data_SMR-8ba83b4fcac8cfd3aa273637519ba474_1 _entry.id SMR-8ba83b4fcac8cfd3aa273637519ba474_1 _struct.entry_id SMR-8ba83b4fcac8cfd3aa273637519ba474_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - Q9WTN3 (isoform 2)/ SRBP1_MOUSE, Sterol regulatory element-binding protein 1 Estimated model accuracy of this model is 0.033, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q9WTN3 (isoform 2)' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 133086.124 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SRBP1_MOUSE Q9WTN3 1 ;MDCTFEDMLQLINNQDSDFPGLFDAPYAGGETGDTGPSSPGANSPESFSSASLASSLEAFLGGPKPAAPQ PSPGTLLPPSFPAPPVQLSPAPVLGYSSLPSGFSGTLPGNTQQPPSSLPLAPAPGVLPTPALHTQVQSLA SQQPLPASAAPRTNTVTSQVQQVPVVLQPHFIKADSLLLTAVKTDAGATVKTAGISTLAPGTAVQAGPLQ TLVSGGTILATVPLVVDTDKLPIHRLAAGSKALGSAQSRGEKRTAHNAIEKRYRSSINDKIVELKDLVVG TEAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLTLRSAHKSKSLKDLVSACGSGGGTDVSMEGMKPEVVE TLTPPPSDAGSPSQSSPLSFGSRASSSGGSDSEPDSPAFEDSQVKAQRLPSHSRGMLDRSRLALCVLAFL CLTCNPLASLFGWGILTPSDATGTHRSSGRSMLEAESRDGSNWTQWLLPPLVWLANGLLVLACLALLFVY GEPVTRPHSGPAVHFWRHRKQADLDLARGDFPQAAQQLWLALQALGRPLPTSNLDLACSLLWNLIRHLLQ RLWVGRWLAGQAGGLLRDRGLRKDARASARDAAVVYHKLHQLHAMGKYTGGHLAASNLALSALNLAECAG DAISMATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQSGSVPLAMQWLCHPVGHRFFVDGDW AVHGAPPESLYSVAGNPVDPLAQVTRLFREHLLERALNCIAQPSPGAADGDREFSDALGYLQLLNSCSDA AGAPACSFSVSSSMAATTGPDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAERLYPLVEHIPQVLQDTERPLPRAA LYSFKAARALLDHRKVESSPASLAICEKASGYLRDSLASTPTGSSIDKAMQLLLCDLLLVARTSLWQRQQ SPASVQVAHGTSNGPQASALELRGFQHDLSSLRRLAQSFRPAMRRVFLHEATARLMAGASPARTHQLLDR SLRRRAGSSGKGGTTAELEPRPTWREHTEALLLASCYLPPAFLSAPGQRMSMLAEAARTVEKLGDHRLLL DCQQMLLRLGGGTTVTSS ; 'Sterol regulatory element-binding protein 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1068 1 1068 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . SRBP1_MOUSE Q9WTN3 Q9WTN3-2 1 1068 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2007-07-24 9229327B581AAAD2 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,B ;MDCTFEDMLQLINNQDSDFPGLFDAPYAGGETGDTGPSSPGANSPESFSSASLASSLEAFLGGPKPAAPQ PSPGTLLPPSFPAPPVQLSPAPVLGYSSLPSGFSGTLPGNTQQPPSSLPLAPAPGVLPTPALHTQVQSLA SQQPLPASAAPRTNTVTSQVQQVPVVLQPHFIKADSLLLTAVKTDAGATVKTAGISTLAPGTAVQAGPLQ TLVSGGTILATVPLVVDTDKLPIHRLAAGSKALGSAQSRGEKRTAHNAIEKRYRSSINDKIVELKDLVVG TEAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQENLTLRSAHKSKSLKDLVSACGSGGGTDVSMEGMKPEVVE TLTPPPSDAGSPSQSSPLSFGSRASSSGGSDSEPDSPAFEDSQVKAQRLPSHSRGMLDRSRLALCVLAFL CLTCNPLASLFGWGILTPSDATGTHRSSGRSMLEAESRDGSNWTQWLLPPLVWLANGLLVLACLALLFVY GEPVTRPHSGPAVHFWRHRKQADLDLARGDFPQAAQQLWLALQALGRPLPTSNLDLACSLLWNLIRHLLQ RLWVGRWLAGQAGGLLRDRGLRKDARASARDAAVVYHKLHQLHAMGKYTGGHLAASNLALSALNLAECAG 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GEPVTRPHSGPAVHFWRHRKQADLDLARGDFPQAAQQLWLALQALGRPLPTSNLDLACSLLWNLIRHLLQ RLWVGRWLAGQAGGLLRDRGLRKDARASARDAAVVYHKLHQLHAMGKYTGGHLAASNLALSALNLAECAG DAISMATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQSGSVPLAMQWLCHPVGHRFFVDGDW AVHGAPPESLYSVAGNPVDPLAQVTRLFREHLLERALNCIAQPSPGAADGDREFSDALGYLQLLNSCSDA AGAPACSFSVSSSMAATTGPDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAERLYPLVEHIPQVLQDTERPLPRAA LYSFKAARALLDHRKVESSPASLAICEKASGYLRDSLASTPTGSSIDKAMQLLLCDLLLVARTSLWQRQQ SPASVQVAHGTSNGPQASALELRGFQHDLSSLRRLAQSFRPAMRRVFLHEATARLMAGASPARTHQLLDR SLRRRAGSSGKGGTTAELEPRPTWREHTEALLLASCYLPPAFLSAPGQRMSMLAEAARTVEKLGDHRLLL DCQQMLLRLGGGTTVTSS ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ASP . 1 3 CYS . 1 4 THR . 1 5 PHE . 1 6 GLU . 1 7 ASP . 1 8 MET . 1 9 LEU . 1 10 GLN . 1 11 LEU . 1 12 ILE . 1 13 ASN . 1 14 ASN . 1 15 GLN . 1 16 ASP . 1 17 SER . 1 18 ASP . 1 19 PHE . 1 20 PRO . 1 21 GLY . 1 22 LEU . 1 23 PHE . 1 24 ASP . 1 25 ALA . 1 26 PRO . 1 27 TYR . 1 28 ALA . 1 29 GLY . 1 30 GLY . 1 31 GLU . 1 32 THR . 1 33 GLY . 1 34 ASP . 1 35 THR . 1 36 GLY . 1 37 PRO . 1 38 SER . 1 39 SER . 1 40 PRO . 1 41 GLY . 1 42 ALA . 1 43 ASN . 1 44 SER . 1 45 PRO . 1 46 GLU . 1 47 SER . 1 48 PHE . 1 49 SER . 1 50 SER . 1 51 ALA . 1 52 SER . 1 53 LEU . 1 54 ALA . 1 55 SER . 1 56 SER . 1 57 LEU . 1 58 GLU . 1 59 ALA . 1 60 PHE . 1 61 LEU . 1 62 GLY . 1 63 GLY . 1 64 PRO . 1 65 LYS . 1 66 PRO . 1 67 ALA . 1 68 ALA . 1 69 PRO . 1 70 GLN . 1 71 PRO . 1 72 SER . 1 73 PRO . 1 74 GLY . 1 75 THR . 1 76 LEU . 1 77 LEU . 1 78 PRO . 1 79 PRO . 1 80 SER . 1 81 PHE . 1 82 PRO . 1 83 ALA . 1 84 PRO . 1 85 PRO . 1 86 VAL . 1 87 GLN . 1 88 LEU . 1 89 SER . 1 90 PRO . 1 91 ALA . 1 92 PRO . 1 93 VAL . 1 94 LEU . 1 95 GLY . 1 96 TYR . 1 97 SER . 1 98 SER . 1 99 LEU . 1 100 PRO . 1 101 SER . 1 102 GLY . 1 103 PHE . 1 104 SER . 1 105 GLY . 1 106 THR . 1 107 LEU . 1 108 PRO . 1 109 GLY . 1 110 ASN . 1 111 THR . 1 112 GLN . 1 113 GLN . 1 114 PRO . 1 115 PRO . 1 116 SER . 1 117 SER . 1 118 LEU . 1 119 PRO . 1 120 LEU . 1 121 ALA . 1 122 PRO . 1 123 ALA . 1 124 PRO . 1 125 GLY . 1 126 VAL . 1 127 LEU . 1 128 PRO . 1 129 THR . 1 130 PRO . 1 131 ALA . 1 132 LEU . 1 133 HIS . 1 134 THR . 1 135 GLN . 1 136 VAL . 1 137 GLN . 1 138 SER . 1 139 LEU . 1 140 ALA . 1 141 SER . 1 142 GLN . 1 143 GLN . 1 144 PRO . 1 145 LEU . 1 146 PRO . 1 147 ALA . 1 148 SER . 1 149 ALA . 1 150 ALA . 1 151 PRO . 1 152 ARG . 1 153 THR . 1 154 ASN . 1 155 THR . 1 156 VAL . 1 157 THR . 1 158 SER . 1 159 GLN . 1 160 VAL . 1 161 GLN . 1 162 GLN . 1 163 VAL . 1 164 PRO . 1 165 VAL . 1 166 VAL . 1 167 LEU . 1 168 GLN . 1 169 PRO . 1 170 HIS . 1 171 PHE . 1 172 ILE . 1 173 LYS . 1 174 ALA . 1 175 ASP . 1 176 SER . 1 177 LEU . 1 178 LEU . 1 179 LEU . 1 180 THR . 1 181 ALA . 1 182 VAL . 1 183 LYS . 1 184 THR . 1 185 ASP . 1 186 ALA . 1 187 GLY . 1 188 ALA . 1 189 THR . 1 190 VAL . 1 191 LYS . 1 192 THR . 1 193 ALA . 1 194 GLY . 1 195 ILE . 1 196 SER . 1 197 THR . 1 198 LEU . 1 199 ALA . 1 200 PRO . 1 201 GLY 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B 1 881 PRO 881 ? ? ? B . B 1 882 THR 882 ? ? ? B . B 1 883 GLY 883 ? ? ? B . B 1 884 SER 884 ? ? ? B . B 1 885 SER 885 ? ? ? B . B 1 886 ILE 886 ? ? ? B . B 1 887 ASP 887 ? ? ? B . B 1 888 LYS 888 ? ? ? B . B 1 889 ALA 889 ? ? ? B . B 1 890 MET 890 ? ? ? B . B 1 891 GLN 891 ? ? ? B . B 1 892 LEU 892 ? ? ? B . B 1 893 LEU 893 ? ? ? B . B 1 894 LEU 894 ? ? ? B . B 1 895 CYS 895 ? ? ? B . B 1 896 ASP 896 ? ? ? B . B 1 897 LEU 897 ? ? ? B . B 1 898 LEU 898 ? ? ? B . B 1 899 LEU 899 ? ? ? B . B 1 900 VAL 900 ? ? ? B . B 1 901 ALA 901 ? ? ? B . B 1 902 ARG 902 ? ? ? B . B 1 903 THR 903 ? ? ? B . B 1 904 SER 904 ? ? ? B . B 1 905 LEU 905 ? ? ? B . B 1 906 TRP 906 ? ? ? B . B 1 907 GLN 907 ? ? ? B . B 1 908 ARG 908 ? ? ? B . B 1 909 GLN 909 ? ? ? B . B 1 910 GLN 910 ? ? ? B . B 1 911 SER 911 ? ? ? B . B 1 912 PRO 912 ? ? ? B . B 1 913 ALA 913 ? ? ? B . B 1 914 SER 914 ? ? ? B . B 1 915 VAL 915 ? ? ? B . B 1 916 GLN 916 ? ? ? B . B 1 917 VAL 917 ? ? ? B . B 1 918 ALA 918 ? ? ? B . B 1 919 HIS 919 ? ? ? B . B 1 920 GLY 920 ? ? ? B . B 1 921 THR 921 ? ? ? B . B 1 922 SER 922 ? ? ? B . B 1 923 ASN 923 ? ? ? B . B 1 924 GLY 924 ? ? ? B . B 1 925 PRO 925 ? ? ? B . B 1 926 GLN 926 ? ? ? B . B 1 927 ALA 927 ? ? ? B . B 1 928 SER 928 ? ? ? B . B 1 929 ALA 929 ? ? ? B . B 1 930 LEU 930 ? ? ? B . B 1 931 GLU 931 ? ? ? B . B 1 932 LEU 932 ? ? ? B . B 1 933 ARG 933 ? ? ? B . B 1 934 GLY 934 ? ? ? B . B 1 935 PHE 935 ? ? ? B . B 1 936 GLN 936 ? ? ? B . B 1 937 HIS 937 ? ? ? B . B 1 938 ASP 938 ? ? ? B . B 1 939 LEU 939 ? ? ? B . B 1 940 SER 940 ? ? ? B . B 1 941 SER 941 ? ? ? B . B 1 942 LEU 942 ? ? ? B . B 1 943 ARG 943 ? ? ? B . B 1 944 ARG 944 ? ? ? B . B 1 945 LEU 945 ? ? ? B . B 1 946 ALA 946 ? ? ? B . B 1 947 GLN 947 ? ? ? B . B 1 948 SER 948 ? ? ? B . B 1 949 PHE 949 ? ? ? B . B 1 950 ARG 950 ? ? ? B . B 1 951 PRO 951 ? ? ? B . B 1 952 ALA 952 ? ? ? B . B 1 953 MET 953 ? ? ? B . B 1 954 ARG 954 ? ? ? B . B 1 955 ARG 955 ? ? ? B . B 1 956 VAL 956 ? ? ? B . B 1 957 PHE 957 ? ? ? B . B 1 958 LEU 958 ? ? ? B . B 1 959 HIS 959 ? ? ? B . B 1 960 GLU 960 ? ? ? B . B 1 961 ALA 961 ? ? ? B . B 1 962 THR 962 ? ? ? B . B 1 963 ALA 963 ? ? ? B . B 1 964 ARG 964 ? ? ? B . B 1 965 LEU 965 ? ? ? B . B 1 966 MET 966 ? ? ? B . B 1 967 ALA 967 ? ? ? B . B 1 968 GLY 968 ? ? ? B . B 1 969 ALA 969 ? ? ? B . B 1 970 SER 970 ? ? ? B . B 1 971 PRO 971 ? ? ? B . B 1 972 ALA 972 ? ? ? B . B 1 973 ARG 973 ? ? ? B . B 1 974 THR 974 ? ? ? B . B 1 975 HIS 975 ? ? ? B . B 1 976 GLN 976 ? ? ? B . B 1 977 LEU 977 ? ? ? B . B 1 978 LEU 978 ? ? ? B . B 1 979 ASP 979 ? ? ? B . B 1 980 ARG 980 ? ? ? B . B 1 981 SER 981 ? ? ? B . B 1 982 LEU 982 ? ? ? B . B 1 983 ARG 983 ? ? ? B . B 1 984 ARG 984 ? ? ? B . B 1 985 ARG 985 ? ? ? B . B 1 986 ALA 986 ? ? ? B . B 1 987 GLY 987 ? ? ? B . B 1 988 SER 988 ? ? ? B . B 1 989 SER 989 ? ? ? B . B 1 990 GLY 990 ? ? ? B . B 1 991 LYS 991 ? ? ? B . B 1 992 GLY 992 ? ? ? B . B 1 993 GLY 993 ? ? ? B . B 1 994 THR 994 ? ? ? B . B 1 995 THR 995 ? ? ? B . B 1 996 ALA 996 ? ? ? B . B 1 997 GLU 997 ? ? ? B . B 1 998 LEU 998 ? ? ? B . B 1 999 GLU 999 ? ? ? B . B 1 1000 PRO 1000 ? ? ? B . B 1 1001 ARG 1001 ? ? ? B . B 1 1002 PRO 1002 ? ? ? B . B 1 1003 THR 1003 ? ? ? B . B 1 1004 TRP 1004 ? ? ? B . B 1 1005 ARG 1005 ? ? ? B . B 1 1006 GLU 1006 ? ? ? B . B 1 1007 HIS 1007 ? ? ? B . B 1 1008 THR 1008 ? ? ? B . B 1 1009 GLU 1009 ? ? ? B . B 1 1010 ALA 1010 ? ? ? B . B 1 1011 LEU 1011 ? ? ? B . B 1 1012 LEU 1012 ? ? ? B . B 1 1013 LEU 1013 ? ? ? B . B 1 1014 ALA 1014 ? ? ? B . B 1 1015 SER 1015 ? ? ? B . B 1 1016 CYS 1016 ? ? ? B . B 1 1017 TYR 1017 ? ? ? B . B 1 1018 LEU 1018 ? ? ? B . B 1 1019 PRO 1019 ? ? ? B . B 1 1020 PRO 1020 ? ? ? B . B 1 1021 ALA 1021 ? ? ? B . B 1 1022 PHE 1022 ? ? ? B . B 1 1023 LEU 1023 ? ? ? B . B 1 1024 SER 1024 ? ? ? B . B 1 1025 ALA 1025 ? ? ? B . B 1 1026 PRO 1026 ? ? ? B . B 1 1027 GLY 1027 ? ? ? B . B 1 1028 GLN 1028 ? ? ? B . B 1 1029 ARG 1029 ? ? ? B . B 1 1030 MET 1030 ? ? ? B . B 1 1031 SER 1031 ? ? ? B . B 1 1032 MET 1032 ? ? ? B . B 1 1033 LEU 1033 ? ? ? B . B 1 1034 ALA 1034 ? ? ? B . B 1 1035 GLU 1035 ? ? ? B . B 1 1036 ALA 1036 ? ? ? B . B 1 1037 ALA 1037 ? ? ? B . B 1 1038 ARG 1038 ? ? ? B . B 1 1039 THR 1039 ? ? ? B . B 1 1040 VAL 1040 ? ? ? B . B 1 1041 GLU 1041 ? ? ? B . B 1 1042 LYS 1042 ? ? ? B . B 1 1043 LEU 1043 ? ? ? B . B 1 1044 GLY 1044 ? ? ? B . B 1 1045 ASP 1045 ? ? ? B . B 1 1046 HIS 1046 ? ? ? B . B 1 1047 ARG 1047 ? ? ? B . B 1 1048 LEU 1048 ? ? ? B . B 1 1049 LEU 1049 ? ? ? B . B 1 1050 LEU 1050 ? ? ? B . B 1 1051 ASP 1051 ? ? ? B . B 1 1052 CYS 1052 ? ? ? B . B 1 1053 GLN 1053 ? ? ? B . B 1 1054 GLN 1054 ? ? ? B . B 1 1055 MET 1055 ? ? ? B . B 1 1056 LEU 1056 ? ? ? B . B 1 1057 LEU 1057 ? ? ? B . B 1 1058 ARG 1058 ? ? ? B . B 1 1059 LEU 1059 ? ? ? B . B 1 1060 GLY 1060 ? ? ? B . B 1 1061 GLY 1061 ? ? ? B . B 1 1062 GLY 1062 ? ? ? B . B 1 1063 THR 1063 ? ? ? B . B 1 1064 THR 1064 ? ? ? B . B 1 1065 VAL 1065 ? ? ? B . B 1 1066 THR 1066 ? ? ? B . B 1 1067 SER 1067 ? ? ? B . B 1 1068 SER 1068 ? ? ? B . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'MICROPHTHALMIA-ASSOCIATED TRANSCRIPTION FACTOR {PDB ID=4atk, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=4atk.1.A}' 'template structure' . 2 'MICROPHTHALMIA-ASSOCIATED TRANSCRIPTION FACTOR {PDB ID=4atk, label_asym_id=B, auth_asym_id=B, SMTL ID=4atk.1.B}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by BLAST to 4atk, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by BLAST to 4atk, label_asym_id=B' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 B B 1 1 B # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;ANIKRELTACIFPTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILK ASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHLLLRVQELEMQARAHG ; ;ANIKRELTACIFPTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILK ASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHLLLRVQELEMQARAHG ; 2 ;ANIKRELTACIFPTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILK ASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHLLLRVQELEMQARAHG ; ;ANIKRELTACIFPTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILK ASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHLLLRVQELEMQARAHG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 16 103 2 2 16 103 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 4atk 2023-12-20 2 PDB . 4atk 2023-12-20 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1068 2 2 B 1 1068 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 1072 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 1072 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 7.39e-08 39.286 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'BLAST e-value' . 7.39e-08 39.286 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MDCTFEDMLQLINNQDSDFPGLFDAPYAGGETGDTGPSSPGANSPESFSSASLASSLEAFLGGPKPAAPQPSPGTLLPPSFPAPPVQLSPAPVLGYSSLPSGFSGTLPGNTQQPPSSLPLAPAPGVLPTPALHTQVQSLASQQPLPASAAPRTNTVTSQVQQVPVVLQPHFIKADSLLLTAVKTDAGATVKTAGISTLAPGTAVQAGPLQTLVSGGTILATVPLVVDTDKLPIHRLAAGSKALGSAQSRGEKRTAHNAIEKRYRSSINDKIVELKDLVVGT---EAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQ-ENLTLRSAHKSKSLKDLVSACGSGGGTDVSMEGMKPEVVETLTPPPSDAGSPSQSSPLSFGSRASSSGGSDSEPDSPAFEDSQVKAQRLPSHSRGMLDRSRLALCVLAFLCLTCNPLASLFGWGILTPSDATGTHRSSGRSMLEAESRDGSNWTQWLLPPLVWLANGLLVLACLALLFVYGEPVTRPHSGPAVHFWRHRKQADLDLARGDFPQAAQQLWLALQALGRPLPTSNLDLACSLLWNLIRHLLQRLWVGRWLAGQAGGLLRDRGLRKDARASARDAAVVYHKLHQLHAMGKYTGGHLAASNLALSALNLAECAGDAISMATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQSGSVPLAMQWLCHPVGHRFFVDGDWAVHGAPPESLYSVAGNPVDPLAQVTRLFREHLLERALNCIAQPSPGAADGDREFSDALGYLQLLNSCSDAAGAPACSFSVSSSMAATTGPDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAERLYPLVEHIPQVLQDTERPLPRAALYSFKAARALLDHRKVESSPASLAICEKASGYLRDSLASTPTGSSIDKAMQLLLCDLLLVARTSLWQRQQSPASVQVAHGTSNGPQASALELRGFQHDLSSLRRLAQSFRPAMRRVFLHEATARLMAGASPARTHQLLDRSLRRRAGSSGKGGTTAELEPRPTWREHTEALLLASCYLPPAFLSAPGQRMSMLAEAARTVEKLGDHRLLLDCQQMLLRLGGGTTVTSS 2 1 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SEARALAKER-QKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILKASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 3 2 1 MDCTFEDMLQLINNQDSDFPGLFDAPYAGGETGDTGPSSPGANSPESFSSASLASSLEAFLGGPKPAAPQPSPGTLLPPSFPAPPVQLSPAPVLGYSSLPSGFSGTLPGNTQQPPSSLPLAPAPGVLPTPALHTQVQSLASQQPLPASAAPRTNTVTSQVQQVPVVLQPHFIKADSLLLTAVKTDAGATVKTAGISTLAPGTAVQAGPLQTLVSGGTILATVPLVVDTDKLPIHRLAAGSKALGSAQSRGEKRTAHNAIEKRYRSSINDKIVELKDLVVGT---EAKLNKSAVLRKAIDYIRFLQHSNQKLKQ-ENLTLRSAHKSKSLKDLVSACGSGGGTDVSMEGMKPEVVETLTPPPSDAGSPSQSSPLSFGSRASSSGGSDSEPDSPAFEDSQVKAQRLPSHSRGMLDRSRLALCVLAFLCLTCNPLASLFGWGILTPSDATGTHRSSGRSMLEAESRDGSNWTQWLLPPLVWLANGLLVLACLALLFVYGEPVTRPHSGPAVHFWRHRKQADLDLARGDFPQAAQQLWLALQALGRPLPTSNLDLACSLLWNLIRHLLQRLWVGRWLAGQAGGLLRDRGLRKDARASARDAAVVYHKLHQLHAMGKYTGGHLAASNLALSALNLAECAGDAISMATLAEIYVAAALRVKTSLPRALHFLTRFFLSSARQACLAQSGSVPLAMQWLCHPVGHRFFVDGDWAVHGAPPESLYSVAGNPVDPLAQVTRLFREHLLERALNCIAQPSPGAADGDREFSDALGYLQLLNSCSDAAGAPACSFSVSSSMAATTGPDPVAKWWASLTAVVIHWLRRDEEAAERLYPLVEHIPQVLQDTERPLPRAALYSFKAARALLDHRKVESSPASLAICEKASGYLRDSLASTPTGSSIDKAMQLLLCDLLLVARTSLWQRQQSPASVQVAHGTSNGPQASALELRGFQHDLSSLRRLAQSFRPAMRRVFLHEATARLMAGASPARTHQLLDRSLRRRAGSSGKGGTTAELEPRPTWREHTEALLLASCYLPPAFLSAPGQRMSMLAEAARTVEKLGDHRLLLDCQQMLLRLGGGTTVTSS 4 2 2 -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------SEARALAKER-QKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILKASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHL------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.413}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 4atk.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . THR 254 254 ? A 19.263 19.291 29.964 1 1 A THR 0.440 1 ATOM 2 C CA . THR 254 254 ? A 19.607 17.837 29.739 1 1 A THR 0.440 1 ATOM 3 C C . THR 254 254 ? A 21.079 17.657 29.393 1 1 A THR 0.440 1 ATOM 4 O O . THR 254 254 ? A 21.475 17.931 28.270 1 1 A THR 0.440 1 ATOM 5 C CB . THR 254 254 ? A 18.733 17.291 28.597 1 1 A THR 0.440 1 ATOM 6 O OG1 . THR 254 254 ? A 18.744 18.151 27.450 1 1 A THR 0.440 1 ATOM 7 C CG2 . THR 254 254 ? A 17.263 17.182 29.039 1 1 A THR 0.440 1 ATOM 8 N N . ALA 255 255 ? A 21.952 17.222 30.343 1 1 A ALA 0.450 1 ATOM 9 C CA . ALA 255 255 ? A 23.389 17.153 30.104 1 1 A ALA 0.450 1 ATOM 10 C C . ALA 255 255 ? A 23.797 16.173 29.001 1 1 A ALA 0.450 1 ATOM 11 O O . ALA 255 255 ? A 24.536 16.521 28.086 1 1 A ALA 0.450 1 ATOM 12 C CB . ALA 255 255 ? A 24.084 16.779 31.434 1 1 A ALA 0.450 1 ATOM 13 N N . HIS 256 256 ? A 23.252 14.940 29.042 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 14 C CA . HIS 256 256 ? A 23.549 13.888 28.075 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 15 C C . HIS 256 256 ? A 23.067 14.176 26.646 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 16 O O . HIS 256 256 ? A 23.794 14.079 25.657 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 17 C CB . HIS 256 256 ? A 22.920 12.548 28.550 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 18 C CG . HIS 256 256 ? A 23.622 11.328 28.060 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 19 N ND1 . HIS 256 256 ? A 24.510 11.466 27.038 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 20 C CD2 . HIS 256 256 ? A 23.520 10.017 28.425 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 21 C CE1 . HIS 256 256 ? A 24.944 10.254 26.767 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 22 N NE2 . HIS 256 256 ? A 24.374 9.343 27.585 1 1 A HIS 0.590 1 ATOM 23 N N . ASN 257 257 ? A 21.811 14.633 26.510 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 24 C CA . ASN 257 257 ? A 21.148 14.830 25.227 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 25 C C . ASN 257 257 ? A 21.873 15.808 24.290 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 26 O O . ASN 257 257 ? A 21.901 15.629 23.075 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 27 C CB . ASN 257 257 ? A 19.693 15.343 25.426 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 28 C CG . ASN 257 257 ? A 18.804 14.370 26.197 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 29 O OD1 . ASN 257 257 ? A 19.195 13.251 26.531 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 30 N ND2 . ASN 257 257 ? A 17.566 14.805 26.539 1 1 A ASN 0.660 1 ATOM 31 N N . ALA 258 258 ? A 22.449 16.879 24.865 1 1 A ALA 0.660 1 ATOM 32 C CA . ALA 258 258 ? A 23.314 17.824 24.187 1 1 A ALA 0.660 1 ATOM 33 C C . ALA 258 258 ? A 24.679 17.261 23.842 1 1 A ALA 0.660 1 ATOM 34 O O . ALA 258 258 ? A 25.235 17.644 22.798 1 1 A ALA 0.660 1 ATOM 35 C CB . ALA 258 258 ? A 23.559 19.066 25.054 1 1 A ALA 0.660 1 ATOM 36 N N . ILE 259 259 ? A 25.283 16.388 24.633 1 1 A ILE 0.630 1 ATOM 37 C CA . ILE 259 259 ? A 26.544 15.722 24.309 1 1 A ILE 0.630 1 ATOM 38 C C . ILE 259 259 ? A 26.378 14.721 23.160 1 1 A ILE 0.630 1 ATOM 39 O O . ILE 259 259 ? A 27.188 14.708 22.231 1 1 A ILE 0.630 1 ATOM 40 C CB . ILE 259 259 ? A 27.343 15.136 25.473 1 1 A ILE 0.630 1 ATOM 41 C CG1 . ILE 259 259 ? A 27.354 16.072 26.718 1 1 A ILE 0.630 1 ATOM 42 C CG2 . ILE 259 259 ? A 28.743 14.741 24.940 1 1 A ILE 0.630 1 ATOM 43 C CD1 . ILE 259 259 ? A 28.648 16.822 27.038 1 1 A ILE 0.630 1 ATOM 44 N N . GLU 260 260 ? A 25.300 13.925 23.133 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 45 C CA . GLU 260 260 ? A 24.983 13.036 22.034 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 46 C C . GLU 260 260 ? A 24.437 13.752 20.801 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 47 O O . GLU 260 260 ? A 24.581 13.285 19.678 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 48 C CB . GLU 260 260 ? A 24.009 11.933 22.489 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 49 C CG . GLU 260 260 ? A 24.600 11.073 23.626 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 50 C CD . GLU 260 260 ? A 25.876 10.375 23.173 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 51 O OE1 . GLU 260 260 ? A 25.773 9.420 22.364 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 52 O OE2 . GLU 260 260 ? A 26.967 10.824 23.616 1 1 A GLU 0.720 1 ATOM 53 N N . LYS 261 261 ? A 23.873 14.966 20.965 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 54 C CA . LYS 261 261 ? A 23.578 15.880 19.863 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 55 C C . LYS 261 261 ? A 24.824 16.262 19.065 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 56 O O . LYS 261 261 ? A 24.791 16.351 17.838 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 57 C CB . LYS 261 261 ? A 22.942 17.197 20.374 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 58 C CG . LYS 261 261 ? A 22.505 18.228 19.311 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 59 C CD . LYS 261 261 ? A 22.037 19.546 19.956 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 60 C CE . LYS 261 261 ? A 21.685 20.611 18.915 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 61 N NZ . LYS 261 261 ? A 21.187 21.847 19.561 1 1 A LYS 0.720 1 ATOM 62 N N . ARG 262 262 ? A 25.945 16.488 19.774 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 63 C CA . ARG 262 262 ? A 27.276 16.694 19.218 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 64 C C . ARG 262 262 ? A 27.868 15.457 18.573 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 65 O O . ARG 262 262 ? A 28.554 15.533 17.555 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 66 C CB . ARG 262 262 ? A 28.330 17.132 20.250 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 67 C CG . ARG 262 262 ? A 27.980 18.377 21.072 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 68 C CD . ARG 262 262 ? A 28.501 18.283 22.510 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 69 N NE . ARG 262 262 ? A 29.678 19.190 22.688 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 70 C CZ . ARG 262 262 ? A 30.610 19.026 23.638 1 1 A ARG 0.680 1 ATOM 71 N NH1 . ARG 262 262 ? 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A 26.034 13.144 17.125 1 1 A ARG 0.710 1 ATOM 86 C CA . ARG 264 264 ? A 25.291 13.078 15.884 1 1 A ARG 0.710 1 ATOM 87 C C . ARG 264 264 ? A 25.554 14.112 14.819 1 1 A ARG 0.710 1 ATOM 88 O O . ARG 264 264 ? A 25.505 13.764 13.631 1 1 A ARG 0.710 1 ATOM 89 C CB . ARG 264 264 ? A 23.786 13.096 16.136 1 1 A ARG 0.710 1 ATOM 90 C CG . ARG 264 264 ? A 23.248 11.946 16.999 1 1 A ARG 0.710 1 ATOM 91 C CD . ARG 264 264 ? A 23.937 10.585 16.857 1 1 A ARG 0.710 1 ATOM 92 N NE . ARG 264 264 ? A 22.906 9.561 16.526 1 1 A ARG 0.710 1 ATOM 93 C CZ . ARG 264 264 ? A 22.678 9.078 15.298 1 1 A ARG 0.710 1 ATOM 94 N NH1 . ARG 264 264 ? A 23.340 9.534 14.233 1 1 A ARG 0.710 1 ATOM 95 N NH2 . ARG 264 264 ? A 21.727 8.154 15.137 1 1 A ARG 0.710 1 ATOM 96 N N . SER 265 265 ? A 25.782 15.369 15.190 1 1 A SER 0.780 1 ATOM 97 C CA . SER 265 265 ? A 26.167 16.418 14.259 1 1 A SER 0.780 1 ATOM 98 C C . SER 265 265 ? A 27.497 16.039 13.600 1 1 A SER 0.780 1 ATOM 99 O O . SER 265 265 ? 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'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.642 2 1 3 0.033 3 1 4 0.413 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 254 THR 1 0.440 2 1 A 255 ALA 1 0.450 3 1 A 256 HIS 1 0.590 4 1 A 257 ASN 1 0.660 5 1 A 258 ALA 1 0.660 6 1 A 259 ILE 1 0.630 7 1 A 260 GLU 1 0.720 8 1 A 261 LYS 1 0.720 9 1 A 262 ARG 1 0.680 10 1 A 263 TYR 1 0.710 11 1 A 264 ARG 1 0.710 12 1 A 265 SER 1 0.780 13 1 A 266 SER 1 0.790 14 1 A 267 ILE 1 0.770 15 1 A 268 ASN 1 0.770 16 1 A 269 ASP 1 0.780 17 1 A 270 LYS 1 0.720 18 1 A 271 ILE 1 0.730 19 1 A 272 VAL 1 0.710 20 1 A 273 GLU 1 0.740 21 1 A 274 LEU 1 0.740 22 1 A 275 LYS 1 0.660 23 1 A 276 ASP 1 0.690 24 1 A 277 LEU 1 0.730 25 1 A 278 VAL 1 0.680 26 1 A 279 VAL 1 0.320 27 1 A 280 GLY 1 0.360 28 1 A 281 THR 1 0.340 29 1 A 282 GLU 1 0.450 30 1 A 283 ALA 1 0.380 31 1 A 284 LYS 1 0.330 32 1 A 285 LEU 1 0.490 33 1 A 286 ASN 1 0.710 34 1 A 287 LYS 1 0.730 35 1 A 288 SER 1 0.690 36 1 A 289 ALA 1 0.630 37 1 A 290 VAL 1 0.730 38 1 A 291 LEU 1 0.750 39 1 A 292 ARG 1 0.650 40 1 A 293 LYS 1 0.620 41 1 A 294 ALA 1 0.760 42 1 A 295 ILE 1 0.730 43 1 A 296 ASP 1 0.670 44 1 A 297 TYR 1 0.700 45 1 A 298 ILE 1 0.740 46 1 A 299 ARG 1 0.630 47 1 A 300 PHE 1 0.620 48 1 A 301 LEU 1 0.670 49 1 A 302 GLN 1 0.620 50 1 A 303 HIS 1 0.660 51 1 A 304 SER 1 0.630 52 1 A 305 ASN 1 0.680 53 1 A 306 GLN 1 0.610 54 1 A 307 LYS 1 0.650 55 1 A 308 LEU 1 0.720 56 1 A 309 LYS 1 0.700 57 1 A 310 GLN 1 0.560 58 1 A 311 GLU 1 0.510 59 1 B 252 LYS 1 0.450 60 1 B 253 ARG 1 0.410 61 1 B 254 THR 1 0.630 62 1 B 255 ALA 1 0.660 63 1 B 256 HIS 1 0.600 64 1 B 257 ASN 1 0.680 65 1 B 258 ALA 1 0.690 66 1 B 259 ILE 1 0.680 67 1 B 260 GLU 1 0.710 68 1 B 261 LYS 1 0.740 69 1 B 262 ARG 1 0.700 70 1 B 263 TYR 1 0.720 71 1 B 264 ARG 1 0.720 72 1 B 265 SER 1 0.780 73 1 B 266 SER 1 0.780 74 1 B 267 ILE 1 0.770 75 1 B 268 ASN 1 0.770 76 1 B 269 ASP 1 0.750 77 1 B 270 LYS 1 0.730 78 1 B 271 ILE 1 0.720 79 1 B 272 VAL 1 0.670 80 1 B 273 GLU 1 0.720 81 1 B 274 LEU 1 0.750 82 1 B 275 LYS 1 0.670 83 1 B 276 ASP 1 0.690 84 1 B 277 LEU 1 0.730 85 1 B 278 VAL 1 0.640 86 1 B 279 VAL 1 0.350 87 1 B 280 GLY 1 0.380 88 1 B 281 THR 1 0.350 89 1 B 282 GLU 1 0.310 90 1 B 283 ALA 1 0.410 91 1 B 284 LYS 1 0.330 92 1 B 285 LEU 1 0.590 93 1 B 286 ASN 1 0.670 94 1 B 287 LYS 1 0.710 95 1 B 288 SER 1 0.720 96 1 B 289 ALA 1 0.640 97 1 B 290 VAL 1 0.700 98 1 B 291 LEU 1 0.720 99 1 B 292 ARG 1 0.640 100 1 B 293 LYS 1 0.620 101 1 B 294 ALA 1 0.750 102 1 B 295 ILE 1 0.730 103 1 B 296 ASP 1 0.700 104 1 B 297 TYR 1 0.680 105 1 B 298 ILE 1 0.710 106 1 B 299 ARG 1 0.670 107 1 B 300 PHE 1 0.660 108 1 B 301 LEU 1 0.670 109 1 B 302 GLN 1 0.630 110 1 B 303 HIS 1 0.660 111 1 B 304 SER 1 0.600 112 1 B 305 ASN 1 0.650 113 1 B 306 GLN 1 0.570 114 1 B 307 LYS 1 0.570 115 1 B 308 LEU 1 0.600 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #