data_SMR-82853333bc3af563304d768abcf4da8b_8 _entry.id SMR-82853333bc3af563304d768abcf4da8b_8 _struct.entry_id SMR-82853333bc3af563304d768abcf4da8b_8 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q60952/ CP250_MOUSE, Centrosome-associated protein CEP250 Estimated model accuracy of this model is 0.003, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q60952' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 320670.027 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CP250_MOUSE Q60952 1 ;METGSPGLNMKPQSLQLVLEGQVLALQQQMAENQAASWRKLKNSQEAQKRQATLVRKLQAKVLQYRSWCQ DLEKRLEATGGLIPQRWESVEEPNLEQLLIRLEEEQQRCESLVEVNTELRLHMEKADVVNKALQEDVEKL TVDWSRARDELVRKESQWRMEQEFFKGYLRGEHGRLLNLWREVVTFRRHFLKMKSATDRDLTELKAEHAR LSGSLLTCCLRLTLRAQSRESSGSGRTEESEPARLLLLVAKTQALEKEAHEKSQELMQLKSHGDLEKAEL QDRVTELSALLTQSQKQNEDYEKMVKALRETMEILETNHAELMEHEASLSRNAQEEKLSLQQVIKAITQA LASVEEEDTVTQSSGHEDSLQSDCNGLSQFDPQDPDRALTLVQSVLTRRQQAVQDLRQQLSGCQEAMSFL QQQHDQWEEEGRALREKLQKLTGERDALAGQTVGLQGEVDSLSRERELLQKARGELQQQLEVLEQEAWRL RRMNMELQLQGDSAQGEKLEQQEELHLAVRERERLQETLVGLEAKQSESLSELLTLREALESSRLEGELL KQERVEVAAALARAEQSIVELSGSENSLKAEVADLRAAAVKLGALNEALALDKVELNQQLLQLEQENQSL CSRVEAAEQLRSALQVDLAEAERRREALWEKKTQLETQLQKAEEAGAELQAELRGTREEKEELKDKLSEA HHQQETATAHLEQLHQDAERQEETLARAVQEKEALVRERAALEVRLQAVERDRQDLTEHVLGLRSAKEQL ESNLFEAQQQNSVIQVTKGQLEVQIQTIIQAKEVIQGEVKCLKLELDAERTRAEQEWDAVARQLAQAEQE GQASLERQKVAHEEEVNRLQEKWEKERSWLQQELDKTLETLERERAELETKLREQQTEMEAIRAQREEER SQADSALYQMQLETEKERVSLLETLLRTQKELADASQQLERLRQDMKIQKLKEQETTGMLQAQLQETQQE LKEAAQQHRDDLAAFQKDKLDLQKQVEDLMSQLVAHDDSQRLVKEEIEEKVKVAQECSRIQKELEKENAS LALSLVEKEKRLLILQEADSVRQQELSSLRQDIQEAQEGQRELGVQVELLRQEVKEKEADFVAREAQLLE ELEASRVAEQQLRASLWAQEAKATQLQLQLRSTESQLEALVAEQQPENQAQAQLASLCSVLQQALGSACE SRPELRGGGDSAPTLWGPDPDQNGASRLFKRWSLPTALSPEAVALALQKLHQDVWKARQARDDLRDQVQK LVQRLTDTEAQKSQVHSELQDLQRQLSQSQEEKSKWEGRQNSLESELRDLHETAASLQSRLRQAELQKME AQNDRELLQASKEKLSAQVEHLQACVAEAQAQADAAAVLEEDLRTARSALKLKNEELESERERAQALQEQ GELKVAQGKALQENLALLAQTLSNREREVETLQAEVQELEKQREMQKAALELLSLDLKKRSREVDLQQEQ IQELEQCRSVLEHLPMAVQEREQKLSVQRDQIRELENDREAQRSVLEHQLLDLEQKAQVIESQRGQIQDL KKQLGTLECLALELEESHHKVESQQKMITELEGQREMQRVALTHLTLDLEERSQELQAQSSQLHELENHS THLAKELQERDQEVTSQRQQIDELQKQQEQLAQALERKGQELVLQKERIQVLEDQRTLQTKILEEDLEQI KHSLRERSQELASQWQLVHERADDGKSPSKGQRGSLEHLKLILRDKEKEVECQQERIQELQGHMGQLEQQ LQGLHRKVGETSLLLTHREQETATLQQHLQEAKEQGELREQVLQGQLEEAQRDLAQRDHELETLRQEKQQ TQDQEESMKLKTSALQAALEQAHATLKERQGELEEHREQVRRLQEELEVEGRQVRALEEVLGDLRAESRE HEKAVLALQQRCAEQAQEHEAEARTLQDSWLQAQATLTEQEQELAALRAENQYSRRQEEAAVSQAEALQE ALSKAQAALQEKEQSLLEQAELSHTLEASTAALQATLDTCQASARQLEEALRIREGEIQAQALQHHEVTQ HLQQELCQKKEELRQLLEKAGARRSQENGIQEKQSLEQERQEETRRLLESLKELQLTVAQREEEILMLRE ASSPRHRALPAEKPALQPLPAQQELERLQTALRQTEAREIEWREKAQDLALSLAQSKASISSLQEITMFL QASVLERESEQQRLQEELVLSRQALEEQQSGGPHSTSRADQGPKVGQGSQSGEVETEPSPGVEEKERLTQ RLERLQQAVAELEVDRSKLQCHNAQLRTALEQVERERRKLKRDSVRASRAGSLEARETMTSSPTQQDGRG SQRGSSDSVLVVELQREVALLRAQLALERKQRQDYIARSVQTSRELAGLHHSLSHSLLTVAQAPEATVLE AETRKLDESLNQSLTSPGPCLLHPSLDTTQNTHR ; 'Centrosome-associated protein CEP250' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2414 1 2414 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . CP250_MOUSE Q60952 . 1 2414 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2011-07-27 7B76E9E781D731CC # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no L ;METGSPGLNMKPQSLQLVLEGQVLALQQQMAENQAASWRKLKNSQEAQKRQATLVRKLQAKVLQYRSWCQ DLEKRLEATGGLIPQRWESVEEPNLEQLLIRLEEEQQRCESLVEVNTELRLHMEKADVVNKALQEDVEKL TVDWSRARDELVRKESQWRMEQEFFKGYLRGEHGRLLNLWREVVTFRRHFLKMKSATDRDLTELKAEHAR LSGSLLTCCLRLTLRAQSRESSGSGRTEESEPARLLLLVAKTQALEKEAHEKSQELMQLKSHGDLEKAEL QDRVTELSALLTQSQKQNEDYEKMVKALRETMEILETNHAELMEHEASLSRNAQEEKLSLQQVIKAITQA LASVEEEDTVTQSSGHEDSLQSDCNGLSQFDPQDPDRALTLVQSVLTRRQQAVQDLRQQLSGCQEAMSFL QQQHDQWEEEGRALREKLQKLTGERDALAGQTVGLQGEVDSLSRERELLQKARGELQQQLEVLEQEAWRL RRMNMELQLQGDSAQGEKLEQQEELHLAVRERERLQETLVGLEAKQSESLSELLTLREALESSRLEGELL KQERVEVAAALARAEQSIVELSGSENSLKAEVADLRAAAVKLGALNEALALDKVELNQQLLQLEQENQSL 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A 1 2278 ARG 2278 ? ? ? L . A 1 2279 LYS 2279 ? ? ? L . A 1 2280 LEU 2280 ? ? ? L . A 1 2281 LYS 2281 ? ? ? L . A 1 2282 ARG 2282 ? ? ? L . A 1 2283 ASP 2283 ? ? ? L . A 1 2284 SER 2284 ? ? ? L . A 1 2285 VAL 2285 ? ? ? L . A 1 2286 ARG 2286 ? ? ? L . A 1 2287 ALA 2287 ? ? ? L . A 1 2288 SER 2288 ? ? ? L . A 1 2289 ARG 2289 ? ? ? L . A 1 2290 ALA 2290 ? ? ? L . A 1 2291 GLY 2291 ? ? ? L . A 1 2292 SER 2292 ? ? ? L . A 1 2293 LEU 2293 ? ? ? L . A 1 2294 GLU 2294 ? ? ? L . A 1 2295 ALA 2295 ? ? ? L . A 1 2296 ARG 2296 ? ? ? L . A 1 2297 GLU 2297 ? ? ? L . A 1 2298 THR 2298 ? ? ? L . A 1 2299 MET 2299 ? ? ? L . A 1 2300 THR 2300 ? ? ? L . A 1 2301 SER 2301 ? ? ? L . A 1 2302 SER 2302 ? ? ? L . A 1 2303 PRO 2303 ? ? ? L . A 1 2304 THR 2304 ? ? ? L . A 1 2305 GLN 2305 ? ? ? L . A 1 2306 GLN 2306 ? ? ? L . A 1 2307 ASP 2307 ? ? ? L . A 1 2308 GLY 2308 ? ? ? L . A 1 2309 ARG 2309 ? ? ? L . A 1 2310 GLY 2310 ? ? ? L . A 1 2311 SER 2311 ? ? ? L . A 1 2312 GLN 2312 ? ? ? L . A 1 2313 ARG 2313 ? ? ? L . A 1 2314 GLY 2314 ? ? ? L . A 1 2315 SER 2315 ? ? ? L . A 1 2316 SER 2316 ? ? ? L . A 1 2317 ASP 2317 ? ? ? L . A 1 2318 SER 2318 ? ? ? L . A 1 2319 VAL 2319 ? ? ? L . A 1 2320 LEU 2320 ? ? ? L . A 1 2321 VAL 2321 ? ? ? L . A 1 2322 VAL 2322 ? ? ? L . A 1 2323 GLU 2323 ? ? ? L . A 1 2324 LEU 2324 ? ? ? L . A 1 2325 GLN 2325 ? ? ? L . A 1 2326 ARG 2326 ? ? ? L . A 1 2327 GLU 2327 ? ? ? L . A 1 2328 VAL 2328 ? ? ? L . A 1 2329 ALA 2329 ? ? ? L . A 1 2330 LEU 2330 ? ? ? L . A 1 2331 LEU 2331 ? ? ? L . A 1 2332 ARG 2332 ? ? ? L . A 1 2333 ALA 2333 ? ? ? L . A 1 2334 GLN 2334 ? ? ? L . A 1 2335 LEU 2335 ? ? ? L . A 1 2336 ALA 2336 ? ? ? L . A 1 2337 LEU 2337 ? ? ? L . A 1 2338 GLU 2338 ? ? ? L . A 1 2339 ARG 2339 ? ? ? L . A 1 2340 LYS 2340 ? ? ? L . A 1 2341 GLN 2341 ? ? ? L . A 1 2342 ARG 2342 ? ? ? L . A 1 2343 GLN 2343 ? ? ? L . A 1 2344 ASP 2344 ? ? ? L . A 1 2345 TYR 2345 ? ? ? L . A 1 2346 ILE 2346 ? ? ? L . A 1 2347 ALA 2347 ? ? ? L . A 1 2348 ARG 2348 ? ? ? L . A 1 2349 SER 2349 ? ? ? L . A 1 2350 VAL 2350 ? ? ? L . A 1 2351 GLN 2351 ? ? ? L . A 1 2352 THR 2352 ? ? ? L . A 1 2353 SER 2353 ? ? ? L . A 1 2354 ARG 2354 ? ? ? L . A 1 2355 GLU 2355 ? ? ? L . A 1 2356 LEU 2356 ? ? ? L . A 1 2357 ALA 2357 ? ? ? L . A 1 2358 GLY 2358 ? ? ? L . A 1 2359 LEU 2359 ? ? ? L . A 1 2360 HIS 2360 ? ? ? L . A 1 2361 HIS 2361 ? ? ? L . A 1 2362 SER 2362 ? ? ? L . A 1 2363 LEU 2363 ? ? ? L . A 1 2364 SER 2364 ? ? ? L . A 1 2365 HIS 2365 ? ? ? L . A 1 2366 SER 2366 ? ? ? L . A 1 2367 LEU 2367 ? ? ? L . A 1 2368 LEU 2368 ? ? ? L . A 1 2369 THR 2369 ? ? ? L . A 1 2370 VAL 2370 ? ? ? L . A 1 2371 ALA 2371 ? ? ? L . A 1 2372 GLN 2372 ? ? ? L . A 1 2373 ALA 2373 ? ? ? L . A 1 2374 PRO 2374 ? ? ? L . A 1 2375 GLU 2375 ? ? ? L . A 1 2376 ALA 2376 ? ? ? L . A 1 2377 THR 2377 ? ? ? L . A 1 2378 VAL 2378 ? ? ? L . A 1 2379 LEU 2379 ? ? ? L . A 1 2380 GLU 2380 ? ? ? L . A 1 2381 ALA 2381 ? ? ? L . A 1 2382 GLU 2382 ? ? ? L . A 1 2383 THR 2383 ? ? ? L . A 1 2384 ARG 2384 ? ? ? L . A 1 2385 LYS 2385 ? ? ? L . A 1 2386 LEU 2386 ? ? ? L . A 1 2387 ASP 2387 ? ? ? L . A 1 2388 GLU 2388 ? ? ? L . A 1 2389 SER 2389 ? ? ? L . A 1 2390 LEU 2390 ? ? ? L . A 1 2391 ASN 2391 ? ? ? L . A 1 2392 GLN 2392 ? ? ? L . A 1 2393 SER 2393 ? ? ? L . A 1 2394 LEU 2394 ? ? ? L . A 1 2395 THR 2395 ? ? ? L . A 1 2396 SER 2396 ? ? ? L . A 1 2397 PRO 2397 ? ? ? L . A 1 2398 GLY 2398 ? ? ? L . A 1 2399 PRO 2399 ? ? ? L . A 1 2400 CYS 2400 ? ? ? L . A 1 2401 LEU 2401 ? ? ? L . A 1 2402 LEU 2402 ? ? ? L . A 1 2403 HIS 2403 ? ? ? L . A 1 2404 PRO 2404 ? ? ? L . A 1 2405 SER 2405 ? ? ? L . A 1 2406 LEU 2406 ? ? ? L . A 1 2407 ASP 2407 ? ? ? L . A 1 2408 THR 2408 ? ? ? L . A 1 2409 THR 2409 ? ? ? L . A 1 2410 GLN 2410 ? ? ? L . A 1 2411 ASN 2411 ? ? ? L . A 1 2412 THR 2412 ? ? ? L . A 1 2413 HIS 2413 ? ? ? L . A 1 2414 ARG 2414 ? ? ? L . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Tropomyosin alpha-1 chain {PDB ID=7nep, label_asym_id=L, auth_asym_id=P, SMTL ID=7nep.1.L}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7nep, label_asym_id=L' 'target-template alignment' . 4 'model 8' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A L 2 1 P # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;LKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEKLELAEKKATD AEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKE AKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDK YEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELY ; ;LKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEKLELAEKKATD AEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKE AKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDK YEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELY ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 55 250 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7nep 2024-05-01 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2414 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2414 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 7.5e-05 16.837 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 METGSPGLNMKPQSLQLVLEGQVLALQQQMAENQAASWRKLKNSQEAQKRQATLVRKLQAKVLQYRSWCQDLEKRLEATGGLIPQRWESVEEPNLEQLLIRLEEEQQRCESLVEVNTELRLHMEKADVVNKALQEDVEKLTVDWSRARDELVRKESQWRMEQEFFKGYLRGEHGRLLNLWREVVTFRRHFLKMKSATDRDLTELKAEHARLSGSLLTCCLRLTLRAQSRESSGSGRTEESEPARLLLLVAKTQALEKEAHEKSQELMQLKSHGDLEKAELQDRVTELSALLTQSQKQNEDYEKMVKALRETMEILETNHAELMEHEASLSRNAQEEKLSLQQVIKAITQALASVEEEDTVTQSSGHEDSLQSDCNGLSQFDPQDPDRALTLVQSVLTRRQQAVQDLRQQLSGCQEAMSFLQQQHDQWEEEGRALREKLQKLTGERDALAGQTVGLQGEVDSLSRERELLQKARGELQQQLEVLEQEAWRLRRMNMELQLQGDSAQGEKLEQQEELHLAVRERERLQETLVGLEAKQSESLSELLTLREALESSRLEGELLKQERVEVAAALARAEQSIVELSGSENSLKAEVADLRAAAVKLGALNEALALDKVELNQQLLQLEQENQSLCSRVEAAEQLRSALQVDLAEAERRREALWEKKTQLETQLQKAEEAGAELQAELRGTREEKEELKDKLSEAHHQQETATAHLEQLHQDAERQEETLARAVQEKEALVRERAALEVRLQAVERDRQDLTEHVLGLRSAKEQLESNLFEAQQQNSVIQVTKGQLEVQIQTIIQAKEVIQGEVKCLKLELDAERTRAEQEWDAVARQLAQAEQEGQASLERQKVAHEEEVNRLQEKWEKERSWLQQELDKTLETLERERAELETKLREQQTEMEAIRAQREEERSQADSALYQMQLETEKERVSLLETLLRTQKELADASQQLERLRQDMKIQKLKEQETTGMLQAQLQETQQELKEAAQQHRDDLAAFQKDKLDLQKQVEDLMSQLVAHDDSQRLVKEEIEEKVKVAQECSRIQKELEKENASLALSLVEKEKRLLILQEADSVRQQELSSLRQDIQEAQEGQRELGVQVELLRQEVKEKEADFVAREAQLLEELEASRVAEQQLRASLWAQEAKATQLQLQLRSTESQLEALVAEQQPENQAQAQLASLCSVLQQALGSACESRPELRGGGDSAPTLWGPDPDQNGASRLFKRWSLPTALSPEAVALALQKLHQDVWKARQARDDLRDQVQKLVQRLTDTEAQKSQVHSELQDLQRQLSQSQEEKSKWEGRQNSLESELRDLHETAASLQSRLRQAELQKMEAQNDRELLQASKEKLSAQVEHLQACVAEAQAQADAAAVLEEDLRTARSALKLKNEELESERERAQALQEQGELKVAQGKALQENLALLAQTLSNREREVETLQAEVQELEKQREMQKAALELLSLDLKKRSREVDLQQEQIQELEQCRSVLEHLPMAVQEREQKLSVQRDQIRELENDREAQRSVLEHQLLDLEQKAQVIESQRGQIQDLKKQLGTLECLALELEESHHKVESQQKMITELEGQREMQRVALTHLTLDLEERSQELQAQSSQLHELENHSTHLAKELQERDQEVTSQRQQIDELQKQQEQLAQALERKGQELVLQKERIQVLEDQRTLQTKILEEDLEQIKHSLRERSQELASQWQLVHERADDGKSPSKGQRGSLEHLKLILRDKEKEVECQQERIQELQGHMGQLEQQLQGLHRKVGETSLLLTHREQETATLQQHLQEAKEQGELREQVLQGQLEEAQRDLAQRDHELETLRQEKQQTQDQEESMKLKTSALQAALEQAHATLKERQGELEEHREQVRRLQEELEVEGRQVRALEEVLGDLRAESREHEKAVLALQQRCAEQAQEHEAEARTLQDSWLQAQATLTEQEQELAALRAENQYSRRQEEAAVSQAEALQEALSKAQAALQEKEQSLLEQAELSHTLEASTAALQATLDTCQASARQLEEALRIREGEIQAQALQHHEVTQHLQQELCQKKEELRQLLEKAGARRSQENGIQEKQSLEQERQEETRRLLESLKELQLTVAQREEEILMLREASSPRHRALPAEKPALQPLPAQQELERLQTALRQTEAREIEWREKAQDLALSLAQSKASISSLQEITMFLQASVLERESEQQRLQEELVLSRQALEEQQSGGPHSTSRADQGPKVGQGSQSGEVETEPSPGVEEKERLTQRLERLQQAVAELEVDRSKLQCHNAQLRTALEQVERERRKLKRDSVRASRAGSLEARETMTSSPTQQDGRGSQRGSSDSVLVVELQREVALLRAQLALERKQRQDYIARSVQTSRELAGLHHSLSHSLLTVAQAPEATVLEAETRKLDESLNQSLTSPGPCLLHPSLDTTQNTHR 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------KDAQEKLELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDAD-------RKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELS---EGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDKYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDEL----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.234}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7nep.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 8' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLN 1238 1238 ? A 153.242 209.492 281.725 1 1 L GLN 0.470 1 ATOM 2 C CA . GLN 1238 1238 ? A 152.369 209.957 280.589 1 1 L GLN 0.470 1 ATOM 3 C C . GLN 1238 1238 ? A 153.002 211.031 279.759 1 1 L GLN 0.470 1 ATOM 4 O O . GLN 1238 1238 ? A 152.953 210.939 278.548 1 1 L GLN 0.470 1 ATOM 5 C CB . GLN 1238 1238 ? A 150.995 210.425 281.100 1 1 L GLN 0.470 1 ATOM 6 C CG . GLN 1238 1238 ? A 150.138 209.276 281.680 1 1 L GLN 0.470 1 ATOM 7 C CD . GLN 1238 1238 ? A 148.802 209.821 282.192 1 1 L GLN 0.470 1 ATOM 8 O OE1 . GLN 1238 1238 ? A 148.720 210.988 282.565 1 1 L GLN 0.470 1 ATOM 9 N NE2 . GLN 1238 1238 ? A 147.762 208.961 282.235 1 1 L GLN 0.470 1 ATOM 10 N N . LYS 1239 1239 ? A 153.676 212.030 280.364 1 1 L LYS 0.520 1 ATOM 11 C CA . LYS 1239 1239 ? A 154.459 212.988 279.622 1 1 L LYS 0.520 1 ATOM 12 C C . LYS 1239 1239 ? A 155.613 212.370 278.871 1 1 L LYS 0.520 1 ATOM 13 O O . LYS 1239 1239 ? A 155.738 212.609 277.685 1 1 L LYS 0.520 1 ATOM 14 C CB . LYS 1239 1239 ? A 154.963 214.057 280.597 1 1 L LYS 0.520 1 ATOM 15 C CG . LYS 1239 1239 ? A 155.706 215.199 279.904 1 1 L LYS 0.520 1 ATOM 16 C CD . LYS 1239 1239 ? A 156.075 216.311 280.889 1 1 L LYS 0.520 1 ATOM 17 C CE . LYS 1239 1239 ? A 156.741 217.507 280.204 1 1 L LYS 0.520 1 ATOM 18 N NZ . LYS 1239 1239 ? A 158.028 217.104 279.586 1 1 L LYS 0.520 1 ATOM 19 N N . LEU 1240 1240 ? A 156.404 211.461 279.496 1 1 L LEU 0.570 1 ATOM 20 C CA . LEU 1240 1240 ? A 157.403 210.712 278.752 1 1 L LEU 0.570 1 ATOM 21 C C . LEU 1240 1240 ? A 156.781 209.915 277.619 1 1 L LEU 0.570 1 ATOM 22 O O . LEU 1240 1240 ? A 157.214 210.035 276.492 1 1 L LEU 0.570 1 ATOM 23 C CB . LEU 1240 1240 ? A 158.218 209.753 279.656 1 1 L LEU 0.570 1 ATOM 24 C CG . LEU 1240 1240 ? A 159.171 210.446 280.653 1 1 L LEU 0.570 1 ATOM 25 C CD1 . LEU 1240 1240 ? A 159.754 209.416 281.636 1 1 L LEU 0.570 1 ATOM 26 C CD2 . LEU 1240 1240 ? A 160.318 211.180 279.933 1 1 L LEU 0.570 1 ATOM 27 N N . HIS 1241 1241 ? A 155.684 209.173 277.839 1 1 L HIS 0.540 1 ATOM 28 C CA . HIS 1241 1241 ? A 154.964 208.469 276.785 1 1 L HIS 0.540 1 ATOM 29 C C . HIS 1241 1241 ? A 154.390 209.360 275.684 1 1 L HIS 0.540 1 ATOM 30 O O . HIS 1241 1241 ? A 154.461 209.033 274.508 1 1 L HIS 0.540 1 ATOM 31 C CB . HIS 1241 1241 ? A 153.822 207.640 277.392 1 1 L HIS 0.540 1 ATOM 32 C CG . HIS 1241 1241 ? A 153.018 206.872 276.405 1 1 L HIS 0.540 1 ATOM 33 N ND1 . HIS 1241 1241 ? A 153.593 205.793 275.779 1 1 L HIS 0.540 1 ATOM 34 C CD2 . HIS 1241 1241 ? A 151.743 207.052 275.979 1 1 L HIS 0.540 1 ATOM 35 C CE1 . HIS 1241 1241 ? A 152.656 205.330 274.979 1 1 L HIS 0.540 1 ATOM 36 N NE2 . HIS 1241 1241 ? A 151.512 206.054 275.061 1 1 L HIS 0.540 1 ATOM 37 N N . GLN 1242 1242 ? A 153.810 210.523 276.027 1 1 L GLN 0.630 1 ATOM 38 C CA . GLN 1242 1242 ? A 153.359 211.503 275.068 1 1 L GLN 0.630 1 ATOM 39 C C . GLN 1242 1242 ? A 154.501 212.131 274.282 1 1 L GLN 0.630 1 ATOM 40 O O . GLN 1242 1242 ? A 154.408 212.217 273.063 1 1 L GLN 0.630 1 ATOM 41 C CB . GLN 1242 1242 ? A 152.541 212.611 275.766 1 1 L GLN 0.630 1 ATOM 42 C CG . GLN 1242 1242 ? A 151.902 213.628 274.793 1 1 L GLN 0.630 1 ATOM 43 C CD . GLN 1242 1242 ? A 150.839 212.978 273.901 1 1 L GLN 0.630 1 ATOM 44 O OE1 . GLN 1242 1242 ? A 149.906 212.351 274.393 1 1 L GLN 0.630 1 ATOM 45 N NE2 . GLN 1242 1242 ? A 150.945 213.144 272.561 1 1 L GLN 0.630 1 ATOM 46 N N . ASP 1243 1243 ? A 155.613 212.524 274.946 1 1 L ASP 0.630 1 ATOM 47 C CA . ASP 1243 1243 ? A 156.865 212.967 274.358 1 1 L ASP 0.630 1 ATOM 48 C C . ASP 1243 1243 ? A 157.463 211.852 273.501 1 1 L ASP 0.630 1 ATOM 49 O O . ASP 1243 1243 ? A 157.954 212.108 272.417 1 1 L ASP 0.630 1 ATOM 50 C CB . ASP 1243 1243 ? A 157.893 213.447 275.447 1 1 L ASP 0.630 1 ATOM 51 C CG . ASP 1243 1243 ? A 157.485 214.741 276.169 1 1 L ASP 0.630 1 ATOM 52 O OD1 . ASP 1243 1243 ? A 156.598 215.453 275.630 1 1 L ASP 0.630 1 ATOM 53 O OD2 . ASP 1243 1243 ? A 158.039 215.061 277.268 1 1 L ASP 0.630 1 ATOM 54 N N . VAL 1244 1244 ? A 157.400 210.576 273.924 1 1 L VAL 0.700 1 ATOM 55 C CA . VAL 1244 1244 ? A 157.775 209.391 273.162 1 1 L VAL 0.700 1 ATOM 56 C C . VAL 1244 1244 ? A 156.910 209.172 271.947 1 1 L VAL 0.700 1 ATOM 57 O O . VAL 1244 1244 ? A 157.456 208.932 270.880 1 1 L VAL 0.700 1 ATOM 58 C CB . VAL 1244 1244 ? A 157.742 208.110 274.003 1 1 L VAL 0.700 1 ATOM 59 C CG1 . VAL 1244 1244 ? A 157.673 206.792 273.191 1 1 L VAL 0.700 1 ATOM 60 C CG2 . VAL 1244 1244 ? A 158.986 208.049 274.906 1 1 L VAL 0.700 1 ATOM 61 N N . TRP 1245 1245 ? A 155.564 209.260 272.039 1 1 L TRP 0.570 1 ATOM 62 C CA . TRP 1245 1245 ? A 154.658 209.177 270.905 1 1 L TRP 0.570 1 ATOM 63 C C . TRP 1245 1245 ? A 154.882 210.329 269.944 1 1 L TRP 0.570 1 ATOM 64 O O . TRP 1245 1245 ? A 154.994 210.132 268.745 1 1 L TRP 0.570 1 ATOM 65 C CB . TRP 1245 1245 ? A 153.168 209.122 271.352 1 1 L TRP 0.570 1 ATOM 66 C CG . TRP 1245 1245 ? 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A 159.703 207.198 246.041 1 1 L GLN 0.730 1 ATOM 223 C CD . GLN 1263 1263 ? A 159.991 205.773 245.563 1 1 L GLN 0.730 1 ATOM 224 O OE1 . GLN 1263 1263 ? A 160.194 204.858 246.369 1 1 L GLN 0.730 1 ATOM 225 N NE2 . GLN 1263 1263 ? A 160.013 205.567 244.228 1 1 L GLN 0.730 1 ATOM 226 N N . ARG 1264 1264 ? A 162.453 209.903 246.397 1 1 L ARG 0.620 1 ATOM 227 C CA . ARG 1264 1264 ? A 162.980 210.930 245.516 1 1 L ARG 0.620 1 ATOM 228 C C . ARG 1264 1264 ? A 164.441 210.781 245.158 1 1 L ARG 0.620 1 ATOM 229 O O . ARG 1264 1264 ? A 164.793 210.998 244.013 1 1 L ARG 0.620 1 ATOM 230 C CB . ARG 1264 1264 ? A 162.807 212.354 246.080 1 1 L ARG 0.620 1 ATOM 231 C CG . ARG 1264 1264 ? A 161.346 212.832 246.083 1 1 L ARG 0.620 1 ATOM 232 C CD . ARG 1264 1264 ? A 161.105 214.054 246.968 1 1 L ARG 0.620 1 ATOM 233 N NE . ARG 1264 1264 ? A 161.888 215.195 246.392 1 1 L ARG 0.620 1 ATOM 234 C CZ . ARG 1264 1264 ? A 162.086 216.371 247.002 1 1 L ARG 0.620 1 ATOM 235 N NH1 . ARG 1264 1264 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #