data_SMR-c243768d212ca0467cc4addb296895dd_1 _entry.id SMR-c243768d212ca0467cc4addb296895dd_1 _struct.entry_id SMR-c243768d212ca0467cc4addb296895dd_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - A0A2I0BTH4/ A0A2I0BTH4_PLAFO, Uncharacterized protein - O77384/ LRR4_PLAF7, Protein PFC0760c Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A0A2I0BTH4, O77384' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 464585.393 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP LRR4_PLAF7 O77384 1 ;MNNDFMKNEKDDYDKVNEEEYSLENFRGIDMNNNVDISNMNNNLNDVGELINIDNNDKYDEDQLSLIKES LEYGELLLSNVKEEDENNRREHFKKNDYMKDTEDVHYKESKIGQDKRFMHSLCVKELKSTEEGELFDDEK YKDKDTLINMLRKKLEIKIKDYNLIMDTLILTKEECSKKEEQLKDYKMKYNKMEKECYSLKNEIERKNNE KHLNIGSFSFYKNEYDDMKYKLLKCEEKNKILLNKNQELHQTIIQMKNDSYNQNIKFKKDIDVLTEDKKN ILIQNKNFTKQNKILIDKYLRQEKIIYKLKKHNEEQEIIIKECHKKIEFVNKNSVNHLNKVRDVLNKSLI KSEEHVKLYTNLKKENDSLKIEYNKSKTNIQQLNEQLVNYKNFIKEMEKKYKQLVVKNNSLFSITHDFIN LKNSNIIIIRRTSDMKQIFKMYNLDIEHFNEQDHLSVIYIYEILYNTNDNNNNDNDNNNDNNNNNNNNND NNNNNNNDNNNNNNNYNNIMMMIENMNSGNHPNSNNLHNYRHNTNDENNLSSLKTSFRYKINNKSGKSRS IKSRSHFSGDNEYIQDQLSNREMKDHYNYIERYNHSSNRNDIHNLYYMEENVSHNNNKSDYDEDGDAENN NYYIKIKKNKYKKLNDLLNKAQMKIITLTRANEMFEKYCSNIKNTLIRDDMKKFRKPDISDVHILHNEKI YLEKLLNEKLNYIKDIEKKLDELHGVINKNKEDIYILQVEKQTLIKVISSVYDYTKMESENHIFKMNTTW NKMLNNVHMSSNKDYNNQNNQNIENNQNIENNQNNQNIENNQNIENNQNNQNNQNNQNNQNNQNNQNNQN NAGIHISPDDFLKYRMSLEKFIQFTIKEHIVYIMKDEKKKTSNIIKESISLKKKHTKKSIINNNNDNNNE DDDDNDMLSVMYSNDDVIKNKRKENNKEILEEHVSFSSFSNNEYIAHSFNSILLQLSNYIFNIECKQMEY FKNSNLLSYVDDYTITIELFYRLKKYNNIFSIEQILGTQYPSILQKLHDGIYCLKDNNKKKNNDGDNKSQ EDDDGNKKKNNDGDNKSQEDDDGNKKKNNDGDNKSQEDDYGNKKKNNDDDDDDSYKIELIVDELNKCKKN YTDEELYELMKGSDFDIFKKYKNFYLNHFININNIFSTIISFHIHNIEDKYKKVYERYFNLFNFNFSNVE LSFDLLIRRFDKILRLTKKYEQLLEENYEKIKNKNEKEEYLHACIKELEMNLERYNNEKIILDEQINEKE KKINIINEKYLILEKEYEEYQNKNIFINAQIENLEKEKKQLQEEIIQKDMINVKLNEKNCDIIKIYEKEK QYLHTLLQENKDSHNYLKDKFENLLNLNEKLKYDHDISLNKINTLWLEEKENNKKNTFHMNNLRVENNNL LLKMKELQNKYNIIKKELNERIKQINVFRNNVSTLSLRDNRSTRGSIHQINNMYMNNTHLGFMGASKINN NISNLYYSNMIHMSHRGSIIKNKEDAEGNSTQARMNNKDSTDNIINNIHNTDNINNMNNINNNTLNSINS NHLYYPFPFHNNVNSPKMVGMCDVTLASGVNKKDDFLLNLEENEENSFLEYEIRIKSLQEELCDKESEIL KIKGEKNILITCIETWKCFCKNSKEEISRLKEICKEQLEKHKEFLLINKSNEDKLKYINSLLCDEKDKYD IVVKDIKNNMRNEIDKLNNDINEKSYEIKLLKHENNNLINEMNILKNKETENMNIKQKEEDYIKLIKKDK TNIQNEYNDLLEKYNEVVVKNNMLYNDMNVLLKEHKEEIFLLKENIKILQKDNTYLNDMFKNQINYVDNN LLKNRLDQLFNINQDLQKHLDTNQKHLEQLKYDYIEIKERLKIEKTKINKQEKYIIQLQKDNNLILNDFN STTTTTNNNNNNDNNNDNNNDNNDNNNDTYQQFIHSLKANLENSRLELKELSNLNEKIQLSDEKNRMKIT ILEDKLFKNEKDKMKLQQIIDDNNKNYMIQYNKLKTNLDMLSEENRMLLLNKEEYEKQIEQLNHDHKLFI STKNNDIQIIENEKLQEQVDQYITTINEKDKIIVHLNLQIKKLANQNEHMRSRCDIFNVAHSQDNIKNDH MVVGEDIMGDTNHDVNKNIDQGTNQHINQGTNQHINQGTNQHDTCDGPNYNYVKVQNATNREDNKNKERN LSQEIYKYINENIDLTSELEKKNDMLENYKNELKEKNEEIYKLNNDIDMLSNNCKKLKESIMMMEKYKII 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DDDDNYENDDDDNYENDDDNYENDDDDNYENGDDDNDNDHNDDNNDEEKYSCHDDKNEHTNNDLLNIDHD NNKNNITDELYSTYNVSVSHNKDPSNKENEIQNLISIDSSNENDENDENDENDENDENDENDENDENDEN DENDEKDENDENDENDENFDNNNEGTLNEMNSEE ; 'Protein PFC0760c' 2 1 UNP A0A2I0BTH4_PLAFO A0A2I0BTH4 1 ;MNNDFMKNEKDDYDKVNEEEYSLENFRGIDMNNNVDISNMNNNLNDVGELINIDNNDKYDEDQLSLIKES LEYGELLLSNVKEEDENNRREHFKKNDYMKDTEDVHYKESKIGQDKRFMHSLCVKELKSTEEGELFDDEK YKDKDTLINMLRKKLEIKIKDYNLIMDTLILTKEECSKKEEQLKDYKMKYNKMEKECYSLKNEIERKNNE KHLNIGSFSFYKNEYDDMKYKLLKCEEKNKILLNKNQELHQTIIQMKNDSYNQNIKFKKDIDVLTEDKKN ILIQNKNFTKQNKILIDKYLRQEKIIYKLKKHNEEQEIIIKECHKKIEFVNKNSVNHLNKVRDVLNKSLI KSEEHVKLYTNLKKENDSLKIEYNKSKTNIQQLNEQLVNYKNFIKEMEKKYKQLVVKNNSLFSITHDFIN LKNSNIIIIRRTSDMKQIFKMYNLDIEHFNEQDHLSVIYIYEILYNTNDNNNNDNDNNNDNNNNNNNNND NNNNNNNDNNNNNNNYNNIMMMIENMNSGNHPNSNNLHNYRHNTNDENNLSSLKTSFRYKINNKSGKSRS IKSRSHFSGDNEYIQDQLSNREMKDHYNYIERYNHSSNRNDIHNLYYMEENVSHNNNKSDYDEDGDAENN NYYIKIKKNKYKKLNDLLNKAQMKIITLTRANEMFEKYCSNIKNTLIRDDMKKFRKPDISDVHILHNEKI 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_ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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A0A2I0BTH4_PLAFO A0A2I0BTH4 . 1 3394 5843 'Plasmodium falciparum (isolate NF54)' 2018-02-28 81BB86F2056A4B57 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MNNDFMKNEKDDYDKVNEEEYSLENFRGIDMNNNVDISNMNNNLNDVGELINIDNNDKYDEDQLSLIKES LEYGELLLSNVKEEDENNRREHFKKNDYMKDTEDVHYKESKIGQDKRFMHSLCVKELKSTEEGELFDDEK YKDKDTLINMLRKKLEIKIKDYNLIMDTLILTKEECSKKEEQLKDYKMKYNKMEKECYSLKNEIERKNNE KHLNIGSFSFYKNEYDDMKYKLLKCEEKNKILLNKNQELHQTIIQMKNDSYNQNIKFKKDIDVLTEDKKN ILIQNKNFTKQNKILIDKYLRQEKIIYKLKKHNEEQEIIIKECHKKIEFVNKNSVNHLNKVRDVLNKSLI KSEEHVKLYTNLKKENDSLKIEYNKSKTNIQQLNEQLVNYKNFIKEMEKKYKQLVVKNNSLFSITHDFIN LKNSNIIIIRRTSDMKQIFKMYNLDIEHFNEQDHLSVIYIYEILYNTNDNNNNDNDNNNDNNNNNNNNND NNNNNNNDNNNNNNNYNNIMMMIENMNSGNHPNSNNLHNYRHNTNDENNLSSLKTSFRYKINNKSGKSRS IKSRSHFSGDNEYIQDQLSNREMKDHYNYIERYNHSSNRNDIHNLYYMEENVSHNNNKSDYDEDGDAENN 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A 1 3337 ASP 3337 ? ? ? A . A 1 3338 GLU 3338 ? ? ? A . A 1 3339 ASN 3339 ? ? ? A . A 1 3340 ASP 3340 ? ? ? A . A 1 3341 GLU 3341 ? ? ? A . A 1 3342 ASN 3342 ? ? ? A . A 1 3343 ASP 3343 ? ? ? A . A 1 3344 GLU 3344 ? ? ? A . A 1 3345 ASN 3345 ? ? ? A . A 1 3346 ASP 3346 ? ? ? A . A 1 3347 GLU 3347 ? ? ? A . A 1 3348 ASN 3348 ? ? ? A . A 1 3349 ASP 3349 ? ? ? A . A 1 3350 GLU 3350 ? ? ? A . A 1 3351 ASN 3351 ? ? ? A . A 1 3352 ASP 3352 ? ? ? A . A 1 3353 GLU 3353 ? ? ? A . A 1 3354 ASN 3354 ? ? ? A . A 1 3355 ASP 3355 ? ? ? A . A 1 3356 GLU 3356 ? ? ? A . A 1 3357 ASN 3357 ? ? ? A . A 1 3358 ASP 3358 ? ? ? A . A 1 3359 GLU 3359 ? ? ? A . A 1 3360 ASN 3360 ? ? ? A . A 1 3361 ASP 3361 ? ? ? A . A 1 3362 GLU 3362 ? ? ? A . A 1 3363 ASN 3363 ? ? ? A . A 1 3364 ASP 3364 ? ? ? A . A 1 3365 GLU 3365 ? ? ? A . A 1 3366 LYS 3366 ? ? ? A . A 1 3367 ASP 3367 ? ? ? A . A 1 3368 GLU 3368 ? ? ? A . A 1 3369 ASN 3369 ? ? ? A . A 1 3370 ASP 3370 ? ? ? A . A 1 3371 GLU 3371 ? ? ? A . A 1 3372 ASN 3372 ? ? ? A . A 1 3373 ASP 3373 ? ? ? A . A 1 3374 GLU 3374 ? ? ? A . A 1 3375 ASN 3375 ? ? ? A . A 1 3376 ASP 3376 ? ? ? A . A 1 3377 GLU 3377 ? ? ? A . A 1 3378 ASN 3378 ? ? ? A . A 1 3379 PHE 3379 ? ? ? A . A 1 3380 ASP 3380 ? ? ? A . A 1 3381 ASN 3381 ? ? ? A . A 1 3382 ASN 3382 ? ? ? A . A 1 3383 ASN 3383 ? ? ? A . A 1 3384 GLU 3384 ? ? ? A . A 1 3385 GLY 3385 ? ? ? A . A 1 3386 THR 3386 ? ? ? A . A 1 3387 LEU 3387 ? ? ? A . A 1 3388 ASN 3388 ? ? ? A . A 1 3389 GLU 3389 ? ? ? A . A 1 3390 MET 3390 ? ? ? A . A 1 3391 ASN 3391 ? ? ? A . A 1 3392 SER 3392 ? ? ? A . A 1 3393 GLU 3393 ? ? ? A . A 1 3394 GLU 3394 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Dynein regulatory complex protein 1/2 N-terminal domain-containing protein {PDB ID=8tek, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=8tek.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 8tek, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MNPSQTQKGKIQIQVSRGSIDLLVRTMYEDINNIKLKNERFQKKKRAEDERRRRERYAEIQQEAIASGKK NAALEMKWAELKELDECEELNREMQDQQQTFQQIIEGKENLRKEFEEELKRKDDEYVKMLKEQSNDIKDM ISKMRSQFYKIRDANMQELEDIERHFEQERSNLLNEFKAKIQATFKKHLDLEEQYVKEHAKTEEEQTKNI EDLRIKGAKHYAELKITMETEIQDLEKCFEDMKALYQLITEKLDYSLKVLQEKFHENNSMCDELKRKENN FKNRLKQLTKDYKQYDKKFKLENKNLTQEYKRIIRQFKELQKKFKHFEKADLDKYSEIQKMNEAEVKELK DKIIKCNITIHIQQLGMQWIPPQSEEEILAQQKLQLEQGGKAEEEEEREFEFCISEIKIGEICNIILEEA DFLIDDKLREELEGSAEPEQIFQRLDCIKKCLYIDSEDEMNLFFRELITKCRVKSAEEIEEEARKQLLLL GLIKEAEENENPEGEEVQQQEGAQQKKKEEGNKKDDPKGKEGAKDSKENANPQGQNKSNQDERKKKKDGQ DDHAGQGQGQYDSNQGGMGENQEEGENAEGQENLEGEIEKEIDLENTQINLNEVVKFLQNWQANKDKRKE KLEKESSKKAVKQETEREKKERIAREGKKYWEKLTQVLPERTFRIWNVNFFKFSFEKQILLNQINKLRFW TDLCPNIMNFFWTDKNQSKKPVNCITKMKNQRIFQINTYKLIMNLLSALQDSLIQIKDKDDFIQTKISTN LFTFHNFQILLQIFIVNQSFLFIRLCQSYSKKIILLIKNINQKLFNLSNFKNQFSF ; ;MNPSQTQKGKIQIQVSRGSIDLLVRTMYEDINNIKLKNERFQKKKRAEDERRRRERYAEIQQEAIASGKK NAALEMKWAELKELDECEELNREMQDQQQTFQQIIEGKENLRKEFEEELKRKDDEYVKMLKEQSNDIKDM ISKMRSQFYKIRDANMQELEDIERHFEQERSNLLNEFKAKIQATFKKHLDLEEQYVKEHAKTEEEQTKNI EDLRIKGAKHYAELKITMETEIQDLEKCFEDMKALYQLITEKLDYSLKVLQEKFHENNSMCDELKRKENN FKNRLKQLTKDYKQYDKKFKLENKNLTQEYKRIIRQFKELQKKFKHFEKADLDKYSEIQKMNEAEVKELK DKIIKCNITIHIQQLGMQWIPPQSEEEILAQQKLQLEQGGKAEEEEEREFEFCISEIKIGEICNIILEEA DFLIDDKLREELEGSAEPEQIFQRLDCIKKCLYIDSEDEMNLFFRELITKCRVKSAEEIEEEARKQLLLL GLIKEAEENENPEGEEVQQQEGAQQKKKEEGNKKDDPKGKEGAKDSKENANPQGQNKSNQDERKKKKDGQ DDHAGQGQGQYDSNQGGMGENQEEGENAEGQENLEGEIEKEIDLENTQINLNEVVKFLQNWQANKDKRKE KLEKESSKKAVKQETEREKKERIAREGKKYWEKLTQVLPERTFRIWNVNFFKFSFEKQILLNQINKLRFW TDLCPNIMNFFWTDKNQSKKPVNCITKMKNQRIFQINTYKLIMNLLSALQDSLIQIKDKDDFIQTKISTN LFTFHNFQILLQIFIVNQSFLFIRLCQSYSKKIILLIKNINQKLFNLSNFKNQFSF ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 119 284 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8tek 2023-09-27 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 3394 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 3415 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 11.000 14.483 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MNNDFMKNEKDDYDKVNEEEYSLENFRGIDMNNNVDISNMNNNLNDVGELINIDNNDKYDEDQLSLIKESLEYGELLLSNVKEEDENNRREHFKKNDYMKDTEDVHYKESKIGQDKRFMHSLCVKELKSTEEGELFDDEKYKDKDTLINMLRKKLEIKIKDYNLIMDTLILTKEECSKKEEQLKDYKMKYNKMEKECYSLKNEIERKNNEKHLNIGSFSFYKNEYDDMKYKLLKCEEKNKILLNKNQELHQTIIQMKNDSYNQNIKFKKDIDVLTEDKKNILIQNKNFTKQNKILIDKYLRQEKIIYKLKKHNEEQEIIIKECHKKIEFVNKNSVNHLNKVRDVLNKSLIKSEEHVKLYTNLKKENDSLKIEYNKSKTNIQQLNEQLVNYKNFIKEMEKKYKQLVVKNNSLFSITHDFINLKNSNIIIIRRTSDMKQIFKMYNLDIEHFNEQDHLSVIYIYEILYNTNDNNNNDNDNNNDNNNNNNNNNDNNNNNNNDNNNNNNNYNNIMMMIENMNSGNHPNSNNLHNYRHNTNDENNLSSLKTSFRYKINNKSGKSRSIKSRSHFSGDNEYIQDQLSNREMKDHYNYIERYNHSSNRNDIHNLYYMEENVSHNNNKSDYDEDGDAENNNYYIKIKKNKYKKLNDLLNKAQMKIITLTRANEMFEKYCSNIKNTLIRDDMKKFRKPDISDVHILHNEKIYLEKLLNEKLNYIKDIEKKLDELHGVINKNKEDIYILQVEKQTLIKVISSVYDYTKMESENHIFKMNTTWNKMLNNVHMSSNKDYNNQNNQNIENNQNIENNQNNQNIENNQNIENNQNNQNNQNNQNNQNNQNNQNNQNNAGIHISPDDFLKYRMSLEKFIQFTIKEHIVYIMKDEKKKTSNIIKESISLKKKHTKKSIINNNNDNNNEDDDDNDMLSVMYSNDDVIKNKRKENNKEILEEHVSFSSFSNNEYIAHSFNSILLQLSNYIFNIECKQMEYFKNSNLLSYVDDYTITIELFYRLKKYNNIFSIEQILGTQYPSILQKLHDGIYCLKDNNKKKNNDGDNKSQEDDDGNKKKNNDGDNKSQEDDDGNKKKNNDGDNKSQEDDYGNKKKNNDDDDDDSYKIELIVDELNKCKKNYTDEELYELMKGSDFDIFKKYKNFYLNHFININNIFSTIISFHIHNIEDKYKKVYERYFNLFNFNFSNVELSFDLLIRRFDKILRLTKKYEQLLEENYEKIKNKNEKEEYLHACIKELEMNLERYNNEKIILDEQINEKEKKINIINEKYLILEKEYEEYQNKNIFINAQIENLEKEKKQLQEEIIQKDMINVKLNEKNCDIIKIYEKEKQYLHTLLQENKDSHNYLKDKFENLLNLNEKLKYDHDISLNKINTLWLEEKENNKKNTFHMNNLRVENNNLLLKMKELQNKYNIIKKELNERIKQINVFRNNVSTLSLRDNRSTRGSIHQINNMYMNNTHLGFMGASKINNNISNLYYSNMIHMSHRGSIIKNKEDAEGNSTQARMNNKDSTDNIINNIHNTDNINNMNNINNNTLNSINSNHLYYPFPFHNNVNSPKMVGMCDVTLASGVNKKDDFLLNLEENEENSFLEYEIRIKSLQEELCDKESEILKIKGEKNILITCIETWKCFCKNSKEEISRLKEICKEQLEKHKEFLLINKSNEDKLKYINSLLCDEKDKYDIVVKDIKNNMRNEIDKLNNDINEKSYEIKLLKHENNNLINEMNILKNKETENMNIKQKEEDYIKLIKKDKTNI-------QNEYNDLLEKYNEVVVKN-NMLYNDMNVLLKEHKEEIFLLKENIKILQKDNTYLNDMFKNQIN------------YVDNNLLKNRLDQLFN-INQDLQKHLDTNQKHLEQLKYDYIEIKERLKIEKTKINKQEKYIIQLQKDNNLILNDFNSTTTTTNNNNNNDNNNDNNNDNNDNNNDTYQQFIHSLKANLENSRLELKELSNLNEKIQLSDEKNRMKITILEDKLFKNEKDKMKLQQIIDDNNKNYMIQYNKLKTNLDMLSEENRMLLLNKEEYEKQIEQLNHDHKLFISTKNNDIQIIENEKLQEQVDQYITTINEKDKIIVHLNLQIKKLANQNEHMRSRCDIFNVAHSQDNIKNDHMVVGEDIMGDTNHDVNKNIDQGTNQHINQGTNQHINQGTNQHDTCDGPNYNYVKVQNATNREDNKNKERNLSQEIYKYINENIDLTSELEKKNDMLENYKNELKEKNEEIYKLNNDIDMLSNNCKKLKESIMMMEKYKIIMNNNIQEKDEIIENLKNKYNNKLDDLINNYSVVDKSIVSCFEDSNIMSPSCNDILNVFNNLSKSNKKVCTNMDICNENMDSISSINNVNNINNVNNINNVNNINNVNNINNVKNIVDINNYLVNNLQLNKDNDNIIIIKFNILKLFKLGSCYLYIINRNLKEIQMLKNQILSLEESIKSLNEFINNLKNENEKNELIKINNFEEILKLKNNLQDNESCIQNLNNYLKKNEELNKINVKNIFKYKGYIIHLIQQSNVFCKIFKHFNENKIIDQSIINKLLYLKKSFDFYMYDSVIQEIRENKNIIINQDFLTDEYFKHIQTFTKTCNVLIQRGYLSILKDTNNDFFIQNKQSNQQGNQNGNHINMCNIYPDDEINVTADQQIFDGTENVQQSLQNEEDYVNNEEMYTDKMDLDNNMNGDDDDDDDDDDDDDNNNNNNNNNNNNNNNMGDEDNHLVNAFNNHNLLTNGNVKSDQINNETLERYEENIIQNIYTNDNVDNNQVIENINKILIKDKQDIINNDELKNEHNNLIRLINESIENAHNLENVYVQNDANNLINDNIKKEETLTYVDEKDNVSNESNSKCDDDKKENEDIIQAKNENYPVSTHYDNNDDINKDNINNDNNNDNINDDNNNDNINNDNNNDNINNDNINNDNINNDNNNDNNNDNSNNGFVCELSSNINDFNNILNVNKDNFQGINKSNNFSTNLSEYNYDAYVKIVEAGSALENKKQQDKKRKYFSDSEITKENGYLGESNSIKIRKVSVGGDNDNNDDDNNDDNDDDDNDDDNNDDDNNNDDDNDDSYDDEEKEQENYSNDVNTELNNHVTFEDISVHNNIQENKKNYFSNVHENTFNLHVDENVHEDLQNYEDYVNNNNNNNDDDNEEESNNSCYIISSDDEGDKKNVSKQNDDDEDDDDNGDDDDNEDDDDNEDDDNGDDDDNEDDDNGDDDDNEDDNYDDEDNDNYENEDDDNYANEDDDNYENDDDDNYENDDDDNYENDDDNYENDDDDNYENGDDDNDNDHNDDNNDEEKYSCHDDKNEHTNNDLLNIDHDNNKNNITDELYSTYNVSVSHNKDPSNKENEIQNLISIDSSNENDENDENDENDENDENDENDENDENDENDENDEKDENDENDENDENFDNNNEGTLNEMNSEE 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LKRKDDEYVKMLKEQSNDIKDMISKMRSQFYKIRDANMQELEDIERHFEQERSNLLNEFKAKIQATFKKHLDLEE--QYVKEHAKTEEEQTKNIEDLRIKGAKHYAELKITMETEIQDLEKCFEDMKALYQLITEKLDYSLKVLQEKFHENNSMCDELKRKENNFKNR------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8tek.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 1856 1856 ? A 157.965 208.715 255.674 1 1 A GLU 0.500 1 ATOM 2 C CA . GLU 1856 1856 ? A 158.468 207.624 254.793 1 1 A GLU 0.500 1 ATOM 3 C C . GLU 1856 1856 ? A 159.363 208.072 253.618 1 1 A GLU 0.500 1 ATOM 4 O O . GLU 1856 1856 ? A 160.555 207.791 253.613 1 1 A GLU 0.500 1 ATOM 5 C CB . GLU 1856 1856 ? A 157.247 206.808 254.312 1 1 A GLU 0.500 1 ATOM 6 C CG . GLU 1856 1856 ? A 157.773 205.565 253.583 1 1 A GLU 0.500 1 ATOM 7 C CD . GLU 1856 1856 ? A 156.767 204.742 252.807 1 1 A GLU 0.500 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 1856 1856 ? A 155.548 204.939 252.949 1 1 A GLU 0.500 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 1856 1856 ? A 157.303 203.996 251.935 1 1 A GLU 0.500 1 ATOM 10 N N . ILE 1857 1857 ? A 158.845 208.813 252.595 1 1 A ILE 0.490 1 ATOM 11 C CA . ILE 1857 1857 ? A 159.637 209.337 251.470 1 1 A ILE 0.490 1 ATOM 12 C C . ILE 1857 1857 ? A 160.812 210.217 251.916 1 1 A ILE 0.490 1 ATOM 13 O O . ILE 1857 1857 ? A 161.949 210.010 251.516 1 1 A ILE 0.490 1 ATOM 14 C CB . ILE 1857 1857 ? 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'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.754 2 1 3 0 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 1856 GLU 1 0.500 2 1 A 1857 ILE 1 0.490 3 1 A 1858 LYS 1 0.790 4 1 A 1859 GLU 1 0.800 5 1 A 1860 ARG 1 0.780 6 1 A 1861 LEU 1 0.810 7 1 A 1862 LYS 1 0.810 8 1 A 1863 ILE 1 0.810 9 1 A 1864 GLU 1 0.810 10 1 A 1865 LYS 1 0.810 11 1 A 1866 THR 1 0.810 12 1 A 1867 LYS 1 0.810 13 1 A 1868 ILE 1 0.800 14 1 A 1869 ASN 1 0.810 15 1 A 1870 LYS 1 0.810 16 1 A 1871 GLN 1 0.790 17 1 A 1872 GLU 1 0.790 18 1 A 1873 LYS 1 0.800 19 1 A 1874 TYR 1 0.790 20 1 A 1875 ILE 1 0.790 21 1 A 1876 ILE 1 0.780 22 1 A 1877 GLN 1 0.790 23 1 A 1878 LEU 1 0.790 24 1 A 1879 GLN 1 0.770 25 1 A 1880 LYS 1 0.540 26 1 A 1881 ASP 1 0.530 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #