data_SMR-37ef6b4d65e0e140bbdc584a6ab8ab1d_10 _entry.id SMR-37ef6b4d65e0e140bbdc584a6ab8ab1d_10 _struct.entry_id SMR-37ef6b4d65e0e140bbdc584a6ab8ab1d_10 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - C0H5F4/ RH2B_PLAF7, Reticulocyte-binding protein homolog 2b Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries C0H5F4' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 442030.413 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP RH2B_PLAF7 C0H5F4 1 ;MKTTLFCSISFCNIIFFFLELSHEHFVGQSSNTHGASSVTDFNFSEEKNLKSFEGKNNNNDNYASINRLY RKKPYMKRSLINLENDLFRLEPISYIQRYYKKNINRSDIFHNKKERGSKVYSNVSSFHSFIQEGKEEVEV FSIWGSNSVLDHIDVLRDNGTVVFSVQPYYLDIYTCKEAILFTTSFYKDLDKSSITKINEDIEKFNEEII KNEEQCLVGGKTDFDNLLIVLENAEKANVRKTLFDNTFNDYKNKKSSFYNCLKNKKNDYDKKIKNIKNEI TKLLKNIESTGNMCKTESYVMNNNLYLLRVNEVKSTPIDLYLNRAKELLESSSKLVNPIKMKLGDNKNMY SIGYIHDEIKDIIKRYNFHLKHIEKGKEYIKRITQANNIADKMKKDELIKKIFESSKHFASFKYSNEMIS KLDSLFIKNEEILNNLFNNIFNIFKKKYETYVDMKTIESKYTTVMTLSEHLLEYAMDVLKANPQKPIDPK ANLDSEVVKLQIKINEKSNELDNAISQVKTLIIIMKSFYDIIISEKASMDEMEKKELSLNNYIEKTDYIL QTYNIFKSKSNIINNNSKNISSKYITIEGLKNDIDELNSLISYFKDSQETLIKDDELKKNMKTDYLNNVK YIEENVTHINEIILLKDSITQRIADIDELNSLNLININDFINEKNISQEKVSYNLNKLYKGSFEELESEL SHFLDTKYLFHEKKSVNELQTILNTSNNECAKLNFMKSDNNNNNNNSNIINLLKTELSHLLSLKENIIKK LLNHIEQNIQNSSNKYTITYTDINNRMEDYKEEIESLEVYKHTIGNIQKEYILHLYENDKNALAVHNTSM QILQYKDAIQNIKNKISDDIKILKKYKEMNQDLLNYYEILDKKLKDNTYIKEMHTASLVQITQYIPYEDK TISELEQEFNNNNQKLDNILQDINAMNLNINILQTLNIGINACNTNNKNVEHLLNKKIELKNILNDQMKI IKNDDIIQDNEKENFSNVLKKEEEKLEKELDDIKFNNLKMDIHKLLNSYDHTKQNIESNLKINLDSFEKE KDSWVHFKSTIDSLYVEYNICNQKTHNTIKQQKNDIIELIYKRIKDINQEIIEKVDNYYSLSDKALTKLK SIHFNIDKEKYKNPKSQENIKLLEDRVMILEKKIKEDKDALIQIKNLSHDHFVNADNEKKKQKEKEEDDE QTHYSKKRKVMGDIYKDIKKNLDELNNKNLIDITLNEANKIESEYEKILIDDICEQITNEAKKSDTIKEK IESYKKDIDYVDVDVSKTRNDHHLNGDKIHDSFFYEDTLNYKAYFDKLKDLYENINKLTNESNGLKSDAH NNNTQVDKLKEINLQVFSNLGNIIKYVEKLENTLHELKDMYEFLETIDINKILKSIHNSMKKSEEYSNET KKIFEQSVNITNQFIEDVEILKTSINPNYESLNDDQIDDNIKSLVLKKEEISEKRKQVNKYITDIESNKE QSDLHLRYASRSIYVIDLFIKHEIINPSDGKNFDIIKVKEMINKTKQVSNEAMEYANKMDEKNKDIIKIE NELYNLINNNIRSLKGVKYEKVRKQARNAIDDINNIHSNIKTILTKSKERLDEIKKQPNIKREGDVLNND KTKIAYITIQINNGRIESNLLNILNMKHNIDTILNKAMDYMNDVSKSDQIVINIDSLNMNDIYNKDKDLL INILKEKQNMEAEYKKMNEMYNYVNETEKEIIKHKKNYEIRIMEHIKKETNEKKKKFMESNNKSLTTLMD SFRSMFYNEYINDYNINENFEKHQNILNEIYNGFNESYNIINTKMTEIINDNLDYNEIKEIKEVAQTEYD KLNKKVDELKNYLNNIKEQEGHRLIDYIKEKIFNLYIKCSEQQNIIDDSYNYITVKKQYIKTIEDVKFLL DSLNTIEEKNKSVANLEICTNKEDIKNLLKHVIKLANFSGIIVMSDTNTEITPENPLEDNDLLNLQLYFE RKHEITSTLENDSDLELDHLGSNSDESIDNLKVYNDIIELHTYSTQILKYLDNIQKLKGDCNDLVKDCKE LRELSTALYDLKIQITSVINRENDISNNIDIVSNKLNEIDAIQYNFEKYKEIFDNVEEYKTLDDTKNAYI VKKAEILKNVDINKTKEDLDIYFNDLDELEKSLTLSSNEMEIKTIVQNSYNSFSDINKNINDIDKEMKTL IPMLDELLNEGHNIDISLYNFIIRNIQIKIGNDIKNIREQENDTNICFEYIQNNYNFIKSDISIFNKYDD HIKVDNYISNNIDVVNKHNSLLSEHVINATNIIENIMTSIVEINEDTEMNSLEETQDKLLELYENFKKEK NIINNNYKIVHFNKLKEIENSLETYNSISTNFNKINETQNIDILKNEFNNIKTKINDKVKELVHVDSTLT LESIQTFNNLYGDLMSNIQDVYKYEDINNVELKKVKLYIENITNLLGRINTFIKELDKYQDENNGIDKYI EINKENNSYIIKLKEKANNLKENFSKLLQNIKRNETELYNINNIKDDIMNTGKSVNNIKQKFSSNLPLKE KLFQMEEMLLNINNIMNETKRISNTDAYTNITLQDIENNKNKENNNMNIETIDKLIDHIKIHNEKIQAEI LIIDDAKRKVKEITDNINKAFNEITENYNNENNGVIKSAKNIVDKATYLNNELDKFLLKLNELLSHNNND IKDLGDEKLILKEEEERKERERLEKAKQEEERKERERIEKEKQEKERLEREKQEQLKKEALKKQEQERQE QQQKEEALKRQEQERLQKEEELKRQEQERLEREKQEQLQKEEELRKKEQEKQQQRNIQELEEQKKPEIIN EALVKGDKILEGSDQRNMELSKPNVSMDNTNNSPISNSEITESDDIDNSENIHTSHMSDIESTQTSHRSN THGQQISDIVEDQITHPSNIGGEKITHNDEISITGERNNISDVNDYSESSNIFENGDSTINTSTRNTSST HDESHISPISNAYDHVVSDNKKSMDENIKDKLKIDESITTDEQIRLDDNSNIVRIDSTDQRDASSHGSSN RDDDEISHVGSDIHMDSVDIHDSIDTDENADHRHNVNSVDSLSSSDYTDTQKDFSSIIKDGGNKEGHAEN ESKEYESQTEQTHEEGIMNPNKYSISEVDGIKLNEEAKHKITEKLVDIYPSTYRTLDEPMETHGPNEKFH MFGSPYVTEEDYTEKHDYDKHEDFNNERYSNHNKMDDFVYNAGGVVCCVLFFASITFFSMDRSNKDECDF DMCEEVNNNDHLSNYADKEEIIEIVFDENEEKYF ; 'Reticulocyte-binding protein homolog 2b' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 3254 1 3254 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . RH2B_PLAF7 C0H5F4 . 1 3254 36329 'Plasmodium falciparum (isolate 3D7)' 2021-09-29 6F9CAFA5AA6167BA # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no E ;MKTTLFCSISFCNIIFFFLELSHEHFVGQSSNTHGASSVTDFNFSEEKNLKSFEGKNNNNDNYASINRLY RKKPYMKRSLINLENDLFRLEPISYIQRYYKKNINRSDIFHNKKERGSKVYSNVSSFHSFIQEGKEEVEV FSIWGSNSVLDHIDVLRDNGTVVFSVQPYYLDIYTCKEAILFTTSFYKDLDKSSITKINEDIEKFNEEII KNEEQCLVGGKTDFDNLLIVLENAEKANVRKTLFDNTFNDYKNKKSSFYNCLKNKKNDYDKKIKNIKNEI TKLLKNIESTGNMCKTESYVMNNNLYLLRVNEVKSTPIDLYLNRAKELLESSSKLVNPIKMKLGDNKNMY SIGYIHDEIKDIIKRYNFHLKHIEKGKEYIKRITQANNIADKMKKDELIKKIFESSKHFASFKYSNEMIS KLDSLFIKNEEILNNLFNNIFNIFKKKYETYVDMKTIESKYTTVMTLSEHLLEYAMDVLKANPQKPIDPK ANLDSEVVKLQIKINEKSNELDNAISQVKTLIIIMKSFYDIIISEKASMDEMEKKELSLNNYIEKTDYIL QTYNIFKSKSNIINNNSKNISSKYITIEGLKNDIDELNSLISYFKDSQETLIKDDELKKNMKTDYLNNVK 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A 1 3129 TYR 3129 ? ? ? E . A 1 3130 PRO 3130 ? ? ? E . A 1 3131 SER 3131 ? ? ? E . A 1 3132 THR 3132 ? ? ? E . A 1 3133 TYR 3133 ? ? ? E . A 1 3134 ARG 3134 ? ? ? E . A 1 3135 THR 3135 ? ? ? E . A 1 3136 LEU 3136 ? ? ? E . A 1 3137 ASP 3137 ? ? ? E . A 1 3138 GLU 3138 ? ? ? E . A 1 3139 PRO 3139 ? ? ? E . A 1 3140 MET 3140 ? ? ? E . A 1 3141 GLU 3141 ? ? ? E . A 1 3142 THR 3142 ? ? ? E . A 1 3143 HIS 3143 ? ? ? E . A 1 3144 GLY 3144 ? ? ? E . A 1 3145 PRO 3145 ? ? ? E . A 1 3146 ASN 3146 ? ? ? E . A 1 3147 GLU 3147 ? ? ? E . A 1 3148 LYS 3148 ? ? ? E . A 1 3149 PHE 3149 ? ? ? E . A 1 3150 HIS 3150 ? ? ? E . A 1 3151 MET 3151 ? ? ? E . A 1 3152 PHE 3152 ? ? ? E . A 1 3153 GLY 3153 ? ? ? E . A 1 3154 SER 3154 ? ? ? E . A 1 3155 PRO 3155 ? ? ? E . A 1 3156 TYR 3156 ? ? ? E . A 1 3157 VAL 3157 ? ? ? E . A 1 3158 THR 3158 ? ? ? E . A 1 3159 GLU 3159 ? ? ? E . A 1 3160 GLU 3160 ? ? ? E . A 1 3161 ASP 3161 ? ? ? E . A 1 3162 TYR 3162 ? ? ? E . A 1 3163 THR 3163 ? ? ? E . A 1 3164 GLU 3164 ? ? ? E . A 1 3165 LYS 3165 ? ? ? E . A 1 3166 HIS 3166 ? ? ? E . A 1 3167 ASP 3167 ? ? ? E . A 1 3168 TYR 3168 ? ? ? E . A 1 3169 ASP 3169 ? ? ? E . A 1 3170 LYS 3170 ? ? ? E . A 1 3171 HIS 3171 ? ? ? E . A 1 3172 GLU 3172 ? ? ? E . A 1 3173 ASP 3173 ? ? ? E . A 1 3174 PHE 3174 ? ? ? E . A 1 3175 ASN 3175 ? ? ? E . A 1 3176 ASN 3176 ? ? ? E . A 1 3177 GLU 3177 ? ? ? E . A 1 3178 ARG 3178 ? ? ? E . A 1 3179 TYR 3179 ? ? ? E . A 1 3180 SER 3180 ? ? ? E . A 1 3181 ASN 3181 ? ? ? E . A 1 3182 HIS 3182 ? ? ? E . A 1 3183 ASN 3183 ? ? ? E . A 1 3184 LYS 3184 ? ? ? E . A 1 3185 MET 3185 ? ? ? E . A 1 3186 ASP 3186 ? ? ? E . A 1 3187 ASP 3187 ? ? ? E . A 1 3188 PHE 3188 ? ? ? E . A 1 3189 VAL 3189 ? ? ? E . A 1 3190 TYR 3190 ? ? ? E . A 1 3191 ASN 3191 ? ? ? E . A 1 3192 ALA 3192 ? ? ? E . A 1 3193 GLY 3193 ? ? ? E . A 1 3194 GLY 3194 ? ? ? E . A 1 3195 VAL 3195 ? ? ? E . A 1 3196 VAL 3196 ? ? ? E . A 1 3197 CYS 3197 ? ? ? E . A 1 3198 CYS 3198 ? ? ? E . A 1 3199 VAL 3199 ? ? ? E . A 1 3200 LEU 3200 ? ? ? E . A 1 3201 PHE 3201 ? ? ? E . A 1 3202 PHE 3202 ? ? ? E . A 1 3203 ALA 3203 ? ? ? E . A 1 3204 SER 3204 ? ? ? E . A 1 3205 ILE 3205 ? ? ? E . A 1 3206 THR 3206 ? ? ? E . A 1 3207 PHE 3207 ? ? ? E . A 1 3208 PHE 3208 ? ? ? E . A 1 3209 SER 3209 ? ? ? E . A 1 3210 MET 3210 ? ? ? E . A 1 3211 ASP 3211 ? ? ? E . A 1 3212 ARG 3212 ? ? ? E . A 1 3213 SER 3213 ? ? ? E . A 1 3214 ASN 3214 ? ? ? E . A 1 3215 LYS 3215 ? ? ? E . A 1 3216 ASP 3216 ? ? ? E . A 1 3217 GLU 3217 ? ? ? E . A 1 3218 CYS 3218 ? ? ? E . A 1 3219 ASP 3219 ? ? ? E . A 1 3220 PHE 3220 ? ? ? E . A 1 3221 ASP 3221 ? ? ? E . A 1 3222 MET 3222 ? ? ? E . A 1 3223 CYS 3223 ? ? ? E . A 1 3224 GLU 3224 ? ? ? E . A 1 3225 GLU 3225 ? ? ? E . A 1 3226 VAL 3226 ? ? ? E . A 1 3227 ASN 3227 ? ? ? E . A 1 3228 ASN 3228 ? ? ? E . A 1 3229 ASN 3229 ? ? ? E . A 1 3230 ASP 3230 ? ? ? E . A 1 3231 HIS 3231 ? ? ? E . A 1 3232 LEU 3232 ? ? ? E . A 1 3233 SER 3233 ? ? ? E . A 1 3234 ASN 3234 ? ? ? E . A 1 3235 TYR 3235 ? ? ? E . A 1 3236 ALA 3236 ? ? ? E . A 1 3237 ASP 3237 ? ? ? E . A 1 3238 LYS 3238 ? ? ? E . A 1 3239 GLU 3239 ? ? ? E . A 1 3240 GLU 3240 ? ? ? E . A 1 3241 ILE 3241 ? ? ? E . A 1 3242 ILE 3242 ? ? ? E . A 1 3243 GLU 3243 ? ? ? E . A 1 3244 ILE 3244 ? ? ? E . A 1 3245 VAL 3245 ? ? ? E . A 1 3246 PHE 3246 ? ? ? E . A 1 3247 ASP 3247 ? ? ? E . A 1 3248 GLU 3248 ? ? ? E . A 1 3249 ASN 3249 ? ? ? E . A 1 3250 GLU 3250 ? ? ? E . A 1 3251 GLU 3251 ? ? ? E . A 1 3252 LYS 3252 ? ? ? E . A 1 3253 TYR 3253 ? ? ? E . A 1 3254 PHE 3254 ? ? ? E . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Flagellar outer dynein arm intermediate protein, putative {PDB ID=7moq, label_asym_id=E, auth_asym_id=E, SMTL ID=7moq.1.E}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 7moq, label_asym_id=E' 'target-template alignment' . 4 'model 10' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A E 5 1 E # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MAEYFTYSKKRKEFNNPINFQDTETRYGGIQNQVVNINQYVQRNPNFIDLDNIAELSEHSVNTERVKTGD RGMSHKEGGWPGNVDPNEAQETGRFKKRIEKDTSFPQAVKDLKEGVEKCIYQNNQIDLLEEYFEGETSEH VVENLSSKTLMLFKDEKEICKRSVSEISWHPEGPTKVAVSYAIMRFQQMPEKMPTQAYVWDLLNPNSPEI KLMSPSAVTNISYNQKIPDQIGGGCYNGLLAVWDGRKGENPIMISPVENSHYEPVTHFHWLMSKTGSECV TTSTDGKVMWWDTRKFEAGPVEKLNIIEGLGENEEIIGGTALEYNVEAGPSKFLIGTESGSILTANKKLK KPVEITTRYGLDQGRHLGPVYSINRSNQNPKYFLSVGDWSCKIWVEDLKTPIIRTKYHGSYLSDGCWSPT RSGAFFLVRRDGWMDVWDYYYRQNEIAFSHKVSDSPLTCIKINQTGGAYHNSGKLCAIGDQDGTVTILEL CDSLYTMQPKEKDIINEMFEREYRKEKNLETIKKQQELAKRQVQKDMGSQKEKWEKKKLEMIETAEASFH ENLAKNPVNEEEFNELDSPSEKRKKTNQNQGREQEEQSREEQEASGNFNQQQQQQQEEEQQQEGEQQHHQ NQEHQNGQGHENGQEEGEENGEEGNQQENEGQEENEQQQE ; ;MAEYFTYSKKRKEFNNPINFQDTETRYGGIQNQVVNINQYVQRNPNFIDLDNIAELSEHSVNTERVKTGD RGMSHKEGGWPGNVDPNEAQETGRFKKRIEKDTSFPQAVKDLKEGVEKCIYQNNQIDLLEEYFEGETSEH VVENLSSKTLMLFKDEKEICKRSVSEISWHPEGPTKVAVSYAIMRFQQMPEKMPTQAYVWDLLNPNSPEI KLMSPSAVTNISYNQKIPDQIGGGCYNGLLAVWDGRKGENPIMISPVENSHYEPVTHFHWLMSKTGSECV TTSTDGKVMWWDTRKFEAGPVEKLNIIEGLGENEEIIGGTALEYNVEAGPSKFLIGTESGSILTANKKLK KPVEITTRYGLDQGRHLGPVYSINRSNQNPKYFLSVGDWSCKIWVEDLKTPIIRTKYHGSYLSDGCWSPT RSGAFFLVRRDGWMDVWDYYYRQNEIAFSHKVSDSPLTCIKINQTGGAYHNSGKLCAIGDQDGTVTILEL CDSLYTMQPKEKDIINEMFEREYRKEKNLETIKKQQELAKRQVQKDMGSQKEKWEKKKLEMIETAEASFH ENLAKNPVNEEEFNELDSPSEKRKKTNQNQGREQEEQSREEQEASGNFNQQQQQQQEEEQQQEGEQQHHQ NQEHQNGQGHENGQEEGEENGEEGNQQENEGQEENEQQQE ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 586 630 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 7moq 2024-05-29 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 3254 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 3254 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 0.056 33.333 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MKTTLFCSISFCNIIFFFLELSHEHFVGQSSNTHGASSVTDFNFSEEKNLKSFEGKNNNNDNYASINRLYRKKPYMKRSLINLENDLFRLEPISYIQRYYKKNINRSDIFHNKKERGSKVYSNVSSFHSFIQEGKEEVEVFSIWGSNSVLDHIDVLRDNGTVVFSVQPYYLDIYTCKEAILFTTSFYKDLDKSSITKINEDIEKFNEEIIKNEEQCLVGGKTDFDNLLIVLENAEKANVRKTLFDNTFNDYKNKKSSFYNCLKNKKNDYDKKIKNIKNEITKLLKNIESTGNMCKTESYVMNNNLYLLRVNEVKSTPIDLYLNRAKELLESSSKLVNPIKMKLGDNKNMYSIGYIHDEIKDIIKRYNFHLKHIEKGKEYIKRITQANNIADKMKKDELIKKIFESSKHFASFKYSNEMISKLDSLFIKNEEILNNLFNNIFNIFKKKYETYVDMKTIESKYTTVMTLSEHLLEYAMDVLKANPQKPIDPKANLDSEVVKLQIKINEKSNELDNAISQVKTLIIIMKSFYDIIISEKASMDEMEKKELSLNNYIEKTDYILQTYNIFKSKSNIINNNSKNISSKYITIEGLKNDIDELNSLISYFKDSQETLIKDDELKKNMKTDYLNNVKYIEENVTHINEIILLKDSITQRIADIDELNSLNLININDFINEKNISQEKVSYNLNKLYKGSFEELESELSHFLDTKYLFHEKKSVNELQTILNTSNNECAKLNFMKSDNNNNNNNSNIINLLKTELSHLLSLKENIIKKLLNHIEQNIQNSSNKYTITYTDINNRMEDYKEEIESLEVYKHTIGNIQKEYILHLYENDKNALAVHNTSMQILQYKDAIQNIKNKISDDIKILKKYKEMNQDLLNYYEILDKKLKDNTYIKEMHTASLVQITQYIPYEDKTISELEQEFNNNNQKLDNILQDINAMNLNINILQTLNIGINACNTNNKNVEHLLNKKIELKNILNDQMKIIKNDDIIQDNEKENFSNVLKKEEEKLEKELDDIKFNNLKMDIHKLLNSYDHTKQNIESNLKINLDSFEKEKDSWVHFKSTIDSLYVEYNICNQKTHNTIKQQKNDIIELIYKRIKDINQEIIEKVDNYYSLSDKALTKLKSIHFNIDKEKYKNPKSQENIKLLEDRVMILEKKIKEDKDALIQIKNLSHDHFVNADNEKKKQKEKEEDDEQTHYSKKRKVMGDIYKDIKKNLDELNNKNLIDITLNEANKIESEYEKILIDDICEQITNEAKKSDTIKEKIESYKKDIDYVDVDVSKTRNDHHLNGDKIHDSFFYEDTLNYKAYFDKLKDLYENINKLTNESNGLKSDAHNNNTQVDKLKEINLQVFSNLGNIIKYVEKLENTLHELKDMYEFLETIDINKILKSIHNSMKKSEEYSNETKKIFEQSVNITNQFIEDVEILKTSINPNYESLNDDQIDDNIKSLVLKKEEISEKRKQVNKYITDIESNKEQSDLHLRYASRSIYVIDLFIKHEIINPSDGKNFDIIKVKEMINKTKQVSNEAMEYANKMDEKNKDIIKIENELYNLINNNIRSLKGVKYEKVRKQARNAIDDINNIHSNIKTILTKSKERLDEIKKQPNIKREGDVLNNDKTKIAYITIQINNGRIESNLLNILNMKHNIDTILNKAMDYMNDVSKSDQIVINIDSLNMNDIYNKDKDLLINILKEKQNMEAEYKKMNEMYNYVNETEKEIIKHKKNYEIRIMEHIKKETNEKKKKFMESNNKSLTTLMDSFRSMFYNEYINDYNINENFEKHQNILNEIYNGFNESYNIINTKMTEIINDNLDYNEIKEIKEVAQTEYDKLNKKVDELKNYLNNIKEQEGHRLIDYIKEKIFNLYIKCSEQQNIIDDSYNYITVKKQYIKTIEDVKFLLDSLNTIEEKNKSVANLEICTNKEDIKNLLKHVIKLANFSGIIVMSDTNTEITPENPLEDNDLLNLQLYFERKHEITSTLENDSDLELDHLGSNSDESIDNLKVYNDIIELHTYSTQILKYLDNIQKLKGDCNDLVKDCKELRELSTALYDLKIQITSVINRENDISNNIDIVSNKLNEIDAIQYNFEKYKEIFDNVEEYKTLDDTKNAYIVKKAEILKNVDINKTKEDLDIYFNDLDELEKSLTLSSNEMEIKTIVQNSYNSFSDINKNINDIDKEMKTLIPMLDELLNEGHNIDISLYNFIIRNIQIKIGNDIKNIREQENDTNICFEYIQNNYNFIKSDISIFNKYDDHIKVDNYISNNIDVVNKHNSLLSEHVINATNIIENIMTSIVEINEDTEMNSLEETQDKLLELYENFKKEKNIINNNYKIVHFNKLKEIENSLETYNSISTNFNKINETQNIDILKNEFNNIKTKINDKVKELVHVDSTLTLESIQTFNNLYGDLMSNIQDVYKYEDINNVELKKVKLYIENITNLLGRINTFIKELDKYQDENNGIDKYIEINKENNSYIIKLKEKANNLKENFSKLLQNIKRNETELYNINNIKDDIMNTGKSVNNIKQKFSSNLPLKEKLFQMEEMLLNINNIMNETKRISNTDAYTNITLQDIENNKNKENNNMNIETIDKLIDHIKIHNEKIQAEILIIDDAKRKVKEITDNINKAFNEITENYNNENNGVIKSAKNIVDKATYLNNELDKFLLKLNELLSHNNNDIKDLGDEKLILKEEEERKERERLEKAKQEEERKERERIEKEKQEKERLEREKQEQLKKEALKKQEQERQEQQQKEEALKRQEQERLQKEEELKRQEQERLEREKQEQLQKEEELRKKEQEKQQQRNIQELEEQKKPEIINEALVKGDKILEGSDQRNMELSKPNVSMDNTNNSPISNSEITESDDIDNSENIHTSHMSDIESTQTSHRSNTHGQQISDIVEDQITHPSNIGGEKITHNDEISITGERNNISDVNDYSESSNIFENGDSTINTSTRNTSSTHDESHISPISNAYDHVVSDNKKSMDENIKDKLKIDESITTDEQIRLDDNSNIVRIDSTDQRDASSHGSSNRDDDEISHVGSDIHMDSVDIHDSIDTDENADHRHNVNSVDSLSSSDYTDTQKDFSSIIKDGGNKEGHAENESKEYESQTEQTHEEGIMNPNKYSISEVDGIKLNEEAKHKITEKLVDIYPSTYRTLDEPMETHGPNEKFHMFGSPYVTEEDYTEKHDYDKHEDFNNERYSNHNKMDDFVYNAGGVVCCVLFFASITFFSMDRSNKDECDFDMCEEVNNNDHLSNYADKEEIIEIVFDENEEKYF 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TNQNQGREQEEQSREEQEASGNFNQQQQQQQEEEQQQEGEQQHHQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 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A 388.154 400.373 620.768 1 1 E LEU 0.910 1 ATOM 184 O OXT . LEU 2760 2760 ? A 391.126 402.120 617.813 1 1 E LEU 0.910 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.922 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 2741 GLN 1 0.940 2 1 A 2742 GLU 1 0.960 3 1 A 2743 GLN 1 0.870 4 1 A 2744 GLU 1 0.890 5 1 A 2745 ARG 1 0.890 6 1 A 2746 LEU 1 0.920 7 1 A 2747 GLN 1 0.940 8 1 A 2748 LYS 1 0.940 9 1 A 2749 GLU 1 0.960 10 1 A 2750 GLU 1 0.960 11 1 A 2751 GLU 1 0.960 12 1 A 2752 LEU 1 0.960 13 1 A 2753 LYS 1 0.940 14 1 A 2754 ARG 1 0.930 15 1 A 2755 GLN 1 0.940 16 1 A 2756 GLU 1 0.900 17 1 A 2757 GLN 1 0.880 18 1 A 2758 GLU 1 0.850 19 1 A 2759 ARG 1 0.890 20 1 A 2760 LEU 1 0.910 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #