data_SMR-67268deb8211ceaa305a47b3f74adf5b_1 _entry.id SMR-67268deb8211ceaa305a47b3f74adf5b_1 _struct.entry_id SMR-67268deb8211ceaa305a47b3f74adf5b_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q2TL32/ UBR4_RAT, E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q2TL32' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 2024-10.3 package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' ZN non-polymer 'ZINC ION' Zn 65.380 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 667974.915 1 . 2 non-polymer man 'ZINC ION' 65.380 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP UBR4_RAT Q2TL32 1 ;MATSGGEEAAAAAPAPGAPATGQDTTPGWEVAVRPLLSASYSAFEMKELPQLVASVIESESEILHHEKQY EPFYSSFVALSTHYITTVCSLIPRNQLQSVAAACKVLIEFSLLRLENPDEACAVSQKHLILLIKGLCTGC SRLDRTEIITFTAMMKSAKLPQTVKTLSDVEDQKELASPVSPELRQKEVQMNFLNQLTSVFNPRTVPSPP ISPQALVEGENDEQSSTEQASAVKTKNVFIAQNVASLQELGGSEKLLRVCLNLPYFLRYINRFQDAVVAN SFFIMPATVADATAVRNGFHSLVIDVTMALDTLSLPVLEPLNPSRLQDVTVLSLSCLYAGVSVATCMAIL HVGSAQQVRTGSTSSKEEDYESDAATIVQKCLEIYDMIGQAISSSRRAGGEHFQNFQLLGAWCLLNSLFL ILHLSPTALADKGKEKDPLAALRVRDILSRTKEGVGSPKLGPGKGHQGFGVLSVILANHAIKLLTSLFQD LQVEALHKGWETDGPPAVLSIMAQSTSTQRVQRLIDSVPLTNLLLTLLSTSYRKACVLQRQRKGSMSSDA SASTDSNTYYEDDFSSTEEDSSQDDDSEPILGQWFEETISPSKEKAAPPPPPPPPPLESSPRVKSPSKQA SGEKGNILASRKDPELFLGLASNILNFITSSMLNSRNNFIRNYLSVSLSEQHMATLASIIKEVDKDGLKG SSDEDFAAALYHFNHSLVTSDLQSPNLQNTLLQQLGVAPLSSGPWPLYIHPQGLSVLSRLLLIWQHKAGA QGDPDVPECLKVWDRFLTTMKQSALQGVVPSETEDLNIEHLQLLLLIFHSFSEKGRRAILTTLVQSIQEL SVNMEVQMRSAPLILARLLLIFDYLLHQYSKAPVYLFEQVQHNLLSPPFGWASGSQDSSSSSRRANIPLY HGFKEVEENWSKHFSSDAAPQPRFYCVLSTEASEEDLNRLDSEACEVLFSKLVKYDELYSSLTALLAAGS QLDTVKRKENKNMTALEACALQYYFLILWRILGILPPSKTYMNQLAMNSPEMSECDILHTLRWSSRLRIS SYVSWIKDHLIRQGMRPEHAGSLVELAASKCSSVKYDVEIVEEYFARQISSFCSIDCTTVLQLHEIPSLQ SIYTLDAAVSKVQVSLDEHFSKMAAETDPHKSSEITKNLLPATLQLIDTYASFTRAYLLQNLNEEGSTEK 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VDLIYNMFKKVPTSNTEGGWSCSLAEYIRHNDMPIYEAADKALKTFQEEFMPVETFSEFLDAAGLLSEIT DPESFLKDLLNSVP ; 'E3 ubiquitin-protein ligase UBR4' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 5194 1 5194 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . UBR4_RAT Q2TL32 . 1 5194 10116 'Rattus norvegicus (Rat)' 2007-05-15 1F7C929C147369E5 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MATSGGEEAAAAAPAPGAPATGQDTTPGWEVAVRPLLSASYSAFEMKELPQLVASVIESESEILHHEKQY EPFYSSFVALSTHYITTVCSLIPRNQLQSVAAACKVLIEFSLLRLENPDEACAVSQKHLILLIKGLCTGC SRLDRTEIITFTAMMKSAKLPQTVKTLSDVEDQKELASPVSPELRQKEVQMNFLNQLTSVFNPRTVPSPP ISPQALVEGENDEQSSTEQASAVKTKNVFIAQNVASLQELGGSEKLLRVCLNLPYFLRYINRFQDAVVAN SFFIMPATVADATAVRNGFHSLVIDVTMALDTLSLPVLEPLNPSRLQDVTVLSLSCLYAGVSVATCMAIL HVGSAQQVRTGSTSSKEEDYESDAATIVQKCLEIYDMIGQAISSSRRAGGEHFQNFQLLGAWCLLNSLFL ILHLSPTALADKGKEKDPLAALRVRDILSRTKEGVGSPKLGPGKGHQGFGVLSVILANHAIKLLTSLFQD LQVEALHKGWETDGPPAVLSIMAQSTSTQRVQRLIDSVPLTNLLLTLLSTSYRKACVLQRQRKGSMSSDA SASTDSNTYYEDDFSSTEEDSSQDDDSEPILGQWFEETISPSKEKAAPPPPPPPPPLESSPRVKSPSKQA 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A 1 5194 PRO 5194 5194 PRO PRO A . # # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 ZN 1 1 1 ZN '_' . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'cDNA FLJ12511 fis, clone NT2RM2001727, highly similar to Homo sapiens ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 4 (UBR4), mRNA {PDB ID=8b5w, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=8b5w.1.A}' 'template structure' . 2 'ZINC ION {PDB ID=8b5w, label_asym_id=B, auth_asym_id=A, SMTL ID=8b5w.1._.1}' 'template structure' . 3 . target . 4 'ZINC ION' target . 5 'Target-template alignment by HHblits to 8b5w, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 4 7 3 1 8 3 2 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 5 13 4 4 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-01 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2024-12-27 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' 2 4 . # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 2 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' non-polymer 1 2 B B 2 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GPLGSAIQHPGTQVLIGTDSIPNLHKLEQVSSDEGIGTLAENLLEALREHPDVNKKIDAARRETRAEKKR MAMAMRQKALGTLGMTTNEKGQVVTKTALLKQMEELIEEPGLTCCICREGYKFQPTKVLGIYTFTKRVAL EELENKPRKQQGYSTVSHFNIVHYDCHLAAVRLARGREEWESAALQNANTKCNGLLPVWGPHVPESAFAT CLARHNTYLQECTGQREPTYQLNIHDIKLLFLRFAMEQSFSADTGGGGRESNIHLIPYIIHTVLYVLNTT RATSREEKNLQGFLEQPKEKWVESAFEVDGPYYFTVLALHILPPEQWRATRVEILRRLLVTSQARAVAPG GATRLTDKAVKDYSAYRSSLLFWALVDLIYNMFKKVPTSNTEGGWSCSLAEYIRHNDMPIYEAADKALKT FQEEFMPVETFSEFLDVAGLLSEITDPESFLKDLLNSVP ; ;GPLGSAIQHPGTQVLIGTDSIPNLHKLEQVSSDEGIGTLAENLLEALREHPDVNKKIDAARRETRAEKKR MAMAMRQKALGTLGMTTNEKGQVVTKTALLKQMEELIEEPGLTCCICREGYKFQPTKVLGIYTFTKRVAL EELENKPRKQQGYSTVSHFNIVHYDCHLAAVRLARGREEWESAALQNANTKCNGLLPVWGPHVPESAFAT CLARHNTYLQECTGQREPTYQLNIHDIKLLFLRFAMEQSFSADTGGGGRESNIHLIPYIIHTVLYVLNTT RATSREEKNLQGFLEQPKEKWVESAFEVDGPYYFTVLALHILPPEQWRATRVEILRRLLVTSQARAVAPG GATRLTDKAVKDYSAYRSSLLFWALVDLIYNMFKKVPTSNTEGGWSCSLAEYIRHNDMPIYEAADKALKT FQEEFMPVETFSEFLDVAGLLSEITDPESFLKDLLNSVP ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 6 459 # # loop_ _ma_template_non_poly.template_id _ma_template_non_poly.comp_id _ma_template_non_poly.details 2 ZN 'ZINC ION' # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 8b5w 2024-04-17 2 PDB . 8b5w 2024-04-17 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 5194 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 5 1 5194 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 8e-113 96.696 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MATSGGEEAAAAAPAPGAPATGQDTTPGWEVAVRPLLSASYSAFEMKELPQLVASVIESESEILHHEKQYEPFYSSFVALSTHYITTVCSLIPRNQLQSVAAACKVLIEFSLLRLENPDEACAVSQKHLILLIKGLCTGCSRLDRTEIITFTAMMKSAKLPQTVKTLSDVEDQKELASPVSPELRQKEVQMNFLNQLTSVFNPRTVPSPPISPQALVEGENDEQSSTEQASAVKTKNVFIAQNVASLQELGGSEKLLRVCLNLPYFLRYINRFQDAVVANSFFIMPATVADATAVRNGFHSLVIDVTMALDTLSLPVLEPLNPSRLQDVTVLSLSCLYAGVSVATCMAILHVGSAQQVRTGSTSSKEEDYESDAATIVQKCLEIYDMIGQAISSSRRAGGEHFQNFQLLGAWCLLNSLFLILHLSPTALADKGKEKDPLAALRVRDILSRTKEGVGSPKLGPGKGHQGFGVLSVILANHAIKLLTSLFQDLQVEALHKGWETDGPPAVLSIMAQSTSTQRVQRLIDSVPLTNLLLTLLSTSYRKACVLQRQRKGSMSSDASASTDSNTYYEDDFSSTEEDSSQDDDSEPILGQWFEETISPSKEKAAPPPPPPPPPLESSPRVKSPSKQASGEKGNILASRKDPELFLGLASNILNFITSSMLNSRNNFIRNYLSVSLSEQHMATLASIIKEVDKDGLKGSSDEDFAAALYHFNHSLVTSDLQSPNLQNTLLQQLGVAPLSSGPWPLYIHPQGLSVLSRLLLIWQHKAGAQGDPDVPECLKVWDRFLTTMKQSALQGVVPSETEDLNIEHLQLLLLIFHSFSEKGRRAILTTLVQSIQELSVNMEVQMRSAPLILARLLLIFDYLLHQYSKAPVYLFEQVQHNLLSPPFGWASGSQDSSSSSRRANIPLYHGFKEVEENWSKHFSSDAAPQPRFYCVLSTEASEEDLNRLDSEACEVLFSKLVKYDELYSSLTALLAAGSQLDTVKRKENKNMTALEACALQYYFLILWRILGILPPSKTYMNQLAMNSPEMSECDILHTLRWSSRLRISSYVSWIKDHLIRQGMRPEHAGSLVELAASKCSSVKYDVEIVEEYFARQISSFCSIDCTTVLQLHEIPSLQSIYTLDAAVSKVQVSLDEHFSKMAAETDPHKSSEITKNLLPATLQLIDTYASFTRAYLLQNLNEEGSTEKPSQEKLHGFAAVLAIGSSRCKANTLGPTLVQNLPSSVQSVCESWNNINTNEFPNIGSWRNAFANDTIPSESYISAVQAAHLGTLCGQSLPLAASLKHALLSLVRLTGDLIVWSDEMNPAQVIRALLPLLLESSTESAAEISSNSLERILGPAESDEFLARVYEKLITGCYNILANHADPSSGLDESVLEECLQYLEKQLESSQARKAMEEFFSDGGELVQIMMATANEDLSAKFCNRVLKFFTKLFQLTEKSPNPSLLHLCGSLAQLACVEPVRLQAWLTRMTTSPPKDSDQLEVIQENRQLLQLLTTYIVRENSQVGEGVCAVLLGTLTPMATDMLANGDGTGFPELMVVMATLASAGQGAGHLQLHNAAVDWLGRCKKYLSQKNVVEKLNANVMHGKHVMVLECTCHIMSYLADVTNALSQSNGQGPSHLSVDGEERAIEVDSDWVEELAVEEEDSQAEDSDEDSLCNKLCTFTITQKEFMNQHWYHCHTCKMVDGVGVCTVCAKVCHKDHEISYAKYGSFFCDCGAKEDGSCLALVKRTPSSGMSSTMKESAFQSEPRVSESLVRHASTSPADKAKVTISDGKVADEEKPKKSSLCRTVEGCREELQNQANFSFAPLVLDMLNFLMDAIQTNFQQASAVGSSSRAQQALSELHTVDKVVEMTDQLMVPTLGSQEGAFENVRMNYSGDQGQTIRQLISAHVLRRVAMCVLSSPHGRRQHLAVSHEKGKITVLQLSALLKQADSSKRKLTLTRLASAPVPFTVLSLTGNPCKEDYLAVCGLKDCHVLTFSSSGSVSDHLVLHPQLATGNFIIKAVWLPGSQTELAIVTADFVKIYDLSVDALSPTFYFLLPSSKIRDVTFLFNEEGKNIIVIMSSAGYMYTQLMEEASSAQQGPFYVTNVLEINHEDLKDSNSQVAGGGVSVYYSHVLQMLFFSYSQGKSFAATVSRSTLEVLQLFPINIKSSNGGSKTSPALCQWSEVMNHPGLVCCVQQTTGVPLVVMVKPDTFLIQEIKTLPAKAKIQDMVAIRHTACNEQQRTTMILLCEDGSLRIYMANVENTSYWLQPSLQPSSVISIMKPVRKRKTATITARTSSQVTFPIDFFEHNQQLTDVEFGGNDLLQVYNAQQIKHRLNSTGMYVANTKPGGFTMEISNNSSTMVMTGMRIQIGTQAIERAPSYIEIFGRTMQLNLSRSRWFDFPFTREEALQADRKLNLFIGASVDPAGVTMIDAVKIYGKTKEQFGWPDEPPEDFPSASVSSVCPPNLNQSNSTGDSDSAAPATTSGTVLERLVVSSLEALESCFAVGPIIEKERNKHAAQELATLLLSLPAPASVQQQSKSLLASLHSSRSAYHSHKDQALLSKAVQCLNTSSKEGKDLDPEVFQRLVITARSIAVTRPNNLVHFTESKLPQMETEGAEEGKEPQKQVEGDGCSFITQLVNHFWKLHASKPKNAFLAPACLPGLTHIEATVNALVDIIHGYCTCELDCINTASKIYMQMLLCPDPAVSFSCKQALIRVLRPRNKRRHVTLPSSPRSNTPMGDKDDDDDDDADEKMQSSGIPDGGHIRQESQEQSEVDHGDFEMVSESMVLETAENVNNGNPSPLEALLAGAEGFPPMLDIPPDADDETMVELAIALSLQQDQQGSSSSALGLQSLGLSGQAPSSSSLDAGTLSDTTASGVCACNSSVTLSAPASDDEGSTAATDGSTLRTSPADHGGSVGSESGGSAVDSVAGEHSVSGRSSAYGDATAEGHPAGPGSVSSSTGAISTTTGHQEGDGSEGEGEGEAEGDVHTSNRLHMVRLMLLERLLQTLPQLRNVGGVRAIPYMQVILMLTTDLDGEDEKDKGALDNLLAQLIAELGMDKKDVSKKNERSALNEVHLVVMRLLSVFMSRTKSGSKSSICESSSLISSATAAALLSSGAVDYCLHVLKSLLEYWKGQQSEEEPVTTSQLLKPHTTSSPPDMSPFFLRQYVKGHAADVFEAYTQLLTEMVLRLPYQIKKIADTSSRIPPPVFDHSWFYFLSEYLMIQQTPFVRRQVRKLLLFICGSKEKYRQLRDLHTLDSHVRGIKKLLEEQGIFLRASVVTASSGSALQYDTLISLMEHLKACAEIAAQRTINWQKFCIKDDSVLYFLLQVSFLVDEGVSPVLLQLLSCALCGSKVLAALAASTGSSSVASSAPPAASSGQTTTQSKSSTKKSKKEKKEKEKEGESSGSQEDQLCTALVNQLNRFADKETLIQFLRCFLLESNSSSVRWQAHCLTLHIYRNSNKAQQELLLDLMWSIWPELPAYGRKAAQFVDLLGYFSLKTAQTEKKLKEYSQKAVEILRTQNHILTNHPNSNIYNTLSGLVEFDGYYLESDPCLVCNNPEVPFCYIKLSSIKVDTRYTTTQQVVKLIGSHTISKVTVKIGDLKRTKMVRTINLYYNNRTVQAIVELKNKPARWHKAKKVQLTPGQTEVKIDLPLPIVASNLMIEFADFYENYQASTETLQCPRCSASVPANPGVCGNCGENVYQCHKCRSINYDEKDPFLCNACGFCKYARFDFMLYAKPCCAVDPIENEEDRKKAVSNINTLLDKADRVYHQLMGHRPQLENLLCKVNEAAPEKPQEDSGTAGGISSTSASVNRYILQLAQEYCGDCKNSFDELSKIIQKVFASRKELLEYDLQQREAATKSSRTSVQPTFTASQYRALSVLGCGHTSSTKCYGCASAVTEHCITLLRALATNPALRHILVSQGLIRELFDYNLRRGAAAIREEVRQLMCLLTRDNPEATQQMNDLIIGKVSTALKGHWANPDLASSLQYEMLLLTDSISKEDSCWELRLRCALSLFLMAVNIKTPVVVENITLMCLRILQKLIKPPAPTSKKNKDVPVEALTTVKPYCNEIHAQAQLWLKRDPKASYEAWKKCLPIRGVDGNGKSPSKSELHRLYLTEKYVWRWKQFLSRRGKRTTPLDLKLGHNNWLRQVLFTPATQAARQAACTIVEALASVPSRKQQVLDLLTSYLDELSVAGECAAEYLALYQKLIASCHWKVYLAARGVLPYVGNLITKEIARLLALEEATLSTDLQQGYALKSLTGLLSSFVEVESIKRHFKSRLVGTVLNGYLCLRKLVLQRTKLIDETQDMLLEMLEDMTTGTESETKAFMAVCIETAKRYNLDDYRTPVFIFERLCSIIYPEENEVTEFFVTLEKDPQQEDFLQGRMPGNPYSSNEPGIGPLMRDIKNKICQDCDLVALLEDDSGMELLVNNKIISLDLPVAEVYKKVWCTTNEGEPMRIVYRMRGLLGDATEEFIESLDSTTDEEEDEEEVYRMAGVMAQCGGLQCMLNRLAGVKDFKQGRHLLTVLLKLFSYCVKVKVNRQQLVKLEMNTLNVMLGTLNLALVAEQESKDSGGAAVAEQVLSIMEIILDESNAEPLSEDKGNLLLTGDKDQLVMLLDQINSTFVRSNPSVLQGLLRIIPYLSFGEVEKMQILVERFKPYCSFDKYDEDHSGDDKVFLDCFCKIAAGIKNNSNGHQLKDLILQKGITQSALDYMKKHIPSAKNLDADIWKKFLSRPALPFILRLLRGLAMQHPATQVLIGTDSITSLHKLEQVSSDEGIGTLAENLLEALREHPDVNKKIDAARRETRAEKKRMAMAMRQKALGTLGMTTNEKGQVVTKTALLKQMEELIEEPGLTCCICREGYKFQPTKVLGIYTFTKRVALEEMENKPRKQQGYSTVSHFNIVHYDCHLAAVRLARGREEWESAALQNANTKCNGLLPVWGPHVPESAFATCLARHNTYLQECTGQREPTYQLNIHDIKLLFLRFAMEQSFSADTGGGGRESNIHL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2 1 2 ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AIQHPGTQVLIGTDSIPNLHKLEQVSSDEGIGTLAENLLEALREHPDVNKKIDAARRETRAEKKRMAMAMRQKALGTLGMTTNEKGQVVTKTALLKQMEELIEEPGLTCCICREGYKFQPTKVLGIYTFTKRVALEELENKPRKQQGYSTVSHFNIVHYDCHLAAVRLARGREEWESAALQNANTKCNGLLPVWGPHVPESAFATCLARHNTYLQECTGQREPTYQLNIHDIKLLFLRFAMEQSFSADTGGGGRESNIHLIPYIIHTVLYVLNTTRATSREEKNLQGFLEQPKEKWVESAFEVDGPYYFTVLALHILPPEQWRATRVEILRRLLVTSQARAVAPGGATRLTDKAVKDYSAYRSSLLFWALVDLIYNMFKKVPTSNTEGGWSCSLAEYIRHNDMPIYEAADKALKTFQEEFMPVETFSEFLDVAGLLSEITDPESFLKDLLNSVP # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 8b5w.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . GLU 4844 4844 ? A 41.828 9.916 71.932 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 2 C CA . GLU 4844 4844 ? A 41.238 10.960 71.044 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 3 C C . GLU 4844 4844 ? A 41.105 10.368 69.655 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 4 O O . GLU 4844 4844 ? A 42.111 9.828 69.206 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 5 C CB . GLU 4844 4844 ? A 42.245 12.120 71.111 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 6 C CG . GLU 4844 4844 ? A 42.157 12.920 72.436 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 7 C CD . GLU 4844 4844 ? A 41.213 14.111 72.294 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 8 O OE1 . GLU 4844 4844 ? A 40.397 14.101 71.336 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 9 O OE2 . GLU 4844 4844 ? A 41.264 15.023 73.153 1 1 A GLU 0.590 1 ATOM 10 N N . PRO 4845 4845 ? A 39.953 10.342 68.975 1 1 A PRO 0.610 1 ATOM 11 C CA . PRO 4845 4845 ? A 39.837 9.624 67.706 1 1 A PRO 0.610 1 ATOM 12 C C . PRO 4845 4845 ? A 40.152 10.545 66.554 1 1 A PRO 0.610 1 ATOM 13 O O . PRO 4845 4845 ? A 40.302 10.061 65.440 1 1 A PRO 0.610 1 ATOM 14 C CB . PRO 4845 4845 ? A 38.365 9.179 67.643 1 1 A PRO 0.610 1 ATOM 15 C CG . PRO 4845 4845 ? A 37.624 10.219 68.482 1 1 A PRO 0.610 1 ATOM 16 C CD . PRO 4845 4845 ? A 38.634 10.580 69.573 1 1 A PRO 0.610 1 ATOM 17 N N . GLY 4846 4846 ? A 40.181 11.869 66.794 1 1 A GLY 0.740 1 ATOM 18 C CA . GLY 4846 4846 ? A 40.359 12.873 65.759 1 1 A GLY 0.740 1 ATOM 19 C C . GLY 4846 4846 ? A 41.744 13.454 65.714 1 1 A GLY 0.740 1 ATOM 20 O O . GLY 4846 4846 ? A 42.723 12.840 66.125 1 1 A GLY 0.740 1 ATOM 21 N N . LEU 4847 4847 ? A 41.863 14.692 65.192 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 22 C CA . LEU 4847 4847 ? A 43.109 15.433 65.176 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 23 C C . LEU 4847 4847 ? A 43.585 15.765 66.584 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 24 O O . LEU 4847 4847 ? A 42.818 16.221 67.433 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 25 C CB . LEU 4847 4847 ? A 42.977 16.743 64.364 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 26 C CG . LEU 4847 4847 ? A 42.471 16.593 62.915 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 27 C CD1 . LEU 4847 4847 ? A 42.300 17.981 62.280 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 28 C CD2 . LEU 4847 4847 ? A 43.347 15.689 62.036 1 1 A LEU 0.750 1 ATOM 29 N N . THR 4848 4848 ? A 44.876 15.530 66.868 1 1 A THR 0.710 1 ATOM 30 C CA . THR 4848 4848 ? A 45.433 15.714 68.193 1 1 A THR 0.710 1 ATOM 31 C C . THR 4848 4848 ? A 46.603 16.655 68.083 1 1 A THR 0.710 1 ATOM 32 O O . THR 4848 4848 ? A 47.340 16.660 67.101 1 1 A THR 0.710 1 ATOM 33 C CB . THR 4848 4848 ? A 45.851 14.416 68.892 1 1 A THR 0.710 1 ATOM 34 O OG1 . THR 4848 4848 ? A 46.888 13.711 68.224 1 1 A THR 0.710 1 ATOM 35 C CG2 . THR 4848 4848 ? A 44.648 13.469 68.922 1 1 A THR 0.710 1 ATOM 36 N N . CYS 4849 4849 ? A 46.800 17.535 69.079 1 1 A CYS 0.710 1 ATOM 37 C CA . CYS 4849 4849 ? A 48.031 18.291 69.197 1 1 A CYS 0.710 1 ATOM 38 C C . CYS 4849 4849 ? A 49.189 17.376 69.585 1 1 A CYS 0.710 1 ATOM 39 O O . CYS 4849 4849 ? A 49.100 16.639 70.561 1 1 A CYS 0.710 1 ATOM 40 C CB . CYS 4849 4849 ? A 47.820 19.398 70.261 1 1 A CYS 0.710 1 ATOM 41 S SG . CYS 4849 4849 ? A 49.258 20.380 70.808 1 1 A CYS 0.710 1 ATOM 42 N N . CYS 4850 4850 ? A 50.324 17.418 68.850 1 1 A CYS 0.690 1 ATOM 43 C CA . CYS 4850 4850 ? A 51.491 16.589 69.135 1 1 A CYS 0.690 1 ATOM 44 C C . CYS 4850 4850 ? A 52.220 16.950 70.431 1 1 A CYS 0.690 1 ATOM 45 O O . CYS 4850 4850 ? A 52.890 16.109 71.025 1 1 A CYS 0.690 1 ATOM 46 C CB . CYS 4850 4850 ? A 52.470 16.514 67.918 1 1 A CYS 0.690 1 ATOM 47 S SG . CYS 4850 4850 ? A 53.388 18.043 67.521 1 1 A CYS 0.690 1 ATOM 48 N N . ILE 4851 4851 ? A 52.082 18.211 70.907 1 1 A ILE 0.670 1 ATOM 49 C CA . ILE 4851 4851 ? A 52.682 18.692 72.154 1 1 A ILE 0.670 1 ATOM 50 C C . ILE 4851 4851 ? A 51.972 18.144 73.382 1 1 A ILE 0.670 1 ATOM 51 O O . ILE 4851 4851 ? A 52.592 17.551 74.260 1 1 A ILE 0.670 1 ATOM 52 C CB . ILE 4851 4851 ? A 52.712 20.234 72.217 1 1 A ILE 0.670 1 ATOM 53 C CG1 . ILE 4851 4851 ? A 53.667 20.794 71.135 1 1 A ILE 0.670 1 ATOM 54 C CG2 . ILE 4851 4851 ? A 53.088 20.754 73.630 1 1 A ILE 0.670 1 ATOM 55 C CD1 . ILE 4851 4851 ? A 53.673 22.322 70.986 1 1 A ILE 0.670 1 ATOM 56 N N . CYS 4852 4852 ? A 50.633 18.306 73.461 1 1 A CYS 0.650 1 ATOM 57 C CA . CYS 4852 4852 ? A 49.910 17.993 74.683 1 1 A CYS 0.650 1 ATOM 58 C C . CYS 4852 4852 ? A 49.159 16.674 74.599 1 1 A CYS 0.650 1 ATOM 59 O O . CYS 4852 4852 ? A 48.718 16.141 75.611 1 1 A CYS 0.650 1 ATOM 60 C CB . CYS 4852 4852 ? A 48.954 19.152 75.083 1 1 A CYS 0.650 1 ATOM 61 S SG . CYS 4852 4852 ? A 47.654 19.509 73.871 1 1 A CYS 0.650 1 ATOM 62 N N . ARG 4853 4853 ? A 49.037 16.106 73.381 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 63 C CA . ARG 4853 4853 ? A 48.368 14.850 73.074 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 64 C C . ARG 4853 4853 ? A 46.842 14.893 73.153 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 65 O O . ARG 4853 4853 ? A 46.174 13.858 73.159 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 66 C CB . ARG 4853 4853 ? A 48.952 13.644 73.838 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 67 C CG . ARG 4853 4853 ? A 50.465 13.452 73.647 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 68 C CD . ARG 4853 4853 ? A 50.926 12.231 74.429 1 1 A ARG 0.660 1 ATOM 69 N NE . 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #