data_SMR-82f46dd7e7f0146b8a7a4404b4ae4c3d_4 _entry.id SMR-82f46dd7e7f0146b8a7a4404b4ae4c3d_4 _struct.entry_id SMR-82f46dd7e7f0146b8a7a4404b4ae4c3d_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q92793 (isoform 2)/ CBP_HUMAN, CREB-binding protein Estimated model accuracy of this model is 0.007, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q92793 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 304554.746 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CBP_HUMAN Q92793 1 ;MAENLLDGPPNPKRAKLSSPGFSANDSTDFGSLFDLENDLPDELIPNGGELGLLNSGNLVPDAASKHKQL SELLRGGSGSSINPGIGNVSASSPVQQGLGGQAQGQPNSANMASLSAMGKSPLSQGDSSAPSLPKQAAST SGPTPAASQALNPQAQKQVGLATSSPATSQTGPGICMNANFNQTHPGLLNSNSGHSLINQASQGQAQVMN GSLGAAGRGRGAGMPYPTPAMQGASSSVLAETLTQVSPQMTGHAGLNTAQAGGMAKMGITGNTSPFGQPF SQAGGQPMGATGVNPQLASKQSMVNSLPTFPTDIKNTSVTNVPNMSQMQTSVGIVPTQAIATGPTADPEK RKLIQQQLVLLLHAHKCQRREQANGEVRACSLPHCRTMKNVLNHMTHCQAGKACQAILGSPASGIQNTIG SVGTGQQNATSLSNPNPIDPSSMQRAYAALGLPYMNQPQTQLQPQVPGQQPAQPQTHQQMRTLNPLGNNP MNIPAGGITTDQQPPNLISESALPTSLGATNPLMNDGSNSGNIGTLSTIPTAAPPSSTGVRKGWHEHVTQ DLRSHLVHKLVQAIFPTPDPAALKDRRMENLVAYAKKVEGDMYESANSRDEYYHLLAEKIYKIQKELEEK RRSRLHKQGILGNQPALPAPGAQPPVIPQAQPVRPPNGPLSLPVNRMQVSQGMNSFNPMSLGNVQLPQAP MGPRAASPMNHSVQMNSMGSVPGMAISPSRMPQPPNMMGAHTNNMMAQAPAQSQFLPQNQFPSSSGAMSV GMGQPPAQTGVSQGQVPGAALPNPLNMLGPQASQLPCPPVTQSPLHPTPPPASTAAGMPSLQHTTPPGMT PPQPAAPTQPSTPVSSSGQTPTPTPGSVPSATQTQSTPTVQAAAQAQVTPQPQTPVQPPSVATPQSSQQQ PTPVHAQPPGTPLSQAAASIDNRVPTPSSVASAETNSQQPGPDVPVLEMKTETQAEDTEPDPGESKGEPR SEMMEEDLQGASQVKEETDIAEQKSEPMEVDEKKPEVKVEVKEEEESSSNGTASQSTSPSQPRKKIFKPE ELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVW LMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLGYCCGRKYEFSPQTLCCYGKQLCTIPRDAAYY SYQNRYHFCEKCFTEIQGENVTLGDDPSQPQTTISKDQFEKKKNDTLDPEPFVDCKECGRKMHQICVLHY DIIWPSGFVCDNCLKKTGRPRKENKFSAKRLQTTRLGNHLEDRVNKFLRRQNHPEAGEVFVRVVASSDKT VEVKPGMKSRFVDSGEMSESFPYRTKALFAFEEIDGVDVCFFGMHVQEYGSDCPPPNTRRVYISYLDSIH FFRPRCLRTAVYHEILIGYLEYVKKLGYVTGHIWACPPSEGDDYIFHCHPPDQKIPKPKRLQEWYKKMLD KAFAERIIHDYKDIFKQATEDRLTSAKELPYFEGDFWPNVLEESIKELEQEEEERKKEESTAASETTEGS QGDSKNAKKKNNKKTNKNKSSISRANKKKPSMPNVSNDLSQKLYATMEKHKEVFFVIHLHAGPVINTLPP IVDPDPLLSCDLMDGRDAFLTLARDKHWEFSSLRRSKWSTLCMLVELHTQGQDRFVYTCNECKHHVETRW HCTVCEDYDLCINCYNTKSHAHKMVKWGLGLDDEGSSQGEPQSKSPQESRRLSIQRCIQSLVHACQCRNA NCSLPSCQKMKRVVQHTKGCKRKTNGGCPVCKQLIALCCYHAKHCQENKCPVPFCLNIKHKLRQQQIQHR LQQAQLMRRRMATMNTRNVPQQSLPSPTSAPPGTPTQQPSTPQTPQPPAQPQPSPVSMSPAGFPSVARTQ PPTTVSTGKPTSQVPAPPPPAQPPPAAVEAARQIEREAQQQQHLYRVNINNSMPPGRTGMGTPGSQMAPV SLNVPRPNQVSGPVMPSMPPGQWQQAPLPQQQPMPGLPRPVISMQAQAAVAGPRMPSVQPPRSISPSALQ DLLRTLKSPSSPQQQQQVLNILKSNPQLMAAFIKQRTAKYVANQPGMQPQPGLQSQPGMQPQPGMHQQPS LQNLNAMQAGVPRPGVPPQQQAMGGLNPQGQALNIMNPGHNPNMASMNPQYREMLRRQLLQQQQQQQQQQ QQQQQQQQGSAGMAGGMAGHGQFQQPQGPGGYPPAMQQQQRMQQHLPLQGSSMGQMAAQMGQLGQMGQPG LGADSTPNIQQALQQRILQQQQMKQQIGSPGQPNPMSPQQHMLSGQPQASHLPGQQIATSLSNQVRSPAP VQSPRPQSQPPHSSPSPRIQPQPSPHHVSPQTGSPHPGLAVTMASSIDQGHLGNPEQSAMLPQLNTPSRS ALSSELSLVGDTTGDTLEKFVEGL ; 'CREB-binding protein' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2404 1 2404 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CBP_HUMAN Q92793 Q92793-2 1 2404 9606 'Homo sapiens (Human)' 2006-10-17 F95ED9F12B5DEDFB # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MAENLLDGPPNPKRAKLSSPGFSANDSTDFGSLFDLENDLPDELIPNGGELGLLNSGNLVPDAASKHKQL SELLRGGSGSSINPGIGNVSASSPVQQGLGGQAQGQPNSANMASLSAMGKSPLSQGDSSAPSLPKQAAST SGPTPAASQALNPQAQKQVGLATSSPATSQTGPGICMNANFNQTHPGLLNSNSGHSLINQASQGQAQVMN GSLGAAGRGRGAGMPYPTPAMQGASSSVLAETLTQVSPQMTGHAGLNTAQAGGMAKMGITGNTSPFGQPF SQAGGQPMGATGVNPQLASKQSMVNSLPTFPTDIKNTSVTNVPNMSQMQTSVGIVPTQAIATGPTADPEK RKLIQQQLVLLLHAHKCQRREQANGEVRACSLPHCRTMKNVLNHMTHCQAGKACQAILGSPASGIQNTIG SVGTGQQNATSLSNPNPIDPSSMQRAYAALGLPYMNQPQTQLQPQVPGQQPAQPQTHQQMRTLNPLGNNP MNIPAGGITTDQQPPNLISESALPTSLGATNPLMNDGSNSGNIGTLSTIPTAAPPSSTGVRKGWHEHVTQ DLRSHLVHKLVQAIFPTPDPAALKDRRMENLVAYAKKVEGDMYESANSRDEYYHLLAEKIYKIQKELEEK 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A 1 2310 PRO 2310 ? ? ? A . A 1 2311 VAL 2311 ? ? ? A . A 1 2312 GLN 2312 ? ? ? A . A 1 2313 SER 2313 ? ? ? A . A 1 2314 PRO 2314 ? ? ? A . A 1 2315 ARG 2315 ? ? ? A . A 1 2316 PRO 2316 ? ? ? A . A 1 2317 GLN 2317 ? ? ? A . A 1 2318 SER 2318 ? ? ? A . A 1 2319 GLN 2319 ? ? ? A . A 1 2320 PRO 2320 ? ? ? A . A 1 2321 PRO 2321 ? ? ? A . A 1 2322 HIS 2322 ? ? ? A . A 1 2323 SER 2323 ? ? ? A . A 1 2324 SER 2324 ? ? ? A . A 1 2325 PRO 2325 ? ? ? A . A 1 2326 SER 2326 ? ? ? A . A 1 2327 PRO 2327 ? ? ? A . A 1 2328 ARG 2328 ? ? ? A . A 1 2329 ILE 2329 ? ? ? A . A 1 2330 GLN 2330 ? ? ? A . A 1 2331 PRO 2331 ? ? ? A . A 1 2332 GLN 2332 ? ? ? A . A 1 2333 PRO 2333 ? ? ? A . A 1 2334 SER 2334 ? ? ? A . A 1 2335 PRO 2335 ? ? ? A . A 1 2336 HIS 2336 ? ? ? A . A 1 2337 HIS 2337 ? ? ? A . A 1 2338 VAL 2338 ? ? ? A . A 1 2339 SER 2339 ? ? ? A . A 1 2340 PRO 2340 ? ? ? A . A 1 2341 GLN 2341 ? ? ? A . A 1 2342 THR 2342 ? ? ? A . A 1 2343 GLY 2343 ? ? ? A . A 1 2344 SER 2344 ? ? ? A . A 1 2345 PRO 2345 ? ? ? A . A 1 2346 HIS 2346 ? ? ? A . A 1 2347 PRO 2347 ? ? ? A . A 1 2348 GLY 2348 ? ? ? A . A 1 2349 LEU 2349 ? ? ? A . A 1 2350 ALA 2350 ? ? ? A . A 1 2351 VAL 2351 ? ? ? A . A 1 2352 THR 2352 ? ? ? A . A 1 2353 MET 2353 ? ? ? A . A 1 2354 ALA 2354 ? ? ? A . A 1 2355 SER 2355 ? ? ? A . A 1 2356 SER 2356 ? ? ? A . A 1 2357 ILE 2357 ? ? ? A . A 1 2358 ASP 2358 ? ? ? A . A 1 2359 GLN 2359 ? ? ? A . A 1 2360 GLY 2360 ? ? ? A . A 1 2361 HIS 2361 ? ? ? A . A 1 2362 LEU 2362 ? ? ? A . A 1 2363 GLY 2363 ? ? ? A . A 1 2364 ASN 2364 ? ? ? A . A 1 2365 PRO 2365 ? ? ? A . A 1 2366 GLU 2366 ? ? ? A . A 1 2367 GLN 2367 ? ? ? A . A 1 2368 SER 2368 ? ? ? A . A 1 2369 ALA 2369 ? ? ? A . A 1 2370 MET 2370 ? ? ? A . A 1 2371 LEU 2371 ? ? ? A . A 1 2372 PRO 2372 ? ? ? A . A 1 2373 GLN 2373 ? ? ? A . A 1 2374 LEU 2374 ? ? ? A . A 1 2375 ASN 2375 ? ? ? A . A 1 2376 THR 2376 ? ? ? A . A 1 2377 PRO 2377 ? ? ? A . A 1 2378 SER 2378 ? ? ? A . A 1 2379 ARG 2379 ? ? ? A . A 1 2380 SER 2380 ? ? ? A . A 1 2381 ALA 2381 ? ? ? A . A 1 2382 LEU 2382 ? ? ? A . A 1 2383 SER 2383 ? ? ? A . A 1 2384 SER 2384 ? ? ? A . A 1 2385 GLU 2385 ? ? ? A . A 1 2386 LEU 2386 ? ? ? A . A 1 2387 SER 2387 ? ? ? A . A 1 2388 LEU 2388 ? ? ? A . A 1 2389 VAL 2389 ? ? ? A . A 1 2390 GLY 2390 ? ? ? A . A 1 2391 ASP 2391 ? ? ? A . A 1 2392 THR 2392 ? ? ? A . A 1 2393 THR 2393 ? ? ? A . A 1 2394 GLY 2394 ? ? ? A . A 1 2395 ASP 2395 ? ? ? A . A 1 2396 THR 2396 ? ? ? A . A 1 2397 LEU 2397 ? ? ? A . A 1 2398 GLU 2398 ? ? ? A . A 1 2399 LYS 2399 ? ? ? A . A 1 2400 PHE 2400 ? ? ? A . A 1 2401 VAL 2401 ? ? ? A . A 1 2402 GLU 2402 ? ? ? A . A 1 2403 GLY 2403 ? ? ? A . A 1 2404 LEU 2404 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'CREB-binding protein {PDB ID=2lqi, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=2lqi.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 2lqi, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GVRKGWHEHVTQDLRSHLVHKLVQAIFPTPDPAALKDRRMENLVAYAKKVEGDMYESANSRDEYYHLLAE KIYKIQKELEEKRRSRL ; ;GVRKGWHEHVTQDLRSHLVHKLVQAIFPTPDPAALKDRRMENLVAYAKKVEGDMYESANSRDEYYHLLAE KIYKIQKELEEKRRSRL ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 87 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 2lqi 2024-05-15 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2404 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2404 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 1.37e-53 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAENLLDGPPNPKRAKLSSPGFSANDSTDFGSLFDLENDLPDELIPNGGELGLLNSGNLVPDAASKHKQLSELLRGGSGSSINPGIGNVSASSPVQQGLGGQAQGQPNSANMASLSAMGKSPLSQGDSSAPSLPKQAASTSGPTPAASQALNPQAQKQVGLATSSPATSQTGPGICMNANFNQTHPGLLNSNSGHSLINQASQGQAQVMNGSLGAAGRGRGAGMPYPTPAMQGASSSVLAETLTQVSPQMTGHAGLNTAQAGGMAKMGITGNTSPFGQPFSQAGGQPMGATGVNPQLASKQSMVNSLPTFPTDIKNTSVTNVPNMSQMQTSVGIVPTQAIATGPTADPEKRKLIQQQLVLLLHAHKCQRREQANGEVRACSLPHCRTMKNVLNHMTHCQAGKACQAILGSPASGIQNTIGSVGTGQQNATSLSNPNPIDPSSMQRAYAALGLPYMNQPQTQLQPQVPGQQPAQPQTHQQMRTLNPLGNNPMNIPAGGITTDQQPPNLISESALPTSLGATNPLMNDGSNSGNIGTLSTIPTAAPPSSTGVRKGWHEHVTQDLRSHLVHKLVQAIFPTPDPAALKDRRMENLVAYAKKVEGDMYESANSRDEYYHLLAEKIYKIQKELEEKRRSRLHKQGILGNQPALPAPGAQPPVIPQAQPVRPPNGPLSLPVNRMQVSQGMNSFNPMSLGNVQLPQAPMGPRAASPMNHSVQMNSMGSVPGMAISPSRMPQPPNMMGAHTNNMMAQAPAQSQFLPQNQFPSSSGAMSVGMGQPPAQTGVSQGQVPGAALPNPLNMLGPQASQLPCPPVTQSPLHPTPPPASTAAGMPSLQHTTPPGMTPPQPAAPTQPSTPVSSSGQTPTPTPGSVPSATQTQSTPTVQAAAQAQVTPQPQTPVQPPSVATPQSSQQQPTPVHAQPPGTPLSQAAASIDNRVPTPSSVASAETNSQQPGPDVPVLEMKTETQAEDTEPDPGESKGEPRSEMMEEDLQGASQVKEETDIAEQKSEPMEVDEKKPEVKVEVKEEEESSSNGTASQSTSPSQPRKKIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLGYCCGRKYEFSPQTLCCYGKQLCTIPRDAAYYSYQNRYHFCEKCFTEIQGENVTLGDDPSQPQTTISKDQFEKKKNDTLDPEPFVDCKECGRKMHQICVLHYDIIWPSGFVCDNCLKKTGRPRKENKFSAKRLQTTRLGNHLEDRVNKFLRRQNHPEAGEVFVRVVASSDKTVEVKPGMKSRFVDSGEMSESFPYRTKALFAFEEIDGVDVCFFGMHVQEYGSDCPPPNTRRVYISYLDSIHFFRPRCLRTAVYHEILIGYLEYVKKLGYVTGHIWACPPSEGDDYIFHCHPPDQKIPKPKRLQEWYKKMLDKAFAERIIHDYKDIFKQATEDRLTSAKELPYFEGDFWPNVLEESIKELEQEEEERKKEESTAASETTEGSQGDSKNAKKKNNKKTNKNKSSISRANKKKPSMPNVSNDLSQKLYATMEKHKEVFFVIHLHAGPVINTLPPIVDPDPLLSCDLMDGRDAFLTLARDKHWEFSSLRRSKWSTLCMLVELHTQGQDRFVYTCNECKHHVETRWHCTVCEDYDLCINCYNTKSHAHKMVKWGLGLDDEGSSQGEPQSKSPQESRRLSIQRCIQSLVHACQCRNANCSLPSCQKMKRVVQHTKGCKRKTNGGCPVCKQLIALCCYHAKHCQENKCPVPFCLNIKHKLRQQQIQHRLQQAQLMRRRMATMNTRNVPQQSLPSPTSAPPGTPTQQPSTPQTPQPPAQPQPSPVSMSPAGFPSVARTQPPTTVSTGKPTSQVPAPPPPAQPPPAAVEAARQIEREAQQQQHLYRVNINNSMPPGRTGMGTPGSQMAPVSLNVPRPNQVSGPVMPSMPPGQWQQAPLPQQQPMPGLPRPVISMQAQAAVAGPRMPSVQPPRSISPSALQDLLRTLKSPSSPQQQQQVLNILKSNPQLMAAFIKQRTAKYVANQPGMQPQPGLQSQPGMQPQPGMHQQPSLQNLNAMQAGVPRPGVPPQQQAMGGLNPQGQALNIMNPGHNPNMASMNPQYREMLRRQLLQQQQQQQQQQQQQQQQQQGSAGMAGGMAGHGQFQQPQGPGGYPPAMQQQQRMQQHLPLQGSSMGQMAAQMGQLGQMGQPGLGADSTPNIQQALQQRILQQQQMKQQIGSPGQPNPMSPQQHMLSGQPQASHLPGQQIATSLSNQVRSPAPVQSPRPQSQPPHSSPSPRIQPQPSPHHVSPQTGSPHPGLAVTMASSIDQGHLGNPEQSAMLPQLNTPSRSALSSELSLVGDTTGDTLEKFVEGL 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GVRKGWHEHVTQDLRSHLVHKLVQAIFPTPDPAALKDRRMENLVAYAKKVEGDMYESANSRDEYYHLLAEKIYKIQKELEEKRRSRL----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 2lqi.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A -20.523 7.155 10.972 1 1 A ARG 0.270 1 ATOM 16 C CB . ARG 551 551 ? A -21.916 5.619 12.989 1 1 A ARG 0.270 1 ATOM 17 C CG . ARG 551 551 ? A -22.388 4.606 14.058 1 1 A ARG 0.270 1 ATOM 18 C CD . ARG 551 551 ? A -21.647 4.605 15.400 1 1 A ARG 0.270 1 ATOM 19 N NE . ARG 551 551 ? A -21.754 6.012 15.901 1 1 A ARG 0.270 1 ATOM 20 C CZ . ARG 551 551 ? A -21.234 6.462 17.050 1 1 A ARG 0.270 1 ATOM 21 N NH1 . ARG 551 551 ? A -20.552 5.646 17.845 1 1 A ARG 0.270 1 ATOM 22 N NH2 . ARG 551 551 ? A -21.426 7.724 17.426 1 1 A ARG 0.270 1 ATOM 23 N N . LYS 552 552 ? A -19.747 5.169 10.259 1 1 A LYS 0.570 1 ATOM 24 C CA . LYS 552 552 ? A -19.538 5.605 8.917 1 1 A LYS 0.570 1 ATOM 25 C C . LYS 552 552 ? A -20.080 4.550 7.979 1 1 A LYS 0.570 1 ATOM 26 O O . LYS 552 552 ? A -19.415 3.580 7.614 1 1 A LYS 0.570 1 ATOM 27 C CB . LYS 552 552 ? A -18.039 5.940 8.711 1 1 A LYS 0.570 1 ATOM 28 C CG . LYS 552 552 ? A -16.989 4.877 9.111 1 1 A LYS 0.570 1 ATOM 29 C CD . LYS 552 552 ? 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LEU 562 562 ? A -9.055 -3.079 -1.808 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 114 C CB . LEU 562 562 ? A -12.418 -2.922 -2.317 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 115 C CG . LEU 562 562 ? A -12.106 -1.481 -2.825 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 116 C CD1 . LEU 562 562 ? A -11.468 -0.536 -1.784 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 117 C CD2 . LEU 562 562 ? A -11.268 -1.469 -4.119 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 118 N N . ARG 563 563 ? A -10.383 -3.444 -0.047 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 119 C CA . ARG 563 563 ? A -9.374 -3.025 0.902 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 120 C C . ARG 563 563 ? A -8.133 -3.904 0.920 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 121 O O . ARG 563 563 ? A -7.023 -3.406 0.865 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 122 C CB . ARG 563 563 ? A -9.968 -2.825 2.331 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 123 C CG . ARG 563 563 ? A -10.704 -4.045 2.914 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 124 C CD . ARG 563 563 ? A -11.801 -3.720 3.931 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 125 N NE . ARG 563 563 ? A -11.073 -3.257 5.134 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 126 C CZ . ARG 563 563 ? A -11.676 -2.833 6.249 1 1 A ARG 0.720 1 ATOM 127 N NH1 . 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A -7.362 -6.557 -5.923 1 1 A HIS 0.770 1 ATOM 142 C CD2 . HIS 565 565 ? A -6.792 -4.415 -6.233 1 1 A HIS 0.770 1 ATOM 143 C CE1 . HIS 565 565 ? A -7.148 -6.360 -7.194 1 1 A HIS 0.770 1 ATOM 144 N NE2 . HIS 565 565 ? A -6.794 -5.079 -7.444 1 1 A HIS 0.770 1 ATOM 145 N N . LEU 566 566 ? A -6.017 -3.194 -2.256 1 1 A LEU 0.790 1 ATOM 146 C CA . LEU 566 566 ? A -5.194 -2.016 -2.055 1 1 A LEU 0.790 1 ATOM 147 C C . LEU 566 566 ? A -4.041 -2.317 -1.114 1 1 A LEU 0.790 1 ATOM 148 O O . LEU 566 566 ? A -2.893 -2.056 -1.449 1 1 A LEU 0.790 1 ATOM 149 C CB . LEU 566 566 ? A -6.040 -0.874 -1.474 1 1 A LEU 0.790 1 ATOM 150 C CG . LEU 566 566 ? A -6.940 -0.082 -2.453 1 1 A LEU 0.790 1 ATOM 151 C CD1 . LEU 566 566 ? A -7.457 -0.817 -3.708 1 1 A LEU 0.790 1 ATOM 152 C CD2 . LEU 566 566 ? A -8.121 0.432 -1.627 1 1 A LEU 0.790 1 ATOM 153 N N . VAL 567 567 ? A -4.321 -2.996 0.025 1 1 A VAL 0.810 1 ATOM 154 C CA . VAL 567 567 ? A -3.363 -3.539 0.990 1 1 A VAL 0.810 1 ATOM 155 C C . VAL 567 567 ? 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A 2.794 -14.101 -1.115 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 282 C CA . LYS 584 584 ? A 1.969 -15.135 -0.519 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 283 C C . LYS 584 584 ? A 2.857 -15.983 0.372 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 284 O O . LYS 584 584 ? A 2.561 -17.135 0.689 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 285 C CB . LYS 584 584 ? A 1.304 -15.996 -1.629 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 286 C CG . LYS 584 584 ? A 2.297 -16.623 -2.631 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 287 C CD . LYS 584 584 ? A 1.652 -17.146 -3.927 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 288 C CE . LYS 584 584 ? A 1.099 -16.003 -4.791 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 289 N NZ . LYS 584 584 ? A 0.521 -16.536 -6.040 1 1 A LYS 0.610 1 ATOM 290 N N . ASP 585 585 ? A 3.993 -15.394 0.779 1 1 A ASP 0.640 1 ATOM 291 C CA . ASP 585 585 ? A 5.060 -15.968 1.554 1 1 A ASP 0.640 1 ATOM 292 C C . ASP 585 585 ? A 4.816 -15.787 3.066 1 1 A ASP 0.640 1 ATOM 293 O O . ASP 585 585 ? A 3.853 -15.171 3.505 1 1 A ASP 0.640 1 ATOM 294 C CB . ASP 585 585 ? A 6.332 -15.271 0.986 1 1 A ASP 0.640 1 ATOM 295 C CG . ASP 585 585 ? 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A 2.510 -10.040 4.603 1 1 A MET 0.680 1 ATOM 324 C CB . MET 588 588 ? A 3.193 -12.183 2.254 1 1 A MET 0.680 1 ATOM 325 C CG . MET 588 588 ? A 1.654 -12.033 2.127 1 1 A MET 0.680 1 ATOM 326 S SD . MET 588 588 ? A 0.955 -10.419 1.654 1 1 A MET 0.680 1 ATOM 327 C CE . MET 588 588 ? A 2.149 -9.703 0.509 1 1 A MET 0.680 1 ATOM 328 N N . GLU 589 589 ? A 2.929 -12.007 5.619 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 329 C CA . GLU 589 589 ? A 2.136 -11.677 6.805 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 330 C C . GLU 589 589 ? A 2.566 -10.369 7.484 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 331 O O . GLU 589 589 ? A 1.733 -9.540 7.823 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 332 C CB . GLU 589 589 ? A 2.034 -12.809 7.874 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 333 C CG . GLU 589 589 ? A 3.271 -13.035 8.786 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 334 C CD . GLU 589 589 ? A 2.944 -13.864 10.028 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 335 O OE1 . GLU 589 589 ? A 2.750 -15.097 9.887 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 336 O OE2 . GLU 589 589 ? A 2.900 -13.252 11.126 1 1 A GLU 0.710 1 ATOM 337 N N . ASN 590 590 ? 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A 24.608 9.945 -2.543 1 1 A LEU 0.130 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #