data_SMR-a75940aeb8847d0ce680caa3818becbd_4 _entry.id SMR-a75940aeb8847d0ce680caa3818becbd_4 _struct.entry_id SMR-a75940aeb8847d0ce680caa3818becbd_4 _struct.pdbx_model_details ;This model was generated unsupervised by the SWISS-MODEL homology-modelling pipeline for the SWISS-MODEL Repository, a database of annotated 3D protein structure models. The modelled monomer covers following UniProtKB entries: - O88573/ AFF1_MOUSE, AF4/FMR2 family member 1 Estimated model accuracy of this model is 0.0, calculated by SWISS-MODEL as Global Model Quality Estimate (GMQE). ; _struct.pdbx_structure_determination_methodology computational _struct.title 'Model for UniProtKB entries O88573' _audit_conform.dict_location https://raw.githubusercontent.com/ihmwg/ModelCIF/d18ba38/base/mmcif_ma-core.dic _audit_conform.dict_name mmcif_ma.dic _audit_conform.dict_version 1.4.6 # loop_ _citation.id _citation.title _citation.journal_abbrev _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.year _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.pdbx_database_id_DOI primary 'The SWISS-MODEL Repository - new features and functionality' 'Nucleic Acids Res.' 45 D313 D319 2017 27899672 10.1093/nar/gkw1132 2 'SWISS-MODEL: homology modelling of protein structures and complexes' 'Nucleic Acids Res.' 46 W296 W303 2018 29788355 10.1093/nar/gky427 3 'ProMod3 - A versatile homology modelling toolbox' 'PLoS Comput. Biol.' 17(1) 1 18 2021 33507980 10.1371/journal.pcbi.1008667 4 'QMEANDisCo - distance constraints applied on model quality estimation' Bioinformatics 36 1765 1771 2020 31697312 10.1093/bioinformatics/btz828 5 'OpenStructure: an integrated software framework for computational structural biology' 'Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr.' 69 701 709 2013 23633579 10.1107/S0907444913007051 6 'BLAST+: architecture and applications' 'BMC Bioinf.' 10 421 . 2009 20003500 10.1186/1471-2105-10-421 7 'HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation' 'BMC Bioinf.' 20 473 . 2019 31521110 10.1186/s12859-019-3019-7 # # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Bienert, S.' 1 primary 'Waterhouse, A.' 2 primary 'de Beer, T.A.P.' 3 primary 'Tauriello, G.' 4 primary 'Studer, G.' 5 primary 'Bordoli, L.' 6 primary 'Schwede, T.' 7 2 'Waterhouse, A.' 8 2 'Bertoni, M.' 9 2 'Bienert, S.' 10 2 'Studer, G.' 11 2 'Tauriello, G.' 12 2 'Gumienny, R.' 13 2 'Heer, F.T.' 14 2 'de Beer, T.A.P.' 15 2 'Rempfer, C.' 16 2 'Bordoli, L.' 17 2 'Lepore, R.' 18 2 'Schwede, T.' 19 3 'Studer, G.' 20 3 'Tauriello, G.' 21 3 'Bienert, S.' 22 3 'Biasini, M.' 23 3 'Johner, N.' 24 3 'Schwede, T.' 25 4 'Studer, G.' 26 4 'Rempfer, C.' 27 4 'Waterhouse, A.M.' 28 4 'Gumienny, R.' 29 4 'Haas, J.' 30 4 'Schwede, T.' 31 5 'Biasini, M.' 32 5 'Schmidt, T.' 33 5 'Bienert, S.' 34 5 'Mariani, V.' 35 5 'Studer, G.' 36 5 'Haas, J.' 37 5 'Johner, N.' 38 5 'Schenk, A.D.' 39 5 'Philippsen, A.' 40 5 'Schwede, T.' 41 6 'Camacho, C.' 42 6 'Coulouris, G.' 43 6 'Avagyan, V.' 44 6 'Ma, N.' 45 6 'Papadopoulos, J.' 46 6 'Bealer, K.' 47 6 'Madden, T.L.' 48 7 'Steinegger, M.' 49 7 'Meier, M.' 50 7 'Mirdita, M.' 51 7 'Vohringer, H.' 52 7 'Haunsberger, S.J.' 53 7 'Soding, J.' 54 # # loop_ _software.pdbx_ordinal _software.name _software.classification _software.description _software.version _software.type _software.location _software.citation_id 1 SWISS-MODEL 'model building' 'Homology modelling web service' 3ef406dae3f6eb8b74980f2a6e69a2109acde4aa package https://swissmodel.expasy.org 2 2 ProMod3 'model building' 'Modular homology modelling engine' 3.4.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/ProMod3 3 3 QMEAN 'model building' 'QMEAN - Qualitative Model Energy ANalysis' 4.3.1 library https://git.scicore.unibas.ch/schwede/QMEAN 4 4 OpenStructure 'data processing' 'Open-Source Computational Structural Biology Framework' 2.8.0 package https://openstructure.org/ 5 5 BLAST 'data collection' . 2.2.31 package https://blast.ncbi.nlm.nih.gov 6 6 HH-suite 'data collection' 'HH-suite3 for sensitive sequence searching' 3.2.0 package https://github.com/soedinglab/hh-suite 7 # # loop_ _ma_software_group.ordinal_id _ma_software_group.group_id _ma_software_group.software_id _ma_software_group.parameter_group_id 1 1 5 . 2 2 1 . 3 2 4 . 4 2 5 . 5 2 6 . 6 3 1 . 7 3 4 . 8 4 1 . 9 4 2 . 10 4 4 . 11 5 3 . 12 6 1 . 13 6 3 . 14 6 4 . # # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal 'Bienert, S.' 1 'Waterhouse, A.' 2 'de Beer, T.A.P.' 3 'Tauriello, G.' 4 'Studer, G.' 5 'Bordoli, L.' 6 'Schwede, T.' 7 # # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.name _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight _chem_comp.ma_provenance ALA 'L-peptide linking' ALANINE 'C3 H7 N O2' 89.094 'CCD Core' ARG 'L-peptide linking' ARGININE 'C6 H15 N4 O2 1' 175.212 'CCD Core' ASN 'L-peptide linking' ASPARAGINE 'C4 H8 N2 O3' 132.119 'CCD Core' ASP 'L-peptide linking' 'ASPARTIC ACID' 'C4 H7 N O4' 133.103 'CCD Core' CYS 'L-peptide linking' CYSTEINE 'C3 H7 N O2 S' 121.154 'CCD Core' GLN 'L-peptide linking' GLUTAMINE 'C5 H10 N2 O3' 146.146 'CCD Core' GLU 'L-peptide linking' 'GLUTAMIC ACID' 'C5 H9 N O4' 147.130 'CCD Core' GLY 'peptide linking' GLYCINE 'C2 H5 N O2' 75.067 'CCD Core' HIS 'L-peptide linking' HISTIDINE 'C6 H10 N3 O2 1' 156.165 'CCD Core' ILE 'L-peptide linking' ISOLEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LEU 'L-peptide linking' LEUCINE 'C6 H13 N O2' 131.175 'CCD Core' LYS 'L-peptide linking' LYSINE 'C6 H15 N2 O2 1' 147.198 'CCD Core' MET 'L-peptide linking' METHIONINE 'C5 H11 N O2 S' 149.208 'CCD Core' PHE 'L-peptide linking' PHENYLALANINE 'C9 H11 N O2' 165.192 'CCD Core' PRO 'L-peptide linking' PROLINE 'C5 H9 N O2' 115.132 'CCD Core' SER 'L-peptide linking' SERINE 'C3 H7 N O3' 105.093 'CCD Core' THR 'L-peptide linking' THREONINE 'C4 H9 N O3' 119.120 'CCD Core' TRP 'L-peptide linking' TRYPTOPHAN 'C11 H12 N2 O2' 204.229 'CCD Core' TYR 'L-peptide linking' TYROSINE 'C9 H11 N O3' 181.191 'CCD Core' VAL 'L-peptide linking' VALINE 'C5 H11 N O2' 117.148 'CCD Core' # # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.details 1 polymer man . 153649.152 1 . # # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.entity_id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_align_begin _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.details 1 1 UNP AFF1_MOUSE O88573 1 ;MAAHSSLYNEDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKAPLFPEPYKTAKGDELSSRIQTMLGDYEEMKEF LSSKSHPHRLDGSEDRPGKPRYPLGHDRGNGAASSSLRTHVYHQPIHTSAPGSRPVGNISHSPKMAQPRM EPSLHTKIYDGPRLTQDHLSQGHCSRKCDRRAEGDSAPERKLSPLISSLPSPVPPLSPVHSRLQGTSKAH SSGVSSKSCCVAKSSKDLVAKAQDKETPHDGLVAVTSLGSAPPQPPCQTFPPPPLPSKSAAMQQKPTAYV RPMDGQDQAPSESPELKLPLEDYGQQSFEKPDLKVPAKAKLTRLRMPSQSVEQPYSNEVHCVEEILKEMT HSWPPPLTAIHTPSTAEPSRFPFPTKDPLHVSPATQSQKQYDTPSKTHPNPQQGTSMLEDDLQLSDSEDS DTEQATEKPPSPPAPPSAPQTLPEPVASAHSSSGESESSESDSSSDSESESSSSDSEEEEENEPLETRAP EPEPPTTNKWQLDNWLTKVNQPSVPLDGRGSTESPQWRQESKGVAEGSSDQQHPDSKDPLPKSSSKTLRG PSEGPSLGRGAVRNPPLNRNPHLGKPWAANNPGNPPRLRPGRAQASSQAESEVGPLPYGSKEQTSKDRPK VKTKGRPRAVGSREPKPEVPAPTPQAAVPRPKPPVPTPSEKRKHKSSTAPSKAPSAPQPPKDSAGDRNPE HSALVSLTQSQGPSHSSRGSSGSVRTSGCRQAVIAQGDGCKDKLLLPLRDTKLLSPLRDSPPPTSLVVKI TLDLLTRIPQPLGKGSRPRKAEDKQLSAGKKQDSETKSCDSSSRVTKKRKVTQKKSTVTRDTNWISRRAS SSSSHTESSRTKAPRSSSENSRKEMLPPASASSVSSSSSSQKPSRPAQKRPRPDEDTCSQEPPRSASSTK SSSTDPPAPKHRKVQARGSEHKGSSGDAANAANPFPVPSLPNGNAKPGKPQVKSDRQQADFHMKEAKKLK CKAETMVDKAGKAFKYLEAVLSFIECGMASESESSAKSAYAVYSETIDLIRYVMSLKCFSDNTMPAQEKI FAVLCLRCQSLLNMAMFRCKKDTVMKYSRTLSEHFKSTSKVAQAPSPCTARSTGVPSPLSPMPSPASSVG SQSSAGSSMGSVGVTATVSTPVSIQNMTSSYVTITSHVLTAFSLWEQAEALTRKNKEFFAQLSTKVRVLA LNSSLVDLVHYTRQGLQRLKQSPKGP ; 'AF4/FMR2 family member 1' # # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.db_align_end 1 1 1 1216 1 1216 # # loop_ _ma_target_ref_db_details.target_entity_id _ma_target_ref_db_details.db_name _ma_target_ref_db_details.db_name_other_details _ma_target_ref_db_details.db_code _ma_target_ref_db_details.db_accession _ma_target_ref_db_details.seq_db_isoform _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_begin _ma_target_ref_db_details.seq_db_align_end _ma_target_ref_db_details.ncbi_taxonomy_id _ma_target_ref_db_details.organism_scientific _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_version_date _ma_target_ref_db_details.seq_db_sequence_checksum 1 UNP . AFF1_MOUSE O88573 . 1 1216 10090 'Mus musculus (Mouse)' 2012-10-03 4CCA54DBB4992E8B # # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can 1 polypeptide(L) no no A ;MAAHSSLYNEDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKAPLFPEPYKTAKGDELSSRIQTMLGDYEEMKEF LSSKSHPHRLDGSEDRPGKPRYPLGHDRGNGAASSSLRTHVYHQPIHTSAPGSRPVGNISHSPKMAQPRM EPSLHTKIYDGPRLTQDHLSQGHCSRKCDRRAEGDSAPERKLSPLISSLPSPVPPLSPVHSRLQGTSKAH SSGVSSKSCCVAKSSKDLVAKAQDKETPHDGLVAVTSLGSAPPQPPCQTFPPPPLPSKSAAMQQKPTAYV RPMDGQDQAPSESPELKLPLEDYGQQSFEKPDLKVPAKAKLTRLRMPSQSVEQPYSNEVHCVEEILKEMT HSWPPPLTAIHTPSTAEPSRFPFPTKDPLHVSPATQSQKQYDTPSKTHPNPQQGTSMLEDDLQLSDSEDS DTEQATEKPPSPPAPPSAPQTLPEPVASAHSSSGESESSESDSSSDSESESSSSDSEEEEENEPLETRAP EPEPPTTNKWQLDNWLTKVNQPSVPLDGRGSTESPQWRQESKGVAEGSSDQQHPDSKDPLPKSSSKTLRG PSEGPSLGRGAVRNPPLNRNPHLGKPWAANNPGNPPRLRPGRAQASSQAESEVGPLPYGSKEQTSKDRPK VKTKGRPRAVGSREPKPEVPAPTPQAAVPRPKPPVPTPSEKRKHKSSTAPSKAPSAPQPPKDSAGDRNPE HSALVSLTQSQGPSHSSRGSSGSVRTSGCRQAVIAQGDGCKDKLLLPLRDTKLLSPLRDSPPPTSLVVKI TLDLLTRIPQPLGKGSRPRKAEDKQLSAGKKQDSETKSCDSSSRVTKKRKVTQKKSTVTRDTNWISRRAS SSSSHTESSRTKAPRSSSENSRKEMLPPASASSVSSSSSSQKPSRPAQKRPRPDEDTCSQEPPRSASSTK SSSTDPPAPKHRKVQARGSEHKGSSGDAANAANPFPVPSLPNGNAKPGKPQVKSDRQQADFHMKEAKKLK CKAETMVDKAGKAFKYLEAVLSFIECGMASESESSAKSAYAVYSETIDLIRYVMSLKCFSDNTMPAQEKI FAVLCLRCQSLLNMAMFRCKKDTVMKYSRTLSEHFKSTSKVAQAPSPCTARSTGVPSPLSPMPSPASSVG SQSSAGSSMGSVGVTATVSTPVSIQNMTSSYVTITSHVLTAFSLWEQAEALTRKNKEFFAQLSTKVRVLA LNSSLVDLVHYTRQGLQRLKQSPKGP ; ;MAAHSSLYNEDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKAPLFPEPYKTAKGDELSSRIQTMLGDYEEMKEF LSSKSHPHRLDGSEDRPGKPRYPLGHDRGNGAASSSLRTHVYHQPIHTSAPGSRPVGNISHSPKMAQPRM EPSLHTKIYDGPRLTQDHLSQGHCSRKCDRRAEGDSAPERKLSPLISSLPSPVPPLSPVHSRLQGTSKAH SSGVSSKSCCVAKSSKDLVAKAQDKETPHDGLVAVTSLGSAPPQPPCQTFPPPPLPSKSAAMQQKPTAYV RPMDGQDQAPSESPELKLPLEDYGQQSFEKPDLKVPAKAKLTRLRMPSQSVEQPYSNEVHCVEEILKEMT HSWPPPLTAIHTPSTAEPSRFPFPTKDPLHVSPATQSQKQYDTPSKTHPNPQQGTSMLEDDLQLSDSEDS DTEQATEKPPSPPAPPSAPQTLPEPVASAHSSSGESESSESDSSSDSESESSSSDSEEEEENEPLETRAP EPEPPTTNKWQLDNWLTKVNQPSVPLDGRGSTESPQWRQESKGVAEGSSDQQHPDSKDPLPKSSSKTLRG PSEGPSLGRGAVRNPPLNRNPHLGKPWAANNPGNPPRLRPGRAQASSQAESEVGPLPYGSKEQTSKDRPK VKTKGRPRAVGSREPKPEVPAPTPQAAVPRPKPPVPTPSEKRKHKSSTAPSKAPSAPQPPKDSAGDRNPE HSALVSLTQSQGPSHSSRGSSGSVRTSGCRQAVIAQGDGCKDKLLLPLRDTKLLSPLRDSPPPTSLVVKI TLDLLTRIPQPLGKGSRPRKAEDKQLSAGKKQDSETKSCDSSSRVTKKRKVTQKKSTVTRDTNWISRRAS SSSSHTESSRTKAPRSSSENSRKEMLPPASASSVSSSSSSQKPSRPAQKRPRPDEDTCSQEPPRSASSTK SSSTDPPAPKHRKVQARGSEHKGSSGDAANAANPFPVPSLPNGNAKPGKPQVKSDRQQADFHMKEAKKLK CKAETMVDKAGKAFKYLEAVLSFIECGMASESESSAKSAYAVYSETIDLIRYVMSLKCFSDNTMPAQEKI FAVLCLRCQSLLNMAMFRCKKDTVMKYSRTLSEHFKSTSKVAQAPSPCTARSTGVPSPLSPMPSPASSVG SQSSAGSSMGSVGVTATVSTPVSIQNMTSSYVTITSHVLTAFSLWEQAEALTRKNKEFFAQLSTKVRVLA LNSSLVDLVHYTRQGLQRLKQSPKGP ; # # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET . 1 2 ALA . 1 3 ALA . 1 4 HIS . 1 5 SER . 1 6 SER . 1 7 LEU . 1 8 TYR . 1 9 ASN . 1 10 GLU . 1 11 ASP . 1 12 ARG . 1 13 ASN . 1 14 LEU . 1 15 LEU . 1 16 ARG . 1 17 ILE . 1 18 ARG . 1 19 GLU . 1 20 LYS . 1 21 GLU . 1 22 ARG . 1 23 ARG . 1 24 ASN . 1 25 GLN . 1 26 GLU . 1 27 ALA . 1 28 HIS . 1 29 GLN . 1 30 GLU . 1 31 LYS . 1 32 GLU . 1 33 ALA . 1 34 PHE . 1 35 PRO . 1 36 GLU . 1 37 LYS . 1 38 ALA . 1 39 PRO . 1 40 LEU . 1 41 PHE . 1 42 PRO . 1 43 GLU . 1 44 PRO . 1 45 TYR . 1 46 LYS . 1 47 THR . 1 48 ALA . 1 49 LYS . 1 50 GLY . 1 51 ASP . 1 52 GLU . 1 53 LEU . 1 54 SER . 1 55 SER . 1 56 ARG . 1 57 ILE . 1 58 GLN . 1 59 THR . 1 60 MET . 1 61 LEU . 1 62 GLY . 1 63 ASP . 1 64 TYR . 1 65 GLU . 1 66 GLU . 1 67 MET . 1 68 LYS . 1 69 GLU . 1 70 PHE . 1 71 LEU . 1 72 SER . 1 73 SER . 1 74 LYS . 1 75 SER . 1 76 HIS . 1 77 PRO . 1 78 HIS . 1 79 ARG . 1 80 LEU . 1 81 ASP . 1 82 GLY . 1 83 SER . 1 84 GLU . 1 85 ASP . 1 86 ARG . 1 87 PRO . 1 88 GLY . 1 89 LYS . 1 90 PRO . 1 91 ARG . 1 92 TYR . 1 93 PRO . 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A 1 1061 LEU 1061 ? ? ? A . A 1 1062 LEU 1062 ? ? ? A . A 1 1063 ASN 1063 ? ? ? A . A 1 1064 MET 1064 ? ? ? A . A 1 1065 ALA 1065 ? ? ? A . A 1 1066 MET 1066 ? ? ? A . A 1 1067 PHE 1067 ? ? ? A . A 1 1068 ARG 1068 ? ? ? A . A 1 1069 CYS 1069 ? ? ? A . A 1 1070 LYS 1070 ? ? ? A . A 1 1071 LYS 1071 ? ? ? A . A 1 1072 ASP 1072 ? ? ? A . A 1 1073 THR 1073 ? ? ? A . A 1 1074 VAL 1074 ? ? ? A . A 1 1075 MET 1075 ? ? ? A . A 1 1076 LYS 1076 ? ? ? A . A 1 1077 TYR 1077 ? ? ? A . A 1 1078 SER 1078 ? ? ? A . A 1 1079 ARG 1079 ? ? ? A . A 1 1080 THR 1080 ? ? ? A . A 1 1081 LEU 1081 ? ? ? A . A 1 1082 SER 1082 ? ? ? A . A 1 1083 GLU 1083 ? ? ? A . A 1 1084 HIS 1084 ? ? ? A . A 1 1085 PHE 1085 ? ? ? A . A 1 1086 LYS 1086 ? ? ? A . A 1 1087 SER 1087 ? ? ? A . A 1 1088 THR 1088 ? ? ? A . A 1 1089 SER 1089 ? ? ? A . A 1 1090 LYS 1090 ? ? ? A . A 1 1091 VAL 1091 ? ? ? A . A 1 1092 ALA 1092 ? ? ? A . A 1 1093 GLN 1093 ? ? ? A . A 1 1094 ALA 1094 ? ? ? A . A 1 1095 PRO 1095 ? ? ? A . A 1 1096 SER 1096 ? ? ? A . A 1 1097 PRO 1097 ? ? ? A . A 1 1098 CYS 1098 ? ? ? A . A 1 1099 THR 1099 ? ? ? A . A 1 1100 ALA 1100 ? ? ? A . A 1 1101 ARG 1101 ? ? ? A . A 1 1102 SER 1102 ? ? ? A . A 1 1103 THR 1103 ? ? ? A . A 1 1104 GLY 1104 ? ? ? A . A 1 1105 VAL 1105 ? ? ? A . A 1 1106 PRO 1106 ? ? ? A . A 1 1107 SER 1107 ? ? ? A . A 1 1108 PRO 1108 ? ? ? A . A 1 1109 LEU 1109 ? ? ? A . A 1 1110 SER 1110 ? ? ? A . A 1 1111 PRO 1111 ? ? ? A . A 1 1112 MET 1112 ? ? ? A . A 1 1113 PRO 1113 ? ? ? A . A 1 1114 SER 1114 ? ? ? A . A 1 1115 PRO 1115 ? ? ? A . A 1 1116 ALA 1116 ? ? ? A . A 1 1117 SER 1117 ? ? ? A . A 1 1118 SER 1118 ? ? ? A . A 1 1119 VAL 1119 ? ? ? A . A 1 1120 GLY 1120 ? ? ? A . A 1 1121 SER 1121 ? ? ? A . A 1 1122 GLN 1122 ? ? ? A . A 1 1123 SER 1123 ? ? ? A . A 1 1124 SER 1124 ? ? ? A . A 1 1125 ALA 1125 ? ? ? A . A 1 1126 GLY 1126 ? ? ? A . A 1 1127 SER 1127 ? ? ? A . A 1 1128 SER 1128 ? ? ? A . A 1 1129 MET 1129 ? ? ? A . A 1 1130 GLY 1130 ? ? ? A . A 1 1131 SER 1131 ? ? ? A . A 1 1132 VAL 1132 ? ? ? A . A 1 1133 GLY 1133 ? ? ? A . A 1 1134 VAL 1134 ? ? ? A . A 1 1135 THR 1135 ? ? ? A . A 1 1136 ALA 1136 ? ? ? A . A 1 1137 THR 1137 ? ? ? A . A 1 1138 VAL 1138 ? ? ? A . A 1 1139 SER 1139 ? ? ? A . A 1 1140 THR 1140 ? ? ? A . A 1 1141 PRO 1141 ? ? ? A . A 1 1142 VAL 1142 ? ? ? A . A 1 1143 SER 1143 ? ? ? A . A 1 1144 ILE 1144 ? ? ? A . A 1 1145 GLN 1145 ? ? ? A . A 1 1146 ASN 1146 ? ? ? A . A 1 1147 MET 1147 ? ? ? A . A 1 1148 THR 1148 ? ? ? A . A 1 1149 SER 1149 ? ? ? A . A 1 1150 SER 1150 ? ? ? A . A 1 1151 TYR 1151 ? ? ? A . A 1 1152 VAL 1152 ? ? ? A . A 1 1153 THR 1153 ? ? ? A . A 1 1154 ILE 1154 ? ? ? A . A 1 1155 THR 1155 ? ? ? A . A 1 1156 SER 1156 ? ? ? A . A 1 1157 HIS 1157 ? ? ? A . A 1 1158 VAL 1158 ? ? ? A . A 1 1159 LEU 1159 ? ? ? A . A 1 1160 THR 1160 ? ? ? A . A 1 1161 ALA 1161 ? ? ? A . A 1 1162 PHE 1162 ? ? ? A . A 1 1163 SER 1163 ? ? ? A . A 1 1164 LEU 1164 ? ? ? A . A 1 1165 TRP 1165 ? ? ? A . A 1 1166 GLU 1166 ? ? ? A . A 1 1167 GLN 1167 ? ? ? A . A 1 1168 ALA 1168 ? ? ? A . A 1 1169 GLU 1169 ? ? ? A . A 1 1170 ALA 1170 ? ? ? A . A 1 1171 LEU 1171 ? ? ? A . A 1 1172 THR 1172 ? ? ? A . A 1 1173 ARG 1173 ? ? ? A . A 1 1174 LYS 1174 ? ? ? A . A 1 1175 ASN 1175 ? ? ? A . A 1 1176 LYS 1176 ? ? ? A . A 1 1177 GLU 1177 ? ? ? A . A 1 1178 PHE 1178 ? ? ? A . A 1 1179 PHE 1179 ? ? ? A . A 1 1180 ALA 1180 ? ? ? A . A 1 1181 GLN 1181 ? ? ? A . A 1 1182 LEU 1182 ? ? ? A . A 1 1183 SER 1183 ? ? ? A . A 1 1184 THR 1184 ? ? ? A . A 1 1185 LYS 1185 ? ? ? A . A 1 1186 VAL 1186 ? ? ? A . A 1 1187 ARG 1187 ? ? ? A . A 1 1188 VAL 1188 ? ? ? A . A 1 1189 LEU 1189 ? ? ? A . A 1 1190 ALA 1190 ? ? ? A . A 1 1191 LEU 1191 ? ? ? A . A 1 1192 ASN 1192 ? ? ? A . A 1 1193 SER 1193 ? ? ? A . A 1 1194 SER 1194 ? ? ? A . A 1 1195 LEU 1195 ? ? ? A . A 1 1196 VAL 1196 ? ? ? A . A 1 1197 ASP 1197 ? ? ? A . A 1 1198 LEU 1198 ? ? ? A . A 1 1199 VAL 1199 ? ? ? A . A 1 1200 HIS 1200 ? ? ? A . A 1 1201 TYR 1201 ? ? ? A . A 1 1202 THR 1202 ? ? ? A . A 1 1203 ARG 1203 ? ? ? A . A 1 1204 GLN 1204 ? ? ? A . A 1 1205 GLY 1205 ? ? ? A . A 1 1206 LEU 1206 ? ? ? A . A 1 1207 GLN 1207 ? ? ? A . A 1 1208 ARG 1208 ? ? ? A . A 1 1209 LEU 1209 ? ? ? A . A 1 1210 LYS 1210 ? ? ? A . A 1 1211 GLN 1211 ? ? ? A . A 1 1212 SER 1212 ? ? ? A . A 1 1213 PRO 1213 ? ? ? A . A 1 1214 LYS 1214 ? ? ? A . A 1 1215 GLY 1215 ? ? ? A . A 1 1216 PRO 1216 ? ? ? A . # # loop_ _ma_data.id _ma_data.name _ma_data.content_type _ma_data.content_type_other_details 1 'AF4/FMR2 family member 4 {PDB ID=5jw9, label_asym_id=A, auth_asym_id=A, SMTL ID=5jw9.1.A}' 'template structure' . 2 . target . 3 'Target-template alignment by BLAST to 5jw9, label_asym_id=A' 'target-template alignment' . 4 'model 4' 'model coordinates' . 5 SMTL 'reference database' . 6 PDB 'reference database' . 7 'Template search output' other 'Results of the sequence search' # # loop_ _ma_data_group.ordinal_id _ma_data_group.group_id _ma_data_group.data_id 1 1 2 2 1 5 3 1 6 4 2 7 5 3 2 6 3 1 7 3 3 8 4 1 9 4 3 10 5 4 # # loop_ _ma_data_ref_db.data_id _ma_data_ref_db.name _ma_data_ref_db.location_url _ma_data_ref_db.version _ma_data_ref_db.release_date 5 SMTL https://swissmodel.expasy.org/templates/ . 2025-01-29 6 PDB https://www.wwpdb.org . 2025-01-24 # # loop_ _ma_target_entity.entity_id _ma_target_entity.data_id _ma_target_entity.origin 1 2 'reference database' # # loop_ _ma_target_entity_instance.asym_id _ma_target_entity_instance.entity_id _ma_target_entity_instance.details A 1 . # # loop_ _ma_template_trans_matrix.id _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][1] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][2] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[1][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[2][3] _ma_template_trans_matrix.rot_matrix[3][3] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[1] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[2] _ma_template_trans_matrix.tr_vector[3] 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0 0 0 # # loop_ _ma_template_details.ordinal_id _ma_template_details.template_id _ma_template_details.template_origin _ma_template_details.template_entity_type _ma_template_details.template_trans_matrix_id _ma_template_details.template_data_id _ma_template_details.target_asym_id _ma_template_details.template_label_asym_id _ma_template_details.template_label_entity_id _ma_template_details.template_model_num _ma_template_details.template_auth_asym_id 1 1 'reference database' polymer 1 1 A A 1 1 A # # loop_ _ma_template_poly.template_id _ma_template_poly.seq_one_letter_code _ma_template_poly.seq_one_letter_code_can 1 GAMGSPSQPLDASASGDVSCVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKEGSGSGSGS GAMGSPSQPLDASASGDVSCVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKEGSGSGSGS # # loop_ _ma_template_poly_segment.id _ma_template_poly_segment.template_id _ma_template_poly_segment.residue_number_begin _ma_template_poly_segment.residue_number_end 1 1 6 56 # # loop_ _ma_template_ref_db_details.template_id _ma_template_ref_db_details.db_name _ma_template_ref_db_details.db_name_other_details _ma_template_ref_db_details.db_accession_code _ma_template_ref_db_details.db_version_date 1 PDB . 5jw9 2024-11-06 # # loop_ _ma_target_template_poly_mapping.id _ma_target_template_poly_mapping.template_segment_id _ma_target_template_poly_mapping.target_asym_id _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_begin _ma_target_template_poly_mapping.target_seq_id_end 1 1 A 1 1216 # # loop_ _ma_alignment_info.alignment_id _ma_alignment_info.data_id _ma_alignment_info.software_group_id _ma_alignment_info.alignment_length _ma_alignment_info.alignment_type _ma_alignment_info.alignment_mode 1 3 1 1216 'target-template pairwise alignment' local # # loop_ _ma_alignment_details.ordinal_id _ma_alignment_details.alignment_id _ma_alignment_details.template_segment_id _ma_alignment_details.target_asym_id _ma_alignment_details.score_type _ma_alignment_details.score_type_other_details _ma_alignment_details.score_value _ma_alignment_details.percent_sequence_identity _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator _ma_alignment_details.sequence_identity_denominator_other_details 1 1 1 A 'BLAST e-value' . 6.78e-17 70.588 'Number of aligned residue pairs (not including the gaps)' . # # loop_ _ma_alignment.ordinal_id _ma_alignment.alignment_id _ma_alignment.target_template_flag _ma_alignment.sequence 1 1 1 MAAHSSLYNEDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKAPLFPEPYKTAKGDELSSRIQTMLGDYEEMKEFLSSKSHPHRLDGSEDRPGKPRYPLGHDRGNGAASSSLRTHVYHQPIHTSAPGSRPVGNISHSPKMAQPRMEPSLHTKIYDGPRLTQDHLSQGHCSRKCDRRAEGDSAPERKLSPLISSLPSPVPPLSPVHSRLQGTSKAHSSGVSSKSCCVAKSSKDLVAKAQDKETPHDGLVAVTSLGSAPPQPPCQTFPPPPLPSKSAAMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKLPLEDYGQQSFEKPDLKVPAKAKLTRLRMPSQSVEQPYSNEVHCVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSRFPFPTKDPLHVSPATQSQKQYDTPSKTHPNPQQGTSMLEDDLQLSDSEDSDTEQATEKPPSPPAPPSAPQTLPEPVASAHSSSGESESSESDSSSDSESESSSSDSEEEEENEPLETRAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVNQPSVPLDGRGSTESPQWRQESKGVAEGSSDQQHPDSKDPLPKSSSKTLRGPSEGPSLGRGAVRNPPLNRNPHLGKPWAANNPGNPPRLRPGRAQASSQAESEVGPLPYGSKEQTSKDRPKVKTKGRPRAVGSREPKPEVPAPTPQAAVPRPKPPVPTPSEKRKHKSSTAPSKAPSAPQPPKDSAGDRNPEHSALVSLTQSQGPSHSSRGSSGSVRTSGCRQAVIAQGDGCKDKLLLPLRDTKLLSPLRDSPPPTSLVVKITLDLLTRIPQPLGKGSRPRKAEDKQLSAGKKQDSETKSCDSSSRVTKKRKVTQKKSTVTRDTNWISRRASSSSSHTESSRTKAPRSSSENSRKEMLPPASASSVSSSSSSQKPSRPAQKRPRPDEDTCSQEPPRSASSTKSSSTDPPAPKHRKVQARGSEHKGSSGDAANAANPFPVPSLPNGNAKPGKPQVKSDRQQADFHMKEAKKLKCKAETMVDKAGKAFKYLEAVLSFIECGMASESESSAKSAYAVYSETIDLIRYVMSLKCFSDNTMPAQEKIFAVLCLRCQSLLNMAMFRCKKDTVMKYSRTLSEHFKSTSKVAQAPSPCTARSTGVPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSSMGSVGVTATVSTPVSIQNMTSSYVTITSHVLTAFSLWEQAEALTRKNKEFFAQLSTKVRVLALNSSLVDLVHYTRQGLQRLKQSPKGP 2 1 2 --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------PSQPLDASASGDVSCVDEILKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKE----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- # # loop_ _ma_protocol_step.ordinal_id _ma_protocol_step.protocol_id _ma_protocol_step.step_id _ma_protocol_step.method_type _ma_protocol_step.step_name _ma_protocol_step.details _ma_protocol_step.software_group_id _ma_protocol_step.input_data_group_id _ma_protocol_step.output_data_group_id 1 1 1 'template search' 'template search' 'SWISS-MODEL template search in PDB' 2 1 2 2 1 2 'template selection' 'template selection' 'Automatic template selection by SWISS-MODEL {QSQE=0.000}' 3 2 4 3 1 3 modeling 'homology modeling' 'SWISS-MODEL auto-model mode using ProMod3 on 5jw9.1' 4 3 5 # # loop_ _ma_model_list.ordinal_id _ma_model_list.model_id _ma_model_list.model_group_id _ma_model_list.model_name _ma_model_list.model_group_name _ma_model_list.data_id _ma_model_list.model_type _ma_model_list.model_type_other_details 1 1 1 'model 4' . 4 'Homology model' . # # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.label_entity_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_PDB_model_num ATOM 1 N N . 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It is produced by the SWISS-MODEL server, developed by the Computational Structural Biology Group at the SIB Swiss Institute of Bioinformatics at the Biozentrum, University of Basel (https://swissmodel.expasy.org). This model is licensed under the CC BY-SA 4.0 Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode), i.e. you can copy and redistribute the model in any medium or format, transform and build upon the model for any purpose, even commercially, under the following terms: Attribution - You must give appropriate credit, provide a link to the license, and indicate if changes were made. You may do so in any reasonable manner, but not in any way that suggests the licensor endorses you or your use. When you publish, patent or distribute results that were fully or partially based on the model, please cite the corresponding papers mentioned under JRNL. ShareAlike - If you remix, transform, or build upon the material, you must distribute your contributions under the same license as the original. No additional restrictions - you may not apply legal terms or technological measures that legally restrict others from doing anything the license permits. Find a human-readable summary of (and not a substitute for) the CC BY-SA 4.0 license at this link: https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/ ; https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/legalcode 2 disclaimer ;The SWISS-MODEL SERVER produces theoretical models for proteins. The results of any theoretical modelling procedure is NON-EXPERIMENTAL and MUST be considered with care. These models may contain significant errors. This is especially true for automated modeling since there is no human intervention during model building. Please read the header section and the logfile carefully to know what templates and alignments were used during the model building process. All information by the SWISS-MODEL SERVER is provided "AS-IS", without any warranty, expressed or implied. ; https://swissmodel.expasy.org/docs/terms_of_use#disclaimer #