data_SMR-4e2c1fb5886b4437489be8fd5e11c205_1 _entry.id SMR-4e2c1fb5886b4437489be8fd5e11c205_1 _struct.entry_id SMR-4e2c1fb5886b4437489be8fd5e11c205_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P18583 (isoform 2)/ SON_HUMAN, Protein SON Estimated model accuracy of this model is 0.012, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P18583 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 271133.184 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SON_HUMAN P18583 1 ;MATNIEQIFRSFVVSKFREIQQELSSGRNEGQLNGETNTPIEGNQAGDAAASARSLPNEEIVQKIEEVLS GVLDTELRYKPDLKEGSRKSRCVSVQTDPTDEIPTKKSKKHKKHKNKKKKKKKEKEKKYKRQPEESESKT KSHDDGNIDLESDSFLKFDSEPSAVALELPTRAFGPSETNESPAVVLEPPVVSMEVSEPHILETLKPATK TAELSVVSTSVISEQSEQSVAVMPEPSMTKILDSFAAAPVPTTTLVLKSSEPVVTMSVEYQMKSVLKSVE STSPEPSKIMLVEPPVAKVLEPSETLVVSSETPTEVYPEPSTSTTMDFPESSAIEALRLPEQPVDVPSEI ADSSMTRPQELPELPKTTALELQESSVASAMELPGPPATSMPELQGPPVTPVLELPGPSATPVPELPGPL STPVPELPGPPATAVPELPGPSVTPVPQLSQELPGLPAPSMGLEPPQEVPEPPVMAQELPGLPLVTAAVE LPEQPAVTVAMELTEQPVTTTELEQPVGMTTVEHPGHPEVTTATGLLGQPEATMVLELPGQPVATTALEL PGQPSVTGVPELPGLPSATRALELSGQPVATGALELPGPLMAAGALEFSGQSGAAGALELLGQPLATGVL ELPGQPGAPELPGQPVATVALEISVQSVVTTSELSTMTVSQSLEVPSTTALESYNTQRSMMSSYERSMMS YERSMMSPMAERSMMSAYERSMMSAYERSMMSPMAERSMMSAYERSMMSAYERSMMSPMADRSMMSMGAD RSMMSSYSAADRSMMSSYSAADRSMMSSYTADRSMMSMAADSYTDSYTDTYTEAYMVPPLPPEEPPTMPP LPPEEPPMTPPLPPEEPPEGPALPTEQSALTAENTWPTEVPSSPSEESVSQPEPPVSQSEISEPSAVPTD YSVSASDPSVLVSEAAVTVPEPPPEPESSITLTPVESAVVAEEHEVVPERPVTCMVSETPAMSAEPTVLA SEPPVMSETAETFDSMRASGHVASEVSTSLLVPAVTTPVLAESILEPPAMAAPESSAMAVLESSAVTVLE SSTVTVLESSTVTVLEPSVVTVPEPPVVAEPDYVTIPVPVVSALEPSVPVLEPAVSVLQPSMIVSEPSVS VQESTVTVSEPAVTVSEQTQVIPTEVAIESTPMILESSIMSSHVMKGINLSSGDQNLAPEIGMQEIALHS GEEPHAEEHLKGDFYESEHGINIDLNINNHLIAKEMEHNTVCAAGTSPVGEIGEEKILPTSETKQRTVLD TYPGVSEADAGETLSSTGPFALEPDATGTSKGIEFTTASTLSLVNKYDVDLSLTTQDTEHDMVISTSPSG GSEADIEGPLPAKDIHLDLPSNNNLVSKDTEEPLPVKESDQTLAALLSPKESSGGEKEVPPPPKETLPDS GFSANIEDINEADLVRPLLPKDMERLTSLRAGIEGPLLASDVGRDRSAASPVVSSMPERASESSSEEKDD YEIFVKVKDTHEKSKKNKNRDKGEKEKKRDSSLRSRSKRSKSSEHKSRKRTSESRSRARKRSSKSKSHRS QTRSRSRSRRRRRSSRSRSKSRGRRSVSKEKRKRSPKHRSKSRERKRKRSSSRDNRKTVRARSRTPSRRS RSHTPSRRRRSRSVGRRRSFSISPSRRSRTPSRRSRTPSRRSRTPSRRSRTPSRRSRTPSRRSRTPSRRR RSRSVVRRRSFSISPVRLRRSRTPLRRRFSRSPIRRKRSRSSERGRSPKRLTDLDKAQLLEIAKANAAAM CAKAGVPLPPNLKPAPPPTIEEKVAKKSGGATIEELTEKCKQIAQSKEDDDVIVNKPHVSDEEEEEPPFY HHPFKLSEPKPIFFNLNIAAAKPTPPKSQVTLTKEFPVSSGSQHRKKEADSVYGEWVPVEKNGEENKDDD NVFSSNLPSEPVDISTAMSERALAQKRLSENAFDLEAMSMLNRAQERIDAWAQLNSIPGQFTGSTGVQVL TQEQLANTGAQAWIKKDQFLRAAPVTGGMGAVLMRKMGWREGEGLGKNKEGNKEPILVDFKTDRKGLVAV GERAQKRSGNFSAAMKDLSGKHPVSALMEICNKRRWQPPEFLLVHDSGPDHRKHFLFRVLINGSAYQPSF ASPNKKHAKATAATVVLQAMGLVPKDLMANATCFRSASRR ; 'Protein SON' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2140 1 2140 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . SON_HUMAN P18583 P18583-2 1 2140 9606 'Homo sapiens (Human)' 2010-05-18 ADE72D9D269A914D # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MATNIEQIFRSFVVSKFREIQQELSSGRNEGQLNGETNTPIEGNQAGDAAASARSLPNEEIVQKIEEVLS GVLDTELRYKPDLKEGSRKSRCVSVQTDPTDEIPTKKSKKHKKHKNKKKKKKKEKEKKYKRQPEESESKT KSHDDGNIDLESDSFLKFDSEPSAVALELPTRAFGPSETNESPAVVLEPPVVSMEVSEPHILETLKPATK TAELSVVSTSVISEQSEQSVAVMPEPSMTKILDSFAAAPVPTTTLVLKSSEPVVTMSVEYQMKSVLKSVE STSPEPSKIMLVEPPVAKVLEPSETLVVSSETPTEVYPEPSTSTTMDFPESSAIEALRLPEQPVDVPSEI ADSSMTRPQELPELPKTTALELQESSVASAMELPGPPATSMPELQGPPVTPVLELPGPSATPVPELPGPL STPVPELPGPPATAVPELPGPSVTPVPQLSQELPGLPAPSMGLEPPQEVPEPPVMAQELPGLPLVTAAVE LPEQPAVTVAMELTEQPVTTTELEQPVGMTTVEHPGHPEVTTATGLLGQPEATMVLELPGQPVATTALEL PGQPSVTGVPELPGLPSATRALELSGQPVATGALELPGPLMAAGALEFSGQSGAAGALELLGQPLATGVL 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A 1 2014 GLU 2014 ? ? ? A . A 1 2015 PRO 2015 ? ? ? A . A 1 2016 ILE 2016 ? ? ? A . A 1 2017 LEU 2017 ? ? ? A . A 1 2018 VAL 2018 ? ? ? A . A 1 2019 ASP 2019 ? ? ? A . A 1 2020 PHE 2020 ? ? ? A . A 1 2021 LYS 2021 ? ? ? A . A 1 2022 THR 2022 ? ? ? A . A 1 2023 ASP 2023 ? ? ? A . A 1 2024 ARG 2024 ? ? ? A . A 1 2025 LYS 2025 ? ? ? A . A 1 2026 GLY 2026 ? ? ? A . A 1 2027 LEU 2027 ? ? ? A . A 1 2028 VAL 2028 ? ? ? A . A 1 2029 ALA 2029 ? ? ? A . A 1 2030 VAL 2030 ? ? ? A . A 1 2031 GLY 2031 ? ? ? A . A 1 2032 GLU 2032 ? ? ? A . A 1 2033 ARG 2033 ? ? ? A . A 1 2034 ALA 2034 ? ? ? A . A 1 2035 GLN 2035 ? ? ? A . A 1 2036 LYS 2036 ? ? ? A . A 1 2037 ARG 2037 ? ? ? A . A 1 2038 SER 2038 ? ? ? A . A 1 2039 GLY 2039 ? ? ? A . A 1 2040 ASN 2040 ? ? ? A . A 1 2041 PHE 2041 ? ? ? A . A 1 2042 SER 2042 ? ? ? A . A 1 2043 ALA 2043 ? ? ? A . A 1 2044 ALA 2044 ? ? ? A . A 1 2045 MET 2045 ? ? ? A . A 1 2046 LYS 2046 ? ? ? A . A 1 2047 ASP 2047 ? ? ? A . A 1 2048 LEU 2048 ? ? ? A . 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A 1 2136 SER 2136 ? ? ? A . A 1 2137 ALA 2137 ? ? ? A . A 1 2138 SER 2138 ? ? ? A . A 1 2139 ARG 2139 ? ? ? A . A 1 2140 ARG 2140 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'RISC-loading complex subunit TARBP2 {PDB ID=3llh, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=3llh.2.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 3llh, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GPLGSHMLAANPGKTPISLLQEYGTRIGKTPVYDLLKAEGQAHQPNFTFRVTVGDTSCTGQGPSKKAAKH KAAEVALKHLKGGSMLEPAL ; ;GPLGSHMLAANPGKTPISLLQEYGTRIGKTPVYDLLKAEGQAHQPNFTFRVTVGDTSCTGQGPSKKAAKH KAAEVALKHLKGGSMLEPAL ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 10 83 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 3llh 2023-11-01 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2140 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2140 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 8.4e-06 31.081 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MATNIEQIFRSFVVSKFREIQQELSSGRNEGQLNGETNTPIEGNQAGDAAASARSLPNEEIVQKIEEVLSGVLDTELRYKPDLKEGSRKSRCVSVQTDPTDEIPTKKSKKHKKHKNKKKKKKKEKEKKYKRQPEESESKTKSHDDGNIDLESDSFLKFDSEPSAVALELPTRAFGPSETNESPAVVLEPPVVSMEVSEPHILETLKPATKTAELSVVSTSVISEQSEQSVAVMPEPSMTKILDSFAAAPVPTTTLVLKSSEPVVTMSVEYQMKSVLKSVESTSPEPSKIMLVEPPVAKVLEPSETLVVSSETPTEVYPEPSTSTTMDFPESSAIEALRLPEQPVDVPSEIADSSMTRPQELPELPKTTALELQESSVASAMELPGPPATSMPELQGPPVTPVLELPGPSATPVPELPGPLSTPVPELPGPPATAVPELPGPSVTPVPQLSQELPGLPAPSMGLEPPQEVPEPPVMAQELPGLPLVTAAVELPEQPAVTVAMELTEQPVTTTELEQPVGMTTVEHPGHPEVTTATGLLGQPEATMVLELPGQPVATTALELPGQPSVTGVPELPGLPSATRALELSGQPVATGALELPGPLMAAGALEFSGQSGAAGALELLGQPLATGVLELPGQPGAPELPGQPVATVALEISVQSVVTTSELSTMTVSQSLEVPSTTALESYNTQRSMMSSYERSMMSYERSMMSPMAERSMMSAYERSMMSAYERSMMSPMAERSMMSAYERSMMSAYERSMMSPMADRSMMSMGADRSMMSSYSAADRSMMSSYSAADRSMMSSYTADRSMMSMAADSYTDSYTDTYTEAYMVPPLPPEEPPTMPPLPPEEPPMTPPLPPEEPPEGPALPTEQSALTAENTWPTEVPSSPSEESVSQPEPPVSQSEISEPSAVPTDYSVSASDPSVLVSEAAVTVPEPPPEPESSITLTPVESAVVAEEHEVVPERPVTCMVSETPAMSAEPTVLASEPPVMSETAETFDSMRASGHVASEVSTSLLVPAVTTPVLAESILEPPAMAAPESSAMAVLESSAVTVLESSTVTVLESSTVTVLEPSVVTVPEPPVVAEPDYVTIPVPVVSALEPSVPVLEPAVSVLQPSMIVSEPSVSVQESTVTVSEPAVTVSEQTQVIPTEVAIESTPMILESSIMSSHVMKGINLSSGDQNLAPEIGMQEIALHSGEEPHAEEHLKGDFYESEHGINIDLNINNHLIAKEMEHNTVCAAGTSPVGEIGEEKILPTSETKQRTVLDTYPGVSEADAGETLSSTGPFALEPDATGTSKGIEFTTASTLSLVNKYDVDLSLTTQDTEHDMVISTSPSGGSEADIEGPLPAKDIHLDLPSNNNLVSKDTEEPLPVKESDQTLAALLSPKESSGGEKEVPPPPKETLPDSGFSANIEDINEADLVRPLLPKDMERLTSLRAGIEGPLLASDVGRDRSAASPVVSSMPERASESSSEEKDDYEIFVKVKDTHEKSKKNKNRDKGEKEKKRDSSLRSRSKRSKSSEHKSRKRTSESRSRARKRSSKSKSHRSQTRSRSRSRRRRRSSRSRSKSRGRRSVSKEKRKRSPKHRSKSRERKRKRSSSRDNRKTVRARSRTPSRRSRSHTPSRRRRSRSVGRRRSFSISPSRRSRTPSRRSRTPSRRSRTPSRRSRTPSRRSRTPSRRSRTPSRRRRSRSVVRRRSFSISPVRLRRSRTPLRRRFSRSPIRRKRSRSSERGRSPKRLTDLDKAQLLEIAKANAAAMCAKAGVPLPPNLKPAPPPTIEEKVAKKSGGATIEELTEKCKQIAQSKEDDDVIVNKPHVSDEEEEEPPFYHHPFKLSEPKPIFFNLNIAAAKPTPPKSQVTLTKEFPVSSGSQHRKKEADSVYGEWVPVEKNGEENKDDDNVFSSNLPSEPVDISTAMSERALAQKRLSENAFDLEAMSMLNRAQERIDAWAQLNSIPGQFTGSTGVQVLTQEQLANTGAQAWIKKDQFLRAAPVTGGMGAVLMRKMGWREGEGLGKNKEGNKEPILVDFKTDRKGLVAVGERAQKRSGNFSAAMKDLSGKHPVSALMEICNKRRWQPPEFLLVHDSGPDHRKHFLFRVLINGSAYQPSFASPNKKHAKATAATVVLQAMGLVPKDLMANATCFRSASRR 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ANPGKTPISLLQEYGTRIG-KTPVYDLLKAEGQAHQPNFTFRVTVGDTSC--TGQGPSKKAAKHKAAEVALKHLKGG----------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 3llh.2' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 2050 2050 ? A -28.436 21.678 26.332 1 1 A GLY 0.210 1 ATOM 2 C CA . GLY 2050 2050 ? A -29.481 22.732 26.633 1 1 A GLY 0.210 1 ATOM 3 C C . GLY 2050 2050 ? A -28.924 24.127 26.628 1 1 A GLY 0.210 1 ATOM 4 O O . GLY 2050 2050 ? A -28.941 24.791 27.655 1 1 A GLY 0.210 1 ATOM 5 N N . LYS 2051 2051 ? A -28.383 24.598 25.484 1 1 A LYS 0.340 1 ATOM 6 C CA . LYS 2051 2051 ? A -27.824 25.927 25.374 1 1 A LYS 0.340 1 ATOM 7 C C . LYS 2051 2051 ? A -28.746 26.793 24.554 1 1 A LYS 0.340 1 ATOM 8 O O . LYS 2051 2051 ? A -29.189 26.413 23.476 1 1 A LYS 0.340 1 ATOM 9 C CB . LYS 2051 2051 ? A -26.402 25.902 24.755 1 1 A LYS 0.340 1 ATOM 10 C CG . LYS 2051 2051 ? A -25.310 25.385 25.713 1 1 A LYS 0.340 1 ATOM 11 C CD . LYS 2051 2051 ? A -25.227 26.176 27.031 1 1 A LYS 0.340 1 ATOM 12 C CE . LYS 2051 2051 ? A -24.092 25.712 27.946 1 1 A LYS 0.340 1 ATOM 13 N NZ . LYS 2051 2051 ? A -24.196 26.416 29.240 1 1 A LYS 0.340 1 ATOM 14 N N . HIS 2052 2052 ? A -29.065 27.971 25.120 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 15 C CA . HIS 2052 2052 ? A -29.913 28.985 24.552 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 16 C C . HIS 2052 2052 ? A -29.096 29.871 23.633 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 17 O O . HIS 2052 2052 ? A -27.868 29.856 23.703 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 18 C CB . HIS 2052 2052 ? A -30.503 29.878 25.673 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 19 C CG . HIS 2052 2052 ? A -31.411 29.127 26.568 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 20 N ND1 . HIS 2052 2052 ? A -32.613 28.705 26.055 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 21 C CD2 . HIS 2052 2052 ? A -31.292 28.771 27.871 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 22 C CE1 . HIS 2052 2052 ? A -33.212 28.095 27.054 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 23 N NE2 . HIS 2052 2052 ? A -32.456 28.105 28.180 1 1 A HIS 0.490 1 ATOM 24 N N . PRO 2053 2053 ? A -29.690 30.691 22.788 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 25 C CA . PRO 2053 2053 ? A -28.959 31.590 21.902 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 26 C C . PRO 2053 2053 ? A -28.094 32.608 22.611 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 27 O O . PRO 2053 2053 ? A -27.011 32.925 22.129 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 28 C CB . PRO 2053 2053 ? A -30.067 32.285 21.124 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 29 C CG . PRO 2053 2053 ? A -31.183 31.244 21.086 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 30 C CD . PRO 2053 2053 ? A -31.116 30.652 22.475 1 1 A PRO 0.690 1 ATOM 31 N N . VAL 2054 2054 ? A -28.557 33.135 23.764 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 32 C CA . VAL 2054 2054 ? A -27.803 34.057 24.601 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 33 C C . VAL 2054 2054 ? A -26.537 33.430 25.135 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 34 O O . VAL 2054 2054 ? A -25.455 33.995 25.009 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 35 C CB . VAL 2054 2054 ? A -28.633 34.527 25.798 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 36 C CG1 . VAL 2054 2054 ? A -27.798 35.372 26.786 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 37 C CG2 . VAL 2054 2054 ? A -29.807 35.364 25.275 1 1 A VAL 0.710 1 ATOM 38 N N . SER 2055 2055 ? A -26.637 32.210 25.709 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 39 C CA . SER 2055 2055 ? A -25.500 31.483 26.235 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 40 C C . SER 2055 2055 ? A -24.568 31.046 25.133 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 41 O O . SER 2055 2055 ? A -23.365 31.247 25.249 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 42 C CB . SER 2055 2055 ? A -25.885 30.301 27.167 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 43 O OG . SER 2055 2055 ? A -26.850 29.412 26.602 1 1 A SER 0.630 1 ATOM 44 N N . ALA 2056 2056 ? A -25.097 30.544 23.993 1 1 A ALA 0.670 1 ATOM 45 C CA . ALA 2056 2056 ? A -24.283 30.175 22.856 1 1 A ALA 0.670 1 ATOM 46 C C . ALA 2056 2056 ? A -23.483 31.353 22.318 1 1 A ALA 0.670 1 ATOM 47 O O . ALA 2056 2056 ? A -22.268 31.282 22.159 1 1 A ALA 0.670 1 ATOM 48 C CB . ALA 2056 2056 ? A -25.207 29.639 21.738 1 1 A ALA 0.670 1 ATOM 49 N N . LEU 2057 2057 ? A -24.133 32.515 22.112 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 50 C CA . LEU 2057 2057 ? A -23.466 33.724 21.683 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 51 C C . LEU 2057 2057 ? A -22.458 34.274 22.675 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 52 O O . LEU 2057 2057 ? A -21.404 34.786 22.295 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 53 C CB . LEU 2057 2057 ? A -24.489 34.818 21.345 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 54 C CG . LEU 2057 2057 ? A -23.869 36.057 20.668 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 55 C CD1 . LEU 2057 2057 ? A -23.185 35.704 19.334 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 56 C CD2 . LEU 2057 2057 ? A -24.961 37.097 20.427 1 1 A LEU 0.690 1 ATOM 57 N N . MET 2058 2058 ? A -22.753 34.165 23.985 1 1 A MET 0.650 1 ATOM 58 C CA . MET 2058 2058 ? A -21.834 34.502 25.052 1 1 A MET 0.650 1 ATOM 59 C C . MET 2058 2058 ? A -20.555 33.695 25.015 1 1 A MET 0.650 1 ATOM 60 O O . MET 2058 2058 ? A -19.461 34.261 25.059 1 1 A MET 0.650 1 ATOM 61 C CB . MET 2058 2058 ? A -22.513 34.243 26.414 1 1 A MET 0.650 1 ATOM 62 C CG . MET 2058 2058 ? A -21.650 34.581 27.643 1 1 A MET 0.650 1 ATOM 63 S SD . MET 2058 2058 ? A -22.450 34.173 29.224 1 1 A MET 0.650 1 ATOM 64 C CE . MET 2058 2058 ? A -22.297 32.360 29.099 1 1 A MET 0.650 1 ATOM 65 N N . GLU 2059 2059 ? A -20.675 32.356 24.871 1 1 A GLU 0.640 1 ATOM 66 C CA . GLU 2059 2059 ? A -19.561 31.452 24.698 1 1 A GLU 0.640 1 ATOM 67 C C . GLU 2059 2059 ? A -18.802 31.738 23.418 1 1 A GLU 0.640 1 ATOM 68 O O . GLU 2059 2059 ? A -17.579 31.812 23.423 1 1 A GLU 0.640 1 ATOM 69 C CB . GLU 2059 2059 ? A -20.053 29.979 24.679 1 1 A GLU 0.640 1 ATOM 70 C CG . GLU 2059 2059 ? A -20.696 29.525 26.018 1 1 A GLU 0.640 1 ATOM 71 C CD . GLU 2059 2059 ? A -21.374 28.157 25.956 1 1 A GLU 0.640 1 ATOM 72 O OE1 . GLU 2059 2059 ? A -20.740 27.214 25.418 1 1 A GLU 0.640 1 ATOM 73 O OE2 . GLU 2059 2059 ? A -22.504 28.029 26.513 1 1 A GLU 0.640 1 ATOM 74 N N . ILE 2060 2060 ? A -19.500 31.950 22.284 1 1 A ILE 0.620 1 ATOM 75 C CA . ILE 2060 2060 ? A -18.874 32.270 21.007 1 1 A ILE 0.620 1 ATOM 76 C C . ILE 2060 2060 ? A -18.091 33.563 20.984 1 1 A ILE 0.620 1 ATOM 77 O O . ILE 2060 2060 ? A -16.935 33.585 20.563 1 1 A ILE 0.620 1 ATOM 78 C CB . ILE 2060 2060 ? A -19.939 32.325 19.907 1 1 A ILE 0.620 1 ATOM 79 C CG1 . ILE 2060 2060 ? A -20.468 30.899 19.600 1 1 A ILE 0.620 1 ATOM 80 C CG2 . ILE 2060 2060 ? 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A -15.360 35.561 27.037 1 1 A ASN 0.540 1 ATOM 94 O OD1 . ASN 2062 2062 ? A -15.080 36.710 27.364 1 1 A ASN 0.540 1 ATOM 95 N ND2 . ASN 2062 2062 ? A -14.769 34.498 27.630 1 1 A ASN 0.540 1 ATOM 96 N N . LYS 2063 2063 ? A -14.811 33.939 23.381 1 1 A LYS 0.550 1 ATOM 97 C CA . LYS 2063 2063 ? A -13.683 33.233 22.802 1 1 A LYS 0.550 1 ATOM 98 C C . LYS 2063 2063 ? A -12.880 34.034 21.789 1 1 A LYS 0.550 1 ATOM 99 O O . LYS 2063 2063 ? A -11.667 33.882 21.690 1 1 A LYS 0.550 1 ATOM 100 C CB . LYS 2063 2063 ? A -14.135 31.928 22.123 1 1 A LYS 0.550 1 ATOM 101 C CG . LYS 2063 2063 ? A -14.601 30.884 23.140 1 1 A LYS 0.550 1 ATOM 102 C CD . LYS 2063 2063 ? A -15.128 29.619 22.450 1 1 A LYS 0.550 1 ATOM 103 C CE . LYS 2063 2063 ? A -15.686 28.600 23.447 1 1 A LYS 0.550 1 ATOM 104 N NZ . LYS 2063 2063 ? A -16.174 27.393 22.745 1 1 A LYS 0.550 1 ATOM 105 N N . ARG 2064 2064 ? A -13.543 34.891 20.993 1 1 A ARG 0.470 1 ATOM 106 C CA . ARG 2064 2064 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.560 2 1 3 0.012 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 2050 GLY 1 0.210 2 1 A 2051 LYS 1 0.340 3 1 A 2052 HIS 1 0.490 4 1 A 2053 PRO 1 0.690 5 1 A 2054 VAL 1 0.710 6 1 A 2055 SER 1 0.630 7 1 A 2056 ALA 1 0.670 8 1 A 2057 LEU 1 0.690 9 1 A 2058 MET 1 0.650 10 1 A 2059 GLU 1 0.640 11 1 A 2060 ILE 1 0.620 12 1 A 2061 CYS 1 0.640 13 1 A 2062 ASN 1 0.540 14 1 A 2063 LYS 1 0.550 15 1 A 2064 ARG 1 0.470 16 1 A 2065 ARG 1 0.380 17 1 A 2066 TRP 1 0.210 18 1 A 2067 GLN 1 0.370 19 1 A 2068 PRO 1 0.580 20 1 A 2069 PRO 1 0.620 21 1 A 2070 GLU 1 0.620 22 1 A 2071 PHE 1 0.630 23 1 A 2072 LEU 1 0.620 24 1 A 2073 LEU 1 0.610 25 1 A 2074 VAL 1 0.620 26 1 A 2075 HIS 1 0.540 27 1 A 2076 ASP 1 0.580 28 1 A 2077 SER 1 0.550 29 1 A 2078 GLY 1 0.470 30 1 A 2079 PRO 1 0.360 31 1 A 2080 ASP 1 0.330 32 1 A 2081 HIS 1 0.310 33 1 A 2082 ARG 1 0.370 34 1 A 2083 LYS 1 0.490 35 1 A 2084 HIS 1 0.540 36 1 A 2085 PHE 1 0.600 37 1 A 2086 LEU 1 0.660 38 1 A 2087 PHE 1 0.640 39 1 A 2088 ARG 1 0.610 40 1 A 2089 VAL 1 0.690 41 1 A 2090 LEU 1 0.590 42 1 A 2091 ILE 1 0.580 43 1 A 2092 ASN 1 0.480 44 1 A 2093 GLY 1 0.460 45 1 A 2094 SER 1 0.470 46 1 A 2095 ALA 1 0.360 47 1 A 2096 TYR 1 0.280 48 1 A 2097 GLN 1 0.330 49 1 A 2098 PRO 1 0.580 50 1 A 2099 SER 1 0.670 51 1 A 2100 PHE 1 0.630 52 1 A 2101 ALA 1 0.690 53 1 A 2102 SER 1 0.660 54 1 A 2103 PRO 1 0.570 55 1 A 2104 ASN 1 0.590 56 1 A 2105 LYS 1 0.650 57 1 A 2106 LYS 1 0.650 58 1 A 2107 HIS 1 0.610 59 1 A 2108 ALA 1 0.720 60 1 A 2109 LYS 1 0.690 61 1 A 2110 ALA 1 0.720 62 1 A 2111 THR 1 0.700 63 1 A 2112 ALA 1 0.750 64 1 A 2113 ALA 1 0.750 65 1 A 2114 THR 1 0.710 66 1 A 2115 VAL 1 0.720 67 1 A 2116 VAL 1 0.710 68 1 A 2117 LEU 1 0.620 69 1 A 2118 GLN 1 0.530 70 1 A 2119 ALA 1 0.530 71 1 A 2120 MET 1 0.430 72 1 A 2121 GLY 1 0.350 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #