data_SMR-7d21f60868a42515f892bf07b71cade9_9 _entry.id SMR-7d21f60868a42515f892bf07b71cade9_9 _struct.entry_id SMR-7d21f60868a42515f892bf07b71cade9_9 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P12111 (isoform 2)/ CO6A3_HUMAN, Collagen alpha-3(VI) chain Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P12111 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 375232.758 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP CO6A3_HUMAN P12111 1 ;MRKHRHLPLVAVFCLFLSGFPTTHAQQQQAAQDSADIIFLIDGSNNTGSVNFAVILDFLVNLLEKLPIGT QQIRVGVVQFSDEPRTMFSLDTYSTKAQVLGAVKALGFAGGELANIGLALDFVVENHFTRAGGSRVEEGV PQVLVLISAGPSSDEIRYGVVALKQASVFSFGLGAQAASRAELQHIATDDNLVFTVPEFRSFGDLQEKLL PYIVGVAQRHIVLKPPTIVTQVIEVNKRDIVFLVDGSSALGLANFNAIRDFIAKVIQRLEIGQDLIQVAV AQYADTVRPEFYFNTHPTKREVITAVRKMKPLDGSALYTGSALDFVRNNLFTSSAGYRAAEGIPKLLVLI TGGKSLDEISQPAQELKRSSIMAFAIGNKGADQAELEEIAFDSSLVFIPAEFRAAPLQGMLPGLLAPLRT LSGTPEVHSNKRDIIFLLDGSANVGKTNFPYVRDFVMNLVNSLDIGNDNIRVGLVQFSDTPVTEFSLNTY QTKSDILGHLRQLQLQGGSGLNTGSALSYVYANHFTEAGGSRIREHVPQLLLLLTAGQSEDSYLQAANAL TRAGILTFCVGASQANKAELEQIAFNPSLVYLMDDFSSLPALPQQLIQPLTTYVSGGVEEVPLAQPESKR DILFLFDGSANLVGQFPVVRDFLYKIIDELNVKPEGTRIAVAQYSDDVKVESRFDEHQSKPEILNLVKRM KIKTGKALNLGYALDYAQRYIFVKSAGSRIEDGVLQFLVLLVAGRSSDRVDGPASNLKQSGVVPFIFQAK NADPAELEQIVLSPAFILAAESLPKIGDLHPQIVNLLKSVHNGAPAPVSGEKDVVFLLDGSEGVRSGFPL LKEFVQRVVESLDVGQDRVRVAVVQYSDRTRPEFYLNSYMNKQDVVNAVRQLTLLGGPTPNTGAALEFVL RNILVSSAGSRITEGVPQLLIVLTADRSGDDVRNPSVVVKRGGAVPIGIGIGNADITEMQTISFIPDFAV AIPTFRQLGTVQQVISERVTQLTREELSRLQPVLQPLPSPGVGGKRDVVFLIDGSQSAGPEFQYVRTLIE RLVDYLDVGFDTTRVAVIQFSDDPKVEFLLNAHSSKDEVQNAVQRLRPKGGRQINVGNALEYVSRNIFKR PLGSRIEEGVPQFLVLISSGKSDDEVDDPAVELKQFGVAPFTIARNADQEELVKISLSPEYVFSVSTFRE LPSLEQKLLTPITTLTSEQIQKLLASTRYPPPAVESDAADIVFLIDSSEGVRPDGFAHIRDFVSRIVRRL NIGPSKVRVGVVQFSNDVFPEFYLKTYRSQAPVLDAIRRLRLRGGSPLNTGKALEFVARNLFVKSAGSRI EDGVPQHLVLVLGGKSQDDVSRFAQVIRSSGIVSLGVGDRNIDRTELQTITNDPRLVFTVREFRELPNIE ERIMNSFGPSAATPAPPGVDTPPPSRPEKKKADIVFLLDGSINFRRDSFQEVLRFVSEIVDTVYEDGDSI QVGLVQYNSDPTDEFFLKDFSTKRQIIDAINKVVYKGGRHANTKVGLEHLRVNHFVPEAGSRLDQRVPQI AFVITGGKSVEDAQDVSLALTQRGVKVFAVGVRNIDSEEVGKIASNSATAFRVGNVQELSELSEQVLETL HDAMHETLCPGVTDAAKACNLDVILGFDGSRDQNVFVAQKGFESKVDAILNRISQMHRVSCSGGRSPTVR VSVVANTPSGPVEAFDFDEYQPEMLEKFRNMRSQHPYVLTEDTLKVYLNKFRQSSPDSVKVVIHFTDGAD GDLADLHRASENLRQEGVRALILVGLERVVNLERLMHLEFGRGFMYDRPLRLNLLDLDYELAEQLDNIAE KACCGVPCKCSGQRGDRGPIGSIGPKGIPGEDGYRGYPGDEGGPGERGPPGVNGTQGFQGCPGQRGVKGS RGFPGEKGEVGEIGLDGLDGEDGDKGLPGSSGEKGNPGRRGDKGPRGEKGERGDVGIRGDPGNPGQDSQE RGPKGETGDLGPMGVPGRDGVPGGPGETGKNGGFGRRGPPGAKGNKGGPGQPGFEGEQGTRGAQGPAGPA GPPGLIGEQGISGPRGSGGAAGAPGERGRTGPLGRKGEPGEPGPKGGIGNRGPRGETGDDGRDGVGSEGR RGKKGERGFPGYPGPKGNPGEPGLNGTTGPKGIRGRRGNSGPPGIVGQKGDPGYPGPAGPKGNRGDSIDQ CALIQSIKDKCPCCYGPLECPVFPTELAFALDTSEGVNQDTFGRMRDVVLSIVNDLTIAESNCPRGARVA VVTYNNEVTTEIRFADSKRKSVLLDKIKNLQVALTSKQQSLETAMSFVARNTFKRVRNGFLMRKVAVFFS NTPTRASPQLREAVLKLSDAGITPLFLTRQEDRQLINALQINNTAVGHALVLPAGRDLTDFLENVLTCHV CLDICNIDPSCGFGSWRPSFRDRRAAGSDVDIDMAFILDSAETTTLFQFNEMKKYIAYLVRQLDMSPDPK ASQHFARVAVVQHAPSESVDNASMPPVKVEFSLTDYGSKEKLVDFLSRGMTQLQGTRALGSAIEYTIENV FESAPNPRDLKIVVLMLTGEVPEQQLEEAQRVILQAKCKGYFFVVLGIGRKVNIKEVYTFASEPNDVFFK LVDKSTELNEEPLMRFGRLLPSFVSSENAFYLSPDIRKQCDWFQGDQPTKNLVKFGHKQVNVPNNVTSSP TSNPVTTTKPVTTTKPVTTTTKPVTTTTKPVTIINQPSVKPAAAKPAPAKPVAAKPVATKMATVRPPVAV KPATAAKPVAAKPAAVRPPAAAAAKPVATKPEVPRPQAAKPAATKPATTKPMVKMSREVQVFEITENSAK LHWERAEPPGPYFYDLTVTSAHDQSLVLKQNLTVTDRVIGGLLAGQTYHVAVVCYLRSQVRATYHGSFST KKSQPPPPQPARSASSSTINLMVSTEPLALTETDICKLPKDEGTCRDFILKWYYDPNTKSCARFWYGGCG GNENKFGSQKECEKVCAPVLAKPGVISVMGT ; 'Collagen alpha-3(VI) chain' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 2971 1 2971 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Collagen alpha3(VI) {PDB ID=4ihk, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=4ihk.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 4ihk, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 9' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ 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_ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;SGEKDVVFLIDGSEGVRSGFPLLKDFVQRVVESLDVGPDQVRVALVQYSDRTRPEFYLNSHMDQQGVISA IRRLTLLGGPTPNTGAALEFVLRNILTSSTGSRIAEGVPQLLIVLTAEPSGDDVRGPSVVLKQGGAVPIG IGIGNADISEMQTISFIPDFAVAIPTFRELGTIQQVISERVIQLNREELSSLKPILTPSTGAG ; ;SGEKDVVFLIDGSEGVRSGFPLLKDFVQRVVESLDVGPDQVRVALVQYSDRTRPEFYLNSHMDQQGVISA IRRLTLLGGPTPNTGAALEFVLRNILTSSTGSRIAEGVPQLLIVLTAEPSGDDVRGPSVVLKQGGAVPIG IGIGNADISEMQTISFIPDFAVAIPTFRELGTIQQVISERVIQLNREELSSLKPILTPSTGAG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 5 194 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4ihk 2023-11-08 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 2971 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 2972 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 2.62e-31 36.508 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MRKHRHLPLVAVFCLFLSGFPTTHAQQQQAAQDSADIIFLIDGSNNTGSVNFAVILDFLVNLLEKLPIGTQQIRVGVVQFSDEPRTMFSLDTYSTKAQVLGAVKALGFAGGELANIGLALDFVVENHFTRAGGSRVEEGVPQVLVLISAGPSSDEIRYGVVALKQASVFSFGLGAQAASRAELQHIATDDNLVFTVPEFRSFGDLQEKLLPYIVGVAQRHI-VLKPPTIVTQVIEVNKRDIVFLVDGSSALGLANFNAIRDFIAKVIQRLEIGQDLIQVAVAQYADTVRPEFYFNTHPTKREVITAVRKMKPLDGSALYTGSALDFVRNNLFTSSAGYRAAEGIPKLLVLITGGKSLDEISQPAQELKRSSIMAFAIGNKGADQAELEEIAFDSSLVFIPAEFRAAPLQGMLPGLLAPLRTLSGTPEVHSNKRDIIFLLDGSANVGKTNFPYVRDFVMNLVNSLDIGNDNIRVGLVQFSDTPVTEFSLNTYQTKSDILGHLRQLQLQGGSGLNTGSALSYVYANHFTEAGGSRIREHVPQLLLLLTAGQSEDSYLQAANALTRAGILTFCVGASQANKAELEQIAFNPSLVYLMDDFSSLPALPQQLIQPLTTYVSGGVEEVPLAQPESKRDILFLFDGSANLVGQFPVVRDFLYKIIDELNVKPEGTRIAVAQYSDDVKVESRFDEHQSKPEILNLVKRMKIKTGKALNLGYALDYAQRYIFVKSAGSRIEDGVLQFLVLLVAGRSSDRVDGPASNLKQSGVVPFIFQAKNADPAELEQIVLSPAFILAAESLPKIGDLHPQIVNLLKSVHNGAPAPVSGEKDVVFLLDGSEGVRSGFPLLKEFVQRVVESLDVGQDRVRVAVVQYSDRTRPEFYLNSYMNKQDVVNAVRQLTLLGGPTPNTGAALEFVLRNILVSSAGSRITEGVPQLLIVLTADRSGDDVRNPSVVVKRGGAVPIGIGIGNADITEMQTISFIPDFAVAIPTFRQLGTVQQVISERVTQLTREELSRLQPVLQPLPSPGVGGKRDVVFLIDGSQSAGPEFQYVRTLIERLVDYLDVGFDTTRVAVIQFSDDPKVEFLLNAHSSKDEVQNAVQRLRPKGGRQINVGNALEYVSRNIFKRPLGSRIEEGVPQFLVLISSGKSDDEVDDPAVELKQFGVAPFTIARNADQEELVKISLSPEYVFSVSTFRELPSLEQKLLTPITTLTSEQIQKLLASTRYPPPAVESDAADIVFLIDSSEGVRPDGFAHIRDFVSRIVRRLNIGPSKVRVGVVQFSNDVFPEFYLKTYRSQAPVLDAIRRLRLRGGSPLNTGKALEFVARNLFVKSAGSRIEDGVPQHLVLVLGGKSQDDVSRFAQVIRSSGIVSLGVGDRNIDRTELQTITNDPRLVFTVREFRELPNIEERIMNSFGPSAATPAPPGVDTPPPSRPEKKKADIVFLLDGSINFRRDSFQEVLRFVSEIVDTVYEDGDSIQVGLVQYNSDPTDEFFLKDFSTKRQIIDAINKVVYKGGRHANTKVGLEHLRVNHFVPEAGSRLDQRVPQIAFVITGGKSVEDAQDVSLALTQRGVKVFAVGVRNIDSEEVGKIASNSATAFRVGNVQELSELSEQVLETLHDAMHETLCPGVTDAAKACNLDVILGFDGSRDQNVFVAQKGFESKVDAILNRISQMHRVSCSGGRSPTVRVSVVANTPSGPVEAFDFDEYQPEMLEKFRNMRSQHPYVLTEDTLKVYLNKFRQSSPDSVKVVIHFTDGADGDLADLHRASENLRQEGVRALILVGLERVVNLERLMHLEFGRGFMYDRPLRLNLLDLDYELAEQLDNIAEKACCGVPCKCSGQRGDRGPIGSIGPKGIPGEDGYRGYPGDEGGPGERGPPGVNGTQGFQGCPGQRGVKGSRGFPGEKGEVGEIGLDGLDGEDGDKGLPGSSGEKGNPGRRGDKGPRGEKGERGDVGIRGDPGNPGQDSQERGPKGETGDLGPMGVPGRDGVPGGPGETGKNGGFGRRGPPGAKGNKGGPGQPGFEGEQGTRGAQGPAGPAGPPGLIGEQGISGPRGSGGAAGAPGERGRTGPLGRKGEPGEPGPKGGIGNRGPRGETGDDGRDGVGSEGRRGKKGERGFPGYPGPKGNPGEPGLNGTTGPKGIRGRRGNSGPPGIVGQKGDPGYPGPAGPKGNRGDSIDQCALIQSIKDKCPCCYGPLECPVFPTELAFALDTSEGVNQDTFGRMRDVVLSIVNDLTIAESNCPRGARVAVVTYNNEVTTEIRFADSKRKSVLLDKIKNLQVALTSKQQSLETAMSFVARNTFKRVRNGFLMRKVAVFFSNTPTRASPQLREAVLKLSDAGITPLFLTRQEDRQLINALQINNTAVGHALVLPAGRDLTDFLENVLTCHVCLDICNIDPSCGFGSWRPSFRDRRAAGSDVDIDMAFILDSAETTTLFQFNEMKKYIAYLVRQLDMSPDPKASQHFARVAVVQHAPSESVDNASMPPVKVEFSLTDYGSKEKLVDFLSRGMTQLQGTRALGSAIEYTIENVFESAPNPRDLKIVVLMLTGEVPEQQLEEAQRVILQAKCKGYFFVVLGIGRKVNIKEVYTFASEPNDVFFKLVDKSTELNEEPLMRFGRLLPSFVSSENAFYLSPDIRKQCDWFQGDQPTKNLVKFGHKQVNVPNNVTSSPTSNPVTTTKPVTTTKPVTTTTKPVTTTTKPVTIINQPSVKPAAAKPAPAKPVAAKPVATKMATVRPPVAVKPATAAKPVAAKPAAVRPPAAAAAKPVATKPEVPRPQAAKPAATKPATTKPMVKMSREVQVFEITENSAKLHWERAEPPGPYFYDLTVTSAHDQSLVLKQNLTVTDRVIGGLLAGQTYHVAVVCYLRSQVRATYHGSFSTKKSQPPPPQPARSASSSTINLMVSTEPLALTETDICKLPKDEGTCRDFILKWYYDPNTKSCARFWYGGCGGNENKFGSQKECEKVCAPVLAKPGVISVMGT 2 1 2 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# # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4ihk.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 9' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A 19.864 9.270 36.198 1 1 A ILE 0.790 1 ATOM 16 C CD1 . ILE 37 37 ? A 22.923 8.628 36.856 1 1 A ILE 0.790 1 ATOM 17 N N . ILE 38 38 ? A 19.899 12.746 35.904 1 1 A ILE 0.820 1 ATOM 18 C CA . ILE 38 38 ? A 18.890 13.748 35.698 1 1 A ILE 0.820 1 ATOM 19 C C . ILE 38 38 ? A 17.944 13.202 34.664 1 1 A ILE 0.820 1 ATOM 20 O O . ILE 38 38 ? A 18.342 12.773 33.585 1 1 A ILE 0.820 1 ATOM 21 C CB . ILE 38 38 ? A 19.467 15.091 35.270 1 1 A ILE 0.820 1 ATOM 22 C CG1 . ILE 38 38 ? A 20.375 15.706 36.363 1 1 A ILE 0.820 1 ATOM 23 C CG2 . ILE 38 38 ? A 18.316 16.083 34.984 1 1 A ILE 0.820 1 ATOM 24 C CD1 . ILE 38 38 ? A 21.767 15.087 36.519 1 1 A ILE 0.820 1 ATOM 25 N N . PHE 39 39 ? A 16.640 13.193 34.974 1 1 A PHE 0.840 1 ATOM 26 C CA . PHE 39 39 ? A 15.638 12.855 33.991 1 1 A PHE 0.840 1 ATOM 27 C C . PHE 39 39 ? A 15.030 14.126 33.463 1 1 A PHE 0.840 1 ATOM 28 O O . PHE 39 39 ? A 14.549 14.975 34.210 1 1 A PHE 0.840 1 ATOM 29 C CB . PHE 39 39 ? A 14.497 11.965 34.515 1 1 A PHE 0.840 1 ATOM 30 C CG . PHE 39 39 ? A 15.028 10.633 34.926 1 1 A PHE 0.840 1 ATOM 31 C CD1 . PHE 39 39 ? A 15.036 9.569 34.012 1 1 A PHE 0.840 1 ATOM 32 C CD2 . PHE 39 39 ? A 15.515 10.427 36.223 1 1 A PHE 0.840 1 ATOM 33 C CE1 . PHE 39 39 ? A 15.516 8.313 34.396 1 1 A PHE 0.840 1 ATOM 34 C CE2 . PHE 39 39 ? A 15.983 9.168 36.608 1 1 A PHE 0.840 1 ATOM 35 C CZ . PHE 39 39 ? A 15.984 8.106 35.698 1 1 A PHE 0.840 1 ATOM 36 N N . LEU 40 40 ? A 15.033 14.268 32.132 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 37 C CA . LEU 40 40 ? A 14.399 15.375 31.467 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 38 C C . LEU 40 40 ? A 13.236 14.807 30.686 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 39 O O . LEU 40 40 ? A 13.388 14.006 29.769 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 40 C CB . LEU 40 40 ? A 15.413 16.134 30.586 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 41 C CG . LEU 40 40 ? A 14.878 17.399 29.892 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 42 C CD1 . LEU 40 40 ? A 14.270 18.397 30.886 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 43 C CD2 . LEU 40 40 ? A 16.005 18.060 29.089 1 1 A LEU 0.820 1 ATOM 44 N N . ILE 41 41 ? A 12.013 15.169 31.102 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 45 C CA . ILE 41 41 ? A 10.808 14.489 30.663 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 46 C C . ILE 41 41 ? A 9.938 15.447 29.880 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 47 O O . ILE 41 41 ? A 9.540 16.496 30.382 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 48 C CB . ILE 41 41 ? A 9.979 13.966 31.840 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 49 C CG1 . ILE 41 41 ? A 10.806 13.125 32.843 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 50 C CG2 . ILE 41 41 ? A 8.779 13.151 31.311 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 51 C CD1 . ILE 41 41 ? A 11.354 11.820 32.266 1 1 A ILE 0.810 1 ATOM 52 N N . ASP 42 42 ? A 9.593 15.097 28.623 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 53 C CA . ASP 42 42 ? A 8.592 15.803 27.841 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 54 C C . ASP 42 42 ? A 7.229 15.716 28.523 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 55 O O . ASP 42 42 ? A 6.665 14.646 28.752 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 56 C CB . ASP 42 42 ? A 8.568 15.220 26.404 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 57 C CG . ASP 42 42 ? A 7.598 15.845 25.403 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 58 O OD1 . ASP 42 42 ? A 6.896 16.841 25.718 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 59 O OD2 . ASP 42 42 ? A 7.496 15.249 24.299 1 1 A ASP 0.780 1 ATOM 60 N N . GLY 43 43 ? A 6.698 16.882 28.909 1 1 A GLY 0.770 1 ATOM 61 C CA . GLY 43 43 ? A 5.411 17.019 29.557 1 1 A GLY 0.770 1 ATOM 62 C C . GLY 43 43 ? A 4.399 17.653 28.668 1 1 A GLY 0.770 1 ATOM 63 O O . GLY 43 43 ? A 3.363 18.092 29.155 1 1 A GLY 0.770 1 ATOM 64 N N . SER 44 44 ? A 4.669 17.759 27.353 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 65 C CA . SER 44 44 ? A 3.739 18.371 26.420 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 66 C C . SER 44 44 ? A 2.501 17.525 26.161 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 67 O O . SER 44 44 ? A 2.393 16.380 26.571 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 68 C CB . SER 44 44 ? A 4.430 18.790 25.093 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 69 O OG . SER 44 44 ? A 4.684 17.681 24.197 1 1 A SER 0.760 1 ATOM 70 N N . ASN 45 45 ? A 1.497 18.073 25.445 1 1 A ASN 0.670 1 ATOM 71 C CA . ASN 45 45 ? A 0.229 17.396 25.198 1 1 A ASN 0.670 1 ATOM 72 C C . ASN 45 45 ? A 0.382 16.046 24.494 1 1 A ASN 0.670 1 ATOM 73 O O . 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A 8.103 8.802 20.254 1 1 A ALA 0.730 1 ATOM 1043 C CB . ALA 175 175 ? A 8.264 7.342 23.003 1 1 A ALA 0.730 1 ATOM 1044 N N . GLN 176 176 ? A 7.615 6.651 19.827 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 1045 C CA . GLN 176 176 ? A 6.569 6.949 18.852 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 1046 C C . GLN 176 176 ? A 6.971 7.835 17.676 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 1047 O O . GLN 176 176 ? A 7.607 7.401 16.721 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 1048 C CB . GLN 176 176 ? A 5.316 7.550 19.554 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 1049 C CG . GLN 176 176 ? A 4.641 6.603 20.570 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 1050 C CD . GLN 176 176 ? A 3.398 7.264 21.167 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 1051 O OE1 . GLN 176 176 ? A 3.293 8.478 21.231 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 1052 N NE2 . GLN 176 176 ? A 2.424 6.434 21.626 1 1 A GLN 0.600 1 ATOM 1053 N N . ALA 177 177 ? A 6.569 9.120 17.715 1 1 A ALA 0.640 1 ATOM 1054 C CA . ALA 177 177 ? A 6.773 10.049 16.632 1 1 A ALA 0.640 1 ATOM 1055 C C . ALA 177 177 ? A 8.022 10.892 16.821 1 1 A ALA 0.640 1 ATOM 1056 O O . ALA 177 177 ? A 8.357 11.727 15.983 1 1 A ALA 0.640 1 ATOM 1057 C CB . ALA 177 177 ? A 5.525 10.945 16.528 1 1 A ALA 0.640 1 ATOM 1058 N N . ALA 178 178 ? A 8.772 10.668 17.915 1 1 A ALA 0.690 1 ATOM 1059 C CA . ALA 178 178 ? A 10.078 11.253 18.112 1 1 A ALA 0.690 1 ATOM 1060 C C . ALA 178 178 ? A 11.110 10.831 17.074 1 1 A ALA 0.690 1 ATOM 1061 O O . ALA 178 178 ? A 11.164 9.698 16.607 1 1 A ALA 0.690 1 ATOM 1062 C CB . ALA 178 178 ? A 10.617 10.934 19.513 1 1 A ALA 0.690 1 ATOM 1063 N N . SER 179 179 ? A 11.993 11.767 16.692 1 1 A SER 0.670 1 ATOM 1064 C CA . SER 179 179 ? A 12.986 11.502 15.665 1 1 A SER 0.670 1 ATOM 1065 C C . SER 179 179 ? A 14.253 10.879 16.224 1 1 A SER 0.670 1 ATOM 1066 O O . SER 179 179 ? A 14.941 11.472 17.047 1 1 A SER 0.670 1 ATOM 1067 C CB . SER 179 179 ? A 13.359 12.811 14.924 1 1 A SER 0.670 1 ATOM 1068 O OG . SER 179 179 ? A 14.354 12.613 13.913 1 1 A SER 0.670 1 ATOM 1069 N N . ARG 180 180 ? A 14.650 9.670 15.737 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 1070 C CA . ARG 180 180 ? A 15.911 9.039 16.134 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 1071 C C . ARG 180 180 ? A 17.111 9.917 15.822 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 1072 O O . ARG 180 180 ? A 18.044 10.002 16.611 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 1073 C CB . ARG 180 180 ? A 16.136 7.618 15.532 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 1074 C CG . ARG 180 180 ? A 17.367 6.859 16.115 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 1075 C CD . ARG 180 180 ? A 17.486 5.392 15.649 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 1076 N NE . ARG 180 180 ? A 18.699 4.742 16.261 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 1077 C CZ . ARG 180 180 ? A 18.739 4.161 17.467 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 1078 N NH1 . ARG 180 180 ? A 17.732 4.242 18.331 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 1079 N NH2 . ARG 180 180 ? A 19.875 3.593 17.883 1 1 A ARG 0.590 1 ATOM 1080 N N . ALA 181 181 ? A 17.066 10.646 14.690 1 1 A ALA 0.710 1 ATOM 1081 C CA . ALA 181 181 ? A 18.090 11.588 14.294 1 1 A ALA 0.710 1 ATOM 1082 C C . ALA 181 181 ? A 18.303 12.725 15.282 1 1 A ALA 0.710 1 ATOM 1083 O O . ALA 181 181 ? A 19.430 13.099 15.601 1 1 A ALA 0.710 1 ATOM 1084 C CB . ALA 181 181 ? 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LEU 183 183 ? A 17.267 10.691 20.064 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 1099 C CG . LEU 183 183 ? A 15.762 10.694 20.226 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 1100 C CD1 . LEU 183 183 ? A 15.361 9.224 20.087 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 1101 C CD2 . LEU 183 183 ? A 15.305 11.348 21.535 1 1 A LEU 0.720 1 ATOM 1102 N N . GLN 184 184 ? A 19.953 11.201 18.391 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 1103 C CA . GLN 184 184 ? A 21.360 10.963 18.078 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 1104 C C . GLN 184 184 ? A 22.195 12.210 18.301 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 1105 O O . GLN 184 184 ? A 23.188 12.194 19.012 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 1106 C CB . GLN 184 184 ? A 21.549 10.506 16.603 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 1107 C CG . GLN 184 184 ? A 21.147 9.037 16.386 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 1108 C CD . GLN 184 184 ? A 21.043 8.595 14.925 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 1109 O OE1 . GLN 184 184 ? A 20.584 9.281 14.024 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 1110 N NE2 . GLN 184 184 ? A 21.421 7.312 14.693 1 1 A GLN 0.690 1 ATOM 1111 N N . HIS 185 185 ? A 21.699 13.360 17.794 1 1 A HIS 0.670 1 ATOM 1112 C CA . HIS 185 185 ? A 22.291 14.665 18.034 1 1 A HIS 0.670 1 ATOM 1113 C C . HIS 185 185 ? A 22.373 15.021 19.519 1 1 A HIS 0.670 1 ATOM 1114 O O . HIS 185 185 ? A 23.393 15.530 19.990 1 1 A HIS 0.670 1 ATOM 1115 C CB . HIS 185 185 ? A 21.492 15.760 17.272 1 1 A HIS 0.670 1 ATOM 1116 C CG . HIS 185 185 ? A 21.539 15.639 15.775 1 1 A HIS 0.670 1 ATOM 1117 N ND1 . HIS 185 185 ? A 20.779 16.496 14.989 1 1 A HIS 0.670 1 ATOM 1118 C CD2 . HIS 185 185 ? A 22.235 14.776 14.989 1 1 A HIS 0.670 1 ATOM 1119 C CE1 . HIS 185 185 ? A 21.026 16.122 13.749 1 1 A HIS 0.670 1 ATOM 1120 N NE2 . HIS 185 185 ? A 21.902 15.092 13.691 1 1 A HIS 0.670 1 ATOM 1121 N N . ILE 186 186 ? A 21.312 14.737 20.304 1 1 A ILE 0.730 1 ATOM 1122 C CA . ILE 186 186 ? A 21.274 14.947 21.748 1 1 A ILE 0.730 1 ATOM 1123 C C . ILE 186 186 ? A 22.238 14.101 22.544 1 1 A ILE 0.730 1 ATOM 1124 O O . ILE 186 186 ? A 22.929 14.597 23.434 1 1 A ILE 0.730 1 ATOM 1125 C CB . 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #