data_SMR-bc20fedd334898de477310a250503c84_4 _entry.id SMR-bc20fedd334898de477310a250503c84_4 _struct.entry_id SMR-bc20fedd334898de477310a250503c84_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q99PP2/ ZN318_MOUSE, Zinc finger protein 318 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q99PP2' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 286967.881 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ZN318_MOUSE Q99PP2 1 ;MYRSGSRSSVSSHRSKDGSASGPPPGRPVGASSGPTRRPSSPPPPSCSSLRLPARRHRSPSGHRGRWASP SPPRGRRGSPSPPRGRRASPSPTRGRRASPSPPRGRRGSPSPPRARRGSPSPPRSRRHYPPGLGGFRGSI RGESRADFARDGRGDHPGGGGGSRRRSPGLCSDSSLEESLRITVGNDHFCVSTPERRRLSDRLGSPVDGL QDMDRDDLTDDSVFTRSSQCSRGLERYISREEGPLSPFLGQLDEDYRTRETFLHRPEFSPQSSCHDELLR GTERNRDKLKSSSYSIRSEERSREAKRPRYDDTEKVHSSGGDHSSFTSGTRNYRQRRSSPSPRFLDPEFR ELDLARRKREEEEEQSRSLSQELVGVGDDQIGCSIPGLAGVLTTSEPGYSLQRPEEVPMMPKKSILKKRI EADMKPSLQLESFSSGASSGEDHPLYSEHSPLPLSGAIAAFTSEIENKGTTVEADLKEPQSNLYQWGPLR EIPKDNSEKFDSFLGFKEKLDLKAEGLEQQTDFLLPHERASQDGSGFSRILSMLADPTITQEKRRRSFPD IEDEEKFLYGDEEEDIKSESPLKSLEDPESAGTRQKANSLPSTPAVKLESLEESNPEYAKIHNLLKTIGL DIGVAEIGKLAARTQERLHGKKPSSRPSADRRLSADRHLSGDRHFSADRCSSVEHSFTADWRSSDPHRPE SRETHHSNTQSPEVSHPHPASPVDPYLRTKNSPPFLKSDHPVCHVSGPEVVGSGFQSSVAVRCMLPSAPS TPIRLPHSAALSQFHIPGASQFAAARIPPNYQGSVIPSASFDAYRHYMAYAASRWPMYPASQPPSHPLSD PHRLLPVTKQAARSRPNLRVIPTVTPAKPKQEIPVLGSISVKRIPVRVSIPSLIKYNPKKISDEKNRASQ KQKVIEEREKLKTEQEARQKKMFYLTTELERLHKQQGEMLRKKRREKDGHKDPLLMEVSRLQDSIMKDIA ELHKETEEAEKKQSELDKVAQILGIDIFDKSLKSSNDSKESTEKPEKEKSKSPEKELSPSNSSSSNKESK MNEKSCIKSPSSTESLQPTVKQSDQPVAAYEYYDAGSHWCKDCNTTCGTMFDFFTHMHNKKHTQTLDPYN RPWASKTQSEAKQDTVKRTDKITVPAKGSEFLIPVTGFYCQLCEEFLGDPISGEQHVKGHQHNENYKKYV EENPLYEERRNLDRQAGLAVVLETERRRQNELKRKLNEKPKEEKIEKKARIVREVKEDDKAPGELEEQLS EDGSAPEKGEVKGNASLRPQVKEEVKKEPSVASIAASFGKFSWKKPEKEEEKGSVVTPGAPKEDTVETSK DRDDGKAEVGKAKPIKIKLSGKTVIAHTSPWTPVVTTSTQTKIRPNLPIPSTVLRKSGSATVSKPAPLNT FLSIKSSGTSTKPLPVVKESSSDLLLPPDIISKAFGGEEVVLKGSPEEKVELAEKNEPSQVPEQMLALLP PPPPPPPPPPPPPPPPPPQAVPQLSAPSPAQANVVLTPVKSNSVISQTFSLGFQGPNILNPGLPVAFMAS EQPTVIPSDETAPGVSESDWDQTLISMLVRPPPPLSSVFSEQAKKLEKRNSCLATANAKDLYDIFYSSGG KGAHETKLSSSTLANGESSSLPRTESSDFSSTCTLNSSMSSEDLPQCSALVTATEISNLENPISKGMEST GKWSVVDQIDPKSRDSTYSFLQPLTRLYQNKPYEIVSPKTDTLVMWTSGSSQNDTHKDRPPEGKIRFDLG EPGPPGTDSTSHLSDTHCQTNGPQKLIEINLIDNQNKNQEVYQSEGCRESEMKRKTELKGKVATEEEEEE EEEGANSIEDSNSNHGNRNTWEGEIGQPKLSTVDKKGEQSSKLMTGHENTSKVVIELSPSLPSKRTKIDL FPSLLQNPKSMPELLLLSPAGSGLCLKRQEIWERPEKPGLEDVELQGTRPELTVTIESKVLENFDTTHLE VEGFASLRNLGDMHANFHNSQTEQTRRSPTALSEKMSEEISVSSVMCNPSSSSDIEPVPSFSGFPLESPK TLVLNFETEGAHSSSNSRNGRITSNSLETGHPVENVGHDLGGERTHQALDLLAGGMLSEDVKETSPLQKD LLRMESTTVSPSGLGPSPCLPDLVDFVTRTPGVPKQKPCSPLSEPDAFLKCSSLEMGSPPPEILSVSVSE VAVPQVSEDNDSALNLVKTPPSGSPSRDQVVGGNVSPREMPEQEAAVDVIPDHTRSNVYNSQDYLNG ; 'Zinc finger protein 318' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2237 1 2237 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ZN318_MOUSE Q99PP2 . 1 2237 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2018-01-31 97B600577866BA14 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MYRSGSRSSVSSHRSKDGSASGPPPGRPVGASSGPTRRPSSPPPPSCSSLRLPARRHRSPSGHRGRWASP SPPRGRRGSPSPPRGRRASPSPTRGRRASPSPPRGRRGSPSPPRARRGSPSPPRSRRHYPPGLGGFRGSI RGESRADFARDGRGDHPGGGGGSRRRSPGLCSDSSLEESLRITVGNDHFCVSTPERRRLSDRLGSPVDGL QDMDRDDLTDDSVFTRSSQCSRGLERYISREEGPLSPFLGQLDEDYRTRETFLHRPEFSPQSSCHDELLR GTERNRDKLKSSSYSIRSEERSREAKRPRYDDTEKVHSSGGDHSSFTSGTRNYRQRRSSPSPRFLDPEFR ELDLARRKREEEEEQSRSLSQELVGVGDDQIGCSIPGLAGVLTTSEPGYSLQRPEEVPMMPKKSILKKRI EADMKPSLQLESFSSGASSGEDHPLYSEHSPLPLSGAIAAFTSEIENKGTTVEADLKEPQSNLYQWGPLR EIPKDNSEKFDSFLGFKEKLDLKAEGLEQQTDFLLPHERASQDGSGFSRILSMLADPTITQEKRRRSFPD IEDEEKFLYGDEEEDIKSESPLKSLEDPESAGTRQKANSLPSTPAVKLESLEESNPEYAKIHNLLKTIGL 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_entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 TYR . 1 3 ARG . 1 4 SER . 1 5 GLY . 1 6 SER . 1 7 ARG . 1 8 SER . 1 9 SER . 1 10 VAL . 1 11 SER . 1 12 SER . 1 13 HIS . 1 14 ARG . 1 15 SER . 1 16 LYS . 1 17 ASP . 1 18 GLY . 1 19 SER . 1 20 ALA . 1 21 SER . 1 22 GLY . 1 23 PRO . 1 24 PRO . 1 25 PRO . 1 26 GLY . 1 27 ARG . 1 28 PRO . 1 29 VAL . 1 30 GLY . 1 31 ALA . 1 32 SER . 1 33 SER . 1 34 GLY . 1 35 PRO . 1 36 THR . 1 37 ARG . 1 38 ARG . 1 39 PRO . 1 40 SER . 1 41 SER . 1 42 PRO . 1 43 PRO . 1 44 PRO . 1 45 PRO . 1 46 SER . 1 47 CYS . 1 48 SER . 1 49 SER . 1 50 LEU . 1 51 ARG . 1 52 LEU . 1 53 PRO . 1 54 ALA . 1 55 ARG . 1 56 ARG . 1 57 HIS . 1 58 ARG . 1 59 SER . 1 60 PRO . 1 61 SER . 1 62 GLY . 1 63 HIS . 1 64 ARG . 1 65 GLY . 1 66 ARG . 1 67 TRP . 1 68 ALA . 1 69 SER . 1 70 PRO . 1 71 SER . 1 72 PRO . 1 73 PRO . 1 74 ARG . 1 75 GLY . 1 76 ARG . 1 77 ARG . 1 78 GLY . 1 79 SER . 1 80 PRO . 1 81 SER . 1 82 PRO . 1 83 PRO . 1 84 ARG . 1 85 GLY . 1 86 ARG . 1 87 ARG . 1 88 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A 1 2205 VAL 2205 ? ? ? A . A 1 2206 SER 2206 ? ? ? A . A 1 2207 PRO 2207 ? ? ? A . A 1 2208 ARG 2208 ? ? ? A . A 1 2209 GLU 2209 ? ? ? A . A 1 2210 MET 2210 ? ? ? A . A 1 2211 PRO 2211 ? ? ? A . A 1 2212 GLU 2212 ? ? ? A . A 1 2213 GLN 2213 ? ? ? A . A 1 2214 GLU 2214 ? ? ? A . A 1 2215 ALA 2215 ? ? ? A . A 1 2216 ALA 2216 ? ? ? A . A 1 2217 VAL 2217 ? ? ? A . A 1 2218 ASP 2218 ? ? ? A . A 1 2219 VAL 2219 ? ? ? A . A 1 2220 ILE 2220 ? ? ? A . A 1 2221 PRO 2221 ? ? ? A . A 1 2222 ASP 2222 ? ? ? A . A 1 2223 HIS 2223 ? ? ? A . A 1 2224 THR 2224 ? ? ? A . A 1 2225 ARG 2225 ? ? ? A . A 1 2226 SER 2226 ? ? ? A . A 1 2227 ASN 2227 ? ? ? A . A 1 2228 VAL 2228 ? ? ? A . A 1 2229 TYR 2229 ? ? ? A . A 1 2230 ASN 2230 ? ? ? A . A 1 2231 SER 2231 ? ? ? A . A 1 2232 GLN 2232 ? ? ? A . A 1 2233 ASP 2233 ? ? ? A . A 1 2234 TYR 2234 ? ? ? A . A 1 2235 LEU 2235 ? ? ? A . A 1 2236 ASN 2236 ? ? ? A . A 1 2237 GLY 2237 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tektin-4 {PDB ID=8to0, label_asym_id=TB, auth_asym_id=Ah, SMTL ID=8to0.72.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8to0, label_asym_id=TB' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A TB 9 1 Ah # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MAQTGVLLTKEPAPQSIDVCELPRKEYEVACNTGAYTSSGLATAGFRTAKYLRDEWFQNSYARYHQAFAD RDYSERQRHESGQLVAETGALAQRTQLDSTRKVGERLEDMHCWKSELQREIDELSSETDLMMAQKLRLQR ALDATSVPYSIATDNLQCRERRQHPDLVRDYVEVELLKETELIRNIQELLKRTIGQAVDQIRLNREHKES CEMNWSDKVEVYNIDDTCSRYTNESTQVQFYPHSSKFEESASTPETWAKFNHDNLLRAERERLASVNLRK LIDCILRDTAEDLRLQCDAVNSAFSSRCQELDDSLQKLQYHLRKTLTEITDQEHQIAALKQAIKDKEAPL RVAQTRLYQRSHRPNVELCRDNAQFRLLSEVEELNMSLRALKEKLQDAEQALRNLEDSRMSLEKDIAVKT NSLFIDRQKCMTHRNRYPSVLQLAGYQ ; ;MAQTGVLLTKEPAPQSIDVCELPRKEYEVACNTGAYTSSGLATAGFRTAKYLRDEWFQNSYARYHQAFAD RDYSERQRHESGQLVAETGALAQRTQLDSTRKVGERLEDMHCWKSELQREIDELSSETDLMMAQKLRLQR ALDATSVPYSIATDNLQCRERRQHPDLVRDYVEVELLKETELIRNIQELLKRTIGQAVDQIRLNREHKES CEMNWSDKVEVYNIDDTCSRYTNESTQVQFYPHSSKFEESASTPETWAKFNHDNLLRAERERLASVNLRK LIDCILRDTAEDLRLQCDAVNSAFSSRCQELDDSLQKLQYHLRKTLTEITDQEHQIAALKQAIKDKEAPL RVAQTRLYQRSHRPNVELCRDNAQFRLLSEVEELNMSLRALKEKLQDAEQALRNLEDSRMSLEKDIAVKT NSLFIDRQKCMTHRNRYPSVLQLAGYQ ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 317 418 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8to0 2023-11-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2237 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2253 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 170.000 20.930 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MYRSGSRSSVSSHRSKDGSASGPPPGRPVGASSGPTRRPSSPPPPSCSSLRLPARRHRSPSGHRGRWASPSPPRGRRGSPSPPRGRRASPSPTRGRRASPSPPRGRRGSPSPPRARRGSPSPPRSRRHYPPGLGGFRGSIRGESRADFARDGRGDHPGGGGGSRRRSPGLCSDSSLEESLRITVGNDHFCVSTPERRRLSDRLGSPVDGLQDMDRDDLTDDSVFTRSSQCSRGLERYISREEGPLSPFLGQLDEDYRTRETFLHRPEFSPQSSCHDELLRGTERNRDKLKSSSYSIRSEERSREAKRPRYDDTEKVHSSGGDHSSFTSGTRNYRQRRSSPSPRFLDPEFRELDLARRKREEEEEQSRSLSQELVGVGDDQIGCSIPGLAGVLTTSEPGYSLQRPEEVPMMPKKSILKKRIEADMKPSLQLESFSSGASSGEDHPLYSEHSPLPLSGAIAAFTSEIENKGTTVEADLKEPQSNLYQWGPLREIPKDNSEKFDSFLGFKEKLDLKAEGLEQQTDFLLPHERASQDGSGFSRILSMLADPTITQEKRRRSFPDIEDEEKFLYGDEEEDIKSESPLKSLEDPESAGTRQKANSLPSTPAVKLESLEESNPEYAKIHNLLKTIGLDIGVAEIGKLAARTQERLHGKKPSSRPSADRRLSADRHLSGDRHFSADRCSSVEHSFTADWRSSDPHRPESRETHHSNTQSPEVSHPHPASPVDPYLRTKNSPPFLKSDHPVCHVSGPEVVGSGFQSSVAVRCMLPSAPSTPIRLPHSAALSQFHIPGASQFAAARIPPNYQGSVIPSASFDAYRHYMAYAASRWPMYPASQPPSHPLSDPHRLLPVTKQAARSRPNLRVIPTVTPAKPKQEIPVLGSISVKRIPVRVSIPSLIKYNPKKISDEKNRASQKQKVIEEREKLKTEQEARQKKMFYLTTELERLHKQQGEM------------LRKKRREKDGHKDP----LLMEVSRLQDSIMKDIAELHKETEEAEKKQSELDKVAQILGIDIFDKSLKSSNDSKESTEKPEKEKSKSPEKELSPSNSSSSNKESKMNEKSCIKSPSSTESLQPTVKQSDQPVAAYEYYDAGSHWCKDCNTTCGTMFDFFTHMHNKKHTQTLDPYNRPWASKTQSEAKQDTVKRTDKITVPAKGSEFLIPVTGFYCQLCEEFLGDPISGEQHVKGHQHNENYKKYVEENPLYEERRNLDRQAGLAVVLETERRRQNELKRKLNEKPKEEKIEKKARIVREVKEDDKAPGELEEQLSEDGSAPEKGEVKGNASLRPQVKEEVKKEPSVASIAASFGKFSWKKPEKEEEKGSVVTPGAPKEDTVETSKDRDDGKAEVGKAKPIKIKLSGKTVIAHTSPWTPVVTTSTQTKIRPNLPIPSTVLRKSGSATVSKPAPLNTFLSIKSSGTSTKPLPVVKESSSDLLLPPDIISKAFGGEEVVLKGSPEEKVELAEKNEPSQVPEQMLALLPPPPPPPPPPPPPPPPPPPQAVPQLSAPSPAQANVVLTPVKSNSVISQTFSLGFQGPNILNPGLPVAFMASEQPTVIPSDETAPGVSESDWDQTLISMLVRPPPPLSSVFSEQAKKLEKRNSCLATANAKDLYDIFYSSGGKGAHETKLSSSTLANGESSSLPRTESSDFSSTCTLNSSMSSEDLPQCSALVTATEISNLENPISKGMESTGKWSVVDQIDPKSRDSTYSFLQPLTRLYQNKPYEIVSPKTDTLVMWTSGSSQNDTHKDRPPEGKIRFDLGEPGPPGTDSTSHLSDTHCQTNGPQKLIEINLIDNQNKNQEVYQSEGCRESEMKRKTELKGKVATEEEEEEEEEGANSIEDSNSNHGNRNTWEGEIGQPKLSTVDKKGEQSSKLMTGHENTSKVVIELSPSLPSKRTKIDLFPSLLQNPKSMPELLLLSPAGSGLCLKRQEIWERPEKPGLEDVELQGTRPELTVTIESKVLENFDTTHLEVEGFASLRNLGDMHANFHNSQTEQTRRSPTALSEKMSEEISVSSVMCNPSSSSDIEPVPSFSGFPLESPKTLVLNFETEGAHSSSNSRNGRITSNSLETGHPVENVGHDLGGERTHQALDLLAGGMLSEDVKETSPLQKDLLRMESTTVSPSGLGPSPCLPDLVDFVTRTPGVPKQKPCSPLSEPDAFLKCSSLEMGSPPPEILSVSVSEVAVPQVSEDNDSALNLVKTPPSGSPSRDQVVGGNVSPREMPEQEAAVDVIPDHTRSNVYNSQDYLNG 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KLQYHLRKTLTEITDQEHQIAALKQAIKDKEAPLRVAQTRLYQRSHRPNVELCRDNAQFRLLSEVEEL----NMSLRALKEKLQDAEQALRNLEDSRMSLEKDIAV---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8to0.72' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . LYS 920 920 ? A 275.277 367.086 224.022 1 1 A LYS 0.410 1 ATOM 2 C CA . LYS 920 920 ? A 275.646 368.004 222.880 1 1 A LYS 0.410 1 ATOM 3 C C . LYS 920 920 ? A 276.621 367.380 221.891 1 1 A LYS 0.410 1 ATOM 4 O O . LYS 920 920 ? A 276.268 367.207 220.729 1 1 A LYS 0.410 1 ATOM 5 C CB . LYS 920 920 ? A 276.170 369.360 223.435 1 1 A LYS 0.410 1 ATOM 6 C CG . LYS 920 920 ? A 276.445 370.419 222.347 1 1 A LYS 0.410 1 ATOM 7 C CD . LYS 920 920 ? A 276.881 371.767 222.949 1 1 A LYS 0.410 1 ATOM 8 C CE . LYS 920 920 ? A 277.194 372.812 221.868 1 1 A LYS 0.410 1 ATOM 9 N NZ . LYS 920 920 ? A 277.610 374.086 222.494 1 1 A LYS 0.410 1 ATOM 10 N N . LEU 921 921 ? A 277.834 366.965 222.331 1 1 A LEU 0.430 1 ATOM 11 C CA . LEU 921 921 ? A 278.880 366.375 221.507 1 1 A LEU 0.430 1 ATOM 12 C C . LEU 921 921 ? A 278.490 365.090 220.780 1 1 A LEU 0.430 1 ATOM 13 O O . LEU 921 921 ? A 278.898 364.849 219.647 1 1 A LEU 0.430 1 ATOM 14 C CB . LEU 921 921 ? A 280.129 366.111 222.384 1 1 A LEU 0.430 1 ATOM 15 C CG . LEU 921 921 ? A 280.795 367.369 222.984 1 1 A LEU 0.430 1 ATOM 16 C CD1 . LEU 921 921 ? A 281.951 366.940 223.906 1 1 A LEU 0.430 1 ATOM 17 C CD2 . LEU 921 921 ? A 281.334 368.294 221.879 1 1 A LEU 0.430 1 ATOM 18 N N . LYS 922 922 ? A 277.669 364.216 221.392 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 19 C CA . LYS 922 922 ? A 277.194 363.000 220.741 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 20 C C . LYS 922 922 ? A 276.306 363.255 219.530 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 21 O O . LYS 922 922 ? A 276.546 362.701 218.456 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 22 C CB . LYS 922 922 ? A 276.488 362.078 221.757 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 23 C CG . LYS 922 922 ? A 277.480 361.564 222.809 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 24 C CD . LYS 922 922 ? A 276.807 360.603 223.795 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 25 C CE . LYS 922 922 ? A 277.783 360.044 224.836 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 26 N NZ . LYS 922 922 ? A 277.059 359.173 225.788 1 1 A LYS 0.630 1 ATOM 27 N N . THR 923 923 ? A 275.329 364.176 219.648 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 28 C CA . THR 923 923 ? A 274.491 364.690 218.563 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 29 C C . THR 923 923 ? A 275.332 365.359 217.485 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 30 O O . THR 923 923 ? A 275.106 365.216 216.279 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 31 C CB . THR 923 923 ? A 273.497 365.751 219.049 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 32 O OG1 . THR 923 923 ? A 272.732 365.325 220.171 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 33 C CG2 . THR 923 923 ? A 272.517 366.140 217.929 1 1 A THR 0.650 1 ATOM 34 N N . GLU 924 924 ? A 276.368 366.118 217.898 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 35 C CA . GLU 924 924 ? A 277.346 366.727 217.018 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 36 C C . GLU 924 924 ? A 278.127 365.699 216.202 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 37 O O . GLU 924 924 ? A 278.332 365.858 214.994 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 38 C CB . GLU 924 924 ? A 278.332 367.608 217.825 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 39 C CG . GLU 924 924 ? A 279.308 368.373 216.899 1 1 A GLU 0.630 1 ATOM 40 C CD . GLU 924 924 ? 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A 291.207 374.406 155.235 1 1 A HIS 0.270 1 ATOM 353 C CB . HIS 960 960 ? A 289.124 372.369 153.500 1 1 A HIS 0.270 1 ATOM 354 C CG . HIS 960 960 ? A 288.440 373.666 153.227 1 1 A HIS 0.270 1 ATOM 355 N ND1 . HIS 960 960 ? A 288.645 374.278 152.016 1 1 A HIS 0.270 1 ATOM 356 C CD2 . HIS 960 960 ? A 287.627 374.428 154.015 1 1 A HIS 0.270 1 ATOM 357 C CE1 . HIS 960 960 ? A 287.957 375.401 152.072 1 1 A HIS 0.270 1 ATOM 358 N NE2 . HIS 960 960 ? A 287.328 375.536 153.259 1 1 A HIS 0.270 1 ATOM 359 N N . LYS 961 961 ? A 290.230 372.719 156.311 1 1 A LYS 0.280 1 ATOM 360 C CA . LYS 961 961 ? A 290.151 373.362 157.603 1 1 A LYS 0.280 1 ATOM 361 C C . LYS 961 961 ? A 290.276 372.452 158.757 1 1 A LYS 0.280 1 ATOM 362 O O . LYS 961 961 ? A 289.685 371.312 158.688 1 1 A LYS 0.280 1 ATOM 363 C CB . LYS 961 961 ? A 288.728 373.971 157.786 1 1 A LYS 0.280 1 ATOM 364 C CG . LYS 961 961 ? A 287.536 372.969 157.690 1 1 A LYS 0.280 1 ATOM 365 C CD . LYS 961 961 ? 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A 286.301 361.855 230.222 1 1 A ASP 0.240 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.522 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 920 LYS 1 0.410 2 1 A 921 LEU 1 0.430 3 1 A 922 LYS 1 0.630 4 1 A 923 THR 1 0.650 5 1 A 924 GLU 1 0.630 6 1 A 925 GLN 1 0.680 7 1 A 926 GLU 1 0.690 8 1 A 927 ALA 1 0.750 9 1 A 928 ARG 1 0.660 10 1 A 929 GLN 1 0.670 11 1 A 930 LYS 1 0.690 12 1 A 931 LYS 1 0.700 13 1 A 932 MET 1 0.640 14 1 A 933 PHE 1 0.610 15 1 A 934 TYR 1 0.650 16 1 A 935 LEU 1 0.690 17 1 A 936 THR 1 0.720 18 1 A 937 THR 1 0.740 19 1 A 938 GLU 1 0.680 20 1 A 939 LEU 1 0.700 21 1 A 940 GLU 1 0.670 22 1 A 941 ARG 1 0.690 23 1 A 942 LEU 1 0.640 24 1 A 943 HIS 1 0.610 25 1 A 944 LYS 1 0.640 26 1 A 945 GLN 1 0.540 27 1 A 946 GLN 1 0.510 28 1 A 947 GLY 1 0.480 29 1 A 948 GLU 1 0.470 30 1 A 949 MET 1 0.400 31 1 A 950 LEU 1 0.260 32 1 A 951 ARG 1 0.270 33 1 A 952 LYS 1 0.300 34 1 A 953 LYS 1 0.250 35 1 A 954 ARG 1 0.270 36 1 A 955 ARG 1 0.260 37 1 A 956 GLU 1 0.260 38 1 A 957 LYS 1 0.290 39 1 A 958 ASP 1 0.290 40 1 A 959 GLY 1 0.290 41 1 A 960 HIS 1 0.270 42 1 A 961 LYS 1 0.280 43 1 A 962 ASP 1 0.250 44 1 A 963 PRO 1 0.290 45 1 A 964 LEU 1 0.260 46 1 A 965 LEU 1 0.350 47 1 A 966 MET 1 0.340 48 1 A 967 GLU 1 0.370 49 1 A 968 VAL 1 0.380 50 1 A 969 SER 1 0.390 51 1 A 970 ARG 1 0.310 52 1 A 971 LEU 1 0.370 53 1 A 972 GLN 1 0.270 54 1 A 973 ASP 1 0.360 55 1 A 974 SER 1 0.430 56 1 A 975 ILE 1 0.380 57 1 A 976 MET 1 0.440 58 1 A 977 LYS 1 0.520 59 1 A 978 ASP 1 0.590 60 1 A 979 ILE 1 0.650 61 1 A 980 ALA 1 0.700 62 1 A 981 GLU 1 0.660 63 1 A 982 LEU 1 0.670 64 1 A 983 HIS 1 0.610 65 1 A 984 LYS 1 0.750 66 1 A 985 GLU 1 0.680 67 1 A 986 THR 1 0.680 68 1 A 987 GLU 1 0.730 69 1 A 988 GLU 1 0.760 70 1 A 989 ALA 1 0.770 71 1 A 990 GLU 1 0.700 72 1 A 991 LYS 1 0.690 73 1 A 992 LYS 1 0.670 74 1 A 993 GLN 1 0.670 75 1 A 994 SER 1 0.680 76 1 A 995 GLU 1 0.640 77 1 A 996 LEU 1 0.640 78 1 A 997 ASP 1 0.630 79 1 A 998 LYS 1 0.610 80 1 A 999 VAL 1 0.650 81 1 A 1000 ALA 1 0.680 82 1 A 1001 GLN 1 0.570 83 1 A 1002 ILE 1 0.530 84 1 A 1003 LEU 1 0.520 85 1 A 1004 GLY 1 0.540 86 1 A 1005 ILE 1 0.420 87 1 A 1006 ASP 1 0.430 88 1 A 1007 ILE 1 0.310 89 1 A 1008 PHE 1 0.210 90 1 A 1009 ASP 1 0.240 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #