data_SMR-99a242f3b2ea6eac33e313d0f289e496_9 _entry.id SMR-99a242f3b2ea6eac33e313d0f289e496_9 _struct.entry_id SMR-99a242f3b2ea6eac33e313d0f289e496_9 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - A0A5H1ZRP8/ A0A5H1ZRP8_HUMAN, Dystrophin - P11532 (isoform 4)/ DMD_HUMAN, Dystrophin Estimated model accuracy of this model is 0.001, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries A0A5H1ZRP8, P11532 (isoform 4)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 492910.686 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP A0A5H1ZRP8_HUMAN A0A5H1ZRP8 1 ;MSEVSSDEREDVQKKTFTKWVNAQFSKFGKQHIENLFSDLQDGRRLLDLLEGLTGQKLPKEKGSTRVHAL NNVNKALRVLQNNNVDLVNIGSTDIVDGNHKLTLGLIWNIILHWQVKNVMKNIMAGLQQTNSEKILLSWV RQSTRNYPQVNVINFTTSWSDGLALNALIHSHRPDLFDWNSVVCQQSATQRLEHAFNIARYQLGIEKLLD PEDVDTTYPDKKSILMYITSLFQVLPQQVSIEAIQEVEMLPRPPKVTKEEHFQLHHQMHYSQQITVSLAQ 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_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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DMD_HUMAN P11532 P11532-4 1 3681 9606 'Homo sapiens (Human)' 2024-10-02 D04A9DF144AF0EB3 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MSEVSSDEREDVQKKTFTKWVNAQFSKFGKQHIENLFSDLQDGRRLLDLLEGLTGQKLPKEKGSTRVHAL NNVNKALRVLQNNNVDLVNIGSTDIVDGNHKLTLGLIWNIILHWQVKNVMKNIMAGLQQTNSEKILLSWV RQSTRNYPQVNVINFTTSWSDGLALNALIHSHRPDLFDWNSVVCQQSATQRLEHAFNIARYQLGIEKLLD PEDVDTTYPDKKSILMYITSLFQVLPQQVSIEAIQEVEMLPRPPKVTKEEHFQLHHQMHYSQQITVSLAQ GYERTSSPKPRFKSYAYTQAAYVTTSDPTRSPFPSQHLEAPEDKSFGSSLMESEVNLDRYQTALEEVLSW LLSAEDTLQAQGEISNDVEVVKDQFHTHEGYMMDLTAHQGRVGNILQLGSKLIGTGKLSEDEETEVQEQM NLLNSRWECLRVASMEKQSNLHRVLMDLQNQKLKELNDWLTKTEERTRKMEEEPLGPDLEDLKRQVQQHK VLQEDLEQEQVRVNSLTHMVVVVDESSGDHATAALEEQLKVLGDRWANICRWTEDRWVLLQDILLKWQRL TEEQCLFSAWLSEKEDAVNKIHTTGFKDQNEMLSSLQKLAVLKADLEKKKQSMGKLYSLKQDLLSTLKNK 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A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'UTROPHIN ACTIN BINDING REGION {PDB ID=1qag, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=1qag.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 1qag, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 9' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;DVQKKTFTKWINARFSKSGKPPINDMFTDLKDGRKLLDLLEGLTGTSLPKERGSTRVHALNNVNRVLQVL HQNNVELVNIGGTDIVDGNHKLTLGLLWSIILHWQVKDVMKDVMSDLQQTNSEKILLSWVRQTTRPYSQV NVLNFTTSWTDGLAFNAVLHRHKPDLFSWDKVVKMSPIERLEHAFSKAQTYLGIEKLLDPEDVAVRLPDK KSIIMYLTSLFEVLPQ ; ;DVQKKTFTKWINARFSKSGKPPINDMFTDLKDGRKLLDLLEGLTGTSLPKERGSTRVHALNNVNRVLQVL HQNNVELVNIGGTDIVDGNHKLTLGLLWSIILHWQVKDVMKDVMSDLQQTNSEKILLSWVRQTTRPYSQV NVLNFTTSWTDGLAFNAVLHRHKPDLFSWDKVVKMSPIERLEHAFSKAQTYLGIEKLLDPEDVAVRLPDK KSIIMYLTSLFEVLPQ ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 1 226 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 1qag 2024-10-30 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 3681 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 3681 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 2.7e-33 74.336 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSEVSSDEREDVQKKTFTKWVNAQFSKFGKQHIENLFSDLQDGRRLLDLLEGLTGQKLPKEKGSTRVHALNNVNKALRVLQNNNVDLVNIGSTDIVDGNHKLTLGLIWNIILHWQVKNVMKNIMAGLQQTNSEKILLSWVRQSTRNYPQVNVINFTTSWSDGLALNALIHSHRPDLFDWNSVVCQQSATQRLEHAFNIARYQLGIEKLLDPEDVDTTYPDKKSILMYITSLFQVLPQQVSIEAIQEVEMLPRPPKVTKEEHFQLHHQMHYSQQITVSLAQGYERTSSPKPRFKSYAYTQAAYVTTSDPTRSPFPSQHLEAPEDKSFGSSLMESEVNLDRYQTALEEVLSWLLSAEDTLQAQGEISNDVEVVKDQFHTHEGYMMDLTAHQGRVGNILQLGSKLIGTGKLSEDEETEVQEQMNLLNSRWECLRVASMEKQSNLHRVLMDLQNQKLKELNDWLTKTEERTRKMEEEPLGPDLEDLKRQVQQHKVLQEDLEQEQVRVNSLTHMVVVVDESSGDHATAALEEQLKVLGDRWANICRWTEDRWVLLQDILLKWQRLTEEQCLFSAWLSEKEDAVNKIHTTGFKDQNEMLSSLQKLAVLKADLEKKKQSMGKLYSLKQDLLSTLKNKSVTQKTEAWLDNFARCWDNLVQKLEKSTAQISQAVTTTQPSLTQTTVMETVTTVTTREQILVKHAQEELPPPPPQKKRQITVDSEIRKRLDVDITELHSWITRSEAVLQSPEFAIFRKEGNFSDLKEKVNAIEREKAEKFRKLQDASRSAQALVEQMVNEGVNADSIKQASEQLNSRWIEFCQLLSERLNWLEYQNNIIAFYNQLQQLEQMTTTAENWLKIQPTTPSEPTAIKSQLKICKDEVNRLSDLQPQIERLKIQSIALKEKGQGPMFLDADFVAFTNHFKQVFSDVQAREKELQTIFDTLPPMRYQETMSAIRTWVQQSETKLSIPQLSVTDYEIMEQRLGELQALQSSLQEQQSGLYYLSTTVKEMSKKAPSEISRKYQSEFEEIEGRWKKLSSQLVEHCQKLEEQMNKLRKIQNHIQTLKKWMAEVDVFLKEEWPALGDSEILKKQLKQCRLLVSDIQTIQPSLNSVNEGGQKIKNEAEPEFASRLETELKELNTQWDHMCQQVYARKEALKGGLEKTVSLQKDLSEMHEWMTQAEEEYLERDFEYKTPDELQKAVEEMKRAKEEAQQKEAKVKLLTESVNSVIAQAPPVAQEALKKELETLTTNYQWLCTRLNGKCKTLEEVWACWHELLSYLEKANKWLNEVEFKLKTTENIPGGAEEISEVLDSLENLMRHSEDNPNQIRILAQTLTDGGVMDELINEELETFNSRWRELHEEAVRRQKLLEQSIQSAQETEKSLHLIQESLTFIDKQLAAYIADKVDAAQMPQEAQKIQSDLTSHEISLEEMKKHNQGKEAAQRVLSQIDVAQKKLQDVSMKFRLFQKPANFEQRLQESKMILDEVKMHLPALETKSVEQEVVQSQLNHCVNLYKSLSEVKSEVEMVIKTGRQIVQKKQTENPKELDERVTALKLHYNELGAKVTERKQQLEKCLKLSRKMRKEMNVLTEWLAATDMELTKRSAVEGMPSNLDSEVAWGKATQKEIEKQKVHLKSITEVGEALKTVLGKKETLVEDKLSLLNSNWIAVTSRAEEWLNLLLEYQKHMETFDQNVDHITKWIIQADTLLDESEKKKPQQKEDVLKRLKAELNDIRPKVDSTRDQAANLMANRGDHCRKLVEPQISELNHRFAAISHRIKTGKASIPLKELEQFNSDIQKLLEPLEAEIQQGVNLKEEDFNKDMNEDNEGTVKELLQRGDNLQQRITDERKREEIKIKQQLLQTKHNALKDLRSQRRKKALEISHQWYQYKRQADDLLKCLDDIEKKLASLPEPRDERKIKEIDRELQKKKEELNAVRRQAEGLSEDGAAMAVEPTQIQLSKRWREIESKFAQFRRLNFAQIHTVREETMMVMTEDMPLEISYVPSTYLTEITHVSQALLEVEQLLNAPDLCAKDFEDLFKQEESLKNIKDSLQQSSGRIDIIHSKKTAALQSATPVERVKLQEALSQLDFQWEKVNKMYKDRQGRFDRSVEKWRRFHYDIKIFNQWLTEAEQFLRKTQIPENWEHAKYKWYLKELQDGIGQRQTVVRTLNATGEEIIQQSSKTDASILQEKLGSLNLRWQEVCKQLSDRKKRLEEQKNILSEFQRDLNEFVLWLEEADNIASIPLEPGKEQQLKEKLEQVKLLVEELPLRQGILKQLNETGGPVLVSAPISPEEQDKLENKLKQTNLQWIKVSRALPEKQGEIEAQIKDLGQLEKKLEDLEEQLNHLLLWLSPIRNQLEIYNQPNQEGPFDVKETEIAVQAKQPDVEEILSKGQHLYKEKPATQPVKRKLEDLSSEWKAVNRLLQELRAKQPDLAPGLTTIGASPTQTVTLVTQPVVTKETAISKLEMPSSLMLEVPALADFNRAWTELTDWLSLLDQVIKSQRVMVGDLEDINEMIIKQKATMQDLEQRRPQLEELITAAQNLKNKTSNQEARTIITDRIERIQNQWDEVQEHLQNRRQQLNEMLKDSTQWLEAKEEAEQVLGQARAKLESWKEGPYTVDAIQKKITETKQLAKDLRQWQTNVDVANDLALKLLRDYSADDTRKVHMITENINASWRSIHKRVSEREAALEETHRLLQQFPLDLEKFLAWLTEAETTANVLQDATRKERLLEDSKGVKELMKQWQDLQGEIEAHTDVYHNLDENSQKILRSLEGSDDAVLLQRRLDNMNFKWSELRKKSLNIRSHLEASSDQWKRLHLSLQELLVWLQLKDDELSRQAPIGGDFPAVQKQNDVHRAFKRELKTKEPVIMSTLETVRIFLTEQPLEGLEKLYQEPRELPPEERAQNVTRLLRKQAEEVNTEWEKLNLHSADWQRKIDETLERLRELQEATDELDLKLRQAEVIKGSWQPVGDLLIDSLQDHLEKVKALRGEIAPLKENVSHVNDLARQLTTLGIQLSPYNLSTLEDLNTRWKLLQVAVEDRVRQLHEAHRDFGPASQHFLSTSVQGPWERAISPNKVPYYINHETQTTCWDHPKMTELYQSLADLNNVRFSAYRTAMKLRRLQKALCLDLLSLSAACDALDQHNLKQNDQPMDILQIINCLTTIYDRLEQEHNNLVNVPLCVDMCLNWLLNVYDTGRTGRIRVLSFKTGIISLCKAHLEDKYRYLFKQVASSTGFCDQRRLGLLLHDSIQIPRQLGEVASFGGSNIEPSVRSCFQFANNKPEIEAALFLDWMRLEPQSMVWLPVLHRVAAAETAKHQAKCNICKECPIIGFRYRSLKHFNYDICQSCFFSGRVAKGHKMHYPMVEYCTPTTSGEDVRDFAKVLKNKFRTKRYFAKHPRMGYLPVQTVLEGDNMETPVTLINFWPVDSAPASSPQLSHDDTHSRIEHYASRLAEMENSNGSYLNDSISPNESIDDEHLLIQHYCQSLNQDSPLSQPRSPAQILISLESEERGELERILADLEEENRNLQAEYDRLKQQHEHKGLSPLPSPPEMMPTSPQSPRDAELIAEAKLLRQHKGRLEARMQILEDHNKQLESQLHRLRQLLEQPQAEAKVNGTTVSSPSTSLQRSDSSQPMLLRVVGSQTSDSMGEEDLLSPPQDTSTGLEEVMEQLNNSFPSSRGRNTPGKPMREDTM 2 1 2 ----------DVQKKTFTKWINARFSKSGKPPINDMFTDLKDGRKLLDLLEGLTGTSLPKERGSTRVHALNNVNRVLQVLHQNNVELVNIGGTDIVDGNHKLTLGLLWSIILHWQVKDVMKDVMSDLQQTNSEKILLSWVRQTTRPYSQVNVLNFTTSWTDGLAFNAVLHRHKPDLFSWDKVV-KMSPIERLEHAFSKAQTYLGIEKLLDPEDVAVRLPDKKSIIMYLTSLFEVLPQ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 1qag.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 9' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . ASP 11 11 ? A 49.638 38.866 38.802 1 1 A ASP 0.610 1 ATOM 2 C CA . ASP 11 11 ? A 50.594 38.190 37.893 1 1 A ASP 0.610 1 ATOM 3 C C . ASP 11 11 ? A 50.343 36.681 37.886 1 1 A ASP 0.610 1 ATOM 4 O O . ASP 11 11 ? A 49.625 36.162 37.040 1 1 A ASP 0.610 1 ATOM 5 C CB . ASP 11 11 ? A 51.986 38.620 38.399 1 1 A ASP 0.610 1 ATOM 6 C CG . ASP 11 11 ? A 52.732 38.677 37.098 1 1 A ASP 0.610 1 ATOM 7 O OD1 . ASP 11 11 ? A 52.557 39.721 36.433 1 1 A ASP 0.610 1 ATOM 8 O OD2 . ASP 11 11 ? A 53.226 37.598 36.708 1 1 A ASP 0.610 1 ATOM 9 N N . VAL 12 12 ? A 50.831 35.944 38.903 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 10 C CA . VAL 12 12 ? A 50.543 34.528 39.119 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 11 C C . VAL 12 12 ? A 49.105 34.273 39.485 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 12 O O . VAL 12 12 ? A 48.446 33.407 38.911 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 13 C CB . VAL 12 12 ? A 51.394 33.956 40.243 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 14 C CG1 . VAL 12 12 ? A 51.038 32.470 40.513 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 15 C CG2 . VAL 12 12 ? A 52.870 34.107 39.829 1 1 A VAL 0.630 1 ATOM 16 N N . GLN 13 13 ? A 48.583 35.108 40.413 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 17 C CA . GLN 13 13 ? A 47.192 35.163 40.824 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 18 C C . GLN 13 13 ? A 46.273 35.378 39.655 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 19 O O . GLN 13 13 ? A 45.144 34.911 39.639 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 20 C CB . GLN 13 13 ? A 46.927 36.293 41.859 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 21 C CG . GLN 13 13 ? A 47.586 36.065 43.241 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 22 C CD . GLN 13 13 ? A 46.914 36.926 44.315 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 23 O OE1 . GLN 13 13 ? A 46.003 37.712 44.042 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 24 N NE2 . GLN 13 13 ? A 47.364 36.785 45.579 1 1 A GLN 0.620 1 ATOM 25 N N . LYS 14 14 ? A 46.745 36.060 38.603 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 26 C CA . LYS 14 14 ? A 45.977 36.202 37.401 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 27 C C . LYS 14 14 ? A 45.737 34.877 36.684 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 28 O O . LYS 14 14 ? A 44.599 34.498 36.450 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 29 C CB . LYS 14 14 ? A 46.737 37.129 36.440 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 30 C CG . LYS 14 14 ? A 45.805 37.679 35.374 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 31 C CD . LYS 14 14 ? A 46.588 38.244 34.190 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 32 C CE . LYS 14 14 ? A 45.720 38.325 32.936 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 33 N NZ . LYS 14 14 ? A 45.815 39.661 32.336 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 34 N N . LYS 15 15 ? A 46.803 34.099 36.387 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 35 C CA . LYS 15 15 ? A 46.731 32.804 35.734 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 36 C C . LYS 15 15 ? A 45.886 31.781 36.475 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 37 O O . LYS 15 15 ? A 45.089 31.071 35.873 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 38 C CB . LYS 15 15 ? A 48.150 32.174 35.650 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 39 C CG . LYS 15 15 ? A 49.032 32.681 34.497 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 40 C CD . LYS 15 15 ? A 50.080 31.621 34.094 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 41 C CE . LYS 15 15 ? A 51.236 31.471 35.102 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 42 N NZ . LYS 15 15 ? A 51.621 30.049 35.287 1 1 A LYS 0.680 1 ATOM 43 N N . THR 16 16 ? A 46.068 31.666 37.802 1 1 A THR 0.750 1 ATOM 44 C CA . THR 16 16 ? A 45.319 30.762 38.665 1 1 A THR 0.750 1 ATOM 45 C C . THR 16 16 ? A 43.859 31.156 38.821 1 1 A THR 0.750 1 ATOM 46 O O . THR 16 16 ? A 42.978 30.301 38.731 1 1 A THR 0.750 1 ATOM 47 C CB . THR 16 16 ? A 45.952 30.558 40.039 1 1 A THR 0.750 1 ATOM 48 O OG1 . THR 16 16 ? A 45.979 31.736 40.821 1 1 A THR 0.750 1 ATOM 49 C CG2 . THR 16 16 ? A 47.425 30.155 39.886 1 1 A THR 0.750 1 ATOM 50 N N . PHE 17 17 ? A 43.551 32.457 39.025 1 1 A PHE 0.770 1 ATOM 51 C CA . PHE 17 17 ? A 42.195 32.974 39.167 1 1 A PHE 0.770 1 ATOM 52 C C . PHE 17 17 ? A 41.416 32.885 37.881 1 1 A PHE 0.770 1 ATOM 53 O O . PHE 17 17 ? A 40.252 32.496 37.880 1 1 A PHE 0.770 1 ATOM 54 C CB . PHE 17 17 ? A 42.156 34.439 39.664 1 1 A PHE 0.770 1 ATOM 55 C CG . PHE 17 17 ? A 42.542 34.590 41.119 1 1 A PHE 0.770 1 ATOM 56 C CD1 . PHE 17 17 ? A 43.131 33.591 41.932 1 1 A PHE 0.770 1 ATOM 57 C CD2 . PHE 17 17 ? 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A 39.913 27.827 35.892 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 72 C CB . LYS 19 19 ? A 43.076 28.342 35.882 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 73 C CG . LYS 19 19 ? A 44.133 28.271 34.784 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 74 C CD . LYS 19 19 ? A 45.351 27.467 35.248 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 75 C CE . LYS 19 19 ? A 46.534 27.662 34.307 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 76 N NZ . LYS 19 19 ? A 47.565 26.647 34.593 1 1 A LYS 0.770 1 ATOM 77 N N . TRP 20 20 ? A 40.596 29.127 37.593 1 1 A TRP 0.740 1 ATOM 78 C CA . TRP 20 20 ? A 39.503 28.830 38.501 1 1 A TRP 0.740 1 ATOM 79 C C . TRP 20 20 ? A 38.156 29.308 37.965 1 1 A TRP 0.740 1 ATOM 80 O O . TRP 20 20 ? A 37.168 28.576 37.980 1 1 A TRP 0.740 1 ATOM 81 C CB . TRP 20 20 ? A 39.774 29.507 39.880 1 1 A TRP 0.740 1 ATOM 82 C CG . TRP 20 20 ? A 38.737 29.219 40.974 1 1 A TRP 0.740 1 ATOM 83 C CD1 . TRP 20 20 ? A 38.747 28.217 41.900 1 1 A TRP 0.740 1 ATOM 84 C CD2 . TRP 20 20 ? A 37.478 29.914 41.169 1 1 A TRP 0.740 1 ATOM 85 N NE1 . TRP 20 20 ? 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A 47.503 27.630 75.868 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 1050 C CD . ARG 141 141 ? A 48.602 26.767 75.217 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 1051 N NE . ARG 141 141 ? A 49.986 27.404 75.310 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 1052 C CZ . ARG 141 141 ? A 50.679 27.702 76.421 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 1053 N NH1 . ARG 141 141 ? A 50.233 27.532 77.654 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 1054 N NH2 . ARG 141 141 ? A 51.932 28.158 76.341 1 1 A ARG 0.740 1 ATOM 1055 N N . GLN 142 142 ? A 45.470 31.287 74.099 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 1056 C CA . GLN 142 142 ? A 45.311 32.561 73.453 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 1057 C C . GLN 142 142 ? A 44.514 33.565 74.280 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 1058 O O . GLN 142 142 ? A 44.924 34.718 74.406 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 1059 C CB . GLN 142 142 ? A 44.647 32.329 72.083 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 1060 C CG . GLN 142 142 ? A 44.268 33.640 71.367 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 1061 C CD . GLN 142 142 ? A 43.896 33.383 69.917 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 1062 O OE1 . GLN 142 142 ? A 44.774 33.084 69.103 1 1 A GLN 0.730 1 ATOM 1063 N NE2 . 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A 41.179 29.908 85.707 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 1239 C CA . LEU 165 165 ? A 39.736 30.091 85.712 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 1240 C C . LEU 165 165 ? A 39.293 31.547 85.750 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 1241 O O . LEU 165 165 ? A 38.429 31.958 84.979 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 1242 C CB . LEU 165 165 ? A 39.117 29.361 86.921 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 1243 C CG . LEU 165 165 ? A 39.087 27.838 86.744 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 1244 C CD1 . LEU 165 165 ? A 38.713 27.214 88.071 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 1245 C CD2 . LEU 165 165 ? A 38.127 27.369 85.636 1 1 A LEU 0.900 1 ATOM 1246 N N . ASN 166 166 ? A 39.913 32.374 86.620 1 1 A ASN 0.890 1 ATOM 1247 C CA . ASN 166 166 ? A 39.665 33.811 86.693 1 1 A ASN 0.890 1 ATOM 1248 C C . ASN 166 166 ? A 40.099 34.573 85.465 1 1 A ASN 0.890 1 ATOM 1249 O O . ASN 166 166 ? A 39.432 35.508 85.035 1 1 A ASN 0.890 1 ATOM 1250 C CB . ASN 166 166 ? A 40.429 34.498 87.842 1 1 A ASN 0.890 1 ATOM 1251 C CG . ASN 166 166 ? A 39.762 34.084 89.120 1 1 A ASN 0.890 1 ATOM 1252 O OD1 . 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A 37.919 29.820 80.153 1 1 A LEU 0.880 1 ATOM 1266 C CD2 . LEU 168 168 ? A 36.388 31.732 80.387 1 1 A LEU 0.880 1 ATOM 1267 N N . ILE 169 169 ? A 37.558 34.428 82.677 1 1 A ILE 0.860 1 ATOM 1268 C CA . ILE 169 169 ? A 36.445 35.340 82.921 1 1 A ILE 0.860 1 ATOM 1269 C C . ILE 169 169 ? A 36.819 36.804 82.677 1 1 A ILE 0.860 1 ATOM 1270 O O . ILE 169 169 ? A 36.107 37.551 82.008 1 1 A ILE 0.860 1 ATOM 1271 C CB . ILE 169 169 ? A 35.991 35.219 84.389 1 1 A ILE 0.860 1 ATOM 1272 C CG1 . ILE 169 169 ? A 35.451 33.803 84.726 1 1 A ILE 0.860 1 ATOM 1273 C CG2 . ILE 169 169 ? A 34.951 36.310 84.768 1 1 A ILE 0.860 1 ATOM 1274 C CD1 . ILE 169 169 ? A 35.355 33.559 86.242 1 1 A ILE 0.860 1 ATOM 1275 N N . HIS 170 170 ? A 37.946 37.251 83.266 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1276 C CA . HIS 170 170 ? A 38.410 38.627 83.325 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1277 C C . HIS 170 170 ? A 38.735 39.252 81.973 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1278 O O . HIS 170 170 ? A 38.469 40.418 81.721 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1279 C CB . HIS 170 170 ? A 39.696 38.725 84.171 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1280 C CG . HIS 170 170 ? A 40.082 40.125 84.516 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1281 N ND1 . HIS 170 170 ? A 41.086 40.732 83.797 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1282 C CD2 . HIS 170 170 ? A 39.603 40.970 85.463 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1283 C CE1 . HIS 170 170 ? A 41.206 41.936 84.317 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1284 N NE2 . HIS 170 170 ? A 40.331 42.127 85.326 1 1 A HIS 0.840 1 ATOM 1285 N N . SER 171 171 ? A 39.338 38.458 81.069 1 1 A SER 0.840 1 ATOM 1286 C CA . SER 171 171 ? A 39.781 38.814 79.721 1 1 A SER 0.840 1 ATOM 1287 C C . SER 171 171 ? A 38.711 39.471 78.859 1 1 A SER 0.840 1 ATOM 1288 O O . SER 171 171 ? A 39.003 40.387 78.091 1 1 A SER 0.840 1 ATOM 1289 C CB . SER 171 171 ? A 40.368 37.574 78.978 1 1 A SER 0.840 1 ATOM 1290 O OG . SER 171 171 ? A 39.389 36.548 78.842 1 1 A SER 0.840 1 ATOM 1291 N N . HIS 172 172 ? A 37.441 39.045 78.994 1 1 A HIS 0.700 1 ATOM 1292 C CA . HIS 172 172 ? 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ARG 173 173 ? A 32.809 42.202 82.336 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 1307 C CD . ARG 173 173 ? A 31.436 41.544 82.362 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 1308 N NE . ARG 173 173 ? A 30.624 42.288 83.364 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 1309 C CZ . ARG 173 173 ? A 29.365 41.964 83.687 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 1310 N NH1 . ARG 173 173 ? A 28.768 40.908 83.143 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 1311 N NH2 . ARG 173 173 ? A 28.687 42.680 84.577 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 1312 N N . PRO 174 174 ? A 37.055 43.218 82.035 1 1 A PRO 0.760 1 ATOM 1313 C CA . PRO 174 174 ? A 38.062 43.466 83.066 1 1 A PRO 0.760 1 ATOM 1314 C C . PRO 174 174 ? A 37.562 44.384 84.170 1 1 A PRO 0.760 1 ATOM 1315 O O . PRO 174 174 ? A 38.226 44.491 85.195 1 1 A PRO 0.760 1 ATOM 1316 C CB . PRO 174 174 ? A 39.238 44.157 82.340 1 1 A PRO 0.760 1 ATOM 1317 C CG . PRO 174 174 ? A 39.019 43.820 80.867 1 1 A PRO 0.760 1 ATOM 1318 C CD . PRO 174 174 ? A 37.493 43.766 80.749 1 1 A PRO 0.760 1 ATOM 1319 N N . ASP 175 175 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #