data_SMR-5d02f5b9dc747c0e63d1a39967499f68_2 _entry.id SMR-5d02f5b9dc747c0e63d1a39967499f68_2 _struct.entry_id SMR-5d02f5b9dc747c0e63d1a39967499f68_2 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q8NFD5/ ARI1B_HUMAN, AT-rich interactive domain-containing protein 1B Estimated model accuracy of this model is 0.064, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q8NFD5' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 285945.404 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ARI1B_HUMAN Q8NFD5 1 ;MAARAAAAAAAAAARARARAGSGERRAPPGPRPAPGARDLEAGARGAAAAAAAPGPMLGGGGDGGGGLNS VHHHPLLPRHELNMAHNAGAAAAAGTHSAKSGGSEAALKEGGSAAALSSSSSSSAAAAAASSSSSSGPGS AMETGLLPNHKLKTVGEAPAAPPHQQHHHHHHAHHHHHHAHHLHHHHALQQQLNQFQQQQQQQQQQQQQQ QQQQHPISNNNSLGGAGGGAPQPGPDMEQPQHGGAKDSAAGGQADPPGPPLLSKPGDEDDAPPKMGEPAG GRYEHPGLGALGTQQPPVAVPGGGGGPAAVPEFNNYYGSAAPASGGPGGRAGPCFDQHGGQQSPGMGMMH SASAAAAGAPGSMDPLQNSHEGYPNSQCNHYPGYSRPGAGGGGGGGGGGGGGSGGGGGGGGAGAGGAGAG AVAAAAAAAAAAAGGGGGGGYGGSSAGYGVLSSPRQQGGGMMMGPGGGGAASLSKAAAGSAAGGFQRFAG QNQHPSGATPTLNQLLTSPSPMMRSYGGSYPEYSSPSAPPPPPSQPQSQAAAAGAAAGGQQAAAGMGLGK DMGAQYAAASPAWAAAQQRSHPAMSPGTPGPTMGRSQGSPMDPMVMKRPQLYGMGSNPHSQPQQSSPYPG GSYGPPGPQRYPIGIQGRTPGAMAGMQYPQQQMPPQYGQQGVSGYCQQGQQPYYSQQPQPPHLPPQAQYL PSQSQQRYQPQQDMSQEGYGTRSQPPLAPGKPNHEDLNLIQQERPSSLPDLSGSIDDLPTGTEATLSSAV SASGSTSSQGDQSNPAQSPFSPHASPHLSSIPGGPSPSPVGSPVGSNQSRSGPISPASIPGSQMPPQPPG SQSESSSHPALSQSPMPQERGFMAGTQRNPQMAQYGPQQTGPSMSPHPSPGGQMHAGISSFQQSNSSGTY GPQMSQYGPQGNYSRPPAYSGVPSASYSGPGPGMGISANNQMHGQGPSQPCGAVPLGRMPSAGMQNRPFP GNMSSMTPSSPGMSQQGGPGMGPPMPTVNRKAQEAAAAVMQAAANSAQSRQGSFPGMNQSGLMASSSPYS QPMNNSSSLMNTQAPPYSMAPAMVNSSAASVGLADMMSPGESKLPLPLKADGKEEGTPQPESKSKKSSSS TTTGEKITKVYELGNEPERKLWVDRYLTFMEERGSPVSSLPAVGKKPLDLFRLYVCVKEIGGLAQVNKNK KWRELATNLNVGTSSSAASSLKKQYIQYLFAFECKIERGEEPPPEVFSTGDTKKQPKLQPPSPANSGSLQ GPQTPQSTGSNSMAEVPGDLKPPTPASTPHGQMTPMQGGRSSTISVHDPFSDVSDSSFPKRNSMTPNAPY QQGMSMPDVMGRMPYEPNKDPFGGMRKVPGSSEPFMTQGQMPNSSMQDMYNQSPSGAMSNLGMGQRQQFP YGASYDRRHEPYGQQYPGQGPPSGQPPYGGHQPGLYPQQPNYKRHMDGMYGPPAKRHEGDMYNMQYSSQQ QEMYNQYGGSYSGPDRRPIQGQYPYPYSRERMQGPGQIQTHGIPPQMMGGPLQSSSSEGPQQNMWAARND MPYPYQNRQGPGGPTQAPPYPGMNRTDDMMVPDQRINHESQWPSHVSQRQPYMSSSASMQPITRPPQPSY QTPPSLPNHISRAPSPASFQRSLENRMSPSKSPFLPSMKMQKVMPTVPTSQVTGPPPQPPPIRREITFPP GSVEASQPVLKQRRKITSKDIVTPEAWRVMMSLKSGLLAESTWALDTINILLYDDSTVATFNLSQLSGFL ELLVEYFRKCLIDIFGILMEYEVGDPSQKALDHNAARKDDSQSLADDSGKEEEDAECIDDDEEDEEDEEE DSEKTESDEKSSIALTAPDAAADPKEKPKQASKFDKLPIKIVKKNNLFVVDRSDKLGRVQEFNSGLLHWQ LGGGDTTEHIQTHFESKMEIPPRRRPPPPLSSAGRKKEQEGKGDSEEQQEKSIIATIDDVLSARPGALPE DANPGPQTESSKFPFGIQQAKSHRNIKLLEDEPRSRDETPLCTIAHWQDSLAKRCICVSNIVRSLSFVPG NDAEMSKHPGLVLILGKLILLHHEHPERKRAPQTYEKEEDEDKGVACSKDEWWWDCLEVLRDNTLVTLAN ISGQLDLSAYTESICLPILDGLLHWMVCPSAEAQDPFPTVGPNSVLSPQRLVLETLCKLSIQDNNVDLIL ATPPFSRQEKFYATLVRYVGDRKNPVCREMSMALLSNLAQGDALAARAIAVQKGSIGNLISFLEDGVTMA QYQQSQHNLMHMQPPPLEPPSVDMMCRAAKALLAMARVDENRSEFLLHEGRLLDISISAVLNSLVASVIC DVLFQIGQL ; 'AT-rich interactive domain-containing protein 1B' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2319 1 2319 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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A 1 2057 GLU 2057 ? ? ? A . A 1 2058 ARG 2058 ? ? ? A . A 1 2059 LYS 2059 ? ? ? A . A 1 2060 ARG 2060 ? ? ? A . A 1 2061 ALA 2061 ? ? ? A . A 1 2062 PRO 2062 ? ? ? A . A 1 2063 GLN 2063 ? ? ? A . A 1 2064 THR 2064 ? ? ? A . A 1 2065 TYR 2065 ? ? ? A . A 1 2066 GLU 2066 ? ? ? A . A 1 2067 LYS 2067 ? ? ? A . A 1 2068 GLU 2068 ? ? ? A . A 1 2069 GLU 2069 ? ? ? A . A 1 2070 ASP 2070 ? ? ? A . A 1 2071 GLU 2071 ? ? ? A . A 1 2072 ASP 2072 ? ? ? A . A 1 2073 LYS 2073 ? ? ? A . A 1 2074 GLY 2074 ? ? ? A . A 1 2075 VAL 2075 ? ? ? A . A 1 2076 ALA 2076 ? ? ? A . A 1 2077 CYS 2077 ? ? ? A . A 1 2078 SER 2078 ? ? ? A . A 1 2079 LYS 2079 ? ? ? A . A 1 2080 ASP 2080 ? ? ? A . A 1 2081 GLU 2081 ? ? ? A . A 1 2082 TRP 2082 ? ? ? A . A 1 2083 TRP 2083 ? ? ? A . A 1 2084 TRP 2084 ? ? ? A . A 1 2085 ASP 2085 ? ? ? A . A 1 2086 CYS 2086 ? ? ? A . A 1 2087 LEU 2087 ? ? ? A . A 1 2088 GLU 2088 ? ? ? A . A 1 2089 VAL 2089 ? ? ? A . A 1 2090 LEU 2090 ? ? ? A . A 1 2091 ARG 2091 ? ? ? A . 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'AT-rich interactive domain-containing protein 1B {PDB ID=2eh9, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2eh9.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 2eh9, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 2' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GSSGSSGEKITKVYELGNEPERKLWVDRYLTFMEERGSPVSSLPAVGKKPLDLFRLYVCVKEIGGLAQVN KNKKWRELATNLNVGTSSSAASSLKKQYIQYLFAFECKIERGEEPPPEVFSTGDT ; ;GSSGSSGEKITKVYELGNEPERKLWVDRYLTFMEERGSPVSSLPAVGKKPLDLFRLYVCVKEIGGLAQVN KNKKWRELATNLNVGTSSSAASSLKKQYIQYLFAFECKIERGEEPPPEVFSTGDT ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 7 124 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2eh9 2024-10-30 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2319 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2319 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 4.1e-22 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAARAAAAAAAAAARARARAGSGERRAPPGPRPAPGARDLEAGARGAAAAAAAPGPMLGGGGDGGGGLNSVHHHPLLPRHELNMAHNAGAAAAAGTHSAKSGGSEAALKEGGSAAALSSSSSSSAAAAAASSSSSSGPGSAMETGLLPNHKLKTVGEAPAAPPHQQHHHHHHAHHHHHHAHHLHHHHALQQQLNQFQQQQQQQQQQQQQQQQQQHPISNNNSLGGAGGGAPQPGPDMEQPQHGGAKDSAAGGQADPPGPPLLSKPGDEDDAPPKMGEPAGGRYEHPGLGALGTQQPPVAVPGGGGGPAAVPEFNNYYGSAAPASGGPGGRAGPCFDQHGGQQSPGMGMMHSASAAAAGAPGSMDPLQNSHEGYPNSQCNHYPGYSRPGAGGGGGGGGGGGGGSGGGGGGGGAGAGGAGAGAVAAAAAAAAAAAGGGGGGGYGGSSAGYGVLSSPRQQGGGMMMGPGGGGAASLSKAAAGSAAGGFQRFAGQNQHPSGATPTLNQLLTSPSPMMRSYGGSYPEYSSPSAPPPPPSQPQSQAAAAGAAAGGQQAAAGMGLGKDMGAQYAAASPAWAAAQQRSHPAMSPGTPGPTMGRSQGSPMDPMVMKRPQLYGMGSNPHSQPQQSSPYPGGSYGPPGPQRYPIGIQGRTPGAMAGMQYPQQQMPPQYGQQGVSGYCQQGQQPYYSQQPQPPHLPPQAQYLPSQSQQRYQPQQDMSQEGYGTRSQPPLAPGKPNHEDLNLIQQERPSSLPDLSGSIDDLPTGTEATLSSAVSASGSTSSQGDQSNPAQSPFSPHASPHLSSIPGGPSPSPVGSPVGSNQSRSGPISPASIPGSQMPPQPPGSQSESSSHPALSQSPMPQERGFMAGTQRNPQMAQYGPQQTGPSMSPHPSPGGQMHAGISSFQQSNSSGTYGPQMSQYGPQGNYSRPPAYSGVPSASYSGPGPGMGISANNQMHGQGPSQPCGAVPLGRMPSAGMQNRPFPGNMSSMTPSSPGMSQQGGPGMGPPMPTVNRKAQEAAAAVMQAAANSAQSRQGSFPGMNQSGLMASSSPYSQPMNNSSSLMNTQAPPYSMAPAMVNSSAASVGLADMMSPGESKLPLPLKADGKEEGTPQPESKSKKSSSSTTTGEKITKVYELGNEPERKLWVDRYLTFMEERGSPVSSLPAVGKKPLDLFRLYVCVKEIGGLAQVNKNKKWRELATNLNVGTSSSAASSLKKQYIQYLFAFECKIERGEEPPPEVFSTGDTKKQPKLQPPSPANSGSLQGPQTPQSTGSNSMAEVPGDLKPPTPASTPHGQMTPMQGGRSSTISVHDPFSDVSDSSFPKRNSMTPNAPYQQGMSMPDVMGRMPYEPNKDPFGGMRKVPGSSEPFMTQGQMPNSSMQDMYNQSPSGAMSNLGMGQRQQFPYGASYDRRHEPYGQQYPGQGPPSGQPPYGGHQPGLYPQQPNYKRHMDGMYGPPAKRHEGDMYNMQYSSQQQEMYNQYGGSYSGPDRRPIQGQYPYPYSRERMQGPGQIQTHGIPPQMMGGPLQSSSSEGPQQNMWAARNDMPYPYQNRQGPGGPTQAPPYPGMNRTDDMMVPDQRINHESQWPSHVSQRQPYMSSSASMQPITRPPQPSYQTPPSLPNHISRAPSPASFQRSLENRMSPSKSPFLPSMKMQKVMPTVPTSQVTGPPPQPPPIRREITFPPGSVEASQPVLKQRRKITSKDIVTPEAWRVMMSLKSGLLAESTWALDTINILLYDDSTVATFNLSQLSGFLELLVEYFRKCLIDIFGILMEYEVGDPSQKALDHNAARKDDSQSLADDSGKEEEDAECIDDDEEDEEDEEEDSEKTESDEKSSIALTAPDAAADPKEKPKQASKFDKLPIKIVKKNNLFVVDRSDKLGRVQEFNSGLLHWQLGGGDTTEHIQTHFESKMEIPPRRRPPPPLSSAGRKKEQEGKGDSEEQQEKSIIATIDDVLSARPGALPEDANPGPQTESSKFPFGIQQAKSHRNIKLLEDEPRSRDETPLCTIAHWQDSLAKRCICVSNIVRSLSFVPGNDAEMSKHPGLVLILGKLILLHHEHPERKRAPQTYEKEEDEDKGVACSKDEWWWDCLEVLRDNTLVTLANISGQLDLSAYTESICLPILDGLLHWMVCPSAEAQDPFPTVGPNSVLSPQRLVLETLCKLSIQDNNVDLILATPPFSRQEKFYATLVRYVGDRKNPVCREMSMALLSNLAQGDALAARAIAVQKGSIGNLISFLEDGVTMAQYQQSQHNLMHMQPPPLEPPSVDMMCRAAKALLAMARVDENRSEFLLHEGRLLDISISAVLNSLVASVICDVLFQIGQL 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GEKITKVYELGNEPERKLWVDRYLTFMEERGSPVSSLPAVGKKPLDLFRLYVCVKEIGGLAQVNKNKKWRELATNLNVGTSSSAASSLKKQYIQYLFAFECKIERGEEPPPEVFSTGD---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2eh9.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 1125 1125 ? A 53.411 9.095 22.965 1 1 A GLU 0.490 1 ATOM 2 C CA . GLU 1125 1125 ? A 53.409 7.669 22.506 1 1 A GLU 0.490 1 ATOM 3 C C . GLU 1125 1125 ? A 52.342 7.385 21.466 1 1 A GLU 0.490 1 ATOM 4 O O . GLU 1125 1125 ? A 51.585 8.279 21.099 1 1 A GLU 0.490 1 ATOM 5 C CB . GLU 1125 1125 ? A 53.266 6.753 23.738 1 1 A GLU 0.490 1 ATOM 6 C CG . GLU 1125 1125 ? A 54.426 6.901 24.748 1 1 A GLU 0.490 1 ATOM 7 C CD . GLU 1125 1125 ? A 54.299 5.827 25.828 1 1 A GLU 0.490 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 1125 1125 ? A 53.265 5.849 26.543 1 1 A GLU 0.490 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 1125 1125 ? A 55.219 4.985 25.921 1 1 A GLU 0.490 1 ATOM 10 N N . LYS 1126 1126 ? A 52.282 6.147 20.935 1 1 A LYS 0.520 1 ATOM 11 C CA . LYS 1126 1126 ? A 51.281 5.705 19.977 1 1 A LYS 0.520 1 ATOM 12 C C . LYS 1126 1126 ? A 49.915 5.616 20.610 1 1 A LYS 0.520 1 ATOM 13 O O . LYS 1126 1126 ? A 49.812 5.404 21.811 1 1 A LYS 0.520 1 ATOM 14 C CB . LYS 1126 1126 ? A 51.632 4.307 19.430 1 1 A LYS 0.520 1 ATOM 15 C CG . LYS 1126 1126 ? A 52.965 4.322 18.680 1 1 A LYS 0.520 1 ATOM 16 C CD . LYS 1126 1126 ? A 53.411 2.927 18.231 1 1 A LYS 0.520 1 ATOM 17 C CE . LYS 1126 1126 ? A 54.770 2.966 17.527 1 1 A LYS 0.520 1 ATOM 18 N NZ . LYS 1126 1126 ? A 55.212 1.598 17.184 1 1 A LYS 0.520 1 ATOM 19 N N . ILE 1127 1127 ? A 48.833 5.755 19.818 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 20 C CA . ILE 1127 1127 ? A 47.461 5.704 20.323 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 21 C C . ILE 1127 1127 ? A 47.129 4.440 21.099 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 22 O O . ILE 1127 1127 ? A 46.405 4.476 22.102 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 23 C CB . ILE 1127 1127 ? A 46.435 5.945 19.222 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 24 C CG1 . ILE 1127 1127 ? A 45.008 6.182 19.777 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 25 C CG2 . ILE 1127 1127 ? A 46.435 4.815 18.159 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 26 C CD1 . ILE 1127 1127 ? A 44.866 7.315 20.803 1 1 A ILE 0.660 1 ATOM 27 N N . THR 1128 1128 ? A 47.727 3.304 20.707 1 1 A THR 0.690 1 ATOM 28 C CA . THR 1128 1128 ? A 47.632 1.971 21.288 1 1 A THR 0.690 1 ATOM 29 C C . THR 1128 1128 ? A 47.891 1.938 22.788 1 1 A THR 0.690 1 ATOM 30 O O . THR 1128 1128 ? A 47.336 1.117 23.513 1 1 A THR 0.690 1 ATOM 31 C CB . THR 1128 1128 ? A 48.565 0.978 20.599 1 1 A THR 0.690 1 ATOM 32 O OG1 . THR 1128 1128 ? A 49.926 1.412 20.592 1 1 A THR 0.690 1 ATOM 33 C CG2 . THR 1128 1128 ? A 48.190 0.803 19.118 1 1 A THR 0.690 1 ATOM 34 N N . LYS 1129 1129 ? A 48.679 2.892 23.310 1 1 A LYS 0.660 1 ATOM 35 C CA . LYS 1129 1129 ? A 48.862 3.142 24.725 1 1 A LYS 0.660 1 ATOM 36 C C . LYS 1129 1129 ? A 47.558 3.365 25.516 1 1 A LYS 0.660 1 ATOM 37 O O . LYS 1129 1129 ? A 47.475 3.040 26.699 1 1 A LYS 0.660 1 ATOM 38 C CB . LYS 1129 1129 ? A 49.796 4.367 24.872 1 1 A LYS 0.660 1 ATOM 39 C CG . LYS 1129 1129 ? A 50.108 4.795 26.311 1 1 A LYS 0.660 1 ATOM 40 C CD . LYS 1129 1129 ? A 50.847 3.699 27.089 1 1 A LYS 0.660 1 ATOM 41 C CE . LYS 1129 1129 ? A 51.074 4.063 28.559 1 1 A LYS 0.660 1 ATOM 42 N NZ . LYS 1129 1129 ? A 51.860 3.016 29.218 1 1 A LYS 0.660 1 ATOM 43 N N . VAL 1130 1130 ? A 46.469 3.874 24.884 1 1 A VAL 0.810 1 ATOM 44 C CA . VAL 1130 1130 ? A 45.163 4.060 25.527 1 1 A VAL 0.810 1 ATOM 45 C C . VAL 1130 1130 ? A 44.544 2.767 26.036 1 1 A VAL 0.810 1 ATOM 46 O O . VAL 1130 1130 ? A 43.714 2.788 26.949 1 1 A VAL 0.810 1 ATOM 47 C CB . VAL 1130 1130 ? A 44.157 4.835 24.662 1 1 A VAL 0.810 1 ATOM 48 C CG1 . VAL 1130 1130 ? A 43.565 3.978 23.529 1 1 A VAL 0.810 1 ATOM 49 C CG2 . VAL 1130 1130 ? A 43.066 5.537 25.513 1 1 A VAL 0.810 1 ATOM 50 N N . TYR 1131 1131 ? A 44.956 1.596 25.498 1 1 A TYR 0.730 1 ATOM 51 C CA . TYR 1131 1131 ? A 44.499 0.295 25.955 1 1 A TYR 0.730 1 ATOM 52 C C . TYR 1131 1131 ? A 44.916 -0.059 27.383 1 1 A TYR 0.730 1 ATOM 53 O O . TYR 1131 1131 ? A 44.190 -0.783 28.063 1 1 A TYR 0.730 1 ATOM 54 C CB . TYR 1131 1131 ? A 44.952 -0.859 25.022 1 1 A TYR 0.730 1 ATOM 55 C CG . TYR 1131 1131 ? A 44.413 -0.743 23.615 1 1 A TYR 0.730 1 ATOM 56 C CD1 . TYR 1131 1131 ? A 45.322 -0.820 22.555 1 1 A TYR 0.730 1 ATOM 57 C CD2 . TYR 1131 1131 ? A 43.046 -0.609 23.307 1 1 A TYR 0.730 1 ATOM 58 C CE1 . TYR 1131 1131 ? A 44.913 -0.647 21.234 1 1 A TYR 0.730 1 ATOM 59 C CE2 . TYR 1131 1131 ? A 42.618 -0.525 21.966 1 1 A TYR 0.730 1 ATOM 60 C CZ . TYR 1131 1131 ? A 43.568 -0.505 20.927 1 1 A TYR 0.730 1 ATOM 61 O OH . TYR 1131 1131 ? A 43.265 -0.415 19.550 1 1 A TYR 0.730 1 ATOM 62 N N . GLU 1132 1132 ? A 46.069 0.442 27.873 1 1 A GLU 0.740 1 ATOM 63 C CA . GLU 1132 1132 ? A 46.652 0.057 29.149 1 1 A GLU 0.740 1 ATOM 64 C C . GLU 1132 1132 ? A 46.592 1.195 30.164 1 1 A GLU 0.740 1 ATOM 65 O O . GLU 1132 1132 ? A 47.237 1.160 31.211 1 1 A GLU 0.740 1 ATOM 66 C CB . GLU 1132 1132 ? A 48.125 -0.386 28.957 1 1 A GLU 0.740 1 ATOM 67 C CG . GLU 1132 1132 ? A 48.966 0.684 28.230 1 1 A GLU 0.740 1 ATOM 68 C CD . GLU 1132 1132 ? A 50.460 0.357 28.213 1 1 A GLU 0.740 1 ATOM 69 O OE1 . GLU 1132 1132 ? A 51.076 0.501 29.284 1 1 A GLU 0.740 1 ATOM 70 O OE2 . GLU 1132 1132 ? A 51.004 0.118 27.105 1 1 A GLU 0.740 1 ATOM 71 N N . LEU 1133 1133 ? 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A 40.111 -2.528 33.045 1 1 A ASN 0.760 1 ATOM 86 O O . ASN 1135 1135 ? A 39.667 -3.640 33.254 1 1 A ASN 0.760 1 ATOM 87 C CB . ASN 1135 1135 ? A 41.894 -2.720 34.804 1 1 A ASN 0.760 1 ATOM 88 C CG . ASN 1135 1135 ? A 41.084 -1.975 35.865 1 1 A ASN 0.760 1 ATOM 89 O OD1 . ASN 1135 1135 ? A 41.317 -0.788 36.133 1 1 A ASN 0.760 1 ATOM 90 N ND2 . ASN 1135 1135 ? A 40.086 -2.643 36.476 1 1 A ASN 0.760 1 ATOM 91 N N . GLU 1136 1136 ? A 39.323 -1.520 32.590 1 1 A GLU 0.800 1 ATOM 92 C CA . GLU 1136 1136 ? A 37.892 -1.642 32.378 1 1 A GLU 0.800 1 ATOM 93 C C . GLU 1136 1136 ? A 37.525 -2.625 31.270 1 1 A GLU 0.800 1 ATOM 94 O O . GLU 1136 1136 ? A 38.145 -2.543 30.211 1 1 A GLU 0.800 1 ATOM 95 C CB . GLU 1136 1136 ? A 37.241 -0.291 32.013 1 1 A GLU 0.800 1 ATOM 96 C CG . GLU 1136 1136 ? A 37.606 0.880 32.954 1 1 A GLU 0.800 1 ATOM 97 C CD . GLU 1136 1136 ? A 38.806 1.657 32.461 1 1 A GLU 0.800 1 ATOM 98 O OE1 . GLU 1136 1136 ? A 39.699 1.095 31.798 1 1 A GLU 0.800 1 ATOM 99 O OE2 . 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A 33.395 -0.615 29.414 1 1 A GLU 0.840 1 ATOM 113 C CD . GLU 1138 1138 ? A 33.361 -1.294 30.788 1 1 A GLU 0.840 1 ATOM 114 O OE1 . GLU 1138 1138 ? A 33.723 -0.598 31.768 1 1 A GLU 0.840 1 ATOM 115 O OE2 . GLU 1138 1138 ? A 33.053 -2.508 30.864 1 1 A GLU 0.840 1 ATOM 116 N N . ARG 1139 1139 ? A 36.837 -1.030 27.760 1 1 A ARG 0.830 1 ATOM 117 C CA . ARG 1139 1139 ? A 37.815 -0.083 27.236 1 1 A ARG 0.830 1 ATOM 118 C C . ARG 1139 1139 ? A 38.273 -0.407 25.822 1 1 A ARG 0.830 1 ATOM 119 O O . ARG 1139 1139 ? A 38.248 0.444 24.936 1 1 A ARG 0.830 1 ATOM 120 C CB . ARG 1139 1139 ? A 39.074 -0.038 28.141 1 1 A ARG 0.830 1 ATOM 121 C CG . ARG 1139 1139 ? A 40.232 0.837 27.604 1 1 A ARG 0.830 1 ATOM 122 C CD . ARG 1139 1139 ? A 41.440 0.887 28.537 1 1 A ARG 0.830 1 ATOM 123 N NE . ARG 1139 1139 ? A 41.066 1.760 29.673 1 1 A ARG 0.830 1 ATOM 124 C CZ . ARG 1139 1139 ? A 41.268 3.084 29.765 1 1 A ARG 0.830 1 ATOM 125 N NH1 . ARG 1139 1139 ? 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LEU 1168 1168 ? A 44.787 12.912 27.284 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 356 C CG . LEU 1168 1168 ? A 43.289 13.247 27.417 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 357 C CD1 . LEU 1168 1168 ? A 42.905 13.649 28.851 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 358 C CD2 . LEU 1168 1168 ? A 42.902 14.343 26.411 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 359 N N . ASP 1169 1169 ? A 43.872 9.924 28.958 1 1 A ASP 0.870 1 ATOM 360 C CA . ASP 1169 1169 ? A 42.941 8.825 28.829 1 1 A ASP 0.870 1 ATOM 361 C C . ASP 1169 1169 ? A 41.628 9.292 28.204 1 1 A ASP 0.870 1 ATOM 362 O O . ASP 1169 1169 ? A 40.709 9.774 28.869 1 1 A ASP 0.870 1 ATOM 363 C CB . ASP 1169 1169 ? A 42.744 8.122 30.198 1 1 A ASP 0.870 1 ATOM 364 C CG . ASP 1169 1169 ? A 42.001 6.809 30.061 1 1 A ASP 0.870 1 ATOM 365 O OD1 . ASP 1169 1169 ? A 41.624 6.424 28.926 1 1 A ASP 0.870 1 ATOM 366 O OD2 . ASP 1169 1169 ? A 41.775 6.156 31.103 1 1 A ASP 0.870 1 ATOM 367 N N . LEU 1170 1170 ? A 41.521 9.138 26.870 1 1 A LEU 0.890 1 ATOM 368 C CA . LEU 1170 1170 ? 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A 43.962 26.068 36.026 1 1 A SER 0.840 1 ATOM 646 C CA . SER 1205 1205 ? A 42.988 26.554 35.049 1 1 A SER 0.840 1 ATOM 647 C C . SER 1205 1205 ? A 43.476 26.405 33.619 1 1 A SER 0.840 1 ATOM 648 O O . SER 1205 1205 ? A 42.697 26.168 32.699 1 1 A SER 0.840 1 ATOM 649 C CB . SER 1205 1205 ? A 42.617 28.038 35.281 1 1 A SER 0.840 1 ATOM 650 O OG . SER 1205 1205 ? A 42.079 28.237 36.592 1 1 A SER 0.840 1 ATOM 651 N N . SER 1206 1206 ? A 44.805 26.514 33.409 1 1 A SER 0.930 1 ATOM 652 C CA . SER 1206 1206 ? A 45.476 26.259 32.136 1 1 A SER 0.930 1 ATOM 653 C C . SER 1206 1206 ? A 45.291 24.815 31.674 1 1 A SER 0.930 1 ATOM 654 O O . SER 1206 1206 ? A 44.901 24.555 30.533 1 1 A SER 0.930 1 ATOM 655 C CB . SER 1206 1206 ? A 46.992 26.599 32.244 1 1 A SER 0.930 1 ATOM 656 O OG . SER 1206 1206 ? A 47.653 26.559 30.980 1 1 A SER 0.930 1 ATOM 657 N N . ALA 1207 1207 ? A 45.477 23.833 32.587 1 1 A ALA 0.930 1 ATOM 658 C CA . ALA 1207 1207 ? A 45.228 22.424 32.341 1 1 A ALA 0.930 1 ATOM 659 C C . ALA 1207 1207 ? A 43.774 22.109 32.001 1 1 A ALA 0.930 1 ATOM 660 O O . ALA 1207 1207 ? A 43.489 21.371 31.059 1 1 A ALA 0.930 1 ATOM 661 C CB . ALA 1207 1207 ? A 45.648 21.615 33.583 1 1 A ALA 0.930 1 ATOM 662 N N . ALA 1208 1208 ? A 42.824 22.716 32.743 1 1 A ALA 0.940 1 ATOM 663 C CA . ALA 1208 1208 ? A 41.399 22.632 32.492 1 1 A ALA 0.940 1 ATOM 664 C C . ALA 1208 1208 ? A 40.975 23.179 31.126 1 1 A ALA 0.940 1 ATOM 665 O O . ALA 1208 1208 ? A 40.228 22.537 30.382 1 1 A ALA 0.940 1 ATOM 666 C CB . ALA 1208 1208 ? A 40.677 23.428 33.597 1 1 A ALA 0.940 1 ATOM 667 N N . SER 1209 1209 ? A 41.491 24.367 30.741 1 1 A SER 0.950 1 ATOM 668 C CA . SER 1209 1209 ? A 41.286 24.960 29.421 1 1 A SER 0.950 1 ATOM 669 C C . SER 1209 1209 ? A 41.839 24.116 28.287 1 1 A SER 0.950 1 ATOM 670 O O . SER 1209 1209 ? A 41.186 23.935 27.261 1 1 A SER 0.950 1 ATOM 671 C CB . SER 1209 1209 ? A 41.928 26.365 29.274 1 1 A SER 0.950 1 ATOM 672 O OG . SER 1209 1209 ? 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GLU 1231 1231 ? A 25.822 5.552 16.597 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 858 O O . GLU 1231 1231 ? A 25.402 6.191 17.562 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 859 C CB . GLU 1231 1231 ? A 27.843 6.827 16.141 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 860 C CG . GLU 1231 1231 ? A 28.766 7.230 14.992 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 861 C CD . GLU 1231 1231 ? A 29.437 6.073 14.260 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 862 O OE1 . GLU 1231 1231 ? A 29.692 6.319 13.065 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 863 O OE2 . GLU 1231 1231 ? A 29.651 4.990 14.850 1 1 A GLU 0.760 1 ATOM 864 N N . PRO 1232 1232 ? A 25.656 4.237 16.560 1 1 A PRO 0.780 1 ATOM 865 C CA . PRO 1232 1232 ? A 25.096 3.522 17.693 1 1 A PRO 0.780 1 ATOM 866 C C . PRO 1232 1232 ? A 26.023 3.686 18.888 1 1 A PRO 0.780 1 ATOM 867 O O . PRO 1232 1232 ? A 27.224 3.758 18.630 1 1 A PRO 0.780 1 ATOM 868 C CB . PRO 1232 1232 ? A 24.973 2.064 17.205 1 1 A PRO 0.780 1 ATOM 869 C CG . PRO 1232 1232 ? A 25.806 1.987 15.917 1 1 A PRO 0.780 1 ATOM 870 C CD . PRO 1232 1232 ? 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PRO 1234 1234 ? A 29.341 4.248 22.098 1 1 A PRO 0.740 1 ATOM 885 O OXT . PRO 1234 1234 ? A 29.960 -0.179 23.349 1 1 A PRO 0.740 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.818 2 1 3 0.064 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1125 GLU 1 0.490 2 1 A 1126 LYS 1 0.520 3 1 A 1127 ILE 1 0.660 4 1 A 1128 THR 1 0.690 5 1 A 1129 LYS 1 0.660 6 1 A 1130 VAL 1 0.810 7 1 A 1131 TYR 1 0.730 8 1 A 1132 GLU 1 0.740 9 1 A 1133 LEU 1 0.790 10 1 A 1134 GLY 1 0.820 11 1 A 1135 ASN 1 0.760 12 1 A 1136 GLU 1 0.800 13 1 A 1137 PRO 1 0.750 14 1 A 1138 GLU 1 0.840 15 1 A 1139 ARG 1 0.830 16 1 A 1140 LYS 1 0.840 17 1 A 1141 LEU 1 0.860 18 1 A 1142 TRP 1 0.830 19 1 A 1143 VAL 1 0.860 20 1 A 1144 ASP 1 0.850 21 1 A 1145 ARG 1 0.850 22 1 A 1146 TYR 1 0.860 23 1 A 1147 LEU 1 0.870 24 1 A 1148 THR 1 0.880 25 1 A 1149 PHE 1 0.850 26 1 A 1150 MET 1 0.830 27 1 A 1151 GLU 1 0.800 28 1 A 1152 GLU 1 0.800 29 1 A 1153 ARG 1 0.790 30 1 A 1154 GLY 1 0.860 31 1 A 1155 SER 1 0.850 32 1 A 1156 PRO 1 0.810 33 1 A 1157 VAL 1 0.810 34 1 A 1158 SER 1 0.700 35 1 A 1159 SER 1 0.650 36 1 A 1160 LEU 1 0.700 37 1 A 1161 PRO 1 0.810 38 1 A 1162 ALA 1 0.830 39 1 A 1163 VAL 1 0.830 40 1 A 1164 GLY 1 0.800 41 1 A 1165 LYS 1 0.720 42 1 A 1166 LYS 1 0.740 43 1 A 1167 PRO 1 0.790 44 1 A 1168 LEU 1 0.820 45 1 A 1169 ASP 1 0.870 46 1 A 1170 LEU 1 0.890 47 1 A 1171 PHE 1 0.880 48 1 A 1172 ARG 1 0.840 49 1 A 1173 LEU 1 0.920 50 1 A 1174 TYR 1 0.880 51 1 A 1175 VAL 1 0.890 52 1 A 1176 CYS 1 0.900 53 1 A 1177 VAL 1 0.910 54 1 A 1178 LYS 1 0.830 55 1 A 1179 GLU 1 0.820 56 1 A 1180 ILE 1 0.810 57 1 A 1181 GLY 1 0.820 58 1 A 1182 GLY 1 0.840 59 1 A 1183 LEU 1 0.830 60 1 A 1184 ALA 1 0.860 61 1 A 1185 GLN 1 0.790 62 1 A 1186 VAL 1 0.870 63 1 A 1187 ASN 1 0.830 64 1 A 1188 LYS 1 0.750 65 1 A 1189 ASN 1 0.810 66 1 A 1190 LYS 1 0.800 67 1 A 1191 LYS 1 0.840 68 1 A 1192 TRP 1 0.850 69 1 A 1193 ARG 1 0.830 70 1 A 1194 GLU 1 0.840 71 1 A 1195 LEU 1 0.880 72 1 A 1196 ALA 1 0.920 73 1 A 1197 THR 1 0.850 74 1 A 1198 ASN 1 0.850 75 1 A 1199 LEU 1 0.860 76 1 A 1200 ASN 1 0.850 77 1 A 1201 VAL 1 0.870 78 1 A 1202 GLY 1 0.880 79 1 A 1203 THR 1 0.860 80 1 A 1204 SER 1 0.840 81 1 A 1205 SER 1 0.840 82 1 A 1206 SER 1 0.930 83 1 A 1207 ALA 1 0.930 84 1 A 1208 ALA 1 0.940 85 1 A 1209 SER 1 0.950 86 1 A 1210 SER 1 0.950 87 1 A 1211 LEU 1 0.920 88 1 A 1212 LYS 1 0.880 89 1 A 1213 LYS 1 0.890 90 1 A 1214 GLN 1 0.880 91 1 A 1215 TYR 1 0.860 92 1 A 1216 ILE 1 0.870 93 1 A 1217 GLN 1 0.830 94 1 A 1218 TYR 1 0.840 95 1 A 1219 LEU 1 0.870 96 1 A 1220 PHE 1 0.810 97 1 A 1221 ALA 1 0.880 98 1 A 1222 PHE 1 0.820 99 1 A 1223 GLU 1 0.800 100 1 A 1224 CYS 1 0.780 101 1 A 1225 LYS 1 0.800 102 1 A 1226 ILE 1 0.770 103 1 A 1227 GLU 1 0.750 104 1 A 1228 ARG 1 0.670 105 1 A 1229 GLY 1 0.730 106 1 A 1230 GLU 1 0.770 107 1 A 1231 GLU 1 0.760 108 1 A 1232 PRO 1 0.780 109 1 A 1233 PRO 1 0.690 110 1 A 1234 PRO 1 0.740 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #