data_SMR-7c86bc27aec924b590def9982b980fc9_2
_entry.id SMR-7c86bc27aec924b590def9982b980fc9_2
_struct.entry_id SMR-7c86bc27aec924b590def9982b980fc9_2
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q53TQ3/ IN80D_HUMAN, INO80 complex subunit D

Estimated model accuracy of this model is 0.005, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q53TQ3'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
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_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
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_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service'
3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
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_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
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_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 131842.036 1 .
#
#
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_struct_ref.entity_id
_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP IN80D_HUMAN Q53TQ3 1
;MYEGKHIHFSEVDNKPLCSYSPKLCKQRRLNGYAFCIRHVLEDKTAPFKQCEYVAKYNSQRCTNPIPKSE
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;
'INO80 complex subunit D'
#
#
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_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1027 1 1027
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
_ma_target_ref_db_details.db_accession
_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . IN80D_HUMAN Q53TQ3 . 1 1027 9606 'Homo sapiens (Human)' 2019-07-31
FC5E886AF361295D
#
#
loop_
_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no B
;MYEGKHIHFSEVDNKPLCSYSPKLCKQRRLNGYAFCIRHVLEDKTAPFKQCEYVAKYNSQRCTNPIPKSE
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;

;MYEGKHIHFSEVDNKPLCSYSPKLCKQRRLNGYAFCIRHVLEDKTAPFKQCEYVAKYNSQRCTNPIPKSE
DRRYCNSHLQVLGFIPKKERKKKNDPIDEVKVRHQMDTMAFSLTVPTLALKMPNGLDGMSLSPPGARVPL
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;

#
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loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 TYR .
1 3 GLU .
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1 5 LYS .
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1 7 ILE .
1 8 HIS .
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1 13 ASP .
1 14 ASN .
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1 17 LEU .
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1 24 LEU .
1 25 CYS .
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1 29 ARG .
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1 158 ASP .
1 159 ASP .
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1 162 LYS .
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1 197 PRO .
1 198 PRO .
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A 1 1 MET 1 ? ? ? B .
A 1 2 TYR 2 ? ? ? B .
A 1 3 GLU 3 ? ? ? B .
A 1 4 GLY 4 ? ? ? B .
A 1 5 LYS 5 ? ? ? B .
A 1 6 HIS 6 ? ? ? B .
A 1 7 ILE 7 ? ? ? B .
A 1 8 HIS 8 ? ? ? B .
A 1 9 PHE 9 ? ? ? B .
A 1 10 SER 10 ? ? ? B .
A 1 11 GLU 11 ? ? ? B .
A 1 12 VAL 12 ? ? ? B .
A 1 13 ASP 13 ? ? ? B .
A 1 14 ASN 14 ? ? ? B .
A 1 15 LYS 15 ? ? ? B .
A 1 16 PRO 16 ? ? ? B .
A 1 17 LEU 17 ? ? ? B .
A 1 18 CYS 18 ? ? ? B .
A 1 19 SER 19 ? ? ? B .
A 1 20 TYR 20 ? ? ? B .
A 1 21 SER 21 ? ? ? B .
A 1 22 PRO 22 ? ? ? B .
A 1 23 LYS 23 ? ? ? B .
A 1 24 LEU 24 ? ? ? B .
A 1 25 CYS 25 ? ? ? B .
A 1 26 LYS 26 ? ? ? B .
A 1 27 GLN 27 ? ? ? B .
A 1 28 ARG 28 ? ? ? B .
A 1 29 ARG 29 ? ? ? B .
A 1 30 LEU 30 ? ? ? B .
A 1 31 ASN 31 ? ? ? B .
A 1 32 GLY 32 ? ? ? B .
A 1 33 TYR 33 ? ? ? B .
A 1 34 ALA 34 ? ? ? B .
A 1 35 PHE 35 ? ? ? B .
A 1 36 CYS 36 ? ? ? B .
A 1 37 ILE 37 ? ? ? B .
A 1 38 ARG 38 ? ? ? B .
A 1 39 HIS 39 ? ? ? B .
A 1 40 VAL 40 ? ? ? B .
A 1 41 LEU 41 ? ? ? B .
A 1 42 GLU 42 ? ? ? B .
A 1 43 ASP 43 ? ? ? B .
A 1 44 LYS 44 ? ? ? B .
A 1 45 THR 45 ? ? ? B .
A 1 46 ALA 46 ? ? ? B .
A 1 47 PRO 47 ? ? ? B .
A 1 48 PHE 48 ? ? ? B .
A 1 49 LYS 49 ? ? ? B .
A 1 50 GLN 50 ? ? ? B .
A 1 51 CYS 51 ? ? ? B .
A 1 52 GLU 52 ? ? ? B .
A 1 53 TYR 53 ? ? ? B .
A 1 54 VAL 54 ? ? ? B .
A 1 55 ALA 55 ? ? ? B .
A 1 56 LYS 56 ? ? ? B .
A 1 57 TYR 57 ? ? ? B .
A 1 58 ASN 58 ? ? ? B .
A 1 59 SER 59 ? ? ? B .
A 1 60 GLN 60 ? ? ? B .
A 1 61 ARG 61 ? ? ? B .
A 1 62 CYS 62 ? ? ? B .
A 1 63 THR 63 ? ? ? B .
A 1 64 ASN 64 ? ? ? B .
A 1 65 PRO 65 ? ? ? B .
A 1 66 ILE 66 ? ? ? B .
A 1 67 PRO 67 ? ? ? B .
A 1 68 LYS 68 ? ? ? B .
A 1 69 SER 69 ? ? ? B .
A 1 70 GLU 70 ? ? ? B .
A 1 71 ASP 71 ? ? ? B .
A 1 72 ARG 72 ? ? ? B .
A 1 73 ARG 73 ? ? ? B .
A 1 74 TYR 74 ? ? ? B .
A 1 75 CYS 75 ? ? ? B .
A 1 76 ASN 76 ? ? ? B .
A 1 77 SER 77 ? ? ? B .
A 1 78 HIS 78 ? ? ? B .
A 1 79 LEU 79 ? ? ? B .
A 1 80 GLN 80 ? ? ? B .
A 1 81 VAL 81 ? ? ? B .
A 1 82 LEU 82 ? ? ? B .
A 1 83 GLY 83 ? ? ? B .
A 1 84 PHE 84 ? ? ? B .
A 1 85 ILE 85 ? ? ? B .
A 1 86 PRO 86 ? ? ? B .
A 1 87 LYS 87 ? ? ? B .
A 1 88 LYS 88 ? ? ? B .
A 1 89 GLU 89 ? ? ? B .
A 1 90 ARG 90 ? ? ? B .
A 1 91 LYS 91 ? ? ? B .
A 1 92 LYS 92 ? ? ? B .
A 1 93 LYS 93 ? ? ? B .
A 1 94 ASN 94 ? ? ? B .
A 1 95 ASP 95 ? ? ? B .
A 1 96 PRO 96 ? ? ? B .
A 1 97 ILE 97 ? ? ? B .
A 1 98 ASP 98 ? ? ? B .
A 1 99 GLU 99 ? ? ? B .
A 1 100 VAL 100 ? ? ? B .
A 1 101 LYS 101 ? ? ? B .
A 1 102 VAL 102 ? ? ? B .
A 1 103 ARG 103 ? ? ? B .
A 1 104 HIS 104 ? ? ? B .
A 1 105 GLN 105 ? ? ? B .
A 1 106 MET 106 ? ? ? B .
A 1 107 ASP 107 ? ? ? B .
A 1 108 THR 108 ? ? ? B .
A 1 109 MET 109 ? ? ? B .
A 1 110 ALA 110 ? ? ? B .
A 1 111 PHE 111 ? ? ? B .
A 1 112 SER 112 ? ? ? B .
A 1 113 LEU 113 ? ? ? B .
A 1 114 THR 114 ? ? ? B .
A 1 115 VAL 115 ? ? ? B .
A 1 116 PRO 116 ? ? ? B .
A 1 117 THR 117 ? ? ? B .
A 1 118 LEU 118 ? ? ? B .
A 1 119 ALA 119 ? ? ? B .
A 1 120 LEU 120 ? ? ? B .
A 1 121 LYS 121 ? ? ? B .
A 1 122 MET 122 ? ? ? B .
A 1 123 PRO 123 ? ? ? B .
A 1 124 ASN 124 ? ? ? B .
A 1 125 GLY 125 ? ? ? B .
A 1 126 LEU 126 ? ? ? B .
A 1 127 ASP 127 ? ? ? B .
A 1 128 GLY 128 ? ? ? B .
A 1 129 MET 129 ? ? ? B .
A 1 130 SER 130 ? ? ? B .
A 1 131 LEU 131 ? ? ? B .
A 1 132 SER 132 ? ? ? B .
A 1 133 PRO 133 ? ? ? B .
A 1 134 PRO 134 ? ? ? B .
A 1 135 GLY 135 ? ? ? B .
A 1 136 ALA 136 ? ? ? B .
A 1 137 ARG 137 ? ? ? B .
A 1 138 VAL 138 ? ? ? B .
A 1 139 PRO 139 ? ? ? B .
A 1 140 LEU 140 ? ? ? B .
A 1 141 HIS 141 ? ? ? B .
A 1 142 TYR 142 ? ? ? B .
A 1 143 LEU 143 ? ? ? B .
A 1 144 GLU 144 ? ? ? B .
A 1 145 THR 145 ? ? ? B .
A 1 146 GLU 146 ? ? ? B .
A 1 147 LEU 147 ? ? ? B .
A 1 148 GLU 148 ? ? ? B .
A 1 149 ASP 149 ? ? ? B .
A 1 150 PRO 150 ? ? ? B .
A 1 151 PHE 151 ? ? ? B .
A 1 152 ALA 152 ? ? ? B .
A 1 153 PHE 153 ? ? ? B .
A 1 154 ASN 154 ? ? ? B .
A 1 155 GLU 155 ? ? ? B .
A 1 156 GLU 156 ? ? ? B .
A 1 157 ASP 157 ? ? ? B .
A 1 158 ASP 158 ? ? ? B .
A 1 159 ASP 159 ? ? ? B .
A 1 160 LEU 160 ? ? ? B .
A 1 161 LYS 161 ? ? ? B .
A 1 162 LYS 162 ? ? ? B .
A 1 163 GLY 163 ? ? ? B .
A 1 164 ALA 164 ? ? ? B .
A 1 165 THR 165 ? ? ? B .
A 1 166 VAL 166 ? ? ? B .
A 1 167 ARG 167 ? ? ? B .
A 1 168 LYS 168 ? ? ? B .
A 1 169 LYS 169 ? ? ? B .
A 1 170 LEU 170 ? ? ? B .
A 1 171 GLN 171 ? ? ? B .
A 1 172 SER 172 ? ? ? B .
A 1 173 LYS 173 ? ? ? B .
A 1 174 LEU 174 ? ? ? B .
A 1 175 ALA 175 ? ? ? B .
A 1 176 GLN 176 ? ? ? B .
A 1 177 ASN 177 ? ? ? B .
A 1 178 ARG 178 ? ? ? B .
A 1 179 GLN 179 ? ? ? B .
A 1 180 ARG 180 ? ? ? B .
A 1 181 GLN 181 ? ? ? B .
A 1 182 ARG 182 ? ? ? B .
A 1 183 GLU 183 ? ? ? B .
A 1 184 THR 184 ? ? ? B .
A 1 185 GLU 185 ? ? ? B .
A 1 186 ILE 186 ? ? ? B .
A 1 187 LEU 187 ? ? ? B .
A 1 188 LYS 188 ? ? ? B .
A 1 189 VAL 189 ? ? ? B .
A 1 190 ARG 190 ? ? ? B .
A 1 191 GLN 191 ? ? ? B .
A 1 192 GLU 192 ? ? ? B .
A 1 193 HIS 193 ? ? ? B .
A 1 194 PHE 194 ? ? ? B .
A 1 195 SER 195 ? ? ? B .
A 1 196 PRO 196 ? ? ? B .
A 1 197 PRO 197 ? ? ? B .
A 1 198 PRO 198 ? ? ? B .
A 1 199 ALA 199 ? ? ? B .
A 1 200 PRO 200 ? ? ? B .
A 1 201 SER 201 ? ? ? B .
A 1 202 GLN 202 ? ? ? B .
A 1 203 GLN 203 ? ? ? B .
A 1 204 GLN 204 ? ? ? B .
A 1 205 PRO 205 ? ? ? B .
A 1 206 PRO 206 ? ? ? B .
A 1 207 GLN 207 ? ? ? B .
A 1 208 GLN 208 ? ? ? B .
A 1 209 HIS 209 ? ? ? B .
A 1 210 SER 210 ? ? ? B .
A 1 211 HIS 211 ? ? ? B .
A 1 212 LEU 212 ? ? ? B .
A 1 213 SER 213 ? ? ? B .
A 1 214 PRO 214 ? ? ? B .
A 1 215 LEU 215 ? ? ? B .
A 1 216 SER 216 ? ? ? B .
A 1 217 THR 217 ? ? ? B .
A 1 218 SER 218 ? ? ? B .
A 1 219 LEU 219 ? ? ? B .
A 1 220 LYS 220 ? ? ? B .
A 1 221 PRO 221 ? ? ? B .
A 1 222 PRO 222 ? ? ? B .
A 1 223 ALA 223 ? ? ? B .
A 1 224 PRO 224 ? ? ? B .
A 1 225 PRO 225 ? ? ? B .
A 1 226 GLN 226 ? ? ? B .
A 1 227 GLY 227 ? ? ? B .
A 1 228 SER 228 ? ? ? B .
A 1 229 VAL 229 ? ? ? B .
A 1 230 CYS 230 ? ? ? B .
A 1 231 LYS 231 ? ? ? B .
A 1 232 SER 232 ? ? ? B .
A 1 233 PRO 233 ? ? ? B .
A 1 234 GLN 234 ? ? ? B .
A 1 235 PRO 235 ? ? ? B .
A 1 236 GLN 236 ? ? ? B .
A 1 237 ASN 237 ? ? ? B .
A 1 238 THR 238 ? ? ? B .
A 1 239 SER 239 ? ? ? B .
A 1 240 LEU 240 ? ? ? B .
A 1 241 PRO 241 ? ? ? B .
A 1 242 MET 242 ? ? ? B .
A 1 243 GLN 243 ? ? ? B .
A 1 244 GLY 244 ? ? ? B .
A 1 245 VAL 245 ? ? ? B .
A 1 246 ALA 246 ? ? ? B .
A 1 247 PRO 247 ? ? ? B .
A 1 248 THR 248 ? ? ? B .
A 1 249 THR 249 ? ? ? B .
A 1 250 HIS 250 ? ? ? B .
A 1 251 THR 251 ? ? ? B .
A 1 252 ILE 252 ? ? ? B .
A 1 253 ALA 253 ? ? ? B .
A 1 254 GLN 254 ? ? ? B .
A 1 255 ALA 255 ? ? ? B .
A 1 256 ARG 256 ? ? ? B .
A 1 257 GLN 257 ? ? ? B .
A 1 258 LEU 258 ? ? ? B .
A 1 259 SER 259 ? ? ? B .
A 1 260 HIS 260 ? ? ? B .
A 1 261 LYS 261 ? ? ? B .
A 1 262 ARG 262 ? ? ? B .
A 1 263 PRO 263 ? ? ? B .
A 1 264 LEU 264 ? ? ? B .
A 1 265 PRO 265 ? ? ? B .
A 1 266 LEU 266 ? ? ? B .
A 1 267 LEU 267 ? ? ? B .
A 1 268 PRO 268 ? ? ? B .
A 1 269 SER 269 ? ? ? B .
A 1 270 SER 270 ? ? ? B .
A 1 271 ARG 271 ? ? ? B .
A 1 272 ALA 272 ? ? ? B .
A 1 273 PRO 273 ? ? ? B .
A 1 274 THR 274 ? ? ? B .
A 1 275 VAL 275 ? ? ? B .
A 1 276 ASP 276 ? ? ? B .
A 1 277 PRO 277 ? ? ? B .
A 1 278 PRO 278 ? ? ? B .
A 1 279 ARG 279 ? ? ? B .
A 1 280 THR 280 ? ? ? B .
A 1 281 ASP 281 ? ? ? B .
A 1 282 ARG 282 ? ? ? B .
A 1 283 ILE 283 ? ? ? B .
A 1 284 LEU 284 ? ? ? B .
A 1 285 MET 285 ? ? ? B .
A 1 286 LYS 286 ? ? ? B .
A 1 287 ALA 287 ? ? ? B .
A 1 288 THR 288 ? ? ? B .
A 1 289 ALA 289 ? ? ? B .
A 1 290 PHE 290 ? ? ? B .
A 1 291 SER 291 ? ? ? B .
A 1 292 PRO 292 ? ? ? B .
A 1 293 HIS 293 ? ? ? B .
A 1 294 PHE 294 ? ? ? B .
A 1 295 SER 295 ? ? ? B .
A 1 296 CYS 296 ? ? ? B .
A 1 297 ILE 297 ? ? ? B .
A 1 298 SER 298 ? ? ? B .
A 1 299 ARG 299 ? ? ? B .
A 1 300 LEU 300 ? ? ? B .
A 1 301 GLN 301 ? ? ? B .
A 1 302 ARG 302 ? ? ? B .
A 1 303 LEU 303 ? ? ? B .
A 1 304 VAL 304 ? ? ? B .
A 1 305 LYS 305 ? ? ? B .
A 1 306 LEU 306 ? ? ? B .
A 1 307 CYS 307 ? ? ? B .
A 1 308 THR 308 ? ? ? B .
A 1 309 GLN 309 ? ? ? B .
A 1 310 LYS 310 ? ? ? B .
A 1 311 HIS 311 ? ? ? B .
A 1 312 GLN 312 ? ? ? B .
A 1 313 LEU 313 ? ? ? B .
A 1 314 ASP 314 ? ? ? B .
A 1 315 THR 315 ? ? ? B .
A 1 316 ASP 316 ? ? ? B .
A 1 317 LEU 317 ? ? ? B .
A 1 318 PHE 318 ? ? ? B .
A 1 319 PRO 319 ? ? ? B .
A 1 320 HIS 320 ? ? ? B .
A 1 321 LEU 321 ? ? ? B .
A 1 322 GLY 322 ? ? ? B .
A 1 323 LEU 323 ? ? ? B .
A 1 324 ASP 324 ? ? ? B .
A 1 325 TRP 325 ? ? ? B .
A 1 326 SER 326 ? ? ? B .
A 1 327 GLU 327 ? ? ? B .
A 1 328 GLU 328 ? ? ? B .
A 1 329 SER 329 ? ? ? B .
A 1 330 GLY 330 ? ? ? B .
A 1 331 GLU 331 ? ? ? B .
A 1 332 GLU 332 ? ? ? B .
A 1 333 PRO 333 ? ? ? B .
A 1 334 GLU 334 ? ? ? B .
A 1 335 ASP 335 ? ? ? B .
A 1 336 SER 336 ? ? ? B .
A 1 337 GLU 337 ? ? ? B .
A 1 338 GLN 338 ? ? ? B .
A 1 339 ALA 339 ? ? ? B .
A 1 340 SER 340 ? ? ? B .
A 1 341 PRO 341 ? ? ? B .
A 1 342 TYR 342 ? ? ? B .
A 1 343 GLN 343 ? ? ? B .
A 1 344 VAL 344 ? ? ? B .
A 1 345 ALA 345 ? ? ? B .
A 1 346 TRP 346 ? ? ? B .
A 1 347 SER 347 ? ? ? B .
A 1 348 ILE 348 ? ? ? B .
A 1 349 ARG 349 ? ? ? B .
A 1 350 GLU 350 ? ? ? B .
A 1 351 THR 351 ? ? ? B .
A 1 352 LEU 352 ? ? ? B .
A 1 353 ARG 353 ? ? ? B .
A 1 354 TYR 354 ? ? ? B .
A 1 355 GLN 355 ? ? ? B .
A 1 356 ARG 356 ? ? ? B .
A 1 357 HIS 357 ? ? ? B .
A 1 358 ALA 358 ? ? ? B .
A 1 359 SER 359 ? ? ? B .
A 1 360 ASP 360 ? ? ? B .
A 1 361 ASP 361 ? ? ? B .
A 1 362 ASP 362 ? ? ? B .
A 1 363 ASP 363 ? ? ? B .
A 1 364 ALA 364 ? ? ? B .
A 1 365 GLU 365 ? ? ? B .
A 1 366 SER 366 366 SER SER B .
A 1 367 ARG 367 367 ARG ARG B .
A 1 368 SER 368 368 SER SER B .
A 1 369 SER 369 369 SER SER B .
A 1 370 ARG 370 370 ARG ARG B .
A 1 371 VAL 371 371 VAL VAL B .
A 1 372 THR 372 372 THR THR B .
A 1 373 GLN 373 373 GLN GLN B .
A 1 374 LEU 374 374 LEU LEU B .
A 1 375 CYS 375 375 CYS CYS B .
A 1 376 THR 376 376 THR THR B .
A 1 377 TYR 377 377 TYR TYR B .
A 1 378 PHE 378 378 PHE PHE B .
A 1 379 GLN 379 379 GLN GLN B .
A 1 380 GLN 380 380 GLN GLN B .
A 1 381 LYS 381 381 LYS LYS B .
A 1 382 TYR 382 382 TYR TYR B .
A 1 383 LYS 383 383 LYS LYS B .
A 1 384 HIS 384 384 HIS HIS B .
A 1 385 LEU 385 385 LEU LEU B .
A 1 386 CYS 386 386 CYS CYS B .
A 1 387 ARG 387 387 ARG ARG B .
A 1 388 LEU 388 388 LEU LEU B .
A 1 389 GLU 389 389 GLU GLU B .
A 1 390 ARG 390 390 ARG ARG B .
A 1 391 ALA 391 391 ALA ALA B .
A 1 392 GLU 392 ? ? ? B .
A 1 393 SER 393 ? ? ? B .
A 1 394 ARG 394 ? ? ? B .
A 1 395 GLN 395 ? ? ? B .
A 1 396 LYS 396 ? ? ? B .
A 1 397 LYS 397 ? ? ? B .
A 1 398 CYS 398 ? ? ? B .
A 1 399 ARG 399 ? ? ? B .
A 1 400 HIS 400 ? ? ? B .
A 1 401 THR 401 ? ? ? B .
A 1 402 PHE 402 ? ? ? B .
A 1 403 ARG 403 ? ? ? B .
A 1 404 LYS 404 ? ? ? B .
A 1 405 ALA 405 ? ? ? B .
A 1 406 LEU 406 ? ? ? B .
A 1 407 LEU 407 ? ? ? B .
A 1 408 GLN 408 ? ? ? B .
A 1 409 ALA 409 ? ? ? B .
A 1 410 ALA 410 ? ? ? B .
A 1 411 SER 411 ? ? ? B .
A 1 412 LYS 412 ? ? ? B .
A 1 413 GLU 413 ? ? ? B .
A 1 414 PRO 414 ? ? ? B .
A 1 415 GLU 415 ? ? ? B .
A 1 416 CYS 416 ? ? ? B .
A 1 417 THR 417 ? ? ? B .
A 1 418 GLY 418 ? ? ? B .
A 1 419 GLN 419 ? ? ? B .
A 1 420 LEU 420 ? ? ? B .
A 1 421 ILE 421 ? ? ? B .
A 1 422 GLN 422 ? ? ? B .
A 1 423 GLU 423 ? ? ? B .
A 1 424 LEU 424 ? ? ? B .
A 1 425 ARG 425 ? ? ? B .
A 1 426 ARG 426 ? ? ? B .
A 1 427 ALA 427 ? ? ? B .
A 1 428 ALA 428 ? ? ? B .
A 1 429 CYS 429 ? ? ? B .
A 1 430 SER 430 ? ? ? B .
A 1 431 ARG 431 ? ? ? B .
A 1 432 THR 432 ? ? ? B .
A 1 433 SER 433 ? ? ? B .
A 1 434 ILE 434 ? ? ? B .
A 1 435 SER 435 ? ? ? B .
A 1 436 ARG 436 ? ? ? B .
A 1 437 THR 437 ? ? ? B .
A 1 438 LYS 438 ? ? ? B .
A 1 439 LEU 439 ? ? ? B .
A 1 440 ARG 440 ? ? ? B .
A 1 441 GLU 441 ? ? ? B .
A 1 442 VAL 442 ? ? ? B .
A 1 443 GLU 443 ? ? ? B .
A 1 444 PRO 444 ? ? ? B .
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A 1 446 ALA 446 ? ? ? B .
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A 1 449 GLY 449 ? ? ? B .
A 1 450 THR 450 ? ? ? B .
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A 1 453 GLY 453 ? ? ? B .
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A 1 605 ASN 605 ? ? ? B .
A 1 606 GLU 606 ? ? ? B .
A 1 607 ILE 607 ? ? ? B .
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A 1 610 ILE 610 ? ? ? B .
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A 1 689 GLY 689 ? ? ? B .
A 1 690 ILE 690 ? ? ? B .
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A 1 697 THR 697 ? ? ? B .
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A 1 779 ALA 779 ? ? ? B .
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A 1 781 PRO 781 ? ? ? B .
A 1 782 GLY 782 ? ? ? B .
A 1 783 GLN 783 ? ? ? B .
A 1 784 PHE 784 ? ? ? B .
A 1 785 HIS 785 ? ? ? B .
A 1 786 GLY 786 ? ? ? B .
A 1 787 LEU 787 ? ? ? B .
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A 1 790 GLY 790 ? ? ? B .
A 1 791 SER 791 ? ? ? B .
A 1 792 HIS 792 ? ? ? B .
A 1 793 ALA 793 ? ? ? B .
A 1 794 SER 794 ? ? ? B .
A 1 795 GLN 795 ? ? ? B .
A 1 796 ARG 796 ? ? ? B .
A 1 797 PRO 797 ? ? ? B .
A 1 798 HIS 798 ? ? ? B .
A 1 799 PRO 799 ? ? ? B .
A 1 800 ALA 800 ? ? ? B .
A 1 801 GLN 801 ? ? ? B .
A 1 802 LEU 802 ? ? ? B .
A 1 803 LEU 803 ? ? ? B .
A 1 804 SER 804 ? ? ? B .
A 1 805 LYS 805 ? ? ? B .
A 1 806 ALA 806 ? ? ? B .
A 1 807 ASP 807 ? ? ? B .
A 1 808 ASP 808 ? ? ? B .
A 1 809 LEU 809 ? ? ? B .
A 1 810 ILE 810 ? ? ? B .
A 1 811 THR 811 ? ? ? B .
A 1 812 SER 812 ? ? ? B .
A 1 813 ARG 813 ? ? ? B .
A 1 814 GLN 814 ? ? ? B .
A 1 815 GLN 815 ? ? ? B .
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A 1 821 SER 821 ? ? ? B .
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A 1 843 ILE 843 ? ? ? B .
A 1 844 THR 844 ? ? ? B .
A 1 845 SER 845 ? ? ? B .
A 1 846 PRO 846 ? ? ? B .
A 1 847 HIS 847 ? ? ? B .
A 1 848 THR 848 ? ? ? B .
A 1 849 THR 849 ? ? ? B .
A 1 850 SER 850 ? ? ? B .
A 1 851 TYR 851 ? ? ? B .
A 1 852 SER 852 ? ? ? B .
A 1 853 GLY 853 ? ? ? B .
A 1 854 ASP 854 ? ? ? B .
A 1 855 ASN 855 ? ? ? B .
A 1 856 MET 856 ? ? ? B .
A 1 857 ALA 857 ? ? ? B .
A 1 858 ALA 858 ? ? ? B .
A 1 859 THR 859 ? ? ? B .
A 1 860 PHE 860 ? ? ? B .
A 1 861 SER 861 ? ? ? B .
A 1 862 ALA 862 ? ? ? B .
A 1 863 GLU 863 ? ? ? B .
A 1 864 MET 864 ? ? ? B .
A 1 865 PRO 865 ? ? ? B .
A 1 866 ILE 866 ? ? ? B .
A 1 867 MET 867 ? ? ? B .
A 1 868 ALA 868 ? ? ? B .
A 1 869 GLN 869 ? ? ? B .
A 1 870 HIS 870 ? ? ? B .
A 1 871 LEU 871 ? ? ? B .
A 1 872 LEU 872 ? ? ? B .
A 1 873 PRO 873 ? ? ? B .
A 1 874 THR 874 ? ? ? B .
A 1 875 GLN 875 ? ? ? B .
A 1 876 LEU 876 ? ? ? B .
A 1 877 GLU 877 ? ? ? B .
A 1 878 VAL 878 ? ? ? B .
A 1 879 PRO 879 ? ? ? B .
A 1 880 LEU 880 ? ? ? B .
A 1 881 GLY 881 ? ? ? B .
A 1 882 GLY 882 ? ? ? B .
A 1 883 VAL 883 ? ? ? B .
A 1 884 VAL 884 ? ? ? B .
A 1 885 ASN 885 ? ? ? B .
A 1 886 PRO 886 ? ? ? B .
A 1 887 ARG 887 ? ? ? B .
A 1 888 THR 888 ? ? ? B .
A 1 889 HIS 889 ? ? ? B .
A 1 890 TRP 890 ? ? ? B .
A 1 891 GLY 891 ? ? ? B .
A 1 892 ASN 892 ? ? ? B .
A 1 893 LEU 893 ? ? ? B .
A 1 894 PRO 894 ? ? ? B .
A 1 895 VAL 895 ? ? ? B .
A 1 896 ASN 896 ? ? ? B .
A 1 897 LEU 897 ? ? ? B .
A 1 898 GLY 898 ? ? ? B .
A 1 899 ASP 899 ? ? ? B .
A 1 900 PRO 900 ? ? ? B .
A 1 901 SER 901 ? ? ? B .
A 1 902 PRO 902 ? ? ? B .
A 1 903 PHE 903 ? ? ? B .
A 1 904 SER 904 ? ? ? B .
A 1 905 ASN 905 ? ? ? B .
A 1 906 LEU 906 ? ? ? B .
A 1 907 LEU 907 ? ? ? B .
A 1 908 GLY 908 ? ? ? B .
A 1 909 ALA 909 ? ? ? B .
A 1 910 ASP 910 ? ? ? B .
A 1 911 GLY 911 ? ? ? B .
A 1 912 HIS 912 ? ? ? B .
A 1 913 LEU 913 ? ? ? B .
A 1 914 LEU 914 ? ? ? B .
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A 1 917 SER 917 ? ? ? B .
A 1 918 LEU 918 ? ? ? B .
A 1 919 SER 919 ? ? ? B .
A 1 920 THR 920 ? ? ? B .
A 1 921 PRO 921 ? ? ? B .
A 1 922 PRO 922 ? ? ? B .
A 1 923 THR 923 ? ? ? B .
A 1 924 THR 924 ? ? ? B .
A 1 925 SER 925 ? ? ? B .
A 1 926 ASN 926 ? ? ? B .
A 1 927 SER 927 ? ? ? B .
A 1 928 GLU 928 ? ? ? B .
A 1 929 THR 929 ? ? ? B .
A 1 930 THR 930 ? ? ? B .
A 1 931 GLN 931 ? ? ? B .
A 1 932 PRO 932 ? ? ? B .
A 1 933 ALA 933 ? ? ? B .
A 1 934 PHE 934 ? ? ? B .
A 1 935 ALA 935 ? ? ? B .
A 1 936 THR 936 ? ? ? B .
A 1 937 VAL 937 ? ? ? B .
A 1 938 THR 938 ? ? ? B .
A 1 939 PRO 939 ? ? ? B .
A 1 940 SER 940 ? ? ? B .
A 1 941 SER 941 ? ? ? B .
A 1 942 SER 942 ? ? ? B .
A 1 943 SER 943 ? ? ? B .
A 1 944 VAL 944 ? ? ? B .
A 1 945 LEU 945 ? ? ? B .
A 1 946 PRO 946 ? ? ? B .
A 1 947 GLY 947 ? ? ? B .
A 1 948 LEU 948 ? ? ? B .
A 1 949 PRO 949 ? ? ? B .
A 1 950 GLN 950 ? ? ? B .
A 1 951 THR 951 ? ? ? B .
A 1 952 SER 952 ? ? ? B .
A 1 953 PHE 953 ? ? ? B .
A 1 954 SER 954 ? ? ? B .
A 1 955 GLY 955 ? ? ? B .
A 1 956 MET 956 ? ? ? B .
A 1 957 GLY 957 ? ? ? B .
A 1 958 PRO 958 ? ? ? B .
A 1 959 SER 959 ? ? ? B .
A 1 960 ALA 960 ? ? ? B .
A 1 961 GLU 961 ? ? ? B .
A 1 962 LEU 962 ? ? ? B .
A 1 963 MET 963 ? ? ? B .
A 1 964 ALA 964 ? ? ? B .
A 1 965 SER 965 ? ? ? B .
A 1 966 THR 966 ? ? ? B .
A 1 967 SER 967 ? ? ? B .
A 1 968 PRO 968 ? ? ? B .
A 1 969 LYS 969 ? ? ? B .
A 1 970 GLN 970 ? ? ? B .
A 1 971 GLN 971 ? ? ? B .
A 1 972 LEU 972 ? ? ? B .
A 1 973 PRO 973 ? ? ? B .
A 1 974 GLN 974 ? ? ? B .
A 1 975 PHE 975 ? ? ? B .
A 1 976 SER 976 ? ? ? B .
A 1 977 ALA 977 ? ? ? B .
A 1 978 ALA 978 ? ? ? B .
A 1 979 PHE 979 ? ? ? B .
A 1 980 GLY 980 ? ? ? B .
A 1 981 HIS 981 ? ? ? B .
A 1 982 GLN 982 ? ? ? B .
A 1 983 LEU 983 ? ? ? B .
A 1 984 SER 984 ? ? ? B .
A 1 985 SER 985 ? ? ? B .
A 1 986 HIS 986 ? ? ? B .
A 1 987 SER 987 ? ? ? B .
A 1 988 GLY 988 ? ? ? B .
A 1 989 ILE 989 ? ? ? B .
A 1 990 PRO 990 ? ? ? B .
A 1 991 LYS 991 ? ? ? B .
A 1 992 ASP 992 ? ? ? B .
A 1 993 LEU 993 ? ? ? B .
A 1 994 GLN 994 ? ? ? B .
A 1 995 PRO 995 ? ? ? B .
A 1 996 SER 996 ? ? ? B .
A 1 997 HIS 997 ? ? ? B .
A 1 998 SER 998 ? ? ? B .
A 1 999 SER 999 ? ? ? B .
A 1 1000 ILE 1000 ? ? ? B .
A 1 1001 ALA 1001 ? ? ? B .
A 1 1002 PRO 1002 ? ? ? B .
A 1 1003 PRO 1003 ? ? ? B .
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A 1 1005 GLY 1005 ? ? ? B .
A 1 1006 PHE 1006 ? ? ? B .
A 1 1007 THR 1007 ? ? ? B .
A 1 1008 VAL 1008 ? ? ? B .
A 1 1009 THR 1009 ? ? ? B .
A 1 1010 GLY 1010 ? ? ? B .
A 1 1011 ALA 1011 ? ? ? B .
A 1 1012 THR 1012 ? ? ? B .
A 1 1013 ALA 1013 ? ? ? B .
A 1 1014 THR 1014 ? ? ? B .
A 1 1015 SER 1015 ? ? ? B .
A 1 1016 THR 1016 ? ? ? B .
A 1 1017 ASN 1017 ? ? ? B .
A 1 1018 ASN 1018 ? ? ? B .
A 1 1019 ALA 1019 ? ? ? B .
A 1 1020 SER 1020 ? ? ? B .
A 1 1021 SER 1021 ? ? ? B .
A 1 1022 PRO 1022 ? ? ? B .
A 1 1023 PHE 1023 ? ? ? B .
A 1 1024 PRO 1024 ? ? ? B .
A 1 1025 SER 1025 ? ? ? B .
A 1 1026 PRO 1026 ? ? ? B .
A 1 1027 ASN 1027 ? ? ? B .
#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'Catenin alpha-1 {PDB ID=5y04, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=5y04.1.B}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 5y04, label_asym_id=B'
'target-template alignment' .
4 'model 2' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
_ma_data_group.ordinal_id
_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
1 1 2
2 1 5
3 1 6
4 2 7
5 3 2
6 3 1
7 3 3
8 4 1
9 4 3
10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
_ma_template_trans_matrix.id
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3]
_ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[1]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[2]
_ma_template_trans_matrix.tr_vector[3]
1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000
1.000000 0 0 0
#
#
loop_
_ma_template_details.ordinal_id
_ma_template_details.template_id
_ma_template_details.template_origin
_ma_template_details.template_entity_type
_ma_template_details.template_trans_matrix_id
_ma_template_details.template_data_id
_ma_template_details.target_asym_id
_ma_template_details.template_label_asym_id
_ma_template_details.template_label_entity_id
_ma_template_details.template_model_num
_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A B 2 1 B
#
#
loop_
_ma_template_poly.template_id
_ma_template_poly.seq_one_letter_code
_ma_template_poly.seq_one_letter_code_can
1
;GPGELAYALNNFDKQIIVDPLSFSEERFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQA
LQDLLSEYMGNAGRKERSDALNSAIDKMTKKT
;

;GPGELAYALNNFDKQIIVDPLSFSEERFRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQA
LQDLLSEYMGNAGRKERSDALNSAIDKMTKKT
;

#
#
loop_
_ma_template_poly_segment.id
_ma_template_poly_segment.template_id
_ma_template_poly_segment.residue_number_begin
_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 52 80
#
#
loop_
_ma_template_ref_db_details.template_id
_ma_template_ref_db_details.db_name
_ma_template_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_template_ref_db_details.db_accession_code
_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 5y04 2024-03-27
#
#
loop_
_ma_target_template_poly_mapping.id
_ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin
_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 1027
#
#
loop_
_ma_alignment_info.alignment_id
_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 1027 'target-template pairwise alignment' local
#
#
loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 120.000 17.241
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
MYEGKHIHFSEVDNKPLCSYSPKLCKQRRLNGYAFCIRHVLEDKTAPFKQCEYVAKYNSQRCTNPIPKSEDRRYCNSHLQVLGFIPKKERKKKNDPIDEVKVRHQMDTMAFSLTVPTLALKMPNGLDGMSLSPPGARVPLHYLETELEDPFAFNEEDDDLKKGATVRKKLQSKLAQNRQRQRETEILKVRQEHFSPPPAPSQQQPPQQHSHLSPLSTSLKPPAPPQGSVCKSPQPQNTSLPMQGVAPTTHTIAQARQLSHKRPLPLLPSSRAPTVDPPRTDRILMKATAFSPHFSCISRLQRLVKLCTQKHQLDTDLFPHLGLDWSEESGEEPEDSEQASPYQVAWSIRETLRYQRHASDDDDAESRSSRVTQLCTYFQQKYKHLCRLERAESRQKKCRHTFRKALLQAASKEPECTGQLIQELRRAACSRTSISRTKLREVEPAACSGTVKGEQCANKALPFTRHCFQHILLNHSQQLFSSCTAKFADGQQCSVPVFDITHQTPLCEEHAKKMDNFLRGDNSRKVQHQQQRKPRKKTKPPALTKKHKKKRRRGPRRPQKPIPPAVPQGNLSMPASVSLPVEASHIRSPSTPELSADELPDDIANEITDIPHDLELNQEDFSDVLPRLPDDLQDFDFFEGKNGDLLPTTEEAEELERALQAVTSLECLSTIGVLAQSDGVPVQELSDRGIGVFSTGTGASGIQSLSREVNTDLGELLNGRIVHDNFSSLELDENLLRSATLSNPPTPLAGQIQGQFSAPANVGLTSATLISQSALGERAFPGQFHGLHDGSHASQRPHPAQLLSKADDLITSRQQYSSDHSHSSPHGSHYDSEHVPSPYSDHITSPHTTSYSGDNMAATFSAEMPIMAQHLLPTQLEVPLGGVVNPRTHWGNLPVNLGDPSPFSNLLGADGHLLSTSLSTPPTTSNSETTQPAFATVTPSSSSVLPGLPQTSFSGMGPSAELMASTSPKQQLPQFSAAFGHQLSSHSGIPKDLQPSHSSIAPPTGFTVTGATATSTNNASSPFPSPN
2 1 2
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5y04.1' 4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_id
_ma_model_list.model_group_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.model_group_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . SER 366 366 ? A 7.398 34.382 22.269 1 1 B SER 0.330 1
ATOM 2 C CA . SER 366 366 ? A 7.356 35.074 20.924 1 1 B SER 0.330 1
ATOM 3 C C . SER 366 366 ? A 8.400 34.622 19.913 1 1 B SER 0.330 1
ATOM 4 O O . SER 366 366 ? A 8.193 34.753 18.717 1 1 B SER 0.330 1
ATOM 5 C CB . SER 366 366 ? A 7.511 36.609 21.104 1 1 B SER 0.330 1
ATOM 6 O OG . SER 366 366 ? A 8.770 36.918 21.709 1 1 B SER 0.330 1
ATOM 7 N N . ARG 367 367 ? A 9.561 34.057 20.336 1 1 B ARG 0.320 1
ATOM 8 C CA . ARG 367 367 ? A 10.566 33.589 19.395 1 1 B ARG 0.320 1
ATOM 9 C C . ARG 367 367 ? A 10.104 32.517 18.424 1 1 B ARG 0.320 1
ATOM 10 O O . ARG 367 367 ? A 10.369 32.624 17.241 1 1 B ARG 0.320 1
ATOM 11 C CB . ARG 367 367 ? A 11.794 32.991 20.105 1 1 B ARG 0.320 1
ATOM 12 C CG . ARG 367 367 ? A 12.516 33.908 21.103 1 1 B ARG 0.320 1
ATOM 13 C CD . ARG 367 367 ? A 13.926 33.365 21.350 1 1 B ARG 0.320 1
ATOM 14 N NE . ARG 367 367 ? A 14.472 33.987 22.592 1 1 B ARG 0.320 1
ATOM 15 C CZ . ARG 367 367 ? A 15.759 33.877 22.951 1 1 B ARG 0.320 1
ATOM 16 N NH1 . ARG 367 367 ? A 16.654 33.305 22.151 1 1 B ARG 0.320 1
ATOM 17 N NH2 . ARG 367 367 ? A 16.159 34.326 24.137 1 1 B ARG 0.320 1
ATOM 18 N N . SER 368 368 ? A 9.380 31.480 18.894 1 1 B SER 0.460 1
ATOM 19 C CA . SER 368 368 ? A 8.861 30.440 18.019 1 1 B SER 0.460 1
ATOM 20 C C . SER 368 368 ? A 7.920 30.969 16.960 1 1 B SER 0.460 1
ATOM 21 O O . SER 368 368 ? A 8.068 30.654 15.791 1 1 B SER 0.460 1
ATOM 22 C CB . SER 368 368 ? A 8.086 29.361 18.807 1 1 B SER 0.460 1
ATOM 23 O OG . SER 368 368 ? A 8.922 28.769 19.800 1 1 B SER 0.460 1
ATOM 24 N N . SER 369 369 ? A 6.970 31.852 17.351 1 1 B SER 0.490 1
ATOM 25 C CA . SER 369 369 ? A 6.064 32.530 16.435 1 1 B SER 0.490 1
ATOM 26 C C . SER 369 369 ? A 6.768 33.457 15.452 1 1 B SER 0.490 1
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ATOM 85 N N . TYR 377 377 ? A 7.497 33.750 5.613 1 1 B TYR 0.580 1
ATOM 86 C CA . TYR 377 377 ? A 7.950 34.780 4.682 1 1 B TYR 0.580 1
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ATOM 113 C CG . GLN 379 379 ? A 7.704 28.239 3.714 1 1 B GLN 0.590 1
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ATOM 115 O OE1 . GLN 379 379 ? A 5.617 28.178 4.928 1 1 B GLN 0.590 1
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ATOM 147 N N . LYS 383 383 ? A 7.605 30.583 -3.055 1 1 B LYS 0.630 1
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ATOM 156 N N . HIS 384 384 ? A 6.038 32.391 -4.666 1 1 B HIS 0.650 1
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ATOM 164 C CE1 . HIS 384 384 ? A 4.199 36.913 -7.502 1 1 B HIS 0.650 1
ATOM 165 N NE2 . HIS 384 384 ? A 5.460 37.368 -7.725 1 1 B HIS 0.650 1
ATOM 166 N N . LEU 385 385 ? A 8.059 33.278 -6.549 1 1 B LEU 0.630 1
ATOM 167 C CA . LEU 385 385 ? A 9.146 33.183 -7.510 1 1 B LEU 0.630 1
ATOM 168 C C . LEU 385 385 ? A 8.968 32.008 -8.467 1 1 B LEU 0.630 1
ATOM 169 O O . LEU 385 385 ? A 9.125 32.134 -9.677 1 1 B LEU 0.630 1
ATOM 170 C CB . LEU 385 385 ? A 10.466 33.058 -6.702 1 1 B LEU 0.630 1
ATOM 171 C CG . LEU 385 385 ? A 11.764 32.809 -7.498 1 1 B LEU 0.630 1
ATOM 172 C CD1 . LEU 385 385 ? A 12.115 33.977 -8.431 1 1 B LEU 0.630 1
ATOM 173 C CD2 . LEU 385 385 ? A 12.933 32.495 -6.545 1 1 B LEU 0.630 1
ATOM 174 N N . CYS 386 386 ? A 8.542 30.845 -7.943 1 1 B CYS 0.650 1
ATOM 175 C CA . CYS 386 386 ? A 8.353 29.641 -8.727 1 1 B CYS 0.650 1
ATOM 176 C C . CYS 386 386 ? A 7.005 29.554 -9.437 1 1 B CYS 0.650 1
ATOM 177 O O . CYS 386 386 ? A 6.862 28.856 -10.438 1 1 B CYS 0.650 1
ATOM 178 C CB . CYS 386 386 ? A 8.498 28.415 -7.797 1 1 B CYS 0.650 1
ATOM 179 S SG . CYS 386 386 ? A 10.169 28.287 -7.082 1 1 B CYS 0.650 1
ATOM 180 N N . ARG 387 387 ? A 5.962 30.258 -8.950 1 1 B ARG 0.470 1
ATOM 181 C CA . ARG 387 387 ? A 4.702 30.417 -9.660 1 1 B ARG 0.470 1
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ATOM 185 C CG . ARG 387 387 ? A 3.112 29.905 -7.651 1 1 B ARG 0.470 1
ATOM 186 C CD . ARG 387 387 ? A 2.128 30.541 -6.667 1 1 B ARG 0.470 1
ATOM 187 N NE . ARG 387 387 ? A 1.874 29.556 -5.564 1 1 B ARG 0.470 1
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ATOM 191 N N . LEU 388 388 ? A 5.718 32.400 -10.660 1 1 B LEU 0.460 1
ATOM 192 C CA . LEU 388 388 ? A 6.000 33.358 -11.700 1 1 B LEU 0.460 1
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ATOM 206 O OE1 . GLU 389 389 ? A 12.850 28.515 -13.698 1 1 B GLU 0.440 1
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ATOM 208 N N . ARG 390 390 ? A 7.261 29.512 -13.725 1 1 B ARG 0.330 1
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ATOM 219 N N . ALA 391 391 ? A 4.788 30.348 -14.750 1 1 B ALA 0.400 1
ATOM 220 C CA . ALA 391 391 ? A 3.678 31.094 -15.281 1 1 B ALA 0.400 1
ATOM 221 C C . ALA 391 391 ? A 2.296 30.434 -14.986 1 1 B ALA 0.400 1
ATOM 222 O O . ALA 391 391 ? A 2.255 29.376 -14.294 1 1 B ALA 0.400 1
ATOM 223 C CB . ALA 391 391 ? A 3.911 31.549 -16.742 1 1 B ALA 0.400 1
ATOM 224 O OXT . ALA 391 391 ? A 1.264 31.035 -15.395 1 1 B ALA 0.400 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
S
#
#
loop_
_ma_qa_metric.id
_ma_qa_metric.name
_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
loop_
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_ma_qa_metric_global.model_id
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_ma_qa_metric_global.metric_value
1 1 2 0.532
2 1 3 0.005
#
#
loop_
_ma_qa_metric_local.ordinal_id
_ma_qa_metric_local.model_id
_ma_qa_metric_local.label_asym_id
_ma_qa_metric_local.label_seq_id
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_ma_qa_metric_local.metric_id
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1 1 A 366 SER 1 0.330
2 1 A 367 ARG 1 0.320
3 1 A 368 SER 1 0.460
4 1 A 369 SER 1 0.490
5 1 A 370 ARG 1 0.510
6 1 A 371 VAL 1 0.540
7 1 A 372 THR 1 0.610
8 1 A 373 GLN 1 0.560
9 1 A 374 LEU 1 0.560
10 1 A 375 CYS 1 0.620
11 1 A 376 THR 1 0.620
12 1 A 377 TYR 1 0.580
13 1 A 378 PHE 1 0.520
14 1 A 379 GLN 1 0.590
15 1 A 380 GLN 1 0.600
16 1 A 381 LYS 1 0.590
17 1 A 382 TYR 1 0.660
18 1 A 383 LYS 1 0.630
19 1 A 384 HIS 1 0.650
20 1 A 385 LEU 1 0.630
21 1 A 386 CYS 1 0.650
22 1 A 387 ARG 1 0.470
23 1 A 388 LEU 1 0.460
24 1 A 389 GLU 1 0.440
25 1 A 390 ARG 1 0.330
26 1 A 391 ALA 1 0.400
#
#
loop_
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_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
_pdbx_data_usage.url
1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
(https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you
can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
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you must distribute your contributions under the same license as the
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No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
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CC BY-SA 4.0 license at this link:
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;
https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode
2 disclaimer
;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
;
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