data_SMR-c4ce991e59b2caab6e81e5ea73dc90a2_1 _entry.id SMR-c4ce991e59b2caab6e81e5ea73dc90a2_1 _struct.entry_id SMR-c4ce991e59b2caab6e81e5ea73dc90a2_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - N0DVB2/ N0DVB2_HUMAN, Zinc finger DBF-type containing 2 vesion 1 - Q9HCK1/ ZDBF2_HUMAN, DBF4-type zinc finger-containing protein 2 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries N0DVB2, Q9HCK1' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' ZN non-polymer 'ZINC ION' Zn 65.380 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 308410.826 1 . 2 non-polymer man 'ZINC ION' 65.380 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP ZDBF2_HUMAN Q9HCK1 1 ;MQKRQGYCSYCRVQYNNLEQHLFSAQHRSLTRQSRRQICTSSLMERFLQDVLQHHPYHCQESSSTQDETH VNTGSSSEVVHLDDAFSEEEEEDEDKVEDEDATEERPSEVSEPIEELHSRPHKSQEGTQEVSVRPSVIQK 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1 2354 1 2354 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . ZDBF2_HUMAN Q9HCK1 . 1 2354 9606 'Homo sapiens (Human)' 2008-01-15 4B72E43A76CED774 1 UNP . N0DVB2_HUMAN N0DVB2 . 1 2354 9606 'Homo sapiens (Human)' 2013-06-26 4B72E43A76CED774 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no B ;MQKRQGYCSYCRVQYNNLEQHLFSAQHRSLTRQSRRQICTSSLMERFLQDVLQHHPYHCQESSSTQDETH VNTGSSSEVVHLDDAFSEEEEEDEDKVEDEDATEERPSEVSEPIEELHSRPHKSQEGTQEVSVRPSVIQK LEKGQQQPLEFVHKIGASVRKCNLVDIGQATNNRSNLVRPPVICNAPASCLPESSNDRPVTANTTSLPPA AHLDSVSKCDPNKVEKYLEQPDGASRNPVPSSHVETTSFSYQKHKESNRKSLRMNSDKLVLWKDVKSQGK TLSAGLKFHERMGTKGSLRVKSPSKLAVNPNKTDMPSNKGIFEDTIAKNHEEFFSNMDCTQEEKHLVFNK TAFWEQKCSVSSEMKFDCISLQSASDQPQETAQDLSLWKEEQIDQEDNYESRGSEMSFDCSSSFHSLTDQ SKVSAKEVNLSKEVRTDVQYKNNKSYVSKISSDCDDILHLVTNQSQMIVKEISLQNARHISLVDQSYESS SSETNFDCDASPQSTSDYPQQSVTEVNLPKEVHIGLVDKNYGSSSSEVSADSVFPLQSVVDRPPVAVTET KLRKKAHTSLVDNYGSSCSETSFDCDVSLESVVDHPQLTVKGRNLKGRQVHLKHKKRKPSSAKAHLDCDV 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A 1 2342 THR 2342 ? ? ? B . A 1 2343 ARG 2343 ? ? ? B . A 1 2344 LEU 2344 ? ? ? B . A 1 2345 ALA 2345 ? ? ? B . A 1 2346 ASN 2346 ? ? ? B . A 1 2347 LYS 2347 ? ? ? B . A 1 2348 LEU 2348 ? ? ? B . A 1 2349 ARG 2349 ? ? ? B . A 1 2350 GLY 2350 ? ? ? B . A 1 2351 ASN 2351 ? ? ? B . A 1 2352 GLU 2352 ? ? ? B . A 1 2353 VAL 2353 ? ? ? B . A 1 2354 LYS 2354 ? ? ? B . # # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 ZN 1 3 3 ZN '_' . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Protein DBF4 homolog A {PDB ID=4f99, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=4f99.1.B}' 'template structure' . 2 'ZINC ION {PDB ID=4f99, label_asym_id=E, auth_asym_id=B, SMTL ID=4f99.1._.3}' 'template structure' . 3 . target . 4 'ZINC ION' target . 5 'Target-template alignment by HHblits to 4f99, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 4 7 3 1 8 3 2 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 5 13 4 4 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' 2 4 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B 2 2 'reference database' non-polymer 1 2 B E 5 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GPGTRTGRLKKPFVKVEDMSQLYRPFYLQLTNMPFINYSIQKPCSPFDVDKPSSMQKQTQVKLRIQTDGD KYGGTSIQLQLKEKKKKGYCECCLQKYEDLETHLLSEQHRNFAQSNQYQVVDDIVSKLVFDFVEYEKDTP KKKR ; ;GPGTRTGRLKKPFVKVEDMSQLYRPFYLQLTNMPFINYSIQKPCSPFDVDKPSSMQKQTQVKLRIQTDGD KYGGTSIQLQLKEKKKKGYCECCLQKYEDLETHLLSEQHRNFAQSNQYQVVDDIVSKLVFDFVEYEKDTP KKKR ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 85 135 # # loop_ _ma_template_non_poly.template_id _ma_template_non_poly.comp_id _ma_template_non_poly.details 2 ZN 'ZINC ION' # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4f99 2023-09-13 2 PDB . 4f99 2023-09-13 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2354 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 5 1 2354 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 4.5e-05 29.412 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MQKRQGYCSYCRVQYNNLEQHLFSAQHRSLTRQSRRQICTSSLMERFLQDVLQHHPYHCQESSSTQDETHVNTGSSSEVVHLDDAFSEEEEEDEDKVEDEDATEERPSEVSEPIEELHSRPHKSQEGTQEVSVRPSVIQKLEKGQQQPLEFVHKIGASVRKCNLVDIGQATNNRSNLVRPPVICNAPASCLPESSNDRPVTANTTSLPPAAHLDSVSKCDPNKVEKYLEQPDGASRNPVPSSHVETTSFSYQKHKESNRKSLRMNSDKLVLWKDVKSQGKTLSAGLKFHERMGTKGSLRVKSPSKLAVNPNKTDMPSNKGIFEDTIAKNHEEFFSNMDCTQEEKHLVFNKTAFWEQKCSVSSEMKFDCISLQSASDQPQETAQDLSLWKEEQIDQEDNYESRGSEMSFDCSSSFHSLTDQSKVSAKEVNLSKEVRTDVQYKNNKSYVSKISSDCDDILHLVTNQSQMIVKEISLQNARHISLVDQSYESSSSETNFDCDASPQSTSDYPQQSVTEVNLPKEVHIGLVDKNYGSSSSEVSADSVFPLQSVVDRPPVAVTETKLRKKAHTSLVDNYGSSCSETSFDCDVSLESVVDHPQLTVKGRNLKGRQVHLKHKKRKPSSAKAHLDCDVSLGTVADESQRAVEKINLLKEKNADLMDMNCESHGPEMGFQADAQLADQSQVAEIERQKVDVDLENKSVQSSRSSLSSDSPASLYHSAHDEPQEALDEVNLKELNIDMEVRSYDCSSSELTFDSDPPLLSVTEQSHLDAEGKERHIDLEDESCESDSSEITFDSDIPLYSVIDQPEVAVYEEETVDLESKSNESCVSEITFDSDIPLHSGNDHPEVAVKEVIQKEEYIHLERKNDEPSGSEISSDSHAPLHSVTNSPEVAVKKLNPQKEEQVHLENKENEPIDSEVSLDYNIIFHSVTGRSEDPIKEISLHTKEHMYLENKSVFETSLDSDVPLQAATHKPEVIVKETWLQREKHAEFQGRSTEFSGSKTSLDSGVPHYSVTEPQVAVNKINRKKQYVLENKNDKCSGSEIILDSNVPPQSMTDQPQLAFLKEKHVNLKDKNSKSGDSKITFDSEQLQEAVKKIDQWKEEVIGLKNKINEPSTYKLIHHPDVSVQSVADQPKVAIKHVNLGNENHMYLEVKNSQYSCSEMNLDSGFLGQSIVNRPQITILEQEHIELEGKHNQCCGSEVSFDSDDPLQSVADRLRETVKEISLWKDEEVDTEDRRNEAKGFEIMYDSDVLQPVAGQPEEVVKEVSLWKEHVDLENKIVKPTDSRINFDSHEPLQSVTNKIPGANKEINLLREEHVCLDDKGYVPSDSEIIYVSNIPLQSVIKQPHILEEEHASLEDKSSNSYSPEESSDSNDSFQAAADELQKPVKEINLWKEDHIYLEDKSYKLGDFDVSYASHIPVQFVTDQSSVPVKEINLQKKDHNDLENKNCEVCGSEIKCHSCVHLQSEVDQPQVSYKEADLQKEEHVVMEEKTDQPSDSEMMYDSDVPFQIVVNQFPGSVKETHLPKVVLVDLVPGDSDYEVISDDIPLQLVTDPPQLTVKDISCINTECIDIEDKSCDFFGSEVRCNCKASTPSMTNQCKETFKIINRKKDYIILGEPSCQSCGSEMNFNVDASDQSMTYESQGPDEKMVKYIDSEDKSCGYNGSKGKFNLEDTSHRTTHRLQKAHKEASLRKDPRNAGLKGKSCQSSASAVDFGASSKSALHRRADKKKRSKLKHRDLEVSCEPDGFEMNFQCAPPLPSDTDQPQETVKKRHPCKKVSSDLKEKNHDSQSSSVLKVDSVRNLKKAKDVIEDNPDEPVLEALPHVPPSFVGKTWSQIMREDDIKINALVKEFREGRFHCYFDDDCETKKVSSKGKKKVTWADLQGKEDTAPTQAVSESDDIVCGISDIDDLSVALDKPCHRHPPAERPPKQKGRVASQCQTAKISHSTQTSCKNYPVMKRKIIRQEEDPPKSKCSRLQDDRKTKKKVKIGTVEFPASCTKVLKPMQPKALVCVLSSLNIKLKEGEGLPFPKMRHHSWDNDIRFICKYKRNIFDYYEPLIKQIVISPPLSVIVPEFERRNWVKIHFNRSNQNSSAGDNDADGQGSASAPLMAVPARYGFNSHQGTSDSSLFLEESKVLHARELPKKRNFQLTFLNHDVVKISPKSVRNKLLESQSKKKIHGKRVTTSSNKLGFPKKVYKPIILQQKPRKASEKQSIWIRTKPSDIIRKYISKYSVFLRHRYQSRSAFLGRYLKKKKSVVSRLKKAKRTAKVLLNSSVPPAGAEELSSAMANPPPKRPVRASCRVARRRKKTDESYHGRQKGPSTPVRAYDLRSSSCLQQRERMMTRLANKLRGNEVK 2 1 2 --KKKGYCECCLQKYEDLETHLLSEQHRNFAQSN-QYQVVDDIVSKLVFDFVEY-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4f99.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 6 6 ? A -1.863 26.692 63.183 1 1 B GLY 0.590 1 ATOM 2 C CA . GLY 6 6 ? A -1.296 25.330 62.852 1 1 B GLY 0.590 1 ATOM 3 C C . GLY 6 6 ? A -2.261 24.208 63.165 1 1 B GLY 0.590 1 ATOM 4 O O . GLY 6 6 ? A -3.406 24.463 63.518 1 1 B GLY 0.590 1 ATOM 5 N N . TYR 7 7 ? A -1.844 22.936 63.051 1 1 B TYR 0.470 1 ATOM 6 C CA . TYR 7 7 ? A -2.707 21.800 63.302 1 1 B TYR 0.470 1 ATOM 7 C C . TYR 7 7 ? A -1.875 20.814 64.103 1 1 B TYR 0.470 1 ATOM 8 O O . TYR 7 7 ? A -0.682 20.644 63.846 1 1 B TYR 0.470 1 ATOM 9 C CB . TYR 7 7 ? A -3.211 21.210 61.950 1 1 B TYR 0.470 1 ATOM 10 C CG . TYR 7 7 ? A -3.837 19.847 62.070 1 1 B TYR 0.470 1 ATOM 11 C CD1 . TYR 7 7 ? A -5.175 19.693 62.460 1 1 B TYR 0.470 1 ATOM 12 C CD2 . TYR 7 7 ? A -3.066 18.700 61.813 1 1 B TYR 0.470 1 ATOM 13 C CE1 . TYR 7 7 ? A -5.728 18.414 62.610 1 1 B TYR 0.470 1 ATOM 14 C CE2 . TYR 7 7 ? A -3.623 17.422 61.946 1 1 B TYR 0.470 1 ATOM 15 C CZ . TYR 7 7 ? A -4.955 17.280 62.347 1 1 B TYR 0.470 1 ATOM 16 O OH . TYR 7 7 ? A -5.512 15.994 62.476 1 1 B TYR 0.470 1 ATOM 17 N N . CYS 8 8 ? A -2.467 20.182 65.132 1 1 B CYS 0.910 1 ATOM 18 C CA . CYS 8 8 ? A -1.789 19.182 65.924 1 1 B CYS 0.910 1 ATOM 19 C C . CYS 8 8 ? A -2.204 17.807 65.450 1 1 B CYS 0.910 1 ATOM 20 O O . CYS 8 8 ? A -3.373 17.419 65.506 1 1 B CYS 0.910 1 ATOM 21 C CB . CYS 8 8 ? A -2.087 19.336 67.439 1 1 B CYS 0.910 1 ATOM 22 S SG . CYS 8 8 ? A -1.128 18.180 68.495 1 1 B CYS 0.910 1 ATOM 23 N N . SER 9 9 ? A -1.220 17.016 64.990 1 1 B SER 0.840 1 ATOM 24 C CA . SER 9 9 ? A -1.386 15.644 64.548 1 1 B SER 0.840 1 ATOM 25 C C . SER 9 9 ? A -1.692 14.700 65.702 1 1 B SER 0.840 1 ATOM 26 O O . SER 9 9 ? A -2.305 13.648 65.524 1 1 B SER 0.840 1 ATOM 27 C CB . SER 9 9 ? A -0.105 15.171 63.809 1 1 B SER 0.840 1 ATOM 28 O OG . SER 9 9 ? A 1.038 15.275 64.664 1 1 B SER 0.840 1 ATOM 29 N N . TYR 10 10 ? A -1.281 15.065 66.938 1 1 B TYR 0.810 1 ATOM 30 C CA . TYR 10 10 ? A -1.488 14.238 68.111 1 1 B TYR 0.810 1 ATOM 31 C C . TYR 10 10 ? A -2.920 14.213 68.607 1 1 B TYR 0.810 1 ATOM 32 O O . TYR 10 10 ? A -3.469 13.142 68.885 1 1 B TYR 0.810 1 ATOM 33 C CB . TYR 10 10 ? A -0.594 14.636 69.311 1 1 B TYR 0.810 1 ATOM 34 C CG . TYR 10 10 ? A 0.848 14.442 68.970 1 1 B TYR 0.810 1 ATOM 35 C CD1 . TYR 10 10 ? A 1.413 13.165 69.095 1 1 B TYR 0.810 1 ATOM 36 C CD2 . TYR 10 10 ? A 1.651 15.508 68.535 1 1 B TYR 0.810 1 ATOM 37 C CE1 . TYR 10 10 ? A 2.758 12.949 68.778 1 1 B TYR 0.810 1 ATOM 38 C CE2 . TYR 10 10 ? A 3.002 15.296 68.225 1 1 B TYR 0.810 1 ATOM 39 C CZ . TYR 10 10 ? A 3.552 14.014 68.347 1 1 B TYR 0.810 1 ATOM 40 O OH . TYR 10 10 ? A 4.910 13.781 68.062 1 1 B TYR 0.810 1 ATOM 41 N N . CYS 11 11 ? A -3.531 15.408 68.716 1 1 B CYS 0.940 1 ATOM 42 C CA . CYS 11 11 ? A -4.846 15.623 69.298 1 1 B CYS 0.940 1 ATOM 43 C C . CYS 11 11 ? A -5.912 15.694 68.222 1 1 B CYS 0.940 1 ATOM 44 O O . CYS 11 11 ? A -7.105 15.721 68.510 1 1 B CYS 0.940 1 ATOM 45 C CB . CYS 11 11 ? A -4.881 16.980 70.055 1 1 B CYS 0.940 1 ATOM 46 S SG . CYS 11 11 ? A -3.623 17.178 71.341 1 1 B CYS 0.940 1 ATOM 47 N N . ARG 12 12 ? A -5.475 15.695 66.948 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 48 C CA . ARG 12 12 ? A -6.297 15.745 65.752 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 49 C C . ARG 12 12 ? A -7.161 16.995 65.645 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 50 O O . ARG 12 12 ? A -8.343 16.943 65.308 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 51 C CB . ARG 12 12 ? A -7.121 14.455 65.531 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 52 C CG . ARG 12 12 ? A -6.277 13.175 65.383 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 53 C CD . ARG 12 12 ? A -7.180 11.960 65.176 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 54 N NE . ARG 12 12 ? A -6.309 10.747 65.042 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 55 C CZ . ARG 12 12 ? A -6.800 9.514 64.856 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 56 N NH1 . ARG 12 12 ? A -8.111 9.303 64.777 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 57 N NH2 . ARG 12 12 ? A -5.977 8.473 64.744 1 1 B ARG 0.740 1 ATOM 58 N N . VAL 13 13 ? A -6.560 18.168 65.907 1 1 B VAL 0.810 1 ATOM 59 C CA . VAL 13 13 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #