ASP 0.590 1 ATOM 62 O OD1 . ASP 8 8 ? A 41.755 102.928 116.939 1 1 B ASP 0.590 1 ATOM 63 O OD2 . ASP 8 8 ? A 42.852 104.310 115.581 1 1 B ASP 0.590 1 ATOM 64 N N . GLU 9 9 ? A 40.590 107.195 119.839 1 1 B GLU 0.560 1 ATOM 65 C CA . GLU 9 9 ? A 40.580 107.911 121.112 1 1 B GLU 0.560 1 ATOM 66 C C . GLU 9 9 ? A 39.648 107.272 122.138 1 1 B GLU 0.560 1 ATOM 67 O O . GLU 9 9 ? A 40.000 107.087 123.303 1 1 B GLU 0.560 1 ATOM 68 C CB . GLU 9 9 ? A 40.210 109.406 120.954 1 1 B GLU 0.560 1 ATOM 69 C CG . GLU 9 9 ? A 41.140 110.145 119.962 1 1 B GLU 0.560 1 ATOM 70 C CD . GLU 9 9 ? A 40.449 110.515 118.648 1 1 B GLU 0.560 1 ATOM 71 O OE1 . GLU 9 9 ? A 39.584 109.715 118.207 1 1 B GLU 0.560 1 ATOM 72 O OE2 . GLU 9 9 ? 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A 34.997 101.912 124.312 1 1 B ILE 0.690 1 ATOM 115 N N . LEU 15 15 ? A 39.713 100.951 127.191 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 116 C CA . LEU 15 15 ? A 40.721 100.052 127.725 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 117 C C . LEU 15 15 ? A 41.253 100.482 129.087 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 118 O O . LEU 15 15 ? A 41.344 99.679 130.006 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 119 C CB . LEU 15 15 ? A 41.856 99.917 126.688 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 120 C CG . LEU 15 15 ? A 43.011 98.972 127.071 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 121 C CD1 . LEU 15 15 ? A 42.541 97.516 127.205 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 122 C CD2 . LEU 15 15 ? A 44.141 99.073 126.037 1 1 B LEU 0.700 1 ATOM 123 N N . GLN 16 16 ? A 41.506 101.790 129.282 1 1 B GLN 0.710 1 ATOM 124 C CA . GLN 16 16 ? A 41.912 102.350 130.555 1 1 B GLN 0.710 1 ATOM 125 C C . GLN 16 16 ? A 40.906 102.114 131.672 1 1 B GLN 0.710 1 ATOM 126 O O . GLN 16 16 ? A 41.266 101.754 132.790 1 1 B GLN 0.710 1 ATOM 127 C CB . GLN 16 16 ? A 42.162 103.863 130.356 1 1 B GLN 0.710 1 ATOM 128 C CG . GLN 16 16 ? A 42.872 104.618 131.508 1 1 B GLN 0.710 1 ATOM 129 C CD . GLN 16 16 ? A 42.003 104.895 132.740 1 1 B GLN 0.710 1 ATOM 130 O OE1 . GLN 16 16 ? A 40.798 105.155 132.713 1 1 B GLN 0.710 1 ATOM 131 N NE2 . GLN 16 16 ? A 42.656 104.886 133.926 1 1 B GLN 0.710 1 ATOM 132 N N . VAL 17 17 ? A 39.587 102.263 131.397 1 1 B VAL 0.730 1 ATOM 133 C CA . VAL 17 17 ? A 38.563 101.951 132.389 1 1 B VAL 0.730 1 ATOM 134 C C . VAL 17 17 ? A 38.603 100.477 132.769 1 1 B VAL 0.730 1 ATOM 135 O O . VAL 17 17 ? A 38.564 100.105 133.938 1 1 B VAL 0.730 1 ATOM 136 C CB . VAL 17 17 ? A 37.153 102.345 131.950 1 1 B VAL 0.730 1 ATOM 137 C CG1 . VAL 17 17 ? A 36.223 102.438 133.175 1 1 B VAL 0.730 1 ATOM 138 C CG2 . VAL 17 17 ? A 37.203 103.717 131.262 1 1 B VAL 0.730 1 ATOM 139 N N . LEU 18 18 ? A 38.755 99.604 131.757 1 1 B LEU 0.750 1 ATOM 140 C CA . LEU 18 18 ? A 38.871 98.171 131.931 1 1 B LEU 0.750 1 ATOM 141 C C . LEU 18 18 ? A 40.101 97.726 132.717 1 1 B LEU 0.750 1 ATOM 142 O O . LEU 18 18 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. 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