data_SMR-84c530d3af8bfb4a02b4ad3d3e05ae19_2
_entry.id SMR-84c530d3af8bfb4a02b4ad3d3e05ae19_2
_struct.entry_id SMR-84c530d3af8bfb4a02b4ad3d3e05ae19_2
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - O08919/ NUMBL_MOUSE, Numb-like protein

Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries O08919'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
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_citation.title
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_citation.page_last
_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
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_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
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_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service'
3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
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_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
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_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 75072.252 1 .
#
#
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_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP NUMBL_MOUSE O08919 1
;MSRSAAASGGPRRPDQHLSPAPCGASGPPETFRTESDGAGTMNKLRQSLRRRKPAYVPEASRPHQWQADE
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PPGTGDSDGINALCTQISSSFASAGAPASGPPPATTGTSAWGEPSVPAAAAFQPGHKRTPSEAERWLEEV
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;
'Numb-like protein'
#
#
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_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 604 1 604
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . NUMBL_MOUSE O08919 . 1 604 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2011-07-27
3DD012B7BB30987E
#
#
loop_
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_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no E
;MSRSAAASGGPRRPDQHLSPAPCGASGPPETFRTESDGAGTMNKLRQSLRRRKPAYVPEASRPHQWQADE
DAVRKGTCSFPVRYLGHVEVEESRGMHVCEDAVKKLKAMGRKSVKSVLWVSADGLRVVDDKTKDLLVDQT
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PPGTGDSDGINALCTQISSSFASAGAPASGPPPATTGTSAWGEPSVPAAAAFQPGHKRTPSEAERWLEEV
SQVAKAQQQQQQQQQQQQQQQATSVPPMPTMAPTLQPFSAPVGPFDTAAAQVAVFLPPTHMQPPFVPAYP
GLGYPPMPRVPVVGITPSQMVANAFCSAAQLQPQPATLLGKAGAFPPPAAPSAPGGQARPRPNGAPWPPE
PAPAPAPELDPFEAQWAALEGKPAVEKPSNPFSGDLQKTFEIEL
;

;MSRSAAASGGPRRPDQHLSPAPCGASGPPETFRTESDGAGTMNKLRQSLRRRKPAYVPEASRPHQWQADE
DAVRKGTCSFPVRYLGHVEVEESRGMHVCEDAVKKLKAMGRKSVKSVLWVSADGLRVVDDKTKDLLVDQT
IEKVSFCAPDRNLDKAFSYICRDGTTRRWICHCFLALKDSGERLSHAVGCAFAACLERKQRREKECGVTA
AFDASRTSFAREGSFRLSGGGRPAEREAGDKKKAEAAAAPAVAPGPAQPGHVSPTPATTSPGEKGEAGTP
VAAGTTAAAIPRRHAPLEQLVRQGSFRGFPALSQKNSPFKRQLSLRLNELPSTLQRRTDFQVKGTVPEME
PPGTGDSDGINALCTQISSSFASAGAPASGPPPATTGTSAWGEPSVPAAAAFQPGHKRTPSEAERWLEEV
SQVAKAQQQQQQQQQQQQQQQATSVPPMPTMAPTLQPFSAPVGPFDTAAAQVAVFLPPTHMQPPFVPAYP
GLGYPPMPRVPVVGITPSQMVANAFCSAAQLQPQPATLLGKAGAFPPPAAPSAPGGQARPRPNGAPWPPE
PAPAPAPELDPFEAQWAALEGKPAVEKPSNPFSGDLQKTFEIEL
;

#
#
loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 SER .
1 3 ARG .
1 4 SER .
1 5 ALA .
1 6 ALA .
1 7 ALA .
1 8 SER .
1 9 GLY .
1 10 GLY .
1 11 PRO .
1 12 ARG .
1 13 ARG .
1 14 PRO .
1 15 ASP .
1 16 GLN .
1 17 HIS .
1 18 LEU .
1 19 SER .
1 20 PRO .
1 21 ALA .
1 22 PRO .
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1 25 ALA .
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1 27 GLY .
1 28 PRO .
1 29 PRO .
1 30 GLU .
1 31 THR .
1 32 PHE .
1 33 ARG .
1 34 THR .
1 35 GLU .
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1 37 ASP .
1 38 GLY .
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1 40 GLY .
1 41 THR .
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1 45 LEU .
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1 47 GLN .
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1 51 ARG .
1 52 ARG .
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1 55 ALA .
1 56 TYR .
1 57 VAL .
1 58 PRO .
1 59 GLU .
1 60 ALA .
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1 63 PRO .
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1 67 GLN .
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1 71 ASP .
1 72 ALA .
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1 83 ARG .
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1 92 GLU .
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1 97 HIS .
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1 120 VAL .
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1 150 ASP .
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1 152 ASN .
1 153 LEU .
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1 166 THR .
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1 168 ARG .
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#
#
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A 1 .
#
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loop_
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A 1 279 THR 279 ? ? ? E .
A 1 280 PRO 280 ? ? ? E .
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A 1 282 ALA 282 ? ? ? E .
A 1 283 ALA 283 ? ? ? E .
A 1 284 GLY 284 ? ? ? E .
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A 1 286 THR 286 ? ? ? E .
A 1 287 ALA 287 ? ? ? E .
A 1 288 ALA 288 ? ? ? E .
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A 1 309 PHE 309 309 PHE PHE E .
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A 1 380 GLY 380 ? ? ? E .
A 1 381 PRO 381 ? ? ? E .
A 1 382 PRO 382 ? ? ? E .
A 1 383 PRO 383 ? ? ? E .
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#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'Peptide from Protein numb homolog {PDB ID=5yqg, label_asym_id=E, auth_asym_id=E, SMTL ID=5yqg.1.E}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 5yqg, label_asym_id=E'
'target-template alignment' .
4 'model 2' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
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#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-22
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-17
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
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1.000000 0 0 0
#
#
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_ma_template_details.template_entity_type
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_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A E 2 1 E
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#
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_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
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#
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_ma_template_poly_segment.template_id
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1 1 1 31
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#
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_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
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1 PDB . 5yqg 2024-10-23
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#
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_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 604
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#
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_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 604 'target-template pairwise alignment' local
#
#
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_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.5e-11 90.323
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
MSRSAAASGGPRRPDQHLSPAPCGASGPPETFRTESDGAGTMNKLRQSLRRRKPAYVPEASRPHQWQADEDAVRKGTCSFPVRYLGHVEVEESRGMHVCEDAVKKLKAMGRKSVKSVLWVSADGLRVVDDKTKDLLVDQTIEKVSFCAPDRNLDKAFSYICRDGTTRRWICHCFLALKDSGERLSHAVGCAFAACLERKQRREKECGVTAAFDASRTSFAREGSFRLSGGGRPAEREAGDKKKAEAAAAPAVAPGPAQPGHVSPTPATTSPGEKGEAGTPVAAGTTAAAIPRRHAPLEQLVRQGSFRGFPALSQKNSPFKRQLSLRLNELPSTLQRRTDFQVKGTVPEMEPPGTGDSDGINALCTQISSSFASAGAPASGPPPATTGTSAWGEPSVPAAAAFQPGHKRTPSEAERWLEEVSQVAKAQQQQQQQQQQQQQQQATSVPPMPTMAPTLQPFSAPVGPFDTAAAQVAVFLPPTHMQPPFVPAYPGLGYPPMPRVPVVGITPSQMVANAFCSAAQLQPQPATLLGKAGAFPPPAAPSAPGGQARPRPNGAPWPPEPAPAPAPELDPFEAQWAALEGKPAVEKPSNPFSGDLQKTFEIEL
2 1 2
-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LARQGSFRGFPALSQKMSPFKRQLSLRINEL----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5yqg.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_id
_ma_model_list.model_group_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.model_group_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . ARG 302 302 ? A -29.369 -26.078 -57.664 1 1 E ARG 0.260 1
ATOM 2 C CA . ARG 302 302 ? A -28.256 -26.620 -56.801 1 1 E ARG 0.260 1
ATOM 3 C C . ARG 302 302 ? A -27.445 -27.674 -57.551 1 1 E ARG 0.260 1
ATOM 4 O O . ARG 302 302 ? A -27.953 -28.761 -57.777 1 1 E ARG 0.260 1
ATOM 5 C CB . ARG 302 302 ? A -28.810 -27.214 -55.477 1 1 E ARG 0.260 1
ATOM 6 C CG . ARG 302 302 ? A -27.739 -27.699 -54.465 1 1 E ARG 0.260 1
ATOM 7 C CD . ARG 302 302 ? A -28.374 -28.266 -53.186 1 1 E ARG 0.260 1
ATOM 8 N NE . ARG 302 302 ? A -27.273 -28.715 -52.273 1 1 E ARG 0.260 1
ATOM 9 C CZ . ARG 302 302 ? A -27.504 -29.272 -51.074 1 1 E ARG 0.260 1
ATOM 10 N NH1 . ARG 302 302 ? A -28.745 -29.444 -50.625 1 1 E ARG 0.260 1
ATOM 11 N NH2 . ARG 302 302 ? A -26.490 -29.671 -50.310 1 1 E ARG 0.260 1
ATOM 12 N N . GLN 303 303 ? A -26.195 -27.413 -57.994 1 1 E GLN 0.910 1
ATOM 13 C CA . GLN 303 303 ? A -25.444 -26.167 -57.951 1 1 E GLN 0.910 1
ATOM 14 C C . GLN 303 303 ? A -26.232 -25.041 -58.644 1 1 E GLN 0.910 1
ATOM 15 O O . GLN 303 303 ? A -26.776 -25.240 -59.724 1 1 E GLN 0.910 1
ATOM 16 C CB . GLN 303 303 ? A -24.044 -26.386 -58.571 1 1 E GLN 0.910 1
ATOM 17 C CG . GLN 303 303 ? A -23.033 -25.286 -58.198 1 1 E GLN 0.910 1
ATOM 18 C CD . GLN 303 303 ? A -21.677 -25.550 -58.856 1 1 E GLN 0.910 1
ATOM 19 O OE1 . GLN 303 303 ? A -21.183 -26.677 -58.890 1 1 E GLN 0.910 1
ATOM 20 N NE2 . GLN 303 303 ? A -21.046 -24.485 -59.390 1 1 E GLN 0.910 1
ATOM 21 N N . GLY 304 304 ? A -26.458 -23.877 -57.978 1 1 E GLY 0.540 1
ATOM 22 C CA . GLY 304 304 ? A -27.351 -22.832 -58.519 1 1 E GLY 0.540 1
ATOM 23 C C . GLY 304 304 ? A -26.788 -22.110 -59.714 1 1 E GLY 0.540 1
ATOM 24 O O . GLY 304 304 ? A -27.475 -21.886 -60.702 1 1 E GLY 0.540 1
ATOM 25 N N . SER 305 305 ? A -25.495 -21.772 -59.649 1 1 E SER 0.610 1
ATOM 26 C CA . SER 305 305 ? A -24.755 -21.173 -60.741 1 1 E SER 0.610 1
ATOM 27 C C . SER 305 305 ? A -23.321 -21.648 -60.605 1 1 E SER 0.610 1
ATOM 28 O O . SER 305 305 ? A -22.983 -22.328 -59.641 1 1 E SER 0.610 1
ATOM 29 C CB . SER 305 305 ? A -24.813 -19.612 -60.788 1 1 E SER 0.610 1
ATOM 30 O OG . SER 305 305 ? A -24.115 -18.973 -59.714 1 1 E SER 0.610 1
ATOM 31 N N . PHE 306 306 ? A -22.420 -21.295 -61.548 1 1 E PHE 0.590 1
ATOM 32 C CA . PHE 306 306 ? A -20.989 -21.614 -61.511 1 1 E PHE 0.590 1
ATOM 33 C C . PHE 306 306 ? A -20.233 -21.056 -60.288 1 1 E PHE 0.590 1
ATOM 34 O O . PHE 306 306 ? A -19.064 -21.359 -60.057 1 1 E PHE 0.590 1
ATOM 35 C CB . PHE 306 306 ? A -20.277 -21.135 -62.820 1 1 E PHE 0.590 1
ATOM 36 C CG . PHE 306 306 ? A -20.245 -19.627 -62.945 1 1 E PHE 0.590 1
ATOM 37 C CD1 . PHE 306 306 ? A -21.247 -18.929 -63.641 1 1 E PHE 0.590 1
ATOM 38 C CD2 . PHE 306 306 ? A -19.217 -18.890 -62.328 1 1 E PHE 0.590 1
ATOM 39 C CE1 . PHE 306 306 ? A -21.231 -17.529 -63.699 1 1 E PHE 0.590 1
ATOM 40 C CE2 . PHE 306 306 ? A -19.215 -17.492 -62.365 1 1 E PHE 0.590 1
ATOM 41 C CZ . PHE 306 306 ? A -20.218 -16.810 -63.058 1 1 E PHE 0.590 1
ATOM 42 N N . ARG 307 307 ? A -20.880 -20.193 -59.481 1 1 E ARG 0.490 1
ATOM 43 C CA . ARG 307 307 ? A -20.313 -19.591 -58.291 1 1 E ARG 0.490 1
ATOM 44 C C . ARG 307 307 ? A -19.838 -20.615 -57.263 1 1 E ARG 0.490 1
ATOM 45 O O . ARG 307 307 ? A -20.610 -21.440 -56.782 1 1 E ARG 0.490 1
ATOM 46 C CB . ARG 307 307 ? A -21.346 -18.647 -57.624 1 1 E ARG 0.490 1
ATOM 47 C CG . ARG 307 307 ? A -20.773 -17.804 -56.464 1 1 E ARG 0.490 1
ATOM 48 C CD . ARG 307 307 ? A -21.796 -16.933 -55.722 1 1 E ARG 0.490 1
ATOM 49 N NE . ARG 307 307 ? A -22.317 -15.901 -56.681 1 1 E ARG 0.490 1
ATOM 50 C CZ . ARG 307 307 ? A -21.717 -14.734 -56.968 1 1 E ARG 0.490 1
ATOM 51 N NH1 . ARG 307 307 ? A -20.574 -14.369 -56.396 1 1 E ARG 0.490 1
ATOM 52 N NH2 . ARG 307 307 ? A -22.270 -13.912 -57.859 1 1 E ARG 0.490 1
ATOM 53 N N . GLY 308 308 ? A -18.538 -20.568 -56.894 1 1 E GLY 0.620 1
ATOM 54 C CA . GLY 308 308 ? A -17.934 -21.556 -56.005 1 1 E GLY 0.620 1
ATOM 55 C C . GLY 308 308 ? A -17.427 -22.802 -56.698 1 1 E GLY 0.620 1
ATOM 56 O O . GLY 308 308 ? A -16.925 -23.702 -56.038 1 1 E GLY 0.620 1
ATOM 57 N N . PHE 309 309 ? A -17.510 -22.885 -58.046 1 1 E PHE 0.560 1
ATOM 58 C CA . PHE 309 309 ? A -16.835 -23.927 -58.822 1 1 E PHE 0.560 1
ATOM 59 C C . PHE 309 309 ? A -15.287 -23.961 -58.811 1 1 E PHE 0.560 1
ATOM 60 O O . PHE 309 309 ? A -14.756 -25.031 -58.504 1 1 E PHE 0.560 1
ATOM 61 C CB . PHE 309 309 ? A -17.365 -23.907 -60.287 1 1 E PHE 0.560 1
ATOM 62 C CG . PHE 309 309 ? A -16.914 -25.087 -61.103 1 1 E PHE 0.560 1
ATOM 63 C CD1 . PHE 309 309 ? A -15.824 -24.985 -61.984 1 1 E PHE 0.560 1
ATOM 64 C CD2 . PHE 309 309 ? A -17.569 -26.321 -60.973 1 1 E PHE 0.560 1
ATOM 65 C CE1 . PHE 309 309 ? A -15.404 -26.095 -62.728 1 1 E PHE 0.560 1
ATOM 66 C CE2 . PHE 309 309 ? A -17.155 -27.430 -61.721 1 1 E PHE 0.560 1
ATOM 67 C CZ . PHE 309 309 ? A -16.076 -27.316 -62.604 1 1 E PHE 0.560 1
ATOM 68 N N . PRO 310 310 ? A -14.472 -22.934 -59.118 1 1 E PRO 0.520 1
ATOM 69 C CA . PRO 310 310 ? A -13.034 -22.994 -58.882 1 1 E PRO 0.520 1
ATOM 70 C C . PRO 310 310 ? A -12.684 -23.185 -57.408 1 1 E PRO 0.520 1
ATOM 71 O O . PRO 310 310 ? A -13.037 -22.355 -56.570 1 1 E PRO 0.520 1
ATOM 72 C CB . PRO 310 310 ? A -12.483 -21.707 -59.518 1 1 E PRO 0.520 1
ATOM 73 C CG . PRO 310 310 ? A -13.640 -20.708 -59.437 1 1 E PRO 0.520 1
ATOM 74 C CD . PRO 310 310 ? A -14.908 -21.574 -59.426 1 1 E PRO 0.520 1
ATOM 75 N N . ALA 311 311 ? A -11.939 -24.258 -57.081 1 1 E ALA 0.690 1
ATOM 76 C CA . ALA 311 311 ? A -11.604 -24.605 -55.731 1 1 E ALA 0.690 1
ATOM 77 C C . ALA 311 311 ? A -10.096 -24.574 -55.625 1 1 E ALA 0.690 1
ATOM 78 O O . ALA 311 311 ? A -9.374 -25.362 -56.234 1 1 E ALA 0.690 1
ATOM 79 C CB . ALA 311 311 ? A -12.154 -26.006 -55.399 1 1 E ALA 0.690 1
ATOM 80 N N . LEU 312 312 ? A -9.580 -23.611 -54.850 1 1 E LEU 0.630 1
ATOM 81 C CA . LEU 312 312 ? A -8.164 -23.433 -54.646 1 1 E LEU 0.630 1
ATOM 82 C C . LEU 312 312 ? A -7.632 -24.372 -53.583 1 1 E LEU 0.630 1
ATOM 83 O O . LEU 312 312 ? A -8.348 -25.162 -52.969 1 1 E LEU 0.630 1
ATOM 84 C CB . LEU 312 312 ? A -7.840 -21.970 -54.253 1 1 E LEU 0.630 1
ATOM 85 C CG . LEU 312 312 ? A -8.124 -20.919 -55.346 1 1 E LEU 0.630 1
ATOM 86 C CD1 . LEU 312 312 ? A -7.752 -19.520 -54.826 1 1 E LEU 0.630 1
ATOM 87 C CD2 . LEU 312 312 ? A -7.385 -21.223 -56.659 1 1 E LEU 0.630 1
ATOM 88 N N . SER 313 313 ? A -6.319 -24.284 -53.280 1 1 E SER 0.690 1
ATOM 89 C CA . SER 313 313 ? A -5.762 -24.876 -52.056 1 1 E SER 0.690 1
ATOM 90 C C . SER 313 313 ? A -6.176 -24.104 -50.792 1 1 E SER 0.690 1
ATOM 91 O O . SER 313 313 ? A -5.403 -23.606 -49.984 1 1 E SER 0.690 1
ATOM 92 C CB . SER 313 313 ? A -4.242 -25.119 -52.153 1 1 E SER 0.690 1
ATOM 93 O OG . SER 313 313 ? A -3.813 -26.090 -51.192 1 1 E SER 0.690 1
ATOM 94 N N . GLN 314 314 ? A -7.512 -24.031 -50.641 1 1 E GLN 0.700 1
ATOM 95 C CA . GLN 314 314 ? A -8.339 -23.612 -49.536 1 1 E GLN 0.700 1
ATOM 96 C C . GLN 314 314 ? A -9.170 -24.831 -49.143 1 1 E GLN 0.700 1
ATOM 97 O O . GLN 314 314 ? A -9.860 -24.876 -48.127 1 1 E GLN 0.700 1
ATOM 98 C CB . GLN 314 314 ? A -9.231 -22.464 -50.058 1 1 E GLN 0.700 1
ATOM 99 C CG . GLN 314 314 ? A -8.436 -21.250 -50.598 1 1 E GLN 0.700 1
ATOM 100 C CD . GLN 314 314 ? A -7.697 -20.493 -49.501 1 1 E GLN 0.700 1
ATOM 101 O OE1 . GLN 314 314 ? A -8.243 -19.590 -48.869 1 1 E GLN 0.700 1
ATOM 102 N NE2 . GLN 314 314 ? A -6.414 -20.846 -49.265 1 1 E GLN 0.700 1
ATOM 103 N N . LYS 315 315 ? A -9.020 -25.898 -49.958 1 1 E LYS 0.730 1
ATOM 104 C CA . LYS 315 315 ? A -9.483 -27.249 -49.751 1 1 E LYS 0.730 1
ATOM 105 C C . LYS 315 315 ? A -8.686 -27.927 -48.651 1 1 E LYS 0.730 1
ATOM 106 O O . LYS 315 315 ? A -9.218 -28.566 -47.751 1 1 E LYS 0.730 1
ATOM 107 C CB . LYS 315 315 ? A -9.287 -28.007 -51.078 1 1 E LYS 0.730 1
ATOM 108 C CG . LYS 315 315 ? A -9.902 -29.410 -51.087 1 1 E LYS 0.730 1
ATOM 109 C CD . LYS 315 315 ? A -9.766 -30.097 -52.455 1 1 E LYS 0.730 1
ATOM 110 C CE . LYS 315 315 ? A -10.419 -31.481 -52.473 1 1 E LYS 0.730 1
ATOM 111 N NZ . LYS 315 315 ? A -10.276 -32.095 -53.811 1 1 E LYS 0.730 1
ATOM 112 N N . ASN 316 316 ? A -7.355 -27.700 -48.671 1 1 E ASN 0.740 1
ATOM 113 C CA . ASN 316 316 ? A -6.395 -28.104 -47.651 1 1 E ASN 0.740 1
ATOM 114 C C . ASN 316 316 ? A -6.347 -27.050 -46.545 1 1 E ASN 0.740 1
ATOM 115 O O . ASN 316 316 ? A -5.306 -26.697 -45.989 1 1 E ASN 0.740 1
ATOM 116 C CB . ASN 316 316 ? A -4.997 -28.382 -48.258 1 1 E ASN 0.740 1
ATOM 117 C CG . ASN 316 316 ? A -5.167 -29.498 -49.277 1 1 E ASN 0.740 1
ATOM 118 O OD1 . ASN 316 316 ? A -5.539 -30.618 -48.926 1 1 E ASN 0.740 1
ATOM 119 N ND2 . ASN 316 316 ? A -4.932 -29.207 -50.576 1 1 E ASN 0.740 1
ATOM 120 N N . SER 317 317 ? A -7.525 -26.483 -46.218 1 1 E SER 0.740 1
ATOM 121 C CA . SER 317 317 ? A -7.710 -25.531 -45.126 1 1 E SER 0.740 1
ATOM 122 C C . SER 317 317 ? A -8.356 -26.118 -43.868 1 1 E SER 0.740 1
ATOM 123 O O . SER 317 317 ? A -7.797 -25.891 -42.793 1 1 E SER 0.740 1
ATOM 124 C CB . SER 317 317 ? A -8.323 -24.155 -45.547 1 1 E SER 0.740 1
ATOM 125 O OG . SER 317 317 ? A -7.936 -23.101 -44.651 1 1 E SER 0.740 1
ATOM 126 N N . PRO 318 318 ? A -9.424 -26.924 -43.884 1 1 E PRO 0.730 1
ATOM 127 C CA . PRO 318 318 ? A -10.050 -27.450 -42.665 1 1 E PRO 0.730 1
ATOM 128 C C . PRO 318 318 ? A -9.230 -28.551 -41.984 1 1 E PRO 0.730 1
ATOM 129 O O . PRO 318 318 ? A -9.596 -28.982 -40.895 1 1 E PRO 0.730 1
ATOM 130 C CB . PRO 318 318 ? A -11.453 -27.899 -43.144 1 1 E PRO 0.730 1
ATOM 131 C CG . PRO 318 318 ? A -11.687 -27.090 -44.424 1 1 E PRO 0.730 1
ATOM 132 C CD . PRO 318 318 ? A -10.302 -27.122 -45.039 1 1 E PRO 0.730 1
ATOM 133 N N . PHE 319 319 ? A -8.115 -28.999 -42.606 1 1 E PHE 0.700 1
ATOM 134 C CA . PHE 319 319 ? A -7.182 -30.006 -42.100 1 1 E PHE 0.700 1
ATOM 135 C C . PHE 319 319 ? A -6.092 -29.391 -41.231 1 1 E PHE 0.700 1
ATOM 136 O O . PHE 319 319 ? A -5.289 -30.085 -40.608 1 1 E PHE 0.700 1
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ATOM 140 C CD2 . PHE 319 319 ? A -7.930 -30.835 -45.307 1 1 E PHE 0.700 1
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ATOM 144 N N . LYS 320 320 ? A -6.032 -28.046 -41.182 1 1 E LYS 0.720 1
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ATOM 155 C C . ARG 321 321 ? A -3.709 -26.595 -36.161 1 1 E ARG 0.610 1
ATOM 156 O O . ARG 321 321 ? A -2.761 -25.847 -36.382 1 1 E ARG 0.610 1
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ATOM 161 C CZ . ARG 321 321 ? A -0.311 -31.124 -32.784 1 1 E ARG 0.610 1
ATOM 162 N NH1 . ARG 321 321 ? A 0.656 -31.661 -33.523 1 1 E ARG 0.610 1
ATOM 163 N NH2 . ARG 321 321 ? A -0.302 -31.324 -31.469 1 1 E ARG 0.610 1
ATOM 164 N N . GLN 322 322 ? A -4.661 -26.284 -35.272 1 1 E GLN 0.620 1
ATOM 165 C CA . GLN 322 322 ? A -4.616 -25.103 -34.449 1 1 E GLN 0.620 1
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ATOM 171 O OE1 . GLN 322 322 ? A -8.098 -22.588 -34.502 1 1 E GLN 0.620 1
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ATOM 173 N N . LEU 323 323 ? A -3.115 -24.951 -32.526 1 1 E LEU 0.500 1
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ATOM 181 N N . SER 324 324 ? A -3.960 -23.483 -30.231 1 1 E SER 0.470 1
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ATOM 185 C CB . SER 324 324 ? A -4.541 -21.226 -29.390 1 1 E SER 0.470 1
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ATOM 187 N N . LEU 325 325 ? A -6.837 -22.706 -28.059 1 1 E LEU 0.490 1
ATOM 188 C CA . LEU 325 325 ? A -8.259 -22.919 -27.867 1 1 E LEU 0.490 1
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ATOM 190 O O . LEU 325 325 ? A -8.903 -21.337 -29.592 1 1 E LEU 0.490 1
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ATOM 193 C CD1 . LEU 325 325 ? A -10.150 -24.216 -25.631 1 1 E LEU 0.490 1
ATOM 194 C CD2 . LEU 325 325 ? A -10.539 -21.842 -24.847 1 1 E LEU 0.490 1
ATOM 195 N N . ARG 326 326 ? A -10.210 -23.150 -29.338 1 1 E ARG 1.000 1
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ATOM 204 N NH1 . ARG 326 326 ? A -10.541 -27.705 -34.943 1 1 E ARG 1.000 1
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ATOM 206 N N . LEU 327 327 ? A -13.480 -21.903 -30.324 1 1 E LEU 0.300 1
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ATOM 211 C CG . LEU 327 327 ? A -14.038 -19.270 -28.819 1 1 E LEU 0.300 1
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ATOM 213 C CD2 . LEU 327 327 ? A -14.253 -19.675 -27.354 1 1 E LEU 0.300 1
ATOM 214 O OXT . LEU 327 327 ? A -17.040 -22.097 -30.478 1 1 E LEU 0.300 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
loop_
_ma_qa_metric_global.ordinal_id
_ma_qa_metric_global.model_id
_ma_qa_metric_global.metric_id
_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.622
2 1 3 0
#
#
loop_
_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
_ma_qa_metric_local.label_seq_id
_ma_qa_metric_local.label_comp_id
_ma_qa_metric_local.metric_id
_ma_qa_metric_local.metric_value
1 1 A 302 ARG 1 0.260
2 1 A 303 GLN 1 0.910
3 1 A 304 GLY 1 0.540
4 1 A 305 SER 1 0.610
5 1 A 306 PHE 1 0.590
6 1 A 307 ARG 1 0.490
7 1 A 308 GLY 1 0.620
8 1 A 309 PHE 1 0.560
9 1 A 310 PRO 1 0.520
10 1 A 311 ALA 1 0.690
11 1 A 312 LEU 1 0.630
12 1 A 313 SER 1 0.690
13 1 A 314 GLN 1 0.700
14 1 A 315 LYS 1 0.730
15 1 A 316 ASN 1 0.740
16 1 A 317 SER 1 0.740
17 1 A 318 PRO 1 0.730
18 1 A 319 PHE 1 0.700
19 1 A 320 LYS 1 0.720
20 1 A 321 ARG 1 0.610
21 1 A 322 GLN 1 0.620
22 1 A 323 LEU 1 0.500
23 1 A 324 SER 1 0.470
24 1 A 325 LEU 1 0.490
25 1 A 326 ARG 1 1.000
26 1 A 327 LEU 1 0.300
#
#
loop_
_pdbx_data_usage.id
_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor
endorses you or your use. When you publish, patent or distribute
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the corresponding papers mentioned under JRNL.
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you must distribute your contributions under the same license as the
original.
No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the
CC BY-SA 4.0 license at this link:
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
;
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode
2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer
#