data_SMR-58d9ef20036285f16a97d40b3119abcf_1 _entry.id SMR-58d9ef20036285f16a97d40b3119abcf_1 _struct.entry_id SMR-58d9ef20036285f16a97d40b3119abcf_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q63870/ CO7A1_MOUSE, Collagen alpha-1(VII) chain Estimated model accuracy of this model is 0.053, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q63870' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' EDT non-polymer '{[-(BIS-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ETHYL]-CARBOXYMETHYL-AMINO}-ACETIC ACID' 'C10 H16 N2 O8' 292.244 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' MG non-polymer 'MAGNESIUM ION' Mg 24.305 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 348597.086 1 . 2 non-polymer man 'MAGNESIUM ION' 24.305 1 . 3 non-polymer man '{[-(BIS-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ETHYL]-CARBOXYMETHYL-AMINO}-ACETIC ACID' 292.244 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CO7A1_MOUSE Q63870 1 ;MRLRLLVAALCAAEILMGAPEVWAQPRDRVTCTRLYAADIVFLLDGSSSIGRSNFREVRGFLEGLVLPFS GAASAQGVRFATVQYSDDPQTEFGLDTLGSGSDTIRAIRELSYKGGNTRTGAALHHVSDRVFLPRLTRPG VPKVCILITDGKSQDLVDTAAQKLKGQGVKLFAVGIKNADPEELKRVASQPTSDFFFFVNDFSILRTLLP LISRRVCTTAGGVPVTLPSDDTPSGPRDLVLSEPSSQSLRVQWTAASGPVTGYKVQYTPLTGLGQPLPSE RQEVNIPAGETSTRLQGLRPLTDYQVTVVALYANSIGEAVSGTARTTAKEGLELSLQNITSHSLLVAWRR VPGANGYRVTWRDLSGGPTQQQDLSPGQGSVFLDHLEPGTDYEVTVSALFGHSVGPAASLTARTASSVEQ TLHPIILSPTSILLSWNLVPEARGYRLEWRRESGLETPQKVELPPDVTRHQLDGLQPGTEYRLTLYTLLE GREVATPATVVPTGLEQLVSPVMNLQAIELPGQRVRVSWNPVPGATEYRFTVRTTQGVERTLLLPGSQTT FDLDDVRAGLSYTVRVSARVGAQEGDASILTIHRDPEAPLVVPGLRVVASDATRIRVAWGLVPGASGFRI SWRTGSGPESSRTLTPDSTVTDILGLQPSTSYQVAVSALRGREEGPPVVIVARTDPLGPVRRVHLTQAGS SSVSITWTGVPGATGYRVSWHSGHGPEKSLLVSGDATVAEIDGLEPDTEYIVRVRTHVAGVDGAPASVVV RTAPEPVGSVSKLQILNASSDVLRVTWVGVPGATSYKLAWGRSEGGPMKHRILPGNKESAEIRDLEGGVS YSVRVTALVGDREGAPVSIVITTPPATPALLETLQVVQSGEHSLRLRWEPVPGAPGFRLHWQPEGGQEQS LTLGPESNSYNLVGLEPATKYQVWLTVLGQTGEGPPRKVTAYTEPSHIPSTELRVVDTSIDSVTLTWTPV SGASSYILSWRPLRGTGQEVPRAPQTLPGTSSSHRVTGLEPGISYVFSLTPIQSGVRGSEISVTQTPACS HGPVDVVFLLHATRDNAHNAEAVRRVLERLVSALGPLGPQAAQVGLLTYSHRPSPLFPLNSSHDLGIILR KIRDIPYVDPSGNNLGTAVTTAHRYLLASNAPGRRQQVPGVMVLLVDEPLRGDILSPIREAQTSGLKVMA LSLVGADPEQLRRLAPGTDPIQNFFAVDNGPGLDRAVSDLAVALCQAAVTIEPQTGPCAVHCPKGQKGEP GVTGLQGQAGPPGPPGLPGRTGAPGPQGPPGSTQAKGERGFPGPEGPPGSPGLPGVPGSPGIKGSTGRPG PRGEQGERGPQGPKGEPGEPGQITGGGGPGFPGKKGDPGPSGPPGSRGPVGDPGPRGPPGLPGISVKGDK GDRGERGPPGPGIGASEQGDPGLPGLPGSPGPQGPAGRPGEKGEKGDCEDGGPGLPGQPGPPGEPGLRGA PGMTGPKGDRGLTGTPGEPGVKGERGHPGPVGPQGLPGAAGHPGVEGPEGPPGPTGRRGEKGEPGRPGDP AVGPGGAGAKGEKGEAGLPGPRGASGSKGEQGAPGLALPGDPGPKGDPGDRGPIGLTGRAGPTGDSGPPG EKGEPGRPGSPGPVGPRGRDGEAGEKGDEGIPGEPGLPGKAGERGLRGAPGPRGPVGEKGDQGDPGEDGR NGSPGSSGPKGDRGEPGPPGPPGRLVDAGIESRDKGEPGQEGPRGPKGDPGPPGVSGERGIDGLRGPPGP QGDPGVRGPAGDKGDRGPPGLDGRSGLDGKPGAPGPPGLHGASGKAGDPGRDGLPGLRGEHGPPGPPGPP GVPGKAGDDGKPGLNGKNGDPGDPGEDGRKGEKGDSGAPGREGPDGPKGERGAPGNPGLQGPPGLPGQVG PPGQGFPGVPGITGPKGDRGETGSKGEQGLPGERGLRGEPGSLPNAERLLETAGIKVSALREIVDTWDES SGSFLPVPERRPGPKGDPGDRGPPGKEGLIGFPGERGLKGERGDPGPQGPPGLALGERGPPGPPGLAGEP GKPGIPGLPGRAGGSGEAGRPGERGERGEKGERGDQGRDGLPGLPGPPGPPGPKVAIEEPGPGLAREQGP PGLKGAKGEPGSDGDPGPKGDRGVPGIKGDVGEPGKRGHDGNPGLPGERGVAGPEGKPGLQGPRGTPGPV GSHGDPGPPGAPGLAGPAGPQGPSGLKGEPGETGPPGRGLPGPVGAVGLPGPPGPSGLVGPQGSPGLPGQ VGETGKPGPPGRDGSSGKDGDRGSPGVPGSPGLPGPVGPKGEPGPVGAPGQVVVGPPGAKGEKGAPGDLA GALLGEPGAKGDRGLPGPRGEKGEAGRAGGPGDPGEDGQKGAPGLKGLKGEPGIGVQGPPGPSGPPGMKG DLGPPGAPGAPGVVGFPGQTGPRGETGQPGPVGERGLAGPPGREGAPGPLGPPGPPGSAGAPGASGLKGD KGDPGAGLPGPRGERGEPGVRGEDGHPGQEGPRGLVGPPGSRGEQGEKGAAGAAGLKGDKGDSAVIEGPP GPRGAKGDMGERGPRGIDGDKGPRGESGNPGDKGSKGEPGDKGSAGSIGVRGLTGPKGEPGAAGIPGEPG APGKDGIPGFRGDKGDIGFMGPRGLKGEKGIKGTCGRDGERGDKGEAGFPGRPGLAGKKGDMGEPGLPGQ SGAPGKEGLIGPKGDRGFDGQSGPKGDQGEKGERGPPGVGGFPGPRGNDGSSGPPGPPGGVGPKGPEGLQ GQKGERGPPGESVVGAPGAPGTPGERGEQGRPGPAGPRGEKGEAALTEDDIRDFVRQEMSQHCACQGQFI ASGSRPLPGYAADTAGSQLHHVPVLRVSHVEEEGQVPPEDDDDFSEYSVYSVEDYQEPEVPWDGEAEIKG WDQRGSDLCSLPLDEGSCTAYTLRWYHRAVPGGTACHPFVYGGCGGNANRFGTREACERRCPPQGVHSQK TGAA ; 'Collagen alpha-1(VII) chain' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2944 1 2944 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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C 3 EDT 1 2 2 EDT '_' . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Collagen alpha-1(VII) chain {PDB ID=6s4c, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=6s4c.1.A}' 'template structure' . 2 'MAGNESIUM ION {PDB ID=6s4c, label_asym_id=D, auth_asym_id=A, SMTL ID=6s4c.1._.3}' 'template structure' . 3 '{[-(BIS-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ETHYL]-CARBOXYMETHYL-AMINO}-ACETIC ACID {PDB ID=6s4c, label_asym_id=C, auth_asym_id=A, SMTL ID=6s4c.1._.2}' 'template structure' . 4 . target . 5 'MAGNESIUM ION' target . 6 '{[-(BIS-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ETHYL]-CARBOXYMETHYL-AMINO}-ACETIC ACID' target . 7 'Target-template alignment by BLAST to 6s4c, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 8 'model 1' 'model coordinates' . 9 SMTL 'reference database' . 10 PDB 'reference database' . 11 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 4 2 1 9 3 1 10 4 2 11 5 3 4 6 3 5 7 3 6 8 3 1 9 3 2 10 3 3 11 3 7 12 4 1 13 4 2 14 4 3 15 4 7 16 4 5 17 4 6 18 5 8 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 9 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 10 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 4 'reference database' 2 5 . 3 6 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 2 . C 3 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' non-polymer 1 2 B D 2 1 A 3 3 'reference database' non-polymer 1 3 C C 3 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GRAMGACSHGPVDVVFLLHATRDNAHNAEAVRRVLERLVSALGPLGPQAAQVGLLTYSHRPSPLFPLNSS HDLGIILRKIRDIPYVDPSGNNLGTAVTTAHRYLLASNAPGRRQQVPGVMVLLVDEPLRGDILSPIREAQ TSGLKVMALSLVGADPEQLRRLAPGTDPIQNFFAVDNGPGLDRAVSDLAVALCQAA ; ;GRAMGACSHGPVDVVFLLHATRDNAHNAEAVRRVLERLVSALGPLGPQAAQVGLLTYSHRPSPLFPLNSS HDLGIILRKIRDIPYVDPSGNNLGTAVTTAHRYLLASNAPGRRQQVPGVMVLLVDEPLRGDILSPIREAQ TSGLKVMALSLVGADPEQLRRLAPGTDPIQNFFAVDNGPGLDRAVSDLAVALCQAA ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 6 196 # # loop_ _ma_template_non_poly.template_id _ma_template_non_poly.comp_id _ma_template_non_poly.details 2 MG 'MAGNESIUM ION' 3 EDT '{[-(BIS-CARBOXYMETHYL-AMINO)-ETHYL]-CARBOXYMETHYL-AMINO}-ACETIC ACID' # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6s4c 2024-01-24 2 PDB . 6s4c 2024-01-24 3 PDB . 6s4c 2024-01-24 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2944 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 7 1 2944 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 8.51e-121 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MRLRLLVAALCAAEILMGAPEVWAQPRDRVTCTRLYAADIVFLLDGSSSIGRSNFREVRGFLEGLVLPFSGAASAQGVRFATVQYSDDPQTEFGLDTLGSGSDTIRAIRELSYKGGNTRTGAALHHVSDRVFLPRLTRPGVPKVCILITDGKSQDLVDTAAQKLKGQGVKLFAVGIKNADPEELKRVASQPTSDFFFFVNDFSILRTLLPLISRRVCTTAGGVPVTLPSDDTPSGPRDLVLSEPSSQSLRVQWTAASGPVTGYKVQYTPLTGLGQPLPSERQEVNIPAGETSTRLQGLRPLTDYQVTVVALYANSIGEAVSGTARTTAKEGLELSLQNITSHSLLVAWRRVPGANGYRVTWRDLSGGPTQQQDLSPGQGSVFLDHLEPGTDYEVTVSALFGHSVGPAASLTARTASSVEQTLHPIILSPTSILLSWNLVPEARGYRLEWRRESGLETPQKVELPPDVTRHQLDGLQPGTEYRLTLYTLLEGREVATPATVVPTGLEQLVSPVMNLQAIELPGQRVRVSWNPVPGATEYRFTVRTTQGVERTLLLPGSQTTFDLDDVRAGLSYTVRVSARVGAQEGDASILTIHRDPEAPLVVPGLRVVASDATRIRVAWGLVPGASGFRISWRTGSGPESSRTLTPDSTVTDILGLQPSTSYQVAVSALRGREEGPPVVIVARTDPLGPVRRVHLTQAGSSSVSITWTGVPGATGYRVSWHSGHGPEKSLLVSGDATVAEIDGLEPDTEYIVRVRTHVAGVDGAPASVVVRTAPEPVGSVSKLQILNASSDVLRVTWVGVPGATSYKLAWGRSEGGPMKHRILPGNKESAEIRDLEGGVSYSVRVTALVGDREGAPVSIVITTPPATPALLETLQVVQSGEHSLRLRWEPVPGAPGFRLHWQPEGGQEQSLTLGPESNSYNLVGLEPATKYQVWLTVLGQTGEGPPRKVTAYTEPSHIPSTELRVVDTSIDSVTLTWTPVSGASSYILSWRPLRGTGQEVPRAPQTLPGTSSSHRVTGLEPGISYVFSLTPIQSGVRGSEISVTQTPACSHGPVDVVFLLHATRDNAHNAEAVRRVLERLVSALGPLGPQAAQVGLLTYSHRPSPLFPLNSSHDLGIILRKIRDIPYVDPSGNNLGTAVTTAHRYLLASNAPGRRQQVPGVMVLLVDEPLRGDILSPIREAQTSGLKVMALSLVGADPEQLRRLAPGTDPIQNFFAVDNGPGLDRAVSDLAVALCQAAVTIEPQTGPCAVHCPKGQKGEPGVTGLQGQAGPPGPPGLPGRTGAPGPQGPPGSTQAKGERGFPGPEGPPGSPGLPGVPGSPGIKGSTGRPGPRGEQGERGPQGPKGEPGEPGQITGGGGPGFPGKKGDPGPSGPPGSRGPVGDPGPRGPPGLPGISVKGDKGDRGERGPPGPGIGASEQGDPGLPGLPGSPGPQGPAGRPGEKGEKGDCEDGGPGLPGQPGPPGEPGLRGAPGMTGPKGDRGLTGTPGEPGVKGERGHPGPVGPQGLPGAAGHPGVEGPEGPPGPTGRRGEKGEPGRPGDPAVGPGGAGAKGEKGEAGLPGPRGASGSKGEQGAPGLALPGDPGPKGDPGDRGPIGLTGRAGPTGDSGPPGEKGEPGRPGSPGPVGPRGRDGEAGEKGDEGIPGEPGLPGKAGERGLRGAPGPRGPVGEKGDQGDPGEDGRNGSPGSSGPKGDRGEPGPPGPPGRLVDAGIESRDKGEPGQEGPRGPKGDPGPPGVSGERGIDGLRGPPGPQGDPGVRGPAGDKGDRGPPGLDGRSGLDGKPGAPGPPGLHGASGKAGDPGRDGLPGLRGEHGPPGPPGPPGVPGKAGDDGKPGLNGKNGDPGDPGEDGRKGEKGDSGAPGREGPDGPKGERGAPGNPGLQGPPGLPGQVGPPGQGFPGVPGITGPKGDRGETGSKGEQGLPGERGLRGEPGSLPNAERLLETAGIKVSALREIVDTWDESSGSFLPVPERRPGPKGDPGDRGPPGKEGLIGFPGERGLKGERGDPGPQGPPGLALGERGPPGPPGLAGEPGKPGIPGLPGRAGGSGEAGRPGERGERGEKGERGDQGRDGLPGLPGPPGPPGPKVAIEEPGPGLAREQGPPGLKGAKGEPGSDGDPGPKGDRGVPGIKGDVGEPGKRGHDGNPGLPGERGVAGPEGKPGLQGPRGTPGPVGSHGDPGPPGAPGLAGPAGPQGPSGLKGEPGETGPPGRGLPGPVGAVGLPGPPGPSGLVGPQGSPGLPGQVGETGKPGPPGRDGSSGKDGDRGSPGVPGSPGLPGPVGPKGEPGPVGAPGQVVVGPPGAKGEKGAPGDLAGALLGEPGAKGDRGLPGPRGEKGEAGRAGGPGDPGEDGQKGAPGLKGLKGEPGIGVQGPPGPSGPPGMKGDLGPPGAPGAPGVVGFPGQTGPRGETGQPGPVGERGLAGPPGREGAPGPLGPPGPPGSAGAPGASGLKGDKGDPGAGLPGPRGERGEPGVRGEDGHPGQEGPRGLVGPPGSRGEQGEKGAAGAAGLKGDKGDSAVIEGPPGPRGAKGDMGERGPRGIDGDKGPRGESGNPGDKGSKGEPGDKGSAGSIGVRGLTGPKGEPGAAGIPGEPGAPGKDGIPGFRGDKGDIGFMGPRGLKGEKGIKGTCGRDGERGDKGEAGFPGRPGLAGKKGDMGEPGLPGQSGAPGKEGLIGPKGDRGFDGQSGPKGDQGEKGERGPPGVGGFPGPRGNDGSSGPPGPPGGVGPKGPEGLQGQKGERGPPGESVVGAPGAPGTPGERGEQGRPGPAGPRGEKGEAALTEDDIRDFVRQEMSQHCACQGQFIASGSRPLPGYAADTAGSQLHHVPVLRVSHVEEEGQVPPEDDDDFSEYSVYSVEDYQEPEVPWDGEAEIKGWDQRGSDLCSLPLDEGSCTAYTLRWYHRAVPGGTACHPFVYGGCGGNANRFGTREACERRCPPQGVHSQKTGAA 2 1 2 ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ACSHGPVDVVFLLHATRDNAHNAEAVRRVLERLVSALGPLGPQAAQVGLLTYSHRPSPLFPLNSSHDLGIILRKIRDIPYVDPSGNNLGTAVTTAHRYLLASNAPGRRQQVPGVMVLLVDEPLRGDILSPIREAQTSGLKVMALSLVGADPEQLRRLAPGTDPIQNFFAVDNGPGLDRAVSDLAVALCQAA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6s4c.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 8 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLY 1052 1052 ? A -21.389 24.007 27.083 1 1 A GLY 0.680 1 ATOM 2 C CA . GLY 1052 1052 ? A -22.300 23.158 26.219 1 1 A GLY 0.680 1 ATOM 3 C C . GLY 1052 1052 ? A -21.563 22.024 25.564 1 1 A GLY 0.680 1 ATOM 4 O O . GLY 1052 1052 ? A -20.358 21.928 25.782 1 1 A GLY 0.680 1 ATOM 5 N N . PRO 1053 1053 ? A -22.211 21.133 24.824 1 1 A PRO 0.740 1 ATOM 6 C CA . PRO 1053 1053 ? A -21.545 20.087 24.051 1 1 A PRO 0.740 1 ATOM 7 C C . PRO 1053 1053 ? A -20.611 20.612 22.974 1 1 A PRO 0.740 1 ATOM 8 O O . PRO 1053 1053 ? A -20.888 21.660 22.403 1 1 A PRO 0.740 1 ATOM 9 C CB . PRO 1053 1053 ? A -22.700 19.286 23.407 1 1 A PRO 0.740 1 ATOM 10 C CG . PRO 1053 1053 ? A -23.951 19.667 24.205 1 1 A PRO 0.740 1 ATOM 11 C CD . PRO 1053 1053 ? A -23.662 21.100 24.651 1 1 A PRO 0.740 1 ATOM 12 N N . VAL 1054 1054 ? A -19.517 19.894 22.662 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 13 C CA . VAL 1054 1054 ? A -18.635 20.277 21.574 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 14 C C . VAL 1054 1054 ? A -17.981 19.029 21.002 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 15 O O . VAL 1054 1054 ? A -17.655 18.101 21.739 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 16 C CB . VAL 1054 1054 ? A -17.590 21.305 22.025 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 17 C CG1 . VAL 1054 1054 ? A -16.648 20.741 23.118 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 18 C CG2 . VAL 1054 1054 ? A -16.823 21.879 20.813 1 1 A VAL 0.830 1 ATOM 19 N N . ASP 1055 1055 ? A -17.783 18.982 19.666 1 1 A ASP 0.890 1 ATOM 20 C CA . ASP 1055 1055 ? A -17.075 17.911 18.994 1 1 A ASP 0.890 1 ATOM 21 C C . ASP 1055 1055 ? A -15.730 18.476 18.544 1 1 A ASP 0.890 1 ATOM 22 O O . ASP 1055 1055 ? A -15.663 19.343 17.679 1 1 A ASP 0.890 1 ATOM 23 C CB . ASP 1055 1055 ? A -17.873 17.438 17.742 1 1 A ASP 0.890 1 ATOM 24 C CG . ASP 1055 1055 ? A -19.176 16.759 18.100 1 1 A ASP 0.890 1 ATOM 25 O OD1 . ASP 1055 1055 ? A -19.383 16.432 19.286 1 1 A ASP 0.890 1 ATOM 26 O OD2 . ASP 1055 1055 ? A -20.010 16.551 17.178 1 1 A ASP 0.890 1 ATOM 27 N N . VAL 1056 1056 ? A -14.608 18.014 19.137 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 28 C CA . VAL 1056 1056 ? A -13.290 18.566 18.845 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 29 C C . VAL 1056 1056 ? A -12.415 17.498 18.225 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 30 O O . VAL 1056 1056 ? A -12.293 16.393 18.735 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 31 C CB . VAL 1056 1056 ? A -12.598 19.091 20.099 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 32 C CG1 . VAL 1056 1056 ? A -11.196 19.662 19.773 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 33 C CG2 . VAL 1056 1056 ? A -13.478 20.198 20.712 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 34 N N . VAL 1057 1057 ? A -11.755 17.811 17.092 1 1 A VAL 0.950 1 ATOM 35 C CA . VAL 1057 1057 ? A -10.784 16.915 16.487 1 1 A VAL 0.950 1 ATOM 36 C C . VAL 1057 1057 ? A -9.449 17.632 16.434 1 1 A VAL 0.950 1 ATOM 37 O O . VAL 1057 1057 ? A -9.326 18.739 15.919 1 1 A VAL 0.950 1 ATOM 38 C CB . VAL 1057 1057 ? A -11.210 16.425 15.104 1 1 A VAL 0.950 1 ATOM 39 C CG1 . VAL 1057 1057 ? A -10.106 15.570 14.438 1 1 A VAL 0.950 1 ATOM 40 C CG2 . VAL 1057 1057 ? A -12.493 15.579 15.273 1 1 A VAL 0.950 1 ATOM 41 N N . PHE 1058 1058 ? A -8.401 16.998 17.002 1 1 A PHE 0.960 1 ATOM 42 C CA . PHE 1058 1058 ? A -7.048 17.526 16.997 1 1 A PHE 0.960 1 ATOM 43 C C . PHE 1058 1058 ? A -6.255 16.931 15.839 1 1 A PHE 0.960 1 ATOM 44 O O . PHE 1058 1058 ? A -6.336 15.739 15.556 1 1 A PHE 0.960 1 ATOM 45 C CB . PHE 1058 1058 ? A -6.285 17.206 18.311 1 1 A PHE 0.960 1 ATOM 46 C CG . PHE 1058 1058 ? A -6.932 17.862 19.495 1 1 A PHE 0.960 1 ATOM 47 C CD1 . PHE 1058 1058 ? A -6.511 19.132 19.915 1 1 A PHE 0.960 1 ATOM 48 C CD2 . PHE 1058 1058 ? A -7.943 17.207 20.218 1 1 A PHE 0.960 1 ATOM 49 C CE1 . PHE 1058 1058 ? A -7.092 19.741 21.035 1 1 A PHE 0.960 1 ATOM 50 C CE2 . PHE 1058 1058 ? A -8.516 17.807 21.348 1 1 A PHE 0.960 1 ATOM 51 C CZ . PHE 1058 1058 ? A -8.088 19.074 21.759 1 1 A PHE 0.960 1 ATOM 52 N N . LEU 1059 1059 ? A -5.469 17.776 15.137 1 1 A LEU 0.950 1 ATOM 53 C CA . LEU 1059 1059 ? A -4.630 17.382 14.019 1 1 A LEU 0.950 1 ATOM 54 C C . LEU 1059 1059 ? A -3.183 17.636 14.376 1 1 A LEU 0.950 1 ATOM 55 O O . LEU 1059 1059 ? A -2.783 18.765 14.632 1 1 A LEU 0.950 1 ATOM 56 C CB . LEU 1059 1059 ? A -4.929 18.170 12.721 1 1 A LEU 0.950 1 ATOM 57 C CG . LEU 1059 1059 ? A -6.155 17.641 11.957 1 1 A LEU 0.950 1 ATOM 58 C CD1 . LEU 1059 1059 ? A -7.479 18.014 12.636 1 1 A LEU 0.950 1 ATOM 59 C CD2 . LEU 1059 1059 ? A -6.138 18.180 10.522 1 1 A LEU 0.950 1 ATOM 60 N N . LEU 1060 1060 ? A -2.361 16.570 14.409 1 1 A LEU 0.920 1 ATOM 61 C CA . LEU 1060 1060 ? A -0.989 16.636 14.888 1 1 A LEU 0.920 1 ATOM 62 C C . LEU 1060 1060 ? A 0.004 16.213 13.832 1 1 A LEU 0.920 1 ATOM 63 O O . LEU 1060 1060 ? A -0.163 15.195 13.173 1 1 A LEU 0.920 1 ATOM 64 C CB . LEU 1060 1060 ? A -0.771 15.692 16.095 1 1 A LEU 0.920 1 ATOM 65 C CG . LEU 1060 1060 ? A -1.050 16.347 17.454 1 1 A LEU 0.920 1 ATOM 66 C CD1 . LEU 1060 1060 ? A -2.535 16.657 17.703 1 1 A LEU 0.920 1 ATOM 67 C CD2 . LEU 1060 1060 ? 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A -2.957 8.787 16.300 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 415 C CD2 . LEU 1106 1106 ? A -3.450 7.170 14.458 1 1 A LEU 0.810 1 ATOM 416 N N . PHE 1107 1107 ? A -8.535 8.077 16.079 1 1 A PHE 0.820 1 ATOM 417 C CA . PHE 1107 1107 ? A -9.792 7.677 16.665 1 1 A PHE 0.820 1 ATOM 418 C C . PHE 1107 1107 ? A -10.883 8.712 16.395 1 1 A PHE 0.820 1 ATOM 419 O O . PHE 1107 1107 ? A -10.576 9.901 16.270 1 1 A PHE 0.820 1 ATOM 420 C CB . PHE 1107 1107 ? A -9.666 7.302 18.178 1 1 A PHE 0.820 1 ATOM 421 C CG . PHE 1107 1107 ? A -9.122 8.416 19.041 1 1 A PHE 0.820 1 ATOM 422 C CD1 . PHE 1107 1107 ? A -9.969 9.403 19.575 1 1 A PHE 0.820 1 ATOM 423 C CD2 . PHE 1107 1107 ? A -7.746 8.489 19.324 1 1 A PHE 0.820 1 ATOM 424 C CE1 . PHE 1107 1107 ? A -9.458 10.426 20.381 1 1 A PHE 0.820 1 ATOM 425 C CE2 . PHE 1107 1107 ? A -7.234 9.505 20.141 1 1 A PHE 0.820 1 ATOM 426 C CZ . PHE 1107 1107 ? A -8.091 10.478 20.667 1 1 A PHE 0.820 1 ATOM 427 N N . PRO 1108 1108 ? A -12.158 8.323 16.287 1 1 A PRO 0.840 1 ATOM 428 C CA . 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ARG 1171 1171 ? A 2.318 21.871 2.156 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 911 C CB . ARG 1171 1171 ? A 5.492 21.976 1.781 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 912 C CG . ARG 1171 1171 ? A 5.282 20.620 2.500 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 913 C CD . ARG 1171 1171 ? A 6.416 19.631 2.210 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 914 N NE . ARG 1171 1171 ? A 6.007 18.269 2.728 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 915 C CZ . ARG 1171 1171 ? A 5.334 17.351 2.012 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 916 N NH1 . ARG 1171 1171 ? A 4.970 17.583 0.756 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 917 N NH2 . ARG 1171 1171 ? A 5.031 16.153 2.511 1 1 A ARG 0.770 1 ATOM 918 N N . GLY 1172 1172 ? A 2.809 22.933 0.231 1 1 A GLY 0.810 1 ATOM 919 C CA . GLY 1172 1172 ? A 1.528 22.662 -0.413 1 1 A GLY 0.810 1 ATOM 920 C C . GLY 1172 1172 ? A 0.415 23.581 0.025 1 1 A GLY 0.810 1 ATOM 921 O O . GLY 1172 1172 ? A 0.588 24.454 0.869 1 1 A GLY 0.810 1 ATOM 922 N N . ASP 1173 1173 ? A -0.774 23.425 -0.591 1 1 A ASP 0.800 1 ATOM 923 C CA . ASP 1173 1173 ? A -1.917 24.257 -0.297 1 1 A ASP 0.800 1 ATOM 924 C C . 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A -15.527 24.147 7.981 1 1 A ALA 0.860 1 ATOM 991 C CB . ALA 1181 1181 ? A -12.515 22.947 7.329 1 1 A ALA 0.860 1 ATOM 992 N N . GLN 1182 1182 ? A -14.150 25.674 7.119 1 1 A GLN 0.780 1 ATOM 993 C CA . GLN 1182 1182 ? A -14.901 26.810 7.626 1 1 A GLN 0.780 1 ATOM 994 C C . GLN 1182 1182 ? A -16.260 27.001 6.976 1 1 A GLN 0.780 1 ATOM 995 O O . GLN 1182 1182 ? A -17.258 27.198 7.667 1 1 A GLN 0.780 1 ATOM 996 C CB . GLN 1182 1182 ? A -14.082 28.091 7.449 1 1 A GLN 0.780 1 ATOM 997 C CG . GLN 1182 1182 ? A -12.877 28.119 8.411 1 1 A GLN 0.780 1 ATOM 998 C CD . GLN 1182 1182 ? A -12.137 29.408 8.159 1 1 A GLN 0.780 1 ATOM 999 O OE1 . GLN 1182 1182 ? A -12.174 29.889 7.001 1 1 A GLN 0.780 1 ATOM 1000 N NE2 . GLN 1182 1182 ? A -11.498 30.036 9.150 1 1 A GLN 0.780 1 ATOM 1001 N N . THR 1183 1183 ? A -16.344 26.884 5.632 1 1 A THR 0.710 1 ATOM 1002 C CA . THR 1183 1183 ? A -17.581 27.001 4.854 1 1 A THR 0.710 1 ATOM 1003 C C . THR 1183 1183 ? 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# loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #