data_SMR-baaca3b71a583360c0d5e5cd3844d363_6 _entry.id SMR-baaca3b71a583360c0d5e5cd3844d363_6 _struct.entry_id SMR-baaca3b71a583360c0d5e5cd3844d363_6 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q6VGS5 (isoform 2)/ DAPLE_MOUSE, Protein Daple Estimated model accuracy of this model is 0.006, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q6VGS5 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 263887.092 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP DAPLE_MOUSE Q6VGS5 1 ;MDVTVSQLVELFLQSPLVTWVKTFGSFGSGHQDNLTLYMDLVDGIFLNQIMLQIDPRPSNQRINKHVNND VNLRIQNLSILVRNIKTYYQEVLQQLIVMNLPNVLMIGKDPLSGKSMEEIKKVLLLVLGCAVQCERKEEF IERIKQLDIETQAGIVAHIQEVTHNQENVFDLQWLDLPDVAPEELEALSRNMVFHLRRLIDERDECTELI VDLTQERDYLQTQQPPSPGKFSSPDSTPSPTSSLSSEDKQHLAVELADTKARLRRVRQELEEKTEQLADT RHEVDQLVLELQKAKQDNIQLAADARSARAYRDELDSLREKANRVERLEMDLVRCKEKLHDVDFYKARME ELREDNIILIETKAMLEEQLTASRARSDKVHELEKENLQLKSKLHDLELDRDADKKQIEKLLEEYMVLEM AQKQSMKESAHLGWELEQLSKNADLSDASRKSFVFELNECASSRILKLEKENQSLQSTIQGLRDTSLALE ESSLKYGELEKENQQLSKKAGSLHLQIEKLQTQLEREKQSNQDLETLSEELIREKEQLQSGMEALKADRA RQIKDLEQEKGHLHQAVWSLRERPQVNSTKDVEKENRALHQAVTEAGSKLSQLELEKQQLHRDLEEAKEK GEQAEALEKELHRLEKENEQLTKEVTSLKAATEKVEALEHQSQGLELENRSLRKSLDTLQNVSVQLEGLE RDKQQLGQENLELRKMVEAMRFTSAKMAQIETENRQLEREKEELRRDVELLKTLSKKSERLELSYQSVSA ENLQLQHSLESSTHKSQALQRELSQLEAERQALRRDLETLQLTHKQLEGAEEDRKALEQEVAQLEKDKKL LEKEARRLWQQVELKDAILDDSAAKLSAAEKESRALDKELARCRDVGSKLKELEKDNRDLTKQVTMHTRT LTTLREDLVLEKLKSQQLSSELDKLSQELEKVGLSKDLLLQEDDGHGDGKGKTESALKTTLAMKEEKIVF LEAQVEEKESLSRQLQIELQMIKKEHEQLRQTQEGGDKAQNALKRPPGKVTSHQEKEAWEPSHKEATMEL LRVKDRAIELERSNAALQAERQLLKEQLQHLETQNVSFSSQILTLQKQSAFLQEHTTTLQTQTAKLQVEN STLSSQNAALSAQYTVLQSQQAAKEAEHEGLQQQQEQLAAVYEALLQDHKHLGTLYECQSSEYEALIRQH SCLKTLHRNLELEHKELGERHGDLQQRKAELEELEKVLSTEREALEREQKTNAIATSENQRLRGELDRIS FLHQQLKGEYEELHAHTKELKTSLNNSQLELSRWQVRFDELKEQHQSMDISLTKMDNHCELLSRLKGNLE EENHHLLSQIQLLSQQNQMLLEQNMESKEQYHEEQKQYIDKLNALRRHKEKLEEKIMDQYKFYDPAPKKK NHWIGAKALVKLIKPKKEGSRERLKSTTDSPPWQLEPSDPASPSPSQALRSQTENPDNPPSGPNCVEERD THNGPVGKGPGDLKPKRGSPRGGSVDRTDTSTDPAVKSWPSEPGSRTFSTSATTAALSSSTPIPKHLGRT KGCNSDDNLCEPSSEPDGPYHRQQASRPNSLESSRNASSNSSPLSLKGSSDHLHSRCESFSSADLIPSRD PATLSRDGNTSGRGLLGRHEYPPPRNGPVSQETIQKKGAASTHTGVRPHSASPSSEMVTLEEFLEESNRG GSPTHDTPSCRDDLLSDYFRKAHDPPALGGQPGPPARKDGAKMPTSFVAPTIKMSINTSEGQQLKPGHYV KPNLRPSEAEALAGMPSRQVQPPQSLSLGRPRQTTMTQNCHMPVSRSASLSRAFSLASADLLRASGPEAC RPESPQKPGGHEAAGARETSTHSLQGSHILARERTPIVGKADSPSPGQGTRGRPLDTRRFSLAPPKEERL APLQQSATAPALATGCSSGSNPQIQHFSPTVAPAVRTKSKVPQHSGEVATVAPVRPGLGTSEGDGGPGHG YSEGLLTKSPGRSSDLPPHVKRGPDDFSQGSSSKSTPASPEPGGDPQTVWYEYGCV ; 'Protein Daple' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2016 1 2016 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . DAPLE_MOUSE Q6VGS5 Q6VGS5-2 1 2016 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2004-07-05 069825088B91C1B2 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MDVTVSQLVELFLQSPLVTWVKTFGSFGSGHQDNLTLYMDLVDGIFLNQIMLQIDPRPSNQRINKHVNND VNLRIQNLSILVRNIKTYYQEVLQQLIVMNLPNVLMIGKDPLSGKSMEEIKKVLLLVLGCAVQCERKEEF IERIKQLDIETQAGIVAHIQEVTHNQENVFDLQWLDLPDVAPEELEALSRNMVFHLRRLIDERDECTELI VDLTQERDYLQTQQPPSPGKFSSPDSTPSPTSSLSSEDKQHLAVELADTKARLRRVRQELEEKTEQLADT RHEVDQLVLELQKAKQDNIQLAADARSARAYRDELDSLREKANRVERLEMDLVRCKEKLHDVDFYKARME ELREDNIILIETKAMLEEQLTASRARSDKVHELEKENLQLKSKLHDLELDRDADKKQIEKLLEEYMVLEM AQKQSMKESAHLGWELEQLSKNADLSDASRKSFVFELNECASSRILKLEKENQSLQSTIQGLRDTSLALE ESSLKYGELEKENQQLSKKAGSLHLQIEKLQTQLEREKQSNQDLETLSEELIREKEQLQSGMEALKADRA RQIKDLEQEKGHLHQAVWSLRERPQVNSTKDVEKENRALHQAVTEAGSKLSQLELEKQQLHRDLEEAKEK 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A 1 1920 THR 1920 ? ? ? A . A 1 1921 VAL 1921 ? ? ? A . A 1 1922 ALA 1922 ? ? ? A . A 1 1923 PRO 1923 ? ? ? A . A 1 1924 ALA 1924 ? ? ? A . A 1 1925 VAL 1925 ? ? ? A . A 1 1926 ARG 1926 ? ? ? A . A 1 1927 THR 1927 ? ? ? A . A 1 1928 LYS 1928 ? ? ? A . A 1 1929 SER 1929 ? ? ? A . A 1 1930 LYS 1930 ? ? ? A . A 1 1931 VAL 1931 ? ? ? A . A 1 1932 PRO 1932 ? ? ? A . A 1 1933 GLN 1933 ? ? ? A . A 1 1934 HIS 1934 ? ? ? A . A 1 1935 SER 1935 ? ? ? A . A 1 1936 GLY 1936 ? ? ? A . A 1 1937 GLU 1937 ? ? ? A . A 1 1938 VAL 1938 ? ? ? A . A 1 1939 ALA 1939 ? ? ? A . A 1 1940 THR 1940 ? ? ? A . A 1 1941 VAL 1941 ? ? ? A . A 1 1942 ALA 1942 ? ? ? A . A 1 1943 PRO 1943 ? ? ? A . A 1 1944 VAL 1944 ? ? ? A . A 1 1945 ARG 1945 ? ? ? A . A 1 1946 PRO 1946 ? ? ? A . A 1 1947 GLY 1947 ? ? ? A . A 1 1948 LEU 1948 ? ? ? A . A 1 1949 GLY 1949 ? ? ? A . A 1 1950 THR 1950 ? ? ? A . A 1 1951 SER 1951 ? ? ? A . A 1 1952 GLU 1952 ? ? ? A . A 1 1953 GLY 1953 ? ? ? A . A 1 1954 ASP 1954 ? ? ? A . A 1 1955 GLY 1955 ? ? ? A . A 1 1956 GLY 1956 ? ? ? A . A 1 1957 PRO 1957 ? ? ? A . A 1 1958 GLY 1958 ? ? ? A . A 1 1959 HIS 1959 ? ? ? A . A 1 1960 GLY 1960 ? ? ? A . A 1 1961 TYR 1961 ? ? ? A . A 1 1962 SER 1962 ? ? ? A . A 1 1963 GLU 1963 ? ? ? A . A 1 1964 GLY 1964 ? ? ? A . A 1 1965 LEU 1965 ? ? ? A . A 1 1966 LEU 1966 ? ? ? A . A 1 1967 THR 1967 ? ? ? A . A 1 1968 LYS 1968 ? ? ? A . A 1 1969 SER 1969 ? ? ? A . A 1 1970 PRO 1970 ? ? ? A . A 1 1971 GLY 1971 ? ? ? A . A 1 1972 ARG 1972 ? ? ? A . A 1 1973 SER 1973 ? ? ? A . A 1 1974 SER 1974 ? ? ? A . A 1 1975 ASP 1975 ? ? ? A . A 1 1976 LEU 1976 ? ? ? A . A 1 1977 PRO 1977 ? ? ? A . A 1 1978 PRO 1978 ? ? ? A . A 1 1979 HIS 1979 ? ? ? A . A 1 1980 VAL 1980 ? ? ? A . A 1 1981 LYS 1981 ? ? ? A . A 1 1982 ARG 1982 ? ? ? A . A 1 1983 GLY 1983 ? ? ? A . A 1 1984 PRO 1984 ? ? ? A . A 1 1985 ASP 1985 ? ? ? A . A 1 1986 ASP 1986 ? ? ? A . A 1 1987 PHE 1987 ? ? ? A . A 1 1988 SER 1988 ? ? ? A . A 1 1989 GLN 1989 ? ? ? A . A 1 1990 GLY 1990 ? ? ? A . A 1 1991 SER 1991 ? ? ? A . A 1 1992 SER 1992 ? ? ? A . A 1 1993 SER 1993 ? ? ? A . A 1 1994 LYS 1994 ? ? ? A . A 1 1995 SER 1995 ? ? ? A . A 1 1996 THR 1996 ? ? ? A . A 1 1997 PRO 1997 ? ? ? A . A 1 1998 ALA 1998 ? ? ? A . A 1 1999 SER 1999 ? ? ? A . A 1 2000 PRO 2000 ? ? ? A . A 1 2001 GLU 2001 ? ? ? A . A 1 2002 PRO 2002 ? ? ? A . A 1 2003 GLY 2003 ? ? ? A . A 1 2004 GLY 2004 ? ? ? A . A 1 2005 ASP 2005 ? ? ? A . A 1 2006 PRO 2006 ? ? ? A . A 1 2007 GLN 2007 ? ? ? A . A 1 2008 THR 2008 ? ? ? A . A 1 2009 VAL 2009 ? ? ? A . A 1 2010 TRP 2010 ? ? ? A . A 1 2011 TYR 2011 ? ? ? A . A 1 2012 GLU 2012 ? ? ? A . A 1 2013 TYR 2013 ? ? ? A . A 1 2014 GLY 2014 ? ? ? A . A 1 2015 CYS 2015 ? ? ? A . A 1 2016 VAL 2016 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Protein origami triangle {PDB ID=8p4y, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=8p4y.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8p4y, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 6' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSPEDEIERLERENEKLERENERLEREIRWLEEGSGQLEDKVEELLSKNYHLENEVERLKKLVGSGSPED KIEELKRKIEKLKRENERLERENEWLERGSGSPEDKIEELKRKNRELKEKNKELKEKIYRLKEGSGQLED KVEELLSKNYHLENEVERLKKLVGSGSPENEIKELEEEIRELEEKNEELKRKNEWLKRGSG ; ;GSPEDEIERLERENEKLERENERLEREIRWLEEGSGQLEDKVEELLSKNYHLENEVERLKKLVGSGSPED KIEELKRKIEKLKRENERLERENEWLERGSGSPEDKIEELKRKNRELKEKNKELKEKIYRLKEGSGQLED KVEELLSKNYHLENEVERLKKLVGSGSPENEIKELEEEIRELEEKNEELKRKNEWLKRGSG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 75 191 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8p4y 2023-08-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2016 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2022 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.7e-05 24.324 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MDVTVSQLVELFLQSPLVTWVKTFGSFGSGHQDNLTLYMDLVDGIFLNQIMLQIDPRPSNQRINKHVNNDVNLRIQNLSILVRNIKTYYQEVLQQLIVMNLPNVLMIGKDPLSGKSMEEIKKVLLLVLGCAVQCERKEEFIERIKQLDIETQAGIVAHIQEVTHNQENVFDLQWLDLPDVAPEELEALSRNMVFHLRRLIDERDECTELIVDLTQERDYLQTQQPPSPGKFSSPDSTPSPTSSLSSEDKQHLAVELADTKARLRRVRQELEEKTEQLADTRHEVDQLVLELQKAKQDNIQLAADARSARAYRDELDSLREKANRVERLEMDLVRCKEKLHDVDFYKARMEELREDNIILIETKAMLEEQLTASRARSDKVHELEKENLQLKSKLHDLELDRDADKKQIEKLLEEYMVLEMAQKQSMKESAHLGWELEQLSKNADLSDASRKSFVFELNECASSRILKLEKENQSLQSTIQGLRDTSLALEESSLKYGELEKENQQLSKKAGSLHLQIEKLQTQLEREKQSNQDLETLSEELIREKEQLQSGMEALKADRARQIKDLEQEKGHLHQAVWSLRERPQVNSTKDVEKENRALHQAVTEAGSKLSQLELEKQQLHRDLEEAKEKGEQAEALEKELHRLEKENEQLTKEVTSLKAATEKVEALEHQSQGLELENRSLRKSLDTLQNVSVQLEGLERDKQQLGQENLELRKMVEAMRFTSAKMAQIETENRQLEREKEELRRDVELLKTL----SKKSERLELSYQSVSAENLQLQHSLESST--HKSQALQRELSQLEAERQALRRDLETLQLTHKQLEGAEEDRKALEQEVAQLEKDKKLLEKEARRLWQQVELKDAILDDSAAKLSAAEKESRALDKELARCRDVGSKLKELEKDNRDLTKQVTMHTRTLTTLREDLVLEKLKSQQLSSELDKLSQELEKVGLSKDLLLQEDDGHGDGKGKTESALKTTLAMKEEKIVFLEAQVEEKESLSRQLQIELQMIKKEHEQLRQTQEGGDKAQNALKRPPGKVTSHQEKEAWEPSHKEATMELLRVKDRAIELERSNAALQAERQLLKEQLQHLETQNVSFSSQILTLQKQSAFLQEHTTTLQTQTAKLQVENSTLSSQNAALSAQYTVLQSQQAAKEAEHEGLQQQQEQLAAVYEALLQDHKHLGTLYECQSSEYEALIRQHSCLKTLHRNLELEHKELGERHGDLQQRKAELEELEKVLSTEREALEREQKTNAIATSENQRLRGELDRISFLHQQLKGEYEELHAHTKELKTSLNNSQLELSRWQVRFDELKEQHQSMDISLTKMDNHCELLSRLKGNLEEENHHLLSQIQLLSQQNQMLLEQNMESKEQYHEEQKQYIDKLNALRRHKEKLEEKIMDQYKFYDPAPKKKNHWIGAKALVKLIKPKKEGSRERLKSTTDSPPWQLEPSDPASPSPSQALRSQTENPDNPPSGPNCVEERDTHNGPVGKGPGDLKPKRGSPRGGSVDRTDTSTDPAVKSWPSEPGSRTFSTSATTAALSSSTPIPKHLGRTKGCNSDDNLCEPSSEPDGPYHRQQASRPNSLESSRNASSNSSPLSLKGSSDHLHSRCESFSSADLIPSRDPATLSRDGNTSGRGLLGRHEYPPPRNGPVSQETIQKKGAASTHTGVRPHSASPSSEMVTLEEFLEESNRGGSPTHDTPSCRDDLLSDYFRKAHDPPALGGQPGPPARKDGAKMPTSFVAPTIKMSINTSEGQQLKPGHYVKPNLRPSEAEALAGMPSRQVQPPQSLSLGRPRQTTMTQNCHMPVSRSASLSRAFSLASADLLRASGPEACRPESPQKPGGHEAAGARETSTHSLQGSHILARERTPIVGKADSPSPGQGTRGRPLDTRRFSLAPPKEERLAPLQQSATAPALATGCSSGSNPQIQHFSPTVAPAVRTKSKVPQHSGEVATVAPVRPGLGTSEGDGGPGHGYSEGLLTKSPGRSSDLPPHVKRGPDDFSQGSSSKSTPASPEPGGDPQTVWYEYGCV 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LKRKIEKLKRENERLERENEWLERGSGS---PEDKIEELKRKNRELKEKNKELKEKIYRLKEGSGQLEDKVEELLSKNYHLENEVERLKKLVGSGSPENEIKELEEEIRELEEKNEELKR----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8p4y.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 6' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . VAL 692 692 ? A 13.950 -27.832 46.424 1 1 A VAL 0.300 1 ATOM 2 C CA . VAL 692 692 ? A 15.092 -26.851 46.371 1 1 A VAL 0.300 1 ATOM 3 C C . VAL 692 692 ? A 14.670 -25.395 46.250 1 1 A VAL 0.300 1 ATOM 4 O O . VAL 692 692 ? A 15.076 -24.592 47.076 1 1 A VAL 0.300 1 ATOM 5 C CB . VAL 692 692 ? A 16.057 -27.239 45.265 1 1 A VAL 0.300 1 ATOM 6 C CG1 . VAL 692 692 ? A 17.216 -26.240 45.257 1 1 A VAL 0.300 1 ATOM 7 C CG2 . VAL 692 692 ? A 16.675 -28.622 45.535 1 1 A VAL 0.300 1 ATOM 8 N N . SER 693 693 ? A 13.787 -25.012 45.288 1 1 A SER 0.320 1 ATOM 9 C CA . SER 693 693 ? A 13.257 -23.651 45.154 1 1 A SER 0.320 1 ATOM 10 C C . SER 693 693 ? A 12.663 -23.082 46.436 1 1 A SER 0.320 1 ATOM 11 O O . SER 693 693 ? A 12.897 -21.931 46.779 1 1 A SER 0.320 1 ATOM 12 C CB . SER 693 693 ? A 12.179 -23.577 44.041 1 1 A SER 0.320 1 ATOM 13 O OG . SER 693 693 ? A 12.673 -24.078 42.799 1 1 A SER 0.320 1 ATOM 14 N N . VAL 694 694 ? A 11.941 -23.907 47.228 1 1 A VAL 0.560 1 ATOM 15 C CA . VAL 694 694 ? 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GLU 709 709 ? A 19.758 -8.129 64.513 1 1 A GLU 0.620 1 ATOM 142 O OE1 . GLU 709 709 ? A 20.687 -8.775 65.062 1 1 A GLU 0.620 1 ATOM 143 O OE2 . GLU 709 709 ? A 18.537 -8.297 64.762 1 1 A GLU 0.620 1 ATOM 144 N N . ASN 710 710 ? A 22.087 -6.119 60.382 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 145 C CA . ASN 710 710 ? A 23.456 -5.645 60.257 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 146 C C . ASN 710 710 ? A 23.581 -4.199 59.791 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 147 O O . ASN 710 710 ? A 24.400 -3.445 60.309 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 148 C CB . ASN 710 710 ? A 24.274 -6.516 59.271 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 149 C CG . ASN 710 710 ? A 24.549 -7.874 59.899 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 150 O OD1 . ASN 710 710 ? A 24.326 -8.078 61.090 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 151 N ND2 . ASN 710 710 ? A 25.130 -8.802 59.108 1 1 A ASN 0.640 1 ATOM 152 N N . LEU 711 711 ? A 22.780 -3.756 58.799 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 153 C CA . LEU 711 711 ? A 22.694 -2.354 58.419 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 154 C C . LEU 711 711 ? A 22.137 -1.473 59.507 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 155 O O . LEU 711 711 ? A 22.666 -0.392 59.737 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 156 C CB . LEU 711 711 ? A 21.814 -2.121 57.173 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 157 C CG . LEU 711 711 ? A 22.402 -2.651 55.858 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 158 C CD1 . LEU 711 711 ? A 21.335 -2.535 54.757 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 159 C CD2 . LEU 711 711 ? A 23.700 -1.923 55.460 1 1 A LEU 0.590 1 ATOM 160 N N . GLU 712 712 ? A 21.081 -1.918 60.212 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 161 C CA . GLU 712 712 ? A 20.532 -1.247 61.365 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 162 C C . GLU 712 712 ? A 21.536 -1.067 62.475 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 163 O O . GLU 712 712 ? A 21.806 0.049 62.897 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 164 C CB . GLU 712 712 ? A 19.323 -2.048 61.889 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 165 C CG . GLU 712 712 ? A 18.173 -1.988 60.868 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 166 C CD . GLU 712 712 ? A 16.858 -2.624 61.285 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 167 O OE1 . GLU 712 712 ? A 16.812 -3.361 62.289 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 168 O OE2 . GLU 712 712 ? A 15.864 -2.354 60.556 1 1 A GLU 0.550 1 ATOM 169 N N . LEU 713 713 ? A 22.223 -2.129 62.913 1 1 A LEU 0.540 1 ATOM 170 C CA . LEU 713 713 ? A 23.229 -2.019 63.950 1 1 A LEU 0.540 1 ATOM 171 C C . LEU 713 713 ? A 24.382 -1.097 63.606 1 1 A LEU 0.540 1 ATOM 172 O O . LEU 713 713 ? A 24.843 -0.328 64.445 1 1 A LEU 0.540 1 ATOM 173 C CB . LEU 713 713 ? A 23.854 -3.391 64.254 1 1 A LEU 0.540 1 ATOM 174 C CG . LEU 713 713 ? A 22.900 -4.408 64.898 1 1 A LEU 0.540 1 ATOM 175 C CD1 . LEU 713 713 ? A 23.600 -5.773 64.936 1 1 A LEU 0.540 1 ATOM 176 C CD2 . LEU 713 713 ? A 22.426 -3.977 66.297 1 1 A LEU 0.540 1 ATOM 177 N N . ARG 714 714 ? A 24.872 -1.165 62.353 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 178 C CA . ARG 714 714 ? A 25.910 -0.282 61.862 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 179 C C . ARG 714 714 ? A 25.486 1.178 61.706 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 180 O O . ARG 714 714 ? A 26.218 2.078 62.101 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 181 C CB . ARG 714 714 ? A 26.455 -0.796 60.504 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 182 C CG . ARG 714 714 ? A 27.212 -2.138 60.603 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 183 C CD . ARG 714 714 ? A 27.661 -2.645 59.230 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 184 N NE . ARG 714 714 ? A 28.345 -3.975 59.414 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 185 C CZ . ARG 714 714 ? A 28.797 -4.733 58.404 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 186 N NH1 . ARG 714 714 ? A 28.644 -4.339 57.144 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 187 N NH2 . ARG 714 714 ? A 29.410 -5.892 58.641 1 1 A ARG 0.450 1 ATOM 188 N N . LYS 715 715 ? A 24.295 1.443 61.123 1 1 A LYS 0.470 1 ATOM 189 C CA . LYS 715 715 ? A 23.924 2.752 60.625 1 1 A LYS 0.470 1 ATOM 190 C C . LYS 715 715 ? A 22.705 3.381 61.285 1 1 A LYS 0.470 1 ATOM 191 O O . LYS 715 715 ? A 22.310 4.473 60.900 1 1 A LYS 0.470 1 ATOM 192 C CB . LYS 715 715 ? A 23.596 2.643 59.119 1 1 A LYS 0.470 1 ATOM 193 C CG . LYS 715 715 ? A 24.808 2.203 58.294 1 1 A LYS 0.470 1 ATOM 194 C CD . LYS 715 715 ? A 24.487 2.123 56.800 1 1 A LYS 0.470 1 ATOM 195 C CE . LYS 715 715 ? A 25.721 1.775 55.972 1 1 A LYS 0.470 1 ATOM 196 N NZ . LYS 715 715 ? A 25.350 1.694 54.544 1 1 A LYS 0.470 1 ATOM 197 N N . MET 716 716 ? 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A 24.969 5.283 65.597 1 1 A VAL 0.350 1 ATOM 212 N N . GLU 718 718 ? A 23.908 6.657 62.836 1 1 A GLU 0.370 1 ATOM 213 C CA . GLU 718 718 ? A 24.379 7.432 61.702 1 1 A GLU 0.370 1 ATOM 214 C C . GLU 718 718 ? A 23.200 8.006 60.932 1 1 A GLU 0.370 1 ATOM 215 O O . GLU 718 718 ? A 23.216 9.135 60.441 1 1 A GLU 0.370 1 ATOM 216 C CB . GLU 718 718 ? A 25.243 6.542 60.768 1 1 A GLU 0.370 1 ATOM 217 C CG . GLU 718 718 ? A 26.611 6.108 61.360 1 1 A GLU 0.370 1 ATOM 218 C CD . GLU 718 718 ? A 27.422 5.232 60.399 1 1 A GLU 0.370 1 ATOM 219 O OE1 . GLU 718 718 ? A 26.876 4.819 59.340 1 1 A GLU 0.370 1 ATOM 220 O OE2 . GLU 718 718 ? A 28.612 4.985 60.720 1 1 A GLU 0.370 1 ATOM 221 N N . ALA 719 719 ? A 22.118 7.217 60.839 1 1 A ALA 0.420 1 ATOM 222 C CA . ALA 719 719 ? A 20.895 7.610 60.219 1 1 A ALA 0.420 1 ATOM 223 C C . ALA 719 719 ? A 19.716 6.866 60.832 1 1 A ALA 0.420 1 ATOM 224 O O . ALA 719 719 ? A 19.489 5.686 60.574 1 1 A ALA 0.420 1 ATOM 225 C CB . ALA 719 719 ? 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A 34.035 -17.995 60.788 1 1 A ARG 0.310 1 ATOM 937 N NH2 . ARG 805 805 ? A 35.249 -16.209 60.043 1 1 A ARG 0.310 1 ATOM 938 O OXT . ARG 805 805 ? A 30.926 -12.034 62.255 1 1 A ARG 0.310 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #