data_SMR-ae5f033dbfb8db5eab2ee765ff03d7e3_2 _entry.id SMR-ae5f033dbfb8db5eab2ee765ff03d7e3_2 _struct.entry_id SMR-ae5f033dbfb8db5eab2ee765ff03d7e3_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - O14497 (isoform 2)/ ARI1A_HUMAN, AT-rich interactive domain-containing protein 1A Estimated model accuracy of this model is 0.054, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries O14497 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 255760.679 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ARI1A_HUMAN O14497 1 ;MAAQVAPAAASSLGNPPPPPPSELKKAEQQQREEAGGEAAAAAAAERGEMKAAAGQESEGPAVGPPQPLG KELQDGAESNGGGGGGGAGSGGGPGAEPDLKNSNGNAGPRPALNNNLTEPPGGGGGGSSDGVGAPPHSAA AALPPPAYGFGQPYGRSPSAVAAAAAAVFHQQHGGQQSPGLAALQSGGGGGLEPYAGPQQNSHDHGFPNH QYNSYYPNRSAYPPPAPAYALSSPRGGTPGSGAAAAAGSKPPPSSSASASSSSSSFAQQRFGAMGGGGPS AAGGGTPQPTATPTLNQLLTSPSSARGYQGYPGGDYSGGPQDGGAGKGPADMASQCWGAAAAAAAAAAAS GGAQQRSHHAPMSPGSSGGGGQPLARTPQPSSPMDQMGKMRPQPYGGTNPYSQQQGPPSGPQQGHGYPGQ PYGSQTPQRYPMTMQGRAQSAMGGLSYTQQIPPYGQQGPSGYGQQGQTPYYNQQSPHPQQQQPPYSQQPP SQTPHAQPSYQQQPQSQPPQLQSSQPPYSQQPSQPPHQQSPAPYPSQQSTTQQHPQSQPPYSQPQAQSPY QQQQPQQPAPSTLSQQAAYPQPQSQQSQQTAYSQQRFPPPQELSQDSFGSQASSAPSMTSSKGGQEDMNL SLQSRPSSLPDLSGSIDDLPMGTEGALSPGVSTSGISSSQGEQSNPAQSPFSPHTSPHLPGIRGPSPSPV GSPASVAQSRSGPLSPAAVPGNQMPPRPPSGQSDSIMHPSMNQSSIAQDRGYMQRNPQMPQYSSPQPGSA LSPRQPSGGQIHTGMGSYQQNSMGSYGPQGGQYGPQGGYPRQPNYNALPNANYPSAGMAGGINPMGAGGQ MHGQPGIPPYGTLPPGRMSHASMGNRPYGPNMANMPPQVGSGMCPPPGGMNRKTQETAVAMHVAANSIQN RPPGYPNMNQGGMMGTGPPYGQGINSMAGMINPQGPPYSMGGTMANNSAGMAASPEMMGLGDVKLTPATK MNNKADGTPKTESKSKKSSSSTTTNEKITKLYELGGEPERKMWVDRYLAFTEEKAMGMTNLPAVGRKPLD LYRLYVSVKEIGGLTQVNKNKKWRELATNLNVGTSSSAASSLKKQYIQCLYAFECKIERGEDPPPDIFAA ADSKKSQPKIQPPSPAGSGSMQGPQTPQSTSSSMAEGGDLKPPTPASTPHSQIPPLPGMSRSNSVGIQDA FNDGSDSTFQKRNSMTPNPGYQPSMNTSDMMGRMSYEPNKDPYGSMRKAPGSDPFMSSGQGPNGGMGDPY SRAAGPGLGNVAMGPRQHYPYGGPYDRVRTEPGIGPEGNMSTGAPQPNLMPSNPDSGMYSPSRYPPQQQQ QQQQRHDSYGNQFSTQGTPSGSPFPSQQTTMYQQQQQVSSPAPLPRPMENRTSPSKSPFLHSGMKMQKAG PPVPASHIAPAPVQPPMIRRDITFPPGSVEATQPVLKQRRRLTMKDIGTPEAWRVMMSLKSGLLAESTWA LDTINILLYDDNSIMTFNLSQLPGLLELLVEYFRRCLIEIFGILKEYEVGDPGQRTLLDPGRFSKVSSPA PMEGGEEEEELLGPKLEEEEEEEVVENDEEIAFSGKDKPASENSEEKLISKFDKLPVKIVQKNDPFVVDC SDKLGRVQEFDSGLLHWRIGGGDTTEHIQTHFESKTELLPSRPHAPCPPAPRKHVTTAEGTPGTTDQEGP PPDGPPEKRITATMDDMLSTRSSTLTEDGAKSSEAIKESSKFPFGISPAQSHRNIKILEDEPHSKDETPL CTLLDWQDSLAKRCVCVSNTIRSLSFVPGNDFEMSKHPGLLLILGKLILLHHKHPERKQAPLTYEKEEEQ DQGVSCNKVEWWWDCLEMLRENTLVTLANISGQLDLSPYPESICLPVLDGLLHWAVCPSAEAQDPFSTLG PNAVLSPQRLVLETLSKLSIQDNNVDLILATPPFSRLEKLYSTMVRFLSDRKNPVCREMAVVLLANLAQG DSLAARAIAVQKGSIGNLLGFLEDSLAATQFQQSQASLLHMQNPPFEPTSVDMMRRAARALLALAKVDEN HSEFTLYESRLLDISVSPLMNSLVSQVICDVLFLIGQS ; 'AT-rich interactive domain-containing protein 1A' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2068 1 2068 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ARI1A_HUMAN O14497 O14497-2 1 2068 9606 'Homo sapiens (Human)' 2005-08-30 EF78398FE65F9E33 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MAAQVAPAAASSLGNPPPPPPSELKKAEQQQREEAGGEAAAAAAAERGEMKAAAGQESEGPAVGPPQPLG KELQDGAESNGGGGGGGAGSGGGPGAEPDLKNSNGNAGPRPALNNNLTEPPGGGGGGSSDGVGAPPHSAA AALPPPAYGFGQPYGRSPSAVAAAAAAVFHQQHGGQQSPGLAALQSGGGGGLEPYAGPQQNSHDHGFPNH QYNSYYPNRSAYPPPAPAYALSSPRGGTPGSGAAAAAGSKPPPSSSASASSSSSSFAQQRFGAMGGGGPS AAGGGTPQPTATPTLNQLLTSPSSARGYQGYPGGDYSGGPQDGGAGKGPADMASQCWGAAAAAAAAAAAS GGAQQRSHHAPMSPGSSGGGGQPLARTPQPSSPMDQMGKMRPQPYGGTNPYSQQQGPPSGPQQGHGYPGQ PYGSQTPQRYPMTMQGRAQSAMGGLSYTQQIPPYGQQGPSGYGQQGQTPYYNQQSPHPQQQQPPYSQQPP SQTPHAQPSYQQQPQSQPPQLQSSQPPYSQQPSQPPHQQSPAPYPSQQSTTQQHPQSQPPYSQPQAQSPY QQQQPQQPAPSTLSQQAAYPQPQSQQSQQTAYSQQRFPPPQELSQDSFGSQASSAPSMTSSKGGQEDMNL 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A 1 1881 GLU 1881 ? ? ? A . A 1 1882 ALA 1882 ? ? ? A . A 1 1883 GLN 1883 ? ? ? A . A 1 1884 ASP 1884 ? ? ? A . A 1 1885 PRO 1885 ? ? ? A . A 1 1886 PHE 1886 ? ? ? A . A 1 1887 SER 1887 ? ? ? A . A 1 1888 THR 1888 ? ? ? A . A 1 1889 LEU 1889 ? ? ? A . A 1 1890 GLY 1890 ? ? ? A . A 1 1891 PRO 1891 ? ? ? A . A 1 1892 ASN 1892 ? ? ? A . A 1 1893 ALA 1893 ? ? ? A . A 1 1894 VAL 1894 ? ? ? A . A 1 1895 LEU 1895 ? ? ? A . A 1 1896 SER 1896 ? ? ? A . A 1 1897 PRO 1897 ? ? ? A . A 1 1898 GLN 1898 ? ? ? A . A 1 1899 ARG 1899 ? ? ? A . A 1 1900 LEU 1900 ? ? ? A . A 1 1901 VAL 1901 ? ? ? A . A 1 1902 LEU 1902 ? ? ? A . A 1 1903 GLU 1903 ? ? ? A . A 1 1904 THR 1904 ? ? ? A . A 1 1905 LEU 1905 ? ? ? A . A 1 1906 SER 1906 ? ? ? A . A 1 1907 LYS 1907 ? ? ? A . A 1 1908 LEU 1908 ? ? ? A . A 1 1909 SER 1909 ? ? ? A . A 1 1910 ILE 1910 ? ? ? A . A 1 1911 GLN 1911 ? ? ? A . A 1 1912 ASP 1912 ? ? ? A . A 1 1913 ASN 1913 ? ? ? A . A 1 1914 ASN 1914 ? ? ? A . A 1 1915 VAL 1915 ? ? ? A . A 1 1916 ASP 1916 ? ? ? A . A 1 1917 LEU 1917 ? ? ? A . A 1 1918 ILE 1918 ? ? ? A . A 1 1919 LEU 1919 ? ? ? A . A 1 1920 ALA 1920 ? ? ? A . A 1 1921 THR 1921 ? ? ? A . A 1 1922 PRO 1922 ? ? ? A . A 1 1923 PRO 1923 ? ? ? A . A 1 1924 PHE 1924 ? ? ? A . A 1 1925 SER 1925 ? ? ? A . A 1 1926 ARG 1926 ? ? ? A . A 1 1927 LEU 1927 ? ? ? A . A 1 1928 GLU 1928 ? ? ? A . A 1 1929 LYS 1929 ? ? ? A . A 1 1930 LEU 1930 ? ? ? A . A 1 1931 TYR 1931 ? ? ? A . A 1 1932 SER 1932 ? ? ? A . A 1 1933 THR 1933 ? ? ? A . A 1 1934 MET 1934 ? ? ? A . A 1 1935 VAL 1935 ? ? ? A . A 1 1936 ARG 1936 ? ? ? A . A 1 1937 PHE 1937 ? ? ? A . A 1 1938 LEU 1938 ? ? ? A . A 1 1939 SER 1939 ? ? ? A . A 1 1940 ASP 1940 ? ? ? A . A 1 1941 ARG 1941 ? ? ? A . A 1 1942 LYS 1942 ? ? ? A . A 1 1943 ASN 1943 ? ? ? A . A 1 1944 PRO 1944 ? ? ? A . A 1 1945 VAL 1945 ? ? ? A . A 1 1946 CYS 1946 ? ? ? A . A 1 1947 ARG 1947 ? ? ? A . A 1 1948 GLU 1948 ? ? ? A . A 1 1949 MET 1949 ? ? ? A . A 1 1950 ALA 1950 ? ? ? A . A 1 1951 VAL 1951 ? ? ? A . A 1 1952 VAL 1952 ? ? ? A . A 1 1953 LEU 1953 ? ? ? A . A 1 1954 LEU 1954 ? ? ? A . A 1 1955 ALA 1955 ? ? ? A . A 1 1956 ASN 1956 ? ? ? A . A 1 1957 LEU 1957 ? ? ? A . A 1 1958 ALA 1958 ? ? ? A . A 1 1959 GLN 1959 ? ? ? A . A 1 1960 GLY 1960 ? ? ? A . A 1 1961 ASP 1961 ? ? ? A . A 1 1962 SER 1962 ? ? ? A . A 1 1963 LEU 1963 ? ? ? A . A 1 1964 ALA 1964 ? ? ? A . A 1 1965 ALA 1965 ? ? ? A . A 1 1966 ARG 1966 ? ? ? A . A 1 1967 ALA 1967 ? ? ? A . A 1 1968 ILE 1968 ? ? ? A . A 1 1969 ALA 1969 ? ? ? A . A 1 1970 VAL 1970 ? ? ? A . A 1 1971 GLN 1971 ? ? ? A . A 1 1972 LYS 1972 ? ? ? A . A 1 1973 GLY 1973 ? ? ? A . A 1 1974 SER 1974 ? ? ? A . A 1 1975 ILE 1975 ? ? ? A . A 1 1976 GLY 1976 ? ? ? A . A 1 1977 ASN 1977 ? ? ? A . A 1 1978 LEU 1978 ? ? ? A . A 1 1979 LEU 1979 ? ? ? A . A 1 1980 GLY 1980 ? ? ? A . A 1 1981 PHE 1981 ? ? ? A . A 1 1982 LEU 1982 ? ? ? A . A 1 1983 GLU 1983 ? ? ? A . A 1 1984 ASP 1984 ? ? ? A . A 1 1985 SER 1985 ? ? ? A . A 1 1986 LEU 1986 ? ? ? A . A 1 1987 ALA 1987 ? ? ? A . A 1 1988 ALA 1988 ? ? ? A . A 1 1989 THR 1989 ? ? ? A . A 1 1990 GLN 1990 ? ? ? A . A 1 1991 PHE 1991 ? ? ? A . A 1 1992 GLN 1992 ? ? ? A . A 1 1993 GLN 1993 ? ? ? A . A 1 1994 SER 1994 ? ? ? A . A 1 1995 GLN 1995 ? ? ? A . A 1 1996 ALA 1996 ? ? ? A . A 1 1997 SER 1997 ? ? ? A . A 1 1998 LEU 1998 ? ? ? A . A 1 1999 LEU 1999 ? ? ? A . A 1 2000 HIS 2000 ? ? ? A . A 1 2001 MET 2001 ? ? ? A . A 1 2002 GLN 2002 ? ? ? A . A 1 2003 ASN 2003 ? ? ? A . A 1 2004 PRO 2004 ? ? ? A . A 1 2005 PRO 2005 ? ? ? A . A 1 2006 PHE 2006 ? ? ? A . A 1 2007 GLU 2007 ? ? ? A . A 1 2008 PRO 2008 ? ? ? A . A 1 2009 THR 2009 ? ? ? A . A 1 2010 SER 2010 ? ? ? A . A 1 2011 VAL 2011 ? ? ? A . A 1 2012 ASP 2012 ? ? ? A . A 1 2013 MET 2013 ? ? ? A . A 1 2014 MET 2014 ? ? ? A . A 1 2015 ARG 2015 ? ? ? A . A 1 2016 ARG 2016 ? ? ? A . A 1 2017 ALA 2017 ? ? ? A . A 1 2018 ALA 2018 ? ? ? A . A 1 2019 ARG 2019 ? ? ? A . A 1 2020 ALA 2020 ? ? ? A . A 1 2021 LEU 2021 ? ? ? A . A 1 2022 LEU 2022 ? ? ? A . A 1 2023 ALA 2023 ? ? ? A . A 1 2024 LEU 2024 ? ? ? A . A 1 2025 ALA 2025 ? ? ? A . A 1 2026 LYS 2026 ? ? ? A . A 1 2027 VAL 2027 ? ? ? A . A 1 2028 ASP 2028 ? ? ? A . A 1 2029 GLU 2029 ? ? ? A . A 1 2030 ASN 2030 ? ? ? A . A 1 2031 HIS 2031 ? ? ? A . A 1 2032 SER 2032 ? ? ? A . A 1 2033 GLU 2033 ? ? ? A . A 1 2034 PHE 2034 ? ? ? A . A 1 2035 THR 2035 ? ? ? A . A 1 2036 LEU 2036 ? ? ? A . A 1 2037 TYR 2037 ? ? ? A . A 1 2038 GLU 2038 ? ? ? A . A 1 2039 SER 2039 ? ? ? A . A 1 2040 ARG 2040 ? ? ? A . A 1 2041 LEU 2041 ? ? ? A . A 1 2042 LEU 2042 ? ? ? A . A 1 2043 ASP 2043 ? ? ? A . A 1 2044 ILE 2044 ? ? ? A . A 1 2045 SER 2045 ? ? ? A . A 1 2046 VAL 2046 ? ? ? A . A 1 2047 SER 2047 ? ? ? A . A 1 2048 PRO 2048 ? ? ? A . A 1 2049 LEU 2049 ? ? ? A . A 1 2050 MET 2050 ? ? ? A . A 1 2051 ASN 2051 ? ? ? A . A 1 2052 SER 2052 ? ? ? A . A 1 2053 LEU 2053 ? ? ? A . A 1 2054 VAL 2054 ? ? ? A . A 1 2055 SER 2055 ? ? ? A . A 1 2056 GLN 2056 ? ? ? A . A 1 2057 VAL 2057 ? ? ? A . A 1 2058 ILE 2058 ? ? ? A . A 1 2059 CYS 2059 ? ? ? A . A 1 2060 ASP 2060 ? ? ? A . A 1 2061 VAL 2061 ? ? ? A . A 1 2062 LEU 2062 ? ? ? A . A 1 2063 PHE 2063 ? ? ? A . A 1 2064 LEU 2064 ? ? ? A . A 1 2065 ILE 2065 ? ? ? A . A 1 2066 GLY 2066 ? ? ? A . A 1 2067 GLN 2067 ? ? ? A . A 1 2068 SER 2068 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'AT-rich interactive domain-containing protein 1B {PDB ID=2eh9, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2eh9.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2eh9, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSSGSSGEKITKVYELGNEPERKLWVDRYLTFMEERGSPVSSLPAVGKKPLDLFRLYVCVKEIGGLAQVN KNKKWRELATNLNVGTSSSAASSLKKQYIQYLFAFECKIERGEEPPPEVFSTGDT ; ;GSSGSSGEKITKVYELGNEPERKLWVDRYLTFMEERGSPVSSLPAVGKKPLDLFRLYVCVKEIGGLAQVN KNKKWRELATNLNVGTSSSAASSLKKQYIQYLFAFECKIERGEEPPPEVFSTGDT ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 7 123 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2eh9 2024-10-30 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2068 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2068 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.9e-22 78.632 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAAQVAPAAASSLGNPPPPPPSELKKAEQQQREEAGGEAAAAAAAERGEMKAAAGQESEGPAVGPPQPLGKELQDGAESNGGGGGGGAGSGGGPGAEPDLKNSNGNAGPRPALNNNLTEPPGGGGGGSSDGVGAPPHSAAAALPPPAYGFGQPYGRSPSAVAAAAAAVFHQQHGGQQSPGLAALQSGGGGGLEPYAGPQQNSHDHGFPNHQYNSYYPNRSAYPPPAPAYALSSPRGGTPGSGAAAAAGSKPPPSSSASASSSSSSFAQQRFGAMGGGGPSAAGGGTPQPTATPTLNQLLTSPSSARGYQGYPGGDYSGGPQDGGAGKGPADMASQCWGAAAAAAAAAAASGGAQQRSHHAPMSPGSSGGGGQPLARTPQPSSPMDQMGKMRPQPYGGTNPYSQQQGPPSGPQQGHGYPGQPYGSQTPQRYPMTMQGRAQSAMGGLSYTQQIPPYGQQGPSGYGQQGQTPYYNQQSPHPQQQQPPYSQQPPSQTPHAQPSYQQQPQSQPPQLQSSQPPYSQQPSQPPHQQSPAPYPSQQSTTQQHPQSQPPYSQPQAQSPYQQQQPQQPAPSTLSQQAAYPQPQSQQSQQTAYSQQRFPPPQELSQDSFGSQASSAPSMTSSKGGQEDMNLSLQSRPSSLPDLSGSIDDLPMGTEGALSPGVSTSGISSSQGEQSNPAQSPFSPHTSPHLPGIRGPSPSPVGSPASVAQSRSGPLSPAAVPGNQMPPRPPSGQSDSIMHPSMNQSSIAQDRGYMQRNPQMPQYSSPQPGSALSPRQPSGGQIHTGMGSYQQNSMGSYGPQGGQYGPQGGYPRQPNYNALPNANYPSAGMAGGINPMGAGGQMHGQPGIPPYGTLPPGRMSHASMGNRPYGPNMANMPPQVGSGMCPPPGGMNRKTQETAVAMHVAANSIQNRPPGYPNMNQGGMMGTGPPYGQGINSMAGMINPQGPPYSMGGTMANNSAGMAASPEMMGLGDVKLTPATKMNNKADGTPKTESKSKKSSSSTTTNEKITKLYELGGEPERKMWVDRYLAFTEEKAMGMTNLPAVGRKPLDLYRLYVSVKEIGGLTQVNKNKKWRELATNLNVGTSSSAASSLKKQYIQCLYAFECKIERGEDPPPDIFAAADSKKSQPKIQPPSPAGSGSMQGPQTPQSTSSSMAEGGDLKPPTPASTPHSQIPPLPGMSRSNSVGIQDAFNDGSDSTFQKRNSMTPNPGYQPSMNTSDMMGRMSYEPNKDPYGSMRKAPGSDPFMSSGQGPNGGMGDPYSRAAGPGLGNVAMGPRQHYPYGGPYDRVRTEPGIGPEGNMSTGAPQPNLMPSNPDSGMYSPSRYPPQQQQQQQQRHDSYGNQFSTQGTPSGSPFPSQQTTMYQQQQQVSSPAPLPRPMENRTSPSKSPFLHSGMKMQKAGPPVPASHIAPAPVQPPMIRRDITFPPGSVEATQPVLKQRRRLTMKDIGTPEAWRVMMSLKSGLLAESTWALDTINILLYDDNSIMTFNLSQLPGLLELLVEYFRRCLIEIFGILKEYEVGDPGQRTLLDPGRFSKVSSPAPMEGGEEEEELLGPKLEEEEEEEVVENDEEIAFSGKDKPASENSEEKLISKFDKLPVKIVQKNDPFVVDCSDKLGRVQEFDSGLLHWRIGGGDTTEHIQTHFESKTELLPSRPHAPCPPAPRKHVTTAEGTPGTTDQEGPPPDGPPEKRITATMDDMLSTRSSTLTEDGAKSSEAIKESSKFPFGISPAQSHRNIKILEDEPHSKDETPLCTLLDWQDSLAKRCVCVSNTIRSLSFVPGNDFEMSKHPGLLLILGKLILLHHKHPERKQAPLTYEKEEEQDQGVSCNKVEWWWDCLEMLRENTLVTLANISGQLDLSPYPESICLPVLDGLLHWAVCPSAEAQDPFSTLGPNAVLSPQRLVLETLSKLSIQDNNVDLILATPPFSRLEKLYSTMVRFLSDRKNPVCREMAVVLLANLAQGDSLAARAIAVQKGSIGNLLGFLEDSLAATQFQQSQASLLHMQNPPFEPTSVDMMRRAARALLALAKVDENHSEFTLYESRLLDISVSPLMNSLVSQVICDVLFLIGQS 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GEKITKVYELGNEPERKLWVDRYLTFMEERGSPVSSLPAVGKKPLDLFRLYVCVKEIGGLAQVNKNKKWRELATNLNVGTSSSAASSLKKQYIQYLFAFECKIERGEEPPPEVFSTG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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_atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 38.647 9.572 11.433 1 1 A THR 0.740 1 ATOM 221 C CB . THR 1031 1031 ? A 39.104 9.053 14.621 1 1 A THR 0.740 1 ATOM 222 O OG1 . THR 1031 1031 ? A 39.839 7.877 14.901 1 1 A THR 0.740 1 ATOM 223 C CG2 . THR 1031 1031 ? A 38.517 9.539 15.948 1 1 A THR 0.740 1 ATOM 224 N N . GLU 1032 1032 ? A 38.918 7.375 11.871 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 225 C CA . GLU 1032 1032 ? A 39.276 6.967 10.519 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 226 C C . GLU 1032 1032 ? A 38.191 7.231 9.486 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 227 O O . GLU 1032 1032 ? A 38.460 7.838 8.449 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 228 C CB . GLU 1032 1032 ? A 39.615 5.457 10.470 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 229 C CG . GLU 1032 1032 ? A 41.100 5.159 10.758 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 230 C CD . GLU 1032 1032 ? A 41.389 3.676 10.556 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 231 O OE1 . GLU 1032 1032 ? A 41.116 2.882 11.491 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 232 O OE2 . GLU 1032 1032 ? A 41.885 3.333 9.451 1 1 A GLU 0.680 1 ATOM 233 N N . GLU 1033 1033 ? A 36.925 6.854 9.785 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 234 C CA . GLU 1033 1033 ? A 35.754 7.051 8.940 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 235 C C . GLU 1033 1033 ? A 35.531 8.522 8.575 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 236 O O . GLU 1033 1033 ? A 35.211 8.861 7.439 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 237 C CB . GLU 1033 1033 ? A 34.472 6.475 9.623 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 238 C CG . GLU 1033 1033 ? A 33.141 6.964 8.978 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 239 C CD . GLU 1033 1033 ? A 31.839 6.410 9.556 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 240 O OE1 . GLU 1033 1033 ? A 31.693 6.417 10.801 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 241 O OE2 . GLU 1033 1033 ? A 30.921 6.143 8.737 1 1 A GLU 0.690 1 ATOM 242 N N . LYS 1034 1034 ? A 35.733 9.455 9.532 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 243 C CA . LYS 1034 1034 ? A 35.491 10.880 9.305 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 244 C C . LYS 1034 1034 ? A 36.701 11.660 8.823 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 245 O O . LYS 1034 1034 ? A 36.648 12.903 8.777 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 246 C CB . LYS 1034 1034 ? A 35.002 11.567 10.604 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 247 C CG . LYS 1034 1034 ? A 33.668 11.035 11.124 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 248 C CD . LYS 1034 1034 ? A 32.561 11.243 10.091 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 249 C CE . LYS 1034 1034 ? A 31.215 10.830 10.636 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 250 N NZ . LYS 1034 1034 ? A 30.233 11.046 9.566 1 1 A LYS 0.650 1 ATOM 251 N N . ALA 1035 1035 ? A 37.788 10.981 8.456 1 1 A ALA 0.570 1 ATOM 252 C CA . ALA 1035 1035 ? A 38.983 11.500 7.815 1 1 A ALA 0.570 1 ATOM 253 C C . ALA 1035 1035 ? A 40.051 12.024 8.783 1 1 A ALA 0.570 1 ATOM 254 O O . ALA 1035 1035 ? A 41.009 12.669 8.368 1 1 A ALA 0.570 1 ATOM 255 C CB . ALA 1035 1035 ? A 38.716 12.546 6.694 1 1 A ALA 0.570 1 ATOM 256 N N . MET 1036 1036 ? A 39.967 11.717 10.095 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 257 C CA . MET 1036 1036 ? A 40.847 12.299 11.094 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 258 C C . MET 1036 1036 ? A 41.358 11.211 12.007 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 259 O O . MET 1036 1036 ? A 41.193 11.264 13.220 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 260 C CB . MET 1036 1036 ? A 40.148 13.382 11.958 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 261 C CG . MET 1036 1036 ? A 39.707 14.619 11.153 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 262 S SD . MET 1036 1036 ? A 38.976 15.946 12.167 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 263 C CE . MET 1036 1036 ? A 40.490 16.433 13.050 1 1 A MET 0.570 1 ATOM 264 N N . GLY 1037 1037 ? A 41.992 10.170 11.424 1 1 A GLY 0.640 1 ATOM 265 C CA . GLY 1037 1037 ? A 42.617 9.072 12.162 1 1 A GLY 0.640 1 ATOM 266 C C . GLY 1037 1037 ? A 43.569 9.474 13.268 1 1 A GLY 0.640 1 ATOM 267 O O . GLY 1037 1037 ? A 44.403 10.365 13.110 1 1 A GLY 0.640 1 ATOM 268 N N . MET 1038 1038 ? A 43.511 8.782 14.416 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 269 C CA . MET 1038 1038 ? A 44.297 9.133 15.581 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 270 C C . MET 1038 1038 ? A 45.421 8.136 15.717 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 271 O O . MET 1038 1038 ? A 45.185 6.969 16.021 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 272 C CB . MET 1038 1038 ? A 43.442 9.087 16.877 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 273 C CG . MET 1038 1038 ? A 42.261 10.078 16.878 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 274 S SD . MET 1038 1038 ? A 42.732 11.829 16.755 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 275 C CE . MET 1038 1038 ? A 43.498 11.983 18.392 1 1 A MET 0.660 1 ATOM 276 N N . THR 1039 1039 ? A 46.677 8.555 15.480 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 277 C CA . THR 1039 1039 ? A 47.827 7.658 15.497 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 278 C C . THR 1039 1039 ? A 48.646 7.796 16.764 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 279 O O . THR 1039 1039 ? A 49.245 6.837 17.250 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 280 C CB . THR 1039 1039 ? A 48.760 7.939 14.327 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 281 O OG1 . THR 1039 1039 ? A 49.135 9.309 14.260 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 282 C CG2 . THR 1039 1039 ? A 48.013 7.643 13.022 1 1 A THR 0.660 1 ATOM 283 N N . ASN 1040 1040 ? A 48.633 8.999 17.369 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 284 C CA . ASN 1040 1040 ? A 49.363 9.326 18.573 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 285 C C . ASN 1040 1040 ? A 48.380 9.452 19.708 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 286 O O . ASN 1040 1040 ? A 47.259 9.934 19.533 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 287 C CB . ASN 1040 1040 ? A 50.132 10.669 18.458 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 288 C CG . ASN 1040 1040 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #