data_SMR-456631df8d3c70dbfd1e55675fa0887b_4 _entry.id SMR-456631df8d3c70dbfd1e55675fa0887b_4 _struct.entry_id SMR-456631df8d3c70dbfd1e55675fa0887b_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - P55200 (isoform 2)/ KMT2A_MOUSE, Histone-lysine N-methyltransferase 2A Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries P55200 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' ZN non-polymer 'ZINC ION' Zn 65.380 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 501373.347 1 . 2 non-polymer man 'ZINC ION' 65.380 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP KMT2A_MOUSE P55200 1 ;MAHSCRWRFPARPGTTGGGGGGGRRGLGGAPRQRVPALLLPPGPQAGGGGPGAPPSPPAVAAAAAGSSGA GVPGGAAAASAASSSSASSSSSSSSSASSGPALLRVGPGFDAALQVSAAIGTNLRRFRAVFGESGGGGGS GEDEQFLGFGSDEEVRVRSPTRSPSVKASPRKPRGRPRSGSDRNPAILSDPSVFSPLNKSETKSADKIKK KDSKSIEKKRGRPPTFPGVKIKITHGKDIAELTQGSKEDSLKKVKRTPSAMFQQATKIKKLRAGKLSPLK SKFKTGKLQIGRKGVQIVRRRGRPPSTERIKTPSGLLINSELEKPQKVRKDKEGTPPLTKEDKTVVRQSP RRIKPVRIIPSCKRTDATIAKQLLQRAKKGAQKKIEKEAAQLQGRKVKTQVKNIRQFIMPVVSAISSRII KTPRRFIEDEDYDPPMKIARLESTPNSRFSATSCGSSEKSSAASQHSSQMSSDSSRSSSPSIDTTSDSQA SEEIQALPEERSNTPEVHTPLPISQSPENESNDRRSRRYSMSERSFGSRATKKLPTLQSAPQQQTSSSPP PPLLTPPPPLQPASGISDHTPWLMPPTIPLASPFLPASAAPMQGKRKSILREPTFRWTSLKHSRSEPQYF SSAKYAKEGLIRKPIFDNFRPPPLTPEDVGFASGFSASGTAASARLFSPLHSGTRFDIHKRSPILRAPRF TPSEAHSRIFESVTLPSNRTSSGASSSGVSNRKRKRKVFSPIRSEPRSPSHSMRTRSGRLSTSELSPLTP PSSVSSSLSIPVSPLAASALNPTFTFPSHSLTQSGESTEKNQRARKQTSALAEPFSSNSPALFPWFTPGS QTEKGRKKDTAPEELSKDRDADKSVEKDKSRERDREREKENKRESRKEKRKKGSDIQSSSALYPVGRVSK EKVAGEDVGTSSSAKKATGRKKSSSLDSGADVAPVTLGDTTAVKAKILIKKGRGNLEKNNLDLGPAAPSL EKERTPCLSAPSSSTVKHSTSSIGSMLAQADKLPMTDKRVASLLKKAKAQLCKIEKSKSLKQTDQPKAQG QESDSSETSVRGPRIKHVCRRAAVALGRKRAVFPDDMPTLSALPWEEREKILSSMGNDDKSSVAGSEDAE PLAPPIKPIKPVTRNKAPQEPPVKKGRRSRRCGQCPGCQVPEDCGICTNCLDKPKFGGRNIKKQCCKMRK CQNLQWMPSKASLQKQTKAVKKKEKKSKTTEKKESKESTAVKSPLEPAQKAAPPPREEPAPKKSSSEPPP RKPVEEKSEEGGAPAPAPAPEPKQVSAPASRKSSKQVSQPAAVVPPQPPSTAPQKKEAPKAVPSEPKKKQ PPPPEPGPEQSKQKKVAPRPSIPVKQKPKDKEKPPPVSKQENAGTLNILNPLSNGISSKQKIPADGVHRI RVDFKEDCEAENVWEMGGLGILTSVPITPRVVCFLCASSGHVEFVYCQVCCEPFHKFCLEENERPLEDQL ENWCCRRCKFCHVCGRQHQATKQLLECNKCRNSYHPECLGPNYPTKPTKKKKVWICTKCVRCKSCGSTTP GKGWDAQWSHDFSLCHDCAKLFAKGNFCPLCDKCYDDDDYESKMMQCGKCDRWVHSKCESLSDEMYEILS NLPESVAYTCVNCTERHPAEWRLALEKELQASLKQVLTALLNSRTTSHLLRYRQAAKPPDLNPETEESIP SRSSPEGPDPPVLTEVSKQDEQQPLDLEGVKKRMDQGSYVSVLEFSDDIVKIIQAAINSDGGQPEIKKAN SMVKSFFIRQMERVFPWFSVKKSRFWEPNKVSNNSGMLPNAVLPPSLDHNYAQWQEREESSHTEQPPLMK KIIPAPKPKGPGEPDSPTPLHPPTPPILSTDRSREDSPELNPPPGIDDNRQCALCLMYGDDSANDAGRLL YIGQNEWTHVNCALWSAEVFEDDDGSLKNVHMAVIRGKQLRCEFCQKPGATVGCCLTSCTSNYHFMCSRA KNCVFLDDKKVYCQRHRDLIKGEVVPENGFEVFRRVFVDFEGISLRRKFLNGLEPENIHMMIGSMTIDCL GILNDLSDCEDKLFPIGYQCSRVYWSTTDARKRCVYTCKIMECRPPVVEPDINSTVEHDDNRTIAHSPSS FIDASCKDSQSTAAILSPPSPDRPHSQTSGSCYYHVISKVPRIRTPSYSPTQRSPGCRPLPSAGSPTPTT HEIVTVGDPLLSSGLRSIGSRRHSTSSLSPLRSKLRIMSPVRTGSAYSRSSVSSVPSLGTATDPEASAKA SDRGGLLSSSANLGHSAPPSSSSQRTVGGSKTSHLDGSSPSEVKRCSASDLVPKGSLVKGEKNRTSSSKS TDGSAHSTAYPGIPKLTPQVHNATPGELNISKIGSFAEPSTVPFSSKDTVSYPQLHLRGQRSDRDQHMDP SQSVKPSPNEDGEIKTLKLPGMGHRPSILHEHIGSSSRDRRQKGKKSSKETCKEKHSSKSYLEPGQVTTG EEGNLKPEFADEVLTPGFLGQRPCNNVSSEKIGDKVLPLSGVPKGQSTQVEGSSKELQAPRKCSVKVTPL KMEGENQSKNTQKESGPGSPAHIESVCPAEPVSASRSPGAGPGVQPSPNNTLSQDPQSNNYQNLPEQDRN LMIPDGPKPQEDGSFKRRYPRRSARARSNMFFGLTPLYGVRSYGEEDIPFYSNSTGKKRGKRSAEGQVDG ADDLSTSDEDDLYYYNFTRTVISSGGEERLASHNLFREEEQCDLPKISQLDGVDDGTESDTSVTATSRKS SQIPKRNGKENGTENLKIDRPEDAGEKEHVIKSAVGHKNEPKLDNCHSVSRVKAQGQDSLEAQLSSLESS RRVHTSTPSDKNLLDTYNAELLKSDSDNNNSDDCGNILPSDIMDFVLKNTPSMQALGESPESSSSELLTL GEGLGLDSNREKDIGLFEVFSQQLPATEPVDSSVSSSISAEEQFELPLELPSDLSVLTTRSPTVPSQNPS RLAVISDSGEKRVTITEKSVASSEGDPALLSPGVDPAPEGHMTPDHFIQGHMDADHISSPPCGSVEQGHG NSQDLTRNSGTPGLQVPVSPTVPVQNQKYVPSSTDSPGPSQISNAAVQTTPPHLKPATEKLIVVNQNMQP LYVLQTLPNGVTQKIQLTSPVSSTPSVMETNTSVLGPMGSGLTLTTGLNPSLPPSPSLFPPASKGLLSVP HHQHLHSFPAAAQSSFPPNISSPPSGLLIGVQPPPDPQLLGSEANQRTDLTTTVATPSSGLKKRPISRLH TRKNKKLAPSSAPSNIAPSDVVSNMTLINFTPSQLSNHPSLLDLGSLNPSSHRTVPNIIKRSKSGIMYFE QAPLLPPQSVGGTAATAAGSSTISQDTSHLTSGPVSALASGSSVLNVVSMQTTAAPTSSTSVPGHVTLAN QRLLGTPDIGSISHLLIKASHQSLGIQDQPVALPPSSGMFPQLGTSQTPSAAAMTAASSICVLPSSQTAG MTAASPPGEAEEHYKLQRGNQLLAGKTGTLTSQRDRDPDSAPGTQPSNFTQTAEAPNGVRLEQNKTLPSA KPASSASPGSSPSSGQQSGSSSVPGPTKPKPKAKRIQLPLDKGSGKKHKVSHLRTSSEAHIPHRDTDPAP QPSVTRTPRANREQQDAAGVEQPSQKECGQPAGPVAALPEVQATQNPANEQENAEPKAMEEEESGFSSPL MLWLQQEQKRKESITERKPKKGLVFEISSDDGFQICAESIEDAWKSLTDKVQEARSNARLKQLSFAGVNG LRMLGILHDAVVFLIEQLAGAKHCRNYKFRFHKPEEANEPPLNPHGSARAEVHLRQSAFDMFNFLASKHR QPPEYNPNDEEEEEVQLKSARRATSMDLPMPMRFRHLKKTSKEAVGVYRSPIHGRGLFCKRNIDAGEMVI EYAGNVIRSIQTDKREKYYDSKGIGCYMFRIDDSEVVDATMHGNAARFINHSCEPNCYSRVINIDGQKHI VIFAMRKIYRGEELTYDYKFPIEDASNKLPCNCGAKKCRKFLN ; 'Histone-lysine N-methyltransferase 2A' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 3963 1 3963 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . 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A 1 3931 GLY 3931 3931 GLY GLY A . A 1 3932 GLU 3932 3932 GLU GLU A . A 1 3933 GLU 3933 3933 GLU GLU A . A 1 3934 LEU 3934 3934 LEU LEU A . A 1 3935 THR 3935 3935 THR THR A . A 1 3936 TYR 3936 3936 TYR TYR A . A 1 3937 ASP 3937 3937 ASP ASP A . A 1 3938 TYR 3938 3938 TYR TYR A . A 1 3939 LYS 3939 3939 LYS LYS A . A 1 3940 PHE 3940 3940 PHE PHE A . A 1 3941 PRO 3941 3941 PRO PRO A . A 1 3942 ILE 3942 3942 ILE ILE A . A 1 3943 GLU 3943 3943 GLU GLU A . A 1 3944 ASP 3944 3944 ASP ASP A . A 1 3945 ALA 3945 3945 ALA ALA A . A 1 3946 SER 3946 3946 SER SER A . A 1 3947 ASN 3947 3947 ASN ASN A . A 1 3948 LYS 3948 3948 LYS LYS A . A 1 3949 LEU 3949 3949 LEU LEU A . A 1 3950 PRO 3950 3950 PRO PRO A . A 1 3951 CYS 3951 3951 CYS CYS A . A 1 3952 ASN 3952 3952 ASN ASN A . A 1 3953 CYS 3953 3953 CYS CYS A . A 1 3954 GLY 3954 3954 GLY GLY A . A 1 3955 ALA 3955 3955 ALA ALA A . A 1 3956 LYS 3956 3956 LYS LYS A . A 1 3957 LYS 3957 3957 LYS LYS A . A 1 3958 CYS 3958 3958 CYS CYS A . A 1 3959 ARG 3959 3959 ARG ARG A . A 1 3960 LYS 3960 3960 LYS LYS A . A 1 3961 PHE 3961 3961 PHE PHE A . A 1 3962 LEU 3962 3962 LEU LEU A . A 1 3963 ASN 3963 3963 ASN ASN A . # # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 ZN 1 3 3 ZN '_' . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Histone-lysine N-methyltransferase SETD2 {PDB ID=6j9j, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=6j9j.1.A}' 'template structure' . 2 'ZINC ION {PDB ID=6j9j, label_asym_id=E, auth_asym_id=A, SMTL ID=6j9j.1._.3}' 'template structure' . 3 . target . 4 'ZINC ION' target . 5 'Target-template alignment by HHblits to 6j9j, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 6 'model 4' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 4 7 3 1 8 3 2 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 5 13 4 4 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' 2 4 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' non-polymer 1 2 B E 3 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;PSCVMDDFRDPQRWKECAKQGKMPCYFDLIEENVYLTERAKNKSHRDIKRMQCECTPLSKDERAQGEIAC GEDCLNRLLMIECSSRCPNGDYCSNRRFQRKQHADVEVILTEKKGWGLRAAKDLPSNTFVLEYCGEVLDH KEFKARVKEYARNKNIHYYFMALKNDEIIDATQKGNCSRFMNHSCEPNCETQKWTVNGQLRVGFFTTKLV PSGSELTFDYQFQRYGKEAQKCFCGSANCRGYLGGENRVSIRAAGGK ; ;PSCVMDDFRDPQRWKECAKQGKMPCYFDLIEENVYLTERAKNKSHRDIKRMQCECTPLSKDERAQGEIAC GEDCLNRLLMIECSSRCPNGDYCSNRRFQRKQHADVEVILTEKKGWGLRAAKDLPSNTFVLEYCGEVLDH KEFKARVKEYARNKNIHYYFMALKNDEIIDATQKGNCSRFMNHSCEPNCETQKWTVNGQLRVGFFTTKLV PSGSELTFDYQFQRYGKEAQKCFCGSANCRGYLGGENRVSIRAAGGK ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 92 244 # # loop_ _ma_template_non_poly.template_id _ma_template_non_poly.comp_id _ma_template_non_poly.details 2 ZN 'ZINC ION' # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6j9j 2024-10-23 2 PDB . 6j9j 2024-10-23 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 3963 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 5 1 3964 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 9.1e-26 32.237 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAHSCRWRFPARPGTTGGGGGGGRRGLGGAPRQRVPALLLPPGPQAGGGGPGAPPSPPAVAAAAAGSSGAGVPGGAAAASAASSSSASSSSSSSSSASSGPALLRVGPGFDAALQVSAAIGTNLRRFRAVFGESGGGGGSGEDEQFLGFGSDEEVRVRSPTRSPSVKASPRKPRGRPRSGSDRNPAILSDPSVFSPLNKSETKSADKIKKKDSKSIEKKRGRPPTFPGVKIKITHGKDIAELTQGSKEDSLKKVKRTPSAMFQQATKIKKLRAGKLSPLKSKFKTGKLQIGRKGVQIVRRRGRPPSTERIKTPSGLLINSELEKPQKVRKDKEGTPPLTKEDKTVVRQSPRRIKPVRIIPSCKRTDATIAKQLLQRAKKGAQKKIEKEAAQLQGRKVKTQVKNIRQFIMPVVSAISSRIIKTPRRFIEDEDYDPPMKIARLESTPNSRFSATSCGSSEKSSAASQHSSQMSSDSSRSSSPSIDTTSDSQASEEIQALPEERSNTPEVHTPLPISQSPENESNDRRSRRYSMSERSFGSRATKKLPTLQSAPQQQTSSSPPPPLLTPPPPLQPASGISDHTPWLMPPTIPLASPFLPASAAPMQGKRKSILREPTFRWTSLKHSRSEPQYFSSAKYAKEGLIRKPIFDNFRPPPLTPEDVGFASGFSASGTAASARLFSPLHSGTRFDIHKRSPILRAPRFTPSEAHSRIFESVTLPSNRTSSGASSSGVSNRKRKRKVFSPIRSEPRSPSHSMRTRSGRLSTSELSPLTPPSSVSSSLSIPVSPLAASALNPTFTFPSHSLTQSGESTEKNQRARKQTSALAEPFSSNSPALFPWFTPGSQTEKGRKKDTAPEELSKDRDADKSVEKDKSRERDREREKENKRESRKEKRKKGSDIQSSSALYPVGRVSKEKVAGEDVGTSSSAKKATGRKKSSSLDSGADVAPVTLGDTTAVKAKILIKKGRGNLEKNNLDLGPAAPSLEKERTPCLSAPSSSTVKHSTSSIGSMLAQADKLPMTDKRVASLLKKAKAQLCKIEKSKSLKQTDQPKAQGQESDSSETSVRGPRIKHVCRRAAVALGRKRAVFPDDMPTLSALPWEEREKILSSMGNDDKSSVAGSEDAEPLAPPIKPIKPVTRNKAPQEPPVKKGRRSRRCGQCPGCQVPEDCGICTNCLDKPKFGGRNIKKQCCKMRKCQNLQWMPSKASLQKQTKAVKKKEKKSKTTEKKESKESTAVKSPLEPAQKAAPPPREEPAPKKSSSEPPPRKPVEEKSEEGGAPAPAPAPEPKQVSAPASRKSSKQVSQPAAVVPPQPPSTAPQKKEAPKAVPSEPKKKQPPPPEPGPEQSKQKKVAPRPSIPVKQKPKDKEKPPPVSKQENAGTLNILNPLSNGISSKQKIPADGVHRIRVDFKEDCEAENVWEMGGLGILTSVPITPRVVCFLCASSGHVEFVYCQVCCEPFHKFCLEENERPLEDQLENWCCRRCKFCHVCGRQHQATKQLLECNKCRNSYHPECLGPNYPTKPTKKKKVWICTKCVRCKSCGSTTPGKGWDAQWSHDFSLCHDCAKLFAKGNFCPLCDKCYDDDDYESKMMQCGKCDRWVHSKCESLSDEMYEILSNLPESVAYTCVNCTERHPAEWRLALEKELQASLKQVLTALLNSRTTSHLLRYRQAAKPPDLNPETEESIPSRSSPEGPDPPVLTEVSKQDEQQPLDLEGVKKRMDQGSYVSVLEFSDDIVKIIQAAINSDGGQPEIKKANSMVKSFFIRQMERVFPWFSVKKSRFWEPNKVSNNSGMLPNAVLPPSLDHNYAQWQEREESSHTEQPPLMKKIIPAPKPKGPGEPDSPTPLHPPTPPILSTDRSREDSPELNPPPGIDDNRQCALCLMYGDDSANDAGRLLYIGQNEWTHVNCALWSAEVFEDDDGSLKNVHMAVIRGKQLRCEFCQKPGATVGCCLTSCTSNYHFMCSRAKNCVFLDDKKVYCQRHRDLIKGEVVPENGFEVFRRVFVDFEGISLRRKFLNGLEPENIHMMIGSMTIDCLGILNDLSDCEDKLFPIGYQCSRVYWSTTDARKRCVYTCKIMECRPPVVEPDINSTVEHDDNRTIAHSPSSFIDASCKDSQSTAAILSPPSPDRPHSQTSGSCYYHVISKVPRIRTPSYSPTQRSPGCRPLPSAGSPTPTTHEIVTVGDPLLSSGLRSIGSRRHSTSSLSPLRSKLRIMSPVRTGSAYSRSSVSSVPSLGTATDPEASAKASDRGGLLSSSANLGHSAPPSSSSQRTVGGSKTSHLDGSSPSEVKRCSASDLVPKGSLVKGEKNRTSSSKSTDGSAHSTAYPGIPKLTPQVHNATPGELNISKIGSFAEPSTVPFSSKDTVSYPQLHLRGQRSDRDQHMDPSQSVKPSPNEDGEIKTLKLPGMGHRPSILHEHIGSSSRDRRQKGKKSSKETCKEKHSSKSYLEPGQVTTGEEGNLKPEFADEVLTPGFLGQRPCNNVSSEKIGDKVLPLSGVPKGQSTQVEGSSKELQAPRKCSVKVTPLKMEGENQSKNTQKESGPGSPAHIESVCPAEPVSASRSPGAGPGVQPSPNNTLSQDPQSNNYQNLPEQDRNLMIPDGPKPQEDGSFKRRYPRRSARARSNMFFGLTPLYGVRSYGEEDIPFYSNSTGKKRGKRSAEGQVDGADDLSTSDEDDLYYYNFTRTVISSGGEERLASHNLFREEEQCDLPKISQLDGVDDGTESDTSVTATSRKSSQIPKRNGKENGTENLKIDRPEDAGEKEHVIKSAVGHKNEPKLDNCHSVSRVKAQGQDSLEAQLSSLESSRRVHTSTPSDKNLLDTYNAELLKSDSDNNNSDDCGNILPSDIMDFVLKNTPSMQALGESPESSSSELLTLGEGLGLDSNREKDIGLFEVFSQQLPATEPVDSSVSSSISAEEQFELPLELPSDLSVLTTRSPTVPSQNPSRLAVISDSGEKRVTITEKSVASSEGDPALLSPGVDPAPEGHMTPDHFIQGHMDADHISSPPCGSVEQGHGNSQDLTRNSGTPGLQVPVSPTVPVQNQKYVPSSTDSPGPSQISNAAVQTTPPHLKPATEKLIVVNQNMQPLYVLQTLPNGVTQKIQLTSPVSSTPSVMETNTSVLGPMGSGLTLTTGLNPSLPPSPSLFPPASKGLLSVPHHQHLHSFPAAAQSSFPPNISSPPSGLLIGVQPPPDPQLLGSEANQRTDLTTTVATPSSGLKKRPISRLHTRKNKKLAPSSAPSNIAPSDVVSNMTLINFTPSQLSNHPSLLDLGSLNPSSHRTVPNIIKRSKSGIMYFEQAPLLPPQSVGGTAATAAGSSTISQDTSHLTSGPVSALASGSSVLNVVSMQTTAAPTSSTSVPGHVTLANQRLLGTPDIGSISHLLIKASHQSLGIQDQPVALPPSSGMFPQLGTSQTPSAAAMTAASSICVLPSSQTAGMTAASPPGEAEEHYKLQRGNQLLAGKTGTLTSQRDRDPDSAPGTQPSNFTQTAEAPNGVRLEQNKTLPSAKPASSASPGSSPSSGQQSGSSSVPGPTKPKPKAKRIQLPLDKGSGKKHKVSHLRTSSEAHIPHRDTDPAPQPSVTRTPRANREQQDAAGVEQPSQKECGQPAGPVAALPEVQATQNPANEQENAEPKAMEEEESGFSSPLMLWLQQEQKRKESITERKPKKGLVFEISSDDGFQICAESIEDAWKSLTDKVQEARSNARLKQLSFAGVNGLRMLGILHDAVVFLIEQLAGAKHCRNYKFRFHKPEEANEPPLNPHGSARAEVHLRQSAFDMFNFLASKHRQPPEYNPNDEEEEEVQLKSARRATSMDLPMPMRFRHLKKTSKEAVGVYRSPIHGRGLFCKRNIDAGEMVIEYAGNVIRSIQTDKREKYYD-SKGIGCYMFRIDDSEVVDATMHGNAARFINHSCEPNCYSRVINIDGQKHIVIFAMRKIYRGEELTYDYKFPIEDASNKLPCNCGAKKCRKFLN 2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------YCSNRRFQRKQHADVEVILTEKKGWGLRAAKDLPSNTFVLEYCGEVLDHKEFKARVKEYARNKNIHYYFMALKNDEIIDATQKGNCSRFMNHSCEPNCETQKWTVNGQLRVGFFTTKLVPSGSELTFDYQFQRYG-KEAQKCFCGSANCRGYLG # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6j9j.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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A -16.653 -11.445 7.827 1 1 A TYR 0.640 1 ATOM 148 C CE2 . TYR 3828 3828 ? A -17.047 -12.710 5.800 1 1 A TYR 0.640 1 ATOM 149 C CZ . TYR 3828 3828 ? A -16.932 -12.658 7.193 1 1 A TYR 0.640 1 ATOM 150 O OH . TYR 3828 3828 ? A -17.094 -13.830 7.955 1 1 A TYR 0.640 1 ATOM 151 N N . ARG 3829 3829 ? A -19.182 -8.548 6.452 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 152 C CA . ARG 3829 3829 ? A -19.827 -8.013 7.633 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 153 C C . ARG 3829 3829 ? A -18.896 -8.181 8.815 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 154 O O . ARG 3829 3829 ? A -18.534 -9.294 9.186 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 155 C CB . ARG 3829 3829 ? A -21.148 -8.770 7.902 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 156 C CG . ARG 3829 3829 ? A -21.928 -8.307 9.150 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 157 C CD . ARG 3829 3829 ? A -23.224 -9.100 9.341 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 158 N NE . ARG 3829 3829 ? A -23.875 -8.598 10.588 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 159 C CZ . ARG 3829 3829 ? A -25.010 -9.108 11.083 1 1 A ARG 0.570 1 ATOM 160 N NH1 . ARG 3829 3829 ? 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A -16.356 -9.070 14.425 1 1 A PRO 0.350 1 ATOM 174 C CD . PRO 3831 3831 ? A -16.446 -8.360 13.071 1 1 A PRO 0.350 1 ATOM 175 N N . ILE 3832 3832 ? A -18.664 -5.452 14.650 1 1 A ILE 0.260 1 ATOM 176 C CA . ILE 3832 3832 ? A -19.302 -4.270 15.229 1 1 A ILE 0.260 1 ATOM 177 C C . ILE 3832 3832 ? A -18.897 -2.960 14.537 1 1 A ILE 0.260 1 ATOM 178 O O . ILE 3832 3832 ? A -19.158 -1.859 15.012 1 1 A ILE 0.260 1 ATOM 179 C CB . ILE 3832 3832 ? A -19.129 -4.202 16.760 1 1 A ILE 0.260 1 ATOM 180 C CG1 . ILE 3832 3832 ? A -20.098 -3.188 17.429 1 1 A ILE 0.260 1 ATOM 181 C CG2 . ILE 3832 3832 ? A -17.651 -3.959 17.119 1 1 A ILE 0.260 1 ATOM 182 C CD1 . ILE 3832 3832 ? A -20.234 -3.322 18.947 1 1 A ILE 0.260 1 ATOM 183 N N . HIS 3833 3833 ? A -18.280 -2.999 13.338 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 184 C CA . HIS 3833 3833 ? A -18.010 -1.759 12.597 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 185 C C . HIS 3833 3833 ? A -18.943 -1.597 11.408 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 186 O O . HIS 3833 3833 ? A -18.847 -0.646 10.641 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 187 C CB . HIS 3833 3833 ? A -16.542 -1.689 12.104 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 188 C CG . HIS 3833 3833 ? A -15.885 -0.363 12.372 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 189 N ND1 . HIS 3833 3833 ? A -15.517 -0.043 13.669 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 190 C CD2 . HIS 3833 3833 ? A -15.591 0.667 11.537 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 191 C CE1 . HIS 3833 3833 ? A -15.010 1.170 13.590 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 192 N NE2 . HIS 3833 3833 ? A -15.030 1.649 12.324 1 1 A HIS 0.520 1 ATOM 193 N N . GLY 3834 3834 ? A -19.891 -2.539 11.236 1 1 A GLY 0.590 1 ATOM 194 C CA . GLY 3834 3834 ? A -20.806 -2.579 10.104 1 1 A GLY 0.590 1 ATOM 195 C C . GLY 3834 3834 ? A -20.297 -3.484 9.017 1 1 A GLY 0.590 1 ATOM 196 O O . GLY 3834 3834 ? A -19.799 -4.577 9.268 1 1 A GLY 0.590 1 ATOM 197 N N . ARG 3835 3835 ? A -20.437 -3.077 7.746 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 198 C CA . ARG 3835 3835 ? A -19.795 -3.788 6.657 1 1 A ARG 0.580 1 ATOM 199 C C . ARG 3835 3835 ? 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #