data_SMR-8d06b293fcc89e84c8e200887f74d5de_1 _entry.id SMR-8d06b293fcc89e84c8e200887f74d5de_1 _struct.entry_id SMR-8d06b293fcc89e84c8e200887f74d5de_1 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled homo-dimer covers following UniProtKB entries: - Q3U1N2/ SRBP2_MOUSE, Sterol regulatory element-binding protein 2 Estimated model accuracy of this model is 0.026, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries Q3U1N2' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 6 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 143388.121 2 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP SRBP2_MOUSE Q3U1N2 1 ;MDESSELGVLETMETLTELGDELTLGDIDEMLQFVSNQVGEFPDLFSEQLCSSFPGGGSNGGSGNNSSGR GNNGGATDPAVQRSFSQVPLSTFSPSAASPQAPALQVKVSPTPPRATPVLQPRPQPQPQPPAQLQQQTVM ITPTFSTAPQTRIIQQPLIYQNAATSFQVLQPQVQSLVTSPQVQPVTIQQQVQTVQAQRVLTQTANGTLQ TLAPATVQTVAAPQVQQVPVLVQPQIIKTDSLVLTTLKTDGSPVMAAVQNPALTALTAPIQTAALQVPTL VGSNGTILTTMPVMMGQEKVPIKQVPGGVKQLDPPKEGERRTTHNIIEKRYRSSINDKIIELKDLVMGTD AKMHKSGVLRKAIDYIKYLQQVNHKLRQENMVLKLANQKNKLLKGIDLGSLVDSDVDLKIDDFNQNVLLM SPPASDSGSQAGFSPYSIDSEPGSPLLDDAKVKDEPDSPPVALGMVDRSRILLCVLTFLGLSFNPLTSLL QWGGAHNTDQHPYSGSGRSVLSLESGAGGWFDWMVPTLLLWLVNGVIVLSVFVKLLVHGEPVIRPHSRPS VTFWRHRKQADLDLAKGDFAAAAANLQTCLSVLGRALPTSRLDLACSLSWNVIRYSLQKLRLVRWLLKKV FQRWRATPATAAGFEDEAKSSARDAALAYHRLHQLHITGKLPAGSACSDVHMALCAVNLAECAEEKILPS TLIEIHLTAAMGLKTRCGGKLGFLASYFLNRAQSLCGPEHSTVPDSLRWLCHPLGQKFFMERSWSIKSAA KESLYCAQRSPADPIAQVHQAFCKNLLERAVESLVKPQAKKKAGDQEEESCEFSSALEYLKLLHSFVDSV GFVTSPFSSSSVLRSALGPDVICRWWTSAVTMAISWLQGDDAAVRSRFTEVERVPKALEVTESPLVKAVF YTCRAMHASLSGKADGQQNSFCHCERASGHLWSSLNVSGTTSDPSLNHVIQLFTCDLLLSLRTALWQKQA SASQLLGETYHASGTELAGFQRDLGSLRRLAHSFRPAYRKVFLHEATVRLMAGASPTRTHQLLEHSLRRR PTQNTKHGEVDTWPGQRERATAILLACRHLPLSFLSSPGQRAVLLAEAARTLEKVGDRRSCSDCQQMIVK LGGGTAIAAS ; 'Sterol regulatory element-binding protein 2' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1130 1 1130 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . SRBP2_MOUSE Q3U1N2 . 1 1130 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2008-02-05 052E858B0C3945F2 # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A,C ;MDESSELGVLETMETLTELGDELTLGDIDEMLQFVSNQVGEFPDLFSEQLCSSFPGGGSNGGSGNNSSGR GNNGGATDPAVQRSFSQVPLSTFSPSAASPQAPALQVKVSPTPPRATPVLQPRPQPQPQPPAQLQQQTVM ITPTFSTAPQTRIIQQPLIYQNAATSFQVLQPQVQSLVTSPQVQPVTIQQQVQTVQAQRVLTQTANGTLQ TLAPATVQTVAAPQVQQVPVLVQPQIIKTDSLVLTTLKTDGSPVMAAVQNPALTALTAPIQTAALQVPTL VGSNGTILTTMPVMMGQEKVPIKQVPGGVKQLDPPKEGERRTTHNIIEKRYRSSINDKIIELKDLVMGTD AKMHKSGVLRKAIDYIKYLQQVNHKLRQENMVLKLANQKNKLLKGIDLGSLVDSDVDLKIDDFNQNVLLM SPPASDSGSQAGFSPYSIDSEPGSPLLDDAKVKDEPDSPPVALGMVDRSRILLCVLTFLGLSFNPLTSLL QWGGAHNTDQHPYSGSGRSVLSLESGAGGWFDWMVPTLLLWLVNGVIVLSVFVKLLVHGEPVIRPHSRPS VTFWRHRKQADLDLAKGDFAAAAANLQTCLSVLGRALPTSRLDLACSLSWNVIRYSLQKLRLVRWLLKKV FQRWRATPATAAGFEDEAKSSARDAALAYHRLHQLHITGKLPAGSACSDVHMALCAVNLAECAEEKILPS TLIEIHLTAAMGLKTRCGGKLGFLASYFLNRAQSLCGPEHSTVPDSLRWLCHPLGQKFFMERSWSIKSAA KESLYCAQRSPADPIAQVHQAFCKNLLERAVESLVKPQAKKKAGDQEEESCEFSSALEYLKLLHSFVDSV GFVTSPFSSSSVLRSALGPDVICRWWTSAVTMAISWLQGDDAAVRSRFTEVERVPKALEVTESPLVKAVF YTCRAMHASLSGKADGQQNSFCHCERASGHLWSSLNVSGTTSDPSLNHVIQLFTCDLLLSLRTALWQKQA SASQLLGETYHASGTELAGFQRDLGSLRRLAHSFRPAYRKVFLHEATVRLMAGASPTRTHQLLEHSLRRR PTQNTKHGEVDTWPGQRERATAILLACRHLPLSFLSSPGQRAVLLAEAARTLEKVGDRRSCSDCQQMIVK LGGGTAIAAS ; ;MDESSELGVLETMETLTELGDELTLGDIDEMLQFVSNQVGEFPDLFSEQLCSSFPGGGSNGGSGNNSSGR GNNGGATDPAVQRSFSQVPLSTFSPSAASPQAPALQVKVSPTPPRATPVLQPRPQPQPQPPAQLQQQTVM ITPTFSTAPQTRIIQQPLIYQNAATSFQVLQPQVQSLVTSPQVQPVTIQQQVQTVQAQRVLTQTANGTLQ TLAPATVQTVAAPQVQQVPVLVQPQIIKTDSLVLTTLKTDGSPVMAAVQNPALTALTAPIQTAALQVPTL VGSNGTILTTMPVMMGQEKVPIKQVPGGVKQLDPPKEGERRTTHNIIEKRYRSSINDKIIELKDLVMGTD AKMHKSGVLRKAIDYIKYLQQVNHKLRQENMVLKLANQKNKLLKGIDLGSLVDSDVDLKIDDFNQNVLLM SPPASDSGSQAGFSPYSIDSEPGSPLLDDAKVKDEPDSPPVALGMVDRSRILLCVLTFLGLSFNPLTSLL QWGGAHNTDQHPYSGSGRSVLSLESGAGGWFDWMVPTLLLWLVNGVIVLSVFVKLLVHGEPVIRPHSRPS VTFWRHRKQADLDLAKGDFAAAAANLQTCLSVLGRALPTSRLDLACSLSWNVIRYSLQKLRLVRWLLKKV FQRWRATPATAAGFEDEAKSSARDAALAYHRLHQLHITGKLPAGSACSDVHMALCAVNLAECAEEKILPS TLIEIHLTAAMGLKTRCGGKLGFLASYFLNRAQSLCGPEHSTVPDSLRWLCHPLGQKFFMERSWSIKSAA KESLYCAQRSPADPIAQVHQAFCKNLLERAVESLVKPQAKKKAGDQEEESCEFSSALEYLKLLHSFVDSV GFVTSPFSSSSVLRSALGPDVICRWWTSAVTMAISWLQGDDAAVRSRFTEVERVPKALEVTESPLVKAVF YTCRAMHASLSGKADGQQNSFCHCERASGHLWSSLNVSGTTSDPSLNHVIQLFTCDLLLSLRTALWQKQA SASQLLGETYHASGTELAGFQRDLGSLRRLAHSFRPAYRKVFLHEATVRLMAGASPTRTHQLLEHSLRRR PTQNTKHGEVDTWPGQRERATAILLACRHLPLSFLSSPGQRAVLLAEAARTLEKVGDRRSCSDCQQMIVK LGGGTAIAAS ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ASP . 1 3 GLU . 1 4 SER . 1 5 SER . 1 6 GLU . 1 7 LEU . 1 8 GLY . 1 9 VAL . 1 10 LEU . 1 11 GLU . 1 12 THR . 1 13 MET . 1 14 GLU . 1 15 THR . 1 16 LEU . 1 17 THR . 1 18 GLU . 1 19 LEU . 1 20 GLY . 1 21 ASP . 1 22 GLU . 1 23 LEU . 1 24 THR . 1 25 LEU . 1 26 GLY . 1 27 ASP . 1 28 ILE . 1 29 ASP . 1 30 GLU . 1 31 MET . 1 32 LEU . 1 33 GLN . 1 34 PHE . 1 35 VAL . 1 36 SER . 1 37 ASN . 1 38 GLN . 1 39 VAL . 1 40 GLY . 1 41 GLU . 1 42 PHE . 1 43 PRO . 1 44 ASP . 1 45 LEU . 1 46 PHE . 1 47 SER . 1 48 GLU . 1 49 GLN . 1 50 LEU . 1 51 CYS . 1 52 SER . 1 53 SER . 1 54 PHE . 1 55 PRO . 1 56 GLY . 1 57 GLY . 1 58 GLY . 1 59 SER . 1 60 ASN . 1 61 GLY . 1 62 GLY . 1 63 SER . 1 64 GLY . 1 65 ASN . 1 66 ASN . 1 67 SER . 1 68 SER . 1 69 GLY . 1 70 ARG . 1 71 GLY . 1 72 ASN . 1 73 ASN . 1 74 GLY . 1 75 GLY . 1 76 ALA . 1 77 THR . 1 78 ASP . 1 79 PRO . 1 80 ALA . 1 81 VAL . 1 82 GLN . 1 83 ARG . 1 84 SER . 1 85 PHE . 1 86 SER . 1 87 GLN . 1 88 VAL . 1 89 PRO . 1 90 LEU . 1 91 SER . 1 92 THR . 1 93 PHE . 1 94 SER . 1 95 PRO . 1 96 SER . 1 97 ALA . 1 98 ALA . 1 99 SER . 1 100 PRO . 1 101 GLN . 1 102 ALA . 1 103 PRO . 1 104 ALA . 1 105 LEU . 1 106 GLN . 1 107 VAL . 1 108 LYS . 1 109 VAL . 1 110 SER . 1 111 PRO . 1 112 THR . 1 113 PRO . 1 114 PRO . 1 115 ARG . 1 116 ALA . 1 117 THR . 1 118 PRO . 1 119 VAL . 1 120 LEU . 1 121 GLN . 1 122 PRO . 1 123 ARG . 1 124 PRO . 1 125 GLN . 1 126 PRO . 1 127 GLN . 1 128 PRO . 1 129 GLN . 1 130 PRO . 1 131 PRO . 1 132 ALA . 1 133 GLN . 1 134 LEU . 1 135 GLN . 1 136 GLN . 1 137 GLN . 1 138 THR . 1 139 VAL . 1 140 MET . 1 141 ILE . 1 142 THR . 1 143 PRO . 1 144 THR . 1 145 PHE . 1 146 SER . 1 147 THR . 1 148 ALA . 1 149 PRO . 1 150 GLN . 1 151 THR . 1 152 ARG . 1 153 ILE . 1 154 ILE . 1 155 GLN . 1 156 GLN . 1 157 PRO . 1 158 LEU . 1 159 ILE . 1 160 TYR . 1 161 GLN . 1 162 ASN . 1 163 ALA . 1 164 ALA . 1 165 THR . 1 166 SER . 1 167 PHE . 1 168 GLN . 1 169 VAL . 1 170 LEU . 1 171 GLN . 1 172 PRO . 1 173 GLN . 1 174 VAL . 1 175 GLN . 1 176 SER . 1 177 LEU . 1 178 VAL . 1 179 THR . 1 180 SER . 1 181 PRO . 1 182 GLN . 1 183 VAL . 1 184 GLN . 1 185 PRO . 1 186 VAL . 1 187 THR . 1 188 ILE . 1 189 GLN . 1 190 GLN 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B 1 1037 THR 1037 ? ? ? C . B 1 1038 ARG 1038 ? ? ? C . B 1 1039 THR 1039 ? ? ? C . B 1 1040 HIS 1040 ? ? ? C . B 1 1041 GLN 1041 ? ? ? C . B 1 1042 LEU 1042 ? ? ? C . B 1 1043 LEU 1043 ? ? ? C . B 1 1044 GLU 1044 ? ? ? C . B 1 1045 HIS 1045 ? ? ? C . B 1 1046 SER 1046 ? ? ? C . B 1 1047 LEU 1047 ? ? ? C . B 1 1048 ARG 1048 ? ? ? C . B 1 1049 ARG 1049 ? ? ? C . B 1 1050 ARG 1050 ? ? ? C . B 1 1051 PRO 1051 ? ? ? C . B 1 1052 THR 1052 ? ? ? C . B 1 1053 GLN 1053 ? ? ? C . B 1 1054 ASN 1054 ? ? ? C . B 1 1055 THR 1055 ? ? ? C . B 1 1056 LYS 1056 ? ? ? C . B 1 1057 HIS 1057 ? ? ? C . B 1 1058 GLY 1058 ? ? ? C . B 1 1059 GLU 1059 ? ? ? C . B 1 1060 VAL 1060 ? ? ? C . B 1 1061 ASP 1061 ? ? ? C . B 1 1062 THR 1062 ? ? ? C . B 1 1063 TRP 1063 ? ? ? C . B 1 1064 PRO 1064 ? ? ? C . B 1 1065 GLY 1065 ? ? ? C . B 1 1066 GLN 1066 ? ? ? C . B 1 1067 ARG 1067 ? ? ? C . B 1 1068 GLU 1068 ? ? ? C . B 1 1069 ARG 1069 ? ? ? C . B 1 1070 ALA 1070 ? ? ? C . B 1 1071 THR 1071 ? ? ? C . B 1 1072 ALA 1072 ? ? ? C . B 1 1073 ILE 1073 ? ? ? C . B 1 1074 LEU 1074 ? ? ? C . B 1 1075 LEU 1075 ? ? ? C . B 1 1076 ALA 1076 ? ? ? C . B 1 1077 CYS 1077 ? ? ? C . B 1 1078 ARG 1078 ? ? ? C . B 1 1079 HIS 1079 ? ? ? C . B 1 1080 LEU 1080 ? ? ? C . B 1 1081 PRO 1081 ? ? ? C . B 1 1082 LEU 1082 ? ? ? C . B 1 1083 SER 1083 ? ? ? C . B 1 1084 PHE 1084 ? ? ? C . B 1 1085 LEU 1085 ? ? ? C . B 1 1086 SER 1086 ? ? ? C . B 1 1087 SER 1087 ? ? ? C . B 1 1088 PRO 1088 ? ? ? C . B 1 1089 GLY 1089 ? ? ? C . B 1 1090 GLN 1090 ? ? ? C . B 1 1091 ARG 1091 ? ? ? C . B 1 1092 ALA 1092 ? ? ? C . B 1 1093 VAL 1093 ? ? ? C . B 1 1094 LEU 1094 ? ? ? C . B 1 1095 LEU 1095 ? ? ? C . B 1 1096 ALA 1096 ? ? ? C . B 1 1097 GLU 1097 ? ? ? C . B 1 1098 ALA 1098 ? ? ? C . B 1 1099 ALA 1099 ? ? ? C . B 1 1100 ARG 1100 ? ? ? C . B 1 1101 THR 1101 ? ? ? C . B 1 1102 LEU 1102 ? ? ? C . B 1 1103 GLU 1103 ? ? ? C . B 1 1104 LYS 1104 ? ? ? C . B 1 1105 VAL 1105 ? ? ? C . B 1 1106 GLY 1106 ? ? ? C . B 1 1107 ASP 1107 ? ? ? C . B 1 1108 ARG 1108 ? ? ? C . B 1 1109 ARG 1109 ? ? ? C . B 1 1110 SER 1110 ? ? ? C . B 1 1111 CYS 1111 ? ? ? C . B 1 1112 SER 1112 ? ? ? C . B 1 1113 ASP 1113 ? ? ? C . B 1 1114 CYS 1114 ? ? ? C . B 1 1115 GLN 1115 ? ? ? C . B 1 1116 GLN 1116 ? ? ? C . B 1 1117 MET 1117 ? ? ? C . B 1 1118 ILE 1118 ? ? ? C . B 1 1119 VAL 1119 ? ? ? C . B 1 1120 LYS 1120 ? ? ? C . B 1 1121 LEU 1121 ? ? ? C . B 1 1122 GLY 1122 ? ? ? C . B 1 1123 GLY 1123 ? ? ? C . B 1 1124 GLY 1124 ? ? ? C . B 1 1125 THR 1125 ? ? ? C . B 1 1126 ALA 1126 ? ? ? C . B 1 1127 ILE 1127 ? ? ? C . B 1 1128 ALA 1128 ? ? ? C . B 1 1129 ALA 1129 ? ? ? C . B 1 1130 SER 1130 ? ? ? C . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'Microphthalmia-associated transcription factor {PDB ID=6g1l, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=6g1l.1.C}' 'template structure' . 2 'Microphthalmia-associated transcription factor {PDB ID=6g1l, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=6g1l.1.C}' 'template structure' . 3 . target . 4 'Target-template alignment by HHblits to 6g1l, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 5 'Target-template alignment by HHblits to 6g1l, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 6 'model 1' 'model coordinates' . 7 SMTL 'reference database' . 8 PDB 'reference database' . 9 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 3 2 1 7 3 1 8 4 2 9 5 3 3 6 3 1 7 3 2 8 3 4 9 3 5 10 4 1 11 4 2 12 4 4 13 4 5 14 5 6 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 7 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 8 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 3 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . B 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A 2 2 'reference database' polymer 1 2 B A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 ;GAMANIKRELTACIFPTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGT ILKASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHLLLRVQELEMQARAHG ; ;GAMANIKRELTACIFPTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGT ILKASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHLLLRVQELEMQARAHG ; 2 ;GAMANIKRELTACIFPTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGT ILKASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHLLLRVQELEMQARAHG ; ;GAMANIKRELTACIFPTESEARALAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGT ILKASVDYIRKLQREQQRAKDLENRQKKLEHANRHLLLRVQELEMQARAHG ; # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 24 91 2 2 24 91 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 6g1l 2024-01-17 2 PDB . 6g1l 2024-01-17 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1130 2 2 B 1 1130 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 4 1 1133 'target-template pairwise alignment' local 2 5 1 1133 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'HHblits e-value' . 1.7e-11 35.385 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . 2 2 2 B 'HHblits e-value' . 1.7e-11 35.385 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MDESSELGVLETMETLTELGDELTLGDIDEMLQFVSNQVGEFPDLFSEQLCSSFPGGGSNGGSGNNSSGRGNNGGATDPAVQRSFSQVPLSTFSPSAASPQAPALQVKVSPTPPRATPVLQPRPQPQPQPPAQLQQQTVMITPTFSTAPQTRIIQQPLIYQNAATSFQVLQPQVQSLVTSPQVQPVTIQQQVQTVQAQRVLTQTANGTLQTLAPATVQTVAAPQVQQVPVLVQPQIIKTDSLVLTTLKTDGSPVMAAVQNPALTALTAPIQTAALQVPTLVGSNGTILTTMPVMMGQEKVPIKQVPGGVKQLDPPKEGERRTTHNIIEKRYRSSINDKIIELKDLVMGT---DAKMHKSGVLRKAIDYIKYLQQVNHKLRQENMVLKLANQKNKLLKGIDLGSLVDSDVDLKIDDFNQNVLLMSPPASDSGSQAGFSPYSIDSEPGSPLLDDAKVKDEPDSPPVALGMVDRSRILLCVLTFLGLSFNPLTSLLQWGGAHNTDQHPYSGSGRSVLSLESGAGGWFDWMVPTLLLWLVNGVIVLSVFVKLLVHGEPVIRPHSRPSVTFWRHRKQADLDLAKGDFAAAAANLQTCLSVLGRALPTSRLDLACSLSWNVIRYSLQKLRLVRWLLKKVFQRWRATPATAAGFEDEAKSSARDAALAYHRLHQLHITGKLPAGSACSDVHMALCAVNLAECAEEKILPSTLIEIHLTAAMGLKTRCGGKLGFLASYFLNRAQSLCGPEHSTVPDSLRWLCHPLGQKFFMERSWSIKSAAKESLYCAQRSPADPIAQVHQAFCKNLLERAVESLVKPQAKKKAGDQEEESCEFSSALEYLKLLHSFVDSVGFVTSPFSSSSVLRSALGPDVICRWWTSAVTMAISWLQGDDAAVRSRFTEVERVPKALEVTESPLVKAVFYTCRAMHASLSGKADGQQNSFCHCERASGHLWSSLNVSGTTSDPSLNHVIQLFTCDLLLSLRTALWQKQASASQLLGETYHASGTELAGFQRDLGSLRRLAHSFRPAYRKVFLHEATVRLMAGASPTRTHQLLEHSLRRRPTQNTKHGEVDTWPGQRERATAILLACRHLPLSFLSSPGQRAVLLAEAARTLEKVGDRRSCSDCQQMIVKLGGGTAIAAS 2 1 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILKASVDYIRKLQREQQRAKD-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 3 2 1 MDESSELGVLETMETLTELGDELTLGDIDEMLQFVSNQVGEFPDLFSEQLCSSFPGGGSNGGSGNNSSGRGNNGGATDPAVQRSFSQVPLSTFSPSAASPQAPALQVKVSPTPPRATPVLQPRPQPQPQPPAQLQQQTVMITPTFSTAPQTRIIQQPLIYQNAATSFQVLQPQVQSLVTSPQVQPVTIQQQVQTVQAQRVLTQTANGTLQTLAPATVQTVAAPQVQQVPVLVQPQIIKTDSLVLTTLKTDGSPVMAAVQNPALTALTAPIQTAALQVPTLVGSNGTILTTMPVMMGQEKVPIKQVPGGVKQLDPPKEGERRTTHNIIEKRYRSSINDKIIELKDLVMGT---DAKMHKSGVLRKAIDYIKYLQQVNHKLRQENMVLKLANQKNKLLKGIDLGSLVDSDVDLKIDDFNQNVLLMSPPASDSGSQAGFSPYSIDSEPGSPLLDDAKVKDEPDSPPVALGMVDRSRILLCVLTFLGLSFNPLTSLLQWGGAHNTDQHPYSGSGRSVLSLESGAGGWFDWMVPTLLLWLVNGVIVLSVFVKLLVHGEPVIRPHSRPSVTFWRHRKQADLDLAKGDFAAAAANLQTCLSVLGRALPTSRLDLACSLSWNVIRYSLQKLRLVRWLLKKVFQRWRATPATAAGFEDEAKSSARDAALAYHRLHQLHITGKLPAGSACSDVHMALCAVNLAECAEEKILPSTLIEIHLTAAMGLKTRCGGKLGFLASYFLNRAQSLCGPEHSTVPDSLRWLCHPLGQKFFMERSWSIKSAAKESLYCAQRSPADPIAQVHQAFCKNLLERAVESLVKPQAKKKAGDQEEESCEFSSALEYLKLLHSFVDSVGFVTSPFSSSSVLRSALGPDVICRWWTSAVTMAISWLQGDDAAVRSRFTEVERVPKALEVTESPLVKAVFYTCRAMHASLSGKADGQQNSFCHCERASGHLWSSLNVSGTTSDPSLNHVIQLFTCDLLLSLRTALWQKQASASQLLGETYHASGTELAGFQRDLGSLRRLAHSFRPAYRKVFLHEATVRLMAGASPTRTHQLLEHSLRRRPTQNTKHGEVDTWPGQRERATAILLACRHLPLSFLSSPGQRAVLLAEAARTLEKVGDRRSCSDCQQMIVKLGGGTAIAAS 4 2 2 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------LAKERQKKDNHNLIERRRRFNINDRIKELGTLIPKSNDPDMRWNKGTILKASVDYIRKLQREQQRAKD-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.322}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 6g1l.1, oligomeric state (homo-dimer) as predicted' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 1' . 6 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . PRO 315 315 ? A -12.248 13.049 -44.308 1 1 A PRO 0.260 1 ATOM 2 C CA . PRO 315 315 ? A -12.651 13.596 -42.964 1 1 A PRO 0.260 1 ATOM 3 C C . PRO 315 315 ? A -12.324 12.699 -41.777 1 1 A PRO 0.260 1 ATOM 4 O O . PRO 315 315 ? A -12.430 13.222 -40.683 1 1 A PRO 0.260 1 ATOM 5 C CB . PRO 315 315 ? A -14.127 13.931 -43.149 1 1 A PRO 0.260 1 ATOM 6 C CG . PRO 315 315 ? A -14.672 12.911 -44.144 1 1 A PRO 0.260 1 ATOM 7 C CD . PRO 315 315 ? A -13.471 12.424 -44.938 1 1 A PRO 0.260 1 ATOM 8 N N . LYS 316 316 ? A -11.864 11.422 -41.901 1 1 A LYS 0.220 1 ATOM 9 C CA . LYS 316 316 ? A -11.460 10.624 -40.734 1 1 A LYS 0.220 1 ATOM 10 C C . LYS 316 316 ? A -10.297 11.224 -39.935 1 1 A LYS 0.220 1 ATOM 11 O O . LYS 316 316 ? A -10.274 11.222 -38.707 1 1 A LYS 0.220 1 ATOM 12 C CB . LYS 316 316 ? A -11.101 9.194 -41.189 1 1 A LYS 0.220 1 ATOM 13 C CG . LYS 316 316 ? A -12.313 8.379 -41.674 1 1 A LYS 0.220 1 ATOM 14 C CD . LYS 316 316 ? A -11.911 6.967 -42.139 1 1 A LYS 0.220 1 ATOM 15 C CE . LYS 316 316 ? A -13.100 6.111 -42.588 1 1 A LYS 0.220 1 ATOM 16 N NZ . LYS 316 316 ? A -12.637 4.786 -43.062 1 1 A LYS 0.220 1 ATOM 17 N N . GLU 317 317 ? A -9.326 11.824 -40.653 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 18 C CA . GLU 317 317 ? A -8.263 12.650 -40.095 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 19 C C . GLU 317 317 ? A -8.798 13.854 -39.318 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 20 O O . GLU 317 317 ? A -8.243 14.268 -38.302 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 21 C CB . GLU 317 317 ? A -7.286 13.079 -41.215 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 22 C CG . GLU 317 317 ? A -6.114 14.000 -40.775 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 23 C CD . GLU 317 317 ? A -5.218 13.486 -39.645 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 24 O OE1 . GLU 317 317 ? A -4.836 14.349 -38.794 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 25 O OE2 . GLU 317 317 ? A -4.855 12.275 -39.616 1 1 A GLU 0.510 1 ATOM 26 N N . GLY 318 318 ? A -9.949 14.424 -39.748 1 1 A GLY 0.580 1 ATOM 27 C CA . GLY 318 318 ? A -10.596 15.532 -39.053 1 1 A GLY 0.580 1 ATOM 28 C C . GLY 318 318 ? A -11.086 15.145 -37.673 1 1 A GLY 0.580 1 ATOM 29 O O . GLY 318 318 ? A -10.895 15.880 -36.712 1 1 A GLY 0.580 1 ATOM 30 N N . GLU 319 319 ? A -11.687 13.947 -37.537 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 31 C CA . GLU 319 319 ? A -12.149 13.425 -36.253 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 32 C C . GLU 319 319 ? A -11.041 13.134 -35.262 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 33 O O . GLU 319 319 ? A -11.132 13.505 -34.066 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 34 C CB . GLU 319 319 ? A -12.944 12.121 -36.430 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 35 C CG . GLU 319 319 ? A -13.487 11.559 -35.093 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 36 C CD . GLU 319 319 ? A -14.245 10.245 -35.265 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 37 O OE1 . GLU 319 319 ? A -14.364 9.759 -36.420 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 38 O OE2 . GLU 319 319 ? A -14.688 9.712 -34.215 1 1 A GLU 0.580 1 ATOM 39 N N . ARG 320 320 ? A -9.942 12.506 -35.687 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 40 C CA . ARG 320 320 ? A -8.809 12.175 -34.840 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 41 C C . ARG 320 320 ? A -8.146 13.406 -34.228 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 42 O O . ARG 320 320 ? A -7.771 13.418 -33.052 1 1 A ARG 0.540 1 ATOM 43 C CB . 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A -5.518 38.520 -7.295 1 1 A MET 0.590 1 ATOM 319 C CE . MET 353 353 ? A -6.656 39.634 -8.156 1 1 A MET 0.590 1 ATOM 320 N N . HIS 354 354 ? A -1.977 37.034 -12.418 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 321 C CA . HIS 354 354 ? A -1.897 36.182 -13.581 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 322 C C . HIS 354 354 ? A -1.272 34.899 -13.119 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 323 O O . HIS 354 354 ? A -0.777 34.832 -11.978 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 324 C CB . HIS 354 354 ? A -0.989 36.739 -14.689 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 325 C CG . HIS 354 354 ? A -1.501 38.005 -15.231 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 326 N ND1 . HIS 354 354 ? A -2.605 37.985 -16.046 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 327 C CD2 . HIS 354 354 ? A -1.094 39.270 -14.997 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 328 C CE1 . HIS 354 354 ? A -2.859 39.250 -16.294 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 329 N NE2 . HIS 354 354 ? A -1.974 40.078 -15.679 1 1 A HIS 0.620 1 ATOM 330 N N . LYS 355 355 ? A -1.226 33.853 -13.960 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 331 C CA . LYS 355 355 ? A -0.803 32.514 -13.571 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 332 C C . LYS 355 355 ? A 0.550 32.466 -12.865 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 333 O O . LYS 355 355 ? A 0.687 31.880 -11.796 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 334 C CB . LYS 355 355 ? A -0.720 31.596 -14.811 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 335 C CG . LYS 355 355 ? A -2.066 31.278 -15.476 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 336 C CD . LYS 355 355 ? A -1.854 30.637 -16.856 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 337 C CE . LYS 355 355 ? A -3.165 30.331 -17.575 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 338 N NZ . LYS 355 355 ? A -2.876 29.882 -18.954 1 1 A LYS 0.690 1 ATOM 339 N N . SER 356 356 ? A 1.563 33.162 -13.417 1 1 A SER 0.720 1 ATOM 340 C CA . SER 356 356 ? A 2.897 33.266 -12.833 1 1 A SER 0.720 1 ATOM 341 C C . SER 356 356 ? A 2.941 33.882 -11.455 1 1 A SER 0.720 1 ATOM 342 O O . SER 356 356 ? A 3.686 33.415 -10.591 1 1 A SER 0.720 1 ATOM 343 C CB . SER 356 356 ? A 3.860 34.129 -13.686 1 1 A SER 0.720 1 ATOM 344 O OG . SER 356 356 ? A 4.199 33.499 -14.921 1 1 A SER 0.720 1 ATOM 345 N N . GLY 357 357 ? A 2.173 34.957 -11.207 1 1 A GLY 0.690 1 ATOM 346 C CA . GLY 357 357 ? A 2.127 35.620 -9.908 1 1 A GLY 0.690 1 ATOM 347 C C . GLY 357 357 ? A 1.344 34.822 -8.902 1 1 A GLY 0.690 1 ATOM 348 O O . GLY 357 357 ? A 1.766 34.688 -7.755 1 1 A GLY 0.690 1 ATOM 349 N N . VAL 358 358 ? A 0.213 34.212 -9.300 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 350 C CA . VAL 358 358 ? A -0.574 33.335 -8.430 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 351 C C . VAL 358 358 ? A 0.224 32.128 -7.967 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 352 O O . VAL 358 358 ? A 0.226 31.773 -6.784 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 353 C CB . VAL 358 358 ? A -1.859 32.862 -9.103 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 354 C CG1 . VAL 358 358 ? A -2.605 31.824 -8.240 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 355 C CG2 . VAL 358 358 ? A -2.779 34.072 -9.339 1 1 A VAL 0.700 1 ATOM 356 N N . LEU 359 359 ? A 0.971 31.488 -8.881 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 357 C CA . LEU 359 359 ? A 1.846 30.380 -8.559 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 358 C C . LEU 359 359 ? A 2.997 30.721 -7.623 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 359 O O . LEU 359 359 ? A 3.272 29.974 -6.681 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 360 C CB . LEU 359 359 ? A 2.440 29.781 -9.842 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 361 C CG . LEU 359 359 ? A 1.470 29.012 -10.752 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 362 C CD1 . LEU 359 359 ? A 2.174 28.685 -12.077 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 363 C CD2 . LEU 359 359 ? A 0.967 27.739 -10.066 1 1 A LEU 0.740 1 ATOM 364 N N . ARG 360 360 ? A 3.680 31.869 -7.817 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 365 C CA . ARG 360 360 ? A 4.700 32.357 -6.894 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 366 C C . ARG 360 360 ? A 4.146 32.578 -5.507 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 367 O O . ARG 360 360 ? A 4.733 32.203 -4.496 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 368 C CB . ARG 360 360 ? A 5.305 33.695 -7.384 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 369 C CG . ARG 360 360 ? A 6.199 33.526 -8.621 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 370 C CD . ARG 360 360 ? A 6.770 34.844 -9.154 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 371 N NE . ARG 360 360 ? A 7.222 34.617 -10.580 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 372 C CZ . ARG 360 360 ? A 7.649 35.593 -11.383 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 373 N NH1 . ARG 360 360 ? A 7.719 36.856 -10.950 1 1 A ARG 0.630 1 ATOM 374 N NH2 . ARG 360 360 ? 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ILE 327 327 ? B 9.261 38.260 -25.197 1 1 C ILE 0.710 1 ATOM 641 C CG2 . ILE 327 327 ? B 7.231 37.638 -23.786 1 1 C ILE 0.710 1 ATOM 642 C CD1 . ILE 327 327 ? B 10.124 38.731 -24.023 1 1 C ILE 0.710 1 ATOM 643 N N . GLU 328 328 ? B 7.138 34.199 -24.885 1 1 C GLU 0.680 1 ATOM 644 C CA . GLU 328 328 ? B 6.223 33.107 -24.601 1 1 C GLU 0.680 1 ATOM 645 C C . GLU 328 328 ? B 6.925 31.904 -23.983 1 1 C GLU 0.680 1 ATOM 646 O O . GLU 328 328 ? B 6.483 31.325 -22.993 1 1 C GLU 0.680 1 ATOM 647 C CB . GLU 328 328 ? B 5.468 32.686 -25.887 1 1 C GLU 0.680 1 ATOM 648 C CG . GLU 328 328 ? B 4.560 31.437 -25.740 1 1 C GLU 0.680 1 ATOM 649 C CD . GLU 328 328 ? B 3.529 31.517 -24.613 1 1 C GLU 0.680 1 ATOM 650 O OE1 . GLU 328 328 ? B 3.126 32.636 -24.212 1 1 C GLU 0.680 1 ATOM 651 O OE2 . GLU 328 328 ? B 3.160 30.402 -24.148 1 1 C GLU 0.680 1 ATOM 652 N N . LYS 329 329 ? B 8.108 31.521 -24.514 1 1 C LYS 0.670 1 ATOM 653 C CA . LYS 329 329 ? B 8.917 30.456 -23.946 1 1 C LYS 0.670 1 ATOM 654 C C . LYS 329 329 ? B 9.349 30.707 -22.505 1 1 C LYS 0.670 1 ATOM 655 O O . LYS 329 329 ? B 9.291 29.805 -21.674 1 1 C LYS 0.670 1 ATOM 656 C CB . LYS 329 329 ? B 10.156 30.160 -24.824 1 1 C LYS 0.670 1 ATOM 657 C CG . LYS 329 329 ? B 10.975 28.948 -24.354 1 1 C LYS 0.670 1 ATOM 658 C CD . LYS 329 329 ? B 12.137 28.600 -25.297 1 1 C LYS 0.670 1 ATOM 659 C CE . LYS 329 329 ? B 12.958 27.407 -24.798 1 1 C LYS 0.670 1 ATOM 660 N NZ . LYS 329 329 ? B 14.064 27.107 -25.735 1 1 C LYS 0.670 1 ATOM 661 N N . ARG 330 330 ? B 9.757 31.948 -22.170 1 1 C ARG 0.630 1 ATOM 662 C CA . ARG 330 330 ? B 10.050 32.357 -20.802 1 1 C ARG 0.630 1 ATOM 663 C C . ARG 330 330 ? B 8.860 32.288 -19.857 1 1 C ARG 0.630 1 ATOM 664 O O . ARG 330 330 ? B 8.990 31.893 -18.694 1 1 C ARG 0.630 1 ATOM 665 C CB . ARG 330 330 ? B 10.588 33.802 -20.707 1 1 C ARG 0.630 1 ATOM 666 C CG . ARG 330 330 ? B 11.932 34.049 -21.412 1 1 C ARG 0.630 1 ATOM 667 C CD . ARG 330 330 ? B 12.643 35.315 -20.930 1 1 C ARG 0.630 1 ATOM 668 N NE . ARG 330 330 ? B 13.091 35.011 -19.530 1 1 C ARG 0.630 1 ATOM 669 C CZ . ARG 330 330 ? B 13.464 35.927 -18.626 1 1 C ARG 0.630 1 ATOM 670 N NH1 . ARG 330 330 ? B 13.816 35.546 -17.399 1 1 C ARG 0.630 1 ATOM 671 N NH2 . ARG 330 330 ? B 13.498 37.219 -18.932 1 1 C ARG 0.630 1 ATOM 672 N N . TYR 331 331 ? B 7.672 32.704 -20.324 1 1 C TYR 0.660 1 ATOM 673 C CA . TYR 331 331 ? B 6.436 32.637 -19.565 1 1 C TYR 0.660 1 ATOM 674 C C . TYR 331 331 ? B 6.020 31.208 -19.269 1 1 C TYR 0.660 1 ATOM 675 O O . TYR 331 331 ? B 5.685 30.860 -18.134 1 1 C TYR 0.660 1 ATOM 676 C CB . TYR 331 331 ? B 5.318 33.416 -20.291 1 1 C TYR 0.660 1 ATOM 677 C CG . TYR 331 331 ? B 5.524 34.914 -20.306 1 1 C TYR 0.660 1 ATOM 678 C CD1 . TYR 331 331 ? B 6.493 35.601 -19.548 1 1 C TYR 0.660 1 ATOM 679 C CD2 . TYR 331 331 ? B 4.667 35.669 -21.115 1 1 C TYR 0.660 1 ATOM 680 C CE1 . TYR 331 331 ? B 6.584 36.998 -19.598 1 1 C TYR 0.660 1 ATOM 681 C CE2 . TYR 331 331 ? 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'normalized score' global . 3 # # loop_ _ma_qa_metric_global.ordinal_id _ma_qa_metric_global.model_id _ma_qa_metric_global.metric_id _ma_qa_metric_global.metric_value 1 1 2 0.640 2 1 3 0.026 3 1 4 0.322 # # loop_ _ma_qa_metric_local.ordinal_id _ma_qa_metric_local.model_id _ma_qa_metric_local.label_asym_id _ma_qa_metric_local.label_seq_id _ma_qa_metric_local.label_comp_id _ma_qa_metric_local.metric_id _ma_qa_metric_local.metric_value 1 1 A 315 PRO 1 0.260 2 1 A 316 LYS 1 0.220 3 1 A 317 GLU 1 0.510 4 1 A 318 GLY 1 0.580 5 1 A 319 GLU 1 0.580 6 1 A 320 ARG 1 0.540 7 1 A 321 ARG 1 0.560 8 1 A 322 THR 1 0.680 9 1 A 323 THR 1 0.690 10 1 A 324 HIS 1 0.640 11 1 A 325 ASN 1 0.730 12 1 A 326 ILE 1 0.720 13 1 A 327 ILE 1 0.710 14 1 A 328 GLU 1 0.680 15 1 A 329 LYS 1 0.670 16 1 A 330 ARG 1 0.630 17 1 A 331 TYR 1 0.660 18 1 A 332 ARG 1 0.540 19 1 A 333 SER 1 0.620 20 1 A 334 SER 1 0.680 21 1 A 335 ILE 1 0.700 22 1 A 336 ASN 1 0.650 23 1 A 337 ASP 1 0.720 24 1 A 338 LYS 1 0.710 25 1 A 339 ILE 1 0.700 26 1 A 340 ILE 1 0.680 27 1 A 341 GLU 1 0.700 28 1 A 342 LEU 1 0.740 29 1 A 343 LYS 1 0.680 30 1 A 344 ASP 1 0.710 31 1 A 345 LEU 1 0.740 32 1 A 346 VAL 1 0.770 33 1 A 347 MET 1 0.370 34 1 A 348 GLY 1 0.370 35 1 A 349 THR 1 0.280 36 1 A 350 ASP 1 0.290 37 1 A 351 ALA 1 0.420 38 1 A 352 LYS 1 0.320 39 1 A 353 MET 1 0.590 40 1 A 354 HIS 1 0.620 41 1 A 355 LYS 1 0.690 42 1 A 356 SER 1 0.720 43 1 A 357 GLY 1 0.690 44 1 A 358 VAL 1 0.700 45 1 A 359 LEU 1 0.740 46 1 A 360 ARG 1 0.630 47 1 A 361 LYS 1 0.660 48 1 A 362 ALA 1 0.810 49 1 A 363 ILE 1 0.770 50 1 A 364 ASP 1 0.770 51 1 A 365 TYR 1 0.760 52 1 A 366 ILE 1 0.780 53 1 A 367 LYS 1 0.730 54 1 A 368 TYR 1 0.740 55 1 A 369 LEU 1 0.770 56 1 A 370 GLN 1 0.770 57 1 A 371 GLN 1 0.690 58 1 A 372 VAL 1 0.740 59 1 A 373 ASN 1 0.760 60 1 A 374 HIS 1 0.730 61 1 A 375 LYS 1 0.730 62 1 A 376 LEU 1 0.730 63 1 A 377 ARG 1 0.580 64 1 A 378 GLN 1 0.620 65 1 B 315 PRO 1 0.260 66 1 B 316 LYS 1 0.220 67 1 B 317 GLU 1 0.510 68 1 B 318 GLY 1 0.570 69 1 B 319 GLU 1 0.570 70 1 B 320 ARG 1 0.540 71 1 B 321 ARG 1 0.560 72 1 B 322 THR 1 0.680 73 1 B 323 THR 1 0.690 74 1 B 324 HIS 1 0.640 75 1 B 325 ASN 1 0.730 76 1 B 326 ILE 1 0.720 77 1 B 327 ILE 1 0.710 78 1 B 328 GLU 1 0.680 79 1 B 329 LYS 1 0.670 80 1 B 330 ARG 1 0.630 81 1 B 331 TYR 1 0.660 82 1 B 332 ARG 1 0.540 83 1 B 333 SER 1 0.630 84 1 B 334 SER 1 0.680 85 1 B 335 ILE 1 0.700 86 1 B 336 ASN 1 0.660 87 1 B 337 ASP 1 0.720 88 1 B 338 LYS 1 0.710 89 1 B 339 ILE 1 0.710 90 1 B 340 ILE 1 0.680 91 1 B 341 GLU 1 0.710 92 1 B 342 LEU 1 0.740 93 1 B 343 LYS 1 0.690 94 1 B 344 ASP 1 0.710 95 1 B 345 LEU 1 0.740 96 1 B 346 VAL 1 0.770 97 1 B 347 MET 1 0.370 98 1 B 348 GLY 1 0.370 99 1 B 349 THR 1 0.280 100 1 B 350 ASP 1 0.290 101 1 B 351 ALA 1 0.420 102 1 B 352 LYS 1 0.320 103 1 B 353 MET 1 0.590 104 1 B 354 HIS 1 0.620 105 1 B 355 LYS 1 0.690 106 1 B 356 SER 1 0.720 107 1 B 357 GLY 1 0.690 108 1 B 358 VAL 1 0.700 109 1 B 359 LEU 1 0.730 110 1 B 360 ARG 1 0.630 111 1 B 361 LYS 1 0.660 112 1 B 362 ALA 1 0.810 113 1 B 363 ILE 1 0.770 114 1 B 364 ASP 1 0.770 115 1 B 365 TYR 1 0.760 116 1 B 366 ILE 1 0.780 117 1 B 367 LYS 1 0.730 118 1 B 368 TYR 1 0.740 119 1 B 369 LEU 1 0.770 120 1 B 370 GLN 1 0.770 121 1 B 371 GLN 1 0.690 122 1 B 372 VAL 1 0.740 123 1 B 373 ASN 1 0.760 124 1 B 374 HIS 1 0.730 125 1 B 375 LYS 1 0.730 126 1 B 376 LEU 1 0.730 127 1 B 377 ARG 1 0.580 128 1 B 378 GLN 1 0.620 # # loop_ _pdbx_data_usage.id _pdbx_data_usage.type _pdbx_data_usage.details _pdbx_data_usage.url 1 license ;This SWISS-MODEL protein model is copyright. It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. 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All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #