data_SMR-e5dc6a1579c09cf64ec4d3ae5ec4b4fa_1 _entry.id SMR-e5dc6a1579c09cf64ec4d3ae5ec4b4fa_1 _struct.entry_id SMR-e5dc6a1579c09cf64ec4d3ae5ec4b4fa_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - Q95QA6 (isoform 2)/ PAT12_CAEEL, Protein pat-12 Estimated model accuracy of this model is 0.016, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q95QA6 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 136522.354 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP PAT12_CAEEL Q95QA6 1 ;MSFQQPQASPISPGDSGWLIKMRKNRYLDHTSKVNEPKKYRSMDQLPTGKVGAPDNEKSEGTDPLHWQLR KDFHLAKYSERRASYHVESSSYIHSSQQIQHPPQQHHPPPPSPPPVAETIQHQPHPSQQQPSTTTISSRQ LYKSQLLYPPGSTENIASEHKPAIRPPEKSVYENNPIAPSELNVQVKRAPPQGPPPPPPPQAPADIDYPE RLMSPPPTHQPRSILKGYSSQQYYSQTNLTESHHHQSSQETSLNPQQMHPRPSDRRTPTHFEDLSEDEKT RIMHENLQRHRNMRSGPNGPRPTTTSFNGPFFRLEQVNPGQNQPQQPQYQQHPRSQSVDPSGDMNGGPRP IHQNFSASEIELHHYSRNAEPSVVVWPPVSEKERERPSSVLAKNFNDPERIDEYQRQKRLEYEAIQRTNE KQAVSMAKQVNAMMQQQKLYERSHGMTSPVPIMESISPQPQVSHHHHQPQQHQQHQPQQQYYPSPPPPPQ PYRDPEPVFNPVQVYETRPISALSDQIDQPPSQQAPTSWKRTYIVERPRDVAKNEIITSDQLLEKEAYDV DLLKRRETFVEKPEEAPRINRLGRRWQPPPERPYVWPTLRRAMSVEPSSMPVDFAPGVPHNYDDNEEYKW EPVVNDPGYKKEDKNFTPVNSPPASPRRGHGVGPLDEPARRQAKYVIQPSPDGSHRPKAVFRKERHAPSG GFYPHAPNAIKVVKKRAQSVQGLLSPTDNVEVIHQRNYHRLDLEQNGHHGQKLRRSQHGGSEMDLRRSTQ EMPDWEKIYELPPHSSQIVQKDMPRHVDVQRRLSKFEGSIQNLRAATSTQHLDSMQQLHFPMPDYEPPQP PQQRRRTESSGYRGGPPPPPPMPQQQPREMSRRNSVASTRIDSPSLMIPHHRQSRSDSRGPPQMSRAASS IPLSPQPTPQHHHHHHSQRPTTPGATRARNYIARATAPSPTPYSYDRARAYVPPALPPGYRLADPIPDQR AMSPSPGHTRKLIRNVSESAQRLHPSGSTPQTSRAPSRHSHRQSPNPRFL ; 'Protein pat-12' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1030 1 1030 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . PAT12_CAEEL Q95QA6 Q95QA6-2 1 1030 6239 'Caenorhabditis elegans' 2001-12-01 04C4F9F46F43F865 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no X ;MSFQQPQASPISPGDSGWLIKMRKNRYLDHTSKVNEPKKYRSMDQLPTGKVGAPDNEKSEGTDPLHWQLR KDFHLAKYSERRASYHVESSSYIHSSQQIQHPPQQHHPPPPSPPPVAETIQHQPHPSQQQPSTTTISSRQ LYKSQLLYPPGSTENIASEHKPAIRPPEKSVYENNPIAPSELNVQVKRAPPQGPPPPPPPQAPADIDYPE RLMSPPPTHQPRSILKGYSSQQYYSQTNLTESHHHQSSQETSLNPQQMHPRPSDRRTPTHFEDLSEDEKT RIMHENLQRHRNMRSGPNGPRPTTTSFNGPFFRLEQVNPGQNQPQQPQYQQHPRSQSVDPSGDMNGGPRP IHQNFSASEIELHHYSRNAEPSVVVWPPVSEKERERPSSVLAKNFNDPERIDEYQRQKRLEYEAIQRTNE KQAVSMAKQVNAMMQQQKLYERSHGMTSPVPIMESISPQPQVSHHHHQPQQHQQHQPQQQYYPSPPPPPQ PYRDPEPVFNPVQVYETRPISALSDQIDQPPSQQAPTSWKRTYIVERPRDVAKNEIITSDQLLEKEAYDV DLLKRRETFVEKPEEAPRINRLGRRWQPPPERPYVWPTLRRAMSVEPSSMPVDFAPGVPHNYDDNEEYKW EPVVNDPGYKKEDKNFTPVNSPPASPRRGHGVGPLDEPARRQAKYVIQPSPDGSHRPKAVFRKERHAPSG GFYPHAPNAIKVVKKRAQSVQGLLSPTDNVEVIHQRNYHRLDLEQNGHHGQKLRRSQHGGSEMDLRRSTQ EMPDWEKIYELPPHSSQIVQKDMPRHVDVQRRLSKFEGSIQNLRAATSTQHLDSMQQLHFPMPDYEPPQP PQQRRRTESSGYRGGPPPPPPMPQQQPREMSRRNSVASTRIDSPSLMIPHHRQSRSDSRGPPQMSRAASS IPLSPQPTPQHHHHHHSQRPTTPGATRARNYIARATAPSPTPYSYDRARAYVPPALPPGYRLADPIPDQR AMSPSPGHTRKLIRNVSESAQRLHPSGSTPQTSRAPSRHSHRQSPNPRFL ; ;MSFQQPQASPISPGDSGWLIKMRKNRYLDHTSKVNEPKKYRSMDQLPTGKVGAPDNEKSEGTDPLHWQLR KDFHLAKYSERRASYHVESSSYIHSSQQIQHPPQQHHPPPPSPPPVAETIQHQPHPSQQQPSTTTISSRQ LYKSQLLYPPGSTENIASEHKPAIRPPEKSVYENNPIAPSELNVQVKRAPPQGPPPPPPPQAPADIDYPE RLMSPPPTHQPRSILKGYSSQQYYSQTNLTESHHHQSSQETSLNPQQMHPRPSDRRTPTHFEDLSEDEKT RIMHENLQRHRNMRSGPNGPRPTTTSFNGPFFRLEQVNPGQNQPQQPQYQQHPRSQSVDPSGDMNGGPRP IHQNFSASEIELHHYSRNAEPSVVVWPPVSEKERERPSSVLAKNFNDPERIDEYQRQKRLEYEAIQRTNE KQAVSMAKQVNAMMQQQKLYERSHGMTSPVPIMESISPQPQVSHHHHQPQQHQQHQPQQQYYPSPPPPPQ PYRDPEPVFNPVQVYETRPISALSDQIDQPPSQQAPTSWKRTYIVERPRDVAKNEIITSDQLLEKEAYDV DLLKRRETFVEKPEEAPRINRLGRRWQPPPERPYVWPTLRRAMSVEPSSMPVDFAPGVPHNYDDNEEYKW EPVVNDPGYKKEDKNFTPVNSPPASPRRGHGVGPLDEPARRQAKYVIQPSPDGSHRPKAVFRKERHAPSG GFYPHAPNAIKVVKKRAQSVQGLLSPTDNVEVIHQRNYHRLDLEQNGHHGQKLRRSQHGGSEMDLRRSTQ EMPDWEKIYELPPHSSQIVQKDMPRHVDVQRRLSKFEGSIQNLRAATSTQHLDSMQQLHFPMPDYEPPQP PQQRRRTESSGYRGGPPPPPPMPQQQPREMSRRNSVASTRIDSPSLMIPHHRQSRSDSRGPPQMSRAASS IPLSPQPTPQHHHHHHSQRPTTPGATRARNYIARATAPSPTPYSYDRARAYVPPALPPGYRLADPIPDQR AMSPSPGHTRKLIRNVSESAQRLHPSGSTPQTSRAPSRHSHRQSPNPRFL ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 SER . 1 3 PHE . 1 4 GLN . 1 5 GLN . 1 6 PRO . 1 7 GLN . 1 8 ALA . 1 9 SER . 1 10 PRO . 1 11 ILE . 1 12 SER . 1 13 PRO . 1 14 GLY . 1 15 ASP . 1 16 SER . 1 17 GLY . 1 18 TRP . 1 19 LEU . 1 20 ILE . 1 21 LYS . 1 22 MET . 1 23 ARG . 1 24 LYS . 1 25 ASN . 1 26 ARG . 1 27 TYR . 1 28 LEU . 1 29 ASP . 1 30 HIS . 1 31 THR . 1 32 SER . 1 33 LYS . 1 34 VAL . 1 35 ASN . 1 36 GLU . 1 37 PRO . 1 38 LYS . 1 39 LYS . 1 40 TYR . 1 41 ARG . 1 42 SER . 1 43 MET . 1 44 ASP . 1 45 GLN . 1 46 LEU . 1 47 PRO . 1 48 THR . 1 49 GLY . 1 50 LYS . 1 51 VAL . 1 52 GLY . 1 53 ALA . 1 54 PRO . 1 55 ASP . 1 56 ASN . 1 57 GLU . 1 58 LYS . 1 59 SER . 1 60 GLU . 1 61 GLY . 1 62 THR . 1 63 ASP . 1 64 PRO . 1 65 LEU . 1 66 HIS . 1 67 TRP . 1 68 GLN . 1 69 LEU . 1 70 ARG . 1 71 LYS . 1 72 ASP . 1 73 PHE . 1 74 HIS . 1 75 LEU . 1 76 ALA . 1 77 LYS . 1 78 TYR . 1 79 SER . 1 80 GLU . 1 81 ARG . 1 82 ARG . 1 83 ALA . 1 84 SER . 1 85 TYR . 1 86 HIS . 1 87 VAL . 1 88 GLU . 1 89 SER . 1 90 SER . 1 91 SER . 1 92 TYR . 1 93 ILE . 1 94 HIS . 1 95 SER . 1 96 SER . 1 97 GLN . 1 98 GLN . 1 99 ILE . 1 100 GLN . 1 101 HIS . 1 102 PRO . 1 103 PRO . 1 104 GLN . 1 105 GLN . 1 106 HIS . 1 107 HIS . 1 108 PRO . 1 109 PRO . 1 110 PRO . 1 111 PRO . 1 112 SER . 1 113 PRO . 1 114 PRO . 1 115 PRO . 1 116 VAL . 1 117 ALA . 1 118 GLU . 1 119 THR . 1 120 ILE . 1 121 GLN . 1 122 HIS . 1 123 GLN . 1 124 PRO . 1 125 HIS . 1 126 PRO . 1 127 SER . 1 128 GLN . 1 129 GLN . 1 130 GLN . 1 131 PRO . 1 132 SER . 1 133 THR . 1 134 THR . 1 135 THR . 1 136 ILE . 1 137 SER . 1 138 SER . 1 139 ARG . 1 140 GLN . 1 141 LEU . 1 142 TYR . 1 143 LYS . 1 144 SER . 1 145 GLN . 1 146 LEU . 1 147 LEU . 1 148 TYR . 1 149 PRO . 1 150 PRO . 1 151 GLY . 1 152 SER . 1 153 THR . 1 154 GLU . 1 155 ASN . 1 156 ILE . 1 157 ALA . 1 158 SER . 1 159 GLU . 1 160 HIS . 1 161 LYS . 1 162 PRO . 1 163 ALA . 1 164 ILE . 1 165 ARG . 1 166 PRO . 1 167 PRO . 1 168 GLU . 1 169 LYS . 1 170 SER . 1 171 VAL . 1 172 TYR . 1 173 GLU . 1 174 ASN . 1 175 ASN . 1 176 PRO . 1 177 ILE . 1 178 ALA . 1 179 PRO . 1 180 SER . 1 181 GLU . 1 182 LEU . 1 183 ASN . 1 184 VAL . 1 185 GLN . 1 186 VAL . 1 187 LYS . 1 188 ARG . 1 189 ALA . 1 190 PRO . 1 191 PRO . 1 192 GLN . 1 193 GLY . 1 194 PRO . 1 195 PRO . 1 196 PRO . 1 197 PRO . 1 198 PRO . 1 199 PRO . 1 200 PRO . 1 201 GLN . 1 202 ALA . 1 203 PRO . 1 204 ALA . 1 205 ASP . 1 206 ILE . 1 207 ASP . 1 208 TYR . 1 209 PRO . 1 210 GLU . 1 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A 1 840 PRO 840 ? ? ? X . A 1 841 PRO 841 ? ? ? X . A 1 842 GLN 842 ? ? ? X . A 1 843 GLN 843 ? ? ? X . A 1 844 ARG 844 ? ? ? X . A 1 845 ARG 845 ? ? ? X . A 1 846 ARG 846 ? ? ? X . A 1 847 THR 847 ? ? ? X . A 1 848 GLU 848 ? ? ? X . A 1 849 SER 849 ? ? ? X . A 1 850 SER 850 ? ? ? X . A 1 851 GLY 851 ? ? ? X . A 1 852 TYR 852 ? ? ? X . A 1 853 ARG 853 ? ? ? X . A 1 854 GLY 854 ? ? ? X . A 1 855 GLY 855 ? ? ? X . A 1 856 PRO 856 ? ? ? X . A 1 857 PRO 857 ? ? ? X . A 1 858 PRO 858 ? ? ? X . A 1 859 PRO 859 ? ? ? X . A 1 860 PRO 860 ? ? ? X . A 1 861 PRO 861 ? ? ? X . A 1 862 MET 862 ? ? ? X . A 1 863 PRO 863 ? ? ? X . A 1 864 GLN 864 ? ? ? X . A 1 865 GLN 865 ? ? ? X . A 1 866 GLN 866 ? ? ? X . A 1 867 PRO 867 ? ? ? X . A 1 868 ARG 868 ? ? ? X . A 1 869 GLU 869 ? ? ? X . A 1 870 MET 870 ? ? ? X . A 1 871 SER 871 ? ? ? X . A 1 872 ARG 872 ? ? ? X . A 1 873 ARG 873 ? ? ? X . A 1 874 ASN 874 ? ? ? X . A 1 875 SER 875 ? ? ? X . A 1 876 VAL 876 ? ? ? X . A 1 877 ALA 877 ? ? ? X . A 1 878 SER 878 ? ? ? X . A 1 879 THR 879 ? ? ? X . A 1 880 ARG 880 ? ? ? X . A 1 881 ILE 881 ? ? ? X . A 1 882 ASP 882 ? ? ? X . A 1 883 SER 883 ? ? ? X . A 1 884 PRO 884 ? ? ? X . A 1 885 SER 885 ? ? ? X . A 1 886 LEU 886 ? ? ? X . A 1 887 MET 887 ? ? ? X . A 1 888 ILE 888 ? ? ? X . A 1 889 PRO 889 ? ? ? X . A 1 890 HIS 890 ? ? ? X . A 1 891 HIS 891 ? ? ? X . A 1 892 ARG 892 ? ? ? X . A 1 893 GLN 893 ? ? ? X . A 1 894 SER 894 ? ? ? X . A 1 895 ARG 895 ? ? ? X . A 1 896 SER 896 ? ? ? X . A 1 897 ASP 897 ? ? ? X . A 1 898 SER 898 ? ? ? X . A 1 899 ARG 899 ? ? ? X . A 1 900 GLY 900 ? ? ? X . A 1 901 PRO 901 ? ? ? X . A 1 902 PRO 902 ? ? ? X . A 1 903 GLN 903 ? ? ? X . A 1 904 MET 904 ? ? ? X . A 1 905 SER 905 ? ? ? X . A 1 906 ARG 906 ? ? ? X . A 1 907 ALA 907 ? ? ? X . A 1 908 ALA 908 ? ? ? X . A 1 909 SER 909 ? ? ? X . A 1 910 SER 910 ? ? ? X . A 1 911 ILE 911 ? ? ? X . A 1 912 PRO 912 ? ? ? X . A 1 913 LEU 913 ? ? ? X . A 1 914 SER 914 ? ? ? X . A 1 915 PRO 915 ? ? ? X . A 1 916 GLN 916 ? ? ? X . A 1 917 PRO 917 ? ? ? X . A 1 918 THR 918 ? ? ? X . A 1 919 PRO 919 ? ? ? X . A 1 920 GLN 920 ? ? ? X . A 1 921 HIS 921 ? ? ? X . A 1 922 HIS 922 ? ? ? X . A 1 923 HIS 923 ? ? ? X . A 1 924 HIS 924 ? ? ? X . A 1 925 HIS 925 ? ? ? X . A 1 926 HIS 926 ? ? ? X . A 1 927 SER 927 ? ? ? X . A 1 928 GLN 928 ? ? ? X . A 1 929 ARG 929 ? ? ? X . A 1 930 PRO 930 ? ? ? X . A 1 931 THR 931 ? ? ? X . A 1 932 THR 932 ? ? ? X . A 1 933 PRO 933 ? ? ? X . A 1 934 GLY 934 ? ? ? X . A 1 935 ALA 935 ? ? ? X . A 1 936 THR 936 ? ? ? X . A 1 937 ARG 937 ? ? ? X . A 1 938 ALA 938 ? ? ? X . A 1 939 ARG 939 ? ? ? X . A 1 940 ASN 940 ? ? ? X . A 1 941 TYR 941 ? ? ? X . A 1 942 ILE 942 ? ? ? X . A 1 943 ALA 943 ? ? ? X . A 1 944 ARG 944 ? ? ? X . A 1 945 ALA 945 ? ? ? X . A 1 946 THR 946 ? ? ? X . A 1 947 ALA 947 ? ? ? X . A 1 948 PRO 948 ? ? ? X . A 1 949 SER 949 ? ? ? X . A 1 950 PRO 950 ? ? ? X . A 1 951 THR 951 ? ? ? X . A 1 952 PRO 952 ? ? ? X . A 1 953 TYR 953 ? ? ? X . A 1 954 SER 954 ? ? ? X . A 1 955 TYR 955 ? ? ? X . A 1 956 ASP 956 ? ? ? X . A 1 957 ARG 957 ? ? ? X . A 1 958 ALA 958 ? ? ? X . A 1 959 ARG 959 ? ? ? X . A 1 960 ALA 960 ? ? ? X . A 1 961 TYR 961 ? ? ? X . A 1 962 VAL 962 ? ? ? X . A 1 963 PRO 963 ? ? ? X . A 1 964 PRO 964 ? ? ? X . A 1 965 ALA 965 ? ? ? X . A 1 966 LEU 966 ? ? ? X . A 1 967 PRO 967 ? ? ? X . A 1 968 PRO 968 ? ? ? X . A 1 969 GLY 969 ? ? ? X . A 1 970 TYR 970 ? ? ? X . A 1 971 ARG 971 ? ? ? X . A 1 972 LEU 972 ? ? ? X . A 1 973 ALA 973 ? ? ? X . A 1 974 ASP 974 ? ? ? X . A 1 975 PRO 975 ? ? ? X . A 1 976 ILE 976 ? ? ? X . A 1 977 PRO 977 ? ? ? X . A 1 978 ASP 978 ? ? ? X . A 1 979 GLN 979 ? ? ? X . A 1 980 ARG 980 ? ? ? X . A 1 981 ALA 981 ? ? ? X . A 1 982 MET 982 ? ? ? X . A 1 983 SER 983 ? ? ? X . A 1 984 PRO 984 ? ? ? X . A 1 985 SER 985 ? ? ? X . A 1 986 PRO 986 ? ? ? X . A 1 987 GLY 987 ? ? ? X . A 1 988 HIS 988 ? ? ? X . A 1 989 THR 989 ? ? ? X . A 1 990 ARG 990 ? ? ? X . A 1 991 LYS 991 ? ? ? X . 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A 1 1028 ARG 1028 ? ? ? X . A 1 1029 PHE 1029 ? ? ? X . A 1 1030 LEU 1030 ? ? ? X . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'PRKR-interacting protein 1 {PDB ID=6icz, label_asym_id=X, auth_asym_id=X, SMTL ID=6icz.1.X}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by HHblits to 6icz, label_asym_id=X' 'target-template alignment' . 4 'model 1' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A X 24 1 X # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;MASPAASSVRPPRPKKEPQTLVIPKNAAEEQKLKLERLMKNPDKAVPIPEKMSEWAPRPPPEFVRDVMGS SAGAGSGEFHVYRHLRRREYQRQDYMDAMAEKQKLDAEFQKRLEKNKIAAEEQTAKRRKKRQKLKEKKLL AKKMKLEQKKQEGPGQPKEQGSSSSAEASGTEEEEEVPSFTMGR ; ;MASPAASSVRPPRPKKEPQTLVIPKNAAEEQKLKLERLMKNPDKAVPIPEKMSEWAPRPPPEFVRDVMGS SAGAGSGEFHVYRHLRRREYQRQDYMDAMAEKQKLDAEFQKRLEKNKIAAEEQTAKRRKKRQKLKEKKLL AKKMKLEQKKQEGPGQPKEQGSSSSAEASGTEEEEEVPSFTMGR ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 81 107 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6icz 2024-11-13 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1030 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1030 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 64.000 25.926 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MSFQQPQASPISPGDSGWLIKMRKNRYLDHTSKVNEPKKYRSMDQLPTGKVGAPDNEKSEGTDPLHWQLRKDFHLAKYSERRASYHVESSSYIHSSQQIQHPPQQHHPPPPSPPPVAETIQHQPHPSQQQPSTTTISSRQLYKSQLLYPPGSTENIASEHKPAIRPPEKSVYENNPIAPSELNVQVKRAPPQGPPPPPPPQAPADIDYPERLMSPPPTHQPRSILKGYSSQQYYSQTNLTESHHHQSSQETSLNPQQMHPRPSDRRTPTHFEDLSEDEKTRIMHENLQRHRNMRSGPNGPRPTTTSFNGPFFRLEQVNPGQNQPQQPQYQQHPRSQSVDPSGDMNGGPRPIHQNFSASEIELHHYSRNAEPSVVVWPPVSEKERERPSSVLAKNFNDPERIDEYQRQKRLEYEAIQRTNEKQAVSMAKQVNAMMQQQKLYERSHGMTSPVPIMESISPQPQVSHHHHQPQQHQQHQPQQQYYPSPPPPPQPYRDPEPVFNPVQVYETRPISALSDQIDQPPSQQAPTSWKRTYIVERPRDVAKNEIITSDQLLEKEAYDVDLLKRRETFVEKPEEAPRINRLGRRWQPPPERPYVWPTLRRAMSVEPSSMPVDFAPGVPHNYDDNEEYKWEPVVNDPGYKKEDKNFTPVNSPPASPRRGHGVGPLDEPARRQAKYVIQPSPDGSHRPKAVFRKERHAPSGGFYPHAPNAIKVVKKRAQSVQGLLSPTDNVEVIHQRNYHRLDLEQNGHHGQKLRRSQHGGSEMDLRRSTQEMPDWEKIYELPPHSSQIVQKDMPRHVDVQRRLSKFEGSIQNLRAATSTQHLDSMQQLHFPMPDYEPPQPPQQRRRTESSGYRGGPPPPPPMPQQQPREMSRRNSVASTRIDSPSLMIPHHRQSRSDSRGPPQMSRAASSIPLSPQPTPQHHHHHHSQRPTTPGATRARNYIARATAPSPTPYSYDRARAYVPPALPPGYRLADPIPDQRAMSPSPGHTRKLIRNVSESAQRLHPSGSTPQTSRAPSRHSHRQSPNPRFL 2 1 2 ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------VYRHLRRREYQRQDYMDAMAEKQKLDA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6icz.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PHE 395 395 ? A 261.481 273.167 318.209 1 1 X PHE 0.330 1 ATOM 2 C CA . PHE 395 395 ? A 261.621 273.653 319.631 1 1 X PHE 0.330 1 ATOM 3 C C . PHE 395 395 ? A 260.268 273.722 320.327 1 1 X PHE 0.330 1 ATOM 4 O O . PHE 395 395 ? A 260.075 272.983 321.287 1 1 X PHE 0.330 1 ATOM 5 C CB . PHE 395 395 ? A 262.456 274.966 319.655 1 1 X PHE 0.330 1 ATOM 6 C CG . PHE 395 395 ? A 262.732 275.416 321.070 1 1 X PHE 0.330 1 ATOM 7 C CD1 . PHE 395 395 ? A 261.969 276.450 321.636 1 1 X PHE 0.330 1 ATOM 8 C CD2 . PHE 395 395 ? A 263.718 274.797 321.860 1 1 X PHE 0.330 1 ATOM 9 C CE1 . PHE 395 395 ? A 262.200 276.876 322.947 1 1 X PHE 0.330 1 ATOM 10 C CE2 . PHE 395 395 ? A 263.953 275.226 323.175 1 1 X PHE 0.330 1 ATOM 11 C CZ . PHE 395 395 ? A 263.201 276.274 323.715 1 1 X PHE 0.330 1 ATOM 12 N N . ASN 396 396 ? A 259.281 274.494 319.814 1 1 X ASN 0.360 1 ATOM 13 C CA . ASN 396 396 ? A 257.919 274.594 320.340 1 1 X ASN 0.360 1 ATOM 14 C C . ASN 396 396 ? A 257.239 273.233 320.471 1 1 X ASN 0.360 1 ATOM 15 O O . ASN 396 396 ? A 256.533 272.989 321.448 1 1 X ASN 0.360 1 ATOM 16 C CB . ASN 396 396 ? A 257.039 275.509 319.437 1 1 X ASN 0.360 1 ATOM 17 C CG . ASN 396 396 ? A 257.594 276.925 319.389 1 1 X ASN 0.360 1 ATOM 18 O OD1 . ASN 396 396 ? A 258.576 277.281 320.068 1 1 X ASN 0.360 1 ATOM 19 N ND2 . ASN 396 396 ? A 257.043 277.786 318.519 1 1 X ASN 0.360 1 ATOM 20 N N . ASP 397 397 ? A 257.437 272.295 319.522 1 1 X ASP 0.570 1 ATOM 21 C CA . ASP 397 397 ? A 256.962 270.919 319.629 1 1 X ASP 0.570 1 ATOM 22 C C . ASP 397 397 ? A 257.508 270.071 320.793 1 1 X ASP 0.570 1 ATOM 23 O O . ASP 397 397 ? A 256.678 269.568 321.553 1 1 X ASP 0.570 1 ATOM 24 C CB . ASP 397 397 ? A 257.092 270.187 318.267 1 1 X ASP 0.570 1 ATOM 25 C CG . ASP 397 397 ? A 256.298 270.928 317.207 1 1 X ASP 0.570 1 ATOM 26 O OD1 . ASP 397 397 ? A 255.333 271.646 317.572 1 1 X ASP 0.570 1 ATOM 27 O OD2 . ASP 397 397 ? A 256.721 270.835 316.031 1 1 X ASP 0.570 1 ATOM 28 N N . PRO 398 398 ? A 258.815 269.902 321.056 1 1 X PRO 0.630 1 ATOM 29 C CA . PRO 398 398 ? A 259.321 269.374 322.320 1 1 X PRO 0.630 1 ATOM 30 C C . PRO 398 398 ? A 258.768 270.120 323.518 1 1 X PRO 0.630 1 ATOM 31 O O . PRO 398 398 ? A 258.231 269.469 324.412 1 1 X PRO 0.630 1 ATOM 32 C CB . PRO 398 398 ? A 260.859 269.414 322.188 1 1 X PRO 0.630 1 ATOM 33 C CG . PRO 398 398 ? A 261.145 269.454 320.677 1 1 X PRO 0.630 1 ATOM 34 C CD . PRO 398 398 ? A 259.856 269.979 320.041 1 1 X PRO 0.630 1 ATOM 35 N N . GLU 399 399 ? A 258.804 271.469 323.523 1 1 X GLU 0.630 1 ATOM 36 C CA . GLU 399 399 ? A 258.333 272.293 324.626 1 1 X GLU 0.630 1 ATOM 37 C C . GLU 399 399 ? A 256.894 271.994 325.045 1 1 X GLU 0.630 1 ATOM 38 O O . GLU 399 399 ? A 256.607 271.718 326.209 1 1 X GLU 0.630 1 ATOM 39 C CB . GLU 399 399 ? A 258.410 273.781 324.205 1 1 X GLU 0.630 1 ATOM 40 C CG . GLU 399 399 ? A 257.920 274.824 325.240 1 1 X GLU 0.630 1 ATOM 41 C CD . GLU 399 399 ? A 257.993 276.239 324.664 1 1 X GLU 0.630 1 ATOM 42 O OE1 . GLU 399 399 ? A 258.430 276.384 323.492 1 1 X GLU 0.630 1 ATOM 43 O OE2 . GLU 399 399 ? A 257.588 277.182 325.389 1 1 X GLU 0.630 1 ATOM 44 N N . ARG 400 400 ? A 255.936 271.966 324.094 1 1 X ARG 0.600 1 ATOM 45 C CA . ARG 400 400 ? A 254.556 271.627 324.400 1 1 X ARG 0.600 1 ATOM 46 C C . ARG 400 400 ? A 254.311 270.196 324.858 1 1 X ARG 0.600 1 ATOM 47 O O . ARG 400 400 ? A 253.448 269.957 325.704 1 1 X ARG 0.600 1 ATOM 48 C CB . ARG 400 400 ? A 253.569 271.965 323.250 1 1 X ARG 0.600 1 ATOM 49 C CG . ARG 400 400 ? A 253.806 271.203 321.928 1 1 X ARG 0.600 1 ATOM 50 C CD . ARG 400 400 ? A 252.744 271.430 320.854 1 1 X ARG 0.600 1 ATOM 51 N NE . ARG 400 400 ? A 251.595 270.538 321.238 1 1 X ARG 0.600 1 ATOM 52 C CZ . ARG 400 400 ? A 250.355 270.639 320.743 1 1 X ARG 0.600 1 ATOM 53 N NH1 . ARG 400 400 ? A 249.444 269.701 320.999 1 1 X ARG 0.600 1 ATOM 54 N NH2 . ARG 400 400 ? A 250.010 271.677 319.993 1 1 X ARG 0.600 1 ATOM 55 N N . ILE 401 401 ? A 255.028 269.194 324.298 1 1 X ILE 0.690 1 ATOM 56 C CA . ILE 401 401 ? A 254.930 267.804 324.725 1 1 X ILE 0.690 1 ATOM 57 C C . ILE 401 401 ? A 255.455 267.650 326.149 1 1 X ILE 0.690 1 ATOM 58 O O . ILE 401 401 ? A 254.751 267.086 326.980 1 1 X ILE 0.690 1 ATOM 59 C CB . ILE 401 401 ? A 255.552 266.826 323.721 1 1 X ILE 0.690 1 ATOM 60 C CG1 . ILE 401 401 ? A 254.743 266.888 322.396 1 1 X ILE 0.690 1 ATOM 61 C CG2 . ILE 401 401 ? A 255.561 265.385 324.297 1 1 X ILE 0.690 1 ATOM 62 C CD1 . ILE 401 401 ? A 255.379 266.124 321.225 1 1 X ILE 0.690 1 ATOM 63 N N . ASP 402 402 ? A 256.628 268.236 326.490 1 1 X ASP 0.730 1 ATOM 64 C CA . ASP 402 402 ? A 257.220 268.233 327.822 1 1 X ASP 0.730 1 ATOM 65 C C . ASP 402 402 ? A 256.300 268.866 328.869 1 1 X ASP 0.730 1 ATOM 66 O O . ASP 402 402 ? A 256.018 268.273 329.917 1 1 X ASP 0.730 1 ATOM 67 C CB . ASP 402 402 ? A 258.596 268.971 327.790 1 1 X ASP 0.730 1 ATOM 68 C CG . ASP 402 402 ? A 259.658 268.180 327.031 1 1 X ASP 0.730 1 ATOM 69 O OD1 . ASP 402 402 ? A 259.400 267.001 326.682 1 1 X ASP 0.730 1 ATOM 70 O OD2 . ASP 402 402 ? A 260.759 268.751 326.817 1 1 X ASP 0.730 1 ATOM 71 N N . GLU 403 403 ? A 255.721 270.050 328.576 1 1 X GLU 0.750 1 ATOM 72 C CA . GLU 403 403 ? A 254.741 270.711 329.425 1 1 X GLU 0.750 1 ATOM 73 C C . GLU 403 403 ? A 253.454 269.916 329.616 1 1 X GLU 0.750 1 ATOM 74 O O . GLU 403 403 ? A 252.951 269.776 330.732 1 1 X GLU 0.750 1 ATOM 75 C CB . GLU 403 403 ? A 254.469 272.164 328.940 1 1 X GLU 0.750 1 ATOM 76 C CG . GLU 403 403 ? A 255.721 273.074 329.082 1 1 X GLU 0.750 1 ATOM 77 C CD . GLU 403 403 ? A 256.173 273.099 330.535 1 1 X GLU 0.750 1 ATOM 78 O OE1 . GLU 403 403 ? A 255.281 273.177 331.427 1 1 X GLU 0.750 1 ATOM 79 O OE2 . GLU 403 403 ? A 257.383 272.982 330.827 1 1 X GLU 0.750 1 ATOM 80 N N . TYR 404 404 ? A 252.910 269.298 328.552 1 1 X TYR 0.740 1 ATOM 81 C CA . TYR 404 404 ? A 251.784 268.379 328.641 1 1 X TYR 0.740 1 ATOM 82 C C . TYR 404 404 ? A 252.050 267.116 329.426 1 1 X TYR 0.740 1 ATOM 83 O O . TYR 404 404 ? A 251.187 266.678 330.187 1 1 X TYR 0.740 1 ATOM 84 C CB . TYR 404 404 ? A 251.226 268.019 327.246 1 1 X TYR 0.740 1 ATOM 85 C CG . TYR 404 404 ? A 250.490 269.172 326.605 1 1 X TYR 0.740 1 ATOM 86 C CD1 . TYR 404 404 ? A 249.946 270.277 327.298 1 1 X TYR 0.740 1 ATOM 87 C CD2 . TYR 404 404 ? A 250.320 269.116 325.217 1 1 X TYR 0.740 1 ATOM 88 C CE1 . TYR 404 404 ? A 249.271 271.293 326.610 1 1 X TYR 0.740 1 ATOM 89 C CE2 . TYR 404 404 ? A 249.630 270.124 324.536 1 1 X TYR 0.740 1 ATOM 90 C CZ . TYR 404 404 ? A 249.110 271.217 325.232 1 1 X TYR 0.740 1 ATOM 91 O OH . TYR 404 404 ? A 248.415 272.245 324.569 1 1 X TYR 0.740 1 ATOM 92 N N . GLN 405 405 ? 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A 240.373 260.160 352.395 1 1 X LYS 0.380 1 # # loop_ _atom_type.symbol C N O # # loop_ _ma_qa_metric.id _ma_qa_metric.name _ma_qa_metric.description _ma_qa_metric.type _ma_qa_metric.mode _ma_qa_metric.type_other_details _ma_qa_metric.software_group_id 1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5 2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].' 'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5 3 GMQE 'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.' 'normalized score' global . 6 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.689 2 1 3 0.016 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 395 PHE 1 0.330 2 1 A 396 ASN 1 0.360 3 1 A 397 ASP 1 0.570 4 1 A 398 PRO 1 0.630 5 1 A 399 GLU 1 0.630 6 1 A 400 ARG 1 0.600 7 1 A 401 ILE 1 0.690 8 1 A 402 ASP 1 0.730 9 1 A 403 GLU 1 0.750 10 1 A 404 TYR 1 0.740 11 1 A 405 GLN 1 0.770 12 1 A 406 ARG 1 0.720 13 1 A 407 GLN 1 0.790 14 1 A 408 LYS 1 0.790 15 1 A 409 ARG 1 0.740 16 1 A 410 LEU 1 0.800 17 1 A 411 GLU 1 0.800 18 1 A 412 TYR 1 0.790 19 1 A 413 GLU 1 0.810 20 1 A 414 ALA 1 0.870 21 1 A 415 ILE 1 0.800 22 1 A 416 GLN 1 0.820 23 1 A 417 ARG 1 0.730 24 1 A 418 THR 1 0.760 25 1 A 419 ASN 1 0.760 26 1 A 420 GLU 1 0.440 27 1 A 421 LYS 1 0.380 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #