data_SMR-817ebab71607bf7053cbf1c357933444_2
_entry.id SMR-817ebab71607bf7053cbf1c357933444_2
_struct.entry_id SMR-817ebab71607bf7053cbf1c357933444_2
_struct.pdbx_model_details
;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries:

  - Q80TD3/ FNIP2_MOUSE, Folliculin-interacting protein 2

Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE).
;
_struct.pdbx_structure_determination_methodology computational
_struct.title 'Model for UniProtKB entries Q80TD3'
_audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic
_audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic
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_citation.title
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_citation.page_last
_citation.year
_citation.pdbx_database_id_PubMed
_citation.pdbx_database_id_DOI
primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality'
'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132
2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes'
'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427
3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1)
1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667
4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation'
Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828
5
'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology'
'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579
10.1107/S0907444913007051
6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500
10.1186/1471-2105-10-421
7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation'
'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7
#
#
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_citation_author.citation_id
_citation_author.name
_citation_author.ordinal
primary 'Bienert, S.' 1
primary 'Waterhouse, A.' 2
primary 'de Beer, T.A.P.' 3
primary 'Tauriello, G.' 4
primary 'Studer, G.' 5
primary 'Bordoli, L.' 6
primary 'Schwede, T.' 7
2 'Waterhouse, A.' 8
2 'Bertoni, M.' 9
2 'Bienert, S.' 10
2 'Studer, G.' 11
2 'Tauriello, G.' 12
2 'Gumienny, R.' 13
2 'Heer, F.T.' 14
2 'de Beer, T.A.P.' 15
2 'Rempfer, C.' 16
2 'Bordoli, L.' 17
2 'Lepore, R.' 18
2 'Schwede, T.' 19
3 'Studer, G.' 20
3 'Tauriello, G.' 21
3 'Bienert, S.' 22
3 'Biasini, M.' 23
3 'Johner, N.' 24
3 'Schwede, T.' 25
4 'Studer, G.' 26
4 'Rempfer, C.' 27
4 'Waterhouse, A.M.' 28
4 'Gumienny, R.' 29
4 'Haas, J.' 30
4 'Schwede, T.' 31
5 'Biasini, M.' 32
5 'Schmidt, T.' 33
5 'Bienert, S.' 34
5 'Mariani, V.' 35
5 'Studer, G.' 36
5 'Haas, J.' 37
5 'Johner, N.' 38
5 'Schenk, A.D.' 39
5 'Philippsen, A.' 40
5 'Schwede, T.' 41
6 'Camacho, C.' 42
6 'Coulouris, G.' 43
6 'Avagyan, V.' 44
6 'Ma, N.' 45
6 'Papadopoulos, J.' 46
6 'Bealer, K.' 47
6 'Madden, T.L.' 48
7 'Steinegger, M.' 49
7 'Meier, M.' 50
7 'Mirdita, M.' 51
7 'Vohringer, H.' 52
7 'Haunsberger, S.J.' 53
7 'Soding, J.' 54
#
#
loop_
_software.pdbx_ordinal
_software.name
_software.classification
_software.description
_software.version
_software.type
_software.location
_software.citation_id
1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service'
3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2
2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library
https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3
3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1
library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4
4 OpenStructure 'data processing'
'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package
https://openstructure.org/ 5
5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6
6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0
package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7
#
#
loop_
_ma_software_group.ordinal_id
_ma_software_group.group_id
_ma_software_group.software_id
_ma_software_group.parameter_group_id
1 1 6 .
2 2 1 .
3 2 4 .
4 2 5 .
5 2 6 .
6 3 1 .
7 3 4 .
8 4 1 .
9 4 2 .
10 4 4 .
11 5 3 .
12 6 1 .
13 6 3 .
14 6 4 .
#
#
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_audit_author.name
_audit_author.pdbx_ordinal
'Bienert, S.' 1
'Waterhouse, A.' 2
'de Beer, T.A.P.' 3
'Tauriello, G.' 4
'Studer, G.' 5
'Bordoli, L.' 6
'Schwede, T.' 7
#
#
loop_
_chem_comp.id
_chem_comp.type
_chem_comp.name
_chem_comp.formula
_chem_comp.formula_weight
_chem_comp.ma_provenance
ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core'
ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core'
ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core'
ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core'
CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core'
GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core'
GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core'
GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core'
HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core'
ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core'
LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core'
MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core'
PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core'
PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core'
SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core'
THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core'
TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core'
TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core'
VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core'
#
#
loop_
_entity.id
_entity.type
_entity.src_method
_entity.pdbx_description
_entity.formula_weight
_entity.pdbx_number_of_molecules
_entity.details
1 polymer man . 142610.227 1 .
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#
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_struct_ref.db_name
_struct_ref.db_code
_struct_ref.pdbx_db_accession
_struct_ref.pdbx_align_begin
_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code
_struct_ref.details
1 1 UNP FNIP2_MOUSE Q80TD3 1
;MAPTLLQKLFNKRGGGAASAQARPPKEEPAFSWSCSEFGLSDIRLLVYQDCERRGRQVMFDSRAVQKMEE
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;
'Folliculin-interacting protein 2'
#
#
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_struct_ref_seq.align_id
_struct_ref_seq.ref_id
_struct_ref_seq.seq_align_beg
_struct_ref_seq.seq_align_end
_struct_ref_seq.db_align_beg
_struct_ref_seq.db_align_end
1 1 1 1108 1 1108
#
#
loop_
_ma_target_ref_db_details.target_entity_id
_ma_target_ref_db_details.db_name
_ma_target_ref_db_details.db_name_other_details
_ma_target_ref_db_details.db_code
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_ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin
_ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end
_ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id
_ma_target_ref_db_details.organism_scientific
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date
_ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum
1 UNP . FNIP2_MOUSE Q80TD3 . 1 1108 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2008-02-26
4B54789BF8D3357A
#
#
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_entity_poly.entity_id
_entity_poly.type
_entity_poly.nstd_linkage
_entity_poly.nstd_monomer
_entity_poly.pdbx_strand_id
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code
_entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
1 polypeptide(L) no no A
;MAPTLLQKLFNKRGGGAASAQARPPKEEPAFSWSCSEFGLSDIRLLVYQDCERRGRQVMFDSRAVQKMEE
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;

;MAPTLLQKLFNKRGGGAASAQARPPKEEPAFSWSCSEFGLSDIRLLVYQDCERRGRQVMFDSRAVQKMEE
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;

#
#
loop_
_entity_poly_seq.entity_id
_entity_poly_seq.num
_entity_poly_seq.mon_id
_entity_poly_seq.hetero
1 1 MET .
1 2 ALA .
1 3 PRO .
1 4 THR .
1 5 LEU .
1 6 LEU .
1 7 GLN .
1 8 LYS .
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1 11 ASN .
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1 15 GLY .
1 16 GLY .
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1 18 ALA .
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1 25 PRO .
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1 28 GLU .
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1 46 LEU .
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1 54 ARG .
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1 64 ALA .
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1 88 CYS .
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1 181 ASN .
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1 1040 LEU .
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1 1048 HIS .
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1 1055 GLU .
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1 1098 THR .
1 1099 HIS .
1 1100 SER .
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1 1102 TYR .
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#
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A 1 .
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A 1 788 GLY 788 ? ? ? A .
A 1 789 GLU 789 ? ? ? A .
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A 1 1102 TYR 1102 ? ? ? A .
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A 1 1105 GLN 1105 ? ? ? A .
A 1 1106 ILE 1106 ? ? ? A .
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#
#
loop_
_ma_data.id
_ma_data.name
_ma_data.content_type
_ma_data.content_type_other_details
1
'Folliculin-interacting protein 2,Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein {PDB ID=7lsw, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=7lsw.1.A}'
'template structure' .
2 . target .
3 'Target-template alignment by HHblits to 7lsw, label_asym_id=A'
'target-template alignment' .
4 'model 2' 'model coordinates' .
5 SMTL 'reference database' .
6 PDB 'reference database' .
7 'Template search output' other 'Results of the sequence search'
#
#
loop_
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_ma_data_group.group_id
_ma_data_group.data_id
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2 1 5
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10 5 4
#
#
loop_
_ma_data_ref_db.data_id
_ma_data_ref_db.name
_ma_data_ref_db.location_url
_ma_data_ref_db.version
_ma_data_ref_db.release_date
5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29
6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24
#
#
loop_
_ma_target_entity.entity_id
_ma_target_entity.data_id
_ma_target_entity.origin
1 2 'reference database'
#
#
loop_
_ma_target_entity_instance.asym_id
_ma_target_entity_instance.entity_id
_ma_target_entity_instance.details
A 1 .
#
#
loop_
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1.000000 0 0 0
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#
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_ma_template_details.template_label_entity_id
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_ma_template_details.template_auth_asym_id
1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A
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DLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQEHHEEDFFLYIAYSDE
SVYGL
;

;GKIITALEKGEVEESEYVVITVRNEPGSMKFVYKEEHPFEKRRSEGEKIRKKYPDRVPVIVEKAPKARIG
DLDKKKYLVPSDLTVGQFYFLIRKRIHLRAEDALFFFVNNVIPPTSATMGQLYQEHHEEDFFLYIAYSDE
SVYGL
;

#
#
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_ma_template_poly_segment.template_id
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_ma_template_poly_segment.residue_number_end
1 1 3 26
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_ma_template_ref_db_details.db_version_date
1 PDB . 7lsw 2023-10-18
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_ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id
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_ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end
1 1 A 1 1108
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#
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_ma_alignment_info.data_id
_ma_alignment_info.software_group_id
_ma_alignment_info.alignment_length
_ma_alignment_info.alignment_type
_ma_alignment_info.alignment_mode
1 3 1 1108 'target-template pairwise alignment' local
#
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loop_
_ma_alignment_details.ordinal_id
_ma_alignment_details.alignment_id
_ma_alignment_details.template_segment_id
_ma_alignment_details.target_asym_id
_ma_alignment_details.score_type
_ma_alignment_details.score_type_other_details
_ma_alignment_details.score_value
_ma_alignment_details.percent_sequence_identity
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator
_ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details
1 1 1 A 'HHblits e-value' . 3.900 87.500
'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' .
#
#
loop_
_ma_alignment.ordinal_id
_ma_alignment.alignment_id
_ma_alignment.target_template_flag
_ma_alignment.sequence
1 1 1
MAPTLLQKLFNKRGGGAASAQARPPKEEPAFSWSCSEFGLSDIRLLVYQDCERRGRQVMFDSRAVQKMEEAAAQKAEDVPIKMSARCCQESSSSSGSSSSGSSSSHGFGGSLQHAKQQLPKYQYTRPASDVSMLGEMMFGSVAMSYKGSTLKIHYIRSPPQLMISKVFSATMGSFCGSTNNLQDSFEYINQDPQAGKLNTNQYNLGPFRTGSNLAHSTPVDMPSRGQNEDRDSGIARSASLSSLLITPFPSPSSSTSSSSSYQRRWLRSQTTSLENGIFPRRSTDETFSLAEETCSSNPAMVRRKKIAISIIFSLCEREAAQRDFQDFFFSHFPLFESHMNRLKGAIEKAMISCRKISESSLRVQFYVSRLMEALGEFRGTIWNLYSVPRIAEPVWLTMMSNTLEKNQLCQRFLKEFILLIEQVNKNQFFAALLTAVLTYHLAWVPTVMPVDHPPIKAFSEKRTSQSVNMLAKTHPYNPLWAQLGDLYGAIGSPVRLTRTVVIGKQKDLVQRILYVLTYFLRCSELQENQLSWSGNPSEDDQVINGSKIITALEKGEVEESEYVVVTVSSEPALVPPILPQGTAERRSPEPTVVAEISEGVNTSELGHKPEKNRCKRPEQNSEASSMGFQEAEPDSSWIPQGIFCEDKQNDQEATQDCSSSPPSCEVPRVRRRMDQQTLHSKLHGETLKKRAEQSAAWPCPDRHSQEDPPVEKVTFHIGSSISPESDFESRTKRMEERLKACGHFHGASASASSSMDTGLTQEQQGSGCSFKADFEKDITPQDHSSGGEGVSEDRGLRANMTHAVGQLSQVDGPLAHSLCAAESGRRLLEQTRDVQLKGYKGPSSEPVPNRCRQQGGLLIAADVPYGDASGKGNYRSEGDIPRNESLDSALGDSDDEACVLALLELGHSCDRTEESLEVELPLPRSQSTSKANVRNFGRSLLAGYCATYMPDLVLHGTSSDEKLKQCLAADLVHTVHHPVLDEPIAEAVCIIADTDKWTVQVATSQRKVTDTMKLGQDVLVSSQVSSLLQSILQLYKLHLPADFCIMHLEDRLQEMYLKSKMLSEYLRGHTRVHVKELSVVLGIESNDLPLLTAIASTHSPYVAQILL
2 1 2
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------IITALEKGEVEESEYVVITVRNEP--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
#
#
loop_
_ma_protocol_step.ordinal_id
_ma_protocol_step.protocol_id
_ma_protocol_step.step_id
_ma_protocol_step.method_type
_ma_protocol_step.step_name
_ma_protocol_step.details
_ma_protocol_step.software_group_id
_ma_protocol_step.input_data_group_id
_ma_protocol_step.output_data_group_id
1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2
1 2
2 1 2 'template selection' 'template selection'
'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4
3 1 3 modeling 'homology modeling'
'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 7lsw.1, oligomeric state (monomer) as predicted'
4 3 5
#
#
loop_
_ma_model_list.ordinal_id
_ma_model_list.model_id
_ma_model_list.model_group_id
_ma_model_list.model_name
_ma_model_list.model_group_name
_ma_model_list.data_id
_ma_model_list.model_type
_ma_model_list.model_type_other_details
1 1 1 'model 2' . 4 'Homology model' .
#
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
ATOM 1 N N . ILE 549 549 ? A 11.069 -3.928 10.439 1 1 A ILE 0.650 1
ATOM 2 C CA . ILE 549 549 ? A 11.603 -5.097 11.240 1 1 A ILE 0.650 1
ATOM 3 C C . ILE 549 549 ? A 12.547 -5.878 10.375 1 1 A ILE 0.650 1
ATOM 4 O O . ILE 549 549 ? A 12.234 -6.095 9.209 1 1 A ILE 0.650 1
ATOM 5 C CB . ILE 549 549 ? A 10.436 -5.958 11.768 1 1 A ILE 0.650 1
ATOM 6 C CG1 . ILE 549 549 ? A 9.877 -5.251 13.029 1 1 A ILE 0.650 1
ATOM 7 C CG2 . ILE 549 549 ? A 10.882 -7.409 12.110 1 1 A ILE 0.650 1
ATOM 8 C CD1 . ILE 549 549 ? A 8.766 -5.999 13.783 1 1 A ILE 0.650 1
ATOM 9 N N . ILE 550 550 ? A 13.721 -6.269 10.900 1 1 A ILE 0.670 1
ATOM 10 C CA . ILE 550 550 ? A 14.659 -7.134 10.222 1 1 A ILE 0.670 1
ATOM 11 C C . ILE 550 550 ? A 14.835 -8.317 11.146 1 1 A ILE 0.670 1
ATOM 12 O O . ILE 550 550 ? A 14.627 -8.201 12.358 1 1 A ILE 0.670 1
ATOM 13 C CB . ILE 550 550 ? A 16.007 -6.457 9.931 1 1 A ILE 0.670 1
ATOM 14 C CG1 . ILE 550 550 ? A 16.616 -5.792 11.197 1 1 A ILE 0.670 1
ATOM 15 C CG2 . ILE 550 550 ? A 15.802 -5.459 8.766 1 1 A ILE 0.670 1
ATOM 16 C CD1 . ILE 550 550 ? A 18.040 -5.236 11.024 1 1 A ILE 0.670 1
ATOM 17 N N . THR 551 551 ? A 15.160 -9.498 10.603 1 1 A THR 0.720 1
ATOM 18 C CA . THR 551 551 ? A 15.337 -10.709 11.381 1 1 A THR 0.720 1
ATOM 19 C C . THR 551 551 ? A 16.696 -11.289 11.076 1 1 A THR 0.720 1
ATOM 20 O O . THR 551 551 ? A 17.216 -11.165 9.966 1 1 A THR 0.720 1
ATOM 21 C CB . THR 551 551 ? A 14.262 -11.775 11.156 1 1 A THR 0.720 1
ATOM 22 O OG1 . THR 551 551 ? A 14.126 -12.144 9.794 1 1 A THR 0.720 1
ATOM 23 C CG2 . THR 551 551 ? A 12.891 -11.215 11.558 1 1 A THR 0.720 1
ATOM 24 N N . ALA 552 552 ? A 17.320 -11.936 12.071 1 1 A ALA 0.810 1
ATOM 25 C CA . ALA 552 552 ? A 18.519 -12.721 11.891 1 1 A ALA 0.810 1
ATOM 26 C C . ALA 552 552 ? A 18.249 -14.092 12.473 1 1 A ALA 0.810 1
ATOM 27 O O . ALA 552 552 ? A 17.269 -14.286 13.197 1 1 A ALA 0.810 1
ATOM 28 C CB . ALA 552 552 ? A 19.736 -12.073 12.599 1 1 A ALA 0.810 1
ATOM 29 N N . LEU 553 553 ? A 19.086 -15.090 12.151 1 1 A LEU 0.720 1
ATOM 30 C CA . LEU 553 553 ? A 18.954 -16.446 12.634 1 1 A LEU 0.720 1
ATOM 31 C C . LEU 553 553 ? A 20.200 -16.799 13.377 1 1 A LEU 0.720 1
ATOM 32 O O . LEU 553 553 ? A 21.312 -16.502 12.932 1 1 A LEU 0.720 1
ATOM 33 C CB . LEU 553 553 ? A 18.767 -17.468 11.494 1 1 A LEU 0.720 1
ATOM 34 C CG . LEU 553 553 ? A 17.376 -17.362 10.843 1 1 A LEU 0.720 1
ATOM 35 C CD1 . LEU 553 553 ? A 17.504 -17.233 9.312 1 1 A LEU 0.720 1
ATOM 36 C CD2 . LEU 553 553 ? A 16.502 -18.559 11.272 1 1 A LEU 0.720 1
ATOM 37 N N . GLU 554 554 ? A 20.027 -17.414 14.548 1 1 A GLU 0.700 1
ATOM 38 C CA . GLU 554 554 ? A 21.122 -17.781 15.399 1 1 A GLU 0.700 1
ATOM 39 C C . GLU 554 554 ? A 20.784 -19.075 16.091 1 1 A GLU 0.700 1
ATOM 40 O O . GLU 554 554 ? A 19.724 -19.208 16.701 1 1 A GLU 0.700 1
ATOM 41 C CB . GLU 554 554 ? A 21.387 -16.632 16.397 1 1 A GLU 0.700 1
ATOM 42 C CG . GLU 554 554 ? A 22.320 -16.981 17.582 1 1 A GLU 0.700 1
ATOM 43 C CD . GLU 554 554 ? A 22.904 -15.729 18.229 1 1 A GLU 0.700 1
ATOM 44 O OE1 . GLU 554 554 ? A 23.352 -14.832 17.468 1 1 A GLU 0.700 1
ATOM 45 O OE2 . GLU 554 554 ? A 22.906 -15.660 19.483 1 1 A GLU 0.700 1
ATOM 46 N N . LYS 555 555 ? A 21.671 -20.088 16.000 1 1 A LYS 0.640 1
ATOM 47 C CA . LYS 555 555 ? A 21.615 -21.294 16.813 1 1 A LYS 0.640 1
ATOM 48 C C . LYS 555 555 ? A 21.838 -20.985 18.271 1 1 A LYS 0.640 1
ATOM 49 O O . LYS 555 555 ? A 22.723 -20.199 18.604 1 1 A LYS 0.640 1
ATOM 50 C CB . LYS 555 555 ? A 22.680 -22.346 16.415 1 1 A LYS 0.640 1
ATOM 51 C CG . LYS 555 555 ? A 22.620 -22.727 14.935 1 1 A LYS 0.640 1
ATOM 52 C CD . LYS 555 555 ? A 23.577 -23.878 14.606 1 1 A LYS 0.640 1
ATOM 53 C CE . LYS 555 555 ? A 23.830 -24.038 13.104 1 1 A LYS 0.640 1
ATOM 54 N NZ . LYS 555 555 ? A 22.576 -24.369 12.401 1 1 A LYS 0.640 1
ATOM 55 N N . GLY 556 556 ? A 21.080 -21.600 19.195 1 1 A GLY 0.530 1
ATOM 56 C CA . GLY 556 556 ? A 21.417 -21.482 20.608 1 1 A GLY 0.530 1
ATOM 57 C C . GLY 556 556 ? A 22.741 -22.115 20.966 1 1 A GLY 0.530 1
ATOM 58 O O . GLY 556 556 ? A 23.242 -22.984 20.259 1 1 A GLY 0.530 1
ATOM 59 N N . GLU 557 557 ? A 23.356 -21.711 22.089 1 1 A GLU 0.360 1
ATOM 60 C CA . GLU 557 557 ? A 24.605 -22.307 22.528 1 1 A GLU 0.360 1
ATOM 61 C C . GLU 557 557 ? A 24.416 -23.556 23.379 1 1 A GLU 0.360 1
ATOM 62 O O . GLU 557 557 ? A 25.255 -24.441 23.414 1 1 A GLU 0.360 1
ATOM 63 C CB . GLU 557 557 ? A 25.407 -21.257 23.317 1 1 A GLU 0.360 1
ATOM 64 C CG . GLU 557 557 ? A 25.957 -20.147 22.391 1 1 A GLU 0.360 1
ATOM 65 C CD . GLU 557 557 ? A 26.892 -19.219 23.154 1 1 A GLU 0.360 1
ATOM 66 O OE1 . GLU 557 557 ? A 27.975 -18.900 22.600 1 1 A GLU 0.360 1
ATOM 67 O OE2 . GLU 557 557 ? A 26.541 -18.848 24.304 1 1 A GLU 0.360 1
ATOM 68 N N . VAL 558 558 ? A 23.270 -23.651 24.089 1 1 A VAL 0.590 1
ATOM 69 C CA . VAL 558 558 ? A 22.912 -24.833 24.861 1 1 A VAL 0.590 1
ATOM 70 C C . VAL 558 558 ? A 21.928 -25.690 24.086 1 1 A VAL 0.590 1
ATOM 71 O O . VAL 558 558 ? A 22.180 -26.849 23.790 1 1 A VAL 0.590 1
ATOM 72 C CB . VAL 558 558 ? A 22.296 -24.458 26.208 1 1 A VAL 0.590 1
ATOM 73 C CG1 . VAL 558 558 ? A 21.961 -25.741 27.011 1 1 A VAL 0.590 1
ATOM 74 C CG2 . VAL 558 558 ? A 23.297 -23.575 26.991 1 1 A VAL 0.590 1
ATOM 75 N N . GLU 559 559 ? A 20.756 -25.124 23.726 1 1 A GLU 0.320 1
ATOM 76 C CA . GLU 559 559 ? A 19.795 -25.801 22.890 1 1 A GLU 0.320 1
ATOM 77 C C . GLU 559 559 ? A 19.994 -25.218 21.515 1 1 A GLU 0.320 1
ATOM 78 O O . GLU 559 559 ? A 19.779 -24.027 21.313 1 1 A GLU 0.320 1
ATOM 79 C CB . GLU 559 559 ? A 18.363 -25.606 23.458 1 1 A GLU 0.320 1
ATOM 80 C CG . GLU 559 559 ? A 17.299 -26.534 22.810 1 1 A GLU 0.320 1
ATOM 81 C CD . GLU 559 559 ? A 16.642 -25.959 21.555 1 1 A GLU 0.320 1
ATOM 82 O OE1 . GLU 559 559 ? A 16.866 -26.522 20.452 1 1 A GLU 0.320 1
ATOM 83 O OE2 . GLU 559 559 ? A 15.884 -24.968 21.689 1 1 A GLU 0.320 1
ATOM 84 N N . GLU 560 560 ? A 20.518 -26.005 20.560 1 1 A GLU 0.370 1
ATOM 85 C CA . GLU 560 560 ? A 21.138 -25.476 19.362 1 1 A GLU 0.370 1
ATOM 86 C C . GLU 560 560 ? A 20.201 -25.307 18.172 1 1 A GLU 0.370 1
ATOM 87 O O . GLU 560 560 ? A 20.649 -25.080 17.043 1 1 A GLU 0.370 1
ATOM 88 C CB . GLU 560 560 ? A 22.351 -26.342 18.950 1 1 A GLU 0.370 1
ATOM 89 C CG . GLU 560 560 ? A 23.483 -26.431 20.010 1 1 A GLU 0.370 1
ATOM 90 C CD . GLU 560 560 ? A 24.649 -27.274 19.495 1 1 A GLU 0.370 1
ATOM 91 O OE1 . GLU 560 560 ? A 25.482 -27.696 20.334 1 1 A GLU 0.370 1
ATOM 92 O OE2 . GLU 560 560 ? A 24.715 -27.506 18.257 1 1 A GLU 0.370 1
ATOM 93 N N . SER 561 561 ? A 18.856 -25.357 18.374 1 1 A SER 0.600 1
ATOM 94 C CA . SER 561 561 ? A 17.896 -24.891 17.378 1 1 A SER 0.600 1
ATOM 95 C C . SER 561 561 ? A 18.038 -23.401 17.121 1 1 A SER 0.600 1
ATOM 96 O O . SER 561 561 ? A 18.713 -22.669 17.854 1 1 A SER 0.600 1
ATOM 97 C CB . SER 561 561 ? A 16.417 -25.389 17.506 1 1 A SER 0.600 1
ATOM 98 O OG . SER 561 561 ? A 15.549 -24.614 18.328 1 1 A SER 0.600 1
ATOM 99 N N . GLU 562 562 ? A 17.515 -22.926 15.983 1 1 A GLU 0.500 1
ATOM 100 C CA . GLU 562 562 ? A 17.689 -21.558 15.562 1 1 A GLU 0.500 1
ATOM 101 C C . GLU 562 562 ? A 16.616 -20.625 16.086 1 1 A GLU 0.500 1
ATOM 102 O O . GLU 562 562 ? A 15.421 -20.777 15.828 1 1 A GLU 0.500 1
ATOM 103 C CB . GLU 562 562 ? A 17.829 -21.448 14.024 1 1 A GLU 0.500 1
ATOM 104 C CG . GLU 562 562 ? A 19.106 -22.213 13.584 1 1 A GLU 0.500 1
ATOM 105 C CD . GLU 562 562 ? A 19.678 -21.975 12.193 1 1 A GLU 0.500 1
ATOM 106 O OE1 . GLU 562 562 ? A 19.042 -21.306 11.354 1 1 A GLU 0.500 1
ATOM 107 O OE2 . GLU 562 562 ? A 20.804 -22.520 11.983 1 1 A GLU 0.500 1
ATOM 108 N N . TYR 563 563 ? A 17.034 -19.583 16.825 1 1 A TYR 0.620 1
ATOM 109 C CA . TYR 563 563 ? A 16.198 -18.454 17.156 1 1 A TYR 0.620 1
ATOM 110 C C . TYR 563 563 ? A 15.992 -17.581 15.940 1 1 A TYR 0.620 1
ATOM 111 O O . TYR 563 563 ? A 16.934 -17.291 15.206 1 1 A TYR 0.620 1
ATOM 112 C CB . TYR 563 563 ? A 16.825 -17.510 18.220 1 1 A TYR 0.620 1
ATOM 113 C CG . TYR 563 563 ? A 16.914 -18.163 19.567 1 1 A TYR 0.620 1
ATOM 114 C CD1 . TYR 563 563 ? A 18.021 -18.953 19.919 1 1 A TYR 0.620 1
ATOM 115 C CD2 . TYR 563 563 ? A 15.920 -17.918 20.529 1 1 A TYR 0.620 1
ATOM 116 C CE1 . TYR 563 563 ? A 18.152 -19.449 21.224 1 1 A TYR 0.620 1
ATOM 117 C CE2 . TYR 563 563 ? A 16.054 -18.410 21.836 1 1 A TYR 0.620 1
ATOM 118 C CZ . TYR 563 563 ? A 17.182 -19.161 22.187 1 1 A TYR 0.620 1
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ATOM 179 O O . PRO 572 572 ? A 16.632 3.895 21.926 1 1 A PRO 0.220 1
ATOM 180 C CB . PRO 572 572 ? A 13.623 5.543 21.784 1 1 A PRO 0.220 1
ATOM 181 C CG . PRO 572 572 ? A 12.702 4.313 21.624 1 1 A PRO 0.220 1
ATOM 182 C CD . PRO 572 572 ? A 13.507 3.327 20.774 1 1 A PRO 0.220 1
ATOM 183 O OXT . PRO 572 572 ? A 16.475 6.019 22.555 1 1 A PRO 0.220 1
#
#
loop_
_atom_type.symbol
C
N
O
#
#
loop_
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_ma_qa_metric.description
_ma_qa_metric.type
_ma_qa_metric.mode
_ma_qa_metric.type_other_details
_ma_qa_metric.software_group_id
1 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' local . 5
2 QMEANDisCo 'Predicted accuracy according to all-atom lDDT in [0,1].'
'pLDDT all-atom in [0,1]' global . 5
3 GMQE
'Global Model Quality Estimate of the model accuracy, calculated by SWISS-MODEL.'
'normalized score' global . 6
#
#
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1 1 2 0.574
2 1 3 0
#
#
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_ma_qa_metric_local.metric_id
_ma_qa_metric_local.metric_value
1 1 A 549 ILE 1 0.650
2 1 A 550 ILE 1 0.670
3 1 A 551 THR 1 0.720
4 1 A 552 ALA 1 0.810
5 1 A 553 LEU 1 0.720
6 1 A 554 GLU 1 0.700
7 1 A 555 LYS 1 0.640
8 1 A 556 GLY 1 0.530
9 1 A 557 GLU 1 0.360
10 1 A 558 VAL 1 0.590
11 1 A 559 GLU 1 0.320
12 1 A 560 GLU 1 0.370
13 1 A 561 SER 1 0.600
14 1 A 562 GLU 1 0.500
15 1 A 563 TYR 1 0.620
16 1 A 564 VAL 1 0.580
17 1 A 565 VAL 1 0.540
18 1 A 566 VAL 1 0.670
19 1 A 567 THR 1 0.650
20 1 A 568 VAL 1 0.630
21 1 A 569 SER 1 0.640
22 1 A 570 SER 1 0.630
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#
#
loop_
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_pdbx_data_usage.type
_pdbx_data_usage.details
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1 license
;This SWISS-MODEL protein model is copyright.
It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational
Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the
Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This
model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons
Attribution-ShareAlike 4.0 International License
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can copy and redistribute the model in any medium or format,
transform and build upon the model for any purpose, even
commercially, under the following terms:
Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to
the license, and indicate if changes were made. You may do so in any
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you must distribute your contributions under the same license as the
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No additional restrictions - you may not apply legal terms or
technological measures that legally restrict others from doing
anything the license permits.
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;
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;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for
proteins. The results of any theoretical modelling procedure is
NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may
contain significant errors. This is especially true for automated
modeling since there is no human intervention during model
building. Please read the header section and the logfile carefully
to know what templates and alignments were used during the model
building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is
provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied.
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