data_SMR-bc20fedd334898de477310a250503c84_9 _entry.id SMR-bc20fedd334898de477310a250503c84_9 _struct.entry_id SMR-bc20fedd334898de477310a250503c84_9 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q99PP2/ ZN318_MOUSE, Zinc finger protein 318 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q99PP2' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 286967.881 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ZN318_MOUSE Q99PP2 1 ;MYRSGSRSSVSSHRSKDGSASGPPPGRPVGASSGPTRRPSSPPPPSCSSLRLPARRHRSPSGHRGRWASP SPPRGRRGSPSPPRGRRASPSPTRGRRASPSPPRGRRGSPSPPRARRGSPSPPRSRRHYPPGLGGFRGSI RGESRADFARDGRGDHPGGGGGSRRRSPGLCSDSSLEESLRITVGNDHFCVSTPERRRLSDRLGSPVDGL QDMDRDDLTDDSVFTRSSQCSRGLERYISREEGPLSPFLGQLDEDYRTRETFLHRPEFSPQSSCHDELLR GTERNRDKLKSSSYSIRSEERSREAKRPRYDDTEKVHSSGGDHSSFTSGTRNYRQRRSSPSPRFLDPEFR ELDLARRKREEEEEQSRSLSQELVGVGDDQIGCSIPGLAGVLTTSEPGYSLQRPEEVPMMPKKSILKKRI EADMKPSLQLESFSSGASSGEDHPLYSEHSPLPLSGAIAAFTSEIENKGTTVEADLKEPQSNLYQWGPLR EIPKDNSEKFDSFLGFKEKLDLKAEGLEQQTDFLLPHERASQDGSGFSRILSMLADPTITQEKRRRSFPD IEDEEKFLYGDEEEDIKSESPLKSLEDPESAGTRQKANSLPSTPAVKLESLEESNPEYAKIHNLLKTIGL DIGVAEIGKLAARTQERLHGKKPSSRPSADRRLSADRHLSGDRHFSADRCSSVEHSFTADWRSSDPHRPE SRETHHSNTQSPEVSHPHPASPVDPYLRTKNSPPFLKSDHPVCHVSGPEVVGSGFQSSVAVRCMLPSAPS TPIRLPHSAALSQFHIPGASQFAAARIPPNYQGSVIPSASFDAYRHYMAYAASRWPMYPASQPPSHPLSD PHRLLPVTKQAARSRPNLRVIPTVTPAKPKQEIPVLGSISVKRIPVRVSIPSLIKYNPKKISDEKNRASQ KQKVIEEREKLKTEQEARQKKMFYLTTELERLHKQQGEMLRKKRREKDGHKDPLLMEVSRLQDSIMKDIA ELHKETEEAEKKQSELDKVAQILGIDIFDKSLKSSNDSKESTEKPEKEKSKSPEKELSPSNSSSSNKESK MNEKSCIKSPSSTESLQPTVKQSDQPVAAYEYYDAGSHWCKDCNTTCGTMFDFFTHMHNKKHTQTLDPYN RPWASKTQSEAKQDTVKRTDKITVPAKGSEFLIPVTGFYCQLCEEFLGDPISGEQHVKGHQHNENYKKYV EENPLYEERRNLDRQAGLAVVLETERRRQNELKRKLNEKPKEEKIEKKARIVREVKEDDKAPGELEEQLS EDGSAPEKGEVKGNASLRPQVKEEVKKEPSVASIAASFGKFSWKKPEKEEEKGSVVTPGAPKEDTVETSK DRDDGKAEVGKAKPIKIKLSGKTVIAHTSPWTPVVTTSTQTKIRPNLPIPSTVLRKSGSATVSKPAPLNT FLSIKSSGTSTKPLPVVKESSSDLLLPPDIISKAFGGEEVVLKGSPEEKVELAEKNEPSQVPEQMLALLP PPPPPPPPPPPPPPPPPPQAVPQLSAPSPAQANVVLTPVKSNSVISQTFSLGFQGPNILNPGLPVAFMAS EQPTVIPSDETAPGVSESDWDQTLISMLVRPPPPLSSVFSEQAKKLEKRNSCLATANAKDLYDIFYSSGG KGAHETKLSSSTLANGESSSLPRTESSDFSSTCTLNSSMSSEDLPQCSALVTATEISNLENPISKGMEST GKWSVVDQIDPKSRDSTYSFLQPLTRLYQNKPYEIVSPKTDTLVMWTSGSSQNDTHKDRPPEGKIRFDLG EPGPPGTDSTSHLSDTHCQTNGPQKLIEINLIDNQNKNQEVYQSEGCRESEMKRKTELKGKVATEEEEEE EEEGANSIEDSNSNHGNRNTWEGEIGQPKLSTVDKKGEQSSKLMTGHENTSKVVIELSPSLPSKRTKIDL FPSLLQNPKSMPELLLLSPAGSGLCLKRQEIWERPEKPGLEDVELQGTRPELTVTIESKVLENFDTTHLE VEGFASLRNLGDMHANFHNSQTEQTRRSPTALSEKMSEEISVSSVMCNPSSSSDIEPVPSFSGFPLESPK TLVLNFETEGAHSSSNSRNGRITSNSLETGHPVENVGHDLGGERTHQALDLLAGGMLSEDVKETSPLQKD LLRMESTTVSPSGLGPSPCLPDLVDFVTRTPGVPKQKPCSPLSEPDAFLKCSSLEMGSPPPEILSVSVSE VAVPQVSEDNDSALNLVKTPPSGSPSRDQVVGGNVSPREMPEQEAAVDVIPDHTRSNVYNSQDYLNG ; 'Zinc finger protein 318' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2237 1 2237 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ZN318_MOUSE Q99PP2 . 1 2237 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2018-01-31 97B600577866BA14 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MYRSGSRSSVSSHRSKDGSASGPPPGRPVGASSGPTRRPSSPPPPSCSSLRLPARRHRSPSGHRGRWASP SPPRGRRGSPSPPRGRRASPSPTRGRRASPSPPRGRRGSPSPPRARRGSPSPPRSRRHYPPGLGGFRGSI RGESRADFARDGRGDHPGGGGGSRRRSPGLCSDSSLEESLRITVGNDHFCVSTPERRRLSDRLGSPVDGL QDMDRDDLTDDSVFTRSSQCSRGLERYISREEGPLSPFLGQLDEDYRTRETFLHRPEFSPQSSCHDELLR GTERNRDKLKSSSYSIRSEERSREAKRPRYDDTEKVHSSGGDHSSFTSGTRNYRQRRSSPSPRFLDPEFR ELDLARRKREEEEEQSRSLSQELVGVGDDQIGCSIPGLAGVLTTSEPGYSLQRPEEVPMMPKKSILKKRI EADMKPSLQLESFSSGASSGEDHPLYSEHSPLPLSGAIAAFTSEIENKGTTVEADLKEPQSNLYQWGPLR EIPKDNSEKFDSFLGFKEKLDLKAEGLEQQTDFLLPHERASQDGSGFSRILSMLADPTITQEKRRRSFPD IEDEEKFLYGDEEEDIKSESPLKSLEDPESAGTRQKANSLPSTPAVKLESLEESNPEYAKIHNLLKTIGL 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_entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 TYR . 1 3 ARG . 1 4 SER . 1 5 GLY . 1 6 SER . 1 7 ARG . 1 8 SER . 1 9 SER . 1 10 VAL . 1 11 SER . 1 12 SER . 1 13 HIS . 1 14 ARG . 1 15 SER . 1 16 LYS . 1 17 ASP . 1 18 GLY . 1 19 SER . 1 20 ALA . 1 21 SER . 1 22 GLY . 1 23 PRO . 1 24 PRO . 1 25 PRO . 1 26 GLY . 1 27 ARG . 1 28 PRO . 1 29 VAL . 1 30 GLY . 1 31 ALA . 1 32 SER . 1 33 SER . 1 34 GLY . 1 35 PRO . 1 36 THR . 1 37 ARG . 1 38 ARG . 1 39 PRO . 1 40 SER . 1 41 SER . 1 42 PRO . 1 43 PRO . 1 44 PRO . 1 45 PRO . 1 46 SER . 1 47 CYS . 1 48 SER . 1 49 SER . 1 50 LEU . 1 51 ARG . 1 52 LEU . 1 53 PRO . 1 54 ALA . 1 55 ARG . 1 56 ARG . 1 57 HIS . 1 58 ARG . 1 59 SER . 1 60 PRO . 1 61 SER . 1 62 GLY . 1 63 HIS . 1 64 ARG . 1 65 GLY . 1 66 ARG . 1 67 TRP . 1 68 ALA . 1 69 SER . 1 70 PRO . 1 71 SER . 1 72 PRO . 1 73 PRO . 1 74 ARG . 1 75 GLY . 1 76 ARG . 1 77 ARG . 1 78 GLY . 1 79 SER . 1 80 PRO . 1 81 SER . 1 82 PRO . 1 83 PRO . 1 84 ARG . 1 85 GLY . 1 86 ARG . 1 87 ARG . 1 88 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A 1 2202 GLY 2202 ? ? ? A . A 1 2203 GLY 2203 ? ? ? A . A 1 2204 ASN 2204 ? ? ? A . A 1 2205 VAL 2205 ? ? ? A . A 1 2206 SER 2206 ? ? ? A . A 1 2207 PRO 2207 ? ? ? A . A 1 2208 ARG 2208 ? ? ? A . A 1 2209 GLU 2209 ? ? ? A . A 1 2210 MET 2210 ? ? ? A . A 1 2211 PRO 2211 ? ? ? A . A 1 2212 GLU 2212 ? ? ? A . A 1 2213 GLN 2213 ? ? ? A . A 1 2214 GLU 2214 ? ? ? A . A 1 2215 ALA 2215 ? ? ? A . A 1 2216 ALA 2216 ? ? ? A . A 1 2217 VAL 2217 ? ? ? A . A 1 2218 ASP 2218 ? ? ? A . A 1 2219 VAL 2219 ? ? ? A . A 1 2220 ILE 2220 ? ? ? A . A 1 2221 PRO 2221 ? ? ? A . A 1 2222 ASP 2222 ? ? ? A . A 1 2223 HIS 2223 ? ? ? A . A 1 2224 THR 2224 ? ? ? A . A 1 2225 ARG 2225 ? ? ? A . A 1 2226 SER 2226 ? ? ? A . A 1 2227 ASN 2227 ? ? ? A . A 1 2228 VAL 2228 ? ? ? A . A 1 2229 TYR 2229 ? ? ? A . A 1 2230 ASN 2230 ? ? ? A . A 1 2231 SER 2231 ? ? ? A . A 1 2232 GLN 2232 ? ? ? A . A 1 2233 ASP 2233 ? ? ? A . A 1 2234 TYR 2234 ? ? ? A . A 1 2235 LEU 2235 ? ? ? A . A 1 2236 ASN 2236 ? ? ? A . A 1 2237 GLY 2237 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Coiled-coil domain-containing protein 105 {PDB ID=8otz, label_asym_id=PC, auth_asym_id=BQ, SMTL ID=8otz.94.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8otz, label_asym_id=PC' 'target-template alignment' . 4 'model 9' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A PC 19 1 BQ # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MPVLIPPVEHSQDTRVGHPAWREATRALAEEAHQLTDRCGQEAVTMWQPNESVRDPHVAHHLCRAAYILP WRFRVEMLKGGSTMEKPPPGEGVTLWKSKMKPPAWHARLPLPMHRDARALQTAEVVQAHARGARLTAARL GRAQHQINGQLRLLQRQREATDRRLSEVRKALLINQQSVKLRGYRPKSETISDKADSMLTWEKEELKSMK RKMEADMEKSEALLKTLASCRDALVFCCKERLQAVELMNQPLDKVLEQAGRHSWVNISRVPTPRTQGLKT PPPDPVGTYTPECAKALYEAKRLLMESKDTLLDMAKNEEDIREQQQQISDRVCASLAQKMRETLELKDRL NMTLGLMRGTIHRCTKFNQEMYITRGLIKGPLSKSHLETREKLDRPLVRMYQRHVGTQLPEAARLAQGTD KLQRHISHVEKNLDELLSMRKKLTWSFNCKKIGHNVDYSVVRLRLRQRHPQVCYEQAQRLVNDWDPRTPP RVKSNTAITK ; ;MPVLIPPVEHSQDTRVGHPAWREATRALAEEAHQLTDRCGQEAVTMWQPNESVRDPHVAHHLCRAAYILP WRFRVEMLKGGSTMEKPPPGEGVTLWKSKMKPPAWHARLPLPMHRDARALQTAEVVQAHARGARLTAARL GRAQHQINGQLRLLQRQREATDRRLSEVRKALLINQQSVKLRGYRPKSETISDKADSMLTWEKEELKSMK RKMEADMEKSEALLKTLASCRDALVFCCKERLQAVELMNQPLDKVLEQAGRHSWVNISRVPTPRTQGLKT PPPDPVGTYTPECAKALYEAKRLLMESKDTLLDMAKNEEDIREQQQQISDRVCASLAQKMRETLELKDRL NMTLGLMRGTIHRCTKFNQEMYITRGLIKGPLSKSHLETREKLDRPLVRMYQRHVGTQLPEAARLAQGTD KLQRHISHVEKNLDELLSMRKKLTWSFNCKKIGHNVDYSVVRLRLRQRHPQVCYEQAQRLVNDWDPRTPP RVKSNTAITK ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 145 242 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8otz 2023-11-22 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2237 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2237 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 110.000 14.286 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MYRSGSRSSVSSHRSKDGSASGPPPGRPVGASSGPTRRPSSPPPPSCSSLRLPARRHRSPSGHRGRWASPSPPRGRRGSPSPPRGRRASPSPTRGRRASPSPPRGRRGSPSPPRARRGSPSPPRSRRHYPPGLGGFRGSIRGESRADFARDGRGDHPGGGGGSRRRSPGLCSDSSLEESLRITVGNDHFCVSTPERRRLSDRLGSPVDGLQDMDRDDLTDDSVFTRSSQCSRGLERYISREEGPLSPFLGQLDEDYRTRETFLHRPEFSPQSSCHDELLRGTERNRDKLKSSSYSIRSEERSREAKRPRYDDTEKVHSSGGDHSSFTSGTRNYRQRRSSPSPRFLDPEFRELDLARRKREEEEEQSRSLSQELVGVGDDQIGCSIPGLAGVLTTSEPGYSLQRPEEVPMMPKKSILKKRIEADMKPSLQLESFSSGASSGEDHPLYSEHSPLPLSGAIAAFTSEIENKGTTVEADLKEPQSNLYQWGPLREIPKDNSEKFDSFLGFKEKLDLKAEGLEQQTDFLLPHERASQDGSGFSRILSMLADPTITQEKRRRSFPDIEDEEKFLYGDEEEDIKSESPLKSLEDPESAGTRQKANSLPSTPAVKLESLEESNPEYAKIHNLLKTIGLDIGVAEIGKLAARTQERLHGKKPSSRPSADRRLSADRHLSGDRHFSADRCSSVEHSFTADWRSSDPHRPESRETHHSNTQSPEVSHPHPASPVDPYLRTKNSPPFLKSDHPVCHVSGPEVVGSGFQSSVAVRCMLPSAPSTPIRLPHSAALSQFHIPGASQFAAARIPPNYQGSVIPSASFDAYRHYMAYAASRWPMYPASQPPSHPLSDPHRLLPVTKQAARSRPNLRVIPTVTPAKPKQEIPVLGSISVKRIPVRVSIPSLIKYNPKKISDEKNRASQKQKVIEEREKLKTEQEARQKKMFYLTTELERLHKQQGEMLRKKRREKDGHKDPLLMEVSRLQDSIMKDIAELHKETEEAEKKQSELDKVAQILGIDIFDKSLKSSNDSKESTEKPEKEKSKSPEKELSPSNSSSSNKESKMNEKSCIKSPSSTESLQPTVKQSDQPVAAYEYYDAGSHWCKDCNTTCGTMFDFFTHMHNKKHTQTLDPYNRPWASKTQSEAKQDTVKRTDKITVPAKGSEFLIPVTGFYCQLCEEFLGDPISGEQHVKGHQHNENYKKYVEENPLYEERRNLDRQAGLAVVLETERRRQNELKRKLNEKPKEEKIEKKARIVREVKEDDKAPGELEEQLSEDGSAPEKGEVKGNASLRPQVKEEVKKEPSVASIAASFGKFSWKKPEKEEEKGSVVTPGAPKEDTVETSKDRDDGKAEVGKAKPIKIKLSGKTVIAHTSPWTPVVTTSTQTKIRPNLPIPSTVLRKSGSATVSKPAPLNTFLSIKSSGTSTKPLPVVKESSSDLLLPPDIISKAFGGEEVVLKGSPEEKVELAEKNEPSQVPEQMLALLPPPPPPPPPPPPPPPPPPPQAVPQLSAPSPAQANVVLTPVKSNSVISQTFSLGFQGPNILNPGLPVAFMASEQPTVIPSDETAPGVSESDWDQTLISMLVRPPPPLSSVFSEQAKKLEKRNSCLATANAKDLYDIFYSSGGKGAHETKLSSSTLANGESSSLPRTESSDFSSTCTLNSSMSSEDLPQCSALVTATEISNLENPISKGMESTGKWSVVDQIDPKSRDSTYSFLQPLTRLYQNKPYEIVSPKTDTLVMWTSGSSQNDTHKDRPPEGKIRFDLGEPGPPGTDSTSHLSDTHCQTNGPQKLIEINLIDNQNKNQEVYQSEGCRESEMKRKTELKGKVATEEEEEEEEEGANSIEDSNSNHGNRNTWEGEIGQPKLSTVDKKGEQSSKLMTGHENTSKVVIELSPSLPSKRTKIDLFPSLLQNPKSMPELLLLSPAGSGLCLKRQEIWERPEKPGLEDVELQGTRPELTVTIESKVLENFDTTHLEVEGFASLRNLGDMHANFHNSQTEQTRRSPTALSEKMSEEISVSSVMCNPSSSSDIEPVPSFSGFPLESPKTLVLNFETEGAHSSSNSRNGRITSNSLETGHPVENVGHDLGGERTHQALDLLAGGMLSEDVKETSPLQKDLLRMESTTVSPSGLGPSPCLPDLVDFVTRTPGVPKQKPCSPLSEPDAFLKCSSLEMGSPPPEILSVSVSEVAVPQVSEDNDSALNLVKTPPSGSPSRDQVVGGNVSPREMPEQEAAVDVIPDHTRSNVYNSQDYLNG 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------HQINGQLRLLQRQREATDRRLSEVRKALLI--NQQSVKLRGYRPKSETISDKADSMLTWEKEELKSMKRKMEADMEKSEALLKTLASCRDALVFCCKERL-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8otz.94' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 9' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLN 912 912 ? A 367.867 411.890 592.784 1 1 A GLN 0.380 1 ATOM 2 C CA . GLN 912 912 ? A 367.107 412.727 591.792 1 1 A GLN 0.380 1 ATOM 3 C C . GLN 912 912 ? A 367.907 413.287 590.621 1 1 A GLN 0.380 1 ATOM 4 O O . GLN 912 912 ? A 367.285 413.742 589.663 1 1 A GLN 0.380 1 ATOM 5 C CB . GLN 912 912 ? A 366.293 413.801 592.583 1 1 A GLN 0.380 1 ATOM 6 C CG . GLN 912 912 ? A 365.190 414.577 591.807 1 1 A GLN 0.380 1 ATOM 7 C CD . GLN 912 912 ? A 364.196 413.613 591.166 1 1 A GLN 0.380 1 ATOM 8 O OE1 . GLN 912 912 ? A 363.752 412.687 591.863 1 1 A GLN 0.380 1 ATOM 9 N NE2 . GLN 912 912 ? A 363.887 413.770 589.869 1 1 A GLN 0.380 1 ATOM 10 N N . LYS 913 913 ? A 369.257 413.247 590.553 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 11 C CA . LYS 913 913 ? A 369.969 413.696 589.357 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 12 C C . LYS 913 913 ? A 370.514 412.521 588.567 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 13 O O . LYS 913 913 ? A 370.482 412.506 587.336 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 14 C CB . LYS 913 913 ? A 371.102 414.673 589.753 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 15 C CG . LYS 913 913 ? A 370.582 415.961 590.423 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 16 C CD . LYS 913 913 ? A 369.686 416.797 589.493 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 17 C CE . LYS 913 913 ? A 369.234 418.128 590.088 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 18 N NZ . LYS 913 913 ? A 368.323 418.788 589.129 1 1 A LYS 0.440 1 ATOM 19 N N . VAL 914 914 ? A 370.934 411.439 589.250 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 20 C CA . VAL 914 914 ? A 371.368 410.204 588.609 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 21 C C . VAL 914 914 ? A 370.274 409.568 587.758 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 22 O O . VAL 914 914 ? A 370.517 409.143 586.630 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 23 C CB . VAL 914 914 ? A 371.876 409.207 589.647 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 24 C CG1 . VAL 914 914 ? A 372.226 407.850 589.002 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 25 C CG2 . VAL 914 914 ? A 373.130 409.798 590.320 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 26 N N . ILE 915 915 ? A 369.026 409.540 588.277 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 27 C CA . ILE 915 915 ? A 367.845 409.062 587.562 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 28 C C . ILE 915 915 ? A 367.574 409.896 586.310 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 29 O O . ILE 915 915 ? A 367.454 409.330 585.212 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 30 C CB . ILE 915 915 ? A 366.628 409.012 588.500 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 31 C CG1 . ILE 915 915 ? A 366.868 407.970 589.626 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 32 C CG2 . ILE 915 915 ? A 365.334 408.681 587.716 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 33 C CD1 . ILE 915 915 ? A 365.839 408.012 590.764 1 1 A ILE 0.680 1 ATOM 34 N N . GLU 916 916 ? A 367.578 411.242 586.396 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 35 C CA . GLU 916 916 ? A 367.321 412.158 585.289 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 36 C C . GLU 916 916 ? A 368.331 411.997 584.154 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 37 O O . GLU 916 916 ? A 367.982 411.872 582.978 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 38 C CB . GLU 916 916 ? A 367.332 413.639 585.786 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 39 C CG . GLU 916 916 ? A 366.156 414.038 586.727 1 1 A GLU 0.730 1 ATOM 40 C CD . GLU 916 916 ? 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A 380.471 406.790 542.583 1 1 A GLU 0.500 1 ATOM 483 C CG . GLU 967 967 ? A 379.635 407.780 543.423 1 1 A GLU 0.500 1 ATOM 484 C CD . GLU 967 967 ? A 380.531 408.637 544.314 1 1 A GLU 0.500 1 ATOM 485 O OE1 . GLU 967 967 ? A 379.986 409.308 545.213 1 1 A GLU 0.500 1 ATOM 486 O OE2 . GLU 967 967 ? A 381.784 408.622 544.113 1 1 A GLU 0.500 1 ATOM 487 N N . VAL 968 968 ? A 379.900 403.997 543.827 1 1 A VAL 0.560 1 ATOM 488 C CA . VAL 968 968 ? A 379.084 403.050 544.557 1 1 A VAL 0.560 1 ATOM 489 C C . VAL 968 968 ? A 379.808 402.226 545.571 1 1 A VAL 0.560 1 ATOM 490 O O . VAL 968 968 ? A 379.361 402.046 546.710 1 1 A VAL 0.560 1 ATOM 491 C CB . VAL 968 968 ? A 378.304 402.133 543.620 1 1 A VAL 0.560 1 ATOM 492 C CG1 . VAL 968 968 ? A 377.659 403.035 542.573 1 1 A VAL 0.560 1 ATOM 493 C CG2 . VAL 968 968 ? A 378.932 400.905 542.911 1 1 A VAL 0.560 1 ATOM 494 N N . SER 969 969 ? A 380.992 401.743 545.186 1 1 A SER 0.620 1 ATOM 495 C CA . SER 969 969 ? A 381.915 401.038 546.055 1 1 A SER 0.620 1 ATOM 496 C C . SER 969 969 ? A 382.404 401.920 547.189 1 1 A SER 0.620 1 ATOM 497 O O . SER 969 969 ? A 382.416 401.506 548.345 1 1 A SER 0.620 1 ATOM 498 C CB . SER 969 969 ? A 383.100 400.448 545.248 1 1 A SER 0.620 1 ATOM 499 O OG . SER 969 969 ? A 382.673 399.349 544.421 1 1 A SER 0.620 1 ATOM 500 N N . ARG 970 970 ? A 382.731 403.193 546.903 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 501 C CA . ARG 970 970 ? A 383.061 404.176 547.922 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 502 C C . ARG 970 970 ? A 381.924 404.483 548.872 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 503 O O . ARG 970 970 ? A 382.141 404.618 550.079 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 504 C CB . ARG 970 970 ? A 383.526 405.509 547.304 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 505 C CG . ARG 970 970 ? A 384.880 405.399 546.593 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 506 C CD . ARG 970 970 ? A 385.419 406.748 546.104 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 507 N NE . ARG 970 970 ? A 384.520 407.308 545.032 1 1 A ARG 0.560 1 ATOM 508 C CZ . ARG 970 970 ? 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'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.575 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 912 GLN 1 0.380 2 1 A 913 LYS 1 0.440 3 1 A 914 VAL 1 0.700 4 1 A 915 ILE 1 0.680 5 1 A 916 GLU 1 0.730 6 1 A 917 GLU 1 0.770 7 1 A 918 ARG 1 0.710 8 1 A 919 GLU 1 0.740 9 1 A 920 LYS 1 0.780 10 1 A 921 LEU 1 0.760 11 1 A 922 LYS 1 0.750 12 1 A 923 THR 1 0.710 13 1 A 924 GLU 1 0.700 14 1 A 925 GLN 1 0.690 15 1 A 926 GLU 1 0.650 16 1 A 927 ALA 1 0.710 17 1 A 928 ARG 1 0.620 18 1 A 929 GLN 1 0.660 19 1 A 930 LYS 1 0.660 20 1 A 931 LYS 1 0.650 21 1 A 932 MET 1 0.660 22 1 A 933 PHE 1 0.640 23 1 A 934 TYR 1 0.630 24 1 A 935 LEU 1 0.670 25 1 A 936 THR 1 0.670 26 1 A 937 THR 1 0.630 27 1 A 938 GLU 1 0.620 28 1 A 939 LEU 1 0.610 29 1 A 940 GLU 1 0.490 30 1 A 941 ARG 1 0.450 31 1 A 942 LEU 1 0.500 32 1 A 943 HIS 1 0.410 33 1 A 944 LYS 1 0.440 34 1 A 945 GLN 1 0.440 35 1 A 946 GLN 1 0.360 36 1 A 947 GLY 1 0.450 37 1 A 948 GLU 1 0.430 38 1 A 949 MET 1 0.330 39 1 A 950 LEU 1 0.370 40 1 A 951 ARG 1 0.430 41 1 A 952 LYS 1 0.520 42 1 A 953 LYS 1 0.390 43 1 A 954 ARG 1 0.340 44 1 A 955 ARG 1 0.330 45 1 A 956 GLU 1 0.330 46 1 A 957 LYS 1 0.460 47 1 A 958 ASP 1 0.480 48 1 A 959 GLY 1 0.470 49 1 A 960 HIS 1 0.330 50 1 A 961 LYS 1 0.460 51 1 A 962 ASP 1 0.420 52 1 A 963 PRO 1 0.370 53 1 A 964 LEU 1 0.410 54 1 A 965 LEU 1 0.520 55 1 A 966 MET 1 0.490 56 1 A 967 GLU 1 0.500 57 1 A 968 VAL 1 0.560 58 1 A 969 SER 1 0.620 59 1 A 970 ARG 1 0.560 60 1 A 971 LEU 1 0.590 61 1 A 972 GLN 1 0.610 62 1 A 973 ASP 1 0.620 63 1 A 974 SER 1 0.700 64 1 A 975 ILE 1 0.680 65 1 A 976 MET 1 0.680 66 1 A 977 LYS 1 0.750 67 1 A 978 ASP 1 0.770 68 1 A 979 ILE 1 0.740 69 1 A 980 ALA 1 0.790 70 1 A 981 GLU 1 0.760 71 1 A 982 LEU 1 0.760 72 1 A 983 HIS 1 0.730 73 1 A 984 LYS 1 0.740 74 1 A 985 GLU 1 0.730 75 1 A 986 THR 1 0.740 76 1 A 987 GLU 1 0.710 77 1 A 988 GLU 1 0.710 78 1 A 989 ALA 1 0.730 79 1 A 990 GLU 1 0.630 80 1 A 991 LYS 1 0.680 81 1 A 992 LYS 1 0.660 82 1 A 993 GLN 1 0.670 83 1 A 994 SER 1 0.760 84 1 A 995 GLU 1 0.700 85 1 A 996 LEU 1 0.650 86 1 A 997 ASP 1 0.630 87 1 A 998 LYS 1 0.690 88 1 A 999 VAL 1 0.670 89 1 A 1000 ALA 1 0.660 90 1 A 1001 GLN 1 0.600 91 1 A 1002 ILE 1 0.550 92 1 A 1003 LEU 1 0.500 93 1 A 1004 GLY 1 0.490 94 1 A 1005 ILE 1 0.320 95 1 A 1006 ASP 1 0.320 96 1 A 1007 ILE 1 0.250 97 1 A 1008 PHE 1 0.250 98 1 A 1009 ASP 1 0.370 99 1 A 1010 LYS 1 0.260 100 1 A 1011 SER 1 0.330 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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