data_SMR-7d21f60868a42515f892bf07b71cade9_1 _entry.id SMR-7d21f60868a42515f892bf07b71cade9_1 _struct.entry_id SMR-7d21f60868a42515f892bf07b71cade9_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P12111 (isoform 2)/ CO6A3_HUMAN, Collagen alpha-3(VI) chain Estimated model accuracy of this model is 0.077, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P12111 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 375232.758 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CO6A3_HUMAN P12111 1 ;MRKHRHLPLVAVFCLFLSGFPTTHAQQQQAAQDSADIIFLIDGSNNTGSVNFAVILDFLVNLLEKLPIGT QQIRVGVVQFSDEPRTMFSLDTYSTKAQVLGAVKALGFAGGELANIGLALDFVVENHFTRAGGSRVEEGV PQVLVLISAGPSSDEIRYGVVALKQASVFSFGLGAQAASRAELQHIATDDNLVFTVPEFRSFGDLQEKLL PYIVGVAQRHIVLKPPTIVTQVIEVNKRDIVFLVDGSSALGLANFNAIRDFIAKVIQRLEIGQDLIQVAV AQYADTVRPEFYFNTHPTKREVITAVRKMKPLDGSALYTGSALDFVRNNLFTSSAGYRAAEGIPKLLVLI TGGKSLDEISQPAQELKRSSIMAFAIGNKGADQAELEEIAFDSSLVFIPAEFRAAPLQGMLPGLLAPLRT LSGTPEVHSNKRDIIFLLDGSANVGKTNFPYVRDFVMNLVNSLDIGNDNIRVGLVQFSDTPVTEFSLNTY QTKSDILGHLRQLQLQGGSGLNTGSALSYVYANHFTEAGGSRIREHVPQLLLLLTAGQSEDSYLQAANAL TRAGILTFCVGASQANKAELEQIAFNPSLVYLMDDFSSLPALPQQLIQPLTTYVSGGVEEVPLAQPESKR DILFLFDGSANLVGQFPVVRDFLYKIIDELNVKPEGTRIAVAQYSDDVKVESRFDEHQSKPEILNLVKRM KIKTGKALNLGYALDYAQRYIFVKSAGSRIEDGVLQFLVLLVAGRSSDRVDGPASNLKQSGVVPFIFQAK NADPAELEQIVLSPAFILAAESLPKIGDLHPQIVNLLKSVHNGAPAPVSGEKDVVFLLDGSEGVRSGFPL LKEFVQRVVESLDVGQDRVRVAVVQYSDRTRPEFYLNSYMNKQDVVNAVRQLTLLGGPTPNTGAALEFVL RNILVSSAGSRITEGVPQLLIVLTADRSGDDVRNPSVVVKRGGAVPIGIGIGNADITEMQTISFIPDFAV AIPTFRQLGTVQQVISERVTQLTREELSRLQPVLQPLPSPGVGGKRDVVFLIDGSQSAGPEFQYVRTLIE RLVDYLDVGFDTTRVAVIQFSDDPKVEFLLNAHSSKDEVQNAVQRLRPKGGRQINVGNALEYVSRNIFKR PLGSRIEEGVPQFLVLISSGKSDDEVDDPAVELKQFGVAPFTIARNADQEELVKISLSPEYVFSVSTFRE LPSLEQKLLTPITTLTSEQIQKLLASTRYPPPAVESDAADIVFLIDSSEGVRPDGFAHIRDFVSRIVRRL NIGPSKVRVGVVQFSNDVFPEFYLKTYRSQAPVLDAIRRLRLRGGSPLNTGKALEFVARNLFVKSAGSRI EDGVPQHLVLVLGGKSQDDVSRFAQVIRSSGIVSLGVGDRNIDRTELQTITNDPRLVFTVREFRELPNIE ERIMNSFGPSAATPAPPGVDTPPPSRPEKKKADIVFLLDGSINFRRDSFQEVLRFVSEIVDTVYEDGDSI QVGLVQYNSDPTDEFFLKDFSTKRQIIDAINKVVYKGGRHANTKVGLEHLRVNHFVPEAGSRLDQRVPQI AFVITGGKSVEDAQDVSLALTQRGVKVFAVGVRNIDSEEVGKIASNSATAFRVGNVQELSELSEQVLETL HDAMHETLCPGVTDAAKACNLDVILGFDGSRDQNVFVAQKGFESKVDAILNRISQMHRVSCSGGRSPTVR VSVVANTPSGPVEAFDFDEYQPEMLEKFRNMRSQHPYVLTEDTLKVYLNKFRQSSPDSVKVVIHFTDGAD GDLADLHRASENLRQEGVRALILVGLERVVNLERLMHLEFGRGFMYDRPLRLNLLDLDYELAEQLDNIAE KACCGVPCKCSGQRGDRGPIGSIGPKGIPGEDGYRGYPGDEGGPGERGPPGVNGTQGFQGCPGQRGVKGS RGFPGEKGEVGEIGLDGLDGEDGDKGLPGSSGEKGNPGRRGDKGPRGEKGERGDVGIRGDPGNPGQDSQE RGPKGETGDLGPMGVPGRDGVPGGPGETGKNGGFGRRGPPGAKGNKGGPGQPGFEGEQGTRGAQGPAGPA GPPGLIGEQGISGPRGSGGAAGAPGERGRTGPLGRKGEPGEPGPKGGIGNRGPRGETGDDGRDGVGSEGR RGKKGERGFPGYPGPKGNPGEPGLNGTTGPKGIRGRRGNSGPPGIVGQKGDPGYPGPAGPKGNRGDSIDQ CALIQSIKDKCPCCYGPLECPVFPTELAFALDTSEGVNQDTFGRMRDVVLSIVNDLTIAESNCPRGARVA VVTYNNEVTTEIRFADSKRKSVLLDKIKNLQVALTSKQQSLETAMSFVARNTFKRVRNGFLMRKVAVFFS NTPTRASPQLREAVLKLSDAGITPLFLTRQEDRQLINALQINNTAVGHALVLPAGRDLTDFLENVLTCHV CLDICNIDPSCGFGSWRPSFRDRRAAGSDVDIDMAFILDSAETTTLFQFNEMKKYIAYLVRQLDMSPDPK ASQHFARVAVVQHAPSESVDNASMPPVKVEFSLTDYGSKEKLVDFLSRGMTQLQGTRALGSAIEYTIENV FESAPNPRDLKIVVLMLTGEVPEQQLEEAQRVILQAKCKGYFFVVLGIGRKVNIKEVYTFASEPNDVFFK LVDKSTELNEEPLMRFGRLLPSFVSSENAFYLSPDIRKQCDWFQGDQPTKNLVKFGHKQVNVPNNVTSSP TSNPVTTTKPVTTTKPVTTTTKPVTTTTKPVTIINQPSVKPAAAKPAPAKPVAAKPVATKMATVRPPVAV KPATAAKPVAAKPAAVRPPAAAAAKPVATKPEVPRPQAAKPAATKPATTKPMVKMSREVQVFEITENSAK LHWERAEPPGPYFYDLTVTSAHDQSLVLKQNLTVTDRVIGGLLAGQTYHVAVVCYLRSQVRATYHGSFST KKSQPPPPQPARSASSSTINLMVSTEPLALTETDICKLPKDEGTCRDFILKWYYDPNTKSCARFWYGGCG GNENKFGSQKECEKVCAPVLAKPGVISVMGT ; 'Collagen alpha-3(VI) chain' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2971 1 2971 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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_ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;EKKKADIVFLLDGSINFRRDSFQEVLRFVSEIVDTVYEDGDSIQVGLVQYNSDPTDEFFLKDFSTKRQII DAINKVVYKGGRHANTKVGLEHLRVNHFVPEAGSRLDQRVPQIAFVITGGKSVEDAQDVSLALTQRGVKV FAVGVRNIDSEEVGKIASNSATAFRVGNVQELSELSEQVLETLHDAMHETLCPGVTDAAK ; ;EKKKADIVFLLDGSINFRRDSFQEVLRFVSEIVDTVYEDGDSIQVGLVQYNSDPTDEFFLKDFSTKRQII DAINKVVYKGGRHANTKVGLEHLRVNHFVPEAGSRLDQRVPQIAFVITGGKSVEDAQDVSLALTQRGVKV FAVGVRNIDSEEVGKIASNSATAFRVGNVQELSELSEQVLETLHDAMHETLCPGVTDAAK ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 200 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6snk 2024-01-24 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2971 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2971 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 1.06e-116 100.000 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MRKHRHLPLVAVFCLFLSGFPTTHAQQQQAAQDSADIIFLIDGSNNTGSVNFAVILDFLVNLLEKLPIGTQQIRVGVVQFSDEPRTMFSLDTYSTKAQVLGAVKALGFAGGELANIGLALDFVVENHFTRAGGSRVEEGVPQVLVLISAGPSSDEIRYGVVALKQASVFSFGLGAQAASRAELQHIATDDNLVFTVPEFRSFGDLQEKLLPYIVGVAQRHIVLKPPTIVTQVIEVNKRDIVFLVDGSSALGLANFNAIRDFIAKVIQRLEIGQDLIQVAVAQYADTVRPEFYFNTHPTKREVITAVRKMKPLDGSALYTGSALDFVRNNLFTSSAGYRAAEGIPKLLVLITGGKSLDEISQPAQELKRSSIMAFAIGNKGADQAELEEIAFDSSLVFIPAEFRAAPLQGMLPGLLAPLRTLSGTPEVHSNKRDIIFLLDGSANVGKTNFPYVRDFVMNLVNSLDIGNDNIRVGLVQFSDTPVTEFSLNTYQTKSDILGHLRQLQLQGGSGLNTGSALSYVYANHFTEAGGSRIREHVPQLLLLLTAGQSEDSYLQAANALTRAGILTFCVGASQANKAELEQIAFNPSLVYLMDDFSSLPALPQQLIQPLTTYVSGGVEEVPLAQPESKRDILFLFDGSANLVGQFPVVRDFLYKIIDELNVKPEGTRIAVAQYSDDVKVESRFDEHQSKPEILNLVKRMKIKTGKALNLGYALDYAQRYIFVKSAGSRIEDGVLQFLVLLVAGRSSDRVDGPASNLKQSGVVPFIFQAKNADPAELEQIVLSPAFILAAESLPKIGDLHPQIVNLLKSVHNGAPAPVSGEKDVVFLLDGSEGVRSGFPLLKEFVQRVVESLDVGQDRVRVAVVQYSDRTRPEFYLNSYMNKQDVVNAVRQLTLLGGPTPNTGAALEFVLRNILVSSAGSRITEGVPQLLIVLTADRSGDDVRNPSVVVKRGGAVPIGIGIGNADITEMQTISFIPDFAVAIPTFRQLGTVQQVISERVTQLTREELSRLQPVLQPLPSPGVGGKRDVVFLIDGSQSAGPEFQYVRTLIERLVDYLDVGFDTTRVAVIQFSDDPKVEFLLNAHSSKDEVQNAVQRLRPKGGRQINVGNALEYVSRNIFKRPLGSRIEEGVPQFLVLISSGKSDDEVDDPAVELKQFGVAPFTIARNADQEELVKISLSPEYVFSVSTFRELPSLEQKLLTPITTLTSEQIQKLLASTRYPPPAVESDAADIVFLIDSSEGVRPDGFAHIRDFVSRIVRRLNIGPSKVRVGVVQFSNDVFPEFYLKTYRSQAPVLDAIRRLRLRGGSPLNTGKALEFVARNLFVKSAGSRIEDGVPQHLVLVLGGKSQDDVSRFAQVIRSSGIVSLGVGDRNIDRTELQTITNDPRLVFTVREFRELPNIEERIMNSFGPSAATPAPPGVDTPPPSRPEKKKADIVFLLDGSINFRRDSFQEVLRFVSEIVDTVYEDGDSIQVGLVQYNSDPTDEFFLKDFSTKRQIIDAINKVVYKGGRHANTKVGLEHLRVNHFVPEAGSRLDQRVPQIAFVITGGKSVEDAQDVSLALTQRGVKVFAVGVRNIDSEEVGKIASNSATAFRVGNVQELSELSEQVLETLHDAMHETLCPGVTDAAKACNLDVILGFDGSRDQNVFVAQKGFESKVDAILNRISQMHRVSCSGGRSPTVRVSVVANTPSGPVEAFDFDEYQPEMLEKFRNMRSQHPYVLTEDTLKVYLNKFRQSSPDSVKVVIHFTDGADGDLADLHRASENLRQEGVRALILVGLERVVNLERLMHLEFGRGFMYDRPLRLNLLDLDYELAEQLDNIAEKACCGVPCKCSGQRGDRGPIGSIGPKGIPGEDGYRGYPGDEGGPGERGPPGVNGTQGFQGCPGQRGVKGSRGFPGEKGEVGEIGLDGLDGEDGDKGLPGSSGEKGNPGRRGDKGPRGEKGERGDVGIRGDPGNPGQDSQERGPKGETGDLGPMGVPGRDGVPGGPGETGKNGGFGRRGPPGAKGNKGGPGQPGFEGEQGTRGAQGPAGPAGPPGLIGEQGISGPRGSGGAAGAPGERGRTGPLGRKGEPGEPGPKGGIGNRGPRGETGDDGRDGVGSEGRRGKKGERGFPGYPGPKGNPGEPGLNGTTGPKGIRGRRGNSGPPGIVGQKGDPGYPGPAGPKGNRGDSIDQCALIQSIKDKCPCCYGPLECPVFPTELAFALDTSEGVNQDTFGRMRDVVLSIVNDLTIAESNCPRGARVAVVTYNNEVTTEIRFADSKRKSVLLDKIKNLQVALTSKQQSLETAMSFVARNTFKRVRNGFLMRKVAVFFSNTPTRASPQLREAVLKLSDAGITPLFLTRQEDRQLINALQINNTAVGHALVLPAGRDLTDFLENVLTCHVCLDICNIDPSCGFGSWRPSFRDRRAAGSDVDIDMAFILDSAETTTLFQFNEMKKYIAYLVRQLDMSPDPKASQHFARVAVVQHAPSESVDNASMPPVKVEFSLTDYGSKEKLVDFLSRGMTQLQGTRALGSAIEYTIENVFESAPNPRDLKIVVLMLTGEVPEQQLEEAQRVILQAKCKGYFFVVLGIGRKVNIKEVYTFASEPNDVFFKLVDKSTELNEEPLMRFGRLLPSFVSSENAFYLSPDIRKQCDWFQGDQPTKNLVKFGHKQVNVPNNVTSSPTSNPVTTTKPVTTTKPVTTTTKPVTTTTKPVTIINQPSVKPAAAKPAPAKPVAAKPVATKMATVRPPVAVKPATAAKPVAAKPAAVRPPAAAAAKPVATKPEVPRPQAAKPAATKPATTKPMVKMSREVQVFEITENSAKLHWERAEPPGPYFYDLTVTSAHDQSLVLKQNLTVTDRVIGGLLAGQTYHVAVVCYLRSQVRATYHGSFSTKKSQPPPPQPARSASSSTINLMVSTEPLALTETDICKLPKDEGTCRDFILKWYYDPNTKSCARFWYGGCGGNENKFGSQKECEKVCAPVLAKPGVISVMGT 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------EKKKADIVFLLDGSINFRRDSFQEVLRFVSEIVDTVYEDGDSIQVGLVQYNSDPTDEFFLKDFSTKRQIIDAINKVVYKGGRHANTKVGLEHLRVNHFVPEAGSRLDQRVPQIAFVITGGKSVEDAQDVSLALTQRGVKVFAVGVRNIDSEEVGKIASNSATAFRVGNVQELSELSEQVLETLHDAMHETLCPGVTDAAK------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6snk.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 1428 1428 ? A 11.371 45.933 59.940 1 1 A GLU 0.290 1 ATOM 2 C CA . GLU 1428 1428 ? A 12.818 45.537 59.895 1 1 A GLU 0.290 1 ATOM 3 C C . GLU 1428 1428 ? A 13.176 44.192 60.497 1 1 A GLU 0.290 1 ATOM 4 O O . GLU 1428 1428 ? A 13.937 43.451 59.873 1 1 A GLU 0.290 1 ATOM 5 C CB . GLU 1428 1428 ? A 13.641 46.699 60.465 1 1 A GLU 0.290 1 ATOM 6 C CG . GLU 1428 1428 ? A 15.170 46.484 60.377 1 1 A GLU 0.290 1 ATOM 7 C CD . GLU 1428 1428 ? A 15.875 47.814 60.111 1 1 A GLU 0.290 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 1428 1428 ? A 16.912 47.791 59.410 1 1 A GLU 0.290 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 1428 1428 ? A 15.324 48.854 60.555 1 1 A GLU 0.290 1 ATOM 10 N N . LYS 1429 1429 ? A 12.610 43.781 61.658 1 1 A LYS 0.360 1 ATOM 11 C CA . LYS 1429 1429 ? A 12.758 42.431 62.200 1 1 A LYS 0.360 1 ATOM 12 C C . LYS 1429 1429 ? A 12.448 41.331 61.200 1 1 A LYS 0.360 1 ATOM 13 O O . LYS 1429 1429 ? A 11.371 41.329 60.579 1 1 A LYS 0.360 1 ATOM 14 C CB . LYS 1429 1429 ? A 11.817 42.253 63.433 1 1 A LYS 0.360 1 ATOM 15 C CG . LYS 1429 1429 ? A 11.288 40.822 63.688 1 1 A LYS 0.360 1 ATOM 16 C CD . LYS 1429 1429 ? A 10.514 40.646 65.002 1 1 A LYS 0.360 1 ATOM 17 C CE . LYS 1429 1429 ? A 9.064 40.194 64.833 1 1 A LYS 0.360 1 ATOM 18 N NZ . LYS 1429 1429 ? A 8.514 39.806 66.151 1 1 A LYS 0.360 1 ATOM 19 N N . LYS 1430 1430 ? A 13.354 40.354 61.060 1 1 A LYS 0.760 1 ATOM 20 C CA . LYS 1430 1430 ? A 13.167 39.245 60.175 1 1 A LYS 0.760 1 ATOM 21 C C . LYS 1430 1430 ? A 12.186 38.245 60.758 1 1 A LYS 0.760 1 ATOM 22 O O . LYS 1430 1430 ? A 12.169 37.923 61.957 1 1 A LYS 0.760 1 ATOM 23 C CB . LYS 1430 1430 ? A 14.513 38.604 59.791 1 1 A LYS 0.760 1 ATOM 24 C CG . LYS 1430 1430 ? A 15.435 39.571 59.026 1 1 A LYS 0.760 1 ATOM 25 C CD . LYS 1430 1430 ? A 16.520 38.826 58.234 1 1 A LYS 0.760 1 ATOM 26 C CE . LYS 1430 1430 ? A 17.455 37.945 59.073 1 1 A LYS 0.760 1 ATOM 27 N NZ . LYS 1430 1430 ? A 18.329 38.724 59.976 1 1 A LYS 0.760 1 ATOM 28 N N . LYS 1431 1431 ? A 11.271 37.762 59.917 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 29 C CA . LYS 1431 1431 ? A 10.346 36.713 60.249 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 30 C C . LYS 1431 1431 ? A 10.482 35.706 59.158 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 31 O O . LYS 1431 1431 ? A 10.322 36.063 57.993 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 32 C CB . LYS 1431 1431 ? A 8.879 37.207 60.258 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 33 C CG . LYS 1431 1431 ? A 8.490 37.807 61.610 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 34 C CD . LYS 1431 1431 ? A 7.083 38.434 61.676 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 35 C CE . LYS 1431 1431 ? A 6.802 39.635 60.758 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 36 N NZ . LYS 1431 1431 ? A 7.726 40.748 61.061 1 1 A LYS 0.780 1 ATOM 37 N N . ALA 1432 1432 ? A 10.775 34.446 59.493 1 1 A ALA 0.870 1 ATOM 38 C CA . ALA 1432 1432 ? A 10.768 33.398 58.511 1 1 A ALA 0.870 1 ATOM 39 C C . ALA 1432 1432 ? A 10.706 32.056 59.199 1 1 A ALA 0.870 1 ATOM 40 O O . ALA 1432 1432 ? A 11.066 31.939 60.377 1 1 A ALA 0.870 1 ATOM 41 C CB . ALA 1432 1432 ? A 12.033 33.458 57.637 1 1 A ALA 0.870 1 ATOM 42 N N . ASP 1433 1433 ? A 10.273 31.012 58.481 1 1 A ASP 0.880 1 ATOM 43 C CA . ASP 1433 1433 ? A 10.301 29.651 58.960 1 1 A ASP 0.880 1 ATOM 44 C C . ASP 1433 1433 ? A 11.165 28.857 57.989 1 1 A ASP 0.880 1 ATOM 45 O O . ASP 1433 1433 ? A 10.903 28.807 56.784 1 1 A ASP 0.880 1 ATOM 46 C CB . ASP 1433 1433 ? A 8.868 29.076 59.054 1 1 A ASP 0.880 1 ATOM 47 C CG . ASP 1433 1433 ? A 8.011 29.864 60.011 1 1 A ASP 0.880 1 ATOM 48 O OD1 . ASP 1433 1433 ? A 8.545 30.296 61.064 1 1 A ASP 0.880 1 ATOM 49 O OD2 . ASP 1433 1433 ? A 6.793 30.023 59.769 1 1 A ASP 0.880 1 ATOM 50 N N . ILE 1434 1434 ? A 12.268 28.256 58.480 1 1 A ILE 0.910 1 ATOM 51 C CA . ILE 1434 1434 ? A 13.268 27.636 57.623 1 1 A ILE 0.910 1 ATOM 52 C C . ILE 1434 1434 ? A 13.327 26.154 57.950 1 1 A ILE 0.910 1 ATOM 53 O O . ILE 1434 1434 ? A 13.599 25.756 59.080 1 1 A ILE 0.910 1 ATOM 54 C CB . ILE 1434 1434 ? A 14.664 28.259 57.780 1 1 A ILE 0.910 1 ATOM 55 C CG1 . ILE 1434 1434 ? A 14.632 29.803 57.597 1 1 A ILE 0.910 1 ATOM 56 C CG2 . ILE 1434 1434 ? A 15.635 27.597 56.769 1 1 A ILE 0.910 1 ATOM 57 C CD1 . ILE 1434 1434 ? A 15.918 30.518 58.045 1 1 A ILE 0.910 1 ATOM 58 N N . VAL 1435 1435 ? A 13.078 25.269 56.972 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 59 C CA . VAL 1435 1435 ? A 13.114 23.836 57.204 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 60 C C . VAL 1435 1435 ? A 14.255 23.259 56.395 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 61 O O . VAL 1435 1435 ? A 14.301 23.369 55.171 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 62 C CB . VAL 1435 1435 ? A 11.789 23.143 56.896 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 63 C CG1 . VAL 1435 1435 ? A 11.882 21.644 57.249 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 64 C CG2 . VAL 1435 1435 ? A 10.669 23.803 57.729 1 1 A VAL 0.940 1 ATOM 65 N N . PHE 1436 1436 ? A 15.243 22.642 57.070 1 1 A PHE 0.950 1 ATOM 66 C CA . PHE 1436 1436 ? A 16.390 22.043 56.415 1 1 A PHE 0.950 1 ATOM 67 C C . PHE 1436 1436 ? A 16.095 20.601 56.056 1 1 A PHE 0.950 1 ATOM 68 O O . PHE 1436 1436 ? A 15.627 19.820 56.883 1 1 A PHE 0.950 1 ATOM 69 C CB . PHE 1436 1436 ? A 17.665 22.068 57.295 1 1 A PHE 0.950 1 ATOM 70 C CG . PHE 1436 1436 ? A 18.236 23.452 57.365 1 1 A PHE 0.950 1 ATOM 71 C CD1 . PHE 1436 1436 ? A 19.166 23.873 56.403 1 1 A PHE 0.950 1 ATOM 72 C CD2 . PHE 1436 1436 ? A 17.860 24.344 58.381 1 1 A PHE 0.950 1 ATOM 73 C CE1 . PHE 1436 1436 ? A 19.698 25.167 56.441 1 1 A PHE 0.950 1 ATOM 74 C CE2 . PHE 1436 1436 ? A 18.402 25.635 58.432 1 1 A PHE 0.950 1 ATOM 75 C CZ . PHE 1436 1436 ? A 19.318 26.049 57.458 1 1 A PHE 0.950 1 ATOM 76 N N . LEU 1437 1437 ? A 16.376 20.208 54.805 1 1 A LEU 0.950 1 ATOM 77 C CA . LEU 1437 1437 ? A 16.213 18.856 54.333 1 1 A LEU 0.950 1 ATOM 78 C C . LEU 1437 1437 ? A 17.582 18.342 53.923 1 1 A LEU 0.950 1 ATOM 79 O O . LEU 1437 1437 ? A 18.170 18.770 52.926 1 1 A LEU 0.950 1 ATOM 80 C CB . LEU 1437 1437 ? A 15.216 18.828 53.152 1 1 A LEU 0.950 1 ATOM 81 C CG . LEU 1437 1437 ? A 14.910 17.435 52.570 1 1 A LEU 0.950 1 ATOM 82 C CD1 . LEU 1437 1437 ? A 14.269 16.480 53.591 1 1 A LEU 0.950 1 ATOM 83 C CD2 . 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SER 1531 1531 ? A 4.415 26.084 58.988 1 1 A SER 0.840 1 ATOM 839 O OG . SER 1531 1531 ? A 4.412 26.892 57.807 1 1 A SER 0.840 1 ATOM 840 N N . ARG 1532 1532 ? A 4.085 29.245 59.928 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 841 C CA . ARG 1532 1532 ? A 3.294 30.448 59.877 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 842 C C . ARG 1532 1532 ? A 2.927 30.807 58.447 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 843 O O . ARG 1532 1532 ? A 2.664 31.970 58.125 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 844 C CB . ARG 1532 1532 ? A 4.082 31.588 60.532 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 845 C CG . ARG 1532 1532 ? A 4.421 31.308 62.004 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 846 C CD . ARG 1532 1532 ? A 5.266 32.420 62.604 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 847 N NE . ARG 1532 1532 ? A 6.663 32.173 62.133 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 848 C CZ . ARG 1532 1532 ? A 7.720 32.912 62.539 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 849 N NH1 . ARG 1532 1532 ? A 7.532 33.930 63.309 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 850 N NH2 . ARG 1532 1532 ? A 8.947 32.508 62.251 1 1 A ARG 0.750 1 ATOM 851 N N . LEU 1533 1533 ? 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A 17.897 6.706 43.915 1 1 A VAL 0.770 1 ATOM 985 C CG2 . VAL 1550 1550 ? A 15.612 7.264 44.942 1 1 A VAL 0.770 1 ATOM 986 N N . GLU 1551 1551 ? A 14.293 9.547 42.525 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 987 C CA . GLU 1551 1551 ? A 12.991 9.898 42.021 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 988 C C . GLU 1551 1551 ? A 12.934 11.388 41.775 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 989 O O . GLU 1551 1551 ? A 13.342 12.171 42.622 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 990 C CB . GLU 1551 1551 ? A 11.934 9.466 43.045 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 991 C CG . GLU 1551 1551 ? A 10.514 9.379 42.464 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 992 C CD . GLU 1551 1551 ? A 9.636 8.555 43.390 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 993 O OE1 . GLU 1551 1551 ? A 10.047 7.426 43.749 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 994 O OE2 . GLU 1551 1551 ? A 8.556 9.057 43.798 1 1 A GLU 0.780 1 ATOM 995 N N . ASP 1552 1552 ? A 12.463 11.815 40.582 1 1 A ASP 0.820 1 ATOM 996 C CA . ASP 1552 1552 ? A 12.412 13.206 40.210 1 1 A ASP 0.820 1 ATOM 997 C C . ASP 1552 1552 ? A 11.542 14.049 41.146 1 1 A ASP 0.820 1 ATOM 998 O O . ASP 1552 1552 ? A 10.415 13.681 41.475 1 1 A ASP 0.820 1 ATOM 999 C CB . ASP 1552 1552 ? A 11.993 13.320 38.739 1 1 A ASP 0.820 1 ATOM 1000 C CG . ASP 1552 1552 ? A 12.594 14.573 38.200 1 1 A ASP 0.820 1 ATOM 1001 O OD1 . ASP 1552 1552 ? A 12.630 15.657 38.804 1 1 A ASP 0.820 1 ATOM 1002 O OD2 . ASP 1552 1552 ? A 13.086 14.369 37.047 1 1 A ASP 0.820 1 ATOM 1003 N N . ALA 1553 1553 ? A 12.084 15.182 41.642 1 1 A ALA 0.860 1 ATOM 1004 C CA . ALA 1553 1553 ? A 11.473 16.003 42.662 1 1 A ALA 0.860 1 ATOM 1005 C C . ALA 1553 1553 ? A 10.961 17.294 42.057 1 1 A ALA 0.860 1 ATOM 1006 O O . ALA 1553 1553 ? A 10.481 18.173 42.787 1 1 A ALA 0.860 1 ATOM 1007 C CB . ALA 1553 1553 ? A 12.473 16.276 43.812 1 1 A ALA 0.860 1 ATOM 1008 N N . GLN 1554 1554 ? A 11.007 17.434 40.714 1 1 A GLN 0.800 1 ATOM 1009 C CA . GLN 1554 1554 ? A 10.598 18.644 40.021 1 1 A GLN 0.800 1 ATOM 1010 C C . GLN 1554 1554 ? A 9.175 19.115 40.321 1 1 A GLN 0.800 1 ATOM 1011 O O . GLN 1554 1554 ? 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A 10.446 41.939 50.654 1 1 A HIS 0.560 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O S # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 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1615 HIS 1 0.560 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #